基因外显子与内含子的查找方法

基因外显子与内含子的查找方法

基因的内含子和外显子的序列

在NCBI找到基因序列之后，要确定其内含子和外显子的序列是比较简单的。如果是RefSeq 序列的话，那就更加容易了。简单的思路就是跟基因组序列比对就行了。

%用NCBI的Splign工具，详见：图解：如何在NCBI上找到HNF-4基因第4个外显子的序列。%但由于猪KIT(FJ938289)基因不是Refseq序列。这就比较难了，由该序列的注释可知（/chromosome="8），该序列是属于第8号染色体。

%所以先确定猪（Pig，Sus scrofa）的第8号染色体是否已经测完序了。先在Taxonomy数据库搜索，得到Taxonomy ID: 9823。直接用关键词txid9823[Organism:noexp]搜索Genome数据库。猪有19条染色体，结果为11。看图：

%但其中并没有第8号染色体的。所以要确定猪KIT(FJ938289)基因的内含子和外显子的序列，好像就不大可能了。反正我是没办法了。

基因结构图

1，NCBI提供的Graphics工具

在NCBI搜索FJ938289之后，接下来用NCBI提供的Graphics工具来查看，就能知道基因的内含子和外显子的序列了（同时也是一个基因结构图哦）。看图：