奶山羊AGPAT6基因多态性与生长性状的关联分析
山羊GnRHR和ESR基因多态性及其与繁殖力的关联分析的开题报告
山羊GnRHR和ESR基因多态性及其与繁殖力的关联分析的开题报告1. 研究背景山羊是重要的畜牧动物之一，其肉、奶、毛等资源对人类具有重要的经济价值。
而繁殖力是影响山羊产业发展的重要因素之一。
研究山羊繁殖相关基因多态性以及其与繁殖力的关联，可以为山羊遗传改良及繁殖技术的提高提供科学依据。
2. 研究内容本研究将选取山羊GnRHR和ESR基因，利用PCR-RFLP技术对其多态性进行分析，并分别进行基因频率、基因型及等位基因分布分析。
同时，选择一定数量的母羊，对其生殖性能参数进行测定，如孕率、产子率、断奶指标等，并分析其与GnRHR和ESR基因多态性之间的关联。
3. 研究目的（1）研究山羊GnRHR和ESR基因的多态性；（2）分析山羊GnRHR和ESR基因多态性与繁殖性能之间的关联；（3）探讨山羊繁殖相关基因的遗传规律，为山羊遗传改良提供科学依据。
4. 研究意义（1）为山羊繁殖技术提供指导：研究山羊繁殖相关基因与繁殖性能之间的关联，有助于鉴定优良母羊和选配优良公羊，提高山羊繁殖技术水平；（2）为山羊遗传改良提供科学依据：研究山羊繁殖相关基因的遗传规律，有助于针对性地进行山羊的种质改良，提高山羊的繁殖力水平；（3）为其他家畜动物繁殖基因研究提供借鉴：山羊GnRHR和ESR基因多态性及其与繁殖力的关联分析，为其他家畜动物繁殖基因的研究提供了一定的借鉴意义。
5. 研究方法（1）样本采集与处理：选取一定数量的山羊，采集其血液样品，进行DNA提取。
（2）PCR-RFLP分析：利用PCR扩增GnRHR和ESR基因特定区域，然后利用限制性核酸内切酶对PCR产物进行酶切，分析PCR-RFLP结果。
（3）繁殖性能参数测定：选取一定数量的母羊，测定其孕率、产子率、断奶指标等生殖性能参数。
（4）数据分析：统计分析PCR-RFLP结果及繁殖性能参数数据，得出基因频率、基因型及等位基因分布情况，并分析其与繁殖性能之间的关联。
6. 预期结果（1）成功分析山羊GnRHR和ESR基因多态性；（2）明确山羊GnRHR和ESR基因多态性与繁殖性能之间的关联；（3）丰富山羊繁殖相关基因的研究成果。
欧拉型藏羊Callipyge基因多态性与生长性状相关性研究
（ 肃 农 业 大 学 动 物 科 学 技 术 学 院 ， 肃 兰州 ７ ０ ７ ） 甘 甘 ３ ００
摘要 ： 用 Ｐ ＲＳＣ 利 Ｃ —Ｓ Ｐ方 法 ， ２ ５只 欧 拉 型 藏 羊 Ｃ ｌｉｙ ｅ 因序 列 的 多 态 性 进 行 了检 测 ， 分 析 了 ＡＡ 和 对 １ ａｌ ｇ 基 ｐ 并
Ａｂ ｔ ａ ｔ Ｔｈｅ ｇ ｎｅ ｉ ｏｌ ｍｏｒ ｈｉｍ ｆＣａｌ ｉ ｓｒ ｃ ： ｅ ｔｃ ｐ ｙ ｐ ｓ ｏ ｌｐｙｇｅｇｅ ｅ ｅ ｃ ｎ ２１ ｎｅ ｓ ｑｕ ｎ ｅ ｉ ５ Ｏｕｌ ｂ ｔ ｎ ｓ ｅ ｓ ｄ ｔ ｃ ａ Ｔｉ ｅ ａ ｈｅ ｐ ｗａ ｅ ｅ — ｔ ｄ ｗｉｈ ＰＣＲ— ｅ ｔ ＳＳＣＰ ｍ ｅ ｈｏ ａ ｔ ｏｒ ｅ ａ ｉ ｎｓ ｗｉｈ ｇ ｏｗｔ ｒ ｉｓ ｂｅ ｗｅ ｎ ＡＡ ｎｄ ＢＢ ｅ ｏｔ ｅ ｒ ｔ ｄ。 ｎｄ ｉｓ ｃ ｒ ｌ ｔｏ ｔ ｒ ｈ ｔ ａ ｔ ｔ ｅ ａ ｇ ｎ ｙｐ ｓ ｗｅ ｅ ａ ｌ ｓ ｄ．Ｔｈｅ ｒ ｓ ｔ ｎ ｃ ｔ ｄ ｔ ａ ｈｅ ｅ ｗｅ ｅ ｔ ｒ ｅ ｇ ｎｏ ｙ ｅ ａ ｈ ｎｏ ｙ ｃ ｆｅ ｅ ｃｅ ｎａ ｙ ｅ ｅ ｕｌｓ ｉ ｄｉａ ｅ ｈ ｔ ｔ ｒ ｒ ｈ ｅ ｅ ｔ ｐ ｓ， ｎｄ ｔ ｅ ｇｅ ｔ ｐｉ ｒ ｑｕ ｎ ｉ ｓ ｏｆＡＡ ， ＢＢ ａ ｎｄ ＡＢ ｒ ． ２３ ３， ． ０ ｎ １ ７ ４， ｅ ｐ ｃ ｉ ｌ ．Ｔｈｅ ｓ ｑｕ ｎｃｎ ｅ ｕ ｔ ｓ ｗｅ ｈａ ｈ ｍ ｐ ｉｉｄ ｗｅ ｅ ０ ８ ０ ０９ ３ ａ ｄ ０． ６ ｒ ｓ ｅ ｔｖｅｙ ｅ ｅ ｉ ｇ ｒ ｓ ｌ ｈｏ ｄ ｔ ｔｔ ｅ ａ ｌｆｅ ｆａ ｍ ｅ ｆＣａ ｌｐｙｇｅｇｅ ｓ ｃ ｕｓ ｄ ｂｙ Ｃ÷ Ｔ ｕ ａ ｉ ｎ ａ ｈｅ １ ６ ｂ ｏｓｔｏｎ Ｔｈｅｐｏ ｌ ｔｏ ｓ Ｈａ — ｒ ｇ ｎｔ ｏ ｌ ｉ ｎｅ ｗａ ａ ｅ ｍ ｔ ｔｏ ｔｔ ７ ｐ ｐ ｉｉ ． ｐｕ ａ ｉ ｎ ｗａ ｒ
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》范文
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》篇一蒙古羊与乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数关联性分析一、引言随着畜牧业的快速发展，对动物遗传资源的深入研究显得尤为重要。
蒙古羊和乌珠穆沁羊作为我国特有的畜禽品种，其遗传特性的研究对于提高其生产性能和育种工作具有重要意义。
BMP15基因作为影响动物繁殖性能的关键基因之一，其多态性对羊的产羔数有着重要影响。
本文旨在分析蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因的多态性及其与产羔数的关联性，为进一步优化育种方案提供理论依据。
二、研究方法本研究采用PCR-RFLP（聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性）技术，对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行多态性分析。
通过统计各基因型个体的产羔数，探讨BMP15基因多态性与产羔数之间的关联性。
三、结果与分析1. BMP15基因多态性分析通过对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行PCR-RFLP 分析，我们发现该基因存在多种基因型。
其中，蒙古羊的BMP15基因型主要为A、B、C三种，而乌珠穆沁羊的BMP15基因型主要为A、D两种。
各基因型在两个品种中的分布存在显著差异。
2. BMP15基因多态性与产羔数的关联性分析统计各基因型个体的产羔数发现，蒙古羊和乌珠穆沁羊中，不同BMP15基因型的个体产羔数存在显著差异。
具体来说，某些基因型的个体产羔数较高，而另一些基因型的个体产羔数较低。
进一步分析表明，BMP15基因多态性与产羔数之间存在显著关联性。
四、讨论本研究表明，蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因存在多种基因型，且各基因型在两个品种中的分布存在显著差异。
此外，BMP15基因多态性与产羔数之间存在显著关联性。
这表明BMP15基因可能是影响蒙古羊和乌珠穆沁羊产羔数的重要遗传因素之一。
在育种工作中，可以通过对BMP15基因的多态性进行检测，选育出产羔数较高的优良个体，进一步提高畜牧业的生產效益。
同时，本研究结果还表明，不同品种的羊在BMP15基因型分布和产羔数方面存在差异，这为进一步开展品种改良和育种工作提供了重要的理论依据。
绵羊FUT8基因多态性及其与生长性状的关联分析
绵羊FUT8基因多态性及其与生长性状的关联分析冯勉;尚明玉;毕亚珍;胡文萍;张莉【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2022(49)10【摘要】【目的】研究岩藻糖基转移酶8(fucosyltransferase 8,FUT8)基因g.74522417 C>T位点多态性及其对绵羊生长性状的影响,为绵羊分子育种筛选新的遗传标记。
【方法】采用Sequenom MassARRAY SNP分型技术、Illumina OvineSNP 600K BeadChip及Illumina OvineSNP 50K BeadChip芯片检测技术对湖羊(n=992)和乌珠穆沁羊群体(n=333)FUT 8基因g.74522417 C>T位点进行分型,并将其多态性与湖羊和乌珠穆沁羊的生长性状进行关联分析。
【结果】FUT 8基因g.74522417 C>T位点在乌珠穆沁羊和湖羊群体中均检测出3种基因型:CC、TC和TT。
群体遗传分析表明,g.74522417 C>T位点在乌珠穆沁羊和湖羊群体中均处于中度多态(0.25<PIC<0.50)。
卡方适应性检验结果表明,g.74522417 C>T位点在乌珠穆沁羊和湖羊群体中均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。
关联分析结果表明,FUT 8基因g.74522417 C>T位点与乌珠穆沁羊4月龄体长和6月龄体高均呈显著相关(P<0.05);与湖羊3月龄管围、5月龄腰角宽和管围、6月龄眼肌面积和管围均呈显著或极显著相关(P<0.05;P<0.01)。
【结论】FUT 8基因g.74522417 C>T位点可作为绵羊生长发育潜在分子标记,为FUT 8基因在绵羊分子育种中的应用提供参考。
【总页数】8页(P3838-3845)【作者】冯勉;尚明玉;毕亚珍;胡文萍;张莉【作者单位】中国农业科学院北京畜牧兽医研究所【正文语种】中文【中图分类】S813.3【相关文献】1.TXNRD1基因多态性与乌珠穆沁绵羊生长性状的关联分析2.三个绵羊品种LHX3基因多态性与生长性状的关联分析3.不同绵羊品种GHSR基因多态性与生长性状的关联分析4.绵羊MyoG基因内含子Ⅱ多态性及其与生长性状的关联分析5.绵羊IGF1R基因多态性及其与生长性状的关联分析因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》范文
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》篇一蒙古羊与乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数关联性分析一、引言随着现代畜牧业的快速发展，羊的品种和遗传特性研究逐渐成为畜牧科学研究的重要领域。
蒙古羊和乌珠穆沁羊作为我国重要的畜牧品种，其繁殖性能的遗传机制研究对于提高其产羔数、优化育种方案具有重要意义。
BMP15基因作为影响羊繁殖性能的关键基因之一，其多态性对羊的生殖系统发育及产羔数具有重要影响。
本文旨在分析蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因的多态性及其与产羔数的关联性，以期为提高这两种羊的繁殖性能提供理论依据。
二、材料与方法1. 样本采集本研究所用样本为蒙古羊和乌珠穆沁羊的精液、血液等遗传物质。
采集过程中严格按照采样规范进行，确保样本质量。
2. DNA提取与PCR扩增提取样本中的DNA，采用PCR技术对BMP15基因进行扩增。
3. 基因分型与多态性分析对PCR产物进行基因分型，分析BMP15基因的多态性。
4. 数据统计与分析收集产羔数等相关数据，采用统计学方法分析BMP15基因多态性与产羔数的关联性。
三、结果与分析1. BMP15基因多态性分析通过对蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因的PCR扩增及基因分型，发现该基因存在多种基因型和等位基因。
其中，某些基因型在两个品种中的分布存在显著差异。
2. BMP15基因多态性与产羔数的关联性分析统计两个品种的产羔数，分析BMP15基因多态性与产羔数的关系。
结果显示，某些BMP15基因型与较高的产羔数显著相关，而其他基因型则与较低的产羔数相关。
这表明BMP15基因多态性对产羔数具有重要影响。
3. 讨论BMP15基因作为影响羊繁殖性能的关键基因，其多态性对羊的生殖系统发育及产羔数具有重要影响。
本研究发现，蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因存在多种基因型和等位基因，且某些基因型与较高的产羔数显著相关。
这为优化育种方案、提高这两种羊的繁殖性能提供了理论依据。
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》范文
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》篇一蒙古羊与乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析摘要：本文通过对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行多态性分析，探讨了BMP15基因多态性与产羔数之间的关联性。
研究结果显示，BMP15基因在两种羊中存在明显多态性，并且这种多态性与产羔数具有显著的关联性，这为改良和选育高产品羔数的优质品种提供了重要参考依据。
一、引言随着畜牧业的快速发展，羊的品种选育和遗传改良成为了重要的研究领域。
BMP15基因作为影响羊繁殖性能的关键基因之一，其多态性对羊的产羔数具有重要影响。
蒙古羊和乌珠穆沁羊作为我国重要的畜牧品种，其繁殖性能的遗传机制研究对于提高其生产效率和经济效益具有重要意义。
因此，本文旨在分析蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因的多态性及其与产羔数的关联性。
二、材料与方法1. 实验材料选择健康的蒙古羊和乌珠穆沁羊作为实验对象，采集其血液样本用于基因组DNA的提取。
2. 方法（1）基因组DNA的提取：采用常规的DNA提取方法，从血液样本中提取基因组DNA。
（2）PCR扩增和测序：以提取的DNA为模板，进行PCR 扩增，对BMP15基因进行扩增，并对其产物进行测序。
（3）数据分析：对测序结果进行序列比对和分析，统计不同基因型在两种羊中的分布情况，分析BMP15基因多态性与产羔数的关联性。
三、结果与分析1. BMP15基因多态性分析通过对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行PCR扩增和测序，发现该基因存在明显的多态性。
在蒙古羊中，共发现三种基因型；而在乌珠穆沁羊中，亦发现三种不同的基因型分布。
2. BMP15基因多态性与产羔数的关联性分析统计两种羊的产羔数与BMP15基因型的关系，发现不同基因型在产羔数上存在显著差异。
具体而言，某些基因型在蒙古羊和乌珠穆沁羊中均表现出较高的产羔数。
这表明BMP15基因的多态性与产羔数具有显著的关联性。
波尔山羊PLAG1基因克隆、多态性鉴定及其与出生体重、体尺性状的关联分析
波尔山羊PLAG1基因克隆、多态性鉴定及其与出生体重、体尺性状的关联分析冯小品;李隐侠;张晨俭;张俊;孟春花;钱勇;曹少先【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2022(49)9【摘要】【目的】试验旨在研究多形性腺瘤基因1(plemorphic adenoma gene 1,PLAG1)基因序列特征、多态性以及对山羊出生体重、体尺的影响。
【方法】以波尔山羊为研究对象,克隆PLAG1基因序列并测序,采用实时荧光定量PCR鉴定其在不同年龄和体重波尔山羊组织中的表达模式,采用Western blotting方法检测PLAG1在不同体重羔羊腿肌中的表达水平,进一步筛选PLAG1基因CDS和3′-UTR区SNP,并分析各位点不同基因型与波尔山羊出生体重、体尺的相关性。
【结果】波尔山羊PLAG1基因CDS全长1 500 bp,编码499个氨基酸,PLAG1蛋白相对保守。
组织表达谱显示,PLAG1基因在出生体重较大的羔羊心脏、小肠和腿肌中表达水平显著或极显著高于出生体重较小的羔羊,在胎羊各组织中mRNA表达水平均显著或极显著高于成年母羊(P<0.05;P<0.01);PLAG1蛋白在出生体重较大的羔羊腿肌中表达量极显著高于出生体重较小的羔羊(P<0.01)。
在波尔山羊PLAG1基因3′-UTR区共筛选到6个SNPs位点,分别为:2664 A>G、2712 A>G、2721 T>C、2879 T>A、2990 A>T和3270 A>G。
关联分析发现,2664 A>G位点AG 基因型个体出生管围显著大于GG基因型(P<0.05);2721 T>C位点TT基因型个体出生体长显著大于TC基因型(P<0.05);2879 T>A位点TA基因型个体出生管围显著大于AA基因型(P<0.05);2990 A>T位点AA基因型个体出生体重显著高于AT 基因型(P<0.05);3270 A>G位点GG基因型个体出生体长显著大于AA基因型,AG基因型个体出生胸围显著大于AA基因型(P<0.05)。
山羊MyoG基因Csp6Ⅰ酶切多态性分析
第３ｌ卷第２期 ２００９年４月 江西农业大学学报
Ａｃｔａ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔａｔｉｓ Ｊｉａｎｇｘｉｅｎｓｉｓ Ｖｏ１．３１，Ｎｏ．２
Ａｐｒ．，２００９
文章编号：１０００—２２８６（２００９）０２—０３１７—０５
山羊ＭｙｏＧ基因Ｃｓｐ６Ｉ酶切多态性分析 刘铮铸，张文香，张传生，巩元芳 ，刘谢荣 （河北科技师范学院动物科学系，河北昌黎０６６６００） 摘要：采用限制性内切核酸酶Ｃｓｐ６Ｉ对山羊ＭｙｏＧ基因的９５９ ｂｐ扩增产物进行ＰＣＲ—ＲＦＬＰ多态性分析，检测 到３种基因型，其酶切位点分别由２种共显性基因控制；对该片段的纯合型（ＡＡ、ＢＢ）分别测序发现，ＢＢ型在 １７９１位点发生了Ｔ—Ｃ的突变。上述结果为首次试验证实山羊ＭｙｏＧ内含子二区域存在多态性。
关键词：山羊；ＭｙｏＧ；遗传多态性；ＲＦＬＰ；Ｃｓｐ６Ｉ 中图分类号：￥８２７．２ 文献标识码：Ａ
Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ＭｙｏＧ Ｇｅｎｅ Ｄｉｇｅｓｔｅｄ ｗｉｔｌｌ Ｃｓｐ６Ｉ ｉｎ Ｇｏａｔ ＬＩＵ Ｚｈｅｎｇ—ｚｈｕ，ＺＨＡＮＧ Ｗｅｎ—ｘｉａｎｇ， ＺＨＡＮＧ Ｃｈｕａｎ—ｓｈｅｎｇ，ＧＯＮＧ Ｙｕａｎ—ｆａｎｇ ，ＬＩＵ Ｘｉｅ—ｒｏｎｇ
（Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｈｅｂｅｉ Ｎｏｒｍａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅ＆Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｃｈａｎｇｌｉ ０６６６００， Ｃｈｉｎａ）
Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＭｙｏＧ ｇｅｎｅ ｉｎ ｇｏａｔ ｗａｓ ａｍｐｈｆｉｅｄ ａｎｄ ａｌｌ ｕｎｉｆｏｒｍ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｏｆ ９５９ｂｐ ｗａｓ ｏｂｔａｉｎｅｄ．Ｔｈｅ ９５９ｂｐ ＰＣＲ ｐｒｏｄｕｃｔ ｗａｓ ｄｉｇｅｓｔｅｄ ｗｉｔｈ ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ ｅｎｄｏｍｕｃｌｅａｓｅ Ｃｓｐ６Ｉ ａｎｄ ｇｅｎｅｔｉｃ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｗａｓ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄ ｂｙ ＰＣＲ—ＲＦＬＰ．Ｔｈｒｅｅ ｋｉｎｄｓ ｏｆ ｇｅｎｏｔｙｐｅｓ ｗｅｒｅ ｆｏｕｎｄ ｉｎ ｔｈｅｓｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ，ｗｈｉｃｈ ｗｅｒｅ ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｂｙ ｔｗｏ ａｌｌｅｌｅｓ． Ｔｈｅ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ｆｒａｇｍｅｎｔｓ ｏｆ ＡＡ ａｎｄ ＢＢ ｏｆ ｔｈｅ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｗｅｒｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｄ．Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ９５９ ｂｐ ＢＢ ｇｅｎｏｔｙｐｅ ｈａｄ ｏｎｅ ｍｕｔａｔｉｏｎ ａｔ １７９１ ｓｉｔｅ（Ｔ－－￣Ｃ）．Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ａｂｏｖｅ—ｍｅｎｔｉｏｎｅｄ ｈａｓ ｃｏｎｆｉｒｍｅｄ ｆｏｒ ｔｈｅ ｆｉｒｓｔ ｔｉｍｅ ｔｈａｔ ｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ ｉｎ ｉｎｔｒｏｎ ２ ｒｅｇｉｏｎ ｏｆ ＭｙｏＧ ｇｅｎｅ． Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ：ｇｏａｔ；ＭｙｏＧ；ｇｅｎｅｔｉｃ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ；ＲＦＬＰ；Ｃｓｐ６Ｉ
山羊APOL6基因克隆、生物学特征及组织表达分析
基因组学与应用生物学,2020年，第39卷，第11期，第5039-5044页研宄报告Research Report山羊4P0L6基因克隆、生物学特征及组织表达分析谢光杰1张亚楠u林亚秋^1西南民族大学畜牧兽医学院,成都，610041; 2西南民族大学，靑藏高原动物遗传资源保护与利用教育部_電点实验室,成都，610041*通信作者，丨****************摘要本实验室前期通过转录组测序发现基因在山羊(Co;;r<z肌内脂肪细胞分化前后存在差异表达。
因此，推测,4P0/4基因对山羊肌内脂肪沉积具有调控作用。
然而，关于山羊基因cD N A序 列特征和组织表达特性均不清楚。
因此本研究利用降落PCR(Touchdown PCR)等方法克隆山羊包含完整开放阅读框的cDNA序列，利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR，qPCR)技术检测其在 心、肝、脾、肺、肾、背最长肌、皮下脂肪和腹间脂肪等各组织中的表达差异。
结果表明，克隆获得的山羊 4POL6cDNA序列为I 295 bp,其中包括完整的开放阅读框984 bp,5'非翻译区序列153 b p和3'非翻译区 序列158 基因共编码327个氨基酸，合成不稳定亲水性蛋白质。
组织表达谱检测结果显示/1R几6基因在山羊检测的各组织中均有表达，但在脂肪组织中表达量最高，显著高于其它检测的各组织k<〇.〇5)。
该 研究为最终揭示dP0J L6基因在山羊肌内脂肪沉积中的作用提供科学依据。
关键词山羊，/1P0L6,基因克隆，组织表达Cloning, Biological Characteristic and Tissue Expression Analysis o f Apolipoprotein L6 {A P0L6) Gene in GoatXie Guangjie 1Zhang Yanan u Lin Yaqiu l2*1College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University, Chengdu, 610041; 2 Key Laboratory of Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation and Utilization, Ministry of Education, Southwest Minzu University, Chengdu, 610041*Correspondingauthor,*****************DOI: 10.13417/j.gab.039.005039Abstract In previous investigation,the laboratory found that the expression of goat A P0L6gene had differences between preadipocytes and adipocytes by transcriptome sequencing technique.Therefore,it was speculated that goat AP0L6gene might play a role in regulating intramuscular fat deposition.However,the characteristic of A P0L6gene cDNA sequence and its expression patterns in different tissues of goat remained unclear.Hence,this study was performed to clone goat APOL6gene cDNA sequence using the touchdown PCR and other approaches. Also,the expression abundances of goat AP0L6in heart,liver,spleen,lung,kidney,back,subcutaneous fat and abdominal fat were detected by quantitative real-time PCR(qPCR).The results shown that the cDNA sequence of gosit A P0L6gene was 1 295 bp,including984 bp complete open reading frame(ORF), 153 bp5'untranslated region (UTR)sequence and 158 bp 3*UTR sequence.The APOL6gene encoded 327 amino acids which then formed an unstable hydrophilic protein.Goat AP0L6gene was expressed in all the detected tissues,while its expression was the highest in the adipose tissue being significantly higher than that in other tissues(p<0.05). The results from this study would provide a scientific basis to finally reveal the role of A POL6gene in goat intramuscular fat deposition. Keywords Goat,A POL6,Gene cloning,Tissue expression基金项目：本研究由2019年国家级大学生创新创业训练计划项目(S201910656063)资助弓I用格式:Xie G.J., Z h a n g Y.N., a n d Lin Y.Q.，2020, Cloning, biological characteristic a n d tissue expression analysis o f apolipoprotein L6g e n e in goat, Jiyinzuxue Y u Y i n g y o n g S h e n g w u x u e (G e n o m i c s a n d A p p l i e d Biology), 39(11): 5039-5044 (谢光杰，张亚楠，林亚秋，2020,山羊说6基因克隆、生物学特征及组织表达分析，基因组学与应用生物学，39(1丨):5039-5044)5040 基因组学与应用生物学载脂蛋白(Apolipoprotein)是一组凭借其两亲性螺 旋结构与脂质结合进而构成不同类型脂蛋白颗粒的 蛋白质(Breiteretal.，1991; Bolanos-Garcia and Miguel, 2003)。
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※生物技术 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｄａｉｒｙ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ２ｏ１４，ＶｏＬ３７Ｎｏ．２ ６ 奶山￣ＡＧＰＡ 基因多态性与生长性状的关联分析 常振华 ，何成 ，颜伟俊 ，王韦华 ，孟晓静。 （１．渭南职业技术学院农学院，陕西渭南 ７１４０００；２－’ｌ胃南市畜牧技术推广中心，陕西渭南 ７１４０００ ３．蒲城县地方公路站，陕西渭南 ７１４０００）
摘要：利用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术对５４９只西农萨能和关中奶ＬｌＪ羊群的ＡＧＰＡＴ６基因遗传多态 性与生长性状（体高、体长和胸围）的相关性进行研究。结果表明ＡＧＰＡＴ６基因存在４个单核苷酸多态性：Ｐ１、 Ｐ２、Ｐ４与Ｐ１０位点分别位于５ ＵＴＲ（ｇ．１５２Ｇ＞Ｃ）、内含子２（ｇ．８１２４Ｇ＞Ａ）、外显子４（ｇ．９２６３Ｃ＞Ｇ）和３ ＵＴＲ （ｇ．１６４３６Ｇ＞Ａ）。经关联分析，Ｐ２、Ｐ４和Ｐ１０三位点在西农萨能奶山羊和关中奶山羊品种中都属于中度多态， ４个ＳＮＰｓ的不同基因型对两个奶山羊品种的生长性状影响均不显著（Ｐ＞Ｏ．０５）。 关键词：奶山羊；ＡＧＰＡＴ６基因；多态性；生长性状；关联分析
Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｏｆ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ ｉｎ ｔｈｅ ＡＧＰＡＴ６ Ｇｅｎｅ ｗｉｔｈ Ｂｏｄｙ Ｓｉｚｅ Ｔｒａｉｔｓ ｉｎ Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ Ｄａｉｒｙ Ｇｏａｔ Ｂｒｅｅｄｓ ＣＨＡＮＧ Ｚｈｅｎ—ｈｕａ ，ＨＥ Ｃｈｅｎｇ ，ＹＡＮ Ｗｅｉ－ｊｕｎ ，ＷＡＮＧ Ｗｅｉ—ｈｕａ ，ＭＥＮＧ Ｘｉａｏ－ｊｉｎｇ （１．Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｆａｃｕｌｔｙ ｏｆ Ｗｅｉｎａｎ Ｖｏｃａｔｉｏｎａｌ＆Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ Ｃｏｌｌｅｇｅ，Ｗｅｉｎａｎ ７ １４０００，Ｃｈｉｎａ； ２．Ｗｅｉｎａｎ Ｃｉｔｙ Ａｎｉｍａｌ Ｈｕｓｂａｎｄｙ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｃｅｎｔｒｅ，Ｗｅｉｎａｎ ７ １４０００，Ｃｈｉｎａ； ３．Ｐｕｃｈｅｎｇ Ｃｏｕｎｔｙ Ｈｉｇｈｗａｙ Ｓｔａｔｉｏｎ，Ｗｅｉｎａｎ ７１４０００，Ｃｈｉｎａ）
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｈｅ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ＡＧＰＡＴ６ ｇｅｎｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ ａｎｄ ｂｏｄｙ ｓｉｚｅ ｔｒａｉｔｓ（ｂｏｄｙ ｈｅｉｇｈｔ，ｂｏｄｙ ｌｅｎｇｔｈ，ｃｈｅｓｔ ｃｉｒｃｕｍｆｅｒｅｎｃｅ）ｗｅｒｅ ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄ ｉｎ ５４９ Ｘｉｎｏｎｇ Ｓａａｎｅｎ ａｎｄ Ｇｕａｎｚｈｏｎｇ ｄａｉｒｙ ｇｏａｔｓ ｕｓｉｎｇ ＰＣＲ—ＲＦＬＰ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ．Ｆｏｕｒ ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ（ＳＮＰｓ）ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ５’ＵＴＲ（ｇ．１５２Ｇ＞Ｃ），ｉｎｔｒｏｎ２（ｇ．８１２４Ｇ＞Ａ），ｅｘｏｎ４（ｇ．９２６３Ｃ＞Ｇ） ａｎｄ ３ ＵＴＲ（ｇ．１６４３６Ｇ＞Ａ）ｗｅｒｅ ｄｅｔｅｃｔｅｄ ｉｎ ｆｏｕｒ ｌｏｃｉ（Ｐ１，Ｐ２，Ｐ４ ａｎｄ Ｐ１０）ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ｔｈｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ Ｐ２，Ｐ４ ａｎｄ Ｐ１０ ｐｏｓｓｅｓｓｅｄ ｉｎｔｅｒｍｅｄｉａｔｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ．Ｔｈｅ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｓｔｕｄｙ ｒｅｖｅａｌｅｄ ｔｈａｔ ｎｏｎｅ ｏｆ ｔｈｅ ｆｏｕｒ ＳＮＰｓ ｄｅｔｅｃｔｅｄ ｈａｄ ａ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｅｆｆｅｃｔ ｏｎ ｔｈｅ ｂｏｄｙ ｔｒａｉｔｓ ｉｎ ｔｈｅ ｔｗｏ ｇｏａｔ ｂｒｅｅｄｓ ＞０．０５）． Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ：ｄａｉｒｙ ｇｏａｔｓ；ＡＧＰＡＴ６ ｇｅｎｅ；ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ；ｂｏｄｙ ｓｉｚｅ ｔｒａｉｔｓ；ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ 中图分类号：￥８２３．９１ 文献标志码：Ａ 文章编号：１６７１－５１８７（２０１４）０２—０００６—０３
萨能奶山羊和关中奶山羊是著名的乳用山羊品种， 以体格高大、产奶量高、适应性强和遗传稳定而著称”。】。 即磷酸甘油酰基转移酶（１一ａｃｙｌｇｌｙｃｅｒｏ１．３一ｐｈｏｓｐｈａｔｅ．０一 ａｃｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ，ＡＧＰＡＴ），也叫做溶血磷脂酸酰基转移 酶（ａｂｓＷａｃｔｌｙｓｏｐｈｏｓｐｈａｔｉｄｉｃ ａｃｉｄ ａｃｙｌｔｒａｎｓｆｅｒａｓｅ，ＬＰＡＡＴ） ＡＧＰＡＴ能催化甘油三酯 一２位置的酯化 】，而甘油三酯是 乳脂和体脂的主要成分，它能催化溶血磷脂酸形成磷脂 酸 。。目前研究发现，ＡＧＰＡＴ可能有１１种异构体 ，其中 ＡＧＰＡＴ６基因等多个基因的ｍＲＮＡ表达上调基因网络参与 乳脂合成和分泌 。。在国内，昝林森等［１０１和张佳兰等… 就ＡＧＰＡＴ６基因对不同品系的荷斯坦奶牛乳脂率和奶产量 有过研究，但目前尚未有ＡＧＰＡＴ６遗传多样性对生长性状 （体高、体长、胸围）影响的相关报道。为此，本研究 采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｃｈａｉｎ ｒｅａｃｔｉｏｎ—ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｌｅｎｇｔｈ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ， 收稿日期：２０１４—０１—３０ 基金项目：渭南职业技术学院青年科研基金（ＷＺＹＱ２０１２１５） 作者简介：常振华（１９８４一），女，助教，硕士，研究方向为牛、 ＰＣＲ—ＲＦＬＰ）技术分析了西农萨能奶山羊和关中奶山羊群 体ＡＧＰＡＴ６基因遗传多态性及其对生长性状的影响，旨在 为奶山羊的选育提供理论依据。
１ 材料与方法 １．１ 材料与试剂 西农萨能奶山羊２６８份 陕西省千阳县西农萨能 奶山羊种羊场（２０２只）和西北农林科技大学种羊场 （６只）；关中奶山羊血样２８１份 陕西省三原县关中 奶山羊种羊场。 Ｔａｑ ＤＮＡ聚合酶、琼脂糖凝胶电泳上样液 天根生 化科技公司；蛋白酶Ｋ 德国默克公司；三磷酸脱氧核 糖核苷酸 西安沃尔森生物技术有限公司；ＤＮＡ凝胶回 收试剂盒 安徽优晶生物工程公司。
羊生产及育种。Ｅ—ｍａｉｌ：ｚｈｃｈａｎｇ６２０＠１６３．ｃｏｒｎ ７ ２０１４，ＶｏＬ３７Ｎｏ．２ 乳业科学与技７ｔｔ ※生物技术 １．２ 仪器与设备 ＧｅｎｅＡｍｐ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ ９７００ 美国应用生物系统 （ＡＢＩ）公司；３—１８Ｋ高速冷冻离心机 美国Ｓｉｇｍａ公 司；Ｋｏｄａｋｌ２０凝胶成像仪 美国Ｋｏｄａｋ公司；ＤＹＹ一１２ 型电泳仪 北京六一仪器厂；Ａｄｖｅｎｔｕｒｅｒ 电子天平 美国Ｏｈａｕｓ公司；５００型电热恒温培养箱 日本龙口先科 仪器公司。 １．３ 方法 １．３．１ 前处理 本实验采用颈静脉法采血不同地区养血共５４９ 份，每个个体采集１０ ｍＬ，ＪＪＩ］ＡＣＤ抗凝剂带回实验室， 一２０℃冷冻存备用；同时现场测量并记录了５４９头奶山 羊的体尺指标，其中包括体长（ｂｏｄｙ ｌｅｎｇｔｈ，ＢＬ）、体高 （ｂｏｄｙ ｈｅｉｇｈｔ，ＢＨ）和胸围（ｃｈｅｓｔ ｃｉｒｃｕｍｆｅｒｅｎｃｅ，ＣＣ）。 １．３．２ 基因组ＤＮＡ提取与ＡＧＰＡ 基因引物 本实验参照Ｃｈｅｎ等“ 和陈宏等 的方法提取奶山羊 的血样基因组ＤＮＡ。所用到的引物全部参照ＧｅｎｅＢａｎｋ中 提供的牛ＡＧＰＡＴ６基因序列（ＮＣ一００７３２８．３），用Ｐｒｉｍｅｒ ｐｒｅｍｉｅｒ ５．０软件自行设计，如表１所示。 表１ ＡＧＰＡＴ６基因所用引物信息和退火温度 Ｔａｂｌｅ １ Ｐｒｉｍｅｒｓ ｆｏｒ ＰＣＲ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｇｏａｔ ＡＧＰＡＴ６ ｇｅｎｅ 位点 ．３‘） 蜘 备注 １＿３－３ Ｇ 基因ＰＣＲ—ＲＦＬＰ反应条件 以奶山羊的混合ＤＮＡ池（每１０个不同样本混合成１个 ＤＮＡ池）做模板进行基因ＰＣＲ扩增。ＰＣＲ扩增反应总体系 如下：Ｔａｑ ＤＮＡ聚合酶０．４ 、１０×Ｂｕｆｆｅｒ缓冲液２．７ 、 ｄＮＴＰｓ（脱氧核苷酸）２．０ ｇＬ、上游引物（Ｆ）０．５ ｇＬ、 下游引物（Ｒ）０．５ 、１０ ｎｇ／ｇＬ ＤＮＡ模板１．０ ｇＬ和超纯 水１７．９ ，总体积２５ ｇＬ。ＰＣＲ（聚合酶链式反应）扩增 反应程序为：９５℃预变性４ ｍｉｎ，９４℃变性３０ Ｓ，退火 ３０ Ｓ，７２℃延ｔ．４０ Ｓ，循环次数３３，７２℃延伸１０ ｍｉｎ， ４℃保存。利用ＰＣＲ—ＲＦＬＰ技术对发现的单核苷酸多态性 （ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ，ＳＮＰｓ）进行分型。ＰＣＲ－ ＲＦＬＰ技术具体方法：将１０×Ｂｕｆｆｅｒ缓冲液１．０ Ｌ、ＰＣＲ 产物５．０儿Ｌ、超纯水３．５ ｇＬ、限制性内切酶（１０Ｕ／ｇＬ） ０．５ 混合，合计１０ 。根据限制性内切酶说明书中的 反应温度，水浴８ ｈ，用１％琼脂糖电泳（将０．７ ｇ（０．５ｇ） 琼脂糖加入￣ｌＪ７０ ｍＬ（５０ ｍＬ）ＴＮＥ电泳缓冲液）成像， 然后进行基因型分析。 １．４ 数据统计与分析 使用根据突变位点的基因分型结果，对测得的基因 型进行统计，计算多态信息含量、有效等位基因数和群 体杂合度等群体遗传参数。ＳＰＳＳ １６．０进行数据分析。 基因型与生长性状关联分析中用到的模型为： ，（性状 值）＝ （群体均值）＋Ａ （年龄的固定效应）＋Ｇ，（基 因型的固定效应）＋Ｐ （随机误差）。
２ 结果与分析 ２．１ 奶山羊ＡＧＰＡ 基因多态性 通过对５４９只西农萨能奶山羊和关中奶山羊的 Ｇ Ｔ６基因全部外显子和部分５ ＵＴＲ和３ ＵＴＲ进行 分析，经ＤＮＡ池测序发现４个突变位点（Ｐ１、Ｐ２、 Ｐ４、Ｐ１０）：分别为５ ＵＴＲ（ｇ．１５２Ｇ＞Ｃ）、内含子２ （ｇ．８ｌ２４Ｇ＞Ａ）、外显子４（ｇ．９２６３Ｃ＞Ｇ）（图１）和 ３ ＵＴＲ（ｇ．１６４３６Ｇ＞Ａ），其中外显子４处突变引起苏氨 酸的１个同义突变，而５ ＵＴＲ、内含子２和３ ＵＴＲ不进行编 码蛋白，未引起氨基酸突变。
图１ ＡＧＰＡＴ６基因Ｐ４基因座ＣＧ型测序结果。 Ｆｉｇ．１ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｒｅｓｕｌｔｓ ｆｏｒ ＡＧＰＡＴ６－Ｐ４ ＣＧ ｇｅｎｏｔｙｐｅ
表２ Ｐ１、Ｐ２、Ｐ４和ＰＩＯ多态信息含量 Ｔａｂｌｅ ２ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｃｏｎｔｅｎｔ（ＰＩＣ）ｏｆ ｔｈｅ Ｐ１，Ｐ２， Ｐ４ ａｎｄ Ｐ１０ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ｌｏｃｉ
注：ＰＩＣ＜０．２５为低度多态：０．２５＜ＰＩＣ＜０．５为中度多态；ＰＩＣ＞０．５ 为高度多态。
如表２所示，利用限制性内切酶ＫｐｎＩ（引入酶切位 点）对Ｐｌ位点（ｇ．１５２ Ｇ＞Ｃ）的ＰＣＲ产物（１７５ ｂｐ）进 行分型，结果在２个奶山羊品种中都检测到了ＧＧ型、ＧＣ 型和ＣＣ型３种基因型。利用限制性内切酶ＥｃｏＲ 对发现 的Ｐ２位点（ｇ．８１２４Ｇ＞Ａ）的ＰＣＲ产物（３７２ ｂｐ）进行分 型，结果在２个奶山羊品种中都检测到了ＧＧ型、ＧＡ型和 ＡＡ型３种基因型。利用限制性内切酶ＮｃｏＩ￣发现的Ｐ４位 点（ｇ．９２６３Ｃ＞Ｇ）的ＰＣＲ产物（２４１ ｂｐ）进行分型，在２