DNA琼脂糖凝胶电泳原理
琼脂糖凝胶电泳分离dna的原理
琼脂糖凝胶电泳分离dna的原理琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA分离技术，它基于DNA的物理性质和电性质，将DNA按照长度分离出来。
琼脂糖凝胶是一种高分子量的碳水化合物，它可以形成均匀的凝胶，通过电泳，DNA可以在凝胶中缓慢地移动，而且不分解。
琼脂糖凝胶电泳的原理是在一个电场中，DNA带有负电荷，会受到电场的力而向正极运动。
琼脂糖凝胶中的孔隙大小是不一样的，因此DNA向前移动的速度是根据其长度决定的，长链的DNA比短链的DNA移动得更慢。
在凝胶中，DNA的移动还会受到阻滞，因为琼脂糖凝胶的直径很小，只有几纳米，DNA碰到凝胶的时候，就会被彻底阻拦，因而就会停止移动。
因为琼脂糖凝胶的孔隙大小不同，所以琼脂糖凝胶电泳可以将DNA 分离成不同长度的带状图谱。
这个图谱可以用来鉴定不同物种的DNA 是否不同，或者同一物种中是否存在基因型的不同。
这种技术也可以用于判定某种疾病的基因型。
例如，通过一种叫做多态性限制酶切法的技术，可以将染色体裂开，并将切割产生的DNA分别在琼脂糖凝胶中进行电泳分离，这样就可以分离出含有重要基因信息的DNA序列。
琼脂糖凝胶电泳的操作和使用是相对简单的。
首先，制备琼脂糖凝胶，将琼脂糖和缓冲液混合在一起，使其在恒定温度下凝胶，制作成所需大小的凝胶板。
接下来，将DNA和荧光染料混合在一起，并加入样品槽中，放置在琼脂糖凝胶上方。
加上电源，使电流通过样品，从而将DNA包围在凝胶中，等待移动完成，并观察带状图谱的结果。
需要注意的是，在琼脂糖凝胶电泳中，特别是在样品制备过程中，有几个因素需要重视。
首先是DNA的保护，在取样、处理和贮存时要非常小心，避免滋生细菌或其他微生物，而且也要防止DNA在环境中分解。
其次是荧光染料，它可以帮助检测DNA是否已经升华，但需要避免过量添加，以免影响分离效果。
最后，根据实验需求选择合适的缓冲液配方和琼脂糖比例，对于琼脂糖凝胶的制备也应该准确掌握，以保障实验效果。
琼脂糖凝胶电泳通过对DNA的长度进行分离，可以深入研究遗传信息、进化过程等科学领域，同时也是疾病基因研究和诊断的重要技术手段。
DNA的琼脂糖凝胶电泳
加样
用移液器将DNA 样品液5μL与 用移液器将 DNA样品液 5μL 与 6× 上样缓冲液 1μL混匀后加入加样孔，记录点样顺序。其中一 μL混匀后加入加样孔，记录点样顺序。 个加样孔中加入DNA分子量标准品6 个加样孔中加入DNA分子量标准品6
电泳
加样完毕，将靠近样品槽一端连接负极， 加样完毕，将靠近样品槽一端连接负极，另 一端连接正极（千万不要搞错） 接通电源， 一端连接正极（千万不要搞错），接通电源，开 始电泳。在样品进胶前可用略高电压， 始电泳。在样品进胶前可用略高电压，防上样品 扩散。 样品进胶后， 应控制电压降不高于5 扩散 。 样品进胶后 ， 应控制电压降不高于 5 V／ cm(电压值 V 电泳板两极之间距离比 ) cm( 电压值V／ 电泳板两极之间距离比) 。 当染料 条带移动到距离凝胶前沿约lcm时 停止电泳。 条带移动到距离凝胶前沿约lcm时，停止电泳。
五、思考题
（1）琼脂糖与琼脂有什么不同？本次实验 为何选琼脂糖作为电泳介质？ （2）上样缓冲液由哪些成分组成？各有何 作用？ （3）常用的DNA琼脂糖凝胶电泳缓冲液有 ）常用的DNA琼脂糖凝胶电泳缓冲液有 哪些？为何在这些电泳缓冲液中要加入 EDTA？ EDTA？
琼脂和琼脂糖
琼脂是由琼脂糖和琼脂果胶组成的。琼脂糖是线性的多 聚物，基本结构是1,3连结的β 半乳呋喃糖和1,4连结的 聚物，基本结构是1,3连结的β-D-半乳呋喃糖和1,4连结的 3,6-脱水α-L-半乳呋喃糖。琼脂果胶是由许多更小的分子 3,6-脱水α 组成的异质混合物。它们的结构相似，但带硫酸根和羧 基组分，凝胶能力差。 琼脂糖具有亲水性，并几乎完全不存在带电基团，对敏 感的生物大分子极少引起变性和吸附，是理想的惰性载 体。在琼脂糖制备过程中需要把琼脂果胶尽量去除，否 则琼脂糖有可能存在极微量硫酸根和丙酮酸取代电离基 团，就会造成电内渗（EEO），电内渗对质点的移动产 团，就会造成电内渗（EEO），电内渗对质点的移动产 生影响。质量较好的琼脂糖硫酸根含量比较低，通常在 0.2%以下，电内渗比较小，通常在0.13以下。这也就是琼 0.2%以下，电内渗比较小，通常在0.13以下。这也就是琼 脂糖比琼脂贵那么多的原因了。
生物化学经典实验DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、步骤、试剂配制、结果分析分析
凝胶冷却至50°C，加EB至终浓度0.5μg/ml
铺
胶
凝胶凝固后取出梳子
加电泳缓冲液
准备样品
点
样
电
泳
注意观察溴酚蓝染液的迁移
紫外灯下观察电泳结果
照
相
DNA琼脂糖凝胶电泳
实验原理
琼脂糖为链状多糖 →绳状琼脂糖束→大网孔型凝
胶 ——分离、鉴定、纯化DNA
在 pH 值为 8.0～8.3 时，核酸分子碱基几乎不解
离，磷酸全部解离，核酸分子带负电，在电泳时 向正极移动。
采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物，在分
子筛的作用下，使分子大小和构象不同的核酸分
子泳动率出现较大的差异，从而达到分离核酸片 段检测其大小的目的。
实验原理
当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(Ethidium
bromide, EB)染色, 在紫外光下至少可以检出110ng的DNA条带, 从而可以确定DNA片段在凝胶 中的位置。
此外, 还可以从电泳后的凝胶中回收特定的DNA
条带, 用于以后的克隆操作。
状DNA>开环DNA
DNA片段越长，泳动速度越慢
在低电压时，泳动速度与电场强度成正比
不同浓度琼脂糖分离DNA分子的范围
琼脂糖浓度（W/V,%） 分离范围（kb）
0.3
0.6 0.7 0.9 1.2
5-60
1-20 0.8-10 0.5-7 0.4-6
1.5
2.0
0.2-4
0.1-3
DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。
胶浓（%） 0.6 溴酚蓝 b 0.15kb
2kb
1.6kb
操作步骤
琼脂糖凝胶的制备：溶化，冷却，EB 凝胶板的制备：加梳子，倒胶 样品的制备：样品+1/5体积溴酚蓝
琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法
琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法[实验原理]电泳是现在用于分离和纯化DNA片段的最常用技术。
包含电解质的多孔支持介质----“胶”并把它置于静电场中。
则DNA分子将向阳极移动，这是因为DNA分子沿其双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基。
当DNA长度增加时，来自电场的驱动力和来自凝胶的阻力之间的比率就会降低，不同长度的DNA片段就会表现出不同的迁移率。
因而就可依据DNA分子的大小来使其分离。
该过程通过把示踪染料（Purple Loading Dye）或分子量标准参照物(Ladder)和样品(DNA&RNA)一起进行电泳而得到检测。
分子量标准参照物也可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准。
琼脂糖凝胶适用于分离大小在0.2-50Kb范围内的DNA片段。
[实验用品]1.琼脂糖 1.0%1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液(TAE),微波炉中火30秒至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时可加入10mg/ml溴化乙锭10μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子(鉴定胶用细密点的梳子；回收胶用粗稀的梳子）的胶膜中在室温下放置30-45min后现进行电泳。
1.5%:琼脂糖1.5g。
2.电泳缓冲液50×TAE Tris 乙酸 Tris 242g 终2 mol/L乙酸57.1ml 终1mol/L0.5M EDTA200ml pH8.0 终100mmol/LdH2O 补足至1000ml使用时稀释1×TAE。
5×TBE Tris 硼酸 Tris 54g 终445mmol/L硼酸27.5g 终445mmol/L0.5M EDTA20ml pH8.0 终10mmol/LdH2O 补足至1000ml使用时稀释10倍成0.5倍如50ml贮存液+450ml水→500ml工作液。
[实验内容与方法]1.移取适量的琼脂糖(如制备1%的琼脂糖胶液就移1g的琼脂糖溶于100ml TAE缓冲液中)微波炉加热使其溶于TAE缓冲液中。
DNA琼脂糖凝胶电泳原理和操作
DNA琼脂糖凝胶电泳原理和操作【原理】DNA的电泳原理与蛋白质电泳基本相同。
在pH高于其pI时，DNA分子带负电荷。
在直流电场中DNA向正极泳动。
不同的DNA分子因电荷数、构象和分子量大小的不同，在同一电泳系统中的泳动速度有差异，达到分离的目的。
电泳后的凝胶浸泡于溴化乙锭染料中，溴化乙锭分子与DNA分子结合，在紫外线照射下显出荧光，可对DNA进行定性或定量检测。
【操作】1．凝胶板的制备取有机玻璃内槽，洗净、晾干。
用橡皮膏（宽约1cm）将有机玻璃内槽的两端边缘封好（注意，将橡皮膏紧贴在有机玻璃内槽两端边缘，不要留空隙）防止漏胶。
将有机玻璃内槽置于一水平位置，放好样品槽模板（梳子）（图7-1），注意为防止胶漏，梳子不要插到底。
2．灌胶：将溶化的琼脂糖凝胶冷却至约65℃时,小心地将凝胶倒入有机玻璃内槽上，控制灌胶速度，使缓慢地展开，直到整个有机玻璃板表面形成均匀的凝胶层（图7-2），凝胶厚度一般为0.3～0.5cm。
3．室温下放置约1小时，待胶凝固完全后，小心剥去两端的橡皮膏，将铺胶的有机玻璃内槽放在电泳槽中，加入0.5*TBE电泳缓冲液，液面高于凝胶面约0.5cm ，轻轻拔出样品槽模板（梳子），在胶板上即形成相互隔开的样品槽。
4．加样：将样品和上样缓冲液1： 6混匀，用微量加样器将样品分别加入胶板的样品小槽内，（注意：加样时应防止加样器头碰坏凝胶孔壁）。
5．电泳：加样完毕后在靠近样品槽一端连接负极，另一端连接正极，接通电源，开始电泳，为防止样品扩散在样品进胶前可用略高电压，当样品进胶后，应控制电压不高于5V/cm(电压值V/电泳槽两极之间距离cm)。
当染料条带移动到距离凝胶前沿1cm时，停止电泳。
6．染色：将电泳后的胶板小心推进含溴化乙锭（0.5μg/ml）的染色液中，室温下浸泡约30分钟。
7．观测：小心地取出凝胶并用水轻轻冲洗胶表面的溴化乙锭溶液，将凝胶放在紫外灯观察台上，在波长254nm紫外灯下进行观察。
DNA琼脂糖凝胶电泳
学习核酸电泳的原理和优缺点，掌握琼脂糖 凝胶电泳检测DNA的技术。
二、实验原理
带电荷的物质在电场中的趋向运动称为电泳。琼 脂糖凝胶电泳是进行核酸研究的重要手段，是核 酸基因组DNA、核酸扩增等技术所不可或缺的组 成部分。浓度不同的琼脂糖可形成网孔大小不同 的分子筛，能用于分离不同分子量的核酸片段， 是分离、鉴定和纯化核酸的一种常用方法。
三、实验流程
四、实验步骤
（1）1 xTAE溶液的配制：50 xTAE溶液稀释成1 xTAE溶液。 （2）配制1%琼脂糖凝胶：用电子秤称取0.30g琼脂糖，小心移入三角瓶中，加入1 xTAE 电泳缓冲液30ml，轻轻摇匀后放入微波炉中加热30s，完全沸腾后溶液清澈透明取出， 冷却至55℃，倒入已插好样品梳的制胶槽中，胶厚3~5mm，小心赶走气泡。 （3）室温放置30~45 min，胶凝固后，小心拔出梳子，取出制胶板，放入加有1 xTAE电 泳缓冲液的电泳槽中，缓冲液高出凝胶表面1mm。 （4）用微量移液器在点样板上将5μl DNA 液+2μl 上样缓冲液充分混匀，然后用移液器 将样品加入样品孔中，一定要包括合适的DNA 分子量标准物，记录点样顺序。 （5）盖上电泳槽的盖子，连接好电线和电源，打开电源，在1~10V/cm 凝胶的电压降下 进行电泳。 （6）当加样缓冲液中的溴酚蓝迁移至足够分离DNA 片段的距离时，关闭电源。 （7）将凝胶置于0.5μg/ml 溴化乙锭中染色10 min，在紫外下观察，拍照，保存照片。
五、注意事项
（1）凝胶中DNA的上样量要合适，太多会引起DNA条 带模糊，太少又会引起条带信号弱或无DNA带。 （2）EB染色时要带
dna琼脂糖凝胶电泳原理
dna琼脂糖凝胶电泳原理DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离、纯化和分析DNA分子的方法。
它基于DNA分子在电场下的迁移速度与其分子大小和形态之间的关系，利用琼脂糖凝胶的孔隙结构来分离DNA分子。
在这篇文章中，我将深入探讨DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、方法和应用，并分享我的个人观点和理解。
一、DNA琼脂糖凝胶电泳的原理DNA分子是生物体内存储遗传信息的重要分子，其大小可在数百至数千碱基对之间。
DNA琼脂糖凝胶电泳是基于电荷分离的原理进行的。
DNA分子在电场中会带有负电荷，因此会受到电场力的作用而迁移。
琼脂糖凝胶是一种多孔性凝胶，可以形成一些微小的孔隙，这些孔隙能够根据DNA分子的大小和形态来筛选DNA分子。
当DNA样品通过琼脂糖凝胶电泳时，较小的DNA分子会迁移更快，而较大的DNA 分子会迁移更慢。
通过对琼脂糖凝胶上DNA分子的分离和检测，我们可以得到DNA分子的大小分布信息，进而进行DNA的纯化、分析和定性等研究。
二、DNA琼脂糖凝胶电泳的方法1. 准备琼脂糖凝胶：我们需要制备一定浓度的琼脂糖溶液，并加热融化。
我们将琼脂糖溶液倒入电泳槽中，在上下两端放置电极，形成一个电场。
2. 准备DNA样品：将需要进行分析的DNA样品与染料混合，使之具有一定的负电荷，并进行预处理，如加热变性。
3. 进行电泳分离：将DNA样品施加在琼脂糖凝胶孔隙上方，开启电源，使电场通过琼脂糖凝胶。
DNA分子会在电场力的作用下从样品孔隙处迁移到相反电极的方向。
迁移的速度与DNA分子的大小和形态有关，较小的DNA分子迁移较快，而较大的DNA分子迁移较慢。
4. 可视化和分析：凝胶电泳结束后，我们可以使用染料或放射性示踪剂来可视化DNA分子的分离结果，如荧光染料或放射性探针。
通过观察凝胶上的DNA条带，我们可以推测DNA分子的大小分布，进而对样品进行纯化、分析和定性等进一步研究。
三、DNA琼脂糖凝胶电泳的应用DNA琼脂糖凝胶电泳技术在分子生物学、遗传学和犯罪学等领域都有广泛的应用。
dna琼脂糖凝胶电泳的临床意义
dna琼脂糖凝胶电泳的临床意义一、引言DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常见的分子生物学技术，被广泛应用于基因检测、疾病诊断和遗传学研究等领域。
作为一种快速、简便、可靠的实验方法，它在临床实践中具有重要的意义。
二、DNA琼脂糖凝胶电泳的原理DNA琼脂糖凝胶电泳是利用DNA分子在琼脂糖凝胶中移动速度与其分子大小成反比关系的原理，将DNA样品经过电泳处理后在琼脂糖凝胶上形成不同长度的条带，从而达到检测和分析DNA分子大小和数量的目的。
三、DNA琼脂糖凝胶电泳在基因检测中的应用1. 遗传性疾病诊断DNA琼脂糖凝胶电泳可以用于遗传性疾病诊断，如囊性纤维化等。
通过对患者与正常人群进行DNA样品提取和琼脂糖凝胶电泳处理，可以发现患者特异性变异位点，从而确定患者是否携带有致病基因。
2. 基因突变检测DNA琼脂糖凝胶电泳可以用于基因突变检测。
通过对目标基因进行PCR扩增，再将PCR产物经过琼脂糖凝胶电泳处理，可以快速、准确地发现基因的突变情况。
四、DNA琼脂糖凝胶电泳在疾病诊断中的应用1. 肿瘤诊断DNA琼脂糖凝胶电泳可以用于肿瘤诊断。
通过对肿瘤组织和正常组织进行DNA样品提取和琼脂糖凝胶电泳处理，可以发现肿瘤组织中存在的特异性DNA片段，从而帮助医生确定肿瘤类型和治疗方案。
2. 感染性疾病诊断DNA琼脂糖凝胶电泳可以用于感染性疾病的诊断。
通过对感染源（如细菌、真菌等）进行DNA样品提取和琼脂糖凝胶电泳处理，可以快速、准确地鉴定感染源，并帮助医生确定治疗方案。
五、DNA琼脂糖凝胶电泳在遗传学研究中的应用1. 群体遗传学研究DNA琼脂糖凝胶电泳可以用于群体遗传学研究。
通过对不同人群进行DNA样品提取和琼脂糖凝胶电泳处理，可以发现不同人群之间的基因差异，从而帮助科学家了解人类基因演化和种群分化的历史。
2. 基因表达分析DNA琼脂糖凝胶电泳可以用于基因表达分析。
通过对不同组织或细胞中RNA样品提取和琼脂糖凝胶电泳处理，可以发现不同组织或细胞中基因表达的差异，从而帮助科学家了解基因调控机制和生物过程的本质。
DNA琼脂糖凝胶电泳
DNA琼脂糖凝胶电泳一,实验原理琼脂糖凝胶电泳是分离和纯化DNA 片段的常用技术.把DNA样品加入到一块包含电解质的多孔支持介质(琼脂糖凝胶)的样品孔中,并置于静电场上.由于DNA分子的双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基,因此在电场中向正极移动.在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应.具有不同的相对分子质量的DNA片段泳动速度不一样,因而可依据DNA分子的大小来使其分离.凝胶电泳不仅可分离不同分子质量的DNA, 也可以分离相对分子质量相同,而构型不同的DNA分子.在电泳过程中可以通过示踪染料或相对分子质量标准参照物和样品一起进行电泳而得到检测.相对分子质量标准参照物相对可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准.在凝胶中加入少量溴化乙锭(ethidium bromide, EB),其分子可插入DNA的碱基之间,形成一种络合物,在254～365nm波长紫外光照射下,呈桔红色荧光,因此也可对分离的DNA进行检测.一般琼脂糖凝胶电泳适用于大小在0.2kb～50kb范围内的DNA 片段.本实验介绍琼脂糖凝胶的制备以及琼脂糖凝胶电泳在DNA片段分离中的应用方法.琼脂糖凝胶浓度（%）线状DNA分子分离范围（kb）0.3 5--600.6 1--200.9 0.5--71.2 0.4--61.5 0.2--32.0 0.1--2琼脂糖凝胶电泳是用于分离纯化和鉴定核酸的方法，根据琼脂糖的溶解温度，把琼脂糖分为一般琼脂糖和低熔点琼脂糖。
低熔点琼脂糖的熔点为62--65,溶解后在37下维持液体状态约数小时,主要用于DNA片断的回收、质粒与外源性DNA的快速连接等。
DNA在琼脂糖凝胶中的迁移速度与琼脂糖浓度、DNA分子量及其构象、电泳缓冲液、电场强度等因素有关，一般说来，DNA片断越大或者琼脂糖浓度越大，其迁移速率越大；而电场强度越高，其迁移速率越大。
不同浓度琼脂糖凝胶DNA分离范围见上图表。
二,仪器及试剂1.仪器及耗材:水平电泳槽,电泳仪,凝胶成像分析系统,微波炉,微量移液器,透明胶带,点样或parafilm,100 ml或250 ml锥形瓶,量筒,吸头等.2.试剂及配制:50×TAE缓冲液的配制:2 mol/L Tris-乙酸,0.05 mol/L EDTA(pH 8.0)配制1000 mlTris 242 g冰乙酸 57.1 ml0.5 mol/L EDTA 100 ml加入600 ml去离子水后搅拌溶解,将溶液定容至1 L后.高温高压灭菌,室温保存.1×TAE缓冲液的配制:称量20 ml的50×TAE缓冲液,再加入980 ml的去离子水.溴化乙啶贮存液:10 mg/ml 溴化乙啶配制:100 ml称取1 g溴化乙啶,置于100 ml烧杯中,加入80 ml去离子水后搅拌溶解.将溶液定容至100 ml后,转移到棕色瓶中.室温保存.6×上样缓冲液:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青FF,30%甘油.配制:10 ml溴酚蓝 25 mg二甲苯青FF 25 mg甘油 3 ml用6×TAE缓冲液定溶至10 ml,分装成1 ml/管.-20℃保存.其它试剂:DNA样品,DNA Ladder ,琼脂糖三,操作步骤1. 制备1%琼脂糖凝胶(大胶用70ml,小胶用50ml):称取0.7 g(0.5g)琼脂糖置于锥形瓶中,加入70 ml(50ml)1×TAE,瓶口倒扣小烧杯.微波炉加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶液.2. 胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板.取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子.将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子.将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层.室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中.添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板为止.3. 加样:在点样板或parafilm上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数应不小于1X.用10 ul微量移液器分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面.(注意:加样前要先记下加样的顺序).4. 电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60-100V,样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动.电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离范围降低.当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳. (5)电泳完毕后,取出凝胶,用含有0.5 ug/ml的溴化乙锭1×TAE溶液染色约20 min,再用清水漂洗10 min.(6)观察照相:在紫外灯下观察,DNA存在则显示出红色荧光条带,采用凝胶成像系统拍照保存.四,常见问题及注意事项1.配琼脂糖时应使其完全熔化后方可制胶.2.琼脂糖凝胶易于破碎,操作时要轻缓.3.电泳时应注意电源线路,预防触电.4.溴化乙淀具有致癌作用,配制及使用时应带乳胶或一次性塑料手套.并在专门的实验室内使用.5.紫外线对人体有损伤作用,开灯时间不宜太长,注意防护.6.DNA带形状模糊:DNA加样过多;电压太高;凝胶中有气泡.7.质粒DNA的存在形式有3种,①共价闭环DNA(cccDNA),常以超螺旋形式存在;②开环DNA(ocDNA),此种质粒DNA的两条链中有一条发生一处或多处断裂,因此可以自由旋转从而消除张力,形成松弛的环状分子;③线状DNA,因质粒DNA的两条链在同一处断裂而造成.因此质粒DNA电泳的结果中有可能出现三条泳带,它们的泳动速度为: cccDNA > 线状DNA > ocDNA.添加来自TIANGEN的资料:1,琼脂糖:不同厂家＼不同批号的琼脂糖，其杂质含量不同,影响DNA的迁移及其荧光背景的强度,应有选择的使用.2,凝胶的制备:凝胶中所加的缓冲液应该与电泳槽中的相一致,溶化的凝胶应该及时倒入板中,避免倒入之前凝固结块,倒入板中的凝胶应该避免出现气泡,以免影响电泳结果.3,电泳缓冲液:为保持电泳所需的离子强度和PH,应经常更新电泳缓冲液.4,样品加入量:一般情况下,0.5CM宽的梳子可加0.5微克的DNA量,加样量的多少依据加样孔的大小及DNA中片断的数量和大小而定.当加样孔大时,样品上样量应相应加大,否则会造成条带浅甚至辨认不清楚;反之,则应该适当减少加样量,但是上样量过多会造成加样孔超载,从而导致拖尾或扩散,对于较大的DNA此现象更明显.5,DNA样品中盐浓度会影响DNA的迁移率,平行对照样品中应该使用同样的缓冲条件以消除这种影响.6,DNA迁移率取决于琼脂糖的浓度,迁移分子的形状及其大小.采用不同浓度的凝胶有可能分辨范围广泛的DNA分子,制备琼脂糖凝胶可根据DNA分子的范围来决定凝胶的浓度.小片断DNA的检测应采用聚丙烯酰胺凝胶电泳,以提高分辨率.。
dna琼脂糖凝胶电泳
DNA琼脂糖凝胶电泳介绍DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物技术实验方法，用于分离DNA分子并确定其大小。
它基于DNA分子的电荷和大小不同，通过应用电场使DNA分子在琼脂糖凝胶中迁移，从而实现分离。
原理DNA琼脂糖凝胶电泳的基本原理是：DNA分子带负电荷，当置于电场中后，电场将使DNA分子向正电极移动。
然而，DNA分子在琼脂糖凝胶中的迁移速度取决于它的大小。
较长的DNA分子由于受阻力较大，迁移速度较慢，而较短的DNA分子迁移速度较快。
因此，琼脂糖凝胶电泳可以将DNA分子根据大小进行分离。
实验步骤1. 样品处理将待测DNA样品与凝胶电泳缓冲溶液混合，并加入负荷样品的染料来增加样品的重量和使其可见。
一般使用表现著名的溴化乙锭（Ethidium Bromide）来染色DNA分子。
2. 准备琼脂糖凝胶制备琼脂糖凝胶液，并根据实验需要将其倒入电泳槽中，并形成一个凝胶。
此过程需要使用琼脂糖凝胶制备缓冲液，一般为Tris–醋酸–EDTA缓冲液，简称TAE缓冲液。
3. 样品加载使用微量吸管或特殊的样品加载微孔将样品加载到琼脂糖凝胶上。
每个微孔能够承载一定量的样品，因此要根据样品的数量进行安排。
通常还会在凝胶上加载一个DNA分子大小标记（Marker）作为参考，以便确定未知样品的大小。
4. 电泳将凝胶放入电泳槽中，并将正负电极接入电源。
通过给定的电流和时间来进行电泳实验。
电流的选择取决于琼脂糖凝胶的密度和样品的大小范围。
5. 可视化和分析凝胶电泳完成后，通过紫外线照射或荧光成像系统来观察结果。
DNA分子在凝胶上能够与染料结合产生发光，从而可在琼脂糖凝胶上看到DNA分子的大小分布。
通过与已知DNA分子大小标记的对比，可以确定未知样品DNA分子的大小。
应用领域1. 分子生物学在分子生物学研究中，DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的手段。
它可以用于检测DNA分子的大小、评估PCR反应的效果、验证基因敲除和插入等分子操作的成功性等。
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琼脂糖凝胶电泳进行DNA/RNA定量原理DNA（RNA）定量分析可用紫外光谱分析，原理是DNA（RNA）分子在260 nm处有特异的紫外吸收峰，且吸收强度与DNA(RNA)的浓度成正比。
此外，还可通过琼脂糖凝胶电泳上显示的DNA（RNA）带的亮度来分析，因为EB 作为一种荧光染料，能插入DNA(RNA)的碱基对平面之间而结合于其上，在紫外光的激发下产生荧光，DNA(RNA)分子上EB的量与DNA分子的长度和数量成正比。
在电泳时加入已知浓度的DNA（RNA）Marker作为DNA（RNA）分子量及浓度的参考，样品DNA(RNA)的荧光强度就可以大致表示DNA （RNA）量的多少。
这种方法的优点是简便易行，可结合琼脂糖凝胶电泳分析DNA(RNA)样品的完整性来进行，缺点是不太准。
琼脂糖凝胶的配制根据所需凝胶的浓度秤取琼脂糖，加入相应电泳缓冲液中，用微波炉加热煮沸至琼脂糖完全溶解，加入适量 EB 混匀，适当冷却后倾入凝胶铸槽中，插入梳子，凝胶厚度不超过梳孔，如有气泡产生则用玻璃棒驱除，不能过早拔除梳子，应待凝胶完全凝结后才能拔除梳子。
3．P1、P2、P3的配制P1 的配制：在 800ml 去离子水中溶入 Tris 碱 6.06g，Na2EDTA?2H2O 3.72g，用 HCl 调整 pH 至 8.0，用去离子水调整容积至1升，每升P1内加入RNaseA100mg。
P2 的配制：在 950ml 去离子水中溶入 NaOH 8.0g，20％SDS 50ml，调整容积至 1 升。
P3 的配制：在 500ml 去离子水中溶入醋酸钾 294.5g，用冰醋酸调整 pH 值至 5.5，用去离子水调整容积至1升。
4．常用缓冲液：TEpH 7.410mmol/LTris?Cl （pH7.4）1mmol/L EDTA（pH8.0）pH 7.610mmol/LTris?Cl （pH7.6）1mmol/L EDTA（pH8.0）pH 8.010mmol/LTris?Cl （pH8.0）1mmol/L EDTA（pH8.0）STE（亦称 TEN）0.1mmol/L NaCl10mmol/LTris?Cl （pH8.0）1mmol/L EDTA（pH8.0）STET0.1mmol/L NaCl10mmol/LTris?Cl （pH8.0）1mmol/L EDTA（pH8.0）5%Triton X-100TNT10mmol/LTris?Cl （pH8.0）150mmol/L NaCl0.05% Tween 20电泳缓冲液Tris-乙酸（TAE）：50×浓贮存液（每升）：242g Tris 碱5 7.1ml 冰乙酸100ml 0.5mmol/L EDTA（pH8.0）使用时再稀释50倍。
Tris-磷酸（TPE）：10×浓贮存液（每升）：108g Tris 碱15.5ml 85％磷酸（1.679g /ml）40ml 0.5mmol/L EDTA（pH8.0）使用时再稀释10倍。
Tris-硼酸（TBE）：5×浓贮存液（每升）：54g Tris 碱27.5g 硼酸20ml 0.5mmol/L EDTA（pH8.0）使用时再稀释10倍。
碱性缓冲液：1×使用液（每升）：5ml10mol/L NaOH 2ml 0.5mmol/L EDTA（pH8.0）Tris-甘氨酸：5×浓贮存液（每升）：15.1g Tris 碱94g 甘氨酸（电泳级）（pH8.3）50ml 10%SDS（电泳级）2×SDS 凝胶加样缓冲液100mmol/L Tris?HCl（pH6.8）200mmol/L 二硫苏糖醇（DTT）4%SDS（电泳级）0.2％溴酚蓝20％甘油30％丙烯酰胺：将29g 丙烯酰胺和1gN,N’－亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中，加热至37℃溶解之，补加水至终体积为100ml。
用Nalgene滤器（0.45孔径）过滤除菌查证该溶液的pH值应不大于7.0，置棕色瓶中保存于室温。
10mol/L 乙酸铵：把770g 乙酸铵溶解于800ml水中，加水定容至1L后过滤除菌。
1mol/LCaCl2：在200ml纯水中（Milli-Q水或相当级别的水）溶解54gCaCl2?6H2O，用0.22滤器过滤除菌，分装成10ml小份贮存于－20℃。
2.5mol/LCaCl2：在20ml蒸馏水中溶解13.5gCaCl2?6H2O，用0.22滤器过滤除菌，分装成1ml小份贮存于－20℃。
1mol/L 二硫苏糖醇（DTT）：用20ml0.01mol/L乙酸钠溶液（pH5.2）溶解3.09gDTT，过滤除菌后分装成1ml小份贮存于－20℃。
0.5mol/LEDTA（pH8.0）：在 800ml 水中加入 186.1g 二水乙二胺四乙酸二钠（EDTA-Na?H2O），在磁力搅拌器上剧烈搅拌，用NaOH调节溶液的pH值至8.0，然后定容至1升，分装后高压灭菌备用。
溴化乙锭（10mg/ml）：在100ml水中加入1g 溴化乙锭，磁力搅拌数小时以确保其完全溶解，然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中，保存于室温。
1mol/LMgCl2：在800ml水中溶解203.3gMgCl2?6H2O，用水定容至1升，分装成小份并高压灭菌备用。
酚：氯仿：把酚和氯仿等体积混合后用0.1mol/LTris?Cl（pH7.6）抽提几次以平衡这一混合物，置棕色玻璃瓶中，上面覆盖等体积的0.01mol/LTris?Cl（pH7.6）液层，保存于4℃。
磷酸缓冲盐溶液（PBS）：在800ml蒸馏水中溶解8g NaCl、0.2g KCl、1.44gNa2HPO4和0.24gKH2PO4，用HCl调节溶液的pH 值至 7.4，加水定容至 1 升，高压蒸汽灭菌 20min。
保存于室温。
乙酸钾溶液（用于碱裂解）：在60ml 5mol/L乙酸钾溶液中加入11.5ml冰乙酸和28.5ml;水，即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度5mol/L的溶液。
3mol/L 乙酸钠（pH5.2 和 7.0）：在800ml水中溶解408.1g 三水乙酸钠，用冰乙酸调节pH值至5.2或用稀乙酸调节pH至7.0，加水定容至1升，分装后高压灭菌。
1mol/LTris：在800ml水中溶解121.1gTris碱，加入浓HCl调节pH至所需值。
pH HCl7.4 70ml7.6 60ml8.0 42ml应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值，加水定容至1升，分装后高压灭菌。
Tris 缓冲盐溶液（TBS）：在800ml蒸馏水中溶解8gNaCl、0.2gKCl和3gTris碱，加入0.015酚红并用HCl调pH值至7.4，用蒸馏水定容至1升，分装后在15lbf/in2（1.34×105Pa）高压下蒸汽灭菌20分鈡，于室温保存。
5mmol/LNH4Ac 溶液：秤取乙酸铵192.7g，加重蒸水250ml混匀，加重蒸水定容至500ml，1.1kg/cm2灭菌20min。
10mg/mlBSA（小牛血清白蛋白）溶液：秤取100mg小牛血清白蛋白溶于10ml灭菌重蒸水中。
置4℃冰箱贮存备用。
10%十二烷基硫酸钠（SDS）：在900ml水中溶解100g 电泳级SDS，加热至68℃助溶，加入几滴浓盐酸调节溶液的pH值至7.2，加入水定容至1L，分装备用琼脂糖凝胶电泳缓冲液的配制实际工作中常用的缓冲液配制见表琼脂糖凝胶电泳缓冲液配方a.TBE浓储存液长时间存放后会形成沉淀物，为避免这一问题，可在室温条件下用玻璃瓶保存5X溶液，出现沉淀后则予以废弃。
以往都以lX作为使用液(即1：5稀释浓储存液)进行琼脂糖凝胶电泳。
但0．5X的使用液已具备足够的缓冲容量。
目前几乎所有的琼脂糖凝胶电泳都以1：10稀释的储存液作为使用液。
进行聚丙烯酰胺凝胶电泳使用的lXTBE，是琼脂糖凝胶电泳时使用液浓度的2倍。
聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小，通过缓冲液的电流量通常较大，需要使用1XTBE以提供足够的缓冲容量b.碱性电泳缓冲液应现用现配在配制缓冲液时，不论哪一种都需要加适量的EDTA，以除去2价金属离子。
另外，硼酸与琼脂糖易形成复合物，使凝胶带负电荷，可能会吸附带正电荷的物质。
琼脂糖凝胶电泳的操作步骤如下：1. 制备1%琼脂糖凝胶(大胶用70ml,小胶用50ml):称取0.7 g(0.5 g)琼脂糖置于锥形瓶中,加入70 ml(50ml)1×TAE,瓶口倒扣小烧杯.微波炉加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶液.2. 胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板.取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子.将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子.将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层.室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中.添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板为止.3. 加样:在点样板或parafilm上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数应不小于1X.用10 ul微量移液器分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面.(注意:加样前要先记下加样的顺序).4. 电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60-100V,样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动.电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离范围降低.当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳.(5)电泳完毕后,取出凝胶,用含有0.5 ug/ml的溴化乙锭1×TAE溶液染色约20 min,再用清水漂洗10 min.(6)观察照相:在紫外灯下观察,DNA存在则显示出红色荧光条带,采用凝胶成像系统拍照保存琼脂糖凝胶电泳步骤2006-10-24 17:21a)用高压灭菌指示纸带将洗净、干燥的玻璃板的边缘(或电泳装置所配备的塑料盘的开口)封住，形成一个胶模。
将胶模放在工作台的水平位置上(用水平仪校正)。
b)配制足够用于灌满电泳槽和制备凝胶所需的电泳缓冲液（通常是1x TAE或0.5xTBE)。
在已加有一定量的电泳缓冲液的三角锥瓶或瓶盖未拧紧的玻璃瓶中加入准确称量的琼脂糖粉。
缓冲液不宜超过锥瓶或玻璃瓶的50％容量。
c)在锥瓶的瓶颈上松松地塞上Kimwipes纸。
如用玻璃瓶，瓶盖须拧松。
在沸水浴或微波炉中将悬浮液加热至琼脂糖溶解。
d）用融化的琼脂糖封住边界。
e）在合适的位置上放置核子，以便加入琼脂糖后可以形成完好的加样孔。
如果梳子距玻璃板再近，则拔出梳子时孔底将有破裂的危险．破裂后会使样品从凝胶与破璃板之间渗漏。