质粒DNA的提取实验
质粒dna的提取实验报告

质粒dna的提取实验报告质粒DNA的提取实验报告引言:DNA提取是分子生物学研究中的基础实验之一,通过提取DNA可以进一步进行PCR扩增、基因克隆等实验。
本实验旨在提取质粒DNA,质粒DNA是存在于细菌细胞质中的环状DNA分子,具有重要的研究价值。
本文将详细介绍实验的步骤、原理以及结果分析。
材料与方法:1. 细菌培养液:选择含有目标质粒的细菌进行培养,如大肠杆菌。
2. 细菌培养基:选择适宜的培养基,如LB培养基。
3. 细菌培养器具:如培养皿、离心管等。
4. DNA提取试剂盒:选择适合的DNA提取试剂盒,如酚/氯仿法或硅胶柱法。
5. 离心机:用于离心细菌培养液以获取细菌沉淀。
6. 紫外可见分光光度计:用于检测DNA的纯度和浓度。
实验步骤:1. 细菌培养:将含有目标质粒的细菌接种于LB培养基中,培养过夜,使细菌充分繁殖。
2. 收集细菌:将培养液离心,以12000转/分钟离心10分钟,将细菌沉淀收集。
3. 细胞裂解:加入适量的细胞裂解缓冲液,使细菌细胞裂解,释放DNA。
4. 蛋白质沉淀:加入酚/氯仿混合液,离心分离上层的DNA溶液和下层的蛋白质。
5. DNA沉淀:将DNA溶液转移至新的离心管中,加入等体积的冷乙醇,轻轻倒置离心管,使DNA沉淀出来。
6. DNA洗涤:用70%的乙醇洗涤DNA沉淀,去除残余的盐和杂质。
7. DNA溶解:用适量的去离子水溶解DNA沉淀,得到纯净的DNA溶液。
8. DNA浓度检测:用紫外可见分光光度计检测DNA的浓度和纯度。
结果与分析:通过实验,成功提取了质粒DNA,并进行了浓度检测。
根据实验结果,我们可以得到DNA的浓度和纯度信息,这对于后续的实验设计和操作非常重要。
此外,实验中还可以通过凝胶电泳等方法对提取的DNA进行进一步的分析,如确定DNA的大小和完整性。
结论:本实验成功提取了质粒DNA,并获得了纯净的DNA溶液。
通过浓度检测和进一步的分析,我们可以进一步了解DNA的特性和应用。
实验四 质粒DNA的提取

实验四质粒DNA的提取、电泳检测和酶切一、实验目的学会用碱裂解法小量制备质粒DNA。
二、实验原理质粒DNA是存在于细菌中的环状小分子DNA,不同于长链大分子的基因组DNA,游离于细胞质中。
由于细胞中的RNA可以被降解,大分子DNA可与细胞碎片一起沉淀而与质粒DNA分离。
质粒DNA的提取常用碱裂解法、煮沸法、SDS法、Triton-溶菌酶法等,其中以碱裂解法最为常用。
本方法有质粒DNA产量高、快速等优点。
其原理为:在碱性溶液中,双链DNA氢键断裂,DNA双螺旋结构遭破坏而发生变性,但由于质粒DNA分子量相对较小,且呈环状超螺旋结构,即使在高碱性pH条件下,两条互补链也不会充分分离,当加入中和缓冲液调时,染色体线性DNA和或有缺口的质粒DNA变性后双链分离,难以复性而形成缠绕的结构,与蛋白质—SDS复合物结合在一起;当K+取代Na+时,生成不溶的PDS, 这些复合物从溶液中沉淀下来。
通过离心沉淀,细胞碎片、染色体DNA及大部分蛋白质可被除去,而质粒DNA及小分子量的RNA则留在上清液中。
混杂的RNA可用RNA酶(RNAase)消除。
再用酚/氯仿处理,可去除残留蛋白质。
三、实验材料含有质粒pUC19的大肠杆菌菌株DH5a。
四、实验器具、药品试剂A、实验材料:•DH5a受体菌•pUC19B、实验仪器•高压灭菌锅•超净工作台•恒温摇床取•台式离心机(冷冻或非冷冻式)•旋涡振荡器•电泳仪•凝胶成像系统•培养用试管•量筒•冰盒•微量取液器(2ul,20ul,150ul,1000ul)•吸管头若干(2ul,20ul,150ul,1000ul)•EP管若干•一次性手套若干C、溶液药品:•LB培养基•氨苄青霉素(Amp,100 mg/ml)•20%SDS• 4 M NaOH•3M NaAc (pH5.2)•异丙醇•TE缓冲液(pH8.0)•RNAase A(10 mg/ml)•70%乙醇•无水乙醇•75%乙醇,•NEB 标准分子量片段(1kb DNA Ladder),•Eco R I及Dra I(Dra II?)限制性核酸内切酶(TaKaRa),•Eco RI酶解缓冲液(10×H buffer)•10%琼脂糖•电泳缓冲液•EB染色液•溶液I-GET缓冲液:50 mmol/L葡萄糖,10 mmol/L EDTA,25 mMTris-HCl pH8.0。
质粒dna提取实验报告

质粒dna提取实验报告实验目的:本实验旨在通过提取细菌质粒DNA,了解细菌质粒的结构、基因组成和使用纯度较高的质粒DNA的重要性,为后续分子生物学实验打下基础。
实验器材:- 细菌- LB液体培养基- 1.5mL微量离心管- 离心机- 动态温度水浴仪- 恒温振荡器- 超声波清洗器- 洁净平台和无菌技术用品- 始终细切割刀和取样刷- 蒸馏水、2% SDS、醋酸铵、90%乙醇、异丙醇和干燥机实验步骤:1. 制备细菌:在LB液体培养基中培养要提取质粒DNA的细菌,由于质粒DNA在对数生长期达到最高含量,因此在显微镜下观察到对数生长期的细菌时进行取样。
2. 细胞打破和溶解质粒:离心细胞,倒去培养基,加入10mL蒸馏水,用振荡器在4℃下以300rpm摇晃3小时。
然后沉淀细胞,在70℃下干燥30分钟。
随后加入150μL1%SDS和其他化学试剂混合物,使用至少15次的起始细切割刀切成绒毛状的颗粒,浸泡在低盐度醋酸铵中2小时以上。
3. 质粒DNA纯化:将浸泡了细菌绒毛颗粒的混合物离心,抽取上清液,将其加入2x体积的异丙醇与等体积的75%,然后用再生明胶抑制蛋白质在异丙醇中凝聚。
离心,除去异丙醇上清液,加入70%乙醇洗涤。
最后用干燥机吸干。
4. 质量分析:分析提取到的质粒DNA的浓度和纯度,使用分光光度计对其进行光谱分析,以检测质粒DNA的A260/A280比例和A260/A230比例。
通过比较纯度,然后将质粒DNA冻保存至-20℃或-80℃。
实验结论:本实验成功提取了细菌的质粒DNA,并进行了纯化和分析。
质粒DNA的提取和纯化是基于一系列物理和化学方法和技术的,实际操作中需要仔细操作,耐心等待,严格注意洁净操作,才能达到最佳的提取和纯化效果。
通过本实验,我进一步了解了在分子生物学和遗传学中质粒DNA的重要性,它可适用于多种研究项目和应用,例如质粒克隆、基因编辑、基因表达、和质粒蛋白质互作等。
质粒dna的提取

质粒DNA的提取1. 引言质粒DNA提取是在分子生物学研究中常用的实验操作之一。
质粒是一类圆环状的DNA分子,存在于原核生物中。
质粒DNA提取的目的是为了获取纯度高的DNA样品,以便进行后续的实验操作,如聚合酶链式反应(PCR)、限制性酶切、测序等。
2. 实验材料在进行质粒DNA提取实验前,需要准备以下实验材料:•细菌培养液:含有所需质粒的培养液。
•碱裂解液:用于裂解细胞并释放质粒DNA的实验液。
•高盐含量的溶液:用于提取DNA。
•蛋白酶K:用于消化蛋白质。
•硅胶粉末:用于吸附DNA。
•乙醇:用于沉淀DNA。
•TE缓冲液:用于溶解和储存提取的质粒DNA。
3. 实验步骤3.1 细菌培养与收获首先,需进行细菌培养和收获,以获取含有所需质粒的培养液。
培养液中的细菌应为含有目标质粒的菌株,如大肠杆菌。
3.2 细胞破碎与质粒DNA释放将收获的细菌培养液进行离心,去除培养液并沉淀细胞。
然后将细胞重悬于碱裂解液中,用震荡器在适当的温度和时间条件下裂解细胞,释放质粒DNA。
3.3 蛋白质消化为了去除细胞中的蛋白质,加入适量的蛋白酶K,进行蛋白消化。
消化的时间和温度应根据实验要求进行调整。
蛋白消化完成后,通过离心将蛋白质沉淀分离。
3.4 DNA提取将消化液中的DNA溶液转移到其它离心管中,并加入高盐含量的溶液。
通过离心将DNA与其他杂质分离。
此步骤中,DNA会被溶液中的硅胶粉末吸附,以去除杂质。
3.5 DNA沉淀将去除杂质的DNA溶液转移到新的离心管中,加入冰冷的乙醇。
通过离心,将沉淀的DNA分离出来。
注意,在沉淀过程中,应避免DNA的过度离心,以免损坏DNA分子。
3.6 DNA溶解和储存将DNA沉淀后,溶解在适量的TE缓冲液中。
TE缓冲液具有适当的pH值和离子浓度,能够稳定DNA分子,并提供良好的保存条件。
4. 实验注意事项在质粒DNA提取实验中,需要注意以下几点:•操作过程应严格遵守无菌操作,避免外源性DNA的污染。
质粒DNA的提取实验报告

质粒DNA的提取一、实验方法碱裂解法抽提质粒DNA二、实验原理基于质粒DNA与染色体DNA变性与复性的差异。
三、实验步骤1)质粒提取1. 10,000g,1min离心收集1.5-5ml菌液沉淀于1.5ml离心管中。
2. 加入100μl溶液1,振荡至彻底悬浮。
3. 加入200μl溶液2,立即轻柔颠倒离心管6次,使菌体充分裂解,随后将离心管冰上放置3分钟4. 加入150μl溶液3,立即温和颠倒离心管数次,冰上放置3分钟,10,000g离心10min。
5. 将步骤4的上清转移至新的离心管(尽量去除杂质),加入等体积的苯酚/氯仿/异戊醇混合均匀10,000g离心5min。
6. 将步骤5的上清转移至新的离心管,加入2倍体积的无水乙醇,室温放置5-10min,沉降DNA7. 10,000g离心10分钟,弃乙醇,保留沉淀,加入1ml 70%的乙醇洗涤沉淀,10,000g离心5分钟8. 倒掉乙醇溶液,用吸水纸吸净管壁上的水珠,室温蒸发痕量乙醇9. 加入适量含RNase的TE或灭菌双蒸水溶解质粒DNA2)质粒鉴定→琼脂糖凝胶电泳灌胶:胶中加入荧光染料(SYBR Green I)加样:质粒+上样缓冲液→混匀电泳结果观察:UV灯下四、实验结果五、实验分析裂解细胞中除含有质粒DNA外,还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂类等物质,因此用碱裂解法除去杂质1、防止DNA裂解:Solution 11)、所含糖增加溶液黏度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切作用降解2)、所含EDTA抑制酶活性2、溶解与变性:Solution21)强碱使质粒DNA和染色体DNA变性2)离子型表面活性剂SDS可溶解膜蛋白3、沉降与复性:Solution31)质粒DNA复性2)在钾盐中,染色体DNA形成缠连的不溶性网状结构,和不稳定的大分子RNA以及变性的蛋白质和细菌碎片等一起沉淀预期结果为剩余质粒DNA4、琼脂糖凝胶电泳1)荧光染色染料分子可嵌入双链DNA分子配对碱基之间2)琼脂糖可起到电泳和分子筛的作用,因所带电荷、分子量大小和构型不同,泳动速度不同六、误差分析实验失败,本组实验出现4条带,3明1暗,明亮处应为DNA分子数最多的,为质粒DNA,质粒DNA前有较暗的两条带,推测其中一条为未复性质粒DNA,可能Solution2处变性过长,不易复性,或Solution3处时间过短,复性不充分。
生物学实验 质粒DNA的提取

实验8 质粒DNA的提取(碱裂解法)一、实验目的了解碱裂解法提取质粒的基本原理和主要应用,掌握碱裂解法提取质粒的实验方法和各种试剂在提取过程中的作用。
二、实验原理碱裂解法是利用细菌染色体DNA与质粒DNA结构的大小差异来分离质粒DNA的。
碱性(pH 12.0~12.5)条件可以破坏碱基配对,宿主和质粒DNA的碱基之间的氢键被破坏。
当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),共价闭合环状的质粒DNA会迅速准确地恢复配对,重新形成完全天然的超螺旋分子;而较大的细菌染色体DNA分子则难以复性,会交联形成不溶于水的线团结构,缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来,而质粒DNA则留在上清液中,用异丙醇沉淀、70 %乙醇洗涤即可获得质粒DNA。
三、仪器设备微量取液器(2 μL;20 μL;200 μL;1 000 μL),tip头,手掌型离心机,1.5 mL离心管, 恒温水浴,制冰机,超净工作台,恒温培养箱。
振荡器,离心机,金属浴,电泳仪,凝胶成像仪。
四、实验试剂(1)溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖;20 mmol/L Tris·HCl(pH = 8.0);10 mmol/L EDTA(pH=8.0),高压蒸汽灭菌(121 ℃,0.105 Mpa)20 min。
4 ℃贮存。
(2)溶液Ⅱ(现用现配):0.2 mol/L NaOH;1 g / L SDS。
(3)溶液Ⅲ(pH 4.8):每100 mL溶液中含5 mol/L乙酸钾60 mL;冰乙酸11.5 mL;H2O 28.5 mL。
(4)RNase(10 mg / mL),LB液体培养基,氨苄青霉素,异丙醇,70 %(V / V)乙醇,无菌水。
五、实验方法(1)分装3 mL LB液体培养基和3 μL氨苄青霉素(50 mg/mL)于15 mL玻璃试管中。
(2)用灭菌牙签挑取一白色单克隆,放入玻璃管内,置37 ℃恒温摇床中以200转/min培养,至OD600=2.0。
质粒dna提取实验报告

质粒dna提取实验报告引言DNA的提取是生物学实验中非常重要的一步,它可以用于后续的分子生物学研究,比如克隆、PCR、基因测序等。
而本次实验的目的是从细菌中提取质粒DNA,并对提取的结果进行分析,评估提取效果。
材料与方法1. 实验材料- 大肠杆菌菌液- 细胞裂解液- RNase A- 莱文斯坦缓冲液- 高盐裂解液- 乙酰盐- 氯仿- 异丙醇- TE液- 离心管等实验仪器和耗材。
2. 实验步骤- 调制莱文斯坦缓冲液,用于细胞裂解和质粒DNA的稳定。
- 预处理大肠杆菌菌液,用高盐裂解液处理使其细胞壁破裂,释放出质粒DNA。
- 添加异丙醇与氯仿,用于分离DNA和其他细胞组分。
- 加入乙酸盐处理DNA上的蛋白质,使其沉淀。
- 用异丙醇洗涤DNA沉淀,去除杂质。
- 用TE液溶解提取得到的DNA。
结果与讨论经实验,我们成功地从大肠杆菌中提取到了质粒DNA。
通过紫外光照射,我们观察到了明亮的DNA带,证明提取得到的DNA具有较高的纯度。
另外,我们还使用琼脂糖凝胶电泳对提取的DNA进行了分析。
从琼脂糖凝胶电泳的结果中,我们观察到细长而连续的DNA 条带,说明提取得到的质粒DNA具有较好的完整性。
此外,我们还注意到,在琼脂糖凝胶中,质粒DNA的迁移速率要快于细菌染色体DNA,这是因为质粒DNA的分子量较小。
在实验的过程中,我们注意到了一些实验技巧和注意事项。
首先,在进行细胞裂解和DNA提取过程中,必须保持材料的无菌状态,以免外源性DNA的污染。
其次,避免在提取过程中显著提高DNA样本的温度,以防止DNA的降解。
最后,注意避免DNA溶液与金属物质接触,因为金属离子可能对DNA具有毒性。
结论通过本次实验,我们成功地从大肠杆菌中提取到了高质量的质粒DNA,并在琼脂糖凝胶上观察到清晰的DNA带。
实验过程中,我们掌握了DNA提取的基本操作技巧和注意事项,这对我们今后的分子生物学研究将产生积极的影响。
然而,本次实验还有一些改进的空间。
实验二-质粒DNA的提取及酶切

实验二质粒DNA的提取及酶切(8学时,6小时)一、实验目的:通过本实验学习和掌握碱裂解法提取和酶切质粒的技术与方法。
二、实验原理:碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA之间在拓扑学上的差异而达到分离目的。
环状闭合的质粒DNA在限制性内切酶的作用下成为线状质粒DNA,内切酶能识别DNA分子中某一特定的核苷酸序列。
三、仪器、材料、试剂(一)仪器:1、恒温摇床2、台式离心机3、高压灭菌锅4、振荡器(二)材料:1、含PUC-18质粒的大肠杆菌2、乙二胺四乙酸(EDTA)3、三羟甲基氨基甲烷(Tris) 4.葡萄糖 5.氢氧化钠(NaOH) 6.十二烷基硫酸钠(SDS) 7、乙酸钾(KAc) 8、冰醋酸(HAc) 9、盐酸(HCl) 10、Tris饱和酚11、氯仿12、异戊醇13、乙醇14、胰RNA酶15、氨苄青霉素16、离心管(三)试剂:1、溶液І (pH8.0) 2、溶液Ⅱ3、溶液Ш4、TE缓冲液(pH8.0)5、0.5mol/LEDTA6、氯仿:异戊醇(V:V=24:1)7、Tris饱和酚:氯仿:异戊醇(V:V:V=25:24:1)8、70%乙醇9、胰RNA酶10、ECOR I酶四、实验步骤(一)质粒DNA的提取1、先在3mL LB液体培养基中加入3uL羧苄青霉素(终浓度50ug/mL),然后接入一个含puc-18质粒的大肠杆菌单菌落,37℃震荡培养过夜。
2、取过夜培养的菌液1mL加入1.5mL离心管中,4000r/min,倒出培养液,将所有菌体细胞收集在一个离心管中。
3、加入100µl溶液І于含菌体细胞的小指管中,旋涡震荡将细菌沉淀悬浮,室温放置10min。
4、加入200µl溶液Ⅱ(新鲜配置),轻轻混匀内容物,溶液逐渐变清亮后加入溶液Ш(千万不可用旋涡震荡器,裂解时间不超过5min)。
5、加入150µl溶液Ш(冰上预冷),盖紧管口,轻轻混匀数次。
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实验六质粒DNA的提取
一、实验目的
通过本实验学习和掌握碱裂解法提取质粒
二、实验原理
质粒(Plasmid)是独立于染色体外的,能自主复制且稳定遗传的遗传因子。
它是一种环状的双链DNA分子,存在于细菌、放线菌、真菌以及一些动植物细胞中,在细菌细胞中最多。
本实验利用SDS碱裂解法提取质粒DNA。
将细菌悬浮液暴露于高pH值的强阴离子洗涤剂中,会使细胞壁破裂,染色体DNA和蛋白质变性,将质粒DNA释放到上清中。
在裂解过程中,细菌蛋白质、破裂的细胞壁和变性的染色体DNA会相互缠绕成大型复合物,后者被SDS (十二烷基硫酸钠)包盖。
当用K+取代Na+时,这些复合物会从溶液中有效地沉淀下来。
离心除去变性剂后,就可以从上清中回收复性的质粒DNA。
三、实验材料与试剂
1、实验材料大肠杆菌(含有携带插入片段的质粒PMD-18T)
2、实验试剂
(1) 溶液Ⅰ:Tris·HCl(pH8.0)25mmol/L,EDTA(pH8.0)10mmol/L,葡萄糖50mmol/L;
(2) 溶液Ⅱ(新鲜配制) :NaOH 0.2mol/L,SDS 1%(W/V);
(3) 溶液Ⅲ(100ml):5mol/L乙酸钾60ml,冰乙酸11.5ml(pH4.8),水28.5ml;
(4) 氯仿-异戊醇(24:1);
(5) 异丙醇、70%乙醇;
四、实验步骤
(一)提取质粒
1. 挑转化后的单菌落(含PMD-18T质粒),接种到20ml含有适当抗生素(Amp)的丰富培养基中(LB培养液),于37℃剧烈振摇下培养过夜。
(由老师完成)
2. 将1.5ml的培养物倒入1.5ml的EP管中,于4 ℃以12000rpm离心1min。
3. 离心结束, 弃去上层培养液,再向离心管中加入1.5ml的培养物,于4 ℃以12000rpm 离心1min。
4. 弃去上层培养液,使细菌沉淀尽可能干燥。
5. 将细菌沉淀重悬于100μl冰预冷的溶液Ⅰ中,用Tip吸头吹打沉淀至完全混匀(无块状悬浮)。
6. 加200μl新配制的溶液Ⅱ于每管细菌悬液中,盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以混合内容物,注意动作一定要轻柔缓和,切勿振荡!将离心管放置于冰上(2min)。
7. 加150μl用冰预冷的溶液III,盖紧管口,反复颠倒数次,使溶液Ⅲ在粘稠的细菌裂解物中分散均匀,之后将管置于冰上3~5min。
8. 4 ℃以12000rpm离心5 min,将上清液(400 μl )转移到另一离心管中。
9. 加等体积的氯仿:异戊醇(24:1)振荡混匀。
4 ℃以12000rpm离心5min,将上清液(300 μl )转移到另一离心管中。
10. 加2/3体积的异丙醇沉淀质粒DNA,振荡混匀,于冰上放置15min。
11.4 ℃以12000rpm离心5min。
小心吸去上清液,将离心管倒置于纸巾上,以使所有液体流出。
再将附于管壁的液滴除尽。
12. 加1ml 70%乙醇溶液洗涤沉淀,振荡混匀, 4 ℃12000rpm离心5min。
弃去上清液,在空气中使DNA沉淀干燥(约5-10分钟)。
13. 用20μl灭菌的蒸馏水溶解DNA,加1μl胰RNA酶37 ℃消化RNA 30min。
14. 用1%的琼脂糖凝胶电泳检测质粒的提取状况。
五、实验结果
我组为第7组,由电泳图谱可以看出,电泳得到3个条带,条带较为清晰。
最前面的一条带为超螺旋的质粒DNA(分子量2000bp),中间的条带为两条链均发生断裂而形成的线形DNA;最慢的条带为一条链发生断裂的开环质粒DNA。
六、思考题
1. 试述在提取质粒过程中溶液I、II、III的作用是什么?
(1)溶液Ⅰ:Tris·HCl(pH8.0)25mmol/L,EDTA(pH8.0)10mmol/L,葡萄糖50mmol/L;
主要作用是使细菌悬浮,此外EDTA 可抑制DNase的活性。
(2) 溶液Ⅱ(新鲜配制) :NaOH 0.2mol/L,SDS 1%(W/V);
碱会使细胞壁破裂,染色体DNA和蛋白质变性,将质粒DNA排放到上清中;在裂解过程中,细菌蛋白质、破裂的细胞壁和变性的染色体DNA会相互缠绕成大型复合物,可被SDS 包盖。
(3) 溶液Ⅲ(100ml):5mol/L乙酸钾60ml,冰乙酸11.5ml(pH4.8),水28.5ml;
K+置换了SDS中的Na+,得到PDS(十二烷基磺酸钾),这些复合物可以从溶液中有效地沉淀下来,经离心除去。
2. 描述质粒DNA的电泳图谱,并解释产生的现象及可能的原因?
实验中得到的质粒DNA电泳图谱显示共有三条带,其中:
最快的一条带是超螺旋的质粒DNA;中间的是线性DNA,质粒的两条链均断裂形成了线性分子;最远的一条是开环的质粒DNA,有一条链断裂。
后两种情况的发生主要是由于在质粒提取过程中,机械力、酸碱度、试剂等的原因,使质粒DNA链发生断裂。