运用Affymetrix网上分析中心初步分析EGCG作用肝癌细胞SMMC-7721前后差异表达基因数据
抗癌扶正方对人肝癌细胞SMMC_7721的Bcl_2基因表达的调控作用
发热、痛觉过敏和局部毛细血管扩张，并且其与水肿、骨侵蚀等有关联[9-11]。
实验结果表明，TFLS 对FCA 诱导的AA 大鼠继发性足肿胀有较好的抑制作用，提示TFLS 可能通过减轻或抑制滑膜组织炎症从而达到减轻关节肿胀的作用。
TFLS 能明显降低AA 大鼠血清中的NO 水平，并显著减少炎症渗出液中PGE 2的含量，从而减轻关节炎症取得治疗效果。
研究结果显示，TFLS 具有明显的抗炎作用，提示其作用机制可能与抑制血清中NO 的生成以及减少炎症组织中PGE 2的生成有关。
参考文献：[1]中华本草编委会.中华本草（下）[M].上海：上海科学技术出版社，1999：113-113.[2]郭宝林，肖培根，杨世林.贵州珍珠菜属药用植物资源调查与利用[J].基层中药志，1995，9（3）：7-8.[3]向秋玲.追风伞的化学成分研究[D].贵阳：贵州大学，2007，38-40.[4]林军，何萍，全敏敏，等.花红胶囊主要药效学研究[J].中成药，2006，28（3）：383-384.[5]马东来，李俊，陈敏珠，等.卡芬尼对大鼠佐剂性关节炎治疗作用的免疫机制[J].中国免疫学杂志，1992，8（2）：114-117.[6]杨岫岩.风湿科的镇痛与抗炎[J].中国处方药，2008，8（77）：68-69.[7]徐叔云，卞如濂，陈修.药理实验方法学[M]：第3版.北京：人民卫生出版社，2002：911-921.[8]Dinarello CA.Role of pro-and anti-inflammatory cytokines during in －flammation ：experimental and clinical findings [J].Journal of biologi －cal regulators and homeostatic agents ，1997，11（3）：91-103.[9]徐红梅，魏伟.前列腺素E 2与类风湿关节炎及其药物研究[J].中国药理学通报，2005，21（3）：262-265.[10]Bergmsn P ，SchoutensA.Prostaglandins and bone [J].Bone ，1995，16（4）：485-488.[11]Trebino CE ，Stock JL ，Gibbons CP ，et al.Impaired inflammatoryand pain responses in mice lacking an inducible prostaglandin E syn －thase[J]A ，2003，100：9044-9049.（编辑：邓响潮）收稿时间：2010-01-08作者简介：叶丽红（1967-），女，博士，副教授，副主任医师，硕士研究生导师。
affymetrix 基因表达谱芯片 差异基因 -回复
affymetrix 基因表达谱芯片差异基因-回复【Affymetrix基因表达谱芯片差异基因】引言：近年来，基因表达谱研究成为了生物科学领域的热门话题之一。
而Affymetrix基因表达谱芯片作为一种常用的高通量技术，被广泛应用于差异基因的研究中。
本文将针对Affymetrix基因表达谱芯片中差异基因的相关内容进行逐步解析和回答。
第一部分：Affymetrix基因表达谱芯片的基本原理Affymetrix基因表达谱芯片是一种基于DNA探针的技术，其原理基于互补杂交作用和荧光检测。
该芯片包含上百万个DNA探针，每个探针特异性地与基因组中的一个基因匹配。
当样本RNA与探针杂交后，通过荧光标记的信号可以检测到特定基因的表达水平。
这种方式能够同时测量大量基因的表达，因此被广泛应用于差异基因的确定。
第二部分：差异基因的筛选和分析方法1. 数据预处理首先，从Affymetrix芯片获得的原始数据需要经过一系列预处理步骤，如背景校正、正规化、数值转换等，以提高数据的准确性和可比性。
2. 差异基因的筛选差异基因筛选是研究中的关键步骤之一，常用的筛选方法包括t检验、方差分析、秩和检验等。
这些方法可以帮助我们确定哪些基因在不同条件下表达存在显著差异。
3. 基因功能分析确定差异基因后，我们可以进一步通过基因功能分析来探索这些基因的生物学功能和代谢途径。
常用的方法包括基因富集分析、生物网络分析和基因-疾病关联分析等。
这些分析可以帮助我们理解这些差异基因在细胞功能和疾病发展中的作用。
第三部分：Affymetrix基因表达谱芯片在差异基因研究中的应用案例1. 肿瘤研究Affymetrix基因表达谱芯片被广泛用于肿瘤研究中的差异基因鉴定。
通过比较肿瘤组织和正常组织的基因表达谱，我们可以发现调控癌症发生和发展的关键基因。
2. 药物研发Affymetrix基因表达谱芯片也被应用于药物研发领域，通过比较药物处理组和对照组的基因表达谱，我们可以发现药物对特定基因的调控作用，从而加深我们对药物作用机制的理解。
Affymetrix基因芯片在肿瘤表观遗传学中的应用(其明第七讲)PPT课件
10
ncRNA PANDA 募集转 录因子NF-YA从而激 活细胞凋亡通路
11
可以用甲基化/转录因子芯 片发现
12
Cell 2011
ncRNA- and Pc2 Methylation-Dependent Gene Relocation between Nuclear Structures Mediates Gene Activation Programs 13
21
长链非编码RNA靶向的功能/信号通路
长链非编码RNA 靶向关系
22
研究方案
23
• 人/小鼠/拟南芥/果蝇/酵母
Affymetrix基因芯片在甲基化研 究中的应用
24
甲基化与肿瘤的关系
Manel Esteller, nature, 200257
应用案例
雄激素非依赖性
26
应用案例
竖线代表富集度高 的探针
Affymetrix基因芯片在肿瘤表观 遗传学中的应用
咨询部经理 1
2
• HT Array • Human/Mouse/Rat Gene2.0 ST Array
长链非编码RNA研究
3
两种长非编码RNA的调控方式
通过募集转录因子起作用
Trans
1
2
3
4
5
Cis
1
2
3
4
5
4
反式调控：转录激活/转录抑制
You Know, The More Powerful You Will Be
36
谢谢大家
荣幸这一路，与你同行
It'S An Honor To Walk With You All The Way
GeneSpringGX教程——Affymetrix基因芯片分析（三）
GeneSpringGX教程——Affymetrix基因芯片分析（三）弗雷赛斯freescienceFreescience由浙江大学医学院几个硕博士发起创建，旨在最广泛分享有价值的科研技能和知识；FreeScience的宗旨：“科学自由分享、人人平等，共求真理”。
这期继续GeneSpring GX 教程第三期，为零基础的小伙伴学习基因芯片分析提供帮助。
再次声明本教程仅供学习GeneSpring使用，不得用于商业目的。
最后，请大家使用试用版或者正版来分析数据，尊重知识产权。
数据团队将对教程进行校对，任何问题都可以加入freescience大数据群进行交流和讨论。
GEO数据库中很多Affymetrix基因芯片大多都可以用GeneSpring GX进行分析。
1、创建新项目1.1启动GeneSpring GX，启动后显示有3个选项：创建新项目；打开现存项目；打开最近项目。
我们选择创建新项目，按OK继续。
1.2此时显示出一个细节窗口，我们可以输入项目名称和注释。
这里我们的新项目默认名“New Project”，按OK继续。
2、实验选择2.1这时显示带有两个选项的对话框窗口：创建新实验和打开现存实验。
打开现存实验允许用户将任何以前项目中的实验用到当前实验项目中。
我们现在选择创建新实验，此时出现一个实验描述对话框。
首先输入实验名称，我们默认“New Experiment”。
然后指定的实验类型，下拉菜单中提供给用户多种实验类型的选择，我们在进行Affymetrix基因芯片分析时主要是选择“Affymetrix Expression”。
2.2接着是选择工作流程类型。
点击下拉符号可以看到两种类型：工作流程导引和高级分析。
工作流程导引是通过一组默认参数来协助用户创建和分析一项实验。
而高级分析的参数可以改变，以适应个人需要。
3、加载数据3.1打开了加载数据的新对话框后，一个实验就可以利用“选择文件”或“选择样本”这两个按钮来创建。
AFFYMETRIX基因芯片操作流程
AFFYMETRIX 基因芯片操作流程第一章真核靶片断制备＜一＞ RNA 的抽提一、 哺乳动物细胞或组织RNA 的抽提1. 总 RNA 使用 QIAGEN ' 哺乳动物组织作为+2. Poly(A) mRNA 哺乳动物细胞使用 哺乳动物组织作为 离步骤或使用kit.二、 RNA 沉淀1. 总 RNA在用RNeasy Total RNA Isolation kit 分离或洗涤后没有必要沉淀总 RNA.调整洗脱体积以制备cDNA 合成接近希望的 RNA 浓度。
注：为获得足够量的标记 cRNA 用来评估和基因芯片表达探针杂交， AFFYMETRIX 建议开 始合成cDNA 的Poly(A) +mRNA 最小浓度为0.02卩g/卩l 时的最小量是0.2卩g,总RNA 最 小浓度为0.5卩g/卩l 时的最小量是5卩g.这样有两个好处： (1) 有足够量在各步检查样品浓度和质量 (2)制备足够的cRNA 用于杂交在TRIzol 分离和热酚提取后需要乙醇沉淀；见下面方法 +2. Poly(A) mRNA大多数Poly(A) +mRNA 分离过程都会导致得到较稀浓的 RNA ，所以需要在cDNA 合成前浓缩mRNA. 3. 沉淀步骤： (1) 力口 1/10体积3M NaOAc,PH5.2,和2.5倍体积乙醇. (2) 混匀，-20C 放置最少1小时. (3) 4C ,＞ 12000x g 离心 20 分钟. (4) 80%乙醇洗涤沉淀 2次.(5) 空气干燥沉淀.继续下面步骤前检查是否干燥 . (6)DEPC 处理水重新溶解沉淀.最合适的溶解体积由cDNA 合成中需要的 RNA 的浓度和量来决定.先阅读cDNA 合成的过程来决定这一步的适合溶解体积4. RNA 测定用分光光度计分析 RNA 浓度，在260nm1单位吸光度等于 40卩g/mlRNA.需要在260和280nm 测定吸光度来确定样品的浓度和纯度 A 260/A 280应接近2.0为较纯的RNA(比值在1.9-2.1也可)＜二＞由纯化的总RNA 合成双链cDNAAFFYMETRIX 强烈建议 HPLC 纯化 T7-(d7) 24 primerRNeasy Total RNA Isolation kit 成功抽提哺乳动物细胞总 RNA.RNA 的来源，建议使用 TRIzol 抽提总RNA.QIAGEN ' Oligotex Direct mRNA kit,从总 RNA 中抽提 mRNA . RNA 的来源，应首先使用 TRIzol 纯化，再进行一个 Poly(A)+mRNA 分一、第一链cDNA合成开始RNA的量:高质量RNA5.0卩g -40.0卩g纯化后RNA浓缩由260nm吸光度决定（1单位吸光度=40卩g/mlRNA ）, A260/A280应接近2.0，在1.8-2.1的范围内。
EGCG对肝癌细胞株BEL-7402增殖凋亡及Stat3蛋白表达的影响
Ｓ ａ３ ＥＧＣ ｃ ｕ ｄ ｉ ｈ ｂ ｔ ｒｌ ｅ ａｉ ｎ ａ ｄ ｉ ｄ ｃ ｐ ｐ ｏ ｉ ｉ ｏ ｅ ｄ ｐ ｎ ｅ ｔｍａ ｎ ｒｉ ＥＬ一７ ０ ｅ ｌ．Ｍｏ ｔｔ． Ｇ ｏ ｌ ｎ ｉ ｉ ｐ ｏｉ ｒ ｔ ｎ ｎ ｕ ｅ ａ ｏ ｔ ｓｓ ｎ ａ ｄ ｓ ｅ ｅ ｄ ｎ ｎ ｅ Ｂ ｆ ｏ ｎ ４ ２ｃｌ ｓ ．
祁 卫 卫 王 营 徐 学 军 ， ，
（． １ 徐州医学 院， 江苏 徐州 ２ １０ ２ 徐州医学院 附属 医院消化内科 ， ２０ ２； ． 江苏 徐州 ２ １０ ；． ２０ ２ ３ 郑州 大学 ， 河南 郑州 ４ ０ ５ ） ５ ０ ２
摘 要 ：研究 了没食子 儿茶 素没食 子酸酯 （ Ｇ Ｇ） Ｅ Ｃ 对人肝 癌细胞 Ｂ Ｌ一 ４ ２增殖凋亡及对信号转 导蛋 白和转 Ｅ ７０
达 有 关．
关 键 词 ： Ｇ Ｇ； Ｅ ７ ０ Ｅ Ｃ Ｂ Ｌ一 ４ ２细胞 ； 殖 ； 亡 ；ｔ３转 录 因子 增 凋 Ｓａ ｔ
中图分类号 ：： Ａ
文章编号 ：６ ２—３０ （０ ２ ０ ０ ７ １７ ６０ ２ １ ）９— ０ ９—０ ４
Ｅｆｅ ｔ ｆ Ｅ ＣＧ ｎ ｔ ｅ ｐ ｏ ｉ ｒ ｔｏ ｎ ｐ ｐ ｏ ｉ ａ ｄ ｔ ｅ ｅ ｐ ｅ ｓｏ ｆｓａ ３ ｉ ｆ ｃｓｏ Ｇ ｏ ｈ ｒ ｌ ｅ ａ ｉ ｎ ａ ｄ ａ ｏ ｔ ｓｓ ｎ ｈ ｘ ｒ ｓｉ ｎ ｏ ｔ ｔ ｎ ＢＥＬ —７ ０ ｅ ｌ ｆ —４ ２ｃｌ ｓ
ｆ ｒ ｎ ｏ ｃ ｎ ｒ ｔ ｎ ｆ ｅ ｅ ｔｃ ｎ ｅ ｔ ｉ ｓｏ ａｏ ＧＥＣ ｎ ｔ ｅ ｐ ｏ ｉ ｒ ｔ ｎ ｗａ ｅｅ ｔ ｄ ｂ Ｇ ｏ ｈ ｒ ｌ ｅ ａ ｉ ｓ ｄ ｔ ｃｅ ｙ ＭＴＹ ａ ｓ ｙ Ｔ ｅ Ｆ ｏ ｙｏ ｔ ｃ ａ ａｙ ｉ ｗａ ｆ ｏ ｓ ａ ． ｈ ｌｗ ｃ ｔｍｅｒ ｎ ｌ ｓ ｓ ｉ ｓ
affymetrix 基因表达谱芯片 差异基因
Affymetrix基因表达谱芯片是一种常用的高通量基因检测技术，在生物医学领域得到了广泛的应用。
通过对细胞或组织中基因表达水平的全面分析，可以帮助科研人员发现不同生理状态或疾病状态下的差异基因。
本文将对Affymetrix基因表达谱芯片和差异基因进行深入探讨，希望可以为读者提供更全面的了解。
一、Affymetrix基因表达谱芯片概述Affymetrix基因表达谱芯片是一种利用基因芯片技术进行高通量基因表达分析的方法。
该芯片采用了高度平行的探针阵列，每个探针对应一个已知的基因序列，可以同时检测成千上万个基因的表达水平。
Affymetrix基因表达谱芯片的优点在于其高通量、高灵敏度和高特异性，可以快速、准确地获得大量的基因表达信息。
二、Affymetrix基因表达谱芯片的工作原理Affymetrix基因表达谱芯片的工作原理可以简要概括为以下几个步骤：1. RNA提取和标记：首先从待测样本中提取RNA，然后利用标记试剂将RNA转录成cDNA，并进行标记，通常使用生物素和荧光标记等方法。
2. 芯片杂交：标记好的cDNA与芯片上的探针阵列进行杂交，在杂交的过程中，标记的cDNA会特异性地结合到与其互补的探针上。
3. 芯片扫描：经过杂交后，芯片上的探针会产生荧光信号，然后使用芯片扫描仪对芯片进行扫描，测得每个探针的荧光强度。
4. 数据分析：最后对扫描得到的数据进行分析和解读，得到与样本中基因表达水平相关的信息。
三、差异基因的分析差异基因是指在不同生理状态或疾病状态下，其表达水平有明显差异的基因。
通过Affymetrix基因表达谱芯片的分析，可以筛选出在不同样本中表达水平有显著差异的基因，进而进行差异基因的进一步研究。
一般来说，差异基因分析主要包括以下几个步骤：1. 数据预处理：对Affymetrix芯片扫描得到的原始数据进行背景校正、归一化处理等，使得数据更加准确可靠。
2. 统计分析：利用统计学方法对处理后的数据进行差异分析，一般采用t检验、方差分析、贝叶斯统计等方法进行差异基因的筛选。
CCR7、VEGF-C、E-cad在非小细胞肺癌中的表达及其与淋巴结转移的关系
山医 院 ２０ ００年 １月 ～ ０６年 ｌ ２０ ２月手术切 除存 档蜡 块 。患者术 前均 未经过 放化疗 。男 ６ 、 ３ ８例 女 ２例 ， 年 龄 ３ ８ （０４±１． ） 。鳞 癌 ８ ８— １ ６ ． ７３ 岁 ０例 ， 癌 ２ 腺 Ｏ 例； 有淋 巴结转移 ５ ６例 ， 淋 巴结转了三种 因子在 Ｎ Ｃ Ｃ及 转 ＳＬ
移 淋 巴结 中 的表 达及其 相互关 系 ， 现报告 如下 。
１ 材 料与方 法
度分为 ４级 ： （一） 为无 明显 阳性 细 胞 ， 着色 ； 无 （＋）
为 阳性 细胞 ＜２ ％ ， 色 为 淡 黄 色 ； ５ 着 （＋ ＋） 阳性 为 细胞 ２ ％ ～ ５ ， 色为 棕 黄 色 ； ５ ７％ 着 （＋ ＋＋） 阳性 为
见 表 １ 。
１２ １ 检测 方法 ．．
采用免疫 组化染色 法 ， 组织 块用
表 １ Ｃ Ｒ 、 Ｅ － Ｅ ｃｄ在 不 同组 织 中 的 Ｃ ７ Ｖ ＧＦＣ、 －ａ
１％ 甲醛 固 定 、 蜡 包 埋 ， ｘ 连 续 切 片 。采 用 ０ 石 ３Ｉ ｍ
Ｅ ｖｓ ｎ二 步 法 分 别 检 测 Ｃ Ｒ 、 Ｅ ＦＣ Ｅｃｄ表 ｎ ｉｏ ｉ Ｃ ７ Ｖ Ｇ — 、 —ａ 达情 况 ， 抗 按 １ ５ 稀 释 。并 分 别 作 Ｈ 和 抗 一 ：０ Ｅ
应 用 Ｓ Ｓ Ｉ ． 件 进行 检 Ｐ Ｓ Ｏ ０软
验 。Ｐ≤００ 为差异 有统计 学意义 。 ．５
ａ ８例 ， ｍ ６ 。Ｔ Ｍ分期 Ｉ １ 、 ｍ３ ≤３ａ ２例 Ｎ 期 ６例 Ⅱ期
３ ２例 、 ⅢＡ期 ３ ４例 、 ⅢＢ期 １ 。 ８例
１ ２ 方法 ．
织 中的表 达 比较
（ ．ａ ） Ｅｃｄ 主要 介 导 同型 细 胞 问 的 黏 附反 应 ， 表 达 其
毛花苷C促进肝癌细胞Huh-7凋亡并增强caspase-7的活化
毛花苷C促进肝癌细胞Huh-7凋亡并增强caspase-7的活化张艳群;徐庆;曾永联;罗琴;邹海凡;谭宁【摘要】目的研究毛花苷C对肝癌Huh-7细胞增殖的影响及其对caspase-7的活化作用.方法以不同浓度的毛花苷C作用于Huh-7细胞,通过细胞增殖抑制实验及克隆形成实验,检测毛花苷C对Huh-7细胞增殖的抑制作用;采用流式细胞仪检测其对Huh-7细胞凋亡的影响,并用激光共聚焦显微镜采集细胞凋亡染色图像;通过Western blot分析细胞凋亡蛋白caspase-7的活化水平.结果毛花苷C能明显抑制Huh-7细胞的增殖,实验组与对照组间的差异具有统计学意义(P<0.05),并呈量效依赖关系;通过流式细胞仪与激光共聚焦显微镜,观察到毛花苷C诱导凋亡细胞数增加;West-ern blot检测结果显示,毛花苷C可增强凋亡相关酶caspase-7的活化水平.结论毛花苷C明显促进肝癌Huh-7细胞凋亡并增强凋亡相关酶caspase-7的活化水平.【期刊名称】《中国药理学通报》【年(卷),期】2018(034)012【总页数】6页(P1745-1750)【关键词】毛花苷C;肝癌;Huh-7细胞;细胞增殖;细胞凋亡;caspase-7【作者】张艳群;徐庆;曾永联;罗琴;邹海凡;谭宁【作者单位】桂林医学院药学院,广西桂林 541004;桂林医学院广西肝脏损伤与修复分子医学重点实验室,广西桂林 541004;桂林医学院广西肝脏损伤与修复分子医学重点实验室,广西桂林 541004;桂林医学院科学实验中心,广西桂林 541004;桂林医学院科学实验中心,广西桂林 541004;桂林医学院广西肝脏损伤与修复分子医学重点实验室,广西桂林 541004【正文语种】中文【中图分类】R282.71;R329.24;R329.25;R735.702.2;R977.3原发性肝癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是全球范围内发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一，全国每年约有38.3万人死于肝癌，占全球肝癌死亡总人数的51%[1]。
EGCG对人肝癌细胞体外增殖和凋亡的影响及机制
EGCG对人肝癌细胞体外增殖和凋亡的影响及机制摘要]目的：研究表没食子儿茶素没食子酸酯( EGCG)作用肝癌细胞体外增值与凋亡的机理，探讨抗癌功效。
方法：在体外培植人肝癌细胞，将EGCG作用在培植好的肝癌细胞，对肝癌细胞增殖能力用MTT法观察；对肝癌细胞凋亡用流式细胞仪观察。
结果：肝癌细胞的增值力在表没食子儿茶素没食子酸酯( EGCG)作用下显著降低，而肝癌细胞凋亡的显著增高结论：表没食子儿茶素没食子酸酯( EGCG)具有一定抗癌的功能，建议临床推广应用。
关键词EGCG；肝细胞；体外增殖；凋亡影响；机制目前茶叶是公认的健康饮品，经过研发发现广泛的功效，其中抗癌功效被人们愈加关注，表没食子儿茶素没食子酸酯( EGCG)是从茶叶中提取的，具有生物活性，研究表明是发挥一定抗癌功效的主要生物活性物质，需要我们在进一步的研究与开发，表没食子儿茶素没食子酸酯( EGCG)对抗癌机制研究发现针对癌细胞增值和凋亡两方面有一定的功效。
肝癌在亚洲和非洲是一种患病率极高的肿瘤，其死亡率占癌症死亡率的第三位。
手术治疗是肝癌的有效治疗方式，但是因为肝癌细胞的高转移性使得术后病人的术后生存率非常低[1-2]。
肝癌的发生机制复杂，目前尚未明确，经探讨的主要机制有原癌基因失活，抑癌基因激活，癌基因的突变、癌细胞增殖分化凋亡异常等都参与癌症的发生、发展、转变及其他变化，人们在不断攻克癌症的研究中，发现SMMC-7721细胞增殖能力与凋亡参与肝癌的调控，而表没食子儿茶素没食子酸酯( EGCG)对这两种癌细胞有一定的功效，得出茶叶具有一定的抗癌功能。
1.材料与方法：1．1 一般资料细胞株：体外培植肝癌细胞；试剂 : MTT ;提取物表没食子儿茶素没食子酸酯( EGCG) ; 流式细胞仪凋亡试剂盒;1．2 方法细胞培养：在含10% 特级胎牛血清、青霉素和链霉素各100U/ml、pH7.3的DMEM培养液；37℃，饱和湿度，5%CO2的培养箱中培养培植SMMC27721 细胞。
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和实践相结 合 的教 学方法 ， 以让 学生 学 以致 用 ， 可 并提 高学
生的学 习兴趣 ，对 今后可 能工 作 的专 业和 岗位 有提前 的认
题。学生的毕业设计以我系老师带教为主， 同时也请一些外
面的专家作为我们 的兼职指导 老师 ，参与毕业设计 的指导 ，
识， 并使本系培养的学生向” 三基”” 、三早”” 、 三适应” 培养 目
究等 。
物医学工程医学信息专业的本科毕业生。 当然 ， 时代正在不停 的发展和变化， 医疗机构对 医学信息方 面人才的需求也越来越广， 要求也越来越高。 同时， 我们的教 学体系和培养方式也在不停地进行调整变化 ，并与时俱进， 以满足医疗单位在信息化建设 的大环境下对医学信息复合
型人才 日益增长的需求 。
容 敏 华 ，何 敏 ， 黄千 贻
（． １ 广西 医科 大学环境卫生与劳动卫生学教研 室， 广西 南宁 ５ ０ ２ ；． ３０ １２广西 医科大学 医学科 学实验 中心， 西 南宁 ５ ０ ２ ； 广 ３ ０ １
３广 西 医科 大 学 第 一 附 属 医院 生 殖 医 学研 究 中心 ， 西 南 宁 ５ ０ ２ ． 广 ３ ０ １）
【 胡桂周， ６ 】 鲁鸿， ． 钱毅。 现代 医院发展离不开 医学信息 人才 【． Ｊ 医学信 Ｊ
息， ０ ， ： ９— ６ ５ ２ ５ ２ ６ ３ １９ ． ０ １１
编辑 ／ 鸿 兰 任
运用 Ａｆ ｅ ｉ ｆ ｍ ｔｘ网上分析 中心初步 分析 Ｅ Ｃ ｙ ｒ Ｇ Ｇ作用肝癌细胞 Ｓ Ｍ 一 Ｍ Ｃ ７ ２ 前 后差异表达基 因数据 ７１
Ａｌｍｅ ｉ Ｕ１ ３ ． ｆ ｔｘ ３ Ａ ２ ｙ ｒ ０人基 因表达谱 芯片检测的 经没食 子儿茶 素没食子酸 酯（ Ｇ Ｇ） 用肝 癌细胞 系 Ｓ ＭＣ ７ ２ 前后 的 １６ ＥＣ 作 Ｍ 一７１ ９
个 表 达 差 异 基 因进 行 不 同的 逻 辑 运 算 结 果 得 到 按 功 能 分 类 的 Ｅ Ｃ Ｇ Ｇ作 用肝 癌 细胞 系 Ｓ ＭＭＣ ７２ 后 表 达 差 异 基 因信 息列 表 一７ １
新建立的专业 ， 可以制定本专业高年级学生定期到教学单位 （ 基地） 见习、 学习的相关的规章制度。逐步形成一套完善的 在本专业教师 、 兼职教师和教学单位老师的指导下 ， 学生到 实践工作中去学习、 做科研和毕业论文的培养方式。另一方
面， 通过 该教学过程 的实施 可 已达 到多方 的效 果 ， 通过理 论
摘
要 ：目的
探 索如何ｉ 用 Ａ Ｓ ＿ ｍｅ ｉ ｔｘ网上 分析中心对 Ａ ｙ ｔｘ基 因芯 片数据进行 分析 ． ｒ ｆｍｅ ｉ ｒ 挖掘其 中相 关的生 物学信 ， 用 Ｂ ｔｈＱ ｅｙ 批 量 查 询 ）Ｑ ｉ ｕ ｒ （ 速 壹 询 ）Ｉｔ ｓｃｏ 交 集 ） 查 询 和 分 析 功 能 ， 用 ｆ ｍ ｔｘ ｒ 运 ａｃ ｕ ｒ （ 、 ｕｃ Ｑ ｅ 快 ｋ ｙ 、 ｅ ｅｔ ｎ（ ｎｒ ｉ 等 对
维普资讯
医学 信息 ２０ 年 １ ０７ 月第 ２ Ｏ卷第 １ Ｍ ｄｃ ｆ ｍ ｔｎＪｎ２０ ． ｏ ２． ｏ 期 ｅｉｌｎｏ ａｏ．ａ．０ ７Ｖ １ ０ Ｎ ． ａＩ ｒ ｉ ． １
对整个医学信息行业 的发展有一 个总体的认识 ， 然后在老 师 的引 导下 ， 据学生 自己 的认识 和兴趣 ， 根 选择毕业 设计 的课
６个。分别是 细胞周期进展相关基 因列表 、 细胞 增殖相关基 因列表 、 能量代谢相 关基 因列表 、 亡关基 因和细胞生 长抑制基 因列 凋 表、 免疫应答相 关基 因列表 、 信号转导相关基 因列表。每个列表 包含 了每个基 因对应的探针序 列信 息、 因符 号、 因功 能及参 基 基 与的生物 学过程等一 系列生物学信息。 结论 运用在线、 整合的 Ａ ｙ ｅ ｉ ｆ ｍ ｔｘ网上分析 中心 ， ｒ 可快 速、 并行地操 作大量的基 因芯 片原
参考文献 ：
今年上半 年的 ３ 月到 ６ ，第一届 的本科学 生进行了毕 月
业设计。毕业设计以小组的形式进行， 主要以科研和实际的
工作能力 的培养锻炼 为 目 。在带教老师们精 心的指导下 ， 标 经过 几个月 的学 习和研 究 ， 同学们 的进步很大 ， 根据设 计 并
【Ｊ ． ａＢ ｍ ｅ ＭＡ Ｍ ｓｕ １ ． Ｖｎ ｅ ｍ ｌ ．． ｕｅ 主编， ］Ｈ ， 包含 飞， 郑学侃 主译 ． 医学 信息 学． 上海科学技术 出版社 ， ０ ． ２ ２２ ０ ．
标 看齐 ， 出具有 良好理工 和医学交叉 学科知识 的优秀生 培养
内容包括： ①医院信息系统以及医学科学研究 中功能模块的 开发研究和程序设计。②医学影像信息系统（Ａ Ｓ的数据获 ＰＣ） 取、 存储与信息分析处理， 数字化医疗仪器 ， 以及和医院信息 系统接口 程序的研制开发。 ③临床数据的二次挖掘与分析系 统研制开发， 医学研究过程中的数学建模和计算机仿真的研
研究工作内容 ， 写出了质量比较高的毕业设计论文 ， 达到了
我们 的预期 目标。
３ 展 望
【邹 赛德， 卢初 样， 在 医学 生中开设 ” 信息学 ” 程． ３ 】 练伟， 等． 医学 课 医学
信 息 。 ０ ，６１）６ ３６４ ２ ３ １（ ： － ７． ０ ２ ７
通过实践教学体系建立和对医学信息专业学生的实际
工作 能力 的培养可 以起 到多方面 的作用 。一 方面 ， 于一个 对
【李包 ． ４ 】 我国医院信息系统面Ｉ的挑战与任务． 临 中国医院， ｏ， ２ ３２ ｏ １
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