南京工业大学生物信息学期末考试
生工类1301-3《生物信息学》考试说明
时间：第17 周周五（6 月17 日）上午3-4 节
地点：厚学201
题型：（开卷）名词解释5题20分，单项选择题10题20分，综合分析题4题60分。重点：可参考以下课后题
● 2.2 何为一级数据库？有哪些一级数据库？
一级数据库属于档案数据库，库中的主要内容是来源于实验室操作所得到的原始数
据结果；一级数据库：核酸序列数据库GenBank、EMBL、DDBJ及蛋白质数据库
PDB(protein data bank)。
● 2.3 二级数据库、三级数据库等是指什么样的数据库？
二级数据库是在一级数据库的信息基础上进行了计算加工处理并增加了许多人为的
注释而构成的。例如，NCBI的RefSeq数据库，其mRNA 序列式综合了GenBank
中来源于同一物种相同基因的所有Mrna序列信息的一致性序列；而公共数据库中
大多数的蛋白质序列是将核苷酸序列中的编码序列区域进行蛋白质翻译后，通过后
续的一些计算分析，主观的人为地为序列加上蛋白质产物名称及功能注释。
三级数据库：参考书本P16页
● 2.6 请查阅资料，了解序列信息的标准数据存放格式：FASTA、
NBRF/PIR、GDE 和Raw。
书10页到11页
● 2.8 GenBank 数据库中的 GenBank 条目包含哪些内容？请结合
GenBank 中的一条具体的序列信息加以说明。
书17页到19页
● 2.12 蛋白质序列数据库有哪些？
书22页
● 2.13 Uniprot 数据库分哪几个层次？
书22页，分为三个层次。
一是Uniprot Knowledgebase（Uniprot KB）它涵盖大量人工注释的蛋白质信息，包括功能、分类以及数据库的交叉引用等；
二是Uniprot Archive（Uniparc）力图收集最完整、最全面的蛋白质序列数据，
不过数据没有加以注释整理，只给出了相关序列的来源；
三是Uniprot Reference Clusters（UniRef），是将UniParc中的序列数据依据不
同的参数条件去除冗余后得到的结果。
● 2.14 UniProtKB/SwissProt 和 UniProtKB/TrEMBL 有何关联？
书23页
SwissProt提供了最全面和可靠的注释信息，被称为是蛋白质序列数据的“黄金标
准”；TrEMBL是为了在不降低SwissProt高水平注释质量的同时，又能使经由测
序和翻译获取的蛋白质序列数据得以尽快地发布，作为SwissProt数据库的补充。
● 3.1 序列比对在什么情况下选择核苷酸序列？在什么情况选择蛋白
质序列？
书51页
核苷酸序列：在确认给定DNA序列和DNA数据库中的序列的一致性时。在搜索多
态性时。在分析所克隆的cDNA片段的一致性时。
蛋白质序列：由于蛋白质序列比DNA所含信息多，所以除以上情况外用蛋白质序
列。
● 3.2 请比较同源性、相似性和一致性三个概念。
书51页到53页
同源性：是指从某个共同祖先经趋异进化而形成的不同序列，也就是从一些数据中
推断出的两个基因在进化上具有共同祖先的结论，是质的判断。
一致性：是指两序列在同一位点核苷酸或氨基酸残基完全相同的序列比例。
相似性：两序列间直接的数量关系，如部分相同，相似的百分比或其他一些合适的
度量。
● 3.4 在进化过程中，两条同源蛋白质序列之间会产生分歧的突变有
哪些？
书P54
替换、插入、删除
替换：发生于一个突变导致的一种氨基酸的密码子变成另一种氨基酸的密码子时，
在比对结果中显示为同一位置上出现两个不同的氨基酸。
插入和删除：发生于残基添加或消除时，比对中由一单点表示（.），加在一条或另
一条序列中。插入和删除（即使只有一个字符长度）都被认为是比对中的空位
● 3.13 查阅资料了解BLAST 比对程序家族的主要程序，如何选择？
● 3.15 如何寻找远缘相关的蛋白质？
PSI-BLAST是位点特异性迭代BLAST，用来寻找远缘相关的蛋白质序列，对于蛋白
质的相似序列的寻找比常规blastp更敏感。
PSI-BLAST工具的比对步骤为：
（1）用blastp在目标数据库中进行比对搜索；
（2）从第一步中获得的结果构建多序列对比，根据多序列比对构建一个位点特异性矩阵PSSM；
（3）用第二步获得的PSSM矩阵再一次搜索目标数据库；
（4）位点特异性反复比对后用缺失比对的参数检验每个匹配的统计显著性；反复执行2~4步，一般要重复5次，而当新的结果不再出现或者程序明确指出不会再有新
的结果出现时，可以停止比对循环。
● 3.16 如何利用 BLAST 来发现新基因？
（1）用一个已知序列蛋白质开始TBLAST比对，搜索一个DNA数据库；
（2）检查结果：寻找与已知蛋白质，相关蛋白质的DNA序列匹配，非显著序列的
匹配；
（3）进行BLASTX NR或BLASTP NR比对
（4）用你新发现的DNA或蛋白质搜索一个蛋白质数据库来证实是否真的发现一个
新的基因或蛋白质。
● 4.3 什么是外显子？什么是内含子？
外显子：是真核生物基因的一部分，他在剪接后仍会被保存下来，并可在蛋白质生
物合成过程中被表达为蛋白质。
内含子：是一个基因中非编码DNA片段，他分开相邻的外显子。内含子是阻断基
因线性表达的序列。
● 4.6 基因预测方法有哪些？
书本P107
基于表达数据的基因预测、基于机器学习方法的基因预测
基于表达数据的基因预测方法主要是利用基因产物（包括cDNA、EST以及蛋白
质等）反推基因结构。
基于机器学习方法的基因预测主要是通过挖掘基因组序列以及各类证据以及各类证
据数据信息中蕴含的基因结构特征，并建立数据模型进行基因结构预测。
● 4.7 什么是 EST 序列？如何利用 EST 序列预测基因？
EST：完整mRNA转录物的片段。
把来自不同克隆的EST拼接起来形成完整的cDNA弥补其数量缺少的情况
利用PASA程序软件将聚类的转录物片段（全长cDNA和EST）拼接成最大对比片
段得到完整地或者部分的基因结构，并获得更多的可变剪切的信息
● 5.3 什么是系统发生树？
在研究生物进化和系统分类中，常用一种类似树状分支的图形来概括各种（类）生
物之间的亲缘关系，这种树状分支的图形称为系统发生树。
● 5.5 构建系统发生树有哪两类方法？
P131
一类是基于距离的方法，也直接称为基于距离法
另一类是基于字母特征的方法
● 5.8 分子系统发生分析常用的软件有哪些？
（1）PHYLIP。（2）PAUP。（3）MEGA。（4）TREE-PUZZLE。（5）MrBayes。
（6）PhyML。
● 6.1 提供了蛋白质结构的检索和查询服务的数据库主要有哪些？
PDB数据库、DSSP数据库、 HSSP数据库 SCOP CATH
● 6.2 简要说明四个层次的蛋白质结构。
（一）一级结构
蛋白质的一级结构（primary structure）是指多肽链的氨基酸残基的排列顺序。
（二）二级结构
蛋白质二级结构（secondary structure）是指多肽链主链原子借助于氢键沿一维方
向排列成具有周期性的结构构象，是多肽链局部的空间结构（构象）主要有α螺旋、
β折叠、β转角、无规卷曲等形式
（三）超二级结构、结构域
超二级结构（supersecondary structure）是指相邻的二级结构单元组合在一起，
彼此相互作用，排列形成规则的、在空间结构上能够辨认的二级结构组合体，同时
充当三级结构的构件，基本形式有αα、ββ、βαβ等。
（四）三级结构
三级结构（tertiary structure）是指整条多肽链的三维结构，包括骨架和侧链在内
的所有原子的空间排列。
（五）四级结构e
四级结构（quat rnary structure）指在亚基和亚基之间通过疏水作用等次级键结合
成为有序排列的特定的空间结构。
● 6.4 PDB 收录了哪些实验类型的结构数据？
X射线晶图谱法，核磁共振法，电子显微镜二维晶体三维结构
● 6.6 蛋白质结构家族分类数据库主要有哪些？
SCOP，CATH，FFSP
● 6.8 蛋白质结构分析主要包含哪些方面？
组织层次、结构测定及预测，蛋白质折叠
● 6.9 如何进行蛋白质结构比对？有那些常用的结构比对工具？
首先对两个蛋白质结构定义结构相似部分（或称共同子结构）；然后通过多次迭代
策略来调整共同子结构，直到找出优化的结构比对，即找到两个蛋白质空间上最大
的重叠部分。DALI方法、 CE方法、 STRUCTURAL方法、 SSM方法、 TM-
align方法
● 6.13 同源建模方法预测蛋白质结构的基本步骤有哪些？
1、模板的选择
2、待测序列与模板序列的比对
3、同源模型的建立
4、同源模型精修和评估
●7.2 常用的蛋白质序列分析和功能预测方法有哪几类？
书171页
大致分为四类：
1. 基于序列或结构的分析方法（sequence and structure based methods），
又称进化方法，这类方法基于全局或局部序列或者结构上的保守性来预测蛋白质功
能。
2.基于基因组上下文的方法，又称比较基因组方法，分别基于结构融合事件、系统
进化特征谱、保守的基因顺序、表达谱以及共调控等预测蛋白质功能。
3.基于相互作用的方法，又称细胞方法，利用蛋白质相互作用数据预测功能
4.基于过程的方法，又称代谢方法，利用生物化学路径的结构化网络来匹配蛋白质
的非典型反应。
●7.6 基于序列相似性预测蛋白质功能的主要依据是什么？其基本步
骤有哪些？
P171
大致分为四类：
1. 基于序列或结构的分析方法（sequence and structure based methods），
又称进化方法，这类方法基于全局或局部序列或者结构上的保守性来预测蛋白质功
能。
2.基于基因组上下文的方法，又称比较基因组方法，分别基于结构融合事件、系统
进化特征谱、保守的基因顺序、表达谱以及共调控等预测蛋白质功能。
3.基于相互作用的方法，又称细胞方法，利用蛋白质相互作用数据预测功能
4.基于过程的方法，又称代谢方法，利用生物化学路径的结构化网络来匹配蛋白质
的非典型反应。
●7.7 已注释的蛋白质序列数据库主要有哪些？
P178
已注释的蛋白质序列数据库有很多，如SwissProt、TrEMBL、NRDB（nr)、
GenPept、PIR-PSD、PIR-NREE、NRL-3D和EXProt等。
●10.8 什么是单核苷酸多态性（SNP）？
指分散于基因组中的单个碱基的差异，包括单个碱基的缺失和插入，但更常见的是
单个核苷酸的替换。
2020年南京工业大学有机化学期末试卷
一：命名下列化合物或写出其结构：（10） C H 3C H 3CH 3 1 NH CH 3 O CH 3 2 CH 3 O 3 CH 3 SO 3H CH 3 C H 3Br 5 CHCH 2COOH CH 3 CH 3 OH NO 2 H OH CH 3 3 Br CH 3 8 O COOH 9 10. CH 3 二：完成下列反应（30 ） CH 3CH 2C= CH 2 CH 3 Br + 2, Cl 2 高温 OCH 2CH 3
+ 5, KM nO4 H2C C H C H3 (CH 3 ) 2 CHCHCH 3 OH NaOH 3 CH 2 CHCH(CH 3 ) 2 Cl 稀 (2)水 9,CH3CH2CH2CHO NaOH 4 10 O Cl+OH (CH3)2CHCHO Br2C2H 5 OH 干HCl 11. CH3 12+KM nO4 + O +2Br2 13 NH O KOH CH3CH2OH CH3CHBrCH3 14 NaNO2, HCl NH2 0-5℃ OH 15.
三：排序（10 ） 1．将下列化合物对亲电取代反应的容易程度排列成序 OH CHO Br 2．比较下列醇与卢卡氏试剂反应的相对速率的大小 CH 2OH CH 3 C H 33 OH C H 3CH 3 3．将下列化合物中羰基与同一亲核试剂加成反应的活性大小排列成序 C H 3CHO C H 3CHO CH 3 C H 3CH 3 O 4．比较下列羧酸的酸性 COOH COOH COOH COOH 3H NO 2 Cl 5． 比较下列卤代烃按S N 2反应的速度大小 CH 3CH 2CH 2CH 2Br (CH 3)3C Br CH 3CH 2CHBr CH 3 四、区别下列各组化合物：（6） 1 C H 3CH 3 CH C H 3C H 3CH 3 2 苯甲醛 苯甲酮 3－己酮 五 用化学方法分离下列各组化合物（6） OH CH 2OH 1 2 乙醚 乙烷 六 用指定的原料合成下列各化合物（小分子试剂任选）（20） 1．以丙烯为主要原料合成1-氯-2,3-二溴丙烷
生物信息学期末考试重点
第一讲 生物信息学（Bioinformatics）是20世纪80年代末随着人类基因组计划的启动而兴起的一门新型交叉学科，它体现了生物学、计算机科学、数学、物理学等学科间的渗透与融合。 生物信息学通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析，达到揭示数据所蕴含的生物学意义从而解读生命活动规律的目的。 生物信息学不仅是一门学科，更是一种重要的研究开发平台与工具，是今后进行几乎所有生命科学研究的推手。 生物技术与生物信息学的区别及联系 生物信息学的发展历史 ?人类基因组计划（HGP） ?人类基因组计划由美国科学家于1985年提出，1990年启动。根据该计划，在2015年要把人体约4万个基因的密码全部揭开，同时绘制出人类基因的谱图，也就是说，要揭开组成人体4万个基因的30亿个碱基对的秘密。HGP与曼哈顿原子弹计划和阿波罗计划并称为三大科学计划，被誉为生命科学的登月计划。(百度百科) 随着基因组计划的不断发展，海量的生物学数据必须通过生物信息学的手段进行收集、分析和整理后，才能成为有用的信息和知识。换句话说，人类基因组计划为生物信息学提供了兴盛的契机。上文所说的基因、碱基对、遗传密码子等术语都是生物信息学需要着重研究的地方。 ：
】 第二讲回顾细胞结构 细胞是所有生命形式结构和功能的基本单位 细胞组成 细胞膜主要由脂类和蛋白质组成的环绕在细胞表面的双层膜结构 细胞质细胞膜与细胞核之间的区域：包含液体流质，夹杂物存储的营养、分泌物、天然色素和细胞器 细胞器细胞内完成特定功能的结构：线粒体、核糖体、高尔基体、溶酶体等 细胞核最大的细胞器 DNA的结构 碱基（腺嘌呤A、鸟嘌呤G、胞嘧啶C、胸腺嘧啶G） 。 核苷酸 核苷酸是构成DNA分子的重要模块。每个核苷酸分子由一分子称作脱氧核糖的戊 糖（五碳糖）、一分子磷酸和一分子碱基构成。每种核苷酸都有一个碱基对，也就 是A、T、C、G 基因是什么 基因是遗传物质的基本单位 基因就是核苷酸序列。 大部分的基因大约是1000-4000个核苷酸那么长。 基因通过控制蛋白质的合成，从微观和宏观上影响细胞、组织和器官的产生。 基因在染色体上。
南京工业大学材料力学期末考试复习题及答案
南京工业大学 材料力学期末考试复习题及答案 配高等教育出版社第五版 一、填空题： 1.受力后几何形状和尺寸均保持不变的物体称为。 2.构件抵抗的能力称为强度。 3.圆轴扭转时，横截面上各点的切应力与其到圆心的距离成比。 4.梁上作用着均布载荷，该段梁上的弯矩图为。 5.偏心压缩为的组合变形。 6.柔索的约束反力沿离开物体。 7.构件保持的能力称为稳定性。 8.力对轴之矩在情况下为零。 9.梁的中性层与横截面的交线称为。 10.图所示点的应力状态，其最大切应力是。 11.物体在外力作用下产生两种效应分别是。 12.外力解除后可消失的变形，称为。 13.力偶对任意点之矩都。 14.阶梯杆受力如图所示，设AB和BC段的横截面面积分别为2A和A，弹性模量为E，则杆中最大正应力 为。 15.梁上作用集中力处，其剪力图在该位置有。 16.光滑接触面约束的约束力沿指向物体。 17.外力解除后不能消失的变形，称为。 18.平面任意力系平衡方程的三矩式，只有满足三个矩心的条件时，才能成为力系平衡的 充要条件。 19.图所示，梁最大拉应力的位置在点处。
20.图所示点的应力状态，已知材料的许用正应力[σ]，其第三强度理论的强度条件是。 21.物体相对于地球处于静止或匀速直线运动状态，称为。 22.在截面突变的位置存在集中现象。 23.梁上作用集中力偶位置处，其弯矩图在该位置有。 24.图所示点的应力状态，已知材料的许用正应力[σ]，其第三强度理论的强度条件是。 25.临界应力的欧拉公式只适用于杆。 26.只受两个力作用而处于平衡状态的构件，称为。 27.作用力与反作用力的关系是。 28.平面任意力系向一点简化的结果的三种情形是。 29.阶梯杆受力如图所示，设AB和BC段的横截面面积分别为2A和A，弹性模量为E，则截面C的位移为 。 30.若一段梁上作用着均布载荷，则这段梁上的剪力图为。 二、计算题： 1.梁结构尺寸、受力如图所示，不计梁重，已知q=10kN/m，M=10kN·m，求A、B、C处的约束力。 2.铸铁T梁的载荷及横截面尺寸如图所示，C为截面形心。已知I z=60125000mm4，y C=157.5mm，材料许用压应力[σc]=160MPa，许用拉应力[σt]=40MPa。试求：①画梁的剪力图、弯矩图。②按正应力强度条件校核梁的强度。
南京工业大学生物化学期末试题和详细答案
南京工业大学考试试题 2005级生物化学期中考试试题 一、填空题（每空1分） 1、鉴别醛糖、酮糖、核糖、糖原和淀粉可采用、和反应进行鉴别。 2、胆固醇在体内可转变为哪些活性物质______ 、____ 和______ 。 3、绝大多数水溶性维生素作为酶的辅酶或辅基成分，在物质代谢中起重要作用。泛酸的活性形式为，是酶的辅酶；维生素B6的活性形式 为，是酶的辅酶；烟酰胺（Vit PP）的活性形式为和，核黄素（Vit B2）的活性形式为和，均可作为酶的辅酶；维生素D的活性形式为，主要功能是。 4、维持DNA双螺旋结构稳定的主要因素是____ __，其次，大量存在于DNA分子中的弱作用力如_____ ，_____ 和_____ 也起一定作用。 5、tRNA分子的3’—末端的结构是____ 。 6、DNA变性后，紫外吸收______，粘度______、浮力密度______，生物活性将______。 7、在20种氨基酸中，酸性氨基酸有_________和________两种，具有羟基的氨
基酸是________和_________，能形成二硫键的氨基酸是__________。 8、氨基酸与茚三酮发生氧化脱羧脱氨反应生成______色化合物，而________与茚三酮反应生成黄色化合物。 9、今有A、B、C三种蛋白质，它们的等电点分别为8.0、4.5和10.0,当在pH 8.0缓冲液中，它们在电场中电泳的情况为：甲___ __，乙___ __，丙 _____ __。 10、影响酶促反应速度的因素有____ 、____ _、___ __、___ _和 ___ _等。 二、名词解释（每题5分） 1、第二信使学说 2、增色效应与减色效应 3、蛋白质变性与沉淀 4、玻耳（Bohr）效应 5、酶的活性中心 三、问答题：（每题8分，第4题10 分） 1、写出磷脂酰甘油的通式，并指出4种磷脂酶的作用位点。 2、简述蛋白质的各级结构及主要作用力。 3、以葡萄糖为例，解释单糖溶液的变旋现象。 4、DNA双螺旋结构与蛋白质α-螺旋结构各有何特点？
南京工业大学有机化学期末试卷3
一．命名或写出结构式（12题×1分＝12分）： CH 3CH 2CH(CH 3)CHCH 2CH 2CH 3 CH(CH 3)2 CH 3 OH COCH 3 H 2C H 3C C COOCH 3 NOH SO 3H NO 2 O O O C H 2N H 3C H NH O C CH 3CH 3 O N O C H CH 2 H 2 C Cl 二、填空（每个空格填一个答案）（28分） 1、 ( ) ( ) ( ) ( ) H 3O+ CH 3CH 2CH 2CN SOCl 2 (CH 3)2NH LiAlH 4
2、 LiAlH 4CH 3CH 2CH 2CHO HCN OH-稀NaHSO 3 NHNH 2NO 2 O 2N Zn-Hg,HCl 干HOCH 2CH 2OH Cl H ( ) ( ) ( ) ( )( ) ( ) ( ) 4、 ( ) ( ) ( ) NH O O NaOH KOH BrCH 2COOCH 2CH 3 OH-O H 2 NaOH/H 2O Cl HNO 3,H 2SO 4 5 Cl Zn, HOAc 6 O 3 H 2O (1)(1) CH 3I N Ag 2O 7
8 H 2O, H (1)B 2H 6(2)H 2O 2, NaOH NaOH Cl OH CH 3OH 9 2 NO 2 Br Fe/HCl Br 2 /H 2 O (CH 3 CO) 2 O 稀盐酸 10 三、用化学方法区别下列各组化合物（10分） A) CH 3(CH 2)3NH 2 B) (CH 3CH 2CH 2)2NH C) (CH 3CH 2)3N 1. A) CH 3CH 2CH 2CH 2Br B) CH 3CHBrCH 2CH 3 C) (CH 3)3CBr 2. 四、简要回答问题（10分） 1．写出下述反应的机理： CH 2OH H ++
最新生物信息学考试复习
——古A．名词解释 1. 生物信息学：广义是指从事对基因组研究相关的生物信息的获取，加工，储存，分配，分析和解释。狭义是指综合应用信息科学，数学理论，方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据的科学。 2. 基因芯片：将大量已知或未知序列的DNA片段点在固相载体上，通过物理吸附达到固定化（cDNA芯片），也可以在固相表面直接化学合成，得到寡聚核苷酸芯片。再将待研究的样品与芯片杂交，经过计算机扫描和数据处理，进行定性定量的分析。可以反映大量基因在不同组织或同一组织不同发育时期或不同生理条件下的表达调控情况。 3. NCBI：National Center for Biotechnology Information.是隶属于美国国立医学图书馆（NLM）的综合性数据库，提供生物信息学方面的研究和服务。 4. EMBL：European Molecular Biology Laboratory.EBI为其一部分，是综合性数据库，提供生物信息学方面的研究和服务。 5. 简并引物：PCR引物的某一碱基位置有多种可能的多种引物的混合体。 6. 序列比对：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列。
7. BLAST：Basic Local Alignment Search Tool.是通过比对(alignment)在数据库中寻找和查询序列(query)相似度很高的序列的工具。 8. ORF：Open Reading Frame.由起始密码子开始，到终止密码子结束可以翻译成蛋白质的核酸序列，一个未知的基因，理论上具有6个ORF。 9. 启动子：是RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必须的一段DNA序列。原核生物启动子由上游调控元件和核心启动子组成，核心启动子包括-35区（Sextama box）TTGACA，-10区（Pribnow Box）TATAAT，以及+1区。真核生物启动子包括远上游序列和启动子基本元件构成，启动子基本元件包括启动子上游元件（GC岛，CAAT盒），核心启动子（TATA Box，+1区帽子位点）组成。 10. motif：模体，基序，是序列中局部的保守区域，或者是一组序列中共有的一小段序列模式。 11. 分子进化树：通过比较生物大分子序列的差异的数值重建的进化树。 12. 相似性：序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相似DNA碱基或氨基酸残基序列所占的比例。 13. 同源性：两个基因或蛋白质序列具有共同祖先的结论。
南京工业大学硕士材料科学基础真题02~10年
一、是非题 3. 2 3T图中的临界冷却速度大，则意味着容易形成玻璃，而析晶困难。 3．2 3T图中的临界冷却速度越大，则意味着熔体越容易形成玻璃。 BL．2鲍林规则适用于共价键的晶体结构。 BL．2鲍林规则适用于所有的晶体结构。 BL．2玻璃在常温下能长期稳定存在，因而它是热力学稳定态。 CV. 2 CVD法制备的非晶态硅也具有玻璃的四个通性。 CZ．1存在4根3次轴的晶体必定属于立方晶系。 DD. 1大多数固相反应是由扩散速度所控制的。 DD．2大多数固相反应是由界面上的化学反应速度所控制的。 DJ．1低价阳离子饱和的粘土，其δ一电位高于高价阳离子饱和的粘土。 DY. 2对于相同的体系，非均匀成核速率≤均匀成核速率。 DZ. 1等轴晶系的对称特点是具有4根3次轴。 FH．2非化学计量化合物结构缺陷也是一种杂质缺陷。 FK．1菲克定律是从宏观统计的角度，定量描述了质点的扩散行为。 FK．2菲克扩散定律是根据微观扩散特点与规律而总结得出的。 GR．2固溶体是一种溶解了杂质组分的非晶态固体。 GS．2硅酸盐晶体结构中，按硅氧四面体排列方式的变化，桥氧数可由1～4变化。GS．2硅酸盐熔体的粘度随碱金属氧化物含量的增加而迅速增大。 GX．2固相反应速度与反应物的浓度成正比。 HX．2化学组成不同的晶体其结构也一定不同。 JG. 2金刚石结构是立方面心格子，所以金刚石中的碳是按立方密堆形式排列的。JL．2晶粒生长与再结晶过程与烧结过程(即烧结一开始)是同时进行的。 JM．1晶面在三个坐标轴上的截距之比一定为一简单的整数比。 JP．1晶胚的临界半径r k随着△T的增大而减小。 JT. 2晶体中的热缺陷只有当温度高于某个值时才能形成。 KS．2扩散过程的推动力是浓度梯度。 LW．1螺位错的位错线平行于滑移方向。 NT．1粘土泥浆的触变性是由于粘土泥浆中存在不完全胶溶。 RW．1刃位错的位错线垂直于滑移方向。 SJ．2烧结过程的推动力是晶界能大于表面能。 SJ．2烧结是一个包含了多种物理和化学变化的过程。 SY．2三元相图中的三元无变量点都有可能成为析晶结束点。 TX．2体系中的质点发生扩散时，质点总是从高浓度处向低浓度处扩散。 WG．1微观对称要素的核心是平移轴。 XB．1相变过程是一个物理过程。 XT．1相图表示的是体系的热力学平衡状态。 YB．1一般能够实际进行的纯固相反应是放热的。 YD．1杨德尔方程比金斯特林格方程的适用范围小。 YD．2杨德尔方程比金斯特林格方程的适用范围大。 YX．2有序一无序转变是指晶体与非晶体之间的转变。 YY．2有液相存在的烧结过程称为液相烧结。 ZD．2在低温时，一般固体材料中发生的扩散是本征扩散。 ZE. 2在二元系统相图中至少存在一个二元无变量点。 ZG. 1在各种层状硅酸盐晶体结构中，其晶胞参数a0和b0的值大致相同。 ZG．2在固液界面的润湿中，增加固体表面的粗糙度，就一定有利于润湿。 ZH. 1在宏观晶体中所存在的对称要素都必定通过晶体的中心。 ZH. 2在宏观上具有规则的几何外形是晶体的本质。 ZH．1在宏观晶体中进行对称操作时晶体的中心点是不动的。 ZH．1在宏观晶体中只存在32种不同的对称型。
全国高校的生物学科实力排名
清华大学12 摩擦学国家重点实验室 汽车安全与节能国家重点实验室 智能技术与系统国家重点实验室 微波与数字通信技术国家重点实验室 新型陶瓷与精细工艺国家重点实验室 电力系统及发电设备控制和仿真国家重点实验室 化学工程国家重点联合实验室(萃取分离分室) 精密测试技术及仪器国家重点实验室(清华大学分室) 集成光电子学联合国家重点实验室(清华大学实验区) 生物膜与膜生物工程国家重点实验室((膜生物物理分室) 环境模拟与污染控制国家重点联合实验室(清华大学分室) 水沙科学与水利水电工程国家重点实验室(筹) 一碳化学与化工国家重点实验室(清华大学分室)(评估为差，已摘牌)煤的清洁燃烧技术国家重点实验室(评估为差，已摘牌) 浙江大学10 硅材料国家重点实验室 工业控制技术国家重点实验室 现代光学仪器国家重点实验室 能源清洁利用国家重点实验室 流体传动及控制国家重点实验室 计算机辅助设计与图形学国家重点实验室 水稻生物学国家重点实验室(浙江大学分室) 化学工程国家重点联合实验室(聚合反应工程实验室) 植物生理学与生物化学国家重点实验室(浙江大学分室) 传染病诊治国家重点实验室(筹) 北京大学10 湍流与复杂系统研究国家重点实验室(曾评估为差，经整改未摘牌)稀土材料化学及应用国家重点实验室 天然药物及仿生药物国家重点实验室 人工微结构和介观物理国家重点实验室 蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室 分子动态及稳态结构国家重点实验室(北京大学分室) 生物膜与膜生物工程国家重点实验室(北京大学分室) 环境模拟与污染控制国家重点联合实验室(北京大学分室) 区域光纤通信网与新型光通信系统国家重点实验室(北京大学分室) 核物理与核技术国家重点实验室(筹) 文字信息处理国家重点实验室(评估为差，已摘牌) 暴雨监测与预防国家重点实验室(评估为差，已摘牌) 视觉与听觉信息处理国家重点实验室(评估为差，已摘牌) 南京大学6
生物信息学期末考试重点
1、生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解 释等各方面的学科，也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和计 算机科学相结合形成的一门新学科。它通过综合利用生物学，计算机科学和信息技 术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。 2、数据库（Database）是按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库，它产生于 距今六十多年前，随着信息技术和市场的发展，特别是二十世纪九十年代以后， 数据管理不再仅仅是存储和管理数据，而转变成用户所需要的各种数据管理的方 式。数据库有很多种类型，从最简单的存储有各种数据的表格到能够进行海量数 据存储的大型数据库系统都在各个方面得到了广泛的应用。 3、表达序列标签从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短 的cDNA 部分序列，代表一个完整基因的一小部分，在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等，平均长度为360 ±120bp。EST 来源于一定环境下一个组织总 mRNA 所构建的cDNA 文库，因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。 4、开放阅读框是基因序列中的一段无终止序列打断的碱基序列，可编码相应的蛋白。 ORF识别包括检测六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的 DNA序列而其内部不包含启动子或终止子，符合这些条件的序列有可能对应一个 真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编 码基因的部分或全部的先决条件。 5、蛋白质的一级结构在每种蛋白质中氨基酸按照一定的数目和组成进行排列，并进 一步折叠成特定的空间结构前者我们称为蛋白质的一级结构，也叫初级结构或基 本结构。蛋白质一级结构是理解蛋白质结构、作用机制以及与其同源蛋白质生理 功能的必要基础。 6、基因识别是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别 DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因， 也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。基因识别是基 因组研究的基础。
材料专业全国排名
材料物理与化学是一门以物理、化学和数学等自然科学为基础，从分子、原子、电子等 多层次上研究材料的物理、化学行为与规律，致力于先进材料与相关器件研究开发的学 科。 材料学以理论物理、凝聚态物理和固体化学等为理论基础，应用现代物理与化学研究方法和计算技术，研究材料科学中的物理与化学问题，着重研究材料的微观组织结构和转变规律，以及他们与材料的各种物理、化学性能之间的关系，并运用这些规律改进材料性能，研制新型材料，发展材料科学的基础理论，探索从基本理论出发进行材料设计，着重现代物理和化学的新概念、新方法在材料研究中的应用。 材料加工工程 主要研究内容涉及高分子材料的加工成型原理、工艺学，先进复合材料制备科学与成型技术、原理，无机非金属材料的加工技术及原理，先进的聚合物加工设备设计学，弹性体配合与改性科学，高分子材料的反应加工技术、原理，高分子材料改性科学与技术等方面。 材料专业全国排名 材料专业全国排名 材料学（160） 排名学校名称等级排名学校名称等级排名学校名称等级 1 清华大学A+ 1 2 四川大学 A 2 3 燕山大学 A 2 西北工业大学A+ 1 3 山东大学 A 2 4 吉林大学 A 3 北京科技大学A+ 1 4 武汉理工大学 A 2 5 上海大学 A 4 上海交通大学A+ 1 5 西安交通大学 A 2 6 重庆大学 A 5 哈尔滨工业大学A+ 1 6 北京化工大学 A 2 7 大连理工大学 A 6 同济大学A+ 1 7 北京工业大学 A 2 8 湖南大学 A 7 东北大学A+ 18 中国科学技术大学 A 29 华中科技大学 A 8 北京航空航天大学A+ 19 天津大学 A 30 昆明理工大学 A 9 浙江大学 A 20 东华大学 A 31 北京理工大学 A 10 华南理工大学 A 21 南京理工大学 A 32 武汉科技大学 A 11 中南大学 A 22 合肥工业大学 A B+等(48个)：南京大学、东南大学、武汉大学、复旦大学、西安建筑科技大学、河北工业大学、兰州理工大学、郑州大学、南京工业大学、西安理工大学、厦门大学、电子科技大学、江苏大学、中国石油大学、太原理工大学、华东理工大学、哈尔滨工程大学、陕西科技大学、西南交通大学、广东工业大学、哈尔滨理工大学、苏州大学、青岛科技大学、湘潭大学、青岛大学、福州大学、华侨大学、陕西师范大学、天津工业大学、湖北大学、南京航空航天大学、长春理工大学、沈阳工业大学、长安大学、武汉工程大学、南昌大学、中国地质大学、河南科技大学、安徽工业大学、暨南大学、中国矿业大学、景德镇陶瓷学院、内蒙古科技大学、河海大学、大连交通大学、西南科技大学、长春工业大学、浙江理工大学
仪器分析复习重点南京工业大学生物与制药工程学院.doc
仪器分析重点提要 GC 1、GC仪和HPLC仪在结构原理上有何异同？ 答：同：气源→→色谱柱→检测器→记录仪 进样 异：（1）气源用气泵或贮气瓶供气；（2）要让被测样品组分充分气化，相关通路中应具备高温（100~400℃）环境。 2、能够在GC上检测的化合物，应具哪些主要的理化特性？ 答：具有易挥发性、高温不分解、不能与载气发生反应。 3、GC常用载气有哪些？ 答：N2、H2、Ne 4、固定相、吸附剂、担体、固定液有何异同？常见的气-固吸附色谱有哪些？常见的担体、固定液有哪些？ 答：一、固定相主要分二大类：（1）固体固定相（2）液体固定相 气-固（吸附）色谱固定相吸附剂分类： 吸附剂（1）非极性吸附剂：如活性炭 （2）极性吸附剂：如硅胶、氧化铝、分子筛等 气-液色谱（分配色谱）固定相（1）固定液（2）惰性担体 担体：又称为载体，是一种化学惰性的多孔固体颗粒，作用是提供惰性表面，支持固定液，使固定液以薄膜状态分布在其表面。 二、常见的气-固吸附色谱 （1）非极性吸附剂：如活性炭 （2）极性吸附剂：如硅胶（较强极性）、活性氧化铝（弱极性）、分子筛等 三、常见的担体有：（1）硅藻土型（红色硅藻土白色硅藻土） （2）非硅藻土型 常见固定液 第一类：非极性固定液 多数是饱和烷烃，如：异角鲨烷。固定液和组分分子间的作用力是色散力，主要用于分离烃类和非极性化合物 第二类：弱极性固定液 主要是含甲基的硅氧烷类。固定液和组分分子间的作用力为色散力。 第三类：中等极性固定液 种类多、应用广，如硅氧烷（OV－17）等 5、GC检测器可分为哪几种类型（英文缩写），其工作原理是什么？哪些属于浓度型检测器，哪些属于质量型检测器？ 答：（1）热导池检测器（TCD） 检测原理：基于不同的物质有不同的导热系数 （2）（氢）火焰离子化检测器（FID） 原理：根据气体的导电率与该气体中所含带电离子的浓度呈正比这一事实而设计的。 一般情况下，组分蒸汽不导电，但在能源作用下，组分蒸汽可被电离生成带电离子而导电。 （3）电子捕获检测器（ECD）
南京工业大学有机化学1
一、根据结构式命名或写出下列化合物的结构式（本大题共10小题，每小题1分，共10分） 二、单项选择题(本大题共15小题，每小题1分，共15分) 在每小题列出的四个备选项中只有一个是符合题目要求的，请将其代码填写在题后的括号内。错选、多选或未选均无分。 1. 下列各组化合物不属于同分异构体的是（A）。 A. 乙醇和乙醚 B. 环丙烷和丙烯 C. 环戊烯和戊炔 D. 1，3-丁二烯和丁炔 2. 下列化合物中若按S N1反应,反应速度最快的是（ D ） A. 1-溴丁烷 B. 2-溴丁烷 C. 2-甲基-2-溴丁烷 D. 2-甲基-3-溴丁烷 3. 下述卤代烃中发生S N2反应速度最快的是（ C ）。
4. 下列化合物中不属于Lewis酸的是（A）。 A. 硫酸 B. 三氯化铝 C. 三氟化硼 D. 氯化锌 5. 下列化合物中与硝酸银溶液作用最快的是（A）。 A. 氯化苄 B. 氯苯 C. 溴苯 D. 氯乙烯 6. 化合物HOOCCH（OH）CH（OH）COOH中含有手性碳原子个数为（ B ）。 A. 1个 B. 2个 C. 3个 D. 4个 7. 下列化合物硝化反应速度最快的是（ C ）。 A. 硝基苯 B. 氯苯 C. 甲苯 D. 苯 8. 用卢卡氏试剂可鉴别下列哪组化合物?（A） A. 叔丁醇与丙醇 B. 苯与甲苯 C. 环己烷与己烯 D. 乙烯与乙炔 9. 能与2,4-二硝基苯肼反应生成黄色沉淀，但不能发生银镜反应和碘仿反应的是（ D ）。 A. 丁醛 B. 2-丁醇 C. 2-丁酮 D. 3-戊酮 10. 甲苯与氯气在光照下进行反应的反应机理是（ C ）。 A. 亲电取代 B. 亲核取代 C. 自由基取代 D. 亲电加成 11. 我们常用下列哪种试纸判断重氮化反应的终点。（ C ） A. PH试纸 B. 刚果红试 C. 淀粉-碘化钾试纸 D. 石磊试纸 12. 下列乙酸衍生物中最容易发生水解反应的是 ( D )。 A. 乙酸乙酯 B. 乙酸酐 C. 乙酰胺 D. 乙酰氯 13. 下列化合物中酸性最强的是（ B ）。 A. 苯酚 B. 氯乙酸 C. 冰醋酸 D. 对硝基苯酚 14. 下述含氮化合物中碱性最强的是（A）。 A. 甲胺 B. 苯胺 C. 乙酰胺 D. 四丁基溴化铵 15. 下述手性化合物中互为对映异构体的一组是（ B ）。
生物信息学试题复习参考(张弓)
2014-2015学年生物信息学期末考试题 写在前面：这是我考试时候写的答案的大致内容，具体文字我已经不记得了，给大家一个参考，希望对大家复习有帮助。因为我也是扣了很多分，所以答案也有很多错的，大家不要尽信。祝大家考试顺利。 一、实验设计和基础分析 以下qPT-PCR实验方案有哪些错误？请标出错误，并说明原因和写出正确方案。 目的：比较肺癌细胞迁移前后的X基因转录水平表达量 方法：（1）用Trizol法提取细胞总RNA，并用跑胶、OD260/280等方法确认无降解。 （2）用poly-dT引物进行反转录 （3）设计基因特异性PCR引物，用qPCR仪测定X基因和GAPDH基因的Ct值。GAPDH作为内参。 （4）以2^-ΔΔCt方法计算X基因相对于GAPDH的相对含量 （5）比较迁移前后的相对表达量，做三个重复，用t-test进行统计检验，P<0.05为差异显著 1.错误：不能用GAPDH基因作为定量标准；原因：癌症迁移前后GAPDH基因的表达量已经改变了，做定量标准不准确；方案：采用外参（如：其他物种的基因） 2.错误：不能用t-test进行统计检验；原因：t-test进行统计检验的前提是数据呈正态分布，基因表达量不一定呈正太分布；方案：将数据取log10，对数化。 上述两个是我考试时候写的答案，后来经提醒：还发现了一个错误：不能用poly-dT引物进行反转录；原因：。。。。。。；方案：用Oligodt进行逆转录。 二、双序列比对的生物学意义解释 两种细菌的同源蛋白质endonuclease III，长度都为200氨基酸左右，其功能相同，蛋白质序列使用BLAST 可以比对上，同源性高达57%，但其编码DNA序列用BLAST却无法比对上，为了尽可能提高亲缘关系较远的序列的比对效率，比对已经使用BLAST网站上Somewhat similar sequence选项，默认参数（见下图）：
南京工业大学材料科学基础试卷
南京工业大学材料科学基础试卷 班级:__________ 学号:_________ 姓名:__________ 一. 名词解释：（12分） 1. 网络形成体 2. 烧结 3. 一级相变 4. 弗仑克尔缺陷 5. 反尖晶石结构 6. 萤石结构 二. 填空：（28分） 1. 1. 空间群为Fm3m的晶体结构属于晶族，晶系。 2. 2. 晶胞是___________________________________________。 3. 3. 硅酸盐晶体分类的依据是______________________。按此分类法可将硅酸盐矿物分为：结构、结构、结构和结构。 4. 4. 当12mol％的MgO加入到UO2 晶格中形成置换型固溶体，试写出其缺陷反应方程式，其固溶式为。 5. 5. 由于的结果，必然会在晶体结构中产生“组分缺陷”，组分缺陷的浓度主要取决于：和。 6. 6. 在玻璃性质随温度变化的曲线上有二个特征温度_______________和______________，与这二个特征温度相对应的粘度分别为_____________和________________。 7. 7. 玻璃具有下列通性：、、 和。 8. 8. 粘土荷电的主要原因有：、 和。 9. 9. 马氏体相变的特征有__________________、_______________、________________和________________。 10. 10.本征扩散是由____________________________而引起的质点迁移，本征扩
散的活化能由_____________和_____________两部分组成。 11. 11.熔体的析晶过程分二步完成，先是__________________，然后是_____________过程。均匀成核的成核速率Iυ由_________________因子和_________________因子所决定的。 12. 烧结的主要传质方式有：________________、_______________、________________和__________________四种，这四种传质过程的坯体线收缩ΔL/L与烧结时间的关系依次为____________、___________、_____________和_____________。 三. 选择题：（20分） 1. 1. 晶体结构中一切对称要素的集合称为（）。 a.对称型 b.点群 c.微观对称的要素的集合 d.空间群 2. 2. 在ABO3(钙铁矿)型结构中，B离子占有________。 a.四面体空隙 b.八面体空隙 c.立方体空隙 d.三方柱空隙晶体 3. 3. 非化学计量化合物Cd1+xO，由于在化学组成上偏离化学计量而产生的晶格缺陷是（）。 a.阴离子空位 b.阳离子空位 c.阴离子填隙 d.阳离子填隙 4. 4. 粘土泥浆胶溶必须使介质呈（） a. 酸性 b. 碱性 c. 中性 5. 5. 对于下列化合物表面能最小的是（） a. CaF2 b. PbF2 c. PbI2 d. BaSO4 e. SrSO4 6. 6. 在下列几类晶体中，形成间隙型固溶体的次序是（）。 a. 沸石＞CaF2＞TiO2＞MgO b. MgO＞TiO2＞CaF2＞沸石 c. CaF2＞TiO2＞MgO＞沸石 d. TiO2＞MgO＞CaF2＞沸石 7. 7. 在CaO—Al2O3—SiO2系相图中，有低共熔点8个、双升点7个、鞍形点9个，按相平衡规律该系统可划分成（）分三角形。 a. 8个 b. 7个 c. 9个 d. 15个 e. 22个 8. 8. 在扩散系数的热力学关系中，称为扩散系数的热力学因子。在非理想混合体系中：
南京工业大学有机化学期末试卷2
一：命名下列化合物（10） 1. F Br I Cl H 3C C O N CH 3CH 3 2 3 CH 3 NO 2 NO 2 O 2N 4 5. 6. COOCH 3 7 NH 2 HOOC 8 SO 3H 3 9. OH HO OH 10. 3 H 3C 二：完成下列反应（30） H 3C H C CH 2 H 2C H C H C CH 2 1NBS + Cl 2 光 2, CH C H 3[A g (N H 3)2]N O 3 3 O OH 4. SOCl 2CH 3OH
+ 5, KMnO4 H2C CHCH3 6 NaOH溶液 7, OH CH3CH2CHCH3 C2H5OH NaOH 8 稀 (2)水9,CH3CH2CH2CHO4 O N H2 CH3 +N a O H+Br2 10 (CH3)2CHCHO Br2CH3OH 干HCl 11. CH3 O H 2 O 12 13, NH O KOH C2H5OH CH3CHBrCH3 14 NaNO2, HCl NH 2 0-5℃ 15.
三：排序（10 ） 1．将下列化合物对亲电取代反应的容易程度排列成序 NO2Cl H CH3 2．比较下列化合物的碱性（气态条件下） 氨甲胺二甲胺 3．将下列化合物中羰基与同一亲核试剂加成反应的活性排列成序 COCH 3 CH 3CH 2 CHO CH3COCH3 4．比较下列化合物的酸性 C6H5OH CH3COOH ClCH2COOH 5.比较下列卤代烃按S N1反应的速度大小 CH 3CH 2 CH 2 CH 2 Br(CH3)3C Br CH3CH2CHBr CH 3 四、区别下列各组化合物：（6） 1 丙烷，丙烯，丙炔 22-丁醇苄醇正丙醇 五用化学方法分离下列各组化合物（10） 1.苯、苯酚 2. 2—丁醇与2—丁酮 六立体化学问题：用R/S标出下列手性碳原子的构型（4分） H3C C Cl Br C H C2H5 C3H7 2 3 3 HBr 6 H5 3
中国科学院大学生物信息学期末考试资料,陈润生老师
生物信息学期末考试复习 1.生物学中的7个数学故事 (1) 孟德尔遗传定律（分离和自由组合定律）运用了组、合原理中的加法原理和乘法原理。 (2) Hardy-Weinberg遗传平衡定律通过构造数学关系式来证明。 (3)基因在染色体上的线性排列采用概率分布优化距离的计算距离，使其更接近真实情况。 (4)关联分析通过假设检验看两个特征的关联有无统计显著性。 (5) 序列比对设计合适的算法可以有效降低计算复杂度。 (6)基因组学和其他的组学组学时代产生的大量数据需要依赖数据库技术来寻找生物分子之间的关联。 (7)微阵列芯片大规模芯片数据需要数据挖掘：聚类、关联、预测建模、异常检测。 2. DNA、protein、RNA序列比对及其算法 序列比对：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列。常用的方法有：点阵法，动态规划算法，k-tup 算法等。 （1）dotplot算法：通过点阵作图的方法表示，能很直观地氨基酸序列或核苷酸序列上的插入、删除、重复和反相重复。 算法步骤：将两条序列的碱基（或残基）分别沿x轴和y轴排列，依次比较两条序列的每个碱基（或残基），如果两个碱基（或残基）相同则在矩阵中填充点，这样就形成一个点矩阵。在点矩阵中，将对角线上的点连接起来，这些直线所对应的矩形区域就是这两条序列的相似性片段。 算法特点：该算法相似性片段实际上是相同的片段；而且不能提供相似性片段在统计学意义上的相似性。 （2）动态规划算法：分为全局动态规划算法和局部动态规划算法。保证了指定打分模型的情况下，两条序列能获得尽可能的最高分 算法步骤：①初始化序列矩阵；②将序列输入矩阵，计算分数并绘制箭头；③用箭头回溯找到最优得分路径；④连接最优路径，产生序列比对。 动态规划算法优缺点： 优点：对于一个给定的计分函数集合，能找到最优的比对 缺点：时间复杂度为O(n 2)，运行慢，计算所需的内存与序列长度的平方成正比，因此不适用于非常长序列的比对。 序列比对的定义，存在哪几种算法，打分矩阵是什么意思 序列比对：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列; 算法种类：动态规划算法、Smith-Waterman Alterations算法、FASTA - Hi Level Algorithm 算法、BLAST – Heuristic算法； 打分矩阵：通过点矩阵对序列比对进行积分，根据不同物质情况可分为DNA序列打分矩阵：等价矩阵、转换-颠换矩阵、blast矩阵；蛋白质打分矩阵：等价矩阵、遗传密码矩阵、疏水性矩阵、PAM矩阵、BLOSUM矩阵。 1.动态规划算法，给个表格可以把数字填出：
南京工业大学有机化学考前模拟试卷整理集(吐血整理必做)
水平测试一 一、用IUPAC 命名法命名下列化合物（10分）： 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 二、是非题（正确的打“√”，错误的打“×”）（10分）： 1. 含有手性碳的化合物都有光学活性。--------------------------------------------------（ ） 2．共轭效应通过共轭体系传递，是一种长程的电效应，即其作用强度在共轭体系中几乎不受距离的影响；诱导效应通过σ 键传递，是一种短程的电效应，即其作用强度随距离远离而急剧减弱。-----------------------------------------------------------------------------------------（ ） 3．共轭体系π 电子数符合4n+2的，该化合物具有芳香性。-----------------------（ ） 4．亲核取代反应和消除反应是一对竞争反应，提高反应温度往往更有利于得到消除产物。-----------------------------------------------------------------------------------------------------（ ） 5．α-D-吡喃葡萄糖和β-D-吡喃葡萄糖是一对对映异构体，也是一对差向异构体。--------------------------------------------------------------------（ ） 6．变旋现象是指一种右旋转变成左旋，或左旋转变成右旋的旋光性发生改变的现象。例如右旋的蔗糖水解变成左旋的转化糖有此现象。---------------------------------------------（ ） 7．自由基反应是一种连锁反应，其反应机理总是经过链引发、链增长和链终止三个阶段。发生自由基反应的一般情形有：自由基引发剂催化、光照或高温加热等。 --------------------------------------------------------------------（ ） 8．硝基是极强的间位定位基，硝基苯与乙酰氯在三氯化铝催化下发生的亲电取代反应可高产率地得到间硝基苯乙酮。----------------------------------------------（ ） 9. 在立体化学中S 表示左旋，R 表示右旋。------------------------------（ ） C = C C H 3C H 2C H (C H 3)2C H 3 C H 2C H 2C H 3 C H 3 C H 3C H C H 3 C H 3C H 2C H C H 2C H 2C C H 2C H 3C H 3 C H 2=C H C ≡C H H C H 3 C H 3 N O 2 O H N O 2 N O 2 O 2N O C H 3C C H 2C C H 3O O NH O O
生物信息学考试试卷
一、名词解释(每小题4分,共20分) 1、生物信息学 广义：生命科学中的信息科学。生物体系和过程中信息的存贮、传递和表达；细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程的中各种生物信息。 狭义：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用。 2、人类基因组计划 人类基因组计划准备用15年时间，投入30亿美元，完成人类全部24条染色体的3×109脱氧核苷酸对(bp)的序列测定，主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立及转录图谱的绘制)、测序和基因识别。其中还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序，以及信息系统的建立。作图和测序是基本的任务，在此基础上解读和破译生物体生老病死以及和疾病相关的遗传信息。 3、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的序列 4、基因 基因--有遗传效应的DNA片断,是控制生物性状的基本遗传单位。 5、中心法则 是指遗传信息从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA，即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。 6 、DNA序列比较 序列比较的根本任务是：（1）发现序列之间的相似性；（2）辨别序列之间的差异 目的： 相似序列 相似的结构，相似的功能 判别序列之间的同源性 推测序列之间的进化关系 7、一级数据库 数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释 8、基因识别 基因识别，是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA 序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。 9、系统发生学 系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系。 10、基因芯片 基因芯片（gene chip），又称DNA微阵列（microarray），是由大量cDNA或寡核苷酸探针密集排列所形成的探针阵列，其工作的基本原理是通过杂交检测信息。