第三章 氨基酸

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第3章-氨基酸

第3章-氨基酸

三字符
Gly A1a Val Leu 11e
单字符
G A V L I
中文名称
甘氨酸 L-丙氨酸 L-缬氨酸 L-亮氨酸 L-异亮氨酸
第3章 氨基酸
英文名称
L-phenylalanine L-tyrosine L-tryptophan L-serine L-theonine L-cysteine L-methionine L-asparagines L-glutamine L-aspartic acid L-Glutamic acid L-1ysine L-arginine L-histidine L-proline
第3章 氨基酸
(二)氨基酸的解离
HA

A- +

H+
质子
Bronsted-Lowry的酸碱质子理论: 酸是质子(H+)的供体(donor); 碱是质子的受体或接纳体(acceptor); 原始的酸(HA)和生成的碱(A-)被称为共轭酸-碱对。
第3章 氨基酸
二元酸
Ka1
Ka2
阳离子 A+
兼性离子 A0
第3章 氨基酸
鸟氨酸
瓜氨酸
第3章 氨基酸
扩展内容
UGA
UAG: 吡咯赖氨酸
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第3章 氨基酸
三、氨基酸的酸碱化学
(一)氨基酸的兼性离子(zwitterrion)形式
氨基酸分子是一种两性电解质。 氨基酸在结晶形态或在水溶液中,并不是以游离的 羧基或氨基形式存在,而是离解成两性离子。在两 性离子中,氨基是以质子化(-NH3+)形式存在,羧基 是以离解状态(-COO-)存在。 在不同的pH条件下,两性离子的状态也随之发生变 化。

生物化学第3章 氨基酸

生物化学第3章 氨基酸
生物化学 第三章 氨基酸 (amino acid)
一、氨基酸——蛋白质的构件分子
氨基酸(amino acid) :α-氨基酸是一切蛋白质的组成单位。氨基酸是与羧酸 相邻α-碳原子上连有一个氨基,故称α-氨基酸。 利用酸水解、碱水解、酶解可把蛋白质分子水解释放氨基酸。
不变部分(除脯氨酸) 可变部分 L型 α -氨基酸
氨基酸
芳香族氨基酸 Phe、Tyr、Trp 杂环氨基酸 His、Pro
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸)
甘氨酸
丙氨酸
缬氨酸
亮氨酸
异亮氨酸
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸):含有羟基
丝氨酸Ser的-OH在生理条件下不解离,但是个极性基团,能与其 他基团形成氢键,常出现在酶的活性中心; 苏氨酸Thr的-OH是仲醇,具有亲水性;
水中心)
极性氨基酸侧链能与水形成氢键,易溶于水 带电荷和极性氨基酸一般位于蛋白表面 蛋白的活性中心:His,Ser,Cys
2.3氨基酸的分类——不常见蛋白质氨基酸
2.4氨基酸的分类——非蛋白质氨基酸
150 多种,不是蛋白质组成,但是有特定生理功能
(1)大多是L型α氨基酸衍生物
(2)有D型氨基酸 (3)还有β-、γ-、δ-氨基酸
/view/e845c4c8a1c7aa00b52acb47.html
用强酸型阳离子交换树脂分离氨基酸
氨基酸与树脂的亲和力取决于:
气液层析
高效液相层析
蛋白质的水解条件及优缺点
第一章糖课后题 第6题
高碘酸及其盐可以定量的氧 化断裂邻二羟基、α-羟基醛等 的碳碳键,产生相应的羰基 化合物。该反应可以用来区 分糖苷是呋喃还是吡喃型的。 侧翼测定直连多糖的相对分 子量和支链淀粉的非还原末 端残基数,即分支数目。

生物化学第3章 氨基酸分析

生物化学第3章 氨基酸分析
氨基酸首尾脱水聚合成肽键。
180多种天然氨基酸; 20种蛋白质氨基酸
二、氨基酸的分类、性质
各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同 20种蛋白质氨基酸按R的极性可分为非极性氨基酸、不带电荷极性氨基酸、 带正电R基氨基酸和带负电R基氨基酸
按R基的结构可分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸及杂环氨基酸3大类
脂肪族氨基酸:一氨基一羧基(中性氨基酸):含有硫
Cysteine Methionine (Cys,C) (Met,M)
(1) 两个半胱氨酸的巯基氧化生成二硫键,生成胱氨酸,Cys-S-SCys
(2) 蛋氨酸的甲硫基的硫原子有亲核性,容易发生极化,在生物合成
中是重要的甲基供体
脂肪族氨基酸:一氨基二羧基(酸性氨基酸)
水中心)
极性氨基酸侧链能与水形成氢键,易溶于水 带电荷和极性氨基酸一般位于蛋白表面 蛋白的活性中心:His,Ser,Cys
2.3氨基酸的分类——不常见蛋白质氨基酸
2.4氨基酸的分类——非蛋白质氨基酸
150 多种,不是蛋白质组成,但是有特定生理功能
(1)大多是L型α氨基酸衍生物
(2)有D型氨基酸 (3)还有β-、γ-、δ-氨基酸
四、氨基酸的化学反应
ɑ-氨基参与的反应: 亚硝酸、酰化试剂、烃基、 醛基氧化酶 氨基酸的 化学反应
茚三酮、肽键形成!
ɑ-羧基参与的反应: 成盐、成酯、成酰氯、脱 羧、叠氮
侧链R基参与的反应: 取决于R侧链的官能团
ɑ-氨基参与的反应:
与亚硝酸反应:
通过测定N2的量而计算氨基酸的量,可衡量蛋白质的水解程度 与酰化试剂反应: X=Cl, OH, -OCOR; 可多肽合成中保护氨基;丹磺酰氯可以与肽的N-端氨基 酸反应,生成丹磺酰-肽,水解得到有强烈荧光的丹磺酰-氨基酸,用电泳法 或层析法分析即可得知N-端是何种氨基酸,被广泛用于蛋白质N端测定。 烃基化反应:

第三章 氨基酸

第三章 氨基酸

1889
1895
1896 1899
1901
1901 1901
1904
1922 1935
Drechsel
Hedin
Kossel Morner
Fischer
Fischer Hopkins
Erhlich
Mueller McCoy et al
珊瑚
牛角
奶酪
牛角 奶酪
奶酪
奶酪 纤维蛋白 奶酪 奶酪
20种基本氨基酸的名称与符号
-
COO
H2N C H
+
H3N C H
R
R
熔点: 高
溶液介电常数: 增加
2、等电点
Br?nsted -Lowry 的酸碱理论,即广义酸碱
理论。
HA
A- + H +

碱 质子
氨基酸在水中的两性离子形式既能像酸一 样放出质子,也能像碱一样接受质子,氨 基酸具有酸碱性质,是一类两性电解质。
+
H 3N
-
R
正离子
+
H 3N
-
COO
CH
R
两性离子
+ OH + H+
-
COO
H2N C H R
负离子
在某一 pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子
和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离
子,呈电中性。此时溶液的 pH值称为该氨
基酸的等电点 (isoelectric point ),以
pI表示。
在等电点时,氨基酸主要以两性离子形式存
半胱胺酸 Cysteine (Cys,C)
甲硫胺酸(蛋胺酸)
Methionine (Met,M)

第三章氨基酸 1.氨基酸的侧链对多肽或蛋白质的结构和生物学功能

第三章氨基酸 1.氨基酸的侧链对多肽或蛋白质的结构和生物学功能

第三章氨基酸1.氨基酸的侧链对多肽或蛋白质的结构和生物学功能非常重要。

用三字母和单字母缩写形式列出其侧链为如下要求的氨基酸:(a)含有一个羟基;(b)含有一个氨基;(c)含有一个具有芳香族性质的基团;,(d)含有分支的脂肪族烃链;(e)含有硫;(f)含有一个在pH 7~10范围内可作为亲核体的基团或原子,指出该亲核基团或原子。

2.就异亮氨酸的结构式回答下列问题:(a)它有多少个手性中心?(b)它有多少个光学异构体?(c)绘出异亮氨酸所有光学异构体。

’3.根据各个氨基酸相应的pKα值(见书)画出以下各氨基酸在pH 3.0,pH 7.0,pH 13.0时的主要离子结构:(a)Gly;(b)Glu;(c)Asp;(d)Arg;(e)His;(f)Pro。

4.计算第3题中各氨基酸的等电点(pI)。

5.一种氨基酸的可解离基团可以带电或中性状态存在,这取决于它的pK值和溶液的pH。

(a)组氨酸有3种可解离基团,写出相应于每个pK值的3种解离状态的平衡方程式。

每种解离状态下的组氨酸分子的净电荷是多少?(b)在pH 1,4,8和12时,组氨酸的净电荷分别是多少?将每一pH下的组氨酸置于电场中,它们将向阴极还是阳极迁移?6.某种溶液中含有三种三肽:Tyr-Arg-Ser,Glu-Met-Phe和Asp-Pro-Lys,α-COOH 基团的pKα为3.8;α-NH3基团的pKα为8.5。

在哪种pH(2.0,6.0或13.0)下,通过电泳分离这三种多肽的效果最好?7.利用阳离子交换层析分离下列每一对氨基酸,哪一种氨基酸首先被pH7缓冲液从离子交换柱上洗脱出来。

(a)Asp和Lys;(b)Arg和Met;(c)Glu和Val;(d)Gly和Leu;(e)Ser和Ala。

8.含有685个氨基酸残基的单一一条多肽链的蛋白质的近似相对分子质量是多少?9.氨基酸的定量分析表明牛血清白蛋白含有o.58%的色氨酸(色氨酸的相对分子质量为204)。

第三章氨基酸

第三章氨基酸

第三章氨基酸第3章氨基酸四大类生物分子中蛋白质是生物功能的主要载体,而氨基酸(amino acid)是蛋白质的构件分子。

自然界中存成千上万在的种蛋白质,在结构和功能上的惊人的多样性归根结底是由20种常见氨基酸的内在性质造成的。

这些性质包括①聚合能力,②特有的酸碱性质,③侧链的结构及其化学功能的多样性,④手性。

本章主要讲述这些性质,它们是讨论蛋白质和酶的结构、功能以及许多其他有关问题的基础。

一、氨基酸—蛋白质的构件分子(一)蛋白质的水解一百多年前就开始了关于蛋白质的化学研究。

在早期的研究中,水解作用提供了关于蛋白质组成和结构的极其价值的资料。

蛋白质可以被酸、碱或蛋白酶催化水解。

在水解过程中,逐渐降解成相对分子质量越来越小的肽段(peptide fragment),直到最后成为氨基酸的混合物。

根据蛋白质的水解程度,可分为完全水解和部分水解两种情况。

完全水解或称彻底水解,得到的水解产物是各种氨基酸的混合物。

部分水解即不完全水解,得到的产物是各种大小不等的肽段和氨基酸。

下面简略地介绍酸、碱和酶3种水解方法及其优缺点:⑴酸水解常用H2SO4或HCl进行水解。

一般6mol/L HCl,4mol/L H2SO4;回流煮沸20h左右可使蛋白质完全水解。

酸水解的优点是不引起消旋作用(racemization),得到的是L-氨基酸。

缺点是色氨酸完全被沸酸所破坏,羟基氨基酸(丝氨酸及苏氨酸)有一小部分被分解,同时天冬氨酸和谷氨酰胺的酰胺基被水解下来。

⑵碱水解一般与5mol/L NaOH共煮10~20h,即可使蛋白质完全水解。

水解过程中多数氨基酸遭到不同程度的破坏,并且产生消旋现象,所得产物是D-和L-氨基酸的混合物,称消旋物(见本章氨基酸的光学活性部分)。

此外,碱水解所需时间较长。

因此酶法主要用于部分水解。

常用的蛋白酶有胰蛋白酶(trypsin)、胰凝乳蛋白酶或称糜蛋白酶(chymotrypsin)以及胃蛋白酶(pepsin)等,它们主要用于蛋白质一级结构分析以获得蛋白质的部分水解产物。

专业课生物化学第三章 氨基酸

专业课生物化学第三章 氨基酸
是一个很强的亲核基团,与烃化试剂如甲基碘容 易形成锍盐。
此反应可被巯基试剂逆转
6、半胱氨酸侧链上的巯基:
反应性能很高,在微碱性条件下,巯基发生解离形 成硫醇阴离子(-CH2-S-),能与卤化烷例如碘乙酸,碘 乙酰胺,甲基碘等迅速反应,生成相应的稳定烷基衍 生物。
半胱氨酸的巯基能打开乙撑亚胺,即氨丙啶的环.
第3章:氨基酸
第一节:氨基酸的结构与分类
第二节:氨基酸的酸碱化学
第三节:氨基酸的化学性质
第四节:氨基酸的光学活性和光谱性质
第一节(一):氨基酸的结构
一、氨基酸—— 组成蛋白质的基本单位
1、酸水解: 盐酸或硫酸回流煮沸20小时。 不引起消旋作用,得到L-氨基酸。色氨酸完全被破坏;羟基氨 基酸、天冬酰胺、谷胺酰胺部分被破坏。 2、碱水解:氢氧化钠共煮10—20小时。 产物是D型和L型氨基酸的混合物。产生消旋现象。多数氨基酸 遭到破坏。色氨酸稳定。 3、酶水解: 胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶水解。 不产生消旋作用,也不破坏氨基酸。水解不彻底。
反应中1分子的半胱氨酸引起1分子的硫硝基苯甲酸的 释放。它在pH8.0时,在412nm波长处有强烈的光吸收, 因此可利用比色法定量测定-SH基。
二硫键的形成和打开 1、二硫键的形成
在痕量的金属离子如Cu2+,Fe2+,C02+和Mn2+ 存在下,巯基在空气中氧化显著提高。这些离子 可能是反应所需的催化剂。
3. 碱性氨基酸(+)
1、非极性R基(中性-非极性氨基酸)
共8种氨基酸,4种带脂肪烃侧链的氨基酸;2种含芳香环 氨基酸;1种含巯基氨基酸和1种甘氨酸。它们在水中的溶 解度比极性氨基酸小。
2、不带电荷的极性R基(中性-极性氨基酸)

生物化学第3章氨基酸

生物化学第3章氨基酸

5.两个巯基氧化成二硫键
(蛋白质形成二、三级结构时)
6.蛋白质中二硫键的氧化和还原
反应一
胱氨酸 Cystine
反应二
(蛋白质结构研究)
7.蛋白质中二硫键的被DTT还原
二硫苏糖醇 DTT
(蛋白质结构研究)
五、氨基酸的光学活性 和光谱性质
氨 基 酸 的 相 对 构 型
苏氨酸的4种光学异构体
部分氨基酸的比旋光度
R基pKa 3.86(βCOOH) 4.25(γCOOH) 12.48(胍基) 10.53(εNH3+) 6.00(咪唑基)
8.33(SH) 10.07(OH)
pI 2.97 3.22 10.76 9.74 7.59 5.02 5.66
反应的结果减弱 了氨基的碱性
甘氨酸的氨基与甲醛的反应
由于加甲 醛与氨基酸的 氨基反应,减 弱了氨基的碱 性,使得滴定 终点向中性pH 偏移,由pH12 左右降低到 pH9 左 右 , 正 好是酚酞指示 剂的变色区域。
义为:光通过1cm光径时1Mol / L溶质对该波长光的吸 收值。
六、氨基酸混合物的分析分离
蛋白质的水解
(1)酸水解:用6 mol/L HCl或4 mol/L H2SO4回流20h左右可 使蛋白质完全水解。酸水解不引起消旋作用,得到的是L-氨基 酸。但色氨酸被完全破坏,丝氨酸和苏氨酸有一小部分被分解, 同时天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基被水解下来。
不带电荷的极 性R基氨基酸
甘氨酸 丝氨酸 苏氨酸 半胱氨酸 酪氨酸 天冬酰胺 谷氨酰胺
带正电荷的R 基氨基酸
赖氨酸 精氨酸 组氨酸
带负电荷的R 基氨基酸
天冬氨酸 谷氨酸
不常见蛋白质氨基酸Ⅰ
不常见蛋白质氨基酸Ⅱ
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氨基酸的甲醛滴定
由于甲醛能与氨基酸中的由于甲醛能与氨基酸中的-NH2 作用形成作用形成NHCH2OH、-N(CH2OH)2 等羟甲基衍生物,使氨基 OH、 酸向解离出H 酸向解离出H+ 的方向移动,表现为酸性增强,碱 性减弱(约2 性减弱(约2~3个pH单位)。 pH单位)。
五、氨基酸的化学反应
四、氨基酸的两性解离
酸 性 氨 基 酸 的 滴 定 曲 线
碱 性 氨 基 酸 的 滴 定 曲 线
Glu是酸性氨基酸,其解离形式为:
等电点时,Glu主要以两性离子(Glu±)存在, 〔 Glu+〕和〔 Glu-〕很小,且相等, Glu2-的量 可忽略不计。 故: pI=(pK1′+ pKR′)/2 =(2.19+4.25)/2 = 3.22
第三章 氨基酸
一、氨基酸的结构
共同特点: 1.除脯氨酸外,在α-C上皆有一个氨基; 2. 均为L-氨基酸; 3. 除甘氨酸外,均有手性碳。
二、 氨基酸的分类
修饰的氨基酸 (Modified amino acids)
三、氨基酸的一般物理性质
① 能结晶,晶形多种多样; ② 熔点高(>200℃); ③ 味道各异; ④ 除甘氨酸外,均有旋光性,蛋白质中的氨 基酸均为L-型,细菌中有D-型氨基酸; ⑤ 在近紫外光区(220nm-300nm),只有Tyr、 Phe和Trp三种氨基酸有光吸收能力,最大 吸收值在280nm左右;
碱法
加6mol/LNaoH,密封于 ①能完全水解或不完全 6mol/LNaoH,密封于 小试管,置110℃ 小试管,置110℃水解若 水解, 水解, 干小时 ② Trp不被破坏, Trp不被破坏,
③ 水解液较清亮. 水解液较清亮.
酸法
加5Mol/LHCl,密封于小 5Mol/LHCl,密封于小 试管, 110℃ 试管,置110℃水解若干 小时
(2) 半胱氨酸的巯基:
a 和碘乙酸反应 b 和各种金属形成络合物; c 和Ellman‘试剂反应,用于-SH的定量测定; Ellman‘试剂反应,用于-SH的定量测定; d 巯基的氧化
(3) 胱氨酸的二硫键:
能被氧化剂(如过甲酸)及还原剂( 能被氧化剂(如过甲酸)及还原剂(如巯 基乙醇、二硫苏糖醇DTT)打开。 基乙醇、二硫苏糖醇DTT)打开。
阴离子交换树脂(含碱性基团),如:
-N(CH3)3OH (强碱性) -NH3OH (弱碱性) 可解离出OH-,溶液中的阴离子 能与其交换而结合在树脂上
分离氨基酸混合物常用强酸型阳离子交换树脂: 分离氨基酸混合物常用强酸型阳离子交换树脂:
用碱处理交换柱,树脂变成Na+型,调氨基酸混合物 至pH2-3,使氨基酸变成阳离子,与Na+交换而挂在树脂上。 结合牢固程度取决于: 静电引力 (主) 疏水相互作用 (次) pH3时,静电引力大小: 碱性AA(R2+) >中性AA(R+) >酸性AA(R0) 洗脱顺序: R0 (先) R+ (次) R2+ (后) 同时考虑疏水 作用影响: 疏水性较大的AA 与树脂的作用力> 疏水性较小的 AA与树脂的作用力
两种因素综合影响的洗脱顺序: 两种因素综合影响的洗脱顺序: Asp→Thr→Ser →Glu Asp→Thr→Ser →Glu → Pro → Gly →Ala →Cys →Val → Met →Ile → Leu →Tyr →Phe →Lys →His→Arg →Lys
氨基酸自动分析仪
蛋白质的水解
Lys是碱性氨基酸,其解离情况是: Lys是碱性氨基酸,其解离情况是:
依理可推得 pI=( pI=(pK2′+ pKR′)/2 =(8.95+10.53)/2 8.95+10.53) = 9.74
Handerson-Hasselbalch公式: Handerson-Hasselbalch公式:
pH=pK′+ lg 〔质子受体〕 质子受体〕 〔质子供体〕 质子供体〕
有水,属分配层 析;若无水,则 属于吸附层析
薄层层 析
纸 层 柱 层 析 析
薄 层 层 析柱Leabharlann 层 析 示 意 图离子交换层析
以人工合成的高分子化合物( 以人工合成的高分子化合物(如苯乙烯-苯二乙烯 树脂) 树脂)做支持物,其上交联着可交换的阳离子或阴离子。 阳离子交换树脂(含酸性基团),如:
-SO3H (强酸型) -COOH (弱酸型) 可解离出H+,溶液中的阳离 子与其交换而结合在树脂上
备注
分配柱 层析柱中的填充 又称洗脱剂, 物(如硅胶、纤 为与水不互溶 依靠物质在两 层析 纸层析
维素) 维素)上吸附的 或微溶的有机 相中的分配系 水 溶剂 数不同而得以 彼此分开 支持物(滤纸) 支持物(滤纸)上 又称展开剂, 吸附的水 为与水不互溶 或微溶的有机 溶剂 若固定相上吸附 硅胶、氧化铝 同纸层析
水解方 法
操作
优点
缺点
①水解作用强烈, 水解作用强烈, 大部分氨基酸 被破坏, 被破坏, ②发生外消旋作 用 ① Trp被破坏, Trp被破坏, ②Asn.Gln脱去酰 Asn.Gln脱去酰 胺氨基, 胺氨基, ③水解液呈黑色. 水解液呈黑色. ① 水解不完全, 水解不完全, ②不宜用来制备 分离氨基酸。
1. 与茚三酮的反应 与茚三酮的反应
用纸层析、柱层析等方法把各种氨基酸分离 后,利用茚三酮可以对各种氨基酸进行定性定量 测定。
2.
氨基酸的α 氨基酸的α-氨基的反应
⑴ 亚硝酸反应
该方法的应用: a. 是Van Slyke法定量测定氨基酸含量的方法之一; b. 可用于测定蛋白质的水解程度;
(2)与酰化试剂反应 氨基酸的氨基与酰化试剂作用生成酰 胺衍生物。
分配层析: 1. 待分离的样品中的各组分彼此的分配系 数不同, 这是先决条件; 2. 分配系数大的组分沿流动相移动的速度 比分配系数小的组分快; 分配系数Kd= 分配系数Kd= C
C流动相
固定相
有效分配系数Keff= 有效分配系数Keff=
C流动相×V流动相 C固定相×V固定相
层析技术
固定相
流动相
①能完全水解, 能完全水解, ②大部分氨基酸不被破 坏, ③不发生外消旋. 不发生外消旋.
酶法
用蛋白酶 酶解样品
①氨基酸不被破坏, 氨基酸不被破坏, ②不发生外消旋, 不发生外消旋, ③水解条件温和. 水解条件温和.
氨 基 酸 与 苯 异 硫 氰 酸 酯 的 反 应 该反应是多肽的氨基酸自动测序的基础, 又称Edman反应。
3. 4.
αα-羧基的反应 氨基和羧基共同参与的反应
5. R基参加的反应 R基参加的反应
(1) 酪氨酸的酚基和组氨酸的咪唑基: 酪氨酸的酚基和组氨酸的咪唑基:
Pauly反应 Pauly反应
六、氨基酸的分析和分离
氨基酸分析、分离的基本方法是各种层析 技术,包括柱层析、纸层析和薄层层析, 都是 基于氨基酸的酸碱性或极性的不同达到分离的 目的的。 各种分配层析技术的共同之处是都有两相: 固定相和流动相,两相互不相溶或溶解度很小。 各种氨基酸在两相中有各自特定的分配系数, 彼此因各不相同而在层析过程中得以彼此分开, 实现分离和分析的目的。差别越大越容易分开。
酰化试剂在多肽和蛋白质的人工合 成中用于对-NH2的保护。
(3) 烃基化反应
在弱碱条件下,烃基试剂发生亲核反应,取代了在弱碱条件下,烃基试剂发生亲核反应,取代了NH2的一个H。 的一个H
DNFB能与蛋白质或多肽的N-末端自由氨基 (-NH2)反应,水解后能得到与DNP相连的末端氨 基酸。结合薄层层析,可用于N-末端氨基酸的定 性鉴定。该反应又称为Sanger反应。
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