生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制、结果分析分析

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琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析

琼脂糖凝胶电泳详细过程与步骤分析琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis)是一种常见的分离和鉴定DNA和RNA分子的实验技术。

它基于DNA和RNA分子在电场中对琼脂糖凝胶的移动速率的差异来进行分离。

以下是琼脂糖凝胶电泳的详细过程与步骤分析:1.准备琼脂糖凝胶:-准备琼脂糖溶液:按照规定比例在缓冲液中加入适量的琼脂糖并混匀。

-加热琼脂糖溶液:将琼脂糖溶液加热至完全溶解,通常在微波炉或水浴中进行。

-倒入模具:在凝胶电泳槽中设置模具,倒入热琼脂糖溶液并待其凝固。

2.准备样品:-提取DNA或RNA:采用适当的提取方法从待测样品中提取所需的DNA 或RNA。

-混合DNA或RNA与加载缓冲液:将提取的DNA或RNA与适量的加载缓冲液混合,以增加样品密度并提供电泳所需的离子浓度。

3.加载样品:-打开模具和样品孔:在琼脂糖凝胶上方打开模具,使用注射器或微量吸管在样品孔中加入适量的样品。

-加载DNA或RNA标记物:如果需要对DNA或RNA进行标记,则需要在样品中加入适量的荧光标记物,并在加载完样品后用紫外灯进行可视化检测。

4.进行电泳:-连接电极:将电泳槽连接到电源,将阳极和阴极电极分别插入缓冲液中的两端。

-调节电流:将所需电流值设置在电源上,并进行预运行电流以使电流通过样品和凝胶。

-进行电泳:打开电源,开始电泳过程,直到样品达到适当的分离位置。

5.可视化与分析结果:-停止电泳:当DNA或RNA样品达到预期位置时,关闭电源并断开电极。

-可视化:用染料(如乙溴橙)染色凝胶电泳的凝胶,或使用紫外灯照射凝胶以可视化DNA或RNA标记物的荧光。

-分析结果:使用图像捕捉设备(如凝胶图像系统)记录凝胶的图像,并根据DNA或RNA标记物的迁移距离和大小进行结果分析。

生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理步骤试剂配制结果分析分析

生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理步骤试剂配制结果分析分析

生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理步骤试剂配制结果分析分析DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物化学分离和分析方法,可以根据DNA片段的大小进行分离和鉴定。

它通过将DNA样品加载在琼脂糖凝胶孔隙中,利用电场的作用使DNA片段沿电场方向迁移,从而实现分离和鉴定。

以下是关于DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制和结果分析的详细解释。

原理:DNA琼脂糖凝胶电泳原理是根据DNA片段的大小和电荷来进行分离。

琼脂糖凝胶是一种大分子网状结构,DNA片段在凝胶中迁移时受到阻碍,较短的DNA片段能够比较快速地通过凝胶,而较长的DNA片段迁移速度较慢。

步骤:1.准备琼脂糖凝胶:将琼脂糖粉溶解在缓冲液中,加热,混合均匀后倒入电泳槽。

插入槽糖待凝固。

2.准备DNA样品:将待测的DNA样品加入到琼脂糖样品缓冲液中。

可加入染料以便可视化DNA迁移。

3.加载DNA样品:将DNA样品缓冲液均匀地加载到琼脂糖凝胶孔隙中。

4.进行电泳:将电泳槽两端连接上电源,设定合适的电场强度和电泳时间,使DNA片段在凝胶中迁移。

5.可视化DNA片段:停止电泳后,将琼脂糖凝胶转移到紫外可视化仪中,或者使用DNA染料染色,然后观察和记录DNA片段的迁移位置。

试剂配制:1. 缓冲液(TAE缓冲液):配制1X TAE缓冲液的方法是将0.4 MTris(pH 8.0)、0.2 M醋酸和0.01 M EDTA混合,在加75 ml水至1 L,将该缓冲液与琼脂糖按比例混合。

2. DNA染料:可以使用SYBR Green I等DNA染料,按照厂家说明进行稀释。

结果分析:DNA琼脂糖凝胶电泳的结果主要通过观察和记录DNA片段的迁移位置来进行分析。

根据DNA片段的大小,可以判断不同样品中的DNA片段是否存在,或者根据已知大小的DNA片段作为标记物,来确定未知DNA片段的大小。

通常,较小的DNA片段迁移得更快,迁移距离较大,而较大的DNA片段迁移得更慢,迁移距离较短。

琼脂糖凝胶电泳及DNA纯化

琼脂糖凝胶电泳及DNA纯化

琼脂糖凝胶电泳法分离DNA,主要是利用分子筛 琼脂糖凝胶电泳法分离DNA,主要是利用分子筛 DNA 效应,迁移速度与分子量的对数值成反比关系。 效应,迁移速度与分子量的对数值成反比关系。 因而就可依据DNA分子的大小使其分离。 DNA分子的大小使其分离 因而就可依据DNA分子的大小使其分离。该过程 可以通过把分子量标准参照物 分子量标准参照物和样品一起进行电 可以通过把分子量标准参照物和样品一起进行电 泳而得到检测。 泳而得到检测。 溴化乙锭(EB)为扁平状分子, 溴化乙锭(EB)为扁平状分子,在紫外光照射下 发射荧光。EB可与DNA分子形成EB-DNA复合物 可与DNA分子形成EB 复合物, 发射荧光。EB可与DNA分子形成EB-DNA复合物, 其荧光强度与DNA的含量成正比。 DNA的含量成正比 其荧光强度与DNA的含量成正比。据此可粗略估 计样品DNA浓度。 计样品DNA浓度。 DNA浓度
配制多大浓度的琼脂糖凝胶, 配制多大浓度的琼脂糖凝胶,要根据被检的 DNA分子大小来确定。 分子大小来确定。 分子大小来确定
琼脂糖凝胶浓度与线性DNA分辨范围 分辨范围 琼脂糖凝胶浓度与线性
常用的电泳缓冲液
4℃ 保存备用 ℃ 保存备用.
常用的6X载样缓冲液 常用的6X载样缓冲液 6X载样 Ⅰ 0.25%溴酚蓝 ,0.25%二甲苯青 ,40%蔗糖 水溶液 Ⅱ 0.25%溴酚蓝 ,0.25%二甲苯青 ,30%甘油 水溶液
均匀混合后60℃加热融化胶块。间断振荡混合,使胶块 充分融化(约10分钟)。 5. 将融化的胶液转移到套放在2ml收集管内的UNIQ-10柱 中(吸附柱),室温放置2分钟,12000rpm室温离心1min。 (如果溶胶液大于750微升,则可多次上样) 6. 取下UNIQ-10柱,倒掉收集管中的废液,将UNIQ-10柱 放入同一个收集管中,加入500微升 Wash solution, 12000rpm 12000rpm室温离心1分钟 1 7. 重复步骤6一次 8. 取下UNIQ-10柱,倒掉收集管中的废液,将UNIQ-10柱 放入同一个收集管中,12000rpm室温离心2分钟。 9. 将UNIQ-10柱放入一根新的1.5ml离心管中,在柱子膜中 央加入40µL Elution Buffer放置2分钟。 10. 12,000rpm室温离心1分钟,离心管中的液体即为回收的 DNA片段,可以立即使用或保存于-20度使用。 4.

DNA琼脂糖凝胶电泳分析

DNA琼脂糖凝胶电泳分析
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
3. 加样
• 将DNA样品(5ul)与6 × 上样缓冲液(1ul) 混匀后, 用微量加样枪小心加入样 品孔内。
– 注意加样枪的枪头不可插入 过深,以免刺穿凝胶,导致 样品外溢。
• 每加完一个样品要更换枪 头,以防止EB污染。电泳
• 接通电源,一般红色为正极,黑色为负极,切 记DNA样品由负极往正极泳动(靠近加样孔的 一端为负),电压为5 V/cm(长度以两个电极 之间的距离计算)
• 此外,还可以从电泳后的凝胶中回收特定的 DNA条带,用于以后的克隆操作。
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
电泳指示剂:
• 核酸电泳常用的指示剂有两种 – 溴酚蓝( bromophenol blue, Bb ); – 二甲苯青( xylene cyanol, Xc ), 它携带的电荷量比溴酚蓝少,在凝 胶中的迁移率比溴酚蓝慢
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
• 银染色
– 银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形 成稳定的复合物,然后用还原剂如甲 醛使Ag+还原成银颗粒,可把核酸电泳 带染成黑褐色。
– 主要用于聚丙烯酰胺凝胶电泳染色, 也用于琼脂糖凝胶染色。
– 灵敏度比EB高200倍,但银染色后, DNA不宜回收
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
• 根据指示剂泳动的位置,判断是否终止电泳 当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿1~2cm处,
停止电泳
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
5. 结果观察
• 电泳结束后,将凝胶板取出。 在紫外仪上观察电泳带及其位 置,记录实验结果。
DNA琼脂糖凝胶电泳分析
注意事项
1、 倒胶时把握好胶的温度,不要高于60℃ ,否 则温度太高会使制板变形;
• 采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分子筛的作用下, 使分子大小和构象不同的核酸分子泳动率出现较大的差异,从而 达到分离核酸片段检测其大小的目的。

DNA琼脂糖凝胶电泳

DNA琼脂糖凝胶电泳
一、实验目的
学习核酸电泳的原理和优缺点,掌握琼脂糖 凝胶电泳检测DNA的技术。
二、实验原理
带电荷的物质在电场中的趋向运动称为电泳。琼 脂糖凝胶电泳是进行核酸研究的重要手段,是核 酸基因组DNA、核酸扩增等技术所不可或缺的组 成部分。浓度不同的琼脂糖可形成网孔大小不同 的分子筛,能用于分离不同分子量的核酸片段, 是分离、鉴定和纯化核酸的一种常用方法。
三、实验流程
四、实验步骤
(1)1 xTAE溶液的配制:50 xTAE溶液稀释成1 xTAE溶液。 (2)配制1%琼脂糖凝胶:用电子秤称取0.30g琼脂糖,小心移入三角瓶中,加入1 xTAE 电泳缓冲液30ml,轻轻摇匀后放入微波炉中加热30s,完全沸腾后溶液清澈透明取出, 冷却至55℃,倒入已插好样品梳的制胶槽中,胶厚3~5mm,小心赶走气泡。 (3)室温放置30~45 min,胶凝固后,小心拔出梳子,取出制胶板,放入加有1 xTAE电 泳缓冲液的电泳槽中,缓冲液高出凝胶表面1mm。 (4)用微量移液器在点样板上将5μl DNA 液+2μl 上样缓冲液充分混匀,然后用移液器 将样品加入样品孔中,一定要包括合适的DNA 分子量标准物,记录点样顺序。 (5)盖上电泳槽的盖子,连接好电线和电源,打开电源,在1~10V/cm 凝胶的电压降下 进行电泳。 (6)当加样缓冲液中的溴酚蓝迁移至足够分离DNA 片段的距离时,关闭电源。 (7)将凝胶置于0.5μg/ml 溴化乙锭中染色10 min,在紫外下观察,拍照,保存照片。
五、注意事项
(1)凝胶中DNA的上样量要合适,太多会引起DNA条 带模糊,太少又会引起条带信号弱或无DNA带。 (2)EB染色时要带

DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤

DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤
称取Tris242.2g,无水乙酸钠82.03g,EDTA-Na237.23g,先用400ml双蒸水加热搅拌溶解后,再用冰乙酸调pH至8.0(大约加入冰乙酸50ml),然后定容至500ml。用时稀释100倍。
4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内加入电泳缓冲液,然后拔出梳子。
5、加样
将DNA样品与加样缓冲液(loading buffer)按4:1混匀后,用微量移液器将混合液加到样品槽中,每槽加10-20μl,记录样品的点样次序和加样量。
6、电泳
安装好电极导线,点样孔一端接负极,另一端接正极,打开电源,调电压至3-5V/cm,电泳1-3hr,当溴酚蓝移到距凝胶前沿1-2cm时,停止电泳。
2、琼脂糖凝胶的制备
称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,(按0.3-1.5%的琼脂糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝胶,20-100kb的DNA用0.5%的凝胶,200-2000bp的DNA用1.5%的凝胶)置微波炉或沸水浴中加热至完全溶化(不要加热至沸腾),取出摇匀。
3、灌胶
将冷却到60℃的琼脂糖溶液轻轻倒入电泳槽水平板上。
一、实验目的
学习和掌握琼脂糖电泳法鉴定DNA的原理和方法。
二、实验原理
琼脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8.0的缓冲液)带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率液不同。溴化乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选重组子的目的。
三、实验材料
实验14提取的DNA样品,
四、器具及药品

dna琼脂糖凝胶电泳原理

dna琼脂糖凝胶电泳原理

dna琼脂糖凝胶电泳原理DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离、纯化和分析DNA分子的方法。

它基于DNA分子在电场下的迁移速度与其分子大小和形态之间的关系,利用琼脂糖凝胶的孔隙结构来分离DNA分子。

在这篇文章中,我将深入探讨DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、方法和应用,并分享我的个人观点和理解。

一、DNA琼脂糖凝胶电泳的原理DNA分子是生物体内存储遗传信息的重要分子,其大小可在数百至数千碱基对之间。

DNA琼脂糖凝胶电泳是基于电荷分离的原理进行的。

DNA分子在电场中会带有负电荷,因此会受到电场力的作用而迁移。

琼脂糖凝胶是一种多孔性凝胶,可以形成一些微小的孔隙,这些孔隙能够根据DNA分子的大小和形态来筛选DNA分子。

当DNA样品通过琼脂糖凝胶电泳时,较小的DNA分子会迁移更快,而较大的DNA 分子会迁移更慢。

通过对琼脂糖凝胶上DNA分子的分离和检测,我们可以得到DNA分子的大小分布信息,进而进行DNA的纯化、分析和定性等研究。

二、DNA琼脂糖凝胶电泳的方法1. 准备琼脂糖凝胶:我们需要制备一定浓度的琼脂糖溶液,并加热融化。

我们将琼脂糖溶液倒入电泳槽中,在上下两端放置电极,形成一个电场。

2. 准备DNA样品:将需要进行分析的DNA样品与染料混合,使之具有一定的负电荷,并进行预处理,如加热变性。

3. 进行电泳分离:将DNA样品施加在琼脂糖凝胶孔隙上方,开启电源,使电场通过琼脂糖凝胶。

DNA分子会在电场力的作用下从样品孔隙处迁移到相反电极的方向。

迁移的速度与DNA分子的大小和形态有关,较小的DNA分子迁移较快,而较大的DNA分子迁移较慢。

4. 可视化和分析:凝胶电泳结束后,我们可以使用染料或放射性示踪剂来可视化DNA分子的分离结果,如荧光染料或放射性探针。

通过观察凝胶上的DNA条带,我们可以推测DNA分子的大小分布,进而对样品进行纯化、分析和定性等进一步研究。

三、DNA琼脂糖凝胶电泳的应用DNA琼脂糖凝胶电泳技术在分子生物学、遗传学和犯罪学等领域都有广泛的应用。

dna凝胶电泳原理

dna凝胶电泳原理

dna凝胶电泳原理
DNA凝胶电泳是一种常用的分离和鉴定DNA片段的方法,基于DNA分子电荷的大小和形状差异。

其原理是通过将DNA
样品运用电场作用力迁移到凝胶中进行分离。

下面将详细介绍其原理和步骤:
1. 准备凝胶:通常使用琼脂糖凝胶作为分离基质。

将琼脂糖加入缓冲溶液中,加热溶解后制备成凝胶。

凝胶浓度可根据需求选择,较低浓度适用于分离大分子量的DNA片段,较高浓度
适用于分离小分子量的DNA片段。

2. 配制电泳缓冲液:电泳缓冲液采用一种称为TAE(三羟乙
丙烷三乙酸)或TBE(三硼酸三甲酯)的缓冲盐溶液。

此缓
冲液有助于维持电流稳定性,平衡样品的电荷。

3. 加载DNA样品:将待检测的DNA样品与DNA标记物混合。

DNA标记物是在DNA片段末端加入荧光染料或放射性标记物,用于可视化DNA分子的迁移。

混合物应加入特定体积的加载
缓冲液中。

4. 分离电泳:将混合物缓慢、均匀地加入至凝胶的一个孔上,然后连接电源线,通以恒定电压,使DNA在凝胶中迁移。

DNA带根据片段的大小不同而以不同速度迁移,较长的片段
迁移较慢,较短的片段迁移较快。

5. 可视化分析:电泳结束后,凝胶在紫外线灯下进行照射,DNA片段会与标记物一起发光或显示出带状图案。

根据标记
物的位置和迁移距离,可以确定DNA片段的大小和数量。

DNA凝胶电泳可用于分析DNA片段长度、DNA浓度以及分离杂合子等。

它在分子生物学、遗传学和法医学等领域具有广泛应用。

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凝胶冷却至50°C,加EB至终浓度0.5μg/ml


凝胶凝固后取出梳子
加电泳缓冲液
准备样品




注意观察溴酚蓝染液的迁移
紫外灯下观察电泳结果


DNA琼脂糖凝胶电泳
实验原理
琼脂糖为链状多糖 →绳状琼脂糖束→大网孔型凝
胶 ——分离、鉴定、纯化DNA
在 pH 值为 8.0~8.3 时,核酸分子碱基几乎不解
离,磷酸全部解离,核酸分子带负电,在电泳时 向正极移动。
采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分
子筛的作用下,使分子大小和构象不同的核酸分
子泳动率出现较大的差异,从而达到分离核酸片 段检测其大小的目的。
实验原理
当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(Ethidium
bromide, EB)染色, 在紫外光下至少可以检出110ng的DNA条带, 从而可以确定DNA片段在凝胶 中的位置。
此外, 还可以从电泳后的凝胶中回收特定的DNA
条带, 用于以后的克隆操作。
状DNA>开环DNA
DNA片段越长,泳动速度越慢
在低电压时,泳动速度与电场强度成正比
不同浓度琼脂糖分离DNA分子的范围
琼脂糖浓度(W/V,%) 分离范围(kb)
0.3
0.6 0.7 0.9 1.2
5-60
1-20 0.8-10 0.5-7 0.4-6
1.5
2.0
0.2-4
0.1-3
DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。
胶浓(%) 0.6 溴酚蓝 b 0.15kb
2kb
1.6kb
操作步骤
琼脂糖凝胶的制备:溶化,冷却,EB 凝胶板的制备:加梳子,倒胶 样品的制备:样品+1/5体积溴酚蓝
加样:加样端为负极(黑)
电泳:5V/cm
观察:紫外灯下观察,照相
溶 胶
准备胶槽
该技术操作简便快速,可以分辨用其它方法(如
密度梯度离心法)所无法分离的DNA片段。
影响DNA迁移率的因素
影响DNA迁移率的因素:DNA分子的大小、构
象,凝胶浓度,电压,电泳缓冲液的组成等
缓冲液pH>DNA pI,DNA带负电荷,迁移率与
分子量对数成反比
DNA分子构象影响迁移率:共价闭环DNA>线
琼脂糖凝胶中DNA的观察
溴化乙锭(EB)—DNA:紫外光下 桔红色荧光
主要实验器材
电泳仪
缓冲液 琼脂糖
凝胶槽
梳子 电泳槽
取液器
溴酚蓝
电泳槽结构
缓冲溶液配制表
电泳指示剂
核酸电泳常用的指
示剂有两种: 溴酚蓝 (bromophenol blue, Bb )呈蓝紫色;二甲 苯腈( xylene cyanol, Xc )呈蓝色,它携 带的电荷量比溴酚 蓝少,在凝胶中的 迁移率比溴酚蓝慢。
嵌入染料的存在
荧光染料溴化乙啶用于检测琼脂糖凝胶中的 DNA, 染料会嵌入到堆积的碱基对之间并拉长线 状和带缺口的环状DNA,使其刚性更强, 还会使 线状DNA迁移率降低15%。
离子强度影响
电泳缓冲液的组成及其离子强度影响DNA的 电泳迁移率。在无离子存在时(如误用蒸馏水配制 凝胶), 电导率最小, DNA几乎不移动; 在高离子强 度的缓冲液中(如误加10×电泳缓冲液), 则电导很 高并明显产热,严重时会引起凝胶熔化或DNA变性。
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