通用引物测序的原理
测序通用引物序列

测序通用引物序列常见载体的测序引物:Primer of Vector:Vector:Primer(F);Primer(R)pACT T7 T3pACT2 GAL4 AD pACT2-RpAS2-1 GAL4 BD pAS2-1.RpB42AD pB42ADF pB42ADRpBACPAK8 BAC1 BAC2pBK-CMV T7 T3PBS(SK/KS)/M13- M13F/T7 T3/M13RpBV220 PBV220F PBV220RpCAMBIA 1301(1300) P1 P2pCAMBIA 2300 M13R(-48) M13F(-47)PCANTB5E S1/M13R S6pCAT3-enhancer RVP3 此载体无反向引物pcDNA3.0 CMV-F/T7 SP6/BGHpcDNA3.1 T7 BGHpcDNA4 T7/CMV-F BGHpcDNA6 T7/CMV-F(J21025在T7前面)BGHpcDNAII T7 SP6pCE2.1 M13F M13RpCEP4 pCEP-F EBV-RpCF-T M13F M13RpCI T7(17Base)此载体无反向引物pCI-neo T7(17Base)T3pCMS-EGFP T7 T3pCMV-3Tag-4A T3 /PFLAG-CMV-F T7pCMV5 pCMV5F pCMV5RpCMV5-Flag pCMV5F pCMV5RpCMV-MYC/HA pCMV-F pCMV-RpCMV-Sport M13F/T7 SP6/M13RpCMV-Tag(KAN+) T3 T7pCR2.1-TOPO M13F/T7 M13RpCR3.1 T7 BGHpCS2 SP6 T7pDonar M13F M13RpDONR221 M13F M13RpDrive T7 SP6pDRIveR(KAN+) T7 SP6pDsRED1-C1 pDsRED-ex-C1-F pEGFP-N-3’(距离很近,一般不用) pDsRED2-C1(KAN+) pDsRED-ex-C1-F pEGFP-N-3’pDSRED-N1(KAN+) pEGFP-N-5’ PDSRED-N-RpECFP-C pEGFP-C-5’ pECFP-C-3′pECFP-N1 pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pEF/myc/ER pEF-F pCDNA3.1RpEGFP-C(KAN+) pEGFP-C-5’ pEGFP-C-3′pEGFP-N(KAN+) pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pENTR/D-TOPO(KAN+) M13F M13RpET-*(His)(KAN+) T7 T7 TerpET22(a,b,c)(AMP+) T7 T7 TerpET28,30,24,49(KAN+) T7 T7 TerpET32(a,b,c)(AMP+) T7/S.tag T7 TerpET50(amp+) T7/s.tag T7TERpET44(AMP+) T7/s.tag T7 TerpEYFP-N1 pEGFP-N-5’ pEGFP-N-3’pEYFP-C1 pEGFP-C-5’ pEGFP-C-3′pFLAG-CMV pFLAG-CMV -F pFLAG-CMV -R pGAD424 GAL4 AD 3′ADpGADGH GAL4 AD 3′ADpGADT7-Rec GAL4 AD/T7 3′ADpGAPZa-A a-FACTOR 3′AOXpGBKT7(Kana+) T7 3′BDpGEM-T(-Easy) M13F/T7 SP6/M13RpGEX-(*)T pGEX-4T-5’ pGEX-4T-3’pGL2 GLP1 GLP2pGL3 RVP3 GLP2(RVP4)(没有特别说明用GLP2) PinpointTM Vector Pinpoint Primer SP6pIRES PIRES-F/T7 T3/PIRES-R (J40720)pIRES2-EGFP pIRES2-EGFP.P5’ pIRES2-EGFP.P3’pLXSN pLXSN-F pLXSN-RpMAL-c2E MalE primer M13F(-47)pMAL-C2x P5’ P3’pMAL-p2X MalE primer M13F(-47)PMD18-T M13R(-48) M13F(-47)PMD19-T M13F(-47) M13R(-48)pPIC9K(AMP+、ZEO+)5’AOX/a-factor 3’AOX pPICZa 5′AOX/PPICZa-F 3′AOXpPROEXHTA M13R(-48) 无反向引物pQE30or40 pQE30-F pQE-R:pRSET T7 T7TERpSilencer3.1-H1 hygro M13F(-47) 3.0REV pSILENCEV2.0-U6 T7 2.0REVpSK01-T M13F M13RpSK-CMV(KAN+) T7 T3pSP72 T7 SP6pSport1 SP6/M13F(-47) T7/M13RpSUPER T7 T3pTA2 M13F/T7(优先使用M13F)T3/M13RpT-Adv M13F /T7 M13RpTARGET TM pTarget.F(在T7前面)/T7 pTarget.R pTO-T7 T7 T7TERpTRC99a-c pTRC99C-F pTRC99C-RpTriPLEx2 5′pTriPLEx2 T7pTWIN-1 T7 T7TER(客户确认再用)pUC18(19)/118(119) M13F(-47) M13R(-48)pUCm-T M13F/T7 M13RpVAX1 T7 BGHpWSK29 T7/M13F/M13F(-47) T3/M13R/M13R(-48)pXT7 T7 SP6pYES2 T7 pYes2.RpLEXA pLEXA-F pLEXA-RpLNCX pLNCX-F pLNCX-RpRECEIVER CMV-F 此载体无反向引物pSHUTTLE-CMV PSHUTTLE-CMV-F PSHUTTLE-CMV-R pSP64/65 SP6 此载体无反向引物pSTBlue-1 T7 SP6pT7Blue(R) T7 M13F(-47)引物名称序列(5′-3′):M13R:CAG GAA ACA GCT ATG ACCM13F:TGT AAA ACG ACG GCC AGTM13F(-47):CGC CAG GGT TTT CCC AGT CAC GACM13R(-48):AGC GGA TAA CAA TTT CAC ACA GGAM13(-96):CCC TCA TAG TTA GCG TAA CGSP6:ATT TAG GTG ACA CTA TAGT7:TAA TAC GAC TCA CTA TAG GGT7 terminator:TGC TAG TTA TTG CTC AGC GGT3:ATT AAC CCT CAC TAA AGG GApGEX-4T-5′:GGG CTG GCA AGC CAC GTT TGG TG pGEX-4T-3′:CCG GGA GCT GCA TGT GTC AGA GG GLp1:TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TGGLp2:CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CARVp3:CTA GCA AAA TAG GCT GTC CCRVp4:GAC GAT AGT CAT GCC CCG CGpcDNA3.1R:TAG AAG GCA CAG TCG AGGPinPoint primer:CGT GAC GCG GTG CAG GGC G pCMV-F:TCT AAA AGC TGC GGA ATT GTpCMV-R:TCCAAACTCATCAATGTATCpTRC99C-F: TTG CGC CGA CAT CAT AACpTRC99C-R: CTGCGTTCTGATTTAATCTGpCEP-F: AGA GCT CGT TTA GTG AAC CGEBV-R : GTG GTT TGT CCA AAC TCA TCpIRES2-EGFP.P5’: GTA GGC GTG TAC GGT GGG AG pIRES2-EGFP.P3’: AAC GCA CAC CGG CCT TAT TC3′AD: AGA TGG TGC ACG ATG CAC AGCMV -F:CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTGS1:CAA CGT GAA AAA ATT ATT ATT CGCS6:GTA AAT GAA TTT TCT GTA GTA GG5`AOX1:GAC TGG TTC CAA TTG ACA AGC3`AOX1:GCA AAT GGC ATT CTG ACA TCCα-Factor:TAC TAT TGC CAG CAT TGC TGCGAL4 AD:TAC CAC TAC AAT GGA TGpACT2-R:GTGCACGATGCACAGTTGAApB42ADF:CCA GCC TCT TGC TGA GTG GAG ATGpB42ADR:AAG CCG ACA ACC TTG ATT GGA GpEGFP-N-5’:TGG GAG GTC TAT ATA AGC AGA G pEGFP-N-3’:CGT CGC CGT CCA GCT CGA CCA G pEGFP-C-5’:CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G pEGFP-C-3′ :TAT GGC TGA TTA TGA TCA GTPBV220F:AAG AAG GGC AGC ATT CAA AGPBV220R:CTG CGT TCT GAT TTA ATC TGU6:ATG GAC TAT CAT ATG CTT ACC GTA2.0rev primer:AGG CGA TTA AGT TGG GTA3.0rev:GAG TTA GCT CAC TCA TTA GGCS.tag:GAA CGC CAG CAC ATG GAC5′TriplEx2:CTC CGA GAT CTG GAC GAG CRVP4:GAC GAT AGT CAT GCC CCG CGRVP3:CTA GCA AAA TAG GCT GTC CCpQE30-R:GTT CTG AGG TCA TTA CTG GpQE30-F:TGA GCG GAT AAC AAT TTC ACpEF-F:TCA AGC CTC AGA CAG TGG TTCpDSRED-N1-R:TGA AGC GCA TGA ACT CCT TG pDsRED-express-C1-F:TCC CAC AAC GAG GAC TAC AC pCMV5R:ATT ATA GAG GAC ACC TAG TCpCMV5F:TTC CAA AAT GTC GTA ATA ACP5′:TGC GTA CTG CGG TGA TCA ACP3′:CTG CAA GGC GAT TAA GTT GGBAC2:ACG CAC AGA ATC TAG CGC TTBAC1:AAC CAT CTC GCA AAT AAA TA3′BD:TAA GAG TCA CTT TAA AAT TTG TAT AC pTarget.F:CCA GGA TTT TCC CAG TCA CpTarget.R:GGC TTT ACA CTT TAT GCT TCT7(17base):ACA TCC ACT TTG CCT TTC TCpYes2.R:TCG GTT AGA GCG GAT GTGGAL4 BD:TCA TCG GAA GAG AGT AGpAS2-1.R:AAG AGT TAC TCA AGA ACA AGA ApFlag-CMV-F: GGT AGG CGT GTA CGG TGGpFlag-CMV-R: GCA CTG GAG TGG CAA CTTpIRES-F: CTT ACT GAC ATC CAC TTT GCpIRES.R: CAC TGC ATT CTA GTT GTG GTP1:CCA GGC TTT ACA CTT TAT GCP2:GCG ATT AAG TTG GGT AAC GCpLEXA-F:CGT CAG CAG AGC TTC ACC ATpLEXA-R:TAA AAC CTA AGA GTC ACT TTpLNCX-F:AGC TCG TTT AGT GAA CCG TCA GAT CG pLNCX-R:ACC TAC AGG TGG GGT CTT TCA TTC CC pLXSN-F:CTT GAA CCT CCT CGT TCG ACpLXSN-R:GTT GCT GAC TAA TTG AGA TGpSHUTTLE-CMV-F:GGT CTA TAT AAG CAG AGG TG pSHUTTLE-CMV-R:GTG GTA TGG CTG ATT ATG ATC AG MalE Primer:GGT CGT CAG ACT GTC GAT GAA GCC。
PCR的原理与应用课件

cDNA合成完毕,准备连接
第一链合成
cDNA合成过程示意图
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cDNA序列的克隆
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(二)PCR的种类 2.Nested PCR: 巢式PCR 原理: 利用两套PCR引物(巢式引物)对进行两轮PCR扩增反应。在第一轮扩增中,外引物用以产生扩增产物,此产物在内引物的存在下进行第二轮扩增。 优点: 由于巢式PCR反应有两次PCR扩增,从而降低了扩增多个靶位点的可能性(因为与两套引物都互补的引物很少)增加了检测的敏感性;两对PCR引物与检测模板的配对,增加了检测的可靠性;增加有限量靶序列(如稀有mRNA)的灵敏度,并且提高了困难PCR(如5'RACE)的特异性。 应用: 一般应用于动物方面。如: 病毒,梅毒螺旋体,HIV,肿瘤基因等。
•高灵敏度
•适用于在单个样品中检测几个mRNA
•适用于大量样品分析
一步法和两步法RT-PCR的比较
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EcoRI
寡聚(dT)随机6碱基引物R
寡聚(dT)
随机6碱基引物R
mRNA
(A)n (T)
(A)n
(A)n (T)
R
R
R
R
R
R
第二链合成
(A)n (T)
(A)n
R
R
R
R
R
R
(A)n (T)
EcoRI
很少有在公司工作的科研人员得 诺贝尔奖, Mullis是其中之一
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Mullis开车的时候, 瞬间感觉两排路灯就是DNA的两条链, 自己的车和对面开来的车象是DNA聚合酶, 面对面地合成着DNA, ……
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菌种鉴定通用引物

菌种鉴定通用引物引言菌种鉴定是微生物学领域中的一项重要工作,它对于疾病诊断、环境监测和食品安全等方面具有重要意义。
菌种鉴定的关键是通过引物对目标微生物的DNA序列进行扩增和分析,从而确定其分类地位和种属鉴定。
本文将介绍菌种鉴定通用引物的原理和应用。
一、引物的选择原则菌种鉴定通用引物的选择需要考虑以下几个因素:1. 引物的特异性:引物应具有足够的特异性,只能扩增目标微生物的DNA序列,而不扩增其他非目标微生物的DNA序列。
2. 引物的保守性:引物应选择在目标微生物的DNA序列中高度保守的区域,以确保扩增的目标序列的一致性。
3. 引物的长度:引物的长度应适中,一般为18-30个碱基对,过长的引物可能导致扩增效率降低,而过短的引物可能导致特异性降低。
4. 引物的G+C含量:引物的G+C含量应适中,一般在40-60%之间,过低或过高的G+C含量可能影响扩增效率。
5. 引物的互补性:引物的两个端部应互补,以确保引物在目标DNA 序列上的结合和扩增。
二、常用的菌种鉴定通用引物1. 16S rRNA通用引物:16S rRNA序列是细菌和古菌中高度保守的基因序列,因此广泛用于细菌和古菌的鉴定。
常用的引物包括27F(5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3')和1492R(5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3')。
2. 18S rRNA通用引物:18S rRNA序列是真核生物中高度保守的基因序列,因此广泛用于真菌和原生动物的鉴定。
常用的引物包括ITS1(5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3')和ITS4(5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3')。
3. 基因编码区通用引物:除了rRNA序列外,一些基因编码区的引物也被广泛应用于菌种鉴定。
例如,ITS区(内转录间隔区)是真菌常用的鉴定区域,常用的引物包括ITS1和ITS4。
pcr测序原理

pcr测序原理1. 引言PCR(聚合酶链反应)是一种在分子生物学领域中广泛应用的技术,它可以在短时间内扩增DNA的特定片段。
PCR测序是一种基于PCR 技术的DNA测序方法,它通过PCR扩增出的DNA片段来确定DNA 序列。
本文将深入探讨PCR测序的原理及其在基因组研究中的应用。
2. PCR测序原理PCR测序是一种无模板法的测序方法,它利用PCR扩增DNA片段,然后通过测序仪器对扩增的片段进行测序。
下面将详细介绍PCR测序的原理。
2.1 PCR扩增需要设计一对引物,引物的序列应该与待扩增片段的两端序列匹配。
PCR反应涉及到三个步骤:变性、退火和延伸。
在变性步骤中,将待扩增的双链DNA加热至95°C,使其变性成两条单链DNA。
将反应体系温度降低至55-65°C,引物与目标片段的互补序列进行配对,这一步骤称为退火。
在72°C的延伸步骤中,分别使用DNA聚合酶和四种核苷酸(dNTPs)扩增新的DNA链,形成DNA扩增产物。
2.2 扩增产物纯化在PCR反应结束后,扩增产物需要进行纯化。
纯化的目的是去除杂质和剩余的引物、核苷酸和酶等。
纯化的方法通常包括酶处理、柱层析或凝胶电泳等。
纯化后的扩增产物可以被用于后续的PCR测序实验。
2.3 PCR测序PCR测序需要使用测序仪器,测序仪器可以检测到每个扩增产物的碱基序列。
通常使用有效的荧光标记dideoxynucleotides(ddNTPs)来标记链终止。
在测序反应中,扩增产物会与引物和ddNTPs一起放入测序仪器中。
随着延伸的进行,当ddNTPs加入到新合成链中时,DNA链的扩增会终止。
由于每种ddNTPs都有不同的荧光标记,测序仪器会同时监测DNA链扩增的终止情况和发出的荧光信号,从而确定DNA序列。
3. PCR测序的应用PCR测序在基因组研究中有着广泛的应用。
下面将介绍PCR测序在以下几个方面的应用:3.1 基因突变检测PCR测序可以用于检测基因组中的突变,从而帮助研究人员了解突变与疾病之间的关系。
野生动物及其制品物种DNA鉴定技术规程-最新国标

野生动物及其制品物种DNA鉴定技术规程1 范围本标准规定了对野生动物及其制品的来源物种进行DNA鉴定时样品的采集与制备、DNA 鉴定程序、结果表述、污染的预防与处理、安全防护等主要技术内容。
本标准适用于野生动物及其制品来源物种的DNA检验鉴定。
本标准也适用于家养动物及其制品来源物种的DNA检验鉴定。
2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB 19489 实验室生物安全通用要求GB/T 34796 水溶液中核酸的浓度和纯度检测紫外分光光度法GB/T 19495.2 转基因产品检测实验室技术要求SN/T 1193 基因检测实验室技术要求LY/T 2501 -2015 野生动物及其产品的物种鉴定规范GA/T 383 法庭科学DNA实验室检验规范T/LTIA 20-2022 动物鉴定样品DNA的提取技术规范3 术语和定义下列术语和定义适用于本文件。
3.1野生动物w ildlife本标准指野生脊椎动物和无脊椎动物。
3.2野生动物制品wildlife products前款所指野生动物的整体(含卵、蛋)、部分及其衍生物。
3.3物种鉴定species identification采用形态学、生物化学、分子生物学等检验技术,对野生动物及其制品进行分类地位(科、属、种)的认定。
3.4PCR Polymerase Chain Reaction聚合酶链式反应。
通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
3.5实时荧光PCR Real Time Fluorescence Quantitative PCR (qPCR)在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光探针,利用荧光信号的积累实时监控整个PCR 扩增过程。
3.6Ct值Cycle threshold每个反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。
引物设计

无任何特异性
03
目的基因的获取-PCR引物设计
特异引物设计:
通用引物设计:
1、扩增的完整序列完全已知 1、扩增保守的同源基因
2、扩增序列长度要≥CDS
2、扩增序列长度一般<CDS
3、引物长度18-22,得分高
3、一般测序用
4、要blast
4、不用个人设计
5、测序时要提供引物,连到T载 5、测序不需要提供引物
03
PART THREE
引物设计原则和方法
03
目的基因的克隆
基因工程的主要目的是把经过遗传学和分子生物学前期 研究探明了结构与功能的靶基因(target gene)转导 宿主细胞中表达,以大量获取该基因的产物或改变宿主 性状。由此可见,如何分离得到靶基因是基因工程操作 的关键步骤之一,否则“巧妇难为无米之炊”。
序不好进行
3、 随机6或9个mers
4、要获得完整基因要做步移
PCR或反向PCR或测完整基因组
03
目的基因的获取-PCR引物设计
引物设计软件: 1、Oligo 6 2、Primer premier 5/6 3、Dnastar 4、Primer 3plus(在线)
03
目的基因的获取-PCR引物设计
引物二聚体
发夹结构
03
目的基因的获取-PCR引物设计
引物设计种类:
引物
克隆引物 表达引物
特异引物Specific
primers
只扩增某一类基因或生物
通用引物Universal 与基因两端基因匹配(载体)
Primers
兼并引物Degenerate 可以扩增某一类相似基因
Primers
随机引物
Random primers
基因的荧光定量pcr引物序列-概述说明以及解释

基因的荧光定量pcr引物序列-概述说明以及解释1.引言1.1 概述概述:引物在荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction)中扮演着至关重要的角色。
荧光定量PCR是一种基于聚合酶链反应的技术,用于检测和定量目标DNA序列的方法。
引物序列的选择和设计对于PCR的成功至关重要,因为它们直接影响到PCR的灵敏度、特异性和准确性。
在荧光定量PCR中,引物是一对短的DNA或RNA序列,它们与目标DNA或RNA序列中具有互补碱基配对的部分相互结合,从而充当DNA 复制的起始点。
这两个引物必须经过精确的设计和合成,以确保它们能够特异性地与目标序列结合,并且在PCR反应中不产生非特异性扩增。
引物序列的选择是基于目标基因或RNA序列的独特性。
为了确保特异性扩增,引物的设计需要避免与其他非靶标序列的互补性。
此外,引物的长度和碱基组成也需要仔细考虑,以保证PCR反应的效率和稳定性。
在荧光定量PCR中,引物通常与荧光探针结合使用,以实现实时监测和定量。
荧光探针是一种含有荧光染料和阻尼剂的DNA探针,它与PCR扩增产物的结合会导致荧光信号的释放和增强。
通过测量荧光信号的强度,可以准确地定量PCR反应中产生的扩增产物。
因此,正确选择和设计引物序列对于基因的荧光定量PCR至关重要。
它不仅影响到PCR的准确性和特异性,还直接关系到实验结果的可靠性和可重复性。
进一步的研究和改进引物设计策略将有助于提高荧光定量PCR 技术在基因研究和临床诊断中的应用。
1.2 文章结构本文主要包括引言、正文和结论三个部分。
引言部分主要包括概述、文章结构和目的。
首先,我们将简要介绍基因的荧光定量PCR技术的背景和意义。
然后,我们将详细阐述本文的结构安排,以帮助读者了解全文内容。
最后,我们明确本文的目的,即探讨基因的荧光定量PCR引物序列的重要性及其在基因检测中的应用。
正文部分将重点讨论基因的荧光定量PCR技术及其原理。
我们将介绍PCR技术的基本原理以及荧光定量PCR技术与传统PCR技术的区别。
生物工程毕业论文

毕业论文人工化学法全基因合成学生姓名XXX学号院系生物工程专业生物制药指导教师二0XX年五月二十日人工化学法全基因合成XXX湖北荆楚理工学院生物制药专业摘要:人工化学法全基因合成就是在已知DNA序列的情况下,通过设计引物,拉出全长目的片段并将该段DNA序列克隆到特定的载体里,通过菌检验证得出目的基因已经克隆到载体质粒,最后测序得到克隆基因的序列并与已知DNA序列完全相同无突变的过程。
全基因合成的方法目前获取目的基因的方法主要有三种:反向转录法、从细胞基因组直接分离法和人工化学合成法,这些方法都有一个前提,就是已有文献报道所研究的目的基因的蛋白序列或者基因的序列。
1)反向转录法:这种方法主要用于分子量较大而又不知其序列的基因,它以目的基因的mRNA为模板,设计上下游引物,借助反转录酶合成碱基互补的DNA片段,即cDNA,再在DNA聚合酶的作用下合成双链cDNA,亦即目的基因的双链DNA。
2)基因组扩增法:利用基因组抽提试剂盒,可以从细胞、植物、血液、动物组织中直接分离基因组,设计特异扩增的引物,利用抽提的基因组为模版,直接PCR扩增,以获取目的基因。
3)人工合成:依照某一蛋白质的氨基酸序列,或基因序列,设计全长引物,利用OVERLAP方法形成模版DNA,再利用PCR扩增的方法得到双链DNA,然后将PCR产物转化克隆至克隆载体或者表达载体中。
化学合成全基因目前是准确率最高,速度最快的方法,同时可以依据密码子在不同宿主细胞的偏爱性和不同的实验需求,设计基因序列,提高表达水平。
1流程概观已知DNA片段设计引物引物的合pcr扩增PCR得到目的短片段二次pcr 目的片段拼接全长TA克隆克隆到目的载感受态细胞转化菌液pcr菌液检测测序对比序列突变修复得到正确结果确定与已知DNA片段一至。
2具体操作及各方面注意的事项当我们研究细胞生物学的时候,我们有时会需要研究一些特定的基因所表现的显性或隐性性状,而我们又没有这段基因的现成模板,这时我们就要通过人工合成的方法制备这段特殊的基因。
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通用引物测序的原理
通用引物测序是一种用于测定DNA序列的方法,它基于DNA的复制和扩增原理。
通用引物是一段具有特定序列的短DNA片段,能够与目标DNA序列的特定区域进行互补配对。
通用引物通常用于PCR(聚合酶链式反应)或Sanger 测序等技术中。
通用引物测序的原理如下:
1. DNA提取:从样本中提取DNA,并将其纯化。
2. PCR扩增:使用通用引物对目标DNA进行扩增。
通常,每个引物配对目标DNA的两个相邻区域,使其能够扩增出完整的目标序列。
3. PCR循环:PCR反应进行多个循环,每个循环包括DNA的变性、引物的结合和扩增等步骤。
这些循环可以使目标DNA的数量指数级增加。
4. 扩增产物检测:在每个PCR循环的末尾,通过电泳等方法检测扩增产物的大小和数量。
5. 分离扩增产物:将扩增产物分离出来,通常使用凝胶电泳等技术。
6. 测序:对扩增产物进行测序,通常使用Sanger测序方法。
在测序中,通用引物作为测序反应的起始点,通过DNA聚合酶和荧光标记的核苷酸逐个加入,形成DNA序列。
7. 数据分析:通过计算机软件对测序结果进行分析和解读,得到目标DNA序列。
通用引物测序的优点是可以扩增和测序多个目标序列,适用于不同种类的样本。
同时,通用引物也可以用于筛查和鉴定特定基因或序列的存在。