基于使用的网状Meta分析软件的比较研究与选择
间接比较与网状Meta析
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疗效评定标准
①8周治疗为限，如无8周资料，则以原始研究资料中6 ～12周期间评定作为本研究急性期疗效最终评定；
②有效：汉密尔顿抑郁量表(HDRS)评分和蒙哥马利一 奥斯伯格抑郁量表(MADRS)评分均较基线改进最少50 ％，或临床大致印象量表(CGI)评分显著改进；假如上 述3个量表评分都有改进，仅选HDRS评分作为研究指 标；
③治疗中止(耐受性)：患者在最初8周治疗期间因任何原 因而中止研究(脱落或失访)人数；
④剂量：以氟西汀为参考药品(因为它是第一个在欧美 上市新一代抗抑郁药)
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对12种抗抑郁药品作疗效排序分析
结果：米氮平、艾司西酞普兰、文拉法辛和舍曲林是最有效治疗 药品，而艾司西酞普兰、舍曲林、安非他酮和西酞普兰是耐受性 最好药品。
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安非他酮、西酞普兰、度洛西汀、艾司西酞普 兰、氟西汀、氟伏沙明、米那普仑、米氮平、 帕罗西汀、瑞波西汀、舍曲林和文拉法辛
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排除标准
抚慰剂对照研究 产后抑郁症研究
入选
共检索到117项随机对照研究(RCT)
间接比较与网状Meta析
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STATA软件
该软件可完成二分类变量和连续性变量meta 分析，也能够进行meta回归分析，还能够绘 制meta分析相关图型，如森林图（Forest） 漏斗图
Statameta分析功效比较全方面、强大。
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间接比较与网状Meta析
《2024年Meta分析系列之二_Meta分析的软件》范文
《Meta分析系列之二_Meta分析的软件》篇一Meta分析系列之二_Meta分析的软件Meta分析系列之二：Meta分析的软件一、引言Meta分析作为一种综合性的文献研究方法，已经在多个学科领域中得到了广泛的应用。
然而，Meta分析的过程涉及到大量的数据整理、统计分析等工作，这就需要借助专业的软件来辅助完成。
本文将重点介绍Meta分析的软件，以及如何利用这些软件提高Meta分析的质量。
二、Meta分析软件概述1. 常用Meta分析软件目前，市面上有很多用于Meta分析的软件，如Comprehensive Meta Analysis (CMA)、Review Manager (RevMan)、Stata等。
这些软件在功能、操作等方面有所不同，但都能有效地支持Meta分析的过程。
2. 软件功能特点(1) Comprehensive Meta Analysis (CMA)：CMA是一款功能强大的Meta分析软件，支持多种统计模型，如固定效应模型、随机效应模型等。
同时，CMA还提供了丰富的图形工具，有助于研究者直观地了解分析结果。
(2) Review Manager (RevMan)：RevMan是Cochrane协作网推出的专门用于系统评价和Meta分析的软件。
RevMan操作简便，界面友好，适合初学者使用。
(3) Stata：Stata是一款强大的统计分析软件，也支持Meta分析。
Stata的语法较为复杂，但功能丰富，适合有一定统计学基础的研究者使用。
三、软件使用方法及注意事项1. 选择合适的软件在选择Meta分析软件时，应根据自己的需求、经验水平以及软件的功能特点进行综合考虑。
对于初学者，建议选择操作简便、界面友好的软件；对于有一定统计学基础的研究者，可以选择功能更强大、灵活性更高的软件。
2. 严格按照软件操作指南进行操作在使用Meta分析软件时，应严格按照软件操作指南进行操作，避免因操作不当导致分析结果出现偏差。
应用ADDIS软件实现网状Meta分析
应用ADDIS软件实现网状Meta分析曾宪涛1,2# 张 超1# 杜 亮3*1. 湖北医药学院附属太和医院循证医学中心（湖北十堰 442000）；2. 湖北医药学院附属太和医院口腔科（湖北十堰 442000）；3. 四川大学华西医院中国循证医学中心（成都 610041）摘要 在当前能够实现网状Meta 分析的软件中，ADDIS 软件是一款基于贝叶斯框架、运用Markov chain Monte Carlo （MCMC ）法对数据进行先验评估与处理的非编程软件。
该软件操作较为简便，只需操作者对模型一致性及结果收敛性诊断做相关判断后，软件将自动产出结果及相关图形；但该软件的最大缺点在于数据录入较为繁琐。
本文介绍了如何应用ADDIS 软件实现网状Meta 分析。
关键词 ADDIS 软件；网状Meta 分析；MCMC 法Using ADDIS Software for Implementation Network Meta-AnalysisZENG Xian-Tao 1,2#, ZHANG Chao 1#, DU Liang 3*1. Center for Evidence-Based Medicine and Clinical Research, Taihe Hospital, Hubei University of Medicine, Shiyan 442000, China;2. Department of Stomatology, Taihe Hospital, Hubei University of Medicine, Shiyan 442000, China;3. Chinese Evidence-Based Medicine Center, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, ChinaAbstract The aggregate data drug information system (ADDIS) software is a non-programming software which is based on the Bayesian framework and using the Markov chain Monte Carlo (MCMC) method for prior assessment and implementation. The operation is fairly easy for users. The consequent results and relevant plots could be output auto-matically by the software after users assess the consistency of model and convergence diagnostics. The major disadvantage of ADDIS is the more complicated data entry. This article introduces how to perform network meta-analysis using ADDIS software.Key words ADDIS; Network Meta-analysis; MCMC methodDOI: 10.7507/1672-2531.20130257基金项目：湖北省教育科学“十二五”规划2012年度重点课题（2012A050），湖北医药学院2011年度优秀中青年科技创新团队项目（2011CZX01），湖北医药学院附属太和医院2013年循证医学“苗圃基金”项目（EBM2013004）。
流行病学和询证医学：网状Meta分析
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网状Meta分析实例
• 网状meta分析比较4 种不同机制的一线抗抑郁药 治疗抑郁症的临床疗效
阿米替林 艾司西酞普兰 米氮平 文拉法辛 治疗中国抑郁症患者的临床疗效 主要结局指标为有效例数( 或有效率) ，结局指标评价采用汉密尔顿 抑郁量表与基线相比 HAMD 减分率≥50%为有效
2016，中国药物评价，刘强等
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间接比较
虽然有直接比较研究证据，但这些研究数量较少或质量较低 时也可以用间接比较证据进行补充
在面对一个具体临床问题时，临床医生或决策者通常需要在 众多的干预措施中选择对具体患者最安全有效的措施，此时 传统Meta分析就显得无能为力，需要多种干预措施比较， 多种干预措施比较既可以同时比较多种干预措施，也可以合 并直接比较和间接比较证据
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（一）证据图 证据是循证医学的核心，基于随机对照试验（RCT）的系
统评价/Meta分析是当前公认的最高级别证据。证据图主要通 过networkplot命令实现，从图中我们可以看出纳入研究的臂 数，构成的闭合环个数，每种干预措施的样本量。 证据中最重要的：样本量和纳入文献质量
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（二）贡献图 通过netweight命令，从图中可以看出每个直接比较对整
网状Meta分析和普通Meta分析的区别在于： 普通Meta分析着重比较两个组，而网状Meta分析 着重强调在同一条件下比较多种干预措施。所以也叫 MTM(Multiple-Treatments Meta-Analysis)
《2024年Meta分析系列之二_Meta分析的软件》范文
《Meta分析系列之二_Meta分析的软件》篇一Meta分析系列之二_Meta分析的软件Meta分析系列之二：Meta分析的软件的高质量范文一、引言Meta分析是一种统计方法，用于综合多个独立研究的结果，以提供更全面、更准确的结论。
随着科研工作的不断发展，Meta 分析在各领域的应用越来越广泛。
而进行Meta分析，软件的选择是关键。
本文将就Meta分析的软件进行详细探讨，以期为读者提供参考和帮助。
二、Meta分析软件概述在进行Meta分析时，我们需要选择合适的软件来辅助我们完成工作。
目前，市面上有很多Meta分析软件，如Comprehensive Meta-Analysis（CMA）、Metafor、Review Manager等。
这些软件各有优缺点，适用于不同的研究需求。
1. Comprehensive Meta-Analysis（CMA）CMA是一款功能强大的Meta分析软件，具有直观的用户界面和丰富的统计功能。
它支持多种类型的Meta分析，包括固定效应模型、随机效应模型等，还可以进行网络Meta分析、亚组分析等高级功能。
CMA的优点在于其强大的统计功能和灵活的模型选择，能够满足各种复杂的Meta分析需求。
2. MetaforMetafor是一款开源的R语言包，适用于各种类型的Meta分析。
它提供了丰富的统计方法和模型选择工具，可以进行复杂的亚组分析和网络Meta分析。
与CMA相比，Metafor更加灵活和可定制化，但需要一定的R语言基础。
3. Review ManagerReview Manager是Cochrane Collaboration中心开发的一款专门用于系统评价和Meta分析的软件。
它具有简单易用的用户界面和丰富的统计工具，适用于各种类型的Meta分析。
Review Manager的优点在于其简单易用和可重复性，适合初学者使用。
三、软件选择建议在选择Meta分析软件时，我们需要根据研究需求、数据类型、模型选择等因素进行综合考虑。
网状Meta分析一致性的鉴别与处理方法
01 摘要
03 文献综述 05 参考内容
目录
02 引言 04 研究方法
摘要
本次演示旨在介绍网状Meta分析一致性的鉴别与处理方法。通过文献综述和 研究发现，网状Meta分析的一致性对于研究结果的准确性和可靠性具有重要意义。 本次演示将介绍如何进行一致性的鉴别和处理，以提高网状Meta分析的质量。
引言
随着科学研究的发展，Meta分析已经成为一种重要的文献综述方法，它可以 对多个研究进行定量综合分析，从而得出更为准确和可靠的结论。网状Meta分析 是Meta分析的一种扩展形式，它可以将多个研究进行网状比较和分析，从而得出 更为全面和准确的结果。然而，网状Meta分析的一致性对于其结果的准确性和可 靠性具有重要意义。因此，本次演示将介绍如何进行网状Meta分析一致性的鉴别 和处理方法，以提高网状Meta分析的质量。
敏感性分析主要用于测试模型对数据变化的反应程度。在NMA中，我们可以 考虑不同的模型、数据结构或者假设来进行敏感性分析。例如，我们可以使用完 全随机和混合效应模型来进行比较。
在R软件中，可以使用"mvmeta"包来进行这种类型的敏感性分析。"mvmeta" 包允许使用多种模型进行比较，包括固定效应、随机效应、混合效应等。
3、进行敏感性分析
#使用mvmeta包进行敏感性分析
res <- mvmeta(ES, random=~1|study, rvs=~1|study, studies=study, data=data)
4、进行一致性分析
#使用metafor包计算I^2
res_forest <- rma(ES, study="Group", varwidth=sqrt(n1*n2), slab=paste(c("Study", study), collapse=" "))
系统综述与网状Meta分析的PRISMA扩展声明
系统综述与网状Meta分析的PRISMA扩展声明一、本文概述随着医学研究和临床实践的不断发展，越来越多的治疗方法被引入到临床实践中。
然而，这些方法之间的比较和选择一直是一个难题。
系统综述和网状Meta分析作为一种重要的统计分析方法，可以帮助我们更好地理解和比较不同治疗方法的效果，从而为临床实践提供更为科学和准确的指导。
本文旨在通过PRISMA扩展声明的方式，详细阐述系统综述和网状Meta分析的基本原理、实施步骤和注意事项，以提高读者对这一方法的理解和掌握程度。
我们将从定义和背景、研究问题和目标、文献检索和筛选、数据提取和质量评价、数据分析和解释、结果呈现和讨论等方面展开论述，以期为读者提供一份全面而深入的指南。
通过本文的阅读，读者将能够了解系统综述和网状Meta分析的基本概念、原理和实施步骤，掌握相关软件工具的使用方法，了解该方法在临床实践中的应用和限制，从而更好地利用这一方法进行医学研究和临床实践。
我们也希望通过本文的阐述，为医学研究和临床实践提供更为科学和准确的方法支持，推动医学领域的进步和发展。
二、PRISMA扩展声明概述PRISMA（Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses）扩展声明是PRISMA声明的进一步细化和扩展，专门针对系统综述与网状Meta分析这一复杂研究领域制定的详细报告规范。
这一扩展声明在PRISMA原有27个条目的基础上，增加了针对网状Meta分析的特定要求，以确保研究者在进行系统综述和网状Meta分析时，能够全面、透明地报告其研究方法和结果，从而提高研究的可重复性和可靠性。
PRISMA扩展声明强调了以下几个关键方面的报告要求：在引言部分，研究者需要明确阐述研究的目的、研究问题和假设，以及网状Meta分析相较于传统Meta分析的适用性和优势。
在方法部分，研究者需要详细描述文献搜索策略、纳入和排除标准、数据提取和处理过程，以及网状Meta分析的具体方法和模型选择。
R软件bnma程序包在贝叶斯网状Meta分析中的应用
R软件bnma程序包在贝叶斯网状Meta分析中的应用目录一、内容描述 (2)1.1 贝叶斯网状Meta分析简介 (3)1.2 R软件bnma程序包介绍 (4)二、R软件bnma程序包安装与使用 (5)2.1 R软件安装与配置 (6)2.2 bnma程序包安装步骤 (7)2.3 程序包使用方法 (8)三、贝叶斯网状Meta分析原理 (8)3.1 贝叶斯网状Meta分析基本概念 (10)3.2 贝叶斯网状Meta分析模型构建 (11)3.3 贝叶斯网状Meta分析参数估计 (11)四、R软件bnma程序包在贝叶斯网状Meta分析中的应用实例 (12)4.1 实例一 (13)4.2 实例二 (15)4.3 实例三 (16)五、结果分析与讨论 (17)5.1 实例分析结果展示 (18)5.2 结果讨论与解析 (19)5.3 程序包性能评估 (20)六、结论与展望 (21)6.1 研究总结 (23)6.2 程序包改进与优化建议 (24)6.3 未来研究方向 (25)一、内容描述本文档主要介绍了R软件bnma程序包在贝叶斯网状Meta分析中的应用。
贝叶斯网状Meta分析是一种基于贝叶斯方法的Meta分析方法，它通过构建贝叶斯网络来估计研究结果的不确定性，从而为临床决策提供更可靠的依据。
bnma程序包是R软件中专门用于贝叶斯网状Meta分析的一个强大工具，它提供了丰富的统计功能和灵活的图形界面，使得研究人员可以方便地进行贝叶斯网状Meta分析。
在本文档中，我们首先介绍了贝叶斯网状Meta分析的基本概念和原理，然后详细讲解了bnma程序包的安装和使用方法。
我们通过实际案例演示了如何使用bnma程序包进行贝叶斯网状Meta分析，包括数据准备、模型拟合、结果解释等步骤。
我们还对bnma程序包的一些高级功能进行了简要介绍，如贝叶斯网结构的可视化、模型参数的诊断等。
通过本文档的学习，读者将能够掌握R软件bnma程序包的基本使用方法，并了解如何在实际研究中应用贝叶斯网状Meta分析来解决临床问题。
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基于使用的网状Meta分析软件的比较研究与选择曾宪涛1,2,3 张 超1,3 邝心颖2 孙 鑫2 李幼平2*1. 武汉大学中南医院循证与转化医学中心（武汉 430071）；2. 四川大学华西医院中国循证医学中心（成都 610041）；3. 湖北医药学院附属太和医院循证医学与临床研究中心（湖北十堰 442000）摘要 目的 比较各种网状Meta 分析（NMA ）软件的特征及功能，为使用者选择软件提供参考。
方法 计算机检索PubMed 、CNKI 、Stata 公司官方网站、R 软件官方网站和Google ，收集具有NMA 功能的软件及程序包，检索时限截至2014年7月。
下载软件和程序包及其使用指南，用示例进行计算。
对软件的基本特征、功能和计算结果进行比较分析。
结果 共纳入11款软件，包括编程软件和非编程软件，主要基于贝叶斯学派和频率学派研发。
大多数软件已具操作简单、易掌握、计算准确及图形绘制优良等优点，但无一款同时具备较佳计算能力与绘图功能的软件，必需多款软件联合来实现。
结论 建议使用者首先依据自身编程基础与习惯等选取，可考虑选用两种或三种软件相互配合来实现NMA 。
建议研发一款功能完备、操作简单的免费软件。
关键词 网状Meta 分析；BUGS 软件；R 软件；Stata 软件；SAS 软件；ADDIS 软件；GeMTC 软件；JAGS 软件Software for Network Meta-Analysis: A Usage-based Comparative StudyZENG Xian-tao 1,2,3, ZHANG Chao 1,3, Joey S.W. KWONG 2, SUN Xin 2, LI You-ping 21. Center for Evidence-based and Translational Medicine, Zhongnan Hospital, Wuhan University, Wuhan 430071, China;2. Chinese Evidence-Based Medicine Centre, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, China;3. Center for Evidence-based Medicine and Clinical Research, Taihe Hospital, Hubei University of Medicine, Shiyan 442000, ChinaAbstract Objective To compare the characteristics and functions of the network meta-analysis software and for providing references for users. Methods PubMed, CNKI, official website of Stata and R, and Google were searched to col-lect the software and packages that can perform network meta-analysis up to July 2014. After downloading the software, packages, and their user guides, we used the software and packages to calculate a typical example. The characteristics, func-tions, and computed results were compared and analyzed. Results Finally, 11 types of software were included, including programming and non-programming software. They were developed mainly based on Bayesian or Frequentist. Most types of software have the characteristics of easy to operate, easy to master, exactitude calculation, or good graphing; however, there is no software that has the exactitude calculation and good graphing at the same time, which needs two or more kinds of soft-ware combined to achieve. Conclusion We suggest the user to choose the software at least according to personal program-ming basis and custom; and the user can consider to choose two or more kinds of software combined to finish the objective network meta-analysis. We also suggest to develop a kind of software which is characterized of fully function, easy operation, and free.Key words Network meta-analysis; BUGS software; R software; Stata; SAS; ADDIS; GeMTC software; JAGS softwareDOI: 10.7507/1672-2531.20140204基金项目：湖北省教育科学“十二五”规划2012年度重点课题（编号：2012A050）；湖北医药学院附属太和医院2013年循证医学“苗圃基金”项目（编号：EBM2013004）作者简介：曾宪涛，男（1984年～），硕士，副主任医师、讲师，以循证医学、口腔临床医学、临床流行病学、系统评价/Meta 分析为主要研究方向。
Email: zengxiantao1128@ * 通讯作者，Email: yzmylab@自2002年正式提出网状Meta 分析（network meta-analysis ，NMA ）以来，其方法学与制作软件均迅速发展 [1-3]。
与传统Meta 分析相比，NMA 因纳入干预措施多、数据量大、内在结构复杂，对软件的依赖更为突出。
目前已有多款能实现NMA 计算的软件，但尚无能独立且全面实现NMA 计算及相关图形绘制的软件，必须多款软件相互配合方可完成 [4,5]。
目前，最新版Cochrane 手册 [6]虽在16.6和16.8章节介绍NMA ，并建议使用WinBUGS 软件 [7]，但该软件欠缺绘图功能。
如何有效选择软件并配合使用，是当前制作NMA 的一个难点。
本研究比较分析当前能实现NMA 的软件，为读者更好地选择相关软件提供参考。
1 对象与方法1.1 NMA 软件选择标准可以实现NMA的软件或程序包。
1.2软件获取计算机检索PubMed、CNKI、Stata公司官方网站、R软件官方网站和Google，查看并记录已发表的网状Meta分析中所使用的软件与程序包，及介绍软件和程序包的方法学文献，检索时限截至2014年7月。
然后下载这些软件、程序包及介绍文件。
检索词包括network meta-analysis、multiple treat-ment comparison、mixed treatment comparison和indirect treatment comparison。
1.3研究方法阅读各软件及程序包的介绍内容，比较软件及程序包涉及的理论、模型、使用权限、是否编程、能否被调用及能否调用。
再以《R软件R2WinBUGS程序包在网状Meta分析中的应用》 [8]一文中有关13种抗抑郁药和安慰剂治疗抑郁症有效性的数据为例，用各种软件及程序包进行分析，比较其计算功能、计算结果和绘图功能。
2结果2.1纳入软件最终共纳入11种软件，其基本特征详见表1。
其中免费软件有BUGS软件（WinBUGS与OpenBUGS软件） [8-12]、JAGS软件 [13]、Stan软件 [14]、GeMTC软件 [15,16]、ADDIS软件 [17,18]及R软件（或称“R语言”） [8,9,13,16,19,20]；收费软件有Microsoft Excel [11, 30-31]、Stata [21-23]及SAS [24]。
相关下载地址可从笔者系列文章中获取 [5,8-19,31]。
按是否需要编程来分，软件又可分为编程软件与非编程软件，非编程软件仅有GeMTC软件 [15,16]和ADDIS软件 [17,18]两款。
R软件包含的程序包最多，达11个（表2）。
2.2涉及的方法2.2.1 理论制作NMA的基本理论目前主要分为贝叶斯理论与传统统计理论。
与传统统计相比，贝叶斯统计除对结果可信区间的解释更合理外，还在先验设定、风险利益排序及决策分析等方面优势显著 [2]，这对保证NMA结果的准确性及完整性十分重要。
故从NMA出现以来，基于贝叶斯理论的运算一直备受推崇。
但贝叶斯统计中的先验设定不同将会直接导致结果不同，因此，先验设定的合理性在整个NMA 的制作中十分关键，也一直是众多统计学家担忧的问题之一。
表1中基于贝叶斯统计理论框架下的软件均通过自身或调用外界软件来实现NMA，仅R 软件（或R语言）、Stata软件及SAS软件同时适用于传统统计理论。
总体来讲，基于贝叶斯理论框架的BUGS软件是当前使用最频繁的NMA软件，亦为Cochrane协作网推荐 [6]。
2.2.2模型与实现方法 NMA制作方法目前主要基于分层模型、回归模型、多元分析模型及两步法。
前3种模型均在贝叶斯框架下实现，两步法则常基于传统频率学派。
相关信息详见表1。
基于分层模型的软件主要通过自身或调用外界软件基于贝叶斯理论框架实现NMA。
其中Stata软件本身无法完成，需要调用BUGS软件来实现；而SAS软件的proc genmod [25]与proc glimmix [26]是分别基于软件自身编程功能，运用传统广义线性模型与广义线性混合模型来建立分层模型；而proc MCMC [24]则用贝叶斯理论进行NMA。