药物设计
药物设计学完整版

药物设计学完整版药物设计学是一门研究如何设计出具有特定生物活性的化合物的学科,它结合了化学、生物学、计算机科学等多个领域的知识。
药物设计的目标是通过理解疾病发生发展的分子机制,找到能够干扰或调节这些过程的化合物,从而开发出新的治疗方法。
药物设计学的主要内容包括:1. 目标选择:选择合适的药物靶点,即与疾病相关的生物分子,如蛋白质、核酸等。
2. 先导化合物的发现:通过高通量筛选、计算机辅助设计等方法,寻找具有潜在生物活性的化合物。
3. 优化和改造:对先导化合物进行结构改造,以提高其生物活性、选择性和药代动力学性质。
4. 体外和体内活性测试:评估化合物的生物活性、毒性和药代动力学性质。
5. 临床前研究:对候选药物进行安全性、有效性和药代动力学研究。
6. 临床试验:在人体中评估候选药物的安全性和有效性。
7. 上市后监测:对上市药物进行长期的安全性、有效性和经济性监测。
药物设计学的发展历程可以追溯到20世纪初,当时人们开始尝试通过化学方法合成具有生物活性的化合物。
随着生物学、计算机科学等领域的不断发展,药物设计学逐渐形成了一门独立的学科。
近年来,随着高通量筛选、计算机辅助设计等技术的进步,药物设计学的发展速度大大加快,越来越多的新药被成功开发出来。
药物设计学的研究成果对于新药研发具有重要意义。
通过药物设计学的研究,我们可以更加深入地理解疾病发生发展的分子机制,找到更加有效的治疗方法。
同时,药物设计学的研究还可以推动化学、生物学、计算机科学等领域的交叉融合,促进这些领域的发展。
药物设计学完整版药物设计学是一门研究如何设计出具有特定生物活性的化合物的学科,它结合了化学、生物学、计算机科学等多个领域的知识。
药物设计的目标是通过理解疾病发生发展的分子机制,找到能够干扰或调节这些过程的化合物,从而开发出新的治疗方法。
药物设计学的主要内容包括:1. 目标选择:选择合适的药物靶点,即与疾病相关的生物分子,如蛋白质、核酸等。
药物设计方法研究

药物设计方法研究药物一直是人类解决疾病问题的主要工具之一。
随着科技的不断发展,药物设计方法也在逐渐升级。
药物设计是指根据疾病的发病机制、药物分子的结构特点和药效等因素,在计算机上通过模拟和设计,得出一种新的药物分子结构的过程。
本文将介绍几种常见的药物设计方法。
1. 三维药物设计三维药物设计是一种最常见的药物设计方法。
它基于分子结构、生理学和药理学知识,通过计算机模拟生成药物分子三维构象,进而预测药物分子对靶标的作用。
在三维药物设计中,药物分子和靶标通常以三维网格图或球模型呈现。
常用的三维药物设计软件有Schrödinger和Discovery Studio等。
2. 分子对接分子对接是一种通过计算机模拟预测药物分子与受体(如蛋白质)相互作用的方法。
分子对接的目的是通过计算机预测药物分子与受体的作用模式,从而设计出新的高活性药物分子。
分子对接方法主要有基于力场的方法、基于虚拟筛选和基于量子力学方法等。
3. 贝叶斯优化贝叶斯优化是一种基于统计学理论的药物设计方法。
它可以通过学习过去的药物设计数据,预测药物分子的活性。
贝叶斯优化在药物设计中主要用于分子优化和优化搜索算法等方面。
通过学习过去的数据,贝叶斯优化可以为未来的药物设计提供有价值的参考。
4. 机器学习机器学习是一种基于人工智能的药物设计方法。
它可以通过学习和发现药物分子与靶标之间的规律和关系,得出预测和优化药物分子结构的结果。
机器学习在药物设计中主要用于靶向发现和新药物分子筛选等方面。
总的来说,药物设计方法的不断进步,可以有效提高新药的成功率和研发效率。
然而,药物研究和开发依然面临着许多挑战和难题。
我们期待着新技术的出现和发展,能够为药物研究和创新带来更多的积极影响。
合理药物设计 名词解释

合理药物设计名词解释合理药物设计(RationalDrugDesign,RDD)指的是将一种有效的活性化合物的表征、靶标定位以及抗原的设计相结合的一种药物设计方法。
它被广泛用于药物研发,是药物设计流程的一个重要环节。
从研究方法上看,合理药物设计把计算机辅助药物设计和结构活性关系(SAR)跟踪技术结合在一起,并将其结合到生物多样性,结构-功能关系,模拟,分子建模等领域中,以研制强效,安全,特异性,稳定性更好的药物。
合理药物设计的主要步骤包括靶标发现、概念药物设计、优化药物设计、筛选药物设计和药代动力学研究。
其中,靶标发现阶段是合理药物设计的开始步骤,即确定疾病的主要影响因素;概念药物设计阶段涉及到将已知的活性化合物转化为新的活性化合物,以期获得更好的活性;药物优化阶段是药物设计流程中最重要的步骤,即研究和改善活性化合物,以最大限度地提高活性;筛选药物阶段旨在从活性化合物中筛选出最有效的活性化合物;最后,药代动力学(PK/PD)研究阶段则是保证安全性,长期有效性,耐受性以及稳定性方面的药物研究。
合理药物设计的主要应用技术包括计算机辅助药物设计、构象搜索、结构活性关系跟踪技术、分子建模技术、系统生物学技术、虚拟筛选技术以及生物信息技术等等。
在药物研发中,计算机辅助药物设计技术可以推断药物用药百分比的可能性及其与疾病的关联性;根据结构活性关系跟踪技术,可以基于有效活性合理地调整新药;分子建模技术可以从大量的分子结构中预测它们的吸收,分布,代谢,排泄等参数;系统生物学技术可以帮助研究靶点组件的功能和相互作用,而虚拟筛选技术可以从药物百万结构中无痛挑选出最佳候选。
合理药物设计在各个领域的应用越来越广泛,尤其是在遗传学、分子生物学、药理学、药物化学等研究领域中。
它不仅为药物研发提供了新的思路和方法,而且可以极大地提高药物研发效率、降低研发成本、加快研发进度以及提高药物纯度等。
合理药物设计技术的发展将有助于改善现有药物的性能,推动新药研发和构建新的药物靶标的实现。
合理药物设计名词解释

合理药物设计名词解释药物设计是一门研究药物的科学,其中研究的目标是建立一种安全有效的药物,可以治疗客观疾病,获得良好的疗效。
药物设计的过程可以被简单的归纳为4个步骤:需求分析、药物先导发现、药物优化和抗性选择。
首先,需求分析是指在药物设计过程中,需要分析出市场上存在哪些需求,药物设计者需要设计出满足市场需求的药物,而非现有的成熟产品。
其次,药物先导发现是指在药物设计过程中,通过收集、整理和分析海量药物信息,快速发现能够满足需求的药物先导,并将其应用到药物设计中。
然后,药物优化是指在药物设计过程中,根据药物先导及其相关信息,采用合理的方法对活性分子结构或者药物发挥活性机制等进行优化,以达到良好的靶点特异性,优化药物的安全性、有效性以及耐受性。
最后,抗性选择是指在药物设计过程中,采用多药联合方案,选择具有与药物有效结合的、无细菌抗性蛋白质作为药物的靶点,使有效细菌对抗药物耐受性下降。
总而言之,合理药物设计是一种科学和技术,其中研究的目标是通过需求分析、药物先导发现、药物优化和抗性选择的方法,设计出安全有效的药物,以达到满足市场需求的疗效。
对于新药设计过程,应当从多方面考虑,以期设计出能够提高安全性、有效性以及耐受性的高效药物。
实现合理药物设计的关键因素,一方面在于药物设计者要掌握先进的科学技术和药物研发流程,另一方面,必须确保药物设计所依据的实验数据被正确地记录和汇总。
在合理药物设计的过程中,药物设计者要积极主动的参与,利用多学科的视角探索不同的药物设计思路,以求最大化研发的成果,并最终获得安全有效的药物。
因此,合理药物设计不仅要求药物设计者掌握先进的科学技术和药物研发流程,更要积极参与到药物设计过程中,利用全新的思路和理念,探索新的药物设计方法,为研发更安全、有效的药物,给患者带来更多实惠。
药物设计的基本原理和方法

靶点定位
02
药物的靶点可以是细胞内的特定分子、细胞膜上的受体或细胞
器等。
药效学特征
03
药物的细胞和组织特异性与其药效学特征密切相关,决定了药
物的治疗效果和副作用。
03
CATALOGUE
药物设计的计算方法
基于配体的药物设计
总结词
基于配体的药物设计是指根据已知活性配体分子的结构特征和药效团,预测和 设计新药分子。
02
CATALOGUE
药物作用的分子机制
药物与受体的相互作用
药物与受体结合
药物通过与细胞膜上的受体结合,传递信号,调节细 胞功能。
药物作用模式
药物与受体结合后,可以激动或拮抗受体,产生兴奋 或抑制效应。
亲和力与选择性
药物与受体结合的亲和力决定了药物作用的强度,而 选择性决定了药物作用的特异性。
药物作用的信号转导通路
人工智能可以帮助研究人员分析大量数据,发现潜在的药物靶点,预测分子的三维 结构和相互作用模式,提高药物设计的精度和效率。
人工智能还可以模拟药物在体内的代谢和分布过程,预测药物的疗效和安全性,为 新药临床试验提供有力支持。
基于免疫疗法的药物设计
免疫疗法已成为一种重要的治疗手段 ,通过调节人体免疫系统来攻击肿瘤 细胞或其他有害物质。
基于结构的药物设计
总结词
基于结构的药物设计是指根据已知靶蛋 白的三维结构,设计和筛选能够与靶蛋 白结合并影响其功能的小分子药物。
VS
详细描述
该方法依赖于对靶蛋白三维结构的了解, 通过计算机辅助药物设计软件,设计和筛 选能够与靶蛋白结合并影响其功能的小分 子药物。这种方法需要高分辨率的靶蛋白 结构信息,并考虑蛋白质的动态性质。
药物设计学

药物设计学
药物设计学是一门研究药物的设计和开发的学科。
它通过结合药理学、化学、生物学和计算机科学等多个学科的知识,旨在设计和发现新的药物,改进现有药物的性能,以及研究药物与生物体的相互作用和机制。
药物设计学的主要目标是开发出具有良好药效和选择性的药物,并且具有良好的安全性和生物利用度。
它涉及到药物的分子结构设计、合成方法的优化、药物与靶点的相互作用研究、药物的药代动力学和毒性学评价等方面。
在药物设计学中,常用的方法包括分子模拟、药物动力学模拟、化学信息学技术和高通量筛选等。
这些方法可以帮助研究人员预测分子的活性、选择性和药代动力学性质,从而指导药物的设计和优化过程。
随着生物技术和计算机技术的快速发展,药物设计学在药
物研发中的作用越来越重要。
它可以加速药物研发的速度,降低成本,并且提高药物的疗效和安全性。
药物设计的原理是
药物设计的原理是药物设计是指利用现代科学技术和药学等相关知识,通过分子设计和合成药物分子,以满足治疗疾病的需要。
药物设计的基本原理包括药物作用靶点选择、药物分子的合成、药物的优化等。
首先,药物设计需要明确疾病的发病机制,找到适合的治疗靶点。
靶点可以是特定的蛋白质、酶、离子通道等,这些靶点参与了生理、病理过程的调控。
通过选择合适的靶点,药物设计师可以根据其功能特点开发出有针对性的药物。
在药物分子的合成过程中,药物设计师需要设计与靶点相互作用的化学结构,并通过有机合成方法合成出药物分子。
药物设计师会考虑药物分子的生理学、药代学性质以及药物的有效性和安全性等方面的因素。
通常,药物分子具有独特的化学结构和功能团,可以与靶点发生特异性的相互作用,从而达到治疗效果。
药物设计的一个重要原则是结构活性关系(Structure-Activity Relationship,SAR)。
药物设计师通过对已知活性药物结构进行结构修饰、改变或优化,使药物分子具备更好的活性和选择性。
这涉及到合理的分子模拟和计算方法,如分子对接、药物动力学和动力学模拟等。
通过这些方法,药物设计师可以预测药物与靶点的相互作用模式和药物分子在体内的代谢途径,为药物分子的优化提供指导。
此外,药物设计也需要考虑药物分子的药物代谢特性。
药物在人体内经历一系列的代谢途径,包括吸收、分布、代谢和排泄。
药物的代谢特性对于药物的治疗效果和毒副作用具有重要影响。
药物设计师可以通过结构优化以及设计药物释放系统等方法,调控药物在体内的代谢过程,提高药物的生物利用度和疗效。
此外,近年来,药物设计中也注重了计算机辅助药物设计(Computer-Aided Drug Design,CADD)。
计算机辅助药物设计通过建立药物分子与靶点的结构模型,应用计算机算法进行分析和预测,加速药物设计的过程。
CADD包括药物活性预测、分子对接、虚拟筛选等技术,它们在药物设计中发挥着重要的作用,并提高了药物研发的效率。
药物设计的5原则
药物设计的5原则一、引言药物设计是一个复杂的过程,需要考虑的因素众多。
以下是药物设计的五个关键原则,这些原则有助于确保药物的研发过程更加有效和成功。
二、药物设计的五原则1.活性原则活性原则是药物设计的核心。
这意味着设计的药物应该具有预期的治疗活性,能够针对特定的疾病或病症产生效果。
在药物设计过程中,需要对目标疾病有深入的理解,明确药物的作用靶点,然后设计出能够与靶点结合并产生所需治疗效果的化合物。
2.安全性原则安全性原则强调药物应具有较低的毒性和副作用。
药物设计的目标不仅是找到具有活性的化合物,还要确保这些化合物在人体内安全、有效地发挥作用。
因此,药物设计过程中需要进行全面的安全性评估,包括对化合物的毒性、致畸性、致突变性等方面的研究。
3.结构-活性关系原则结构-活性关系原则是指化合物的结构与其生物活性之间的关系。
通过对已知活性化合物的研究,可以发现其特定的化学结构和活性之间的关系,从而为新药设计提供思路。
结构-活性关系有助于理解药物与靶点相互作用的方式,为新药的发现和优化提供理论支持。
4.代谢稳定性原则代谢稳定性原则是评估药物在体内的稳定性。
代谢稳定性好的药物能够更好地发挥药效,同时减少不必要的代谢产物。
在药物设计过程中,需要预测和优化药物的代谢稳定性,以确保药物在体内能够稳定存在并达到预期的治疗效果。
5.专利保护原则对于药物研发公司来说,专利保护原则也是重要的考虑因素。
具有专利保护的药物可以为其研发公司带来独家收益,从而补偿其研发成本并获得投资回报。
因此,在药物设计过程中,需要考虑如何设计出具有创新性和专利保护的药物分子。
合理药物设计名词解释
合理药物设计名词解释合理药物设计是指通过合理的科学方法和技术手段,设计和开发具有良好疗效和安全性的药物。
在药物设计过程中,需要考虑药物的多种性质和特性,如药物的靶点、药物的生物利用度、药物的代谢途径等。
以下是一些与合理药物设计相关的名词解释:1. 靶向药物:靶向药物是指能够特异性地作用于疾病相关靶点的药物。
通过靶向药物的设计,可以提高药物的疗效并降低副作用。
2. 异结构物:异结构物是指与已知药物结构相似,但具有不同作用的化合物。
在合理药物设计中,可以通过改变药物的结构,设计出具有更好活性和药物性质的异结构物。
3. 药效团:药效团是指能够与药物靶点结合并发挥药理作用的分子部分。
药效团的识别和设计是合理药物设计的重要环节。
4. 生物利用度:生物利用度是指在体内药物被吸收和利用的程度。
合理药物设计中,需要考虑药物的生物利用度,以确保足够的药物浓度达到靶点并发挥治疗作用。
5. 安全性评价:安全性评价是指对药物在体内的毒性和安全性进行评估。
在合理药物设计中,需要对药物的毒性进行评价,以确保药物的安全性。
6. 药物代谢途径:药物代谢途径是指药物在体内的代谢途径和产物。
了解药物的代谢途径有助于合理药物设计,以提高药物的代谢稳定性和药物浓度。
7. 药物优化:药物优化是指对已有药物进行改进,以提高药物的疗效和安全性。
药物优化是合理药物设计的重要步骤,包括药物结构的改变以及药物性质的调整。
8. 药物相互作用:药物相互作用是指不同药物在体内的相互作用和影响。
了解药物相互作用可以帮助合理药物设计,以减少药物的不良反应和副作用。
合理药物设计是一项综合性的任务,需要借助多种科学和技术手段,包括计算化学、结构生物学、分子模拟等。
通过合理药物设计,可以开发出更安全、更有效的药物,为疾病的治疗和预防提供更好的选择。
药物设计的原理和方法
药物设计的原理和方法药物是指可以治疗疾病的化合物,药物的作用方式是通过与生物大分子相互作用来影响生物系统的功能。
然而,药物因其特异性和效应持续时间等特性而可能对生物系统产生负面影响。
因此,药物设计成为了将化学、生物学和物理学等学科知识综合运用的一个领域。
药物设计的原理药物设计的目标是合成有效而安全的化合物,以用于治疗疾病。
对于一种特定的疾病,可能需要设计多种药物并进行比较,以选择出最有效的药物。
药物的效果取决于药物与它所作用的靶标之间的相互作用。
因此,药物设计不仅要考虑药物的特性,还要考虑靶标的性质。
药物设计的一个基本原理是最优作用理论(Optimum effect theory)。
这个理论认为,在药物治疗中,药物和受体(或靶标)的结合应该遵循“最佳反应”的原则。
这意味着药物应该与靶标相互作用,但不应该对其他分子产生影响。
药物和靶标的相互作用是通过一系列物理和化学过程完成的。
因此,药物设计需要综合考虑分子结构、能量、热力学和动力学等多种因素。
药物设计的方法药物设计的方法有多种,包括传统方法和计算机辅助设计方法。
传统方法包括构建小分子库、分子变异(molecular variation)、受体片段分析(receptor fragment analysis)和高通量药物筛选等。
这些方法可以在无需计算机辅助的情况下进行,因此在早期的药物研发中广泛应用。
随着计算机技术的进步和高分子化学的发展,计算机辅助设计方法也成为了药物设计中不可或缺的一部分。
计算机辅助设计方法可以通过分子模拟和分子对接等技术预测分子间相互作用和性质,以指导实验室合成和测试的药物。
药物设计的一些常见计算机辅助方法包括分子动力学模拟(molecular dynamics simulation)、量子化学计算(quantum chemistry calculation)、分子对接(molecular docking)和分子机器学习(molecular machine learning)等。
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序论• 药物设计(Drug design)就是药物的发现过程,其研究的内容是药物发现的中心环节----先导物的发现途径(衍生与优化)以及所涉及的理论、技术和方法。
1)药物研究的三个时期:发现阶段(Discover)、发展阶段(Develop)和设计阶段(Design)• 2)发现新药的方法:经验积累偶然发现化学合成天然物提取综合筛选代谢启迪毒副作用的利用作用机制研究临床发现与老药新用• 药物发现,包括药物研究和开发过程,• 研究过程分4个阶段:基础研究、可行性分析、项目研究和非临床开发。
• 开发过程主要指临床研究阶段。
• 各阶段的研究都会对上阶段结果质疑而更新设计、重复试验或终止试验,因此药物发现的全过程并非一定能发现药物。
• 新药研究的过程一、基础研究二、可行性分析• 三、项目研究四、总体评价五、临床研究• 新化学实体(New Chemical Entity, NCE)先导化合物(Lead Compounds)。
• 完成临床阶段后为“注册新药”(New Drug Application, NDA)。
• 5新药开发的流程• 先导化合物发现及优化随机筛选候选化合物临床前实验临床实验市场• 受体(receptor)是指生物体的细胞膜上或细胞内的一种特异性的大分子结构。
包括酶、离子通道、抗原、核酸、糖类大分子、脂类等• 配基(ligand)时能与受体产生特异性结合的生物活性物质,包括信息分子和药物。
的受体-配基作用学说是药物设计的主要原理和方法,是理解受体功能和疾病病理学的基础。
• 合理药物设计(rational drug design)是依据生命科学研究中所揭示的包括受体、酶、离子通道、核酸等潜在的药物作用靶点(target, 受体),并参考其内源性配基或天然底物的化学结构特征来设计药物分子,从而发现选择性作用于靶点的新药。
• 1)合理药物设计分为直接设计和间接设计两种• 直接药物设计:在已知靶物质三维结构的前提下,运用定向设计原理,根据靶物质的结构要求利用计算机图形学的研究,直接设计新药分子;• 间接药物设计:在靶物质结构未知的情况下,利用药物分子与靶物质的互补性,探索一系列已知药物的三维结构与生物活性的定量关系,反推出靶物质的结构,从而设计新药• 1)以受体为靶点的新药研究 !•药物与受体结合才能产生药效,同时还必需具有高度的选择性和特异性,选择性要求药物对某种病理状态产生稳定的功效,特异性要求药物对疾病的某一种生理、生化过程有特定的作用.• 孤儿受体(orphan receptor),这类受体其编码基因与某一类受体超族成员的编码有同源性,但是目前在体内还没有发现其相应的配基。
• 逆向分子药理学(reverse molecular *****acology)• 2)以酶/离子通道为靶点的新药研究• 3)以核酸为靶点的新药研究• 将癌变基因作为药物作用靶,利用反义技术抑制癌细胞增殖。
• 以已知的抗肿瘤药为先导,以DNA为靶点设计出新的抗肿瘤药物• 反义技术:用人工合成的或天然存在的寡核苷酸片断,以碱基互补方式结合目标基因或mRNA特定序列,从而有效的抑制或封闭靶细胞的表达,达到抑制癌细胞的增殖的目的• 1)组合化学• 将一些称之为构建模块的基本分子(如氨基酸、核苷酸、单糖及化学小分子)通过化学或生物合成的手段,将它们系统的装配成不同的组合,由此得到大量的具有结构多样性特征的分子,从而建立化学分子库的方法。
组合化学的特点:• 可以在较短的时间内合成出大量的不同结构的化合物• 用组合化学合成的化合物比较完全• 组合化学中应用固相有机合成方法可使构建数据库的操作实现仪器化、自动化。
• 1)高通量自动化药物筛选技术[简称高通量筛选(high throghpt screening)• 3 反义药物的研究与开发• 基因表达的调节一般是通过蛋白-核酸相互作用来实现的,也可通过核酸-核酸之间的相互作用。
互补的核酸可抑制翻译,进而抑制蛋白质的合成,这就是反义方法。
反义作用包括专一性和非专一性两种情况。
• 1)新药设计包括• 类型演化• 通过新的先导化合物(lead compound,or pattern compound)的寻求和发掘, 对各种模型化合物的结构刨析,确定显效化学结构或药效基团模型(*****acophore model)基本结构,进而获得全新结构的化合物。
BLN,P0o08• 结构优化• 设计先导物的同系物或类似物(又叫系列设计)。
• 类型演化为系列设计开辟新的设计条件和领域,系列设计则是类型演化的继续和发展,两者相辅相成• 1)系列设计是基于药物的定量构效关系研究,主要包括:• 1 合成对象选择• 2 合成• 3 拟定将要测定的生物活性指标• 4 化学结构因素选择• 5 QRST方程的求得• 6 活性预测与新合成对象的选定等过程。
• 开发新药的一般程序为:• 情报资料的调研和立题一处方和生产工艺研究一质量标准研究一稳定性研究一药效学研究一毒理学研究一临床资料的整理和报临床一临床研究一全部资料的整理和报生产一生产或技术转让。
第二章药物作用的生物学基础蛋白质的一级结构(primary structure)主要是考虑肽链中氨基酸的种类和排列顺序蛋白质的二级(Secondary)结构是指肽链的主链在空间的排列,或规则的几何走向、旋转及折叠。
它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。
主要有a-螺旋、b-折叠、b-转角。
• 1)在a-螺旋中肽平面的键长和键角一定;• 肽键的原子排列呈反式构型;• 相邻的肽平面构成两面角• 多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转,形成螺旋结构,螺旋一周,沿轴上升的距离即螺距为0.54nm,含3.6个氨基酸残基;两个氨基酸之间的距离为0.15nm; u: 6k(t z• 肽链内形成氢键,氢键的取向几乎与轴平行,第一个氨基酸残基的酰胺基团的-CO基与第四个氨基酸残基酰胺基团的-NH基形成氢键。
• 蛋白质分子为右手a-螺旋。
• 2)b-折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列,通过链间的氢键交联而形成的。
肽链的主链呈锯齿桩折叠构象• 在b-折叠中,a-碳原子总是处于折叠的角上,氨基酸的R基团处于折叠的棱角上并与棱角垂直,两个氨基酸之间的轴心距为0.35nm;• b-折叠结构的氢键主要是由两条肽链之间形成的;也可以在同一肽链的不同部分之间形成。
几乎所有肽键都参与链内氢键的交联,氢键与链的长轴接近垂直。
• b-折叠有两种类型。
一种为平行式,即所有肽链的N-端都在同一边。
另一种为反平行式,即相邻两条肽链的方向相反。
• 3)在b-转角部分,由四个氨基酸残基组成; -• 弯曲处的第一个氨基酸残基的 -C=O 和第四个残基的–N-H 之间形成氢键,形成一个不很稳定的环状结构。
• 这类结构主要存在于球状蛋白分子中。
• 蛋白质的三级结构(Tertiary Structure)是指在二级结构基础上,肽链的不同区段的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构。
• 4)蛋白质的四级结构(Quaternary Structure)是指由多条各自具有一、二、三级结构的肽链通过非共价键连接起来的结构形式;各个亚基在这些蛋白质中的空间排列方式及亚基之间的相互作用关系。
这种蛋白质分子中,最小的单位通常称为亚基或亚单位Subunit,它一般由一条肽链构成,无生理活性;维持亚基之间的化学键主要是疏水力。
• 由多个亚基聚集而成的蛋白质常常称为寡聚蛋白;生物大分子的可变性• 类型• 实质 %• 一级结构改变• 高级结构改变• 局部的• 整体的• 1、前体的激活或剪裁重组• 发生在高分子生物合成后,有共价键改变、断裂或形成• 2、某些单体的结构修饰或改变• 3、单体接上支链• 1、某些单体侧基位置的浮动• 纯粹的热运动• 2、活性部位构象的改变• 与其它分子相互作用时,局部非共价键破坏,重新组合成新的非共价键• 3、变构效应• 生物高分子的变性• 在剧烈条件下,整个分子的大量非共价键破坏 5MPn-<yl• 物大分子的结构可变性是有限度的,超过一定的限度,就会引起生物大分子性质的改变和生物活性的丧失(变性)。
变性是生物大分子高级结构的破坏,引起变性的因素很多,如热、极端pH、高离子强度、脲等破坏氢键的试剂及各种表面活性剂。
• 1)生物大分子的功能特征与共性• 作用的专一性 >M $"3Lf<• 抗体(antibody)与抗原(antigen)• 核酸侧链碱基之间形成的氢键也有专一性υ维系和稳定核酸的空间构象υ与核酸、蛋白质的合成有关(自身复制、转录、识别等)生物体内的识别过程与糖有关 "υ• 作用的配合与协调• 1)生物膜由水和有形物质组成,水占80%,有形物质包括类脂类、蛋白质、少量的糖和微量金属离子等。
• 生物膜的组成• 脂质(主要是磷脂和胆固醇)、蛋白质(包括酶)多糖类,水和金属离子组成等。
• 生物膜是以磷脂、胆固醇和糖脂为主构成的双层脂膜。
生物膜的组成,因膜的种类不同而有很大的差别。
• 1)内嵌蛋白质:蛋白质肽链中亲脂的氨基酸部分嵌入脂质双层,亲水性的氨基酸部分则游离在脂质双层表面,主要是作为转运物质的载体、离子载体、酶或接受活性物质的受体等,约占膜蛋白总量的70~80%。
• 2)表面蛋白质• 附在脂质双层的内侧表面,常组成一种细丝状的肌动蛋白和可结合Ca2+起接触作用的原宁蛋白(troponin)及带有ATP酶的肌球蛋白(myosin)等。
他们可以相互滑动,组成细胞管各种活动的细胞运动器。
• 其它:由微管(tubulin)蛋白链绕聚而成的微管(microtubule)支撑细胞膜。
aO@ nzvL• 注意:不仅表面蛋白可以收缩,内嵌蛋白也可以转动,还可以移动。
• 1)胆固醇以中性脂的形式分布在双层脂膜内,对生物膜中脂类的物理状态有一定的调节作用,有利于保持膜的流动性和降低相变温度。
脂肪酸的不饱和程度越高或局部温度上升,流动性越大。
• 糖类• 生物膜中含有一定的寡糖类物质。
它们大多与膜蛋白结合,少数与膜脂结合。
• 糖类在膜上的分布是不对称的,全部都处于细胞膜的外侧。
生物膜中组成寡糖的单糖主要有半乳糖、半乳糖胺、甘露糖、葡萄糖和葡萄糖胺等。
• 生物膜中的糖类化合物在信息传递和相互识别方面具有重要作用。
• 糖脂糖脂主要分布在细胞膜外侧的单分子层中。
动物细胞膜所含的糖脂主要是脑苷脂• 3)金属离子:主要包括Ca2+、Mg2+等离子,量很少,但却是膜上一些酶或受体功能活动的关键,具有触发细胞各种功能活动的作用。
•△膜上的专属性离子载体、离子泵、酶或原宁蛋白等过渡性结合,有些生物膜中还有专门结合储存离子的部位,如肌浆网膜内侧面可与钙离子专门结合、贮存等• 1)主动运送的机理是:• 在膜一侧的待运离子先同膜上的载体蛋白结合,形成相应的复合物,在到达运送部位后, 与之偶联的ATP分解放出能量, 使复合物变构, 导致载体与被运药物亲合力降低, 将药物释放于膜的另一侧。