肿瘤药物基因组学研究进展_张妍
利用生物信息学分析方法识别子宫颈癌患者预后相关长链非编码RNA

网络出版时间:2020-10-2316:26 网络出版地址:https://kns.cnki.net/kcms/detail/34.1073.R.20201023.0917.021.html利用生物信息学分析方法识别子宫颈癌患者预后相关长链非编码RNA张 妍1,李 娟2,齐丽荣3,何洪敏1摘要:目的 利用生物信息学分析方法,通过对肿瘤基因组图谱(theCancerGenomeAtlas,TCGA)数据库中存储的子宫颈癌测序数据及临床资料进行分析,试图去识别子宫颈癌预后相关的lncRNA,弥补目前lncRNA在子宫颈癌上研究的不足。
方法 TCGA数据库官网下载子宫颈癌转录组测序数据及临床资料,筛选子宫颈癌与正常组织的差异lncRNA,利用Kaplan Meier生存分析和单因素Cox分析初步筛选与患者预后相关的lncRNA基因集,采用多因素Cox法对初步筛选的lncRNA基因集构建与子宫颈癌患者预后相关的基因模型,对在基因模型中具有显著性的lncRNA进行靶基因的功能注释。
结果 首先筛选出子宫颈癌与正常组织差异的lncRNA292个,利用Kaplan Meier生存分析和单因素Cox分析初步筛选与患者预后具有相关lncRNA8个,利用多因素Cox模型构建患者预后相关的7个lncRNA构成预测模型,AUC值为0 714,模型具有可靠性。
结论 共筛选出7个与子宫颈癌预后相关的lncRNA,其中有4个lncRNA在子宫颈癌中尚未涉及,为今后进行相关研究提供方向。
关键词:子宫颈肿瘤;TCGA数据库;lncRNA;生物信息分析中图分类号:R737 33 文献标志码:A 文章编号:1001-7399(2020)10-1222-05doi:10.13315/j.cnki.cjcep.2020.10.021接受日期:2020-06-10基金项目:山东省枣庄市卫生局医药卫生科技发展计划项目(2015033)作者单位:1山东省枣庄市立医院病理科,枣庄 2771002山东省枣庄市妇幼保健院病理科,枣庄 2771003山东省枣庄市市中区妇幼保健院检验科,枣庄 277100作者简介:张 妍,女,硕士,主治医师。
肿瘤分子靶向治疗的研究进展

肿瘤分子靶向治疗的研究进展随着生物技术的不断发展和精准医疗的不断普及,以分子为靶点的肿瘤治疗越来越成为研究的热点领域,这种治疗方法被称为肿瘤分子靶向治疗。
与以往的传统治疗方法相比,肿瘤分子靶向治疗具有特异性高、有效性好、毒副作用小等优点,受到了世界范围内的广泛关注。
本文将从靶点的发现、药物的选型、临床应用等方面介绍肿瘤分子靶向治疗的研究进展。
一、靶点的发现靶点是指某个分子或细胞结构,能够与治疗药物紧密结合,从而起到抗癌作用的位置。
对于肿瘤治疗而言,靶点的发现至关重要,因为它们的存在直接决定了治疗药物的精准性和有效性。
目前,靶点发现的方法主要分为以下几类:化学筛选法、基因组学筛选法、蛋白质组学筛选法和细胞治疗方法。
其中,化学筛选法是指利用生物化学技术,从化学物质中筛选出对于某种癌症有特异性的化合物;基因组学筛选法则是指通过对整个基因组的筛选,寻找具有影响肿瘤发生发展的基因或蛋白质;蛋白质组学筛选法则是通过检测肿瘤细胞和正常细胞中蛋白质表达的差异,寻找具有癌症特异性的蛋白质;而细胞治疗方法则是利用生物技术筛选出能够靶向癌细胞特异性基因的细胞,通过对正常细胞和癌细胞靶向细胞的刺激来治疗癌症。
目前,靶点的发现涉及到生物学、医学、化学等多个学科领域,需要各种技术手段之间的协作,其中最重要的一环是开展肿瘤分子基因组学研究,这对于深入了解肿瘤发生、发展及转移过程中的基因和蛋白质变化十分重要。
二、药物的选型药物的选型是肿瘤分子靶向治疗的核心内容之一。
首先,必须找到能够靶向特定肿瘤细胞的药物,并能够在体内达到理想的浓度。
其次,还需要考虑药物的毒副作用,以及它对正常细胞和组织的影响。
根据靶点的不同,肿瘤分子靶向治疗的药物可以分为信号转导抑制剂、细胞周期抑制剂、免疫治疗剂、抗血管生成剂、DNA损伤修复抑制剂等多个种类。
例如,信号转导抑制剂是针对肿瘤细胞信号通路的药物,可以抑制肿瘤细胞的增殖和转移;而免疫治疗剂则是指通过提高机体免疫力,增强机体对癌细胞的抗体和杀伤力,从而达到抗癌的效果。
全球新型抗肿瘤药物研发进展及趋势

全球新型抗肿瘤药物研发进展及趋势作者:李积宗张博文方淑蓓韩佳毛开云江洪波陈大明来源:《上海医药》2022年第25期李积宗,中共党员﹑高级工程师,上海市生物医药科技发展中心主任、上海医药行业协会副会长,长期从事生物医药领域科研项目管理、科技成果转化和软课题研究等工作,牵头建设运行上海市生物医药研发与转化功能型平台,熟悉上海生物医药科技创新政策,具有丰富的项目管理和成果转化经验。
通信作者:陈大明,研究员,长期从事生物医药等领域的科技情报研究,创新了基于关联索引的情报研究新方法,揭示了多学科交叉融合演进的范式,构建了用于专利价值和成果转化的评估框架,在软科学研究、知识产权分析、产业情报研究等方面带领团队完成了数十项研究课题,有力支撑了多种决策。
摘要:新型抗肿瘤药物已成功用于规避常规策略的某些局限性,同时提供更高的敏感性和特异性、更高的生物利用度和改善的综合治疗效果。
本文总结了过去70年的抗肿瘤药物开发里程碑,综述了基于肿瘤标志性特征的14类抗肿瘤药物开发路径,并且从多学科交叉融合的视角探索了抗肿瘤药物开发中的前景。
关键词:抗肿瘤药物多学科研究中图分类号:R979.1文献标志码:A文章编号:1006-1533(2022)S2-0001-o8引用本文李积宗,张博文,方淑蓓,等.全球新型抗肿瘤药物研发进展及趋势[J.上海医药,2022,43(S2):1-8.Noval anti-tumor drugs: global advances and trendsLlJizong' , ZHANG Bowen', FANG Shubei' ,HAN Jia', MAO Kaiyun',JIANG Hongbo , CHEN Daming( 1.Shanghai Center of Biomedicine Development,Shanghai 201203,China; 2. Shanghai lnformation Center for LifeSciences,Shanghai Institute of Nutrition and Health, Chinese Academy of Sciences ,Shanghai 200031 , China)ABSTRACT Noval anti-tumor drugs have been successfully employed to circumvent certain limitations of conventionalstrategies while providing higher sensitivity and specificity,greater bioavailability, and improved comprehensive effects fortherapeutic outcomes. This paper summarized anti-tumor drug development milestones in the past seven decades,reviewed anti-tumor drug based therapies accroding to 14 different targeting approaches, and discussed the imperative role of multidisciplinaryresearches that could drive anti-tumor drug developments.KEY WORDS anti-tumor ; drug; multidisciplinary research過去数十年来,全球肿瘤治疗巨大需求的拉动力、多种技术融合创新的驱动力,共同推动了全球抗肿瘤药物研发的快速发展。
卵巢癌化疗耐药相关基因与预后的研究进展

卵巢癌化疗耐药相关基因与预后的研究进展
张雯碧;鹿欣
【期刊名称】《国际妇产科学杂志》
【年(卷),期】2007(034)003
【摘要】卵巢癌是妇科常见的恶性肿瘤,死亡率居妇科之首.化疗是目前治疗卵巢癌的重要手段之一.化疗耐药是影响晚期卵巢癌患者预后的主要原因.卵巢癌化疗耐药是多基因多因素共同参与的结果.近年来卵巢癌化疗耐药相关基因成为监测预后的指标.主要从细胞内有效药物浓度的降低(MDR基因,MRP,LRP,GST),药物作用的靶点异常(微管蛋白基因),DNA损伤修复功能异常(MMR,BRCA1基因)及细胞凋亡异常(p53、bcl-2基因、caspase,survivin 基因)这四个方面对卵巢癌化疗耐药相关基因及其与预后作一综述.
【总页数】4页(P193-196)
【作者】张雯碧;鹿欣
【作者单位】复旦大学附属妇产科医院,200011;复旦大学附属妇产科医院,200011【正文语种】中文
【中图分类】R73
【相关文献】
1.上皮性卵巢癌P53、Livin和PARP表达检测及其对卵巢癌化疗耐药、临床预后的影响研究 [J], 贾敏利;宋晓彤
2.DNA修复相关基因与卵巢癌耐药研究进展 [J], 刘国艳;糜若然;袁碧波
3.P53、Livin和PARP在上皮性卵巢癌中的表达及其对卵巢癌患者化疗耐药、临床预后的影响 [J], 张小华;陈开杰;张海伟;陈力学
4.基于生物信息学方法筛选卵巢癌铂类化疗耐药相关基因的研究 [J], 韦仕洋;张明铭;黄晶;林丽娜;徐红
5.P53、Livin、ERCC1、BRCA1、PARP在上皮性卵巢癌中表达及其对卵巢癌化疗耐药、临床预后的影响 [J], 李日明;陈国强;颜露春
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基因组学在肿瘤研究中的意义

基因组学在肿瘤研究中的意义【前言】肿瘤是一种十分复杂的疾病,因其恶性程度高、病因复杂等诸多因素,肿瘤研究一直是医学研究的热点之一。
在传统的肿瘤研究中,常见的手段包括病理学、临床医学、分子生物学等。
然而,随着基因组学的不断发展,它被越来越广泛地应用于肿瘤研究领域。
本文就是要讨论基因组学对肿瘤研究的意义。
【分子水平认识肿瘤病因】基因是决定人类遗传性状的最小单位,在肿瘤的发生中也扮演着十分重要的角色。
相比传统手段,基因组学是一种更加高效、全面的方式来理解肿瘤的发生原因和机制。
随着第三代测序技术的出现,我们可以快速、准确地解读人类基因组的信息,并研究这些信息与肿瘤发生密切相关的基因。
通过分析基因组数据,科研人员可以对不同癌症基因和肿瘤驱动突变进行全面的认识,从而更好地理解肿瘤病因,并对肿瘤的定向治疗提供新思路。
【基因组学辅助肿瘤诊断】肿瘤的诊断常依赖于组织切片及病理学鉴定等传统手段,但是这些方法往往难以为医生提供完整的信息以便快速做出决策。
而基因组学技术可以更好地从分子水平上阐述某些特定癌症的发生原因和机制,辅助医生诊断肿瘤。
基因组学技术还可以通过分析肿瘤的基因组变异信息,帮助医生识别患者的敏感性特异性和复发率,选择更为合适的个体化治疗方法,从而提高治疗效果和实现治疗的精准化。
【基因组学为肿瘤治疗提供新思路】基因组学也为肿瘤治疗提供了崭新的思路。
有些劣质良性肿瘤虽然不会扩散到其他组织,但会给患者带来很大困扰。
又因为这些肿瘤的性质不同,传统的治疗方法难以见效。
但是基因组学为病理类型及分化程度不同的肿瘤找到了一个基因关联学、基因突变关联学和基因型-表型关联学的途径。
从这些方法中找到癌细胞“萎缩的”基因,并尝试阻止它,就是一种新的治疗策略。
在肿瘤治疗中,常用的药物治疗——化疗已经非常成熟。
基因组学就派上了用场,可以通过研究哪些基因变异导致肿瘤细胞对药物的抗性,以及对不同基因变异进行针对性的治疗。
此外,基因组学文献报道了很多未来的癌症治疗的target, 可能带给人们更快、准确的解决途径。
杆状病毒在癌症基因治疗方面的应用

龙源期刊网 杆状病毒在癌症基因治疗方面的应用作者:骆超超杨婧如张妍陈琛刘芸菲王奕曹锦涛陈瑶来源:《健康必读(上旬刊)》2019年第03期【摘; 要】随着癌症发病率居高不下,人们一直在追求如何能够高效的治疗癌症。
随着医药科学的飞速发展,利用基因治疗技术来治疗癌症有了显著成效。
基因载体的选择是基因治疗的核心技术之一,杆状病毒一直就是备受关注的一类基因转导载体。
经过研究者们的深入研究发现,杆状病毒在肝癌、胃癌、黑色素瘤及脑肿瘤等的基因治疗中具有较强的可行性。
目前还可以进一步解决杆状病毒引起的体内补体反应,同时也能不断提高其转导和表达效率。
本文将着重介绍杆状病毒在癌症基因治疗中的应用。
【中图分类号】R730.5;;;;; 【文献标识码】A;;;;; 【文章编号】1672-3783(2019)03-0073-011 杆状病毒1.1杆状病毒杆状病毒是节肢动物的病源病毒,具有囊膜的双链环状DNA,且其基因组为单一的闭合环状双链DNA分子,并以超螺旋形式压缩包装。
根据包涵体的形态及其理化性质,杆状病毒科被分为核型多角体病毒属(nuclear polyhedrosis virus)、颗粒体病毒属(Granulosis Virus,GV)。
核型多角体病毒多用于杆状病毒表达系统的运用。
与其他病毒不同的是,在其双向复制的周期中,杆状病毒以两种形态存在:一种是包涵体病毒(occluded virus, OV),是昆虫间水平感染的病毒形式;一种是细胞外芽生病毒(budded virus, BV),是个体内细胞间感染的病毒形式。
虽然它们的遗传组成相同,但有着不同的形态、囊膜结构、组成和功能。
在时序性的基因表达过程中,在极晚期基因表达的时候,会有两种高效表达的非必需蛋白产生,即多角体蛋白和P10蛋白。
正因如此,杆状病毒表达载体系统理想的外源基因插入点是这两个基因位点。
1.2杆状病毒表达系统杆状病毒载体系统主要分为两大类:一类是用于表达单个外源基因的载体;另一类是多元表达载体,用于插入并表达两个或多个外源基因[1]。
基因组学技术在肿瘤诊断和预后中的应用
基因组学技术在肿瘤诊断和预后中的应用随着科技的不断进步和研究的深入,基因组学技术在肿瘤诊断和预后中扮演着越来越重要的角色。
本文将探讨基因组学技术在肿瘤学领域的应用,并分析其对肿瘤诊断和患者预后评估的重要性。
一、引言肿瘤诊断和预后评估是肿瘤学领域的核心问题,准确的诊断和及时的预后评估对于患者的治疗和生存率至关重要。
传统的肿瘤诊断方法主要依靠组织病理学分析和影像学检查,然而,它们在一些方面存在着局限性。
近年来,基因组学技术的迅速发展为肿瘤诊断和预后带来了新的机遇。
二、基因组学技术在肿瘤诊断中的应用1. 基因突变检测基因突变是肿瘤发生和发展的重要因素。
基因组学技术可以帮助鉴定与肿瘤相关的突变,并提供更准确的诊断依据。
例如,通过测序技术可以检测到肿瘤细胞中的基因突变情况,从而确定特定靶向治疗的可行性。
2. 基因表达分析基因表达的异常与肿瘤的产生相关联。
通过基因组学技术,可以测定肿瘤细胞中的基因表达模式,并与正常细胞进行比较。
这样可以发现异常基因表达,并据此诊断不同类型的肿瘤。
三、基因组学技术在肿瘤预后中的应用1. 个性化治疗选择基因组学技术可以帮助确定肿瘤的分子亚型,从而指导个体化治疗方案的选择。
通过对患者肿瘤样本的基因组分析,可以预测特定治疗方法的疗效,并避免对无效治疗的浪费。
2. 预测预后基因组学技术可以分析肿瘤细胞中的多种基因变化,并据此评估患者的预后情况。
通过对大量病例数据的统计分析,可以建立预后模型,预测患者的存活率和复发率等重要指标。
四、技术挑战和前景展望基因组学技术在肿瘤诊断和预后中的应用面临着一些技术挑战。
首先,高通量测序技术的精准性和可靠性仍然需要提高。
其次,大规模数据的分析和处理需要更加高效的算法和计算平台。
然而,尽管存在一些挑战,基因组学技术在肿瘤学领域的应用前景依然广阔。
随着技术的不断发展,基因组学技术将成为肿瘤诊断和预后评估的重要工具。
结论基因组学技术在肿瘤学领域的应用已经取得了显著的进展,并在肿瘤诊断和患者预后评估上发挥着重要作用。
恶性肿瘤研究肿瘤耐药机制的研究进展和逆转策略
恶性肿瘤研究肿瘤耐药机制的研究进展和逆转策略恶性肿瘤是世界范围内一种常见而严重的疾病,其主要特征是肿瘤细胞的无限增殖和侵袭能力。
然而,随着医学的进步,越来越多的癌症患者在接受化疗或靶向治疗后表现出耐药性,这给治疗带来了巨大的挑战。
因此,研究肿瘤耐药机制以及逆转策略成为了当前肿瘤研究的热点领域。
一、肿瘤耐药机制的研究进展肿瘤耐药机制的研究主要包括细胞内信号通路异常和肿瘤微环境对药物的影响。
在细胞内信号通路异常方面,一些基因突变或表达异常导致了细胞凋亡途径的抑制,从而使肿瘤细胞对化疗药物产生耐药性。
此外,肿瘤细胞通过调节DNA修复功能和泵运输蛋白的活性来逃避药物的杀伤作用。
而肿瘤微环境则通过增加血管生成和诱导免疫抑制等方式改变了治疗的疗效。
二、肿瘤耐药机制的逆转策略逆转肿瘤耐药机制是战胜肿瘤耐药性的重要手段之一。
一种常见的逆转策略是靶向特定信号通路或分子,以恢复细胞的凋亡功能。
例如,Biopterin在乳腺癌化疗中起到抗耐药作用。
此外,还可以通过联合用药的方式延缓耐药性的产生,如将化疗药物与有效的免疫治疗相结合。
最近,免疫治疗被广泛研究,并取得了一定的突破。
三、新兴研究领域除了传统的耐药机制和逆转策略之外,还有一些新兴的研究领域值得关注。
比如,肿瘤免疫治疗的发展将重点放在了治疗肿瘤转移和提高复发患者的生存率上。
此外,一些新的诊断方法和技术的出现,如基因组学、转录组学和蛋白质组学的应用,有助于对个体化的治疗进行精准匹配。
这些研究的出现为我们深入了解肿瘤耐药机制和开发逆转策略提供了新的思路和方法。
总结:肿瘤耐药机制的研究和逆转策略的探索是当前肿瘤研究的重点之一。
通过了解肿瘤耐药机制,我们可以针对不同的耐药机制提出相应的逆转策略,从而提高患者的疗效和生存率。
此外,新兴的研究领域的出现为我们解决肿瘤耐药方面的问题提供了更多的可能性。
相信随着科学技术的不断发展,我们能够逐渐攻克恶性肿瘤耐药问题,为患者带来更好的治疗效果。
紫铆因在恶性肿瘤中的研究进展
紫铆因在恶性肿瘤中的研究进展在全球范围内恶性肿瘤的患病率和死亡率逐年上升且呈年轻化趋势,它仍然是世界上最致命的疾病之一。
恶性肿瘤的主要治疗方法包括放疗、化疗及手术,其中化疗与放疗引起的不良反应会严重损害到身体机能,使患者的生存质量降低。
因此,寻找副作用少的新药是当下抗肿瘤药物领域研究的重点。
许多来源于天然植物的化合物安全有效,在癌症等多种疾病的防治方面表现出巨大的潜力,Butein(紫铆花素:2′,3,4,4′-四羟基查尔酮)是一种从植物中提取出来的天然多酚物质,具有多种生物学活性,大量的文献证实Butein对包括肝癌、肺癌、宫颈癌、膀胱癌、黑色素瘤、骨肉瘤等多种肿瘤具有明确的抗肿瘤作用。
文章旨在对紫铆因在恶性肿瘤中的作用进行一综述。
标签:紫铆因;恶性肿瘤;凋亡Research progress of butein in malignant tumors【Abstract】In the world,the prevalence and mortality of malignant tumors are increasing year by year and showing a younger trend,it is still one of the deadliest diseases in the world. The main treatment methods of malignant tumor include radiotherapy,chemotherapy and surgery,in which the adverse reactions caused by chemotherapy and radiotherapy will seriously damage the body function and reduce the quality of life of patients. Therefore,the search for new,safe and effective anti-tumor methods is the focus of the current research in the field of antineoplastic drugs. Many compounds from natural plants are safe and effective and show great potential in the prevention and treatment of cancer and other diseases. Butein is a kind of natural polyphenols extracted from plants,which has a variety of biological activities. A large number of literatures have confirmed that Butein has a clear anti-tumor effect on a variety of tumors,including liver cancer,lung cancer,cervical cancer,bladder cancer,melanoma,osteosarcoma and so on. The purpose of this paper is to review the role of purple riveting in malignant tumor.【Key words】Butein Malignant Tumor Apoptosis前言目前恶性肿瘤仍是困扰医学界的一大难题,虽然恶性肿瘤在基础和临床研究中已取得较大进展,但恶性肿瘤的发病率和死亡率仍呈逐年上升趋势。
抗肿瘤和生物药物输入的护理
抗肿瘤和生物药物输入的护理吉林大学中日联谊医院肿瘤血液科张妍【背景】肿瘤的生物治疗主要是通过调动宿主的天然防卫机制或给予机体某些物质来取得抗肿瘤的效应。
随着现代生物技术的发展,生物治疗日趋重要。
面向21世纪的肿瘤治疗,抗癌药的发展将从细胞毒性药物的攻击转向非细胞毒性药物的调节。
生物治疗将起到重要的作用。
化学治疗始于20世纪40年代,现在肿瘤化疗已经有了长足的进步。
抗癌药物和生物治疗药物的给药途径主要有:静脉注射、口服给药、肌内注射和皮下注射、动脉注射、胸腹腔注射、蛛网膜下隙注射、膀胱内灌注及局部涂抹。
其中静脉注射是最常用的给药途径,常分为静脉推注、静脉滴注。
【证据】1.预防及减少静脉炎有研究显示,使用精密输液器能有效预防静脉炎的发生。
研究证明在药物浓度不变的情况下,快速静脉推注要优于慢速静脉推注;同时静脉损伤严重程度也受到静脉输入化疗药液总容量的影响,在药物剂量及速度一定的情况下,容量越大,输注持续时间越长,则静脉的损伤程度越重,说明静脉损伤的程度与化疗药物浓度、药物输注速度以及药物总容量均有关系。
2.发疱剂外渗的处理必须由经过专门培训的注册护士给药。
护士需要掌握发疱剂外渗的表现以及能判断外渗后局部反应的情况。
应通过及时处理皮下的肿胀、外用解毒药、舒适的管理、外科干预来尽可能地减少外渗引起的组织损伤。
护士必须要掌握如何减少外渗发生率、减少患者疼痛及不舒适的相关知识。
3.化疗防护专业人员在接触化疗药物过程中具有潜在危害性。
根据其毒性反应具有剂量依赖性的特点,虽然在日常配制药液或给药操作时沾染的剂量很小,但是由于频繁接触会因其蓄积作用而产生毒性反应,如造血系统、消化道上皮细胞等组织器官不同程度的损伤,常表现为白细胞和(或)血小板减少、口腔溃疡、脱发等,同时还会产生远期毒性反应(如致癌、致畸、致突变等)。
护士在处理化疗患者的尿液、粪便、呕吐物或分泌物时必须戴手套,医院必须设有污水处理装置。
【推荐意见】1.必须由经过专门培训的注册护士给药。