核酸的分子杂交技术及其应用

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核酸分子杂交与应用

核酸分子杂交与应用
加水至 20μl
(2)加入所需的限制酶,并在适当条件下温育
(3)加入适量T4DNA聚合酶。
(4)当切除了所需数量的核苷酸后,加入 1μl2mmol/L四种核苷酸(其中一种为标记核苷酸),37oC保温一小时。
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标记步骤
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加入除标记核苷酸外的其他三种脱氧核糖核苷酸溶液(也可以是多种标记核苷酸),20mmol/L溶液各1μl。
以下操作要在同位素工作室中有防护措施的情况下进行操作 加入100μCi(10μl)标记的核苷酸溶液。注:应贮存在-20oC冰箱中,使用前在室温下放置15~30分钟融化。要尽量减少冻融次数。
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随机引物标记法特点
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STEP3
STEP2
STEP1
除能进行双链DNA标记外,也可用于单链DNA或RNA探针的标记。当用RNA为模板是,操作方法同上,但必须采用反转录酶。
标记活性高,只需25ng样品DNA,可在3小时内使40%~60%以上甚至90%的标记dNTP掺入到探针DNA链上
操作方便
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3’末端标记
探针的标记
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随机引物法 标记原理:随机引物是含有各种可能排列的寡聚核苷酸片段的混合物,可以与任何核酸序列杂交,起到聚合酶促反应的引物作用。将待标记的探针模板与随机引物一起退火,合成标记探针。
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标记步骤
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标记步骤
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取200ng双链DNA溶于1μl蒸馏水中,在蜡膜上与1μl随机引物充分混匀,吸入一毛细玻璃管中,用火封严两端。置沸水浴中30分钟并迅速置冰水浴中1分钟。将DNA转入上述离心管中
STEP4
STEP3
STEP2
STEP1
影响变性的因素:
影响变性的因素:
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核酸杂交的原理及其应用

核酸杂交的原理及其应用

核酸杂交的原理及其应用一、核酸杂交的原理核酸杂交是指DNA或RNA的单链与其互补序列的另一条单链通过互补碱基配对结合的过程。

核酸杂交的原理主要包括序列互补性和碱基配对。

1.序列互补性:DNA和RNA分子中的碱基可以通过特定的规则进行互补配对。

DNA的碱基A与RNA的碱基U互补,碱基C与碱基G互补。

这种序列互补性是核酸杂交的基础。

2.碱基配对:核酸杂交的过程中,互补的碱基会通过氢键结合。

DNA双链中的A与T之间形成两个氢键,碱基C与G之间形成三个氢键。

这些氢键的形成增强了双链的稳定性。

二、核酸杂交的应用核酸杂交在生物学和医学领域有广泛的应用。

以下是核酸杂交的主要应有:1.DNA杂交化学(DNA hybridization chemistry):核酸杂交在DNA的杂交化学中,可以用于DNA的检测和诊断。

通过将DNA探针与待测样本中的目标DNA序列进行杂交,可以检测目标DNA的存在与否。

这种技术可以应用于基因检测,病原体检测,遗传疾病的诊断等方面。

2.Northern blotting:Northern blotting是一种用于检测RNA分子的技术。

在Northern blotting中,通过核酸杂交将RNA分子转移到固定膜上,然后使用标记的DNA或RNA探针与目标RNA序列进行杂交。

通过检测探针的杂交信号,可以确定目标RNA的大小和相对丰度。

这种技术常用于研究基因表达的调控机制。

3.Southern blotting:Southern blotting是一种用于检测DNA分子的技术。

在Southern blotting中,通过核酸杂交检测DNA在凝胶上的分子量和数量。

这种技术常用于DNA重排、基因突变和DNA测序等方面。

4.亚细胞定位:核酸杂交可以用于确定特定DNA或RNA序列在细胞中的位置。

通过将探针标记为荧光染料或放射性同位素,可以使探针在细胞中可见。

这种技术可以用于研究基因的表达和定位。

5.基因组学研究:核酸杂交在基因组学中起着重要的作用。

核酸分子杂交与应用

核酸分子杂交与应用
• 基因组DNA探针:有细菌、病毒、原虫、真菌、动物和人类细胞DNA探针,多为某一基 因的全部或部分序列,或某一非编码序列。
• cDNA探针:以mRNA为模板经过逆转录酶催化产生的互补于mRNA的DNA链。
2020年10月29日星期
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探针的种类
• DNA探针优点: • 1、一般克隆在质粒载体中,可以无限繁殖; • 2、DNA探针不易降解 • 3、DNA的标记方法比较成熟。
牛血清白蛋白
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标记步骤
• 3、加入除标记核苷酸外的其他三种脱氧核糖核苷酸溶液(也可以是多种标记核苷酸), 20mmol/L溶液各1μl。 以下操作要在同位素工作室中有防护措施的情况下进行操作
• 4、加入100μCi(10μl)标记的核苷酸溶液。注:应贮存在-20oC冰箱中,使用前在室 温下放置15~30分钟融化。要尽量减少冻融次数。
大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow片段末 端标记法
T4DNA聚合酶标记法
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大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow片段末
端标记法:
标记反应步骤: (1)在反应管中依次加入下列试剂并混匀
DNA
1μg
10xKlenow片段缓冲液
2mmol/L3种dNTP(无dATP)
[α-32P]dATP
2020年10月29日星期
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标记步骤
• 5、加入无菌蒸馏水,至终体积为46.5μl,混匀 • 6、加入0.5μl稀释的DNase I溶液,混匀 • 7、加入1μl(5U)DNA聚合酶I溶液,混匀 注:以上操作均在冰浴中进行 • 8、置14~16oC水浴中保温1~2小时 • 9、加入2μl 0.5mol/L EDTA终止反应 • 10、纯化标记的DNA探针

核酸杂交的常用方法及应用

核酸杂交的常用方法及应用

核酸杂交的常用方法及应用核酸杂交是一种基于互补配对的技术,主要用于研究和分析DNA或RNA的序列、结构和功能。

它是分子生物学和遗传学领域中重要的实验方法之一,具有广泛的应用。

以下将详细介绍核酸杂交的常用方法以及应用领域。

一、核酸杂交的常用方法1. Northern blotting:该技术用于检测和分析RNA的存在和表达水平。

首先,将RNA样本经电泳分离,并转移到固定在膜上的核酸上。

接下来,使用与待测序列互补的探针进行核酸杂交,通过探针与RNA的互补配对形成的杂交物质来检测目标RNA分子。

最后,将膜进行显影和成像,从而获得感兴趣的RNA片段的信息。

2. Southern blotting:该技术用于检测和分析DNA的存在和序列特性。

与Northern blotting相似,该方法也是将DNA样本经过电泳分离后转移到固定在膜上的核酸上。

然后,使用与目标DNA序列互补的探针进行核酸杂交,并通过探针与DNA的互补配对形成的杂交物质来检测目标DNA分子。

3. Fluorescence in situ hybridization (FISH):该技术是一种高分辨率的细胞遗传学方法,用于检测和定位特定DNA或RNA序列在细胞核中的位置。

这种方法使用标记了荧光染料的探针与待测核酸序列进行杂交,然后通过荧光显微镜观察荧光信号的分布情况,从而确定目标序列在细胞中的位置。

4. Hybridization chain reaction (HCR):该技术通过设计一组特定的序列探针,使其形成一个连锁反应,从而实现特定核酸序列的多重扩增。

这种方法可以用于检测特定的DNA或RNA序列,例如基因突变、病原体等,具有高灵敏度和高特异性。

5. DNA microarray:该技术基于DNA杂交原理,可以同时检测上千个DNA 序列。

首先,将多个探针序列固定在特定的载体上,与待测DNA样本进行核酸杂交。

然后通过检测与目标DNA杂交的标记物来确定样本中的目标DNA序列,从而分析样本中大量的DNA信息。

核酸分子杂交

核酸分子杂交

RNA提取
RNA变性电泳 印迹转移 预杂交 杂交
RNase 具有活性高,不 易灭活 抑制RNase活 性
所有的试剂和器皿都 必须进去除RNase 处理!!
变性处理:甲醛、乙二醛
破坏RNA二级结构
洗膜
放射自显影或化学显色
基本步骤
1. RNA经变性电泳完毕后,可立即将RNA转 移至硝酸纤维素滤膜上。 2. 将该杂交膜夹于两张滤纸中间,用真空烤箱 于80℃干燥0.5-2小时。 3. 预杂交,时间为1-2小时。 4. 杂交 过夜 5. 洗膜 6. 用X光片进行放射自显影,附加增感屏于70℃曝光24-48小时。

Northern 杂交与Southern 杂交很相似。主 要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变 性条件下进行,以去除RNA 中的二级结构, 保证RNA 完全按分子大小分离。

变性电泳主要有3 种:
甲醛变性电泳 乙二醛变性电泳
羟甲基汞变性电泳

电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern 转移相 同的方法将RNA 转移到硝酸纤维素滤膜上, 然后与探针杂交。
3. 屏蔽防护:利用射线通过物质时,与物 质相互作用使其能量被物质吸收而逐渐 减弱的原理,可以设置一定的屏障物来 进行防护。常用的材料有水、砖、大理 石、混凝土、重金属铅等。
32P
有机玻璃版 铅衣
4. 利用衰变:可利用放射性物质存在自发 衰变,其活性随之减少的原理进行外照 射防护。如:半衰期小于15天的放射性 废物,允许放置10个半衰期后作一般废 物处理。
注意事项 1. DNase I的量 2. dNTP a-P 3. 温度4-16℃
Pol I DNase I
两条链都可 被标记
随机引物合成法

核酸杂交技术的原理和应用

核酸杂交技术的原理和应用

核酸杂交技术的原理和应用介绍核酸杂交技术是一种利用互补配对原理来检测和分析核酸序列的重要技术。

它广泛应用于基因组学、遗传学、分子生物学和生物医学等领域。

本文将介绍核酸杂交技术的原理和应用,并通过列点方式详细解释。

核酸杂交技术的原理1.互补配对原理:核酸分子由碱基组成,DNA分子中的腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)以及鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)之间可以形成互补配对,RNA 分子中的腺嘌呤(A)和尿嘧啶(U)以及鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)之间也可以形成互补配对。

核酸杂交技术利用这种互补配对原理,根据核酸序列的互补性进行分析。

2.杂交反应:核酸杂交反应是指两条互补的核酸序列在合适的条件下发生结合。

在适当的盐浓度和温度下,核酸链会解开,使碱基的互补配对能够进行。

通过控制反应条件,可以选择性地使核酸链发生杂交反应,从而检测特定的核酸序列。

3.标记物的应用:核酸杂交技术通常需要使用标记物来检测杂交反应的结果。

常用的标记物包括放射性同位素、荧光染料和酶等。

这些标记物可以与杂交的核酸序列结合,通过测量标记物产生的放射性、荧光或酶活性变化来分析核酸杂交反应的结果。

核酸杂交技术的应用1.基因组学研究:核酸杂交技术在基因组学研究中发挥了重要作用。

通过杂交探针,可以检测到不同组织和生物体中的特定基因表达情况,从而深入研究基因调控网络和功能。

此外,核酸杂交技术还可以用于研究基因组的结构和变异。

2.遗传学分析:核酸杂交技术是遗传学分析的重要工具之一。

通过对不同个体的核酸序列进行杂交反应,可以检测到基因型差异和基因变异等关键信息。

这对于遗传性疾病的诊断和研究具有重要意义。

3.分子生物学研究:核酸杂交技术在分子生物学研究中也得到了广泛应用。

它可以用于检测、定位和分析特定核酸序列,从而揭示细胞和分子水平上的生物学过程。

例如,在研究基因表达调控、蛋白质合成和RNA修饰等方面,核酸杂交技术发挥了重要作用。

4.生物医学应用:核酸杂交技术在生物医学领域也有广泛的应用。

分子杂交技术

分子杂交技术

分子杂交技术引言分子杂交技术是一种重要的实验手段,在生物学和生物化学领域被广泛应用。

它通过将两个不同源的核酸序列(DNA或RNA)进行杂交,从而得到具有特定性质和功能的新分子。

在本文中,我们将介绍分子杂交技术的原理、应用和未来发展方向。

原理分子杂交技术主要基于核酸的互补配对原理。

DNA和RNA 分子中的碱基有互补配对性质,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)或尿嘧啶(U)互补配对,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)互补配对。

在杂交过程中,两个互补的核酸序列会通过碱基间的氢键相互结合,形成一个稳定的双链结构。

应用分子克隆分子杂交技术在分子克隆中起到至关重要的作用。

通过将目标基因的DNA序列与载体DNA进行杂交,可以实现基因的定向克隆。

例如,使用限制性内切酶将目标基因和载体DNA切割开后,通过杂交技术将两者粘合在一起,形成重组DNA,然后可以通过转化、转染等手段将重组DNA导入到宿主细胞中,实现基因的表达。

基因探针分子杂交技术也被广泛应用于基因探针的设计和制备。

基因探针是一种用于检测目标基因在细胞或组织中表达情况的分子工具。

通过将特异性的探针与目标基因进行杂交,可以实现对目标基因的检测和定位。

分子杂交技术可以用于制备放射性或非放射性的探针,例如荧光探针或生物素标记的探针,从而实现对目标基因的高灵敏度和高特异性的检测。

基因组分析分子杂交技术还可以用于基因组分析。

例如,通过杂交技术可以将特异性的探针与目标基因组中的特定区域进行杂交,从而实现对基因组的定位和映射。

此外,分子杂交技术还可以用于研究基因组中的DNA重复序列、非编码RNA等。

DNA鉴定分子杂交技术在DNA鉴定领域也有广泛的应用。

例如,通过杂交技术可以将可疑犯罪嫌疑人的DNA样本与现场留下的DNA样本进行比对,以确定是否属于同一人。

此外,分子杂交技术还可以用于亲子鉴定、物种鉴定等。

未来发展方向随着科技的不断发展,分子杂交技术也在不断更新和发展。

未来,我们可以预见以下几个方面的发展:1.高通量分子杂交技术的发展:随着高通量测序技术的发展,分子杂交技术可以与测序技术结合,实现对大规模样本的高效分析,从而推动基因组学、转录组学等领域的研究进展。

核酸杂交的分类原理应用

核酸杂交的分类原理应用

核酸杂交的分类、原理与应用1. 概述核酸杂交是一种重要的实验技术,广泛应用于生物学研究、医学诊断和药物开发等领域。

本文将介绍核酸杂交的分类、原理和应用。

2. 核酸杂交的分类核酸杂交可根据参与杂交的核酸类型进行分类,主要分为DNA-DNA杂交和RNA-DNA杂交。

2.1 DNA-DNA杂交DNA-DNA杂交是指两个DNA分子之间通过互补配对形成双链结构。

该杂交形式常用于寻找基因的同源序列,基因组比较和分子进化研究等。

2.2 RNA-DNA杂交RNA-DNA杂交是指RNA与DNA之间通过互补配对形成双链结构。

该杂交形式在分子生物学研究中被广泛应用,如转录研究、RNA定位和疾病诊断等。

3. 核酸杂交的原理核酸杂交的原理主要基于碱基互补配对,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)之间形成两个氢键,鸟嘌呤(G)与胸腺嘧啶(C)之间形成三个氢键。

通过这样的配对规则,能够确定两个互补的核酸序列之间的配对位置,进而形成双链结构。

4. 核酸杂交的应用4.1 基因组分析核酸杂交技术在基因组分析中被广泛应用。

例如,荧光原位杂交(FISH)技术利用互补的探针标记目标基因或染色体区域,能够帮助研究者确定某一基因的位置和拷贝数变异等。

4.2 基因表达分析核酸杂交技术在基因表达分析中起着重要的作用。

例如,Northern blotting能够通过与目标RNA互补的DNA探针检测特定的mRNA转录水平,帮助研究者了解基因的表达模式。

4.3 分子诊断核酸杂交技术在分子诊断中有着广泛的应用。

例如,DNA杂交检测(Southern blotting)可用于检测病原体的核酸,如病毒、细菌和寄生虫等。

此外,核酸杂交还可以用于检测遗传性疾病的突变和新型病毒的鉴定等。

4.4 药物研发核酸杂交技术在药物研发中扮演着重要角色。

例如,RNA干扰(RNA interference)利用RNA杂交分子诱导特定基因的沉默,为研发基于RNA干扰的药物提供了理论基础。

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核酸的分子杂交技术及其应用1概述核酸的分子杂交(molecular hybridization)技术是目前生物化学和分子生物学研究中应用最广泛的技术之一,是定性或定量检测特异RNA或DNA序列片段的有力工具。

它是利用核酸分子的碱基互补原则而发展起来的。

在碱性环境中加热或加入变性剂等条件下,双链DNA之间的氢键被破坏(变性),双链解开成两条单链。

这时加入异源的DNA或RNA(单链)并在一定离子强度和温度下保温(复性),若异源DNA或RNA之间的某些区域有互补的碱基序列,则在复性时可形成杂交的核酸分子。

在进行分子杂交技术时,要用一种预先分离纯化的已知RNA或DNA序列片段去检测未知的核酸样品。

作为检测工具用的已知RNA或DNA序列片段称为杂交探针(probe)。

它常常用放射性同位素来标记。

虽然核酸分子杂交技术的应用仅有二十多年的历史,但它在核酸的结构和功能的研究中作出了重要贡献,在基因的表达调控和物种的亲缘关系研究中也发挥重要作用。

而且,随着核酸探针制备及标记技术的丰富和完善以及以不同材料为支持物的固相杂交技术的发展,使核酸分子杂交技术在分子生物学领域中的应用更加广泛。

这里我们将就分子杂交技术的几个主要过程及其应用进行介绍。

2核酸探针的制备核酸分子杂交的灵敏性主要依赖杂交探针的放射性比活度。

比活度高就可提高反应的灵敏性,减少待测样品的用量。

目前一般所用的是体外标记,这里介绍几种最常用的方法:2.1DNA的切口平移双链DNA分子的一条链有切口时,大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ可把核苷酸残基加到切口处的3’端,同时由于此酶具有5’→3’外切核酸酶活性,它还可从5’端除去核苷酸。

这样5’端核苷酸的去除与3’端核苷酸的加入同时进行,导致切口沿着DNA链移动,称切口平移(nicktranslation)。

常用于在双链DNA 上打开切口的酶为胰DNA酶Ⅰ。

由于高放射性比活度的核苷酸置换了原有核苷酸,就有可能制备比活度大于108计数/(分.μg)的32P标记的DNA探针。

2.2单链DNA探针的制备与传统的双链探针相比,单链探针由于不存在互补链,因此可以消除由探针的两条链重退火形成无效杂交体的可能。

最常用的是以M13噬菌体载体合成单链DNA探针的方法。

其主要原理是用人工合成的寡核苷酸引物(其序列与载体上固定区段的序列相互补。

可从生物试剂公司直接购买)与来自重组M13噬菌体的单链DNA退火,然后以此寡核苷酸作为引物在大肠杆菌DNA聚合酶ⅠKlenow大片段催化下合成互补的放射性标记DNA。

2.3单链RNA探针的制备首先将感兴趣的DNA序列到带有SP6噬菌体或T7及T3噬菌体的启动子的重组载体质粒中。

由于这些重组质粒带有的强启动子能被噬菌体的依赖DNA的RNA聚合酶所识别。

因此,当把线状质粒与适当的依赖DNA的RNA聚合酶及4种rNTP(核糖核苷三磷酸)在体外混合并温育时,就可在噬菌体启动子处开始合成RNA。

单链RNA探针除具有单链DNA探针的优点之外,还具有:①合成效果高(模板可反复被转录);②用DNA酶Ⅰ处理就可容易除去RNA探针中的模板DNA,而无需用凝胶电泳纯化;③RNA杂交体稳定性高,所以探针在杂交反应中产生的信号较DNA探针强,等优点。

3杂交膜的准备核酸的分子杂交可分成液相杂交和固相杂交两大类。

液相杂交是将待检测的核酸样品和同位素标记的杂交探针同时溶于杂交液中进行反应,然后分离杂交双链和未参加反应的探针,用仪器计数并通过计数分析杂交结果。

固相杂交是把欲检测的核酸样品先结合到某种固相支持物上,再与溶解于溶液中的杂交探针进行反应,杂交结果可用仪器进行检测,但大多数情况下直接进行放射自显影,然后根据自显影图谱分析杂交结果。

目前,固相杂交技术的发展较快,而且应用范围更为广泛。

目前使用最多的固相支持物是硝酸纤维素(NC)膜。

它对单链DNA有较强的吸附作用。

RNA经过一些特殊变性剂处理后,也能较容易地结合到NC膜上。

下面介绍固相杂交反应中常用的几种将核酸样品转移到膜上的方法。

3.1点印迹的直接点样法(Dot blotting)这是一种能快速而且简便地检测样品中微量核酸的常用技术。

其方法主要是将待测样品直接在NC膜上,然后进行杂交检测。

其主要过程包括膜的处理、点样、变性、中和、干燥固定以及变性剂去除(检测RNA法)等。

3.2DNA转移(Southern blotting)用于点印迹的DNA直接点样法具简单、快速、灵敏度高等优点,但不能确定特异DNA序列的大小和定位。

1975年Southern氏建立了吸附转移法硝酸纤维素膜杂交。

其主要原理是利用滤纸对水的毛细管吸附作用,将经限制酶酶切及琼脂糖凝胶电泳分离的的DNA片段转移到固相杂交膜上,此时的DNA 片段还保留着原来凝胶中的分布图式。

然后再用探针进行杂交。

3.3RNA转移(Northern blotting)这是在Southern blot的基础上发展的RNA固相杂交技术,其因两技术相类似而得名。

其方法与Southernblot一样。

但RNA需先经乙二醛等变性剂处理后,再于合适的条件下电泳,这样便能使充分变性的RNA像变性DNA一样直接转移到NC膜上。

固定之后除去变性剂,再进行杂交,可大大提高杂交的敏感性,每条区带所需的RNA量可从500pg降低到1pg以下。

此外,由于有时需要分离的核酸样品分子量很小,用琼脂糖凝胶不能达到要求的分辨率。

这种情况下往往需要聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)进行分离,而由于这种胶的孔经较小,用前述的吸印转移法转移速度缓慢,易造成转移不完全。

为了解决之一问题,发展了电泳转移法。

即以电泳的方法使分离后的待测核酸样品从凝胶转移到NC膜或DBM纸等固相支持物上,再进行杂交。

3.4用于原位杂交的菌落转移在基因克隆操作中,为了在众多转化菌落中筛选带有目的基因的重组,常用的方法是用标记的探针通过原位杂交找出带有互补序列的目的基因。

主要步骤包括长好菌落、制膜、NC膜上菌落的裂解及膜上核酸的固定等。

4固相杂交反应核酸样品经直接点样或转移到NC膜上并经真空干燥后,即进行杂交反应。

在杂交液中,NC膜上变性核酸样品与变性后的标记探针在一定条件下形成杂交双链,然后通过仪器计数或放射自显影判定结果。

主要步骤如下。

4.1预杂交目的在于消除NC膜对探针的非特异性结合,降低杂交背景。

将膜在2×SSC中浸泡2分钟。

然后将膜放入盛有预杂交液[6×SSC、0.05×BLOTTO(1×BLOTTO:5%脱脂奶粉。

含0.02%叠氮钠)]的杂交管中,于68℃杂交炉中温育1~2hr。

4.2杂交将32P标记的双链DNA探针100℃加热5分钟变性,迅速置冰浴中冷却。

然后加入预杂交液中混匀,于68℃下杂交16~18小时。

4.3洗膜将膜置于大体积2×SSC和0.1%SDS溶液中,于室温下轻轻振摇5分钟,反复2次。

又于68℃下用1×SSC和0.1%SDS溶液洗2次,约1~1.5小时。

4.4放射自显影将膜在纸巾上凉干,用Saron膜(或冰箱保鲜膜和微波炉用膜)将NC膜做成一夹心包装,用放射性墨水制作的圆点标签在Saron膜上作几个不对称的标记。

然后置X光片暗盒中,黑暗下加X光片并加增感屏于-20℃或-70℃下曝光12~16小时。

X光底片经显影、定影及冲洗后,利用放射性墨水留下的标记对准NC膜与底片的位置,并与凝胶电泳相片或菌落主板相对比,鉴定阳性核酸带或菌落。

5分子杂交技术的应用Southern印迹技术用来检查DNA样品中是否存在有某个特定的基因,特异性非常高,而且还可知道其大小及酶切位点的分布,尽管其操作比较复杂;Northern印迹技术则用来检查中某个特定的基因是否得到转录;点印迹则仅需要一滴液体的样品,就可快捷地检查出其中是否有某个基因,但不能检出基因的大小或重复的程度;菌落原位杂交技术则是基因克隆中,从众多克隆中快速筛选出阳性的最常用的一种方法。

V.Davis(1990)通过病毒的随机引物逆转录制备了IBDV的互补DNA探针。

在点印迹中,探针不能区分病毒的疫苗株、田间株以及突变株,但在很严格的条件下也可获得一些特异性。

V.Vakharia用按澳大利亚IBDV序列合成的引物以及pGEM系统,制备了已知起始位点的。

将从Delaware E株、Grayson株和STC标准毒株获得的RNA从琼脂糖凝胶转移到膜上并用放射性标记的探针检查。

只需1小时的放射自显影。

但探针不能区分病毒的不同毒株。

他用非放射性的地高辛配基系统也获得了好的杂交结果。

Shaohua Zhao等(1990)通过将滑液膜支原体(MS)的WVU1853株克隆到质粒载体pUC18上,并用大肠杆菌转化,构建了MS的基因文库。

在点印迹中,4个转化的克隆与放射性磷标记的MS染色体DNA杂交,但与MGS6株的染色体DNA则没有杂交。

在Southern印迹中,所有氯化铯纯提的重组质粒都含有2个长度在1.0~2.3kbp的MSDNA片段。

用4个重组质粒制备的探针在点印迹中与MS的WVU1853株和9个田间株均可杂交,但与MG及禽支原体其它15个种均无杂交。

M.L.Khan等已制成用来区分MG致病株和疫苗株的DNA探针。

对于MG感染的快速诊断,他将株和种特异性的DNA探针直接应用在田间样品的点印迹检测上。

将1毫升的样品培养液吸到膜上,然后用探针检查。

株特异性的探针具有与MG疫苗株相同的、长度为6kbp的基因序列,它能特异性地检出经MGF株苗免疫的鸡群。

种特异性的探针含有1个9kbp的插入片段,它可检测出所有的MG,而与其它的鸟类支原体则无交叉杂交。

M.Jenkins用Southern印迹来研究球虫的基因表达、基因的构成以及它们在球虫不同种的分布。

能特异性地鉴别球虫特定的发育阶段的探针也已制备。

此外,还研制出了以诊断为目的、具有种特异性的其它探针。

K.S.Henderson等(1990)通过点印迹法,用cDNA探针来检测感染鸡体内的IBDV抗原,并用琼脂扩散试验和免疫荧光试验来作比较。

结果用后两种方法在接种病毒2天后即可从鸡的组织中检出病毒抗原,检出的持续时间分别为3天和4天。

而用点印迹法在接种病毒后1天即可检出病毒抗原并且在整个试验期里(24天)均可检出。

这表明点印迹法比其它两种方法都敏感。

K.P.Snipes等(1990)应用REA及Southern印迹法可将分离自火鸡的多杀性巴氏杆菌的疫苗株(M9)和致病株相鉴别,尽管两者在血清型或荚膜型、生化特征、抗药性、全细胞蛋白的PAGE图以及质粒的内容等方面完全相同。

为禽霍乱流行病学研究提供很有用的工具。

除上述这些应用之外,分子杂交技术还可用于进行细胞原位杂交。

此项技术是在保持细胞,甚至单个染色体形态的情况下,检查细胞内某些基因位置的一种有效的分子工具。

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