PCR技术的应用ppt课件

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Ct值的含义:每个反应管内的荧光信号到达设定的 阈值时所经历的循环数。
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特别说明: 1、荧光探针和荧光染料:
分别用探针或荧光染料与特异序列结合来指示扩增产物,前者特异性高, 后者操作简单。
TaqMan探针:寡核苷酸探针,荧光基团连接在5’端,淬灭基因连在3’
端。5’端荧光基团吸收能量后转移给临近的3’端淬灭基团,发生共振能 量转移(FRET),只要探针完整,能量就会被淬灭。
GC含量;避免连续相同碱基排列或开成回纹结构;避免形成引 物二聚体。 5、Tm=(G+C)×4+(A+C) ×2 6、primer 5.0 7、模板纯度:不一定要纯,但要确定不含蛋白变性剂、DNA酶、 Mg2+螯合剂等。模板量(100ng/100μl)
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PCR类型:
普通PCR RT-PCR TAIL-PCR Real-time PCR 数字PCR
循 环
56℃ 72℃
退火 延伸
目的:引物先与模板匹配 1-2 min 目的:聚合酶在引物3’端加
核苷酸,合成新链
12℃ 保存
特异性强、灵敏度高、快速、简便
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循环次数 1 2 3 20 30
DNA数量 2 4 8
1048576 1073741824
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特殊说明:
1、Taq酶:具有5’→3’聚合酶和外切酶活性,无3’→5’外切酶活性, 不
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原理:在PCR反应体系中加入非特异性的荧光染料(如 SYBR GREEN 1)或特异性的荧光探针(如
Taqman探 针),利用荧光信号累积实时检测整个PCR过程,
再 通过标准曲线或内参基因对未知基因进行定量分析 的方法。

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实验操作人员应接受专业培训,熟悉安全操作规程,避免在实验过程 中受伤或感染。
07
总结与展望
Pcr技术的总结
PCR技术的原理
PCR是一种在生物实验室中广泛应用的分子生物学技术,其基本原理是通过特定的DNA 聚合酶,在DNA双链之间进行热循环,从而实现DNA的快速扩增。
PCR技术的应用领域
PCR技术在许多领域都有广泛的应用,包括遗传学、医学、生物技术和农业等。通过PCR 技术,科学家们可以快速、准确地检测和鉴定DNA序列,这对于遗传疾病的诊断、生物 多样性的研究和基因工程等领域具有重要意义。
安全问题
生物安全
PCR实验涉及的生物材料可能具有传染性,因此需要采取适当的生物 安全措施,如穿戴个人防护装备、实验室内消毒等。
废物处理
实验产生的废物应按照相关规定进行妥善处理,避免对环境和人类健 康造成危害。
防止污染
PCR实验过程中应采取措施防止污染,如设置阴性对照、定期检测实 验室环境等。
人员安全
PCR技术的优缺点
PCR技术具有高灵敏度、高特异性和操作简便等优点,但也存在一些局限性,如对模板 DNA的纯度要求高、易受污染等。因此,在实际应用中,需要根据具体情况选择合适的 PCR方法。
Pcr技术的发展趋势
要点一
提高灵敏度和特异性
随着基因组学和分子生物学研究的深 入,对PCR技术的灵敏度和特异性提 出了更高的要求。因此,未来的PCR 技术需要进一步提高其灵敏度和特异 性,以满足更广泛的研究和应用需求 。
05
Pcr技术的拓展应用
基因克隆与表达
基因克隆
通过PCR技术,科学家可以快速、准 确地获取特定基因片段,为基因克隆 提供基础。
基因表达
利用PCR技术,可以检测基因在不同 条件下的表达水平,有助于理解基因 功能和调控机制。

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数据处理
对实验数据进行统计分析,如计算Ct值、分析扩增效率等。
04
pcr技术的优化和注意事项
优化pcr反应条件
01
02
03
温度循环
优化pcr反应的变性、退 火、延伸等温度循环,以 提高扩增效率和特异性。
镁离子浓度
调整镁离子浓度,以获得 最佳的pcr扩增效果,镁 离子浓度过高或过低都可 能影响扩增效率。
02
pcr技术的基本原理
核酸的复制
核酸是生物体的遗传物质,负 责携带和传递遗传信息。
在细胞内,核酸通过复制传递 遗传信息,确保遗传信息的稳 定性和连续性。
核酸复制过程中,DNA双链解 开,以母链为模板,r技术基于核酸的复制原理, 通过特定的引物和耐高温的DNA 聚合酶,在体外实现核酸的快速
数字PCR技术具有高灵敏度和高特异性,但设备成本较高;实时PCR技术具有操作简便和 成本较低的优点,但在灵敏度和特异性方面可能略逊于数字PCR技术。
pcr与其他技术的结合
pcr技术与测序技术的结 合
通过将PCR技术和测序技术相结合,可以实 现高通量、高精度的核酸分子检测和分析, 有助于深入研究和理解基因组学和转录组学 等领域。
pcr技术的应用领域
遗传病诊断
通过检测特定基因的突变,对遗传病 进行早期诊断和产前诊断。
微生物检测
用于检测和鉴定细菌、病毒和其他微 生物,在食品安全、环境保护和疾病 控制等领域有广泛应用。
古生物学和考古学
用于分析古代生物遗骸的DNA,研 究物种进化和人类起源。
法医学
用于鉴定个体身份、亲子关系和生物 样本的来源,在犯罪调查和法庭科学 中具有重要应用价值。
扩增。
pcr反应体系中包含模板DNA、 引物、dNTPs和耐高温的DNA聚

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遵循标准化操作流程,确保实验 的一致性和准确性。
数据分析
对实验数据进行统计分析,识别 并排除异常值。
质量控制标准
制定质量控制标准,对实验结果 进行评估和监测。
04
PCR技术发展与展望
PCR技术的改进与创新
1 2
优化反应体系
通过调整反应成分和条件,提高PCR的特异性和 灵敏度,降低背景噪音。
新型PCR技术的开发
PCR技术的原理
双链DNA加热变性
在高温下,双链DNA解旋为单链 DNA。
引物与单链DNA结合
根据已知序列设计特异性引物, 在低温下与单链DNA结合。
DNA聚合酶催化延伸
在适宜温度下,耐高温的DNA聚 合酶催化引物沿着单链DNA延伸
,合成互补链。
重复加热变性、退火和延伸
反复进行变性、退火和延伸,实 现DNA片段的指数级扩增。
产物检测与鉴定
电泳检测
可以使用琼脂糖凝胶电泳 或聚丙烯酰胺凝胶电泳检 测PCR产物。
荧光检测
可以使用荧光染料或探针 检测PCR产物。
测序鉴定
如果需要,可以对PCR产 物进行测序,以确定其序 列是否与预期一致。
03
PCR实验注意事项
实验安全
实验室安全须知
确保实验室内环境整洁,避免交 叉污染。
个人防护措施
THANKS
食品安全检测
利用PCR技术检测食品中的微生物、毒素和污染 物,保障食品安全。
PCR技术的研究方向
提高灵敏度和特异性
进一步优化PCR技术,提高检测的灵敏度和特异性,降低假阳性 或假阴性的可能性。
标准化和质量控制
建立PCR技术的标准化和质量控制体系,确保实验结果的可靠性和 可比性。

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引物二聚体
总结词
引物二聚体是指引物之间形成的二聚体,影响PCR扩增效率。
详细描述
引物二聚体的形成可能由于引物设计不当、引物浓度过高、退火温度过低等原因 导致。为解决这一问题,可以优化引物设计,降低引物浓度,适当提高退火温度 等措施。
05
PCR 实验设计
选择合适的引物
引物长度
根据基因序列选择合适的引物长度, 通常为18-30bp。
设置PCR 仪温度循环
设置变性温度
将PCR仪温度设置为95℃,进 行变性处理,使DNA双链解开
成单链。
设置退火温度
根据引物特异性,设置适当的 退火温度,使引物与单链DNA 结合。
设置延伸温度
设置适当的延伸温度,使DNA 聚合酶从引物起始合成DNA链 。
设置循环数
根据实验目的和DNA片段大小 ,设置适当的循环数,确保目
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目录
• PCR 简介 • PCR 原理 • PCR 实验步骤 • PCR 常见问题与解决方案 • PCR 实验设计 • PCR 数据分析
01
PCR 简介
PCR 定义
• 聚合酶链式反应(PCR):一种在生物体外复制特定DNA的分子生物学技术,通过DNA聚合酶的作用,以一对寡核苷酸引 物定向导引下完成特定DNA的片段扩增。
在PCR中,DNA的复制是通过特定的引物和聚合酶,在特定的温度和循环次数下完 成的。
引物与模板DNA结合后,聚合酶从引物的3’端开始合成新的DNA链。
聚合酶与引物
聚合酶是生物体内负责DNA复 制的酶,具有耐高温的特性。
在PCR中,常用的聚合酶有Taq 酶和Tfl酶等。
引物是人工合成的短片段DNA ,能够与目标DNA特异性结合 ,为聚合酶提供起始点。

pcr技术课件ppt简短

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通量PCR检测。
pcr技术的应用范围
01
02
03
基础研究
基因克隆、基因表达、基 因组测序、单核苷酸多态 性(SNP)检测等。
医学诊断
感染性疾病、遗传性疾病 、肿瘤等疾病的诊断。
生物多样性研究
物种鉴定、种群遗传学分 析、生态学研究等。
02
CATALOGUE
pcr技术的基本步骤
样本准备
样本类型
选择合适的样本类型,如 血液、组织等,以便后续 实验操作。
根据目的基因序列,选择特异性好、扩增 效率高的引物。
确认模板DNA的质量
设置合理的反应体系
确保使用的模板DNA无降解、无污染,浓 度和纯度适中。
根据引物、模板和PCR仪的规格,设置合理 的反应体系。实验Βιβλιοθήκη 的注意事项控制好反应温度和时间
PCR反应中,每个温度点的反应时间和升温/降温速度应保持一致。
避免出现非特异性扩增
将DNA模板、引物、dNTPs、酶等 试剂加入PCR反应管中。
进行PCR扩增
将PCR反应管放入PCR仪中,按照设 定的程序进行扩增。
产物检测和分析
收集PCR扩增产物,进行电泳分析或 荧光定量PCR等检测方法,确定目标 基因序列是否被成功扩增。
实验后处理
数据分析和结论
对实验数据进行统计和分析,得出结论。
将用过的引物和模板妥善储存,以备后续实验使 用。
仪器的维护与保养
定期对PCR仪进行维护和保养,确保设备的正常 运行。
05
CATALOGUE
pcr技术的优缺点
优点
01
02
03
04
灵敏度高
PCR技术可以检测出微量的 DNA,灵敏度非常高。

PCR技术在医学检验中应用PPT

PCR技术在医学检验中应 用
PCR技术是一种用于扩增DNA片段的技术,通过反复进行离子交换、退火和 DNA复制等步骤,可在短时间内从细胞或病原体中快速检测和鉴定特定基因 序列。
什么是PCR技术
PCR技术(聚合酶链式反应)是一种体外扩增DNA的方法,可以从少量DNA 片段扩增为大量。它由三个关键步骤组成:变性、退火、延伸。
乙肝病毒
PCR技术能够检测乙肝病毒的DNA,及早发现感染者,进行干预治疗,降低乙肝炎的发病 和死亡率。
PCR技术在遗传病筛查中的基因 突变,评估遗传病风险,并提供 遗传咨询和辅助生育建议。
人类基因组计划
分子诊断检测
PCR技术在人类基因组计划中发 挥重要作用,加速研究和理解人 类遗传变异对健康和疾病的影响。
PCR技术的原理
PCR技术的原理基于DNA聚合酶的特殊性质,通过循环反应的方式,在不断调整温度条件下,实现DNA片段 的扩增和复制。
PCR技术在医学检验中的应用
1
疾病诊断
PCR技术可用于检测常见疾病的致病因子,如心血管病、肿瘤、传染病等,为 早期诊断和治疗提供重要依据。
2
个体化治疗
PCR技术能够检测个体基因差异,为临床治疗制定个体化方案,提高疗效和减 少不良反应。
PCR技术作为分子诊断的主要手 段,广泛应用于遗传病和染色体 疾病的检测和诊断。
PCR技术的优势和局限
优势
• 高灵敏度和特异性 • 快速和可靠的结果 • 扩增效率高
局限
• 容易受到污染 • 复杂的试剂和仪器要求 • 对样本质量和处理要求高
结论和要点
PCR技术在医学检验中发挥着重要的作用,可用于疾病诊断、个体化治疗、病毒检测和遗传病筛查。它具有 高灵敏度和特异性,但也存在污染和仪器要求高的局限。

《PCR临床应用》课件


案例二:遗传疾病的pcr诊断
总结词
早期诊断、准确率高
详细描述
PCR技术在遗传性疾病的诊断中具有重要作用。通过对特定基因的扩增和检测,可以在早期发现遗传 性疾病的存在,提高诊断的准确率,为患者及早接受治疗提供依据。
案例三:肿瘤标志物的pcr检测
总结词
灵敏度极高、有助于肿瘤早期发现
详细描述
PCR技术可以用于检测肿瘤标志物,如癌胚抗原、甲胎蛋白 等。通过对肿瘤标志物的扩增和检测,可以灵敏地发现肿瘤 的存在,有助于肿瘤的早期发现和治疗。
对样品质量要求高
对于某些降解严重或质量差的 样品,PCR可能无法获得理想
的结果。
PCR技术的前景展望
新技术的发展
个性化医疗
随着新技术如数字PCR、实时荧光定量PCR 等的出现,PCR技术的应用将更加广泛和精 确。
随着基因组学的发展,PCR技术有望在个性 化医疗领域发挥重要作用,为患者提供更 加精准的治疗方案。
特点
高灵敏度、高特异性、高扩增效率。
PCR技术原理
双链DNA在高温下解旋为单链,引物与单链DNA模板结合,在DNA聚合酶的作 用下,按照碱基互补配对原则合成新的DNA链。
通过多次循环,使目的DNA片段在短时间内获得极大程度的扩增。
PCR技术的发展历程
1971年
1985年
1988年
1993年
Kary Mullis发现Taq酶 。
PCR技术具有很好的可重复性 ,实验结果稳定可靠。
PCR技术的局限性
成本高
PCR技术需要特定的仪器和试 剂,成本较高,对于一些资源
有限的地方可能难以普及。
易污染
PCR技术对实验操作要求高, 如果操作不慎,容易造成交叉 污染,影响实验结果。

生物检测技术-PCR技术PPT


引物
根据需要扩增的序列长度和特异性要 求,确定引物的浓度和种类。
PCR扩增及产物分析
扩增
在PCR仪中进行扩增反应,设置适当的温度和循环次数,使DNA片 段得以扩增。
电泳分析
将扩增产物进行电泳分离,通过染色或荧光标记等技术对产物进行 分析和检测。
结果判断
根据电泳结果判断PCR扩增是否成功,并对产物进行定性或定量分析。
3
引物合成
将设计好的引物交由专业的引物合成公司进行合 成,得到可用于PCR反应的引物。
反应体系的组成
DNA聚合酶
选择高活性、高保真度的DNA聚合 酶,确保PCR扩增的准确性和特异性。
dNTPs
提供PCR所需的四种脱氧核苷酸,即 dATP、dCTP、dGTP和dTTP。
缓冲液
提供适宜的酸碱度和离子浓度,维持 DNA聚合酶的活性。
基因突变和突变的检测
基因突变检测
PCR技术可以用于检测基因突变,通过设计特定的引物,可以扩增特定的DNA片段,通过比较正常和异常序列的 扩增产物,可以检测出基因突变的位置和类型。
突变筛选
利用PCR技术可以对大量样本进行突变筛选,通过设计针对特定突变的引物,可以对大量样本进行高通量的突变 检测,有助于疾病的早期发现和治疗。
快速高效
PCR技术能够在短时间内完成DNA的大规模扩增,大大提高了检测效 率。
操作简便
PCR技术流程相对简单,易于操作,使得它在实验室中得到了广泛应 用。
缺点
成本较高
PCR技术所需的仪器、试剂等成本较高, 对于一些经费有限的实验室来说可能是
一个负担。
对样品质量要求高
PCR技术的灵敏度使得其对样品质量 要求较高,样品中微小的杂质或污染

PCR技术及其应用ppt课件


体内DNA的复制体系
5’ 3’
拓扑异构酶 解旋酶类 SSB
DNA聚合酶(I II III)
引物 dNTP Mg2+
Mullis的PCR构思
引物 DNA聚合酶 DNA聚合酶 引物
特定DNA片段
耐热DNA聚合酶
Taq DNA聚合酶(thermus aquaticus)
(%)
100
酶 80 活 60 性 40
(2)引物长度以15-40 bp为宜。
(3)碱基尽可能随机分布,G+C占40-60%。
(4)引物内部避免形成二级结构。
(5)两引物间避免有互补序列。
(6)引物3’端为关键碱基;5’端无严格限制。
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15
(3)延伸 70-75℃,一般为72℃ 延伸时间由扩增片段长度决定
(4)循环次数 主要取决于模版DNA的浓度 一般为25-35次 次数过多:扩增效率降低 错误掺入率增加
PCR的应用
1、特定DNA片段(基因、调控序列)的鉴定、分离 或制备。
A、DNA
B、cDNA
2、基因表达分析(原位、离体)
A、基因是否表达
B、基因表达水平高低
3、基因突变
基因克隆(RT-PCR)
逆转录酶
mRNA 杂交双链
DNA聚合酶
cDNA
PCR扩增
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18
原位PCR分析基因表达的组织特异性
浓度过高易产生错误碱基的掺入,浓度过低则降低反 应产量
dNTP可与Mg2+结合,使游离的Mg2+浓度下降,影响DNA 聚合酶的活性。
(5) Mg2+
Mg2+是DNA聚合酶的激活剂。浓度为0.5-2.5mmol/L。 Mg2+浓度过低会使Taq酶活性丧失、PCR产量下降; Mg2+过高影响反应特异性。 Mg2+可与负离子结合,所以反应体系中dNTP、EDTA等 的浓度影响反应中游离的Mg2+浓度。
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● 利用差示PCR同样可以做mRNA的定量。与DNA模板含量测定基本相似,所不同的 是首先应提取总RNA,加入一个与mRNA 3 7区互补的引物,在逆转录酶的作用下, 合成cDNA,其余的操作与DNA定量相同。利用PCR可以对tuRNA(如进行性肌萎缩蛋 白mRNA)作比较准确的定量,甚至连Northern印迹杂交未能发现的1TIRNA都可以得 到检测。
.
6、PCR技术在法医学鉴定中的应用
● PCR技术用于生物物证的分析,与RFLP技术相比 ,具有操作简单、省时、成本低廉的优点,还可 避免同位素分析所带来的一系列问题,如放射性 污染、操作时的人身防护以及材料来源困难等。 近年来,在PCR技术基础上,又发展了许多基因 位点分型系统,用于法医物证的DNA分析,其中 发展最为完善并得到公认的是HLA—DQa位点的 分型系统,此系统应用PCR技术扩增HLA—DQa 基因特异片段,结合等位基因特异性寡核苷酸探 针杂交技术检测HLA—DQa位点的4个等位基因 ,有特异性好、灵敏度高、结果稳定可靠等优点 ,成为国际上法医科学中应用PCR技术进行个人 识别和亲子鉴定最有效的方法。

由于PCR技术具有高特异性、高灵敏度、
操作快速、简便、对样本要求低等特点,加之它
能与多种分子生物学技术配合使用,PCR技术日
益成为遗传病诊断、发病机理的研究等方面最有
效、最可靠的方法之一。PCR技术的出现为快速
、准确地检测人类遗传病开辟了新途径

.
5、PCR在骨髓移植HLA-D位点配型中的应用
● HLA—DRp位点配型方法,即PCR指纹图,该技术是的 DNA经PCR扩增HLA—DR卢区基因的高度多态区域,在 分别扩增后将供、受者产物混合,混合后进行2个PCR循 环,扩增产物经12%的聚丙烯酰胺凝胶电泳,照相后分析 不同个体的指纹图型。当HLA-DRfl基因相合时,其基因 产物在聚丙烯酰胺凝胶中可产生一致的带型,这种多条带 型的产生是由于各种HLA单倍体中的HLA-DRfl基因的不 同亚型以及假基因上的多态性所致。当PCR最后两个匹配 循环退火时,这些基因的单链DNA复性,DRfl基因相同 的个体形成同型双链,而不同的DRfl基因之间的不同序列 形成异型双链,因此,混合匹配可进一步证实HLA—DRfl 是否相合。
PCR技术的应用
.
1、PCR隆和分离是分子生物学和细胞生 物学研究中必不可少的手段。运用PCR技 术进行基因克隆和亚克隆比传统的方法具有 更大的优点。由于PCR可以对单拷贝的基 因放大上百万倍,产生微克(pg)级的特异 DNA片段,从而可省略从基因组DNA中克 隆某一特定基因片段所需要的DNA的酶切 步骤。
.
2、PCR技术在传染病病原体检测中的应用
● PCR是一种具有高敏感性、且特异性好的靶DNA 快速检测方法,能对前病毒或潜伏期低复制的病 原体特异性靶DNA片段进行扩增检测,只要标本 中含有lfg靶DNA就可检出。可检出经核酸分子杂 交呈阴性的许多标本,而且对标本要求不高,经 简单处理后就能得到满意扩增。可做到早期及时 诊断,对防止传染病流行有重要意义。
.
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.
3、PCR在肿瘤相关基因检测中的应用
● 寡核苷酸探针杂交法 ● 限制性内切酶切片段长度多态性(RFLP)技术 ● PCR—RFLP技术 ● RNA酶A错配清除法 ● 核酸序列分析法
.
4、PCR技术在遗传病早期诊断中的应用
● 基因诊断技术的发展是现代医学发展的一个重要 标志,它从基因水平开辟了诊断学新领域。聚合 酶链反应(PCR)技术是基因诊断主要技术之一,以 PCR为基础的各种分子生物学新技术在遗传病的 基因诊断等方面得到广泛的应用。
.
7、PCR在进化分析中的应用
● rRNA基因有“化石”之称,PCR扩增并分析其 序列,可分析比较界或门分类水平上的生物。通 常,细胞核小亚基rDNA的序列进化相对较慢, 主要用于种系关系较远的生物比较研究;而线粒 体rRNA基因进化非常快,可在科目水平上进行不 同生物的比较;转录的间隔区序列和核rRNA的基 因间隔区重复单位序列进化最快,可用于同属异 种或不同群之间的分析比较。
.
四:用于基因定量
● 应用PCR技术可以定量监测标本中靶基因的拷贝数,这在研究基因的扩增等方面具有 重要意义,这种方法称为差示PCR(differential PCR)。它是将目的基因和一个单拷贝 的参照基因置于同一个试管中进行PCR扩增。电泳分离后呈两条区带,比较两条区带 的丰度;或在引物5’端标记上放射性核素后,通过检测两条区带放射性强度即可测出 目的基因的拷贝数。利用差示PCR还可以对模板DNA(或RNA)的含量进行测定,在一 系列PCR反应中,分别加入待测模板DNA和参照DNA片段。参照DNA片段基本上按待 测DNA的方式进行构建,但增加了一小段内部连接顺序,这样使得两种DNA片段的 PCR产物可在凝胶电泳上分开。由于这两种不同的DNA片段可以在同一种寡核苷酸引 物作用下同步扩增,因此可以避免因使用不同的引物所引起的可能误差。这两种扩增 产物的相对量就反应了在起始反应混合物中的目的DNA和参照DNA的相对浓度。
.
二:重组PCR
在分子生物学研究中常常需要将两个不同的 基因融合在一起。通过PCR反应可以比较容 易地实现这一目的。
.
三:DNA序列的测定
目前广泛采用的DNA测序方法有化学法和双脱氧 法两种,它们对模板的需要量比较大。传统的模 板制备方法是将含目的基因的DNA片段进行酶切 ,建立基因库,筛选克,并亚克隆到M13噬菌体 载体上,经噬菌体产生单链DNA。这是一项比较 复杂的工作。利用PCR方法可以比较容易地测定 位于两个引物之间的序列。
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