明胶酶谱法检测步骤

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明胶酶谱实验方法

明胶酶谱实验方法

明胶酶谱实验72kD(MMP-2)和92kD(MMP-9)抽提缓冲液:10 mmol/L Tris-HCl pH 7.5,150 mmol/L NaCl,20 mmol/L CaCl2,1μmol/L ZnSO4,0.01% (v/v) Triton X-100,(0.5% PMSF)。

10mmol/LPMSF 溶液:取PMSF 粉末17.4mg, 加异丙醇溶解, 定容至100ml,置-20℃备用。

注意:PMSF在临提取组织时再加入,使终浓度为0.5%,配制时不加,不然易失效。

先用新鲜肾组织,蛋白量尽量加至最大。

如果按这个还做不出来,那就是你的实验技术问题了明胶酶是锌依赖的蛋白酶. EDTA是金属离子络合剂.加了就把明胶酶的锌离子络合了,完全抑制MMP的活性。

你加了这个我保证你一辈子也做不出来。

蛋白浓度一般是先摸索一个量。

就是分别上10,20,30,40,50,60,70,80,90,100ug跑一下电泳,先看结果。

条带看不见的,或者太透明的,都不能选。

就是要半明半暗的那种。

看是哪个道分解的,我们就选其中几个量上样。

(1)、5%浓缩胶(现配现用):d3H2O 2.1ml30%丙烯酰胺溶液0.5ml1mol/L Tris-HCL( PH=6.8) 0.38ml10% SDS 30μl10%过硫酸铵(AP) 30μlTEMED 3μl3ml (2)、10%分离胶(现配现用):d3H2O 2.1ml30%丙烯酰胺溶液 2.31ml1.5mol/l Tris-HCL(PH=8.8) 1.75ml10% SDS 70μl10%过硫酸铵(AP) 70μlTEMED 5.6μl1%明胶0.7ml7ml (3)、4×上样缓冲液(4o C保存):0.32% Tris-HCL 6.4ml4%SDS 8ml50%甘油 3.2 ml溴酚蓝0.024gd3H2O 2.4ml20ml①wash buffer Ⅰ500ml50mM Tris-HCl pH 7.6 3.0286g→400ml (调pH )5 mM CaCl2 (110.99)0.2776g1μM ZnCl2 (136.30)0.068mg2.5% Triton X-100 12.5ml②wash buffer Ⅱ500ml50mM Tris-HCl pH 7.6 3.0286g→400ml (调pH )5 mM CaCl2 (110.99)0.2776g1μM ZnCl2 (136.30)0.068mg③incubate buffer 500ml50mM Tris-HCl pH 7.6 3.0286g→400ml (调pH ) 50mM CaCl2 (110.99)0.2776g1μM ZnCl2 (136.30)0.068mg1% Triton X-100 5.0ml(五)注意事项1)孵育时间可以根据情况而定,可以延长。

明胶酶谱法 -回复

明胶酶谱法 -回复

明胶酶谱法 -回复明胶酶谱法是一种用于测定明胶酶活性的分析方法。

明胶酶谱法基于明胶酶对明胶的降解作用,通过测定明胶的降解程度来反映明胶酶活性。

这种方法可以在实验室中进行,通常需要一些特定的试剂和设备。

明胶酶谱法的原理是利用明胶对明胶酶的敏感性,通过观察明胶降解的速度来确定酶的活性。

在明胶酶谱法中,一般会选择特定浓度和分子量的明胶,以确保最佳的测定结果。

明胶酶谱法可以用来研究明胶酶对明胶的降解过程,了解酶的活性和特性。

这个方法可以应用于食品工业、制药工业等领域,用于检测明胶酶的活性和质量。

明胶酶谱法在实验室中的操作比较简单,但需要一定的实验操作技巧和对仪器的熟悉。

这种方法对明胶酶活性和测定结果的准确性有着重要影响,所以需要严格按照操作流程进行实验。

明胶酶谱法的操作流程包括样品制备、反应过程、数据记录等环节,需要仔细阅读方法说明书并进行实践。

在明胶酶谱法中,常用的数据处理方法有绘制酶活性曲线、计算酶活性单位等。

明胶酶谱法需要注意的问题包括试剂的质量、设备的准确性和对废液的处理等。

明胶酶谱法的优点是操作简便、结果准确可靠,可以在较短时间内完成分析。

明胶酶谱法的局限性在于它只是测定明胶酶活性的一种方法,不能全面了解酶的特性。

在明胶酶谱法中,一些因素如温度、pH值等会对酶的活性产生影响,需要进行恰当的控制。

明胶酶谱法的操作需要注意安全,避免对人体和环境造成伤害。

明胶酶谱法是一种常用的分析方法,被广泛应用于生物化学、食品科学等领域。

该方法在明胶酶的研究和应用中具有重要意义,可以帮助科学家们更好地了解酶的特性和机制。

明胶酶谱法的结果可以用于酶活性检测、比较不同酶样品的活性等。

这种方法还可以用于评估明胶酶的纯度和稳定性,指导生产过程中的酶的应用。

明胶酶谱法可以与其他分析方法结合使用,提高酶活性测定的准确度和可靠性。

该方法还可以用于研究明胶酶的底物特异性、抑制剂的效果等。

明胶酶谱法的发展使得对明胶酶的研究更加深入和全面。

酶谱法检测金属蛋白酶活性

酶谱法检测金属蛋白酶活性

原理酶谱法的基本过程是先将样品进行SDS-聚丙烯酰胺(SDS-PAGE,含0.1%明胶)电泳分离,然后在有二价金属离子存在的缓冲系统中使样品中的MMP-2和MMP-9恢复活性,在各自的迁移位置水解凝胶里的明胶,最后用考马斯亮蓝将凝胶染色,再脱色,在蓝色背景下可出现白色条带,条带的强弱与MMP-2和MMP-9活性成正比。

复性原理:在电泳过程中,SDS与样品中的MMPs结合(当然是可逆性结合),破坏其氢键、疏水键而使MMPs不能发挥其分解明胶的作用,而只有当将胶置Trition中洗脱(最好是放在摇床上摇,30min/次,做2次或15min/次,4次。

静置于Trition中是不妥的。

)时,由于SDS被Trition结合而去除,从而使MMPs恢复了活性。

2试剂的配制(1)配制10%SDS聚丙烯酰胺凝胶(含1.0mg/ml 明胶,配好后1周内使用,明胶含量低灵敏度高)A.分离胶的配制(注:根据你所用的电泳仪胶的大小确定配制胶的量)10% SDS聚丙烯酰胺凝胶10ml(包括)ddH2O 4.5ml30%储备胶(0.8%BIS+29.2%丙烯酰胺)2ml1.5mol/l Tris(PH 8.8)2.5ml10% SDS 100ul10%过硫酸铵(APS)100ulTEMED 8ul1%明胶(1g明胶-->100ml,37°C水浴溶解)0.5mlB.浓缩胶的配制浓缩胶6mlddH2O 4.5ml30%储备胶0.75ml1mol/l Tris-HCL( PH 6.8) 0.76ml10% SDS 60ul10%过硫酸铵60ulTEMED 6ul(3)5×Tris –甘氨酸电极缓冲液0.125mol/l Tris-HCL,1.25mol/l 甘氨酸,0.5%SDS(PH 8.3)(4)4 ×上样缓冲液0.32% Tris-HCL 6.4ml4%SDS(PH7.2)8ml16%甘油3.2 ml溴酚蓝0.024gddH2O 2.4ml(5) 洗脱液:2.5% Triton X-100,50mmol/L Tris-HCl<6.057g/L> ,5mmol/LCaCl2<0.5549g/L>,pH7. 6 (40分钟两次,中间换液)(6)漂洗液:50mmol/L Tris-HCl,5mmol/L CaCl2,pH7. 6 (20分钟2次)(7)孵育液:50mmol/LTris,pH7.5,150mmol/LNaCl,10mmol/LCaCl2,0.02%NaN3(孵育42小时)(8)染色液:0.05% Coomassic 亮蓝R-250,30%甲醇,10%乙酸(染色3小时)(9)脱色液A、B、C:甲醇浓度分别为30%、20%、10 % ,乙酸浓度分别为10 %、10 %、5% (分别30min、1h、2h脱色)3实验步骤1.取对数期的癌细胞在的无血清培养基DMEM中培养24h。

明胶酶谱法

明胶酶谱法

明胶酶谱法原理:酶谱法的基本过程是先将样品进行SDS-聚丙烯酰胺(SDS-PAGE,含0.1%明胶)电泳分离,然后在有二价金属离子存在的缓冲系统中使样品中的MMP-2和MMP-9恢复活性,在各自的迁移位置水解凝胶里的明胶,最后用考马斯亮蓝将凝胶染色,再脱色,在蓝色背景下可出现白色条带,条带的强弱与MMP-2和MMP-9活性成正比。

复性原理:在电泳过程中,SDS与样品中的MMPs结合(当然是可逆性结合),破坏其氢键、疏水键而使MMPs不能发挥其分解明胶的作用,而只有当将胶置Trition中洗脱(最好是放在摇床上摇,30min/次,做2次或15min/次,4次。

静置于Trition中是不妥的。

)时,由于SDS被Trition结合而去除,从而使MMPs 恢复了活性。

Mmp-2 72kd mmp-9 92kd实验步骤1.取对数期的癌细胞在的C。

2.次日收集上清液,将上清液移入离心管中2000rpm 离心10min,-70℃储存备用。

3.根据细胞计数调整各组细胞培养上清液中的蛋白浓度(或者测定蛋白浓度调整使所上蛋白总量一致)。

与5×上样缓冲液混合,13ul样本+4ul上样缓冲液。

(不要用枪用力吹打,防止出现过多气泡)4.配制分离胶和浓缩胶,16ul/孔上样(根据表达强度和蛋白浓度确定上样量),4℃进行SDS-PAGE 电泳100v约1.5小时(电泳时在周围敷上冰,有利于使条带跑直)。

5.电泳结束后,将凝胶置于洗脱液(2.5% Triton X-100,50mmol/L Tris -HCl ,5mmol/L CaCl2,pH7. 6) 中振荡洗脱2次,每次40分钟,然后用漂洗液(除不含Triton X - 100 外其余同洗脱液) 漂洗2次,每次20分钟,接着,将凝胶置于孵育液( 50mmol/L Tris - HCl , 5mmol/ CaCl2 , 0. 02% Brij-35 ,pH7.6) 中37℃孵育42h。

明胶酶谱法

明胶酶谱法

明胶酶谱法的定义和步骤
明胶酶谱法是一种常用于检测和定量分析细菌或其他微生物产生的明胶酶活性的实验方法。

明胶酶谱法通过将待测菌株培养在含有明胶的琼脂培养基上,并利用其产生的明胶酶在琼脂中形成透明带区来检测明胶酶活性的存在和水平。

明胶酶谱法的具体实验步骤如下:
1. 准备明胶琼脂板:将明胶溶液加入琼脂培养基中,制备明胶琼脂板;
2. 菌株预处理:将待测菌株培养在适当的富含明胶的培养基上;
3. 制备样品:将培养的菌液离心,收集上清液,加入样品缓冲液中;
4. 蛋白电泳:将样品加入聚丙烯酰胺凝胶电泳胶中,利用电场将蛋白质分离;
5. 明胶酶活性检测:将电泳胶浸泡在明胶酶活性染色剂中,在适当温度下孵育一段时间;
6. 显色和成像:将染色剂去除,并在电泳胶上观察到明显的透明带区,表示明胶酶活性的存在和水平。

通过明胶酶谱法,可以确定菌株是否产生明胶酶及其活性的强弱。

这种方法简单易行,并能够提供定性和半定量的结果。

这种方法在微生物学研究和临床诊断中得到广泛应用,尤其对细菌感染的相关研究具有重要意义。

明胶酶谱法

明胶酶谱法

明胶酶谱法明胶酶谱法是一种新型的蛋白质分析方法,它可以提供准确准确的蛋白质质量分析和分子量分析结果。

明胶酶谱法可以快速有效地测定蛋白质中的氨基酸和糖基化激酶的活性。

这种方法通过使用蛋白质,核酸和其他复合物构成的聚合物,结合相关的酶诱发反应,来分析蛋白质的质量和分子量。

这些复合物可以在单独的氨基酸片段中用来测量激酶反应,从而识别活性位点,反映了蛋白质质量和分子量分析的结果。

明胶酶谱法的原理是基于胶质酶结合物,它由多种蛋白质,核酸和其他复合物组成,使用酶诱发反应来分析蛋白质的质量和分子量。

该方法由激酶和聚合物组成,它们分别催化了激酶和聚合物的反应,从而产生了激酶的活性。

此外,该方法还能够测量氨基酸片段的活性,这将有助于评估蛋白质的质量和分子量。

明胶酶谱法的应用可以追踪物质的合成和分解的变化,从而发现蛋白质结构及其功能的改变。

它可以用来研究蛋白质结合位点分布、激动酶及蛋白质与酶类分子识别蛋白质、以及酶促反应的参与者等,这些结果将有助于改善蛋白质的性能,这将有助于提高药物的疗效和安全性,以及有效防止药物毒性事件的发生。

明胶酶谱法在蛋白质质量和分子量分析方面具有优越性。

它可以快速有效地识别活性位点,由此提供了精确的蛋白质质量和分子量的分析结果。

同时,该方法可以提供有效的数据,可以评估蛋白质的功能和结构。

它还可以用来研究药物及其代谢物的代谢,改善药物的性能和安全性,以及有效防止药物毒性事件的发生。

由此可见,明胶酶谱法已成为药物研究和分析的一种重要的手段。

明胶酶谱法的应用可以提供准确的蛋白质质量和分子量分析结果,从而有助于研究者分析蛋白质的功能和结构,并改善药物的性能和安全性。

明胶酶谱法是一种有效的、快速的、有精度的、具有易操作性的蛋白质质量和分子量分析方法,因此它已经成为药物研究和分析的一种重要手段。

明胶酶谱法详解

明胶酶谱法详解

ZymographyProvided by Hsu suo-wen一。

用品1.细胞培养或者提取组织2.试剂的配制(1)配制10%SDS聚丙烯酰胺凝胶(含1.0mg/ml 明胶)A.分离胶的配制(注:根据你所用的电泳仪胶的大下确定配制胶的量)10% SDS聚丙烯酰胺凝胶 5ml(包括)ddH2o 1.5ml30%储备胶 (0.8%BIS+29.2%丙烯酰胺) 1.65ml1.5mol/l Tris(PH 8.8) 1.25ml10% SDS 50ul10%过硫酸铵(AP) 50ulTEMED 4ul1%明胶 0.5ml(or 100ul)(注意:天气如果较冷除TEMED,其他成分按顺序加完后要置于37度温育,最后加TEMED)B.浓缩胶的配制-同Western Blot浓缩胶 3mlddH2o 2.1ml30%储备胶 0.5ml1mol/l Tris-HCL( PH 6.8) 0.38ml10% SDS 30ul10%过硫酸铵 30ulTEMED 3ul(3)5×Tris –甘氨酸电极缓冲液0.125mol/l Tris-HCL,1.25mol/l 甘氨酸,0.5%SDS(PH 8.3)(4)4 ×上样缓冲液20ml(不同于Western)0.32% Tris-HCL 6.4ml 50mM Tris 0.606g4%SDS(PH7.2) 8ml 2% SDS 0.2g16%甘油 3.2 ml 10%甘油 10ml溴酚蓝 0.024g 0.1%溴酚蓝 0.01gddH2o 2.4ml(20ml) (10mlsystem)(5) 洗脱液(1L):2.5% Triton X-100(25ml),50mmol/L Tris –HCl(6.06g),5mmol/L CaCl2(or 10mMol 1.11g),1μmol/L ZnCl2,pH7. 6漂洗液(相比洗脱液,少了Triton): 50mmol/L Tris -HCl ,5mmol/L CaCl2,1μmol/L ZnCl2,pH7. 6注意:洗脱液不能重复使用,必须现配,尽可能多加洗脱液,温育摇动时注意Triton有毒。

明胶酶谱法

明胶酶谱法

明胶酶谱法原理:酶谱法的基本过程是先将样品进行SDS-聚丙烯酰胺(SDS-PAGE,含0.1%明胶)电泳分离,然后在有二价金属离子存在的缓冲系统中使样品中的MMP-2和MMP-9恢复活性,在各自的迁移位置水解凝胶里的明胶,最后用考马斯亮蓝将凝胶染色,再脱色,在蓝色背景下可出现白色条带,条带的强弱与MMP-2和MMP-9活性成正比。

复性原理:在电泳过程中,SDS与样品中的MMPs结合(当然是可逆性结合),破坏其氢键、疏水键而使MMPs不能发挥其分解明胶的作用,而只有当将胶置Trition中洗脱(最好是放在摇床上摇,30min/次,做2次或15min/次,4次。

静置于Trition中是不妥的。

)时,由于SDS被Trition结合而去除,从而使MMPs恢复了活性。

试剂的配制(1)配制10%SDS聚丙烯酰胺凝胶(含1.0mg/ml 明胶,配好后1周内使用,明胶含量低灵敏度高)A.分离胶的配制(注:根据你所用的电泳仪胶的大小确定配制胶的量)10% SDS聚丙烯酰胺凝胶10ml(包括)ddH2O 4.5ml30%储备胶(0.8%BIS+29.2%丙烯酰胺)2ml1.5mol/l Tris(PH 8.8)2.5ml10% SDS 100ul10%过硫酸铵(APS)100ulTEMED 8ul1%明胶(1g明胶-->100ml,37°C水浴溶解)0.5mlB.浓缩胶的配制浓缩胶6mlddH2O 4.5ml30%储备胶0.75ml1mol/l Tris-HCL( PH 6.8) 0.76ml10% SDS 60ul10%过硫酸铵60ulTEMED 6ul(3)5×Tris –甘氨酸电极缓冲液0.125mol/l Tris-HCL,1.25mol/l 甘氨酸,0.5%SDS(PH 8.3)(4)4 ×上样缓冲液0.32% Tris-HCL 6.4ml4%SDS(PH7.2)8ml16%甘油3.2 ml溴酚蓝0.024gddH2O 2.4ml(5)洗脱液:2.5% Triton X-100,50mmol/L Tris-HCl<6.057g/L> ,5mmol/L CaCl2<0.5549g/L>,pH7. 6 (40分钟两次,中间换液)(6)漂洗液:50mmol/L Tris-HCl,5mmol/L CaCl2,pH7. 6 (20分钟2次)(7)孵育液:50mmol/LTris,pH7.5,150mmol/LNaCl,10mmol/LCaCl2,0.02%NaN3(孵育42小时)(8)染色液:0.05% Coomassic 亮蓝R-250,30%甲醇,10%乙酸(染色3小时)(9)脱色液A、B、C:甲醇浓度分别为30%、20%、10 % ,乙酸浓度分别为10 %、10 %、5% (分别30min、1h、2h脱色)实验步骤1.取对数期的癌细胞在的无血清培养基DMEM中培养24h。

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明胶酶谱法检测步骤
1、明胶酶谱溶液配制
1.1.1洗脱液(1×):
1.1.2Triton X-100,
2.5%(v/v)in water
配法:量取Triton X-10025ml,加去离子水定容至1000ml即可。

1.1.2孵育液(1×):50mM Tris-HCl,5mM CaCl2·2H2O,0.02%Brij-35,0.2M NaCl,pH7.6。

配法:
1)称取Tris碱6.06g,CaCl2·2H2O0.74g(或CaCl20.555g),Brij-350.2g,NaCl11.7g;
2)加水至800ml;
3)用浓HCl调pH至7.6;
4)定容至1000ml。

1.1.32×上样缓冲液(不含β巯基乙醇)
0.5M Tris-HCl,pH6.8 2.5ml
甘油 2.0ml
10%(w/v)SDS 4.0ml
0.1%溴酚蓝0.5ml
dH2O1ml
Total10ml
1.1.45×上样缓冲液(不含β巯基乙醇)
配法:
1)量取下列试剂,置于15ml塑料离心管中
a)1M Tris-HCl(pH6.8) 2.5ml
b)SDS1g
c)溴酚蓝0.05g
d)甘油5ml
2)加dH2O定容至10ml,Vortax振荡混匀;
3)小份分装(1ml/管),-20℃保存。

1.1.50.5%(w/v)考马斯亮蓝R-250400ml
配法:
1)称取2g考马斯亮蓝R-250,置于1L烧杯中;
2)量取100ml异丙醇加入上述烧杯中,搅拌溶解;
3)加入40ml冰醋酸,搅拌均匀;
4)加入260ml去离子水,搅拌溶解;
5)用滤纸过滤除去颗粒物质后,室温保存。

1.1.6考马斯亮蓝脱色液(400ml)
配法甲醇:乙酸:水=200:40:160=5:1:4。

1.1.7明胶储液(10mg/ml in water)
配法:称取明胶(Sigma,猪皮来源)0.1g,加去离子水10ml,溶解。

配好后储存于4℃。

若凝固成胶冻状可用55℃水浴解冻。

1.1.810%SDS-PAGE凝胶之分离胶(含1.0mg/ml明胶)
配法:
dH2O3ml
30%丙烯酰胺溶液 3.3ml
1.5M Tris-HCl(pH8.8)
2.5ml
10%SDS0.1ml
10%过硫酸铵0.1ml
TEMED0.004ml
10mg/ml明胶1ml
Total10ml
1.1.9浓缩胶的配置(与Western Blot完全相同)
2、实验具体步骤
2.1.取对数期的癌细胞在的无血清培养基DMEM中培养24h。

2.2.次日收集上清液,将上清液移入离心管中2000rpm离心10min,-70℃储存备用。

2.3.根据细胞计数调整各组细胞培养上清液中的蛋白浓度(或者测定蛋白浓度调整使所上蛋白总量一致)。

与5×上样缓冲液混合,13ul样本+4ul上样缓冲液。

(不要用枪用力吹打,防止出现过多气泡)
2.4.配制分离胶和浓缩胶,16ul/孔上样(根据表达强度和蛋白浓度确定上样量),4℃进行SDS-PAGE电泳100v约1.5小时(电泳时在周围敷上冰,有利于使条带跑直)。

2.5.电泳结束后,将凝胶置于洗脱液(2.5%Triton X-100,50mmol/L Tris-HCl,5mmol/L CaCl2,pH7.6)中振荡洗脱2次,每次40分钟,然后用漂洗液(除不含Triton X-100外其余同洗脱液)漂洗2次,每次20分钟,接着,将凝胶置于孵育液(50mmol/L Tris-HCl,5mmol/CaCl2,0.02% Brij-35,pH7.6)中37℃孵育42h。

2.6.孵育结束后经染色液(0.05%Coomassic亮蓝、30%甲醇、10%乙酸)染色3h,及脱色液A、
B、C(甲醇浓度分别为30%、20%、10%,乙酸浓度分别为10%、10%、5%)分别脱色0.5、
1、2h后,显示出MMP-2(72KD)和MMP-9(92KD)为位于蓝色背景上的透亮带,用凝胶图像分析系统分析读取条带面积,宽度和灰度值,做统计分析。

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