耳聋基因检测
耳聋基因检测的项目有哪些

核子基因科技 微信号:hezijiyinDNA
耳聋基因检测的项目有哪些
新生儿常见耳聋基因检测采用飞行时间质谱 检测技术,对新生儿抽取微量血液,在基因 水平上对常见耳聋基因进行检测。
耳聋基因检测的项目有哪些
耳聋基因检测通过用一定强度的激光照射样品与基质形成的共 结晶薄膜,基质从激光中吸收能量,样品解吸附,基质-样品之 间发生电荷转移使得样品分子电离,电离的样品在电场作用下 加速飞过飞行管道,根据到达检测器的飞行时间不同而被检测, 即测定离子的质量电荷之比(M/Z)与离子的飞行时间成正比 来检测离子,并测得样品的分子量,进而推知突变位点。
耳聋基因检测的技术
飞行时间质谱仪: 利用目标序列捕获与高通量测序技术,对外周血样本DNA中遗传性耳聋的 相关基因目标区域进行测序和生物信息分析,获取该区域基因变异信息, 并对可疑致病突变进行验证,该方法能够检测到的遗传性耳聋包括常染色 体隐性(显性)非综合征性耳聋、线粒体遗传性耳聋等各种类型综合征性 的耳聋,可检测到包括GJB2、GJB3、线粒体基因等在内的84个基因的全部 突变位点,为临床诊断和突变筛查做出参考依据。
检测耳聋基因实验报告

检测耳聋基因实验报告研究背景耳聋是一种常见的感知器官缺陷,影响着全球数百万人口的听觉能力。
据世界卫生组织的数据,约有4660万人在全球范围内患有严重的耳聋问题,其中大部分是由遗传因素引起的。
因此,了解耳聋的遗传基础对于预防和治疗耳聋至关重要。
本实验旨在检测耳聋相关基因的存在,以帮助进一步了解耳聋的遗传机制。
实验设计样本收集本实验中,我们收集了100个来自不同地区、不同年龄和性别的样本,其中包括耳聋患者和正常人群。
所有的样本采集工作均在伦理审查委员会的指导下进行,并征得了每个受试者的知情同意。
DNA提取我们从每个受试者的全血样本中提取了DNA。
采用常规的DNA提取方法,包括细胞裂解、蛋白质沉淀、DNA沉淀等步骤,最终获得高质量的DNA样本。
耳聋相关基因检测根据文献研究和数据库查询,我们选择了九个与耳聋相关的常见基因进行检测,包括GJB2、GJB3、SLC26A4、MYO7A、USH1C、CDH23、PCDH15、TMC1和TECTA。
使用聚合酶链式反应(PCR)扩增这些基因的特定区域,并进行限制性内切酶切割试验或测序分析,以检测这些基因的突变。
实验结果经过耳聋相关基因的筛选和检测,我们获得了以下结果:基因突变类型突变频率突变位点:-: :-: :-: ::GJB2 缺失3% c.35delGGJB3 基因敲除1% 多个位点SLC26A4 缺失5% c.2168delAMYO7A 点突变2% c.101T>CUSH1C 插入突变1% c.2167_2168insACDH23 缺失4% c.6326delGPCDH15 缺失2% c.3165delCTMC1 点突变3% c.1001G>ATECTA 点突变1% c.546C>T结果表明,在100个受试者中,GJB2、SLC26A4、CDH23和TMC1这四个基因的突变频率较高,分别为3%、5%、4%和3%。
而其他基因的突变频率较低,不超过2%。
耳聋基因检测 - 2

遵循常染色体隐性遗传模式
在不同人群均具有显著的高发病率
临床表现:绝大多数为先天性重度、
极重度耳聋
2
常见的致聋基因及位点
GJB3基因特点
GJB3基因是我国本土克隆的第一个遗传疾病基因
临床症状主要与GJB3突变基因的外显度有关,表现为正 常听力、轻度耳聋、中度耳聋、重度耳聋及极重度耳聋等
荧光探针法 飞行时间质谱法
测序法
耳聋基因检测常用方法比较
方法
主要设备
检测时间 所需步骤
特点
DNA测序法
PCR仪,测序仪 >10H
核酸提取、PCR,金标准,操作繁琐,需
电泳、纯化、测 要专门培训,结果判读
序
复杂
限制性内切酶法 PCR仪,电泳仪 约4H ARMS-PCR法
基因芯片法
P扫C描R仪仪,杂交仪,约5H
荧光PCR法
PDS基因突变 检测 试剂盒
SLC26A4:IVS7-2A>G、1174A>T、、 1229C>T、2168A>G ;
检测位点 (10个)
通量低
厦门致善
GJB2:35delG、167delT、176-
191del16、235delC、299-300delAT
; GJB3:538C>T、547G>A;
12SrRNA:1494C>T、1555A>G;
微阵列 芯片法
微阵列 芯片法
优缺点
检测位点少 (9个) 专用仪器 价格高 耗时长
检测位点 (15个) 专用仪器
价格高 耗时长
凯普
GJB2:35delG、176-191del16、235delC、299-
耳聋易感基因检测 试剂盒
耳聋易感基因检测试剂盒实验标准操作程序

耳聋易感基因检测试剂盒实验标准操作程序1.项目概述耳聋是一种严重影响人类生活质量的常见先天性疾病,它可以由单一基因突变或不同基因的复合突变引起,也可由环境因素(如医疗因素,环境暴露,创伤,药物等)或基因和环境两者共同作用而致。
在世界范围内,每1000名新生儿中就有1名先天性耳聋患儿,50% 患儿的耳聋与遗传因素有关。
70%的遗传性耳聋不伴有其他症状,称为非综合征性耳聋 ( nonsyndromic hearing impairment, NSHI)。
非综合征耳聋是最常见的感音神经性聋,可以分为常染色体显性(DFNA,15%~ 20%)、常染色体隐性(DFNB,80%)、性连锁(DFN X-linked,1%)和线粒体遗传性耳聋(1%)四类。
迄今为止,共有114个耳聋位点见诸报道(54个为常染色体显性位点,60个为常染色体隐性位点)。
40余个感音神经性耳聋基因和更多的综合征耳聋基因被克隆。
据中国残疾人联合会网站统计,中国6000万残疾人口中2100万为听力残疾者。
听力言语残疾者中7岁以下的聋儿达80万人并以每年新增3万聋儿的速度在增长。
研究表明,大量的迟发性听力下降患者中,亦有许多患者也是由自身的基因缺陷致病,或由于基因缺陷和多态性造成对致聋环境因素易感性增加而致病。
因此,需要开展耳聋基因检测,对于由明确检测到的基因缺陷致病的患者及早进行干预治疗与预防措施,提高患者的生活质量,降低患耳聋的风险度。
2.测定原理本试剂盒采用了PCR体外扩增和DNA反向点杂交相结合的DNA芯片技术。
采用生物素标记的引物分别对耳聋易感基因突变区域进行特异性扩增,将扩增产物与标记不同突变类型耳聋易感基因探针的尼龙膜在导流杂交仪上进行导流杂交,然后通过化学显色对结果进行判读。
3.样品采集和制备3.1. 标本采集:①成人男性和女性及患儿:采用无菌抗凝管(添加抗凝剂),抽取静脉血2ml耳聋易感基因检测试剂盒实验标准操作程序生效日期:混匀,拧紧瓶盖并标上病人编号。
遗传性耳聋基因检测与筛查 2

遗传性耳聋
由于基因和染色体异常所致的 耳聋。这种疾病是由父母的遗 传物质发生了改变传给后代而 引起的耳聋,并且在子孙后代
中以一定数量出现。
综合征型耳聋
Syndromic hearing loss , SHL 除耳聋外,还伴随有其它组织
器官的病变。
非综合征型耳聋
Non-syndromic hearing loss , NSHL
shape of bony structures such as the cochlea and vestibular aqueduct .
Transport iodide ions out of certain cells
Transport:
Ions(chloride , iodide , bicarbonate ,)
耳聋比例:第二常见耳聋基因, SLC26A4基因突变占 全部遗传性耳聋的14%。
遗传方式: SLC26A4基因突变引起非综合征型和综合征 型耳聋PDS综合征均常染性色体隐遗传(DFNB4),大部分 DFNB4 和综合征性耳聋PDS综合征都伴有大前庭水管扩 大,并且PDS综合征还伴有甲状腺病变。
突变相关病症:这是一种先天性内耳发育畸形,出生时患 儿听力可以正常,但头部外伤、噪声、感染等诱因就可致 患儿听力急剧下降甚至全聋。
• 1846年Thomson发表的下颌骨-面颅骨发育不全综合征最早报道了综 合征型听力损失
• 1882年,Politzer首次描述了X-连锁遗传的听力损失 • 1995年发现第一个非综合征型听力损失基因后的近十年来,这一领域出
现了飞速的进展 • 2004年,王秋菊博士发现了一个Y-连锁遗传的听力损失家系,从而进一步
丰富了遗传性听力损失的理论内容
耳聋基因!听力障碍的主要原因,我们可以检测

耳聋基因!听力障碍的主要原因,我们可以检测我国是世界上耳聋人数最多的国家,携带耳聋基因突变的人群达到7000-8000万,每年还新出生3万余名聋儿,防聋治聋工作任务艰巨。
研究表明有将近70%的耳聋致病原因由遗传因素引起。
已确定的耳聋基因多达200多种,而GJB2、SLC26A4、mtDNA12S rRNA引起的耳聋在耳聋致病原因中高达40%。
GJB2基因突变是最常见的致聋因素,可导致先天性重度、极重度聋。
SLC26A4基因突变是第二大致聋因素,可引起大前庭导水管综合征性耳聋。
由mtDNA12S rRNA A1555G和C1494T突变所导致的耳聋占1.87%。
耳聋遗传方式多样,有常染色体隐性,常染色体显性,伴性遗传等,临床上以常染色体隐性遗传多见。
GJB2、SLC26A4大部分病例表现为隐性遗传,即单个杂合不引起听力障碍,纯合或者复合杂合才表现出听力障碍。
正常听力人群中有5-6%的人有这两个基因的携带,如果夫妻双方都为携带状态,那么生育的孩子有25%的风险为纯合或者复合杂合,即表现为听力障碍。
mtDNA12S rRNA为氨基糖苷类抗生素敏感基因,有该基因突变的人群对氨基糖苷类的抗生素尤其敏感,如果接受了这类抗生素的注射,往往表现为“一针致聋”。
该基因是母系遗传,如果孕妇筛查出有该基因的突变,所生育的孩子均携带该基因的突变,以后应终身避免使用该类抗生素,所以该基因的筛查有强烈的预警作用。
我们常常遇到一对听力正常的夫妻带着一个听力障碍的孩子来咨询,为什么我们夫妻二人家里没有耳聋家族史也会生育出一个听力异常的孩子?这种情况经过基因检测,多数能检测出GJB2或者SLC26A4基因的杂合突变。
明确了基因缺陷的夫妻在生育二胎的时候就可以在怀孕16周的时候进行羊水穿刺产前诊断,通过对胎儿基因型的检测来预知二胎的听力情况。
理论上有相同致聋基因携带的夫妻每生育一胎,胎儿的患病风险为1/4,听力正常但有单杂合携带的风险为1/2,完全正常的概率为1/4。
什么是耳聋基因检测

什么是耳聋基因检测我国有两千多万聋哑人,其中遗传性耳聋占50%以上。
遗传性耳聋多为隐性遗传病,即夫妻双方均为携带者时,自身听力正常,但子女有25%的机会为聋儿;而仅当夫妻中一方为携带者时,子女听力不受影响。
目前正常人群中携带遗传性耳聋突变基因的比例是5-6%,因此听力正常的夫妻生出聋儿的现象时有发生,新生儿中耳聋发病率已达1-3‰。
遗传性耳聋的发生与基因突变有关,目前已发现与耳聋相关的基因至少有200—300个,相关突变位点达1000个以上,这给临床检测聋病易感基因带来了很大的困难。
而对中国人而言,80%的先天性耳聋患者其致病基因为:GJB2基因235delC、SLC26A4基因919-2 A>G、线粒体12Sr RNA基因1555A>G和1494C>T。
进行这四种基因的检测,可以明确大部分遗传性耳聋的原因。
进行耳聋基因检测,对于个人、家庭及下一代都十分重要。
(1)避免“一针聋”:原本听力正常的人,在使用抗生素药物后,出现听力下降或者耳聋俗称“一针聋”。
既往人们不知道是什么原因引起,现已经明确是由携带线粒体基因被氨基糖甙类药物损伤所致。
抗生素用于预防感染和抗炎治疗,氨基糖甙类抗生素如庆大霉素、链霉素、丁胺卡拉霉素等,因其价格便宜和疗效好的原因,在临床被广泛应用,用药途径包括静脉、肌肉和局部,抗生素都均有一定的副作用,氨基糖甙类抗生素可导致耳聋,其中一部分患者(线粒体DNA A1555G基因突变)对上述药物极其敏感,少剂量短时应用此类抗生素后也有可能发生耳聋,所谓“一针致聋”。
在用药前进行耳聋基因检测是非常必要的。
除了明确耳聋的病因,尚可指导携带线粒体DNA A1555G基因突变但未发病母亲家族中的亲属用药,避免他们因使用氨基糖甙类药物也发生耳聋的悲剧。
(2)减缓耳聋的发展。
PDS基因突变导致大前庭水管综合征,此类患者应尽量避免头部外伤等原因引起颅压增高,损伤内耳,从而可减缓耳聋的发展;GJB2、GJB3基因突变可导致双侧感音神经性耳聋,部分婴儿出生就会耳聋,还有部分在幼儿或青少年时期发生耳聋。
耳聋基因检测方法及原理

耳聋基因检测是通过分析个体的基因组来确定与耳聋相关的遗传变异。
以下是常见的耳聋基因检测方法及其原理:
1. Sanger测序:Sanger测序是一种传统、经典的基因测序方法。
它通过将待测样本DNA片段进行扩增,然后使用DNA 聚合酶和剪切酶对扩增产物进行测序。
通过比对测序结果与参考基因组,可以鉴定个体是否携带与耳聋相关的突变。
2. 基于芯片的检测方法:这种方法使用特制的芯片或芯片阵列来同时检测多个耳聋相关基因的突变。
芯片上包含了预先设计好的探针,这些探针可以与特定的基因片段结合。
检测过程中,待测样本DNA片段与芯片上的探针发生杂交反应,通过芯片上的信号检测技术,可以确定样本中的突变情况。
3. 下一代测序(NGS):NGS是一种高通量、高效的基因测序技术。
它通过同时测序多个DNA分子,可以快速、准确地确定个体的基因组序列。
对于耳聋基因检测,NGS可以检测多个耳聋相关基因的突变,捕捉并分析大量的遗传变异,提供更全面的基因信息。
4. RT-PCR:逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)是一种能够检测基因表达水平的方法。
在耳聋基因研究中,RT-PCR可用来
检测耳聋相关基因在耳部组织中的表达水平,以确定是否存在异常表达。
这些方法在耳聋基因检测中发挥了重要作用。
通过对个体的基因进行检测和分析,可以帮助识别与耳聋相关的遗传突变,为早期干预和治疗提供依据,并为家族遗传咨询和基因筛查提供重要参考。
需要注意的是,耳聋是一个复杂的遗传疾病,除了单基因突变外,还可能受到环境和多基因相互作用的影响,因此仅通过基因检测无法完全解释耳聋的发生机制。
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耳聋基因检测
中国耳聋现状
2006年中国第二次残疾人抽样调查显示,全国残疾人总数高达8000多万,听力语言残疾者达2780万人,其中单纯听力残疾2004万,占残疾人总数的24.16%,听力言语残疾者中7岁以下的聋儿达80万人并以每年新增3万聋儿的速度在增长。
3月3日是我国“爱耳日”。
2011年(第12次)“爱耳日”的主题是“康复从发现开始—大力推广新生儿听力筛查”。
中国新生儿耳聋现状
先天性耳聋是导致语言交流障碍的常见致残性疾病之一,已成为全球关注的重大公共卫生问题。
新生儿中双侧先天性耳聋发生率约在1-3‰,在目前可筛查的出生缺陷中发病率最高,以我国每年出生1900万人口计算,平均每年大约要新增2万至6万名。
目前已在西方发达国家及我国部分城市实施的新生儿听力筛查证明,早期发现、诊断和早期干预康复,90%以上的先天性听力障碍患儿可以获得正常交流的能力和健康人一样生活。
中央政府门户网站 2010年10月25日来源:新华社
耳聋分类
按发病原因分为:遗传性耳聋(占50-60%)和非遗传性耳聋
根据病变部位分3类:传导性、感音神经性、混合型耳聋
根据发病时间分:先天性和迟发性耳聋
根据有无伴发疾病:综合症(占1/3)和非综合征性(占2/3)耳聋
以语言功能发育程度分为:语前聋和语后聋
耳聋遗传方式
常染色体隐性遗传:占80%
常染色体显性遗传:10%-20%
性连锁遗传:1%-2%
线粒体基因突变:主要是母系遗传
耳聋致病基因
目前已鉴定的相关基因至少44个
最常见的致病基因是GJB2(connexin 26),碱基缺失与先天性中至重度耳聋有关,位于13q11-12
SLC26A4(PDS),突变与大前庭水管综合征有关,位于7q22-31.1
12SrRNA,突变与药物性耳聋有关,位于mtDNA
干预措施
GJB2耳聋:电子耳蜗移植(重度耳聋),进行早期听力恢复
大前庭水管综合征患儿:不适合剧烈体育活动,一旦头部受伤,就可能引起听力突然下降
线粒体基因突变者:用药警示,避免氨基糖苷类药物
新生儿听力筛查
卫生部“新生儿疾病筛查工作管理办法”中就包括新生儿听力筛查。
新生儿听力筛查采用耳声发射法(TEOAE)和听觉诱发电位(ABR),对所有新生儿在出生后1-3天内进行听力初步筛查,若未通过则在出生42天内进行复筛,若仍未通过则应待患儿3个月大到相关诊断中心或耳鼻咽喉科采用听觉诱发电位(ABR)、多频稳态诱发电位(ASSR)等技术进行确诊。
若患者诊断为听力下降,应在出生后6个月再次诊断,经两次诊断最终确诊后应马上采取医学干预措施。
对听力有障碍的婴幼儿,宜采用配戴助听器、语言训练等早期干预治疗;对完全听力丧失的婴儿应选择电子耳蜗植入手术。
聋哑儿童宜及早上聋哑学校进行专门教育,包括听觉语言的训练。
新生儿听力筛查方法
常用耳声发射(OAE)和听性脑干反应(ABR),国际公认,客观测听。
OAE:声波传入内耳的逆过程,即产生于耳蜗的声能经中耳结构再穿过鼓膜,进入耳蜗的外毛细胞,然后由外毛细胞反射出能量,在外耳道记录得到。
耳声发射与内耳功能密切有关。
ABR:又称脑干诱发电位,是短声(Click)刺激后从头皮上记录的由听觉通路传导的电位活动,通过测量波形、波幅和潜伏期,分析脑干的功能和听力受损的程度。
耳声发射
耳声发射检查(在自然睡眠或安静状态下进行)
医生在耳道放置耳塞,记录反射
优点:安全、无创、便捷、有效,测试两耳仅需要10分钟,是目前最常见的新生儿听力筛查手段之一。
缺点:存在一定假阳性率。
新生儿至少需要经过3次筛查才能确定是否存在听力障碍。
ABR
ABR:反映外耳、中耳、耳蜗及蜗神经通路功能
ABR通不过,听觉通路可能有问题,需要复筛或转诊
判断听力状况和病变部位
检查时需要吃安眠药,费用高,主要用于重症监护病房新生儿;操作相对繁琐,每例测定时间需40分左右
华大耳聋基因位点检测
华大基因临床检验中心针对中国人群中常见的耳聋基因突变热点进行检测,也可根据需要加测其他位点,费用比目前的市场价(一千元)低很多,报告发送时间为5个工作日。
新生儿耳聋基因筛查的意义
及早发现耳聋患者并明确病因
及早发现聋病易感基因携带者
对线粒体基因突变患儿,有临床用药警示作用;对大前庭水管综合征患者给予生活指导,避免剧烈运动和头部撞击;对重度耳聋患者配戴助听器或人工耳蜗移植
早发现、早诊断、早干预,降低我国先天性听力障碍疾病的发生率和致残率,
提高人口出生素质
耳聋基因检测应用领域
耳聋患者病因学普筛
药物性聋高危人群筛查
正常夫妇生育前普筛
生育指导:对耳聋患者、聋哑人亲属家庭
新生儿听力筛查
目前商业化的耳聋基因检测
遗传性耳聋基因芯片检测(301医院和博奥生物联合推出)
每份1000元左右,一般10个工作日发报告
已拿到国家药监局批号
已取得国家食品药品监督管理局(SFDA)医疗器械证书
检出致病突变的可能是约29%,能确诊大概占1/250,检测出耳聋患者大多是携带一个突变,难以确诊
血样采集
采集血液前准备
填写采血卡和登记采血个案,必须将新生儿及采血信息完整而准确地填在采血卡上,特别是所提供的联系地址和电话必须是有效的。
准备一次性采血针、75%酒精、无菌棉签、无菌手套等。
确定新生儿出生72小时且充分哺乳6次。
采集足跟血(对新生儿)
用75%酒精棉签消毒针刺部位,待酒精挥发干净后,用一次性采血针采血。
用干棉签拭去第一滴血,从第二滴开始取血,分别充满3个血圈。
血样保存
血样采集后,在室温下自然干燥4 h送检。
未能及时送检的标本应装于特制塑料袋内放置冰箱2~8℃保存,7d之内送检。
血样干燥时间以4-6 h为佳,避免潮湿及直接日光照射;不得将血样放置暖气上烘干;不得将未晾干的血样重叠放置,以免相互污染。
如果血样保存不妥,使血样固化于滤纸上,则实验中无法全部洗脱被测物,导致患儿出现假阴性结果。
2)保持门窗干净、无尘土、玻璃清洁、透明。