质谱仪鉴定细菌的流程
益生菌检验的检测方法

益生菌检验的检测方法益生菌的检验方法通常包括培养法、PCR法、酶联免疫吸附法(ELISA)、质谱法等。
以下是关于益生菌检验的50条方法及详细描述:1. 培养法:益生菌可以通过在富含营养物质的琼脂培养基中进行培养,观察生长情况和菌落形态来进行定性和定量分析。
2. PCR法:通过聚合酶链式反应(PCR)对DNA进行扩增,然后使用特定基因序列的引物进行检测,可以快速准确地检测益生菌。
3. 酶联免疫吸附法(ELISA):利用益生菌表面的特定蛋白质进行ELISA检测,可以快速检测益生菌的存在和浓度。
4. 质谱法:利用质谱仪对益生菌进行分析,可以确定其分子量和结构,也可以用于鉴定益生菌的种属。
5. 荧光定量PCR法:利用特定的引物和荧光探针对益生菌的DNA进行扩增和检测,可以实现对益生菌的高灵敏度和定量测定。
6. 基因芯片技术:使用特定的基因芯片对益生菌进行检测,可以实现对多种益生菌的同时检测和鉴定。
7. 流式细胞术:利用流式细胞仪对益生菌进行流式细胞术分析,可以实现高通量的益生菌检测和鉴定。
8. 微生物电极法:利用微生物电极对益生菌进行电化学检测,可以实现对益生菌的迅速检测和定量分析。
9. 蛋白质质谱法:通过蛋白质质谱技术对益生菌进行蛋白质组学分析,可以揭示益生菌的代谢途径和功能。
10. 生物传感器技术:利用生物传感器对益生菌进行检测,可以实现对益生菌的实时监测和分析。
11. 纳米生物传感器技术:使用纳米技术和生物传感器对益生菌进行检测,可以实现对益生菌的高灵敏度和快速检测。
12. 毛细管电泳技术:利用毛细管电泳对益生菌进行检测,可以实现对益生菌的分离和鉴定。
13. 核磁共振技术:利用核磁共振技术对益生菌进行分析,可以揭示益生菌的结构和代谢情况。
14. 高效液相色谱技术:利用高效液相色谱技术对益生菌进行检测,可以实现对益生菌的成分和浓度的分析。
15. 荧光显微镜技术:利用荧光显微镜对益生菌进行观察和检测,可以实现对益生菌的生长和形态的分析。
质谱在微生物检验方面的应用201512

基质辅助激光解吸电离
三、MALDI Biotyper工作流程
直接涂抹法 (direct transfer ) 单一菌种 (Pure culture)
90-95% 以上的常规样品
涂抹单一菌落于样品盘上
(Single colony on MALDI )Target
可于此制备法得到鉴定结果
加上 1 μl 基质溶液
毛霉属:无匍匐菌丝与假根,囊轴呈鼓槌状
根霉属:有匍匐菌丝与假根,孢囊梗与假根对生,囊轴呈 雨伞状
m/z 4364,33 5095,82 5380,39 6255,39 6315,19 6410,60 7157,74 7273,45 7871,06 8368,76
5380.64
6315.49
6254.64
7870.62
1000
0 4000 4500 5000 5500 6000 6500 7000 7500 8000
谁 把 你 的 长 发 盘 起
谁 安 慰 爱 哭 的 你
谁 娶 了 多 愁 善 感 的 你
烟曲霉
土曲霉的“莫西干发型”
茄病镰刀菌 菌落颜色 大分生孢子 小分生孢子 瓶梗类型 厚壁孢子 大分生孢子 白、浅黄、淡兰 较多,粗壮 假头状着生 简单瓶梗,瓶梗 较长 有
串珠镰刀菌 浅紫、淡粉、白 较少,披针形, 细长 串状,假头状着 生 简单瓶梗 无
Who are you?!
理 数 微 生 物 显 示 很 少 的 形 态 学 特 征 !
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Selective media plating/biochemical tests 生化测试 Pulsed field gel electrophoresis (PFGE)脉冲场凝胶电泳 PCR based detection (several) 基于聚合酶技术的检测方法 Microarrays/FISH hybridization/fluorescence microscopy 核酸探针 RiboPrinter DNA杂交 FT-IR 红外光谱 FAME (fatty acid methyl ester) GC-MS细胞脂肪酸甲基酯
完整蛋白质谱检测方法

完整蛋白质谱检测方法
完整蛋白质谱检测方法是一种用于分析和鉴定蛋白质的技术,可以确定蛋白质的氨基酸序列、质量、结构和修饰等信息。
下面是完整蛋白质质谱检测方法的一般步骤:
1. 样品制备:首先,需要纯化或富集感兴趣的蛋白质样品。
这可能包括细菌、真核生物或人类来源的蛋白质。
可以使用各种技术,如电泳、层析和亲和纯化来纯化样品。
2. 消化蛋白质:将样品中的蛋白质用特定的酶进行消化。
常用的酶有胰蛋白酶、Trypsin等。
消化后的蛋白质释放出肽段。
3. 质谱分析:利用质谱仪进行分析。
常用的是液相色谱质谱联用技术(LC-MS/MS)。
样品中的肽段通过液相色谱分离,并进入质谱仪进行质谱分析。
4. 数据分析及鉴定:通过质谱数据进行鉴定和定量分析。
将获得的谱图与数据库中存在的谱图进行比对,以确定蛋白质的身份和氨基酸序列。
这可以利用数据库搜索算法,如Mascot、SEQUEST等。
5. 结果解释和验证:根据质谱分析的结果,解释蛋白质的结构、质量和修饰情况。
这可以包括研究蛋白质的功能、相互作用和代谢途径等。
完整蛋白质谱检测方法可以广泛应用于生物医学研究、药物开发、疾病诊断和治疗等领域。
maldi-tof-m 鉴定菌株的流程

maldi-tof-m 鉴定菌株的流程
MALDI-TOF-MS (Maldi-Time of Flight-Mass Spectrometry, 耐
抗谱分)
实验材料:
- MALDI-TOF-MS设备
- 培养菌株
- 甲醇
- 三氟乙酸
- 培养基
实验流程:
1. 培养菌株:将需要鉴定的菌株在适当的培养基上进行培养。
2. 菌株处理:从培养基上选择一个单纯的菌落,用无菌平片将其转移到一个干净的Eppendorf管中。
3. 菌株提取:在Eppendorf管中加入少量甲醇和三氟乙酸溶液,使用涡旋混匀片刻,使菌细胞充分裂解释放出内部物质。
4. 预处理:将混匀后的细胞提取液转移到MALDI-TOF-MS设
备的样品板上,并将其蒸发至干燥。
5. 涂覆基质:在样品板上加上MALDI基质(常用的基质有辛
基环磷酸、α-环磷酸、环蛋白等),使其充分覆盖菌株提取液。
6. 激光照射:将样品板放入MALDI-TOF-MS设备中,通过激
光照射基质,产生离子,使菌株提取物中的分子离子化。
7. 飞行时间质谱:离子化的分子通过飞行时间质谱仪进行分析,根据不同分子的质量与飞行时间的对应关系,得到质谱图。
8. 数据分析:将质谱图与已知数据库中的菌株质谱图进行比对,使用专门的软件进行数据分析,确定菌株的种属或进行进一步
分析。
注意事项:
- 携带手套和其他必要的个人防护装备,以避免可能的细菌感染。
- 确保所有使用的材料都是无菌的,防止污染和交叉感染。
- 在进行质谱分析之前,确保MALDI-TOF-MS设备的正常运行和校准。
微生物质谱仪操作流程

微生物质谱仪操作流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。
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微生物三级报告流程

微生物三级报告流程
微生物三级报告流程如下:
1. 微生物实验室接收血液、骨髓等标本后,将血培养瓶送至微生物室进行培养和检测。
2. 如果血培养仪检测到有微生物生长,将立即报警提示。
工作人员取出报阳的血培养瓶,抽取培养物进行革兰染色。
革兰染色结果在1小时内作为初次鉴定(初鉴)结果进行报告,即血培养一级报告(危急值)。
3. 同时,接种平板进行分离培养,目的是获得单个菌落用于后续菌种鉴定和药敏试验。
4. 一般细菌培养大多需十余小时,长出菌落后,通过微生物质谱检测方法进行菌种鉴定,菌种报告为血培养二级报告(本实验室暂未进行二级报告)。
5. 鉴定后根据细菌种类进行相应的抗生素药敏试验,结果需要8-24小时,菌种及药敏结果为血培养的三级报告。
以上是微生物三级报告流程的简单介绍,建议查阅相关文献获取更详细的信息。
分子生物学鉴定细菌的方法具体操作步骤与注意事项

16S rDNA鉴定细菌的方法细菌16S rDNA鉴定主要分为7个部分:1.提取细菌基因组DNA,2.设计/选择引物进行PCR扩增,电泳检测纯度与大小。
3.琼脂糖凝胶电泳分离4.胶回收目的片段5.目的片段测序。
6.BLAST比对获取相似片段。
7.构建系统进化树试剂:1、培养基:通常选择组分简单且细菌生长良好的培养基(培养基组分过于复杂会影响DNA 的提取效果,也可以在裂解细菌前用TE缓冲液对菌体进行洗涤。
)。
2、1M Tris-HCl (pH7.4, 7.6, 8.0)(1L):121.1g Tris,加浓盐酸约(70ml, 60ml, 42ml),高温高盐灭菌后,室温保存。
冷却到室温后调pH,每升高1℃,pH大约下降0.03个单位。
3、0.5M EDTA(pH8.0)(1L):186.1g Na2EDTA•2H2O,用NaOH调pH至8.0(约20g),高温高压灭菌,室温保存。
4、10×TE Buffer(pH7.4,7.6,8.0)(1L):组分:100 mM Tris-HCl,10 mM EDTA。
1M Tris-HCl (pH7.4,7.6,8.0)取100ml,0.5M EDTA(pH8.0)取20ml。
高温高压灭菌,室温保存。
1×TE Buffer用10×TE Buffer稀释10倍即可。
5、10%SDS(W/V):称10g,68℃加热溶解,用浓盐酸调pH至7.2。
室温保存。
用之前在65℃溶解。
配置时要戴口罩。
6、5M NaCl:称292.2gNaCl,高温高压灭菌,4℃保存。
7、CTAB/NaCl(10%CTAB,0.7M NaCl):溶解4.1g NaCl,加10g CTAB(十六烷基三甲基溴化铵),加热搅拌。
用之前在65℃溶解。
8、氯仿/异戊醇:按氯仿:异戊醇=24:1(V/V)的比例加入异戊醇。
9、酚/氯仿/异戊醇(25:24:1):按苯酚与氯仿/异戊醇=1:1的比例混合Tris-HCl平衡苯酚与氯仿/异戊醇。
安图细菌质谱仪1000使用说明书

安图细菌质谱仪1000使用说明书
分离和检测不同同位素的仪器。
安图细菌质谱仪的主要装置放在真空中。
将物质气化、电离成离子束,经电压加速和聚焦,然后通过磁场电场区,不同质量的离子受到磁场电场的偏转不同,聚焦在不同的位置,从而获得不同同位素的质量谱。
质谱方法最早于1913年由J.J.汤姆孙确定,以后经 F.W.阿斯顿等人改进完善。
现代质谱仪经过不断改进,仍然利用电磁学原理,使离子束按荷质比分离。
质谱仪的性能指标是它的分辨率,如果质谱仪恰能分辨质量m和m+Δm,分辨率定义为m/Δm。
现代质谱仪的分辨率达 105 ~106 量级,可测量原子质量精确到小数点后7位数字。
安图细菌质谱仪最重要的应用是分离同位素并测定它们的原子质量及相对丰度。
测定原子质量的精度超过化学测量方法,大约2/3以上的原子的精确质量是用质谱方法测定的。
由于质量和能量的当量关系,由此可得到有关核结构与核结合能的知识。
对于可通过矿石中提取的放射性衰变产物元素的分析测量,可确定矿石的地质年代。
质谱方法还可用于有机化学分析,特别是微量杂质分析,测量分子的分子量,为确定化合物的分子式和分子结构提供可靠的依据。
由于化合物有着像指纹一样的独特质谱,安图细菌质谱仪在工业生产中也得到广泛应用。
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质谱仪鉴定细菌的流程
使用质谱仪鉴定细菌的流程:(1)菌株分离与筛选:将样品的微生物中进
行培养、筛选,从而获取未知微生物的菌株;(2)DNA提取:将筛选出
的菌株进行扩增或者提取细菌的DNA,以供分子鉴定细菌株;(3)质谱
仪质量分析:将提取的DNA或者RNA分别通过液相、气相色谱,再
利用质谱仪进行质量分析,形成细菌的质量谱;(4)特异性标记与对比:采用特异性标记物,以及细菌库中有关质量谱进行比对;(5)质量谱分
析与结果判断:将质量谱和有关质量谱进行分析,以确定鉴定出的细
菌类型及部分比较;(6)结果验证:将质谱仪鉴定得到的细菌名称和细
菌培养、鉴定的结果进行对比验证,以确保细菌的类型正确性。
使用质谱仪鉴定细菌的流程:
(1)菌株分离与筛选:我们首先从检测样品中分离微生物株,将其培养、杂菌混合等进行筛选,然后获取未知微生物株;
(2) DNA提取:采用扩增或者提取了染色体内的DNA,再进行分子鉴
定菌株,以便质谱仪的质量分析;
(3)质谱仪质量分析:将提取的DNA或RNA经过液相和气相色谱分离,再利用质谱仪进行质量分析,形成待测细菌的质量谱;
(4)特异性标记与对比:利用特异性标记物,与细菌库中有关质量谱进行比对,以辅助对确定待测细菌的种类;
(5)质量谱分析与结果判断:利用微生物种间质量差异特性,考察质量谱,以确定待测细菌类型以及部分比较;
(6)结果验证:通过与细菌培养鉴定的结果对比验证,来确保质谱仪鉴定出的细菌类型是正确的。