聚类分析实例

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R语言聚类分析实例教程

R语言聚类分析实例教程

R语言聚类分析实例教程R语言是一种广泛应用于数据分析和统计建模的开源编程语言。

聚类分析是一种无监督学习的技术,可以帮助我们发现数据中的隐藏模式和结构。

下面是一个使用R语言进行聚类分析的实例教程。

首先,我们使用一个虚拟的数据集来说明聚类分析的步骤。

假设我们有一个包含100个样本和5个变量的数据集。

我们可以使用以下代码来生成这个数据集:```Rset.seed(123)data <- matrix(rnorm(100*5), ncol = 5)```接下来,我们需要对数据进行预处理。

这包括标准化数据以确保每个变量具有相似的尺度。

我们可以使用以下代码对数据进行标准化:```Rscaled_data <- scale(data)```接下来,我们可以使用K均值聚类算法来对数据进行聚类。

K均值算法将数据集分成K个不同的簇,每个簇包含与其质心最近的样本。

我们可以使用以下代码来执行K均值聚类:```Rkmeans_result <- kmeans(scaled_data, centers = 3)```在这个例子中,我们将数据分成3个簇。

请注意,你可以根据数据的特点选择不同的簇数。

接下来,我们可以检查聚类结果,并将其可视化。

我们可以使用以下代码来绘制数据点,并使用不同的颜色表示不同的聚类:```Rlibrary(ggplot2)df <- data.frame(scaled_data, cluster =as.factor(kmeans_result$cluster))ggplot(df, aes(x = X1, y = X2, color = cluster)) +geom_point( +labs(x = "Variable 1", y = "Variable 2", title = "Cluster Analysis")```上述代码创建了一个散点图,其中x轴和y轴表示数据集的两个变量,颜色表示不同的聚类。

货运企业客户价值聚类分析实例

货运企业客户价值聚类分析实例

远 高 于 现 期水 平 , 5分 ; 高 成 互 补 关 系 , 是对 企 业 有 利 的 同盟 者 , 5分 ; 企业 对

。…
2 期 3
对运 量 相 对 较 大 的 l 5家 典 型 客 户进 行 分 析 。各 项 无专 门 的研 发 机 构 , 品质 量 一般 , 分 。 产 1 评价 指 标 的 打分 标 准 如 下 : ( ) 同时问 1合 ( 3 有 效 订舱 率 1) 9 %以上 , 0 5分 ; 0 8 %以上 , 4

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不 同价 值 的客 户 制 定差 异 化 营销 策 略 。


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客 户 价 值 评 价 指 标 体 系 由直接 价 值 和 潜 在 价
值构 成 , 中 : 其 直接 价 值 包括 交 易 、 用 、 信 特征 等方
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对 企 业 价 值较 大 , 企 业 形 与
( ) 润贡献率 5利
分 ;0 5 %以上 , ; 0 3分 3 %以上 , ;0 2分 3 %以 下 , 。 1分
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聚类分析实例分析题(推荐文档)

聚类分析实例分析题(推荐文档)

5.2酿酒葡萄的等级划分5.2.1葡萄酒的质量分类由问题1中我们得知,第二组评酒员的的评价结果更为可信,所以我们通过第二组评酒员对于酒的评分做出处理。

我们通过excel计算出每位评酒员对每支酒的总分,然后计算出每支酒的10个分数的平均值,作为总的对于这支酒的等级评价。

通过国际酿酒工会对于葡萄酒的分级,以百分制标准评级,总共评出了六个级别(见表5)。

在问题2的计算中,我们求出了各支酒的分数,考虑到所有分数在区间[61.6,81.5]波动,以原等级表分级,结果将会很模糊,不能分得比较清晰。

为此我们需要进一步细化等级。

为此我们重新细化出5个等级,为了方便计算,我们还对等级进行降序数字等级(见表6)。

通过对数据的预处理,我们得到了一个新的关于葡萄酒的分级表格(见表7):考虑到葡萄酒的质量与酿酒葡萄间有比较之间的关系,我们将保留葡萄酒质量对于酿酒葡萄的影响,先单纯从酿酒葡萄的理化指标对酿酒葡萄进行分类,然后在通过葡萄酒质量对酿酒葡萄质量的优劣进一步进行划分。

5.2.2建立模型在通过酿酒葡萄的理化指标对酿酒葡萄分类的过程,我们用到了聚类分析方法中的ward 最小方差法,又叫做离差平方和法。

聚类分析是研究分类问题的一种多元统计方法。

所谓类,通俗地说,就是指相似元素的集合。

为了将样品进行分类,就需要研究样品之间关系。

这里的最小方差法的基本思想就是将一个样品看作P 维空间的一个点,并在空间的定义距离,距离较近的点归为一类;距离较远的点归为不同的类。

面对现在的问题,我们不知道元素的分类,连要分成几类都不知道。

现在我们将用SAS 系统里面的stepdisc 和cluster 过程完成判别分析和聚类分析,最终确定元素对象的分类问题。

建立数据阵,具体数学表示为:1111...............m n nm X X X X X ⎡⎤⎢⎥=⎢⎥⎢⎥⎣⎦(5.2.1) 式中,行向量1(,...,)i i im X x x =表示第i 个样品;列向量1(,...,)'j j nj X x x =’,表示第j 项指标。

SPSS聚类分析加具体案例

SPSS聚类分析加具体案例

六、聚类分析(一)概述1.聚类分析的目的根据已知数据,计算样本或者变量之间亲疏关系的统计量(距离或相关系数)。

根据某种准则(最短距离法、最长距离法、中间距离法、重心法),使同一类内的差别较小,而类与类之间的差别较大,最初达到的就是将样本或变量分成若干类。

2.聚类分析的分类3.距离与相似性为了对样本或者变量进行分类,就需要研究样本之间的关系,最常用的方法有两个。

(二)系统聚类1.系统聚类的步骤距离的具体定义及计算方式计算n各样本两两之间的距离将距离接近的数据依次合并为一类,再计算,再合并 画聚类图,解释类与类之间的关系2.亲疏程度度量方法3.系统聚类的分类4.SPSS操作及实例SPSS采用的是凝聚法。

案例:根据30个省的23个主要行业的平均工资情况,通过聚类分析来判断哪些地区平均工资水平高。

SPSS操作及结果:打开SPSS上方菜单栏中的分析->分类->系统聚类选择变量->勾选统计量->在绘制里选择树状图和冰柱图勾选方法(通常使用组间联接)->度量区间->选择标准化方式(全距从0到1)下图为近似矩阵表,标注了相关系数,数值越大,距离越接近下图为聚类分析结果表,第一类表示这是聚类分析的第几步,第二三列表示该步中那几个样本或者小类聚成一类,第四列表示距离,第五六列表示本步骤中参与的是个体还是小类(0表示样本,非0表示第n步生成的小类),第七列表示本步骤的聚类结果将在以下第几步中用到。

下面是冰柱图和树状图的结果,根据树状图可以看出,如果分为三类的话,第一类包括北京上海,第二类包括天津、广东、浙江、江苏、西藏,剩下的归为一类。

(三)快速聚类(适合大样本聚类)1.快速聚类的步骤指定聚类数目K确定K个初始类的中心(自定义或者根据数据中心初步确定)根据距离最近的原则进行分类根据新的中心位置,重新计算每一记录距离新的类别中心的的距离,并重新分类重复步骤4,直到达到标准2.SPSS操作及实例打开SPSS上方菜单栏中的分析->分类->K-均值聚类选择变量->勾选统计量->定义变量值选择迭代次数->选项(勾选初始聚类中心、每个个案的聚类信息)->定义变量值->保存(勾选聚类成员、聚类中心距离)下图为输出的初始聚类中心下图为最终距离中心,第一类平均工资最高,第二类次之,第三类最低下图为每个聚类中的案例数和聚类成员。

SPSS聚类分析实例讲解

SPSS聚类分析实例讲解

SPSS聚类分析实例讲解SPSS是一款功能强大的统计分析软件,可用于数据清洗、描述统计分析、假设检验和聚类分析等。

聚类分析是一种无监督学习方法,其目标是按照数据的相似性度量,将样本数据划分为多个不同的群组。

下面将以一个实例来讲解如何使用SPSS进行聚类分析。

实例描述:假设有一个超市的销售数据,包含了不同商品的销售额、销售量和利润等信息。

我们希望将商品进行聚类分析,找出相似销售特征的商品群组。

步骤一:数据准备首先,将销售数据保存为一个.SP文件,然后打开SPSS软件。

在主界面上选择“文件”-“打开”-“数据库”-“从SPSS文件”,打开数据文件。

步骤二:变量选择在数据文件中,选择出要进行聚类分析的变量。

在“数据视图”中,选择那些代表销售特征的变量,例如“销售额”、“销售量”和“利润”。

在变量列上按住“Ctrl”键,同时点击这些变量名,选中它们。

步骤三:聚类分析点击菜单上的“数据”-“服务”-“聚类分析”进行聚类分析操作。

会弹出“聚类分析”对话框。

在对话框中,将选中的变量移到右侧的“变量”框中,并选择“K均值聚类”作为聚类方法。

K值是指要分成的群组数量,可以根据实际情况设定。

这里假设将商品分成3个群组,因此设置为3步骤四:聚类结果解读点击“确定”按钮,SPSS将自动进行聚类分析。

完成后,SPSS会在数据文件中生成一个新的变量,用于表示每个样本所属的群组。

在下方的“结果视图”中,可以看到聚类结果的统计数据、聚类中心和变量间的距离。

此外,在“分类变量资料”中,还可以看到每个样本所属的群组编号。

步骤五:聚类结果可视化为了更好地理解聚类结果,可以进行可视化展示。

点击菜单上的“图形”-“散点图”,在对话框中依次选择所属群组变量和销售额、销售量这两个变量。

点击“确定”按钮,即可生成散点图。

散点图可以清楚地显示出不同群组之间的差异和相似性。

根据散点图,可以对聚类结果进行解读。

例如,如果不同群组之间的点比较分散,则说明聚类效果较差;而如果不同群组之间的点比较集中,则说明聚类效果较好。

NTSYS软件进行聚类分析——UPGMA实例

NTSYS软件进行聚类分析——UPGMA实例

NTSYS软件进行聚类分析——UPGMA实例第一部分说明文档Cluster analysis 聚合分析NTSYSpc最常见的使用是对某些相似或相异矩阵进行各种聚类分析。

以下是一个批处理例子;首先,标准化数据矩阵,其次,计算各列之间的距离系数,第三,采用单链路聚类方法,第四,计算表面值(超度量)矩阵和相关系数,第五,以散点图形式显示结果并同时输出距离矩阵。

" Standardize the variables*stand o=data.nts r=sdata.nts" Compute a distance matrix*simint o=sdata.nts r=dist.nts c=dist" Do a single-link cluster analysis of the distance matrix*sahn o=dist.nts r=tree.nts cm=single" Compute cophenetic values*coph o=tree.nts r=coph.nts" Compute the cophenetic correlation*mxcomp x=coph.nts y=dist.nts" Display phenogram*tree o=tree.nts" Display distance matrix*output o=dist.nts第二部分实例解析如果你的数据集包含量纲不一致的变量,则必须要先经过标准化处理,可以用STAND 组件完成。

如下图指明了标准化窗口。

Test.nts文件将被按行(意味着行为变量)标准化,并输出标准化文件名为teststand.nts。

如果你的变量量纲一致(如,基因序列)或者是定性数据则不需要标准化处理。

输出结果如下(5个变量的简单统计)下一步,相似或非相似矩阵数据集必须要在标准化后的数据集上构建,用来衡量各OTUS(列)两两之间的相似/非相似程度。

聚类分析及其应用实例ppt课件

聚类分析及其应用实例ppt课件
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确
Outlines
聚类的思想 常用的聚类方法 实例分析:层次聚类
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确
3. 实例分析:层次聚类算法
定义:对给定的数据进行层次的分解
第4 步

凝聚的方法(自底向上)『常用』
思想:一开始将每个对象作为单独的
第3 步
一组,然后根据同类相近,异类相异 第2步 的原则,合并对象,直到所有的组合
并成一个,或达到一个终止条件。 第1步
a, b, c, d, e c, d, e d, e
X3 Human(人) X4 Gorilla(大猩猩) X5 Chimpanzee(黑猩猩) X2 Symphalangus(合趾猿) X1 Gibbon(长臂猿)
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确
离差平方和法( ward method ):
各元素到类中心的欧式距离之和。
Gp
Cluster P
Cluster M
Cluster Q
D2 WM Wp Wq
G q
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确
凝聚的层次聚类法举例
Gp G q
Dpq max{ dij | i Gp , j Gq}
在整堂课的教学中,刘教师总是让学 生带着 问题来 学习, 而问题 的设置 具有一 定的梯 度,由 浅入深 ,所提 出的问 题也很 明确

聚类分析及其应用实例.ppt

聚类分析及其应用实例.ppt
Gp和Gq中相距最远的两个样本的距离为这两个类之间的距离。
Gp Gq
D pq ? max{ d ij | i ? G p , j ? G q }
类平均距离( average linkage ):
Gp和Gq中每两两样本间距离的平均值作为两个类之间的距离。
Gp Gq
?? D pq
?
1 t ptq
tp i?1
? 相似系数----常用于对变量的聚类
? Pearson相关系数:两个连续变量间呈线性相关 ? Spearman相关系数:利用两变量的秩次大小作线性相关分析 ? Kendall等级相关系数,。。。
凝聚的层次聚类示意图
C3
X4 X3
C4
X5 X2
X1
X1:Gibbon (长臂猿) X2:Symphalangus (合趾猿) X3:Human (人) X4:Gorilla (大猩猩) X5:Chimpanzee (黑猩猩)
tq
X (q) i i ?1
用Gp和Gq表示两个类,它们所包含的样本数目分别为tp和tq,类Gp和Gq之间
的距离用Dpq表示。
离差平方和法( ward method ):
各元素到类中心的欧式距离之和。
Gp
Cluster P
Cluster M
Cluster Q
Gq
D 2 ? WM ? W p ? Wq
凝聚的层次聚类示意图
Oh?
X4 X3
X5 X2
X1
X1:Gibbon (长臂猿) X2:Symphalangus (合趾猿) X3:Human (人) X4:Gorilla (大猩猩) X5:Chimpanzee (黑猩猩)
常用的聚类统计量
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k-means聚类”——数据分析、数据挖掘
一、概要
分类作为一种监督学习方法,要求必须事先明确知道各个类别的信息,并且断言所有待分类项都有一个类别与之对应。

但是很多时候上述条件得不到满足,尤其是在处理海量数据的时候,如果通过预处理使得数据满足分类算法的要求,则代价非常大,这时候可以考虑使用聚类算法。

聚类属于无监督学习,相比于分类,聚类不依赖预定义的类和类标号的训练实例。

本文介绍一种常见的聚类算法——k 均值和k 中心点聚类,最后会举一个实例:应用聚类方法试图解决一个在体育界大家颇具争议的问题——中国男足近几年在亚洲到底处于几流水平。

二、聚类问题
所谓聚类问题,就是给定一个元素集合D,其中每个元素具有n 个可观察属性,使用某种算法将D 划分成k 个子集,要求每个子集内部的元素之间相异度尽可能低,而不同子集的元素相异度尽可能高。

其中每个子集叫做一个簇。

与分类不同,分类是示例式学习,要求分类前明确各个类别,并断言每个元素映射到一个类别,而聚类是观察式学习,在聚类前可以不知道类别甚至不给定类别数量,是无监督学习的一种。

目前聚类广泛应用于统计学、生物学、数据库技术和市场营销等领域,相应的算法也非常的多。

本文仅介绍一种最简单的聚类算法——k 均值(k-means)算法。

三、概念介绍
区分两个概念:
hard clustering:一个文档要么属于类w,要么不属于类w,即文档对确定的类w是二值的1或0。

soft clustering:一个文档可以属于类w1,同时也可以属于w2,而且文档属于一个类的值不是0或1,可以是这样的小数。

K-Means就是一种hard clustering,所谓K-means里的K就是我们要事先指定分类的个数,即K个。

k-means算法的流程如下:
1)从N个文档随机选取K个文档作为初始质心
2)对剩余的每个文档测量其到每个质心的距离,并把它归到最近的质心的类
3)重新计算已经得到的各个类的质心
4)迭代2~3步直至满足既定的条件,算法结束
在K-means算法里所有的文档都必须向量化,n个文档的质心可以认为是这n 个向量的中心,计算方法如下:
这里加入一个方差RSS的概念:
RSSk的值是类k中每个文档到质心的距离,RSS是所有k个类的RSS值的和。

算法结束条件:
1)给定一个迭代次数,达到这个次数就停止,这好像不是一个好建议。

2)k个质心应该达到收敛,即第n次计算出的n个质心在第n+1次迭代时候位置不变。

3)n个文档达到收敛,即第n次计算出的n个文档分类和在第n+1次迭代时候文档分类结果相同。

4)RSS值小于一个阀值,实际中往往把这个条件结合条件1使用
回过头用RSS讨论质心的计算方法是否合理
为了取得RSS的极小值,RSS对质心求偏导数应该为0,所以得到质心
可见,这个质心的选择是合乎数学原理的。

K-means方法的缺点是聚类结果依赖于初始选择的几个质点位置,看下面这个例子:
如果使用2-means方法,初始选择d2和d5那么得到的聚类结果就是{d1,d2,d3}{d4,d5,d6},这不是一个合理的聚类结果
解决这种初始种子问题的方案:
1)去处一些游离在外层的文档后再选择
2)多选一些种子,取结果好的(RSS小)的K个类继续算法
3)用层次聚类的方法选择种子。

我认为这不是一个合适的方法,因为对初始N 个文档进行层次聚类代价非常高。

以上的讨论都是基于K是已知的,但是我们怎么能从随机的文档集合中选择这个k值呢
我们可以对k去1~N分别执行k-means,得到RSS关于K的函数下图:
当RSS由显著下降到不是那么显著下降的K值就可以作为最终的K,如图可以选择4或9。

四、算法及示例
k 均值算法的计算过程非常直观:
1、从D 中随机取k 个元素,作为k 个簇的各自的中心。

2、分别计算剩下的元素到k 个簇中心的相异度,将这些元素分别划归到相异度最低的簇。

3、根据聚类结果,重新计算k 个簇各自的中心,计算方法是取簇中所有元素各自维度的算术平均数。

4、将D 中全部元素按照新的中心重新聚类。

5、重复第4 步,直到聚类结果不再变化。

6、将结果输出。

由于算法比较直观,没有什么可以过多讲解的。

下面,我们来看看k-means 算法一个有趣的应用示例:中国男足近几年到底在亚洲处于几流水平
今年中国男足可算是杯具到家了,几乎到了过街老鼠人人喊打的地步。

对于目前中国男足在亚洲的地位,各方也是各执一词,有人说中国男足亚洲二流,有人说三流,还有人说根本不入流,更有人说其实不比日韩差多少,是亚洲一流。

既然争论不能解决问题,我们就让数据告诉我们结果吧。

下图是采集的亚洲15 只球队在2005 年-2010 年间大型杯赛的战绩(由于澳大利亚是后来加入亚足联的,所以这里没有收录)。

其中包括两次世界杯和一次亚洲杯。

我提前对数据做了如下预处理:对于世界杯,进入决赛圈则取其最终排名,没有进入决赛圈的,打入预选赛十强赛赋予40,预选赛小组未出线的赋予50。

对于亚洲杯,前四名取其排名,八强赋予5,十六强赋予9,预选赛没出现的赋予17。

这样做是为了使得所有数据变为标量,便于后续聚类。

下面先对数据进行[0,1]规格化,下面是规格化后的数据:
其中包括两次世界杯和一次亚洲杯。

我提前对数据做了如下预处理:对于世界杯,进入决赛圈则取其最终排名,没有进入决赛圈的,打入预选赛十强赛赋予40,预选赛小组未出线的赋予50。

对于亚洲杯,前四名取其排名,八强赋予5,十六强赋予9,预选赛没出现的赋予17。

这样做是为了使得所有数据变为标量,便于后续聚类。

下面先对数据进行[0,1]规格化,下面是规格化后的数据:
从做到右依次表示各支球队到当前中心点的欧氏距离,将每支球队分到最近的簇,可对各支球队做如下聚类:
中国C,日本A,韩国A,伊朗A,沙特A,伊拉克C,卡塔尔C,阿联酋C,乌兹别克斯坦B,泰国C,越南C,阿曼C,巴林B,朝鲜B,印尼C。

第一次聚类结果:
A:日本,韩国,伊朗,沙特;
B:乌兹别克斯坦,巴林,朝鲜;
C:中国,伊拉克,卡塔尔,阿联酋,泰国,越南,阿曼,印尼。

下面根据第一次聚类结果,调整各个簇的中心点。

A 簇的新中心点为: {+0++/4=,(0+++/4=,+++/4=} = {, , }
用同样的方法计算得到B 和C 簇的新中心点分别为{, , },{1, ,}。

用调整后的中心点再次进行聚类,得到:
第二次迭代后的结果为:
中国C,日本A,韩国A,伊朗A,沙特A,伊拉克C,卡塔尔C,阿联酋C,乌兹别克斯坦B,泰国C,越南C,阿曼C,巴林B,朝鲜B,印尼C。

结果无变化,说明结果已收敛,于是给出最终聚类结果:
亚洲一流:日本,韩国,伊朗,沙特
亚洲二流:乌兹别克斯坦,巴林,朝鲜
亚洲三流:中国,伊拉克,卡塔尔,阿联酋,泰国,越南,阿曼,印尼
看来数据告诉我们,说国足近几年处在亚洲三流水平真的是没有冤枉他们,至少从国际杯赛战绩是这样的。

其实上面的分析数据不仅告诉了我们聚类信息,还提供了一些其它有趣的信息,例如从中可以定量分析出各个球队之间的差距,例如,在亚洲一流队伍中,日本与沙特水平最接近,而伊朗则相距他们较远,这也和近几年伊朗没落的实际相符。

另外,乌兹别克斯坦和巴林虽然没有打进近两届世界杯,不过凭借预算赛和亚洲杯上的出色表现占据B 组一席之地,而朝鲜由于打入了2010 世界杯决赛圈而有幸进入B 组,可是同样奇迹般夺得2007年亚洲杯的伊拉克却被分在三流,看来亚洲杯冠军的分量还不如打进世界杯决赛圈重啊。

其它有趣的信息,有兴趣的朋友可以进一步挖掘。

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