药物相关基因多态性检测试剂的设计与评估思路

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基因多态性的检测方法

基因多态性的检测方法

基因多态性的检测方法一、直接方法1.目标基因测序:通过对目标基因进行测序,可以直接得到其等位基因的序列信息。

目前,高通量测序技术的发展使得测序成为一种常用的基因多态性检测方法。

2.杂交技术:杂交技术可以用于检测单核苷酸多态性(SNP)和小片段插入/缺失等变异。

常用的方法包括限制性片段长度多态性(RFLP)和串联重复片段多态性(VNTR)等。

3.聚合酶链反应(PCR):PCR可以通过扩增目标片段的方法,检测基因多态性。

例如,引物在目标序列上的配对使得PCR扩增产物的长度与目标基因的等位基因有关。

通过测定扩增产物的长度变化,可以确定基因多态性。

4.克隆测序:克隆测序是一种将目标基因克隆到载体中,并对克隆的DNA进行测序的方法。

这种技术可以用于检测较大的插入/缺失变异以及基因拷贝数变异等。

二、间接方法1.单核苷酸多态性(SNP)芯片:SNP芯片是一种高通量并行检测SNP 的技术。

它通过固定在芯片上的特异性探针与待测样品中的SNP位点进行杂交,然后使用荧光信号检测方法来确定不同等位基因的存在情况。

2.DNA芯片:DNA芯片可以广泛用于基因多态性的检测。

它可以同时测定数百甚至数千个基因,快速、准确地检测多个等位基因的存在情况。

3.高分辨率融解曲线分析:高分辨率融解曲线分析可以用来区分等位基因之间的序列差异。

该方法通过双链DNA在升温过程中解旋变性的温度差异,来分析目标序列中的等位基因。

4. 二代测序技术:二代测序技术(如Illumina和Ion Torrent)基于多组重叠的小片段测序,可以用于高通量的基因多态性检测。

它可以同时测定数百万个SNP位点,识别多个等位基因的存在情况。

综上所述,基因多态性的检测方法涵盖了直接方法和间接方法。

这些方法可以用于检测单核苷酸多态性、插入/缺失变异、基因拷贝数变异等不同类型的基因多态性。

随着技术的不断发展,基因多态性的检测方法将变得更加高效、准确和经济。

如何用PCR法检测基因的多态性

如何用PCR法检测基因的多态性

如何用PCR法检测基因的多态性PCR法(聚合酶链反应法)是一种广泛应用于分子生物学领域的基因检测技术。

它能够在短时间内扩增特定序列的DNA片段,从而实现对基因多态性的检测。

以下是使用PCR法检测基因多态性的步骤:1.设计引物首先,需要根据目标基因的序列设计引物(寡核苷酸序列)。

引物一般包括一对前、后引物,它们各自与目标序列的两侧互补配对。

引物的设计应考虑到目标基因区域的多态性,以确保引物与所有可能的变体都能配对。

2.提取DNA从目标生物体的组织样本(如血液或组织)中提取DNA。

DNA提取方法可以选择物理法或化学法,如离心法和盐析法等。

3.PCR反应将提取到的DNA作为PCR反应的模板,加入引物、四个核苷酸和聚合酶等反应物,进行PCR反应。

PCR反应由多个循环组成,每个循环包括DNA的变性、引物的结合和DNA的扩增。

4.凝胶电泳分析将PCR反应产生的扩增产物进行凝胶电泳分析。

凝胶电泳是一种将DNA分子根据大小分离的方法。

将PCR产物加载到琼脂糖凝胶槽中,然后通过电场进行电泳。

根据其大小,DNA片段将在凝胶中移动到不同的位置。

通过与大小已知的DNA分子比较,可以确定PCR产物的大小。

5.基因型分析通过比较PCR产物的大小,可以检测到基因的多态性。

在不同基因型的个体中,PCR产物的大小可能会有所不同。

可以将PCR产物分成不同的等级,以进行基因型分析。

6.数据分析最后,对PCR结果进行数据分析和解释。

根据PCR产物的大小和基因型等信息,可以确定个体的基因型。

如果一些基因型与一种特定的表型相关联,那么可以推测该基因是多态的,并且可能与该表型相关。

除了上述步骤,还可以通过引入序列特异性的限制酶切位点、单特异性引物扩增等方法,进一步确定基因多态性。

此外,PCR法还可以与其他技术如测序、SNP分析等相结合,以获得更详细的多态性信息。

总之,PCR法是一种快速、敏感且广泛应用的检测基因多态性的方法。

通过合理的引物设计、PCR反应、凝胶电泳和数据分析等步骤,可以确定基因的多态性及其与表型相关性,为遗传研究和疾病诊断等领域提供重要信息。

CYP2C19药物代谢酶基因多态性检测试剂注册技术审查指导原则

CYP2C19药物代谢酶基因多态性检测试剂注册技术审查指导原则

CYP2C19药物代谢酶基因多态性检测试剂注册技术审查指导原则CYP2C19药物代谢酶基因多态性检测试剂是一种用于检测CYP2C19基因的多态性的试剂。

CYP2C19基因是人体内编码CYP2C19酶的基因,CYP2C19酶参与了大约10%的临床药物的代谢,因此CYP2C19基因的多态性与药物的代谢差异相关。

目前,CYP2C19基因多态性检测试剂已经投入了临床应用。

对于CYP2C19药物代谢酶基因多态性检测试剂的注册技术审查,以下是一些指导原则:1.产品安全性评价:注册技术审查应对产品的安全性进行评估,确保试剂没有明显的毒副作用,并对其可能引发的不良反应进行评估。

此外,审查时还应考虑对试剂进行质量控制的要求。

2.技术验证:技术验证是注册审查的关键环节,应要求申请者提供有关试剂的技术特性、敏感性和特异性的数据。

此外,还应要求申请者提供试剂性能验证的数据,确保试剂的可靠性和准确性。

3.临床试验设计和结果分析:临床试验的设计和结果分析也是审查的重点。

注册技术审查应确认试剂是否已经进行了充分的临床试验,并根据试验结果评估试剂的准确性和预测性能。

4.试剂标定和参考范围:试剂标定和参考范围的确定也是注册技术审查的重点。

应要求申请者提供标定方法和结果,确保试剂标定的准确性,并根据标定结果确定参考范围。

5.试剂使用说明:注册技术审查还应对试剂的使用说明进行评估,确保使用说明能够引导用户正确操作试剂,并对可能产生的不良反应和错误操作风险进行警示。

6.质量管理体系:最后,注册技术审查还应对申请者的质量管理体系进行评估,确保申请者具备实施质量管理的能力和措施,以确保试剂的质量。

总之,CYP2C19药物代谢酶基因多态性检测试剂注册技术审查应对产品的安全性、技术验证、临床试验设计和结果分析、试剂标定和参考范围、试剂使用说明以及质量管理体系进行综合评估,确保试剂的安全和准确性。

这些指导原则对于试剂的注册技术审查提供了明确的方向。

基因多态性分析

基因多态性分析

人基因多态性分析一、实验目的1. 了解基因多态性在阐明人体对疾病、毒物的易感性与耐受性、疾病临床表现的多样性以及对药物治疗的反应性中的重要作用。

2. 了解分析基因多态性的基本原理和研究方法。

二、实验原理基因多态性(gene polymorphism)是指在一个生物群体中,同时存在两种及以上的变异型或基因型或等位基因,也称为遗传多态性(genetic polymorphism)。

人类基因多态性对于阐明人体对疾病的易感性、毒物的耐受性、药物代谢差异及遗传性疾病的分子机制有重大意义;与致病基因连锁的多态性位点可作为遗传病的诊断标记,并为分离克隆致病基因提供依据;病因未知的疾病与候选基因多态性的相关性分析,可用于辅助筛选致病易感基因。

聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction—Restriction Fragment Length Polymorphism,PCR-RFLP)分析是一种常用的DNA分子标记。

原理是通过PCR扩增获得目的基因。

若目的基因存在等位变异(多态性),且变异正好发生在某种限制性内切酶识别位点上,使酶切位点增加或者消失,则酶切结果就会产生大小不同的片段,即片段长度多态性,再利用琼脂糖凝胶电泳分离,可呈现出多态性电泳图谱。

若将患者与正常的多态性图谱比较,可确定是否变异。

应用PCR-RFLP,可检测某一致病基因已知的点突变,进行直接基因诊断,也可以此为遗传标记进行连锁分析进行间接基因诊断。

三、器材与试剂1. 器材⑴离心机。

⑵DNA扩增仪。

⑶电泳仪。

⑷水平电泳槽。

⑸紫外检测仪。

⑹移液器。

2. 试剂⑴口腔拭子DNA抽提试剂盒。

⑵琼脂糖。

⑶1×TAE电泳缓冲液:980ml蒸馏水中加入50×TAE母液20ml。

⑷50×TAE母液:Tris 121g,0.5M EDTA(pH8.0)50ml,冰醋酸28.55ml,定容至500ml。

氯吡格雷、阿司匹林药物相关基因多态性的临床分析

氯吡格雷、阿司匹林药物相关基因多态性的临床分析

氯吡格雷、阿司匹林药物相关基因多态性的临床分析刘磊磊;叶民;丁新生【摘要】目的分析CYP2C19、GPⅢa、PTGS1、GP1BA基因多态性.方法收集2017年1月至11月在我院神经内科住院共159例患者基本信息,检测CYP2C19、GPⅢa 、PTGS1、GP1BA基因.结果患者平均年龄(65.32 ± 12.71)岁,其中男 112例(70. 4%),女 47例(29. 6%).CYP2C19*2G681A基因中 GG 58例(36.5%),GA 82例(51.6%),AA 19例(11.9%);CYP2C19*3G636A分型:GG 141例(88.7%),GA 18例(11.3%);CYP2C19*17C806T分型:CC 155例(97.5%),CT 4例(2.5%);GPⅢa基因:TT 157例(98.7%),TC 2例(1.3%);PTGS1基因:AA 159例(100%);GP1BA基因CC 136例(85.5%),CT 23例(14.5%).除PTGS1外,余基因型的频率没有显著偏离Hardy-Weinberg平衡.表型:氯吡格雷超快代谢者2例(1.3%),快代谢者47例(29.6%),中间代谢82例(51.6%),慢代谢者28例(17.6%);阿司匹林抵抗型2例(1.3%),敏感型157例(98.7%).结论基因型分型提示氯吡格雷慢代谢者发生率明显高于阿司匹林抵抗型.%Objective To analyse the polymorphisms ofCYP2C19,GPⅢa,PTGS1,GP1BA genes.Methods The basic information of 159 patients in the department of neurology of our hospital during January 2017 to November 2017 was collected. CYP2C19、GPⅢa、PTGS1、GP1BA genes were detected. Results The average age of the patients was (65.32+12.71)years old,including 112 men (70.4%)and 47 female (29.6%). As for the CYP2C19*2G681Apolymorphism,there were 58 GG-genotype carriers,82 GA-genotype carriers and 19 AC-genotype carriers. For theCYP2C19*3G636Apolymorphism,there were 141 GG-genotype carriers and 18 GA-genotype carriers,for the CYP2C19*17C806Tpolymorphism,therewere 155 CC-genotype carriers and 4 CT-genotype carriers. For the GPⅢa polymorphism,the TT genotype had 157 carriers,and the TC genotype had two carriers. For the PTGS1 polymorphism,there were 159 AA-genotype carriers.For the GP1BA polymorphism,the CC genotype had 136 carriers and the CT genotype had 23 carriers. The distribution of genotypes fitted the Hardy-Weinberg equilibrium for all the polymorphisms,except those of PTGS1.Phenotypes:there were 2 clopidogrel ultra metabolizer (1.3%),47 extensive metabolizer (29.6%),82 intermediate metabolizer (51.6%),and 28 poormetabolizer (17.6%). For aspirin,2 resistance (1.3%)and 157 sensitive (98.7%).Conclusion Clopidogrel poor metabolizer is significantly higher than aspirin resistance.【期刊名称】《临床神经病学杂志》【年(卷),期】2018(031)006【总页数】4页(P414-417)【关键词】阿司匹林;氯吡格雷;基因多态性【作者】刘磊磊;叶民;丁新生【作者单位】210019 南京明基医院(南京医科大学附属明基医院)神经内科;210019 南京明基医院(南京医科大学附属明基医院)神经内科;210019 南京明基医院(南京医科大学附属明基医院)神经内科【正文语种】中文【中图分类】R963近年来,卒中已成为人类死亡的第四大病因,是我国人口死亡的首要疾病,其中脑梗死又称缺血性卒中,占卒中的80%左右[1]。

基因多态性检测方法

基因多态性检测方法

基因多态性检测方法
基因多态性是指在人群中存在着不同等位基因频率的现象,这种现象在一定程
度上能够解释不同个体对于相同疾病易感性的差异。

基因多态性的检测方法对于疾病的预防、诊断和治疗具有重要的意义。

本文将介绍基因多态性检测方法的相关内容。

首先,常见的基因多态性检测方法包括基因测序、基因芯片技术和基因突变检测。

基因测序是指通过测序技术对基因组的特定区域进行测序,从而确定个体的基因型。

基因芯片技术则是利用微阵列芯片来检测基因多态性,其优势在于能够同时检测多个基因位点。

而基因突变检测则是针对已知的疾病相关基因突变进行检测,以确定个体是否携带有害突变。

其次,基因多态性检测方法的选择应根据具体的研究目的和预算来确定。

对于
基因型的初步了解,基因测序是一种较为全面的方法;而对于大规模的基因多态性研究,基因芯片技术则更为适用;而对于已知的疾病相关基因突变的检测,则可以采用基因突变检测方法。

另外,基因多态性检测方法的应用不仅局限于科研领域,同时在临床诊断和个
体健康管理中也具有重要意义。

例如,通过对个体基因多态性的检测,可以预测个体对于特定药物的代谢情况,从而实现个体化用药。

此外,基因多态性检测还可以用于遗传疾病的早期诊断和风险评估,为个体健康提供更为精准的预防和干预措施。

总之,基因多态性检测方法对于科研、临床诊断和个体健康管理具有重要的意义。

随着基因检测技术的不断进步和普及,相信基因多态性检测方法将会在未来发挥越来越重要的作用,为人类健康事业做出更大的贡献。

药物相关基因多态性检测试剂的设计与评估思路

药物相关基因多态性检测试剂的设计与评估思路韩昭昭【摘要】文章旨在阐述基于药物相关基因多态性检测试剂的试剂盒设计、分析性能评估和临床评价的思路.通过介绍该类试剂的申报情况,分析该类试剂的注册申报资料中常见问题,对检测试剂的预期用途、企业内部参考品与质控品的设置、分析性能评估及临床评价等部分注册申报资料要求进行解析.【期刊名称】《中国医疗器械信息》【年(卷),期】2017(023)015【总页数】3页(P6-7,32)【关键词】药物相关基因多态性;性能评估;个体化医疗;技术审评;临床评价【作者】韩昭昭【作者单位】国家食品药品监督管理总局医疗器械技术审评中心北京 100044【正文语种】中文【中图分类】R197.39Abstract: This paper aims to illustrate the idea of pharmacogenetic tests of human genotypic markers kit design, analytical performance evaluation and clinical evaluation.On the basis of introducing declarations of the reagents, analysis registration dossier common problems. And analysis the requirement of performance evaluation, reference material and control setting , clinical evaluation study. This paper aims to analysis of the generalproblem in the registration dossier and make recommendations on in vitro diagnostic device of tumor markers.Key words: drug related human genotypic markers, performace evaluation, individualized medicine, technical review, clinical evaluation随着药物基因组学和药物遗传学的研究进展,传统的基于工作总结的“经验医学”模式、基于循证医学的“标准化医学”模式和“分层医学”模式逐渐向基于个体基因多态性的“个体化医学”模式转移[1]。

基因多态性与药物治疗效果的关系

基因多态性与药物治疗效果的关系现代医学在治疗疾病方面越来越倾向于个性化治疗,这其中,基因多态性已成为研究热点之一。

基因多态性是指同一种基因在不同个体中存在不同的表达形式,这种差异可以影响个体的药物治疗效果,甚至会导致不良反应的发生。

因此,了解基因多态性与药物治疗效果之间的关系,对于提高治疗效果、减少患者的不良反应都有十分重要的现实意义。

1 基因多态性是什么?基因多态性是指同一种基因在不同个体中存在不同的表达形式,这些表达形式是由于基因序列的变异造成的。

常见的基因多态性包括单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)、基因剪接变异(Alternative Splicing,AS)、功能芯片或灰区多态性、DNA重复序列多态性等。

其中,SNP是最常见的一种基因多态性,指同一个基因某个位点出现不同的碱基取代,常用字母表示。

比如,在基因PPARA的位点rs4253778上,如果发生了C/G的替换,那么我们就叫这个位点是一个SNP,把CG的基因型称为一个等位基因。

2 基因多态性如何影响药物治疗效果?基因多态性影响药物治疗效果的主要方式是通过影响药物的代谢和分布。

药物在人体内的代谢主要是通过细胞色素P450酶(Cytochrome P450, CYP)降解完成的。

但是,不同的基因型可能导致同一种酶的表达量或活性不同,从而影响药物的代谢速率。

比如,CYP2D6酶在体内代谢许多临床上常用的药物,如氯丙嗪、芬太尼等,但是,CYP2D6酶的表达量和活性与其基因多态性相关,将个体分为完全代谢型(EM)、部分代谢型(PM)、极度代谢型(UM)等几种类型。

如果医生在处方时不考虑患者的CYP2D6基因型,就容易使药物浓度达到了中毒程度或完全无效。

除了影响药物代谢的酶外,基因多态性还可以影响药物在人体内的分布、转运等方面,进一步影响药物的吸收和利用。

比如,心血管药物普萘洛尔可以被P-glycoprotein(P-gp)转运出肝脏,基因多态性导致P-gp的表达量或功能不同也会影响药物的代谢效果。

CYP2C19药物代谢酶基因多态性检测试剂注册技术审查指导原则2022年

CYP2C19药物代谢酶基因多态性检测试剂注册技术审查指导原则(2022年)本指导原则是在现行法规和标准体系以及当前认知水平下制定的,随着法规和标准的不断完善,以及科学技术的不断发展,本指导原则相关内容也将适时进行调整。

一、适用范围药物代谢酶在药物体内代谢过程中起着重要作用,其活性强弱是药物代谢速率的重要影响因素,直接决定了药物作用的强度和持久性。

人体内的药物代谢酶主要有细胞色素P450(CYP450)同工酶和N- 乙酰转移酶(NAT)等。

CYP2c19酶是一种重要的CYP450同工酶,临床以CYP2c19酶为主要代谢酶的药物包括抗血小板药物(如:氯吡格雷)和质子泵抑制剂等。

氯吡格雷是一种抗血小板药物,广泛用于:急性冠脉综合征(ACS)患者,包括非ST段抬高性ACS (不稳定性心绞痛UA或非Q波心肌梗死)和ST段抬高性心肌梗死(NSTEMI)患者,其中,非ST段抬高性ACS包括经皮冠状动脉介入术后置入支架的患者;外周动脉性疾病患者;近期心肌梗死或近期缺血性卒中患者。

氯吡格雷作为一种前体药物,本身并无药理活性,主要经CYP2c19酶代谢活化,产生活性代谢产物,后者与血小板表面的P2Y12受体不可逆结合,抑制血小板聚集,干扰ADP介导的血小板活化,发挥抗血小板效应。

CYP2C19酶的编码基因为CYP2C19基因,位于人类10号染色体上。

CYP2c19基因含有42个等位基因,CYP2C19*1为野生型等位基因,其编码的酶具有正常活性。

CYP2C19*2(rs4244285,c.681G>A)和CYP2C19*3 (rs4986893,c.636G>A)编码的CYP2c19酶活性降低,是中国人群中存在的2种主要的等位基因,在中国人群的发生频率分别为23.1%〜35%和2%〜7%。

CYP2C19*17 (rs12248560,c.-806C>T)编码的 CYP2c19 酶活性增强,在中国人群的发生频率约为0.5%〜4%。

基因多态性与药物副作用风险评估

基因多态性与药物副作用风险评估随着人们对个体差异越来越关注,基因多态性与药物副作用之间的关系日益受到重视。

基因多态性是指基因在整个人群中存在多个不同的等位基因,这些不同的等位基因可能会导致不同的功能表达。

药物副作用则是药物在治疗目标疾病的同时对人体其他器官或系统产生的负面影响。

本文将探讨基因多态性与药物副作用风险评估之间的关系,并探讨基因多态性在药物副作用风险评估中的应用。

基因多态性对药物代谢和响应的影响已被广泛研究。

药物在体内的代谢通常由特定的酶系统进行,这些酶系统由特定的基因编码。

基因多态性可能会导致药物代谢酶的活性变异,从而影响药物的代谢速率和药物浓度。

一些个体可能会因为基因多态性而产生高峰浓度,导致药物治疗效果不佳或出现毒性反应。

例如,乙醇酸中医药以及心脑血管疾病的常用药物华法林(Warfarin)的抗凝效果会受到维生素K表达基因的多态性影响。

另外,药物的受体也受基因多态性的影响。

不同的基因多态性会导致药物受体在不同个体中的表达水平和结构变异,从而影响药物的作用效果。

例如,癌症治疗药物顺铂(Cisplatin)的抗肿瘤效果会受到DNA修复酶基因的多态性影响。

基于基因多态性与药物副作用之间的关系,药物副作用风险评估成为了现代医学中一个重要的研究领域。

药物副作用风险评估的目标是确定患者在接受特定药物治疗时患上不良反应的风险。

通过研究患者基因多态性与药物副作用之间的关系,可以预测患者在接受某种药物治疗时有多大的可能性会发生副作用。

这种个性化的评估有助于医生在选择药物和调整剂量时减少患者潜在的不良反应风险。

基因多态性在药物副作用风险评估中的应用主要有两方面。

首先,基因多态性可以用作药物副作用的预测因子。

通过对大样本人群进行研究,可以找到与特定药物副作用相关的基因多态性。

然后,利用这些基因多态性可以对患者进行分型,并通过算法模型预测该患者在接受药物治疗时发生副作用的风险。

例如,研究发现ACE(血管紧张素转化酶)基因的I/D多态性与支气管哮喘患者使用ACE抑制剂治疗时出现尿蛋白升高的风险有关。

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.6中国医疗器械信息 | China Medical Device Information专题·技术审评Thematic Forum · T echnical Review随着药物基因组学和药物遗传学的研究进展,传统的基于工作总结的“经验医学”模式、基于循证医学的“标准化医学”模式和“分层医学”模式逐渐向基于个体基因多态性的“个体化医学”模式转移[1]。

药物基因组学从基因组水平出发,研究基因序列多态性与药物效应多样性之间相互关系。

通过研究影响药物吸收、分布、代谢、排泄等个体差异的基因特性以及基因多态性导致的药物效应多样性来减少不良反应的发生、提高疗效,达到个体化给药的目的[2]。

2010年,由于氯吡格雷个体化差异带来的严重心血管不良反应,FDA 要求对氯吡格雷说明书加注“黑框警告”。

其中,告知临床医师目前已存在CYP2C19基因型检测,建议无法将氯吡格雷转化为活性形式的慢代谢型患者改用其他抗血小板药物[3]。

目前采用分子诊断技术有针对性的检测预期用药人群的相关基因多态性,可辅助医生制定用药方案,减少药物不良反应。

1.注册申报情况自2009年我国首次批准药物相关遗传多态性基因检测试剂以来,有多家国内专注于分子诊断产品的公司申报并陆续上市了多个相关产品。

然而就获批产品数量而言,仍远少于其他基因检测试剂,检测靶点目前主要包括药物作用靶点(如血管紧张素转化酶基因)和药物代谢酶相关基因(如编码细胞色素酶P450基因)的检测。

方法学主要有基因芯片技术、PCR 毛细电泳片段分析法、PCR 荧光探针法等。

近年来随着人类基因组序列图谱的绘制完成,蛋白纯化、分子克隆技术和多态性检测技术的成熟,研究者对药物遗传多态性基因的研究飞速发展,其中验证较为充分的部分项目已转化为产品并进行了注册申报。

收稿日期:2017-06-01药物相关基因多态性检测试剂的设计与评估思路韩昭昭 国家食品药品监督管理总局医疗器械技术审评中心 (北京 100044)文章编号:1006-6586(2017)15-0006-02 中图分类号:R197.39 文献标识码:A内容提要: 文章旨在阐述基于药物相关基因多态性检测试剂的试剂盒设计、分析性能评估和临床评价的思路。

通过介绍该类试剂的申报情况,分析该类试剂的注册申报资料中常见问题,对检测试剂的预期用途、企业内部参考品与质控品的设置、分析性能评估及临床评价等部分注册申报资料要求进行解析。

关 键 词: 药物相关基因多态性 性能评估 个体化医疗 技术审评 临床评价Ideas about Design and Evaluation for Pharmacogenetic Tests of Human Genotypic MarkersHAN Zhao-zhao Center for Medical Device Evaluation, CFDA (Beijing 100044)Abstract :This paper aims to illustrate the idea of pharmacogenetic tests of human genotypic markers kit design, analytical performance evaluation and clinical evaluation. On the basis of introducing declarations of the reagents, analysis registration dossier common problems. And analysis the requirement of performance evaluation, reference material and control setting , clinical evaluation study. This paper aims to analysis of the general problem in the registration dossier and make recommendations on in vitro diagnostic device of tumor markers.Key words:drug related human genotypic markers, performace evaluation, individualized medicine, technical review, clinical evaluation技术审评·专题T echnical Review · Thematic Forum2.预期用途该类检测试剂用于定性检测用药相关基因多态性,主要包括药物作用靶点、药物转运蛋白、药物代谢酶相关基因,临床上用于辅助指导临床治疗药物的选择及药物剂量的设定。

生产企业在进行联合检测的项目设置应注意具有临床意义,即所有设定位点应对特定适应症有协同辅助诊断意义。

特定适应症可指某一特定疾病,如高血压用药相关多基因联合检测可作为统一注册单元;或某一类药物,如华法林相关基因联合检测。

不建议按照基因进行联合检测。

如CYP2C19基因的不同型别与抗惊厥药、抗凝血药物、抗高血压药物等相关,不建议将该基因所有不同型别作为联合检测项目进行申报。

应谨慎对待“筛查”和“预测”用途的声称。

“筛查”用途需采用无症状人群进行充分的临床实验,充分考虑低发病率与假阳性带来的影响,同时应有临床相关诊疗指南支持。

“预测”用途则需要在临床实验中对充分样本数的跟踪随访样本进行研究,验证待测靶标与用药疗效之间的关系。

3.企业内部参考品与质控品的设置本类检测试剂项目目前暂无国家参考品及国际参考品提供,企业应根据试剂盒检测靶标设置企业内部参考品。

企业内部参考品建议包含:基因型参考品、最低检出量参考品、精密度参考品及特异性参考品。

参考品设置应包含所有声称可以检测的基因型别,建议尽量选择临床真实样本制备企业内部参考品,对于罕见的基因型别可采用人工构建的方法制备内部参考品。

建议在试剂盒中配置合理的质控品,外部质控品应包含阳性质控品与阴性质控品,阳性质控品应包含低浓度水平;内对照设置也应合理,选择管家基因或其他源于人类基因组DNA无已知单核苷酸多态性位点的片段。

基于不同检验原理的试剂盒质控品的设置可能有所不同,然而都应确保有效控制检测过程中各个关键步骤,确保检测的完成并且无污染及交叉反应发生。

企业内部参考品及试剂盒内质控品的设置应注意包含不同浓度水平。

参考品应包含多个浓度水平(至少包含高和低浓度水平);试剂盒内质控品应至少包含最低检出量浓度水平,以有效监测检验的可靠性。

申请人应于申报资料中详细描述参考品及质控品的制备(构建)方法、序列的确定方法、量值确定方法并明确基质成分。

4.分析性能评估分析性能评估资料是注册产品说明书声称性能指标的重要支持资料,此部分资料应涵盖产品研制阶段对试剂盒进行的所有性能验证的研究资料。

对于本类产品建议应包括以下内容:①对提取试剂的验证,至少包含提取效率、提取重复性、提取抗干扰能力及提取后样本的稳定性的研究;②基因型参考品符合率;③最低检出限研究,应包含所有声称可检测基因型,研究资料包含确认与验证两部分资料,具体研究方法可参考国家食品药品监督管理总局已发布核酸检测试剂相关审查指导原则;④最高检出浓度研究资料;⑤精密度研究,采用不同浓度水平,包含所有声称检测型别(野生型与突变型)进行,建议研究者考虑不同操作者、不同检测地点及不同运行等所有可能影响检测结果的因素;⑥样本相容性研究,验证所有适用样本类型(包含不同抗凝剂类型)都可以测得准确的结果;⑦干扰试验,建议包括内源性物质的定量干扰试验、常用药物及预期人群治疗药物干扰试验、同源性物质的干扰、样本间携带干扰试验;⑧交叉反应研究,研究与非人类基因组DNA、与待测靶基因核酸序列相近或具有同源性的其他序列(如其他突变型别)间是否存在交叉反应。

5.临床评价临床实验入组应选择预期人群,不建议大量入组健康人群进行临床实验。

如华法林用药相关基因检测试剂的临床实验,应选择预期使用华法林用于预防血栓栓塞的患者入组。

应注意临床准确性验证的充分性,确保入组研究具有统计学意义的样本量,对每个声称可检测的位点、每种突变类型(纯合、杂合)和野生型进行充分的一致性研究。

样本量与该检测试剂的性能,如重复性等相关,应提供样本入组量统计分析。

对于已有同类产品上市的产品,建议采用实验用体外诊断试剂与已上市产品针对临床样本进行比较研究。

在比较与已上市产品的检测结果一致性的基础上,还应对所有声称检测基因位点,每个位点不少于30例,进行用药相关临床实验,以验证基因型别与临床用药之间的关系。

对于与药物代谢酶相关位点检测试剂,可以用药物代谢特征(如慢代谢、快代谢)来反应检测靶点与药物之间的关系;对于与药物作用靶点相关位点检测试剂,则可以用临床药效(敏感性)作为观察指标。

(下转第32页)7.China Medical Device Information |中国医疗器械信息.32中国医疗器械信息 | China Medical Device Information标准检测Standard and T esting6.运输稳定性体外诊断试剂运输稳定性主要是考察试剂在实际销售运输过程中的各种条件,对诊断试剂性能的影响。

目前进行运输稳定性主要有模拟试验和实际运输两种方式。

在进行运输稳定性之前,应掌握试剂在实际销售过程中的运输情况,对于大多数试剂而言,在实际运输稳定性研究时,结合目前实际,选取终端客户最远端,充分考虑天气条件、货物转运周期及运输方式,将产品递送至目的地,在此过程中,实时记录温度和湿度等参数,在此条件下评估产品的性能。

运输稳定性的研究建议结合目前监管部门对体外诊断试剂冷链管理的有关要求执行。

对于模拟试验,运输条件的模拟应当基于对实际运输条件的了解,如运输时间、预温度和湿度等)。

值得注意的是,对于不同类型的产品,影响运输稳定的因素各有侧重,比如胶体金试纸条类产品,只要保证密封良好,运输过程中湿度的要求可以适当放宽;对于核酸类试剂,必须要保证运输过程的温度要符合企业的要求。

随着大众医疗需求的不断提高,高质量的体外诊断信息,对于切实发挥临床诊断的指导作用具有重要意义,而体外诊断试剂的稳定是临床诊断信息质量的重要保证,因此,建议诊断试剂制造商重视体外诊断试剂的稳定性研究,按照法规要求,结合产品实际,规范、合理地开展研究工作,保证体外诊断试剂的安全有效。

对于全新无同类上市产品的申报产品,可进行与测序方法的比对研究,验证检测准确性。

另外还需特别注意验证待测位点与用药之间的关系。

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