UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息

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uniprot 数据库格式介绍

uniprot 数据库格式介绍

一、Uniprot 数据库简介Uniprot 数据库是一个重要的蛋白质序列数据库,提供了丰富的蛋白质及其功能信息。

Uniprot 数据库由三个不同的部分组成,分别是UniprotKB、Uniparc 和Uniref。

UniprotKB 是最为广泛应用的部分,包含了蛋白质的序列及其相关的注释信息。

Uniparc 是一个备份数据库,存储了由不同来源提供的蛋白质序列。

Uniref 则是对UniprotKB 中的相似蛋白进行了聚类和注释,提供了更加全面和详细的信息。

二、Uniprot 数据库的格式介绍1. UniprotIDUniprotID 是Uniprot 数据库中用来唯一标识一个蛋白质的一组字母和数字。

每一个UniprotID 对应着一个蛋白质的基本信息和功能注释。

用户可以通过UniprotID 来快速查找感兴趣的蛋白质,获取其相关信息。

2. Entry nameEntry name 是Uniprot 数据库中的另一种标识蛋白质的方式。

每一个Entry name 对应着一个蛋白质的通用名,方便用户进行简单的查询和浏览。

3. Protein nameProtein name 是Uniprot 数据库中对蛋白质的命名,包括了其组成成分和功能。

Protein name 的格式通常是由多个部分组成,包括了蛋白质的家族、亚家族、结构域和功能等信息。

4. Gene namesGene names 是Uniprot 数据库中记录的蛋白质对应的基因名称。

每一个蛋白质都可以由一个或多个基因进行编码,因此在Uniprot 数据库中也会提供蛋白质对应的基因名称。

5. OrganismOrganism 记录了蛋白质来源的生物种属信息。

在Uniprot 数据库中,蛋白质来源于不同的生物种类,因此Organism 字段可以帮助用户区分不同来源的蛋白质。

6. SequenceSequence 是Uniprot 数据库中记录蛋白质序列的部分。

uniprot

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uniprot全球蛋白资源数据库UniProt 收藏UniProt 是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互联系的数据库,也是目前为止收录蛋白质序列目录最广泛、功能注释最全面的一个数据库。

UniProt 是由欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute)、美国蛋白质信息资源(Prontein Information Resource)以及瑞士生物信息研究所(Swiss Institute of Bioinformatics)等机构共同组成的UniProt协会(UniProt Consortium)编辑、制作的一个信息资源,旨在为从事现代生物研究的科研人员提供一个有关蛋白质序列及其相关功能方面的广泛的、高质量的并可免费使用的共享数据库。

UniProt 是一个向所有使用者免费开放的数据库,全球科研人员都可以登陆网站/doc/3d6064972.html, 浏览并下载这些资料。

借助它,科研人员可以对目的蛋白进行交互式分析或特定的分析。

1 UniProt数据库的构成UniProt 数据库由UniProt 知识库(UniProtKB )、UniProt 档案(UniParc )、UniProt 参考资料库(UniRef)以及UniProt元基因组学与环境微生物序列数据库(UniMES)构成。

1.1 UniProt知识库(UniProtKB)UniProt 知识库是一个专家级的数据库,它可以通过与其它资源进行交互查找的方式为用户提供一个有关目的蛋白质的全面的综合信息。

UniProtKB包括两个组成部分:UniProtKB/Swiss-Prot与UniProtKB/TrEMBL。

1.1.1 UniProtKB/Swiss-ProtUniProtKB/Swiss-Prot 主要收录人工注释的序列及其相关文献信息和经过计算机辅助分析的序列。

这些注释都是由专业的生物学家给出的,准确性无需置疑。

Uniprot数据库介绍及信息检索下载指南

Uniprot数据库介绍及信息检索下载指南

UniProt数据库一、UniProt数据库简介蛋白质组常用数据库——UniProt数据库,是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。

它由Swiss-Prot、TrEMBL 和PIR-PSD三大数据库的数据整合而成,数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列,并包含了大量来自文献的蛋白质生物功能的信息。

一般蛋白质组搜库首选数据库也是UniProt,所以对于通过UniProt库搜库的组学数据,可以在此网站中进行蛋白功能查询。

UniProt数据库可以提供的信息包括蛋白功能描述、GO条目、细胞定位、组织特异性表达情况、生理病理情况描述、互作蛋白、Domain、翻译后修饰位点等信息。

蛋白的信息描述段落均会标出引用文章,并且可以跳转到PubMed界面进行浏览。

UniProt 数据库由UniProt 知识库(UniProtKB )、UniProt 档案(UniParc )、UniProt 参考资料库(UniRef)以及UniProt元基因组学与环境微生物序列数据库(UniMES)构成。

UniProtKB全称 UniProt Knowledgebase(UniProt知识库)它是经过专家校验的数据集,主要由两部分组成:UniProtKB/Swiss-Prot (包含检查过的、手工注释的条目) 和 UniProtKB/TrEMBL (包含未校验的、自动注释的条目)。

Swiss-Prot 数据库特点高质量的、手工注释的、非冗余的数据集;主要来自文献中的研究成果和E-value校验过计算分析结果。

有质量保证的数据才被加入该数据库!TrEMBL数据集包含高质量的计算分析结果,一般都在自动注释中富集,主要应对基因组项目获得的大量数据流以人工校验在时间上和人力上的不足。

它能注释所有可用的蛋白序列。

在三大核酸数据库(EMBL-Bank/GenBank/DDBJ)中注释的编码序列都被自动翻译并加入该数据库中。

它也有来自PDB数据库的序列,以及Ensembl、Refeq和CCDS基因预测的序列。

第三讲:Uniprot蛋白数据库及其他蛋白质分析工具

第三讲:Uniprot蛋白数据库及其他蛋白质分析工具

第三讲Uniprot蛋白数据库及其他蛋白质分析工具2013/03/19Uniprot数据库•Uniprot(Universal protein resource)是蛋白质序列的联合数据库。

–SIB: Swiss Institute of Bioinformatics–EBI: European Bioinformatics Institute–PIR: Protein Information Resource–2002年三家联合形成了UniprotSwiss‐Prot•1986年建立•低冗余度•功能导向•由Swiss Institute of Bioinformatics 和EBI共同建立并维护TrEMBL •TrEMBL=Translation from EMBL •EBI建立并维护•是一个自动数据库•冗余度高,可信度低UniprotKB•部分经过专家注释的数据库•具有很高的可信度•包括两部分UniprotKB/Swiss‐Prot和UniprotKB/TrEMBL•UniprotKB/Swiss‐Prot包括539,165条序列•UniprotKB/TrEMBL包括29,769,971 条序列•具有非冗余性Uniparc•非冗余性•给予序列的特异性,非同一物种的相同序列被认为是同一个蛋白质•每一条序列被給予一个特异的编号Uniparc•INSDC EMBL‐Bank/DDBJ/GenBank nucleotide sequence databases•Ensembl•European Patent Office (EPO)•FlyBase•H‐Invitational Database (H‐Inv)•International Protein Index (IPI)•Japan Patent Office (JPO)•Protein Information Resource (PIR‐PSD)•Protein Data Bank (PDB)•Protein Research Foundation (PRF) RefSeq•Saccharomyces Genome Database (SGD)•The Arabidopsis Information Resource (TAIR)•TROME•US Patent Office (USPTO)•UniProtKB/Swiss‐Prot, UniProtKB/Swiss‐Prot protein isoforms, UniProtKB/TrEMBL •Vertebrate and Genome Annotation Database (VEGA)•WormBaseUniRef•包括UniRef100,UniRef90和UniRef50•分别包括了相似度为100%,90%和50%的序列的总和UniMES•UniMES是metagenomics和环境生物学的序列数据库•其中的数据可能是未知的•UniMES提供UniRef类似的聚类功能Uniprot的应用•在质谱领域有广泛的应用–因为其序列的非冗余性–举例:质谱分析–举例:Pyruvate: ferredoxin oxidoreductasesubunit alpha from Pyrococcus furiosus蛋白质的结构域‐‐二级库• 根据序列比对的策略不同存在较多的蛋白质序 列二级库,比如ProSite,PRINT, ProDom, Pfam,  Gene3D,PANTHER, PIRSF,Tigrfams等等 • 目前诸多蛋白质序列二级库已经被整合到 Interpro数据库中 • 利用Interpro可以查找并鉴定蛋白质的结构 域,可能的功能基团以及预测其生理功能等 • 举例:查询actin‐like protein,找到其三维结构 和功能 • 举例:查询4Fe‐4S cluster binding site蛋白质序列分析‐interproscan蛋白质的保守结构域• 举例:利用interpro分析gene symbol为 MA0658的蛋白质,并预测它可能结合什么 cofactorpI和分子量的预测• /compute_pi/• 举例:预测大肠杆菌中WrbA的pI和分子量对信号肽的预测• SignalP 4.0 • http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ • 利用神经网络和HMM模型预测信号肽 • VKLIMFLLMVPLFSYLAAASLRVLSPNPASCDSPEL GYQCNSETTHTWGQYSPFFSVPSEISPSVPEGCR对膜蛋白和跨膜区域的预测• 一般来说是一个20AA长的alpha helix • TMpred • /software/TMPRED_f orm.html • TMHMM • http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/ • msyntslgls enivaalcyp vgwlsglffl llerknkfvr fhamqsvllf mpialfiflv awiptigwfi adgagmtaml lilipmymaf rgskfkipii gniaynfayg eExPASy• SIB运作的一个蛋白质专业网站蛋白质结构和功能的分析与预测Blast寻找相似 蛋白功能 利用Uniprot 分析结构域 分析蛋白质 的位置 利用Interpro 分析结构域 分析蛋白质 的MW和pI 已知序列 阅读相似蛋 白的文献提出蛋白质 功能的假说已知名称寻找序列。

uniprot基因组功能注释

uniprot基因组功能注释

文章标题:解读Uniprot基因组功能注释:深度解析和个人观点1. 引言在生物信息学和基因组学领域,Uniprot数据库是一个重要的资源,它包含了大量关于蛋白质序列和功能的信息。

其中,Uniprot基因组功能注释是指对基因组中每个基因所编码蛋白质的功能进行详细描述和注解。

本文将深入解读Uniprot基因组功能注释,并结合个人观点进行探讨。

2. Uniprot基因组功能注释的概念Uniprot是一个综合性的蛋白质数据库,它包括了各种生物种类的蛋白质序列、结构、功能和相关信息。

在Uniprot中,基因组功能注释是通过对基因对应的蛋白质序列进行实验和计算分析,从而确定其功能、结构和相互作用等信息,从而为研究人员提供了重要的生物信息学资源。

3. 深度评估Uniprot基因组功能注释的价值Uniprot基因组功能注释为研究人员提供了丰富的蛋白质功能信息,便于研究人员对基因组中蛋白质的功能进行深入了解和分析。

通过Uniprot的功能注释,研究人员可以更好地理解蛋白质与生物学过程和疾病的关联,为基因功能研究、生物医学研究以及新药研发提供了重要的数据支持。

4. 广度评估Uniprot基因组功能注释的实际应用在生物信息学领域,Uniprot基因组功能注释广泛应用于基因本体学、蛋白质相互作用、基因突变功能预测等研究领域。

研究人员可以通过Uniprot的功能注释数据,结合其他生物信息学工具和数据库,开展蛋白质结构预测、功能预测、基因组比较等研究,从而深入了解基因组中蛋白质的功能和相互关系。

5. 总结与回顾Uniprot基因组功能注释作为生物信息学领域重要的研究资源,对于理解基因组和蛋白质功能具有重要意义。

通过深度和广度的评估,我们可以更好地认识到Uniprot的功能注释对于生物学研究和应用具有深远影响。

在未来的研究中,可以进一步扩展Uniprot功能注释的内容和应用范围,使其成为更加综合和完善的生物信息学资源。

6. 个人观点与理解作为文章写手,我认为Uniprot基因组功能注释是非常重要的生物信息学资源,它为研究人员提供了丰富的蛋白质功能信息,有力推动了基因功能研究和生物学研究的发展。

uniprot蛋白定位_概述及解释说明

uniprot蛋白定位_概述及解释说明

uniprot蛋白定位概述及解释说明1. 引言1.1 概述蛋白质是生物体中具有重要功能的分子,其定位在细胞内发挥着至关重要的作用。

Uniprot蛋白定位是一种通过收集和整理蛋白质定位相关信息的数据库,为研究者提供了丰富的数据资源和工具,帮助他们深入了解蛋白质在细胞中的位置和功能。

1.2 文章结构本文将以Uniprot蛋白定位为主题,对其概念、应用以及相关信息来源和分类方法进行介绍。

随后,将详细探讨Uniprot数据库中关于蛋白定位的解释说明内容。

最后,给出文章总结并列举参考文献。

1.3 目的本文旨在向读者介绍Uniprot蛋白定位相关知识,并阐明其在生物学研究领域中的重要性和应用价值。

通过阅读本文,读者可以了解到不同细胞器、组织及亚细胞水平上如何对蛋白质进行准确地定位,以及相应的实验技术和方法。

以上所述是“1. 引言”部分内容,请按照这个思路进行详细的撰写。

2. Uniprot蛋白定位概述2.1 Uniprot数据库简介Uniprot是一个综合性的蛋白质序列和功能信息数据库,为科学家提供了全球最大、最全面的蛋白质数据资源。

Uniprot数据库包含了大量已知和预测的蛋白质序列及其相关信息,其中就包括了蛋白质的定位信息。

Uniprot通过整合来自各种来源的实验数据和基因组学研究数据,提供了关于蛋白质定位的重要信息。

2.2 蛋白定位的重要性和应用在细胞中,不同的蛋白质定位在维持正常生理功能中发挥着至关重要的作用。

准确了解蛋白质的定位信息对于揭示其生物学功能、疾病机制以及药物研发具有重要意义。

因此,蛋白质定位是现代生物学研究领域中一个非常活跃且备受关注的方向。

2.3 Uniprot中蛋白定位信息的来源和分类方法Uniprot数据库中关于蛋白定位信息主要来源于实验研究和预测算法。

实验技术如质谱分析、免疫组织化学染色和显微镜技术等可以直接观察或间接鉴定蛋白质的定位。

预测算法可以根据蛋白质的氨基酸序列特征和机器学习方法进行推断。

uniprot使用方法

uniprot使用方法一、什么是UniProt?UniProt(Universal Protein Resource)是一个全球性的蛋白质数据库,致力于提供蛋白质序列、结构、功能和概述相关信息的公共资源。

UniProt 由三个组件组成:UniProtKB、UniRef和UniParc。

其中,UniProtKB是最主要的组件,它包含了三个子数据库:Swiss-Prot、TrEMBL和PROSITE。

1. Swiss-Prot:Swiss-Prot是一个经过人工注释和校正的蛋白质序列数据库,提供了详细的蛋白质功能和注释信息。

2. TrEMBL:TrEMBL是一个基于计算的蛋白质序列数据库,它包含了从未经过详细注释的Swiss-Prot数据集中的序列。

这些序列待进一步注释和校正后会被转移到Swiss-Prot数据库中。

3. PROSITE:PROSITE是一个用于识别蛋白质序列中保守结构域和模体的数据库。

它提供了一系列的蛋白质域和模体的特征模式和描述。

UniRef是一个聚类蛋白质序列数据库,用于提高蛋白质注释效率,减少重复注释。

UniParc是一个蛋白质数据库,用于记录已知和未知蛋白质序列的标识符。

二、使用UniProt的步骤使用UniProt数据库可以帮助研究者快速获取蛋白质信息,查找已知蛋白质、发现新的蛋白质序列和结构等。

以下是使用UniProt的步骤:1. 访问UniProt官方网站,地址为2. 在搜索框中输入要查询的蛋白质名称、序列或标识符等关键词,并选择搜索类型。

3. 点击“搜索”按钮进行搜索。

4. UniProt将会显示与搜索关键词相关的蛋白质信息列表。

用户可以根据需求筛选蛋白质数据库(如Swiss-Prot或TrEMBL)或其他过滤条件,以缩小搜索范围。

5. 点击感兴趣的蛋白质条目,将显示该蛋白质的详细信息页面。

用户可以阅读蛋白质的注释信息、功能描述、序列特征、结构域、文献引用等内容。

6. 若需要进一步了解蛋白质的结构、亚细胞定位等信息,用户可以点击相关链接或标签,以跳转到其他相关数据库或工具。

Uniprot蛋白数据库

这个按钮可以让你用感兴趣的蛋白质序列做blast分析就是查一下在uniprot数据库中还有哪些蛋白质的氨基酸序列与你感兴趣的蛋白质相同或相似别小瞧这个功能知道哪些蛋白与目的蛋白序列相似就有可能知道这个蛋白具有哪些生物系功能如果恰好还有其他相似蛋白的结构信息就能帮助你大致知道这个蛋白的空间结构
Uniprot蛋白数据库
e Columns: 这个可以让您定制蛋白数据列信息,就是自己定制显示哪些列信息,这个内容非常多,包括名称和分类学 信息,序列信息(氨基酸长度,分子量,SNP等),功能信息(EC number, 信号通路,活性位点,各种结合位点等), 相互作用信息,表达信息,亚细胞定位信息, 翻译后修饰,结构,家族及结构域信息, 序列信息.........太多了,感兴趣 的自己进去看吧! b Add to basket: 这个按钮的功能是可以随时将你感兴趣的蛋白质条目加入购物篮以备后期使用,最多可以加400条数 据,呵呵,这个不是超市的购物篮,是不收费的
1、在PDB数据库。 2、通过直接蛋白质测序实验获得的序列,通过Edman降解或MS / MS实验并提交给 UniProtKB / Swiss-Prot。只有约5%的UniProtKB / Swiss-Prot条目包含通过直接蛋 白质测序获得的序列数据(具有关键字的条目列表'Direct protein sequencing')。 3、从文献(ig PRF或其他期刊扫描项目)扫描的序列。 4、从基因预测,没有提交的序列EMBL-Bank / GenBank登录/ DDBJ。 5、序列来源于内部基因预测,在非常特殊的情况下。
首先sp表示,Swiss-Prot数据库是注释精炼的蛋白序列库,它的所有序列都经过了科学家的查阅文献核实(reviewed, manually annotated) 。 P02769是蛋白在uniprot上的ID号,即蛋白的身份证号。 ALBU_BOVIN是蛋白在uniprot上的登录名,跟P02769是一个作用。 Serum albumin是蛋白名称,即蛋白的姓名啦。 OS表示Organism,也就是物种名称,数据库中的物种名称一般为拉丁名称,牛血清白蛋白Bostaurus当然是牛的拉丁。 GN表示gene name,即基因名称 PE表示ProteinExistence,即蛋白的可靠性,PE=1、2、3、4、5分别对应如下,可以看出数字越小可靠性越高: 1. Experimental evidence at protein level 蛋白质水平实验证据 2. Experimental evidence at tran level 转录水平实验证据 3. Protein inferred from homology 从同源蛋白质推断 4. Protein predicted 蛋白质预测 5. Protein uncertain 蛋白质不确定 SV表示SequenceVersion,即序列版本,即蛋白的身份证第二代,第三代…… 这里需要指出的是,除了sp,有时还会出现TR。

uniprot数据库的主要内容

uniprot数据库的主要内容UniProt数据库是目前最大的蛋白质数据库,其中收录了来自世界各地的蛋白质数据。

该数据库涵盖了细菌、植物、真核生物和其他生物的蛋白质数据,并于1985年启动,现有超过160多个国家参与数据提供和收集。

本文将详细讨论UniProt数据库的主要内容。

UniProt数据库所收录的蛋白质数据可以归类为两部分:UniProtKB和UniParc。

其中,UniProtKB是一个包含了比较强的序列验证的数据库,其中收录了来自于NCBI、EMBL、DDBJ等各种蛋白质数据。

UniParc是一个精确的蛋白质序列库,其中收录了来自于UniProtKB以外的其他蛋白质数据,这些数据来自于其他基因组学和蛋白质组学项目,以及其他相关shiye。

UniProt数据库不仅提供了蛋白质序列数据,而且还提供了其他相关的信息,如附加的描述性的概述,以及特定的功能。

这些特定的功能包括:蛋白质的位置、保守度、亚结构、亚细胞定位等等。

此外,UniProt数据库还提供了许多其他的有用的信息,如蛋白质的活动、疾病关联、反应谱等。

此外,UniProt数据库对蛋白质数据进行了分类,分为各种不同的蛋白质家族、子家族、簇和单元。

这种特殊的分类方案让用户可以更加容易地查找某个特定的蛋白质信息。

除此之外,UniProt数据库还提供了一些额外的功能,比如数据可视化、数据分析、序列比对等,这些服务对于研究蛋白质不可或缺。

UniProt数据库同时也提供了一些关于蛋白质结构的有用的信息,比如蛋白质的结构和特性,以及蛋白质分子的三维结构等。

总而言之,UniProt数据库收录了来自许多来源的蛋白质数据,并提供了大量的附加功能,如数据可视化、数据分析、序列比对等。

UniProt数据库涵盖了细菌、植物、真核生物和其他生物的蛋白质信息,可以帮助生物学家们针对各种蛋白质相关的问题进行更有效的研究。

UniProt:蛋白质的全信息数据库

Nucleic Acids Research, 2004, Vol. 32, Database issue D115-D119© 2004 Oxford University PressUniProt:蛋白质的全信息数据库摘要为了给科学界提供一个专门,集中,权威的蛋白质序列和功能的信息资源,瑞士-Prot,TrEMBL 和PIR蛋白质数据库已经合作组成了蛋白质的全信息数据库 (UniProt)。

我们的目的是用广泛的对照和询问接口来提供一个全面的,分类完全的,丰富并且准确的蛋白质序列信息。

中心数据库将有两个部分:符合熟悉的瑞士-Prot(完全手工操作入口)和TrEMBL(使用丰富的自动化的分类,注释和广泛的对照)。

为方便序列查寻,UniProt也提供几个无冗余的序列数据库。

UniProt NREF(UniRef)数据库为高效率的搜寻提供适当的蛋白质的全信息数据库的代表性的子集。

全面的UniProt 档案(UniParc)每天从很多公共来源数据库更新。

数据库那些UniProt接口可在线访问()或者以几个形式下载(ftp:///pub)。

我们鼓励科学界人士向UniProt 提供数据。

介绍近来,瑞士-Prot + TrEMBL和PIR-PSD如同蛋白质数据库不同的序列信息覆盖面和注释优势共存。

2002年,在生物信息科学(SIB)的瑞士研究所和欧洲生物信息科学研究所的瑞士-Prot + TrEMBL 组 (EBI)和蛋白质信息资源(PIR)组织在乔治敦大学医学中心和国家生物医学的研究基金会联合协作。

新联合的组织的主要任务是通过建立一个综合,详细分类,丰富并且准确注释蛋白质序列的优质的数据库和广泛序列对比和询问服务的到科学团体免费接口—knowledgebase来支持生物学的研究。

UniProt 将在组织成员多年合作的坚实基础上建立起来。

UniProt 数据库包括3 个数据库层:1、UniProt 档案(UniParc),通过储存全部可公开得到的蛋白质序列数据供一个稳定,综合,无冗余的序列收集。

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实用生物信息技术课程第3次作业
UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息
姓名________ 学号______________ 组号_____ 日期________年___月___日
1.UniProt蛋白质序列数据库
1)参阅Swiss-Prot和TrEMBL统计报表(Release Statistics),列表说明这两个子库的
总数据量,以及不同蛋白质证据(Protein Existence)的数据条目数。

2)列表说明以下已基本完成基因组测序的重要模式生物和你研究课题相关的物种数
据条目数总数N、已审阅序列条目数Nr、具有蛋白质证据的序列条目数Np、在
参考序列数据库RefSeq中具有mRNA序列的序列条目数Nm、在蛋白质结构数
据库PDB中具有结构的序列条目数Ns。

2.人珠蛋白家族检索
1)写出从UniProt数据库中检索已审阅的人珠蛋白(globin)家族12个亚基的步骤。

2)列表说明这12个珠蛋白的登录号、蛋白质名称、和序列长度。

3)与血红蛋白alpha亚基差异最大的序列是哪个?相同位点百分比?
4)与血红蛋白beta亚基差异最小的序列是哪个?差异位点共多少个?
3.列表说明从UniProt数据库中检索以下序列条目的步骤和结果:
1)所有拟南芥序列
2)已审阅拟南芥序列
3)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据的序列
4)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、且具有跨膜螺旋的序列
5)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋和信号肽的序列
6)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋和信号肽、并具有二硫键的序

7)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋、信号肽、二硫键,且已经测
定三维结构的序列
4.利用高级检索功能,从UniProt数据库中检索你课题相关或最感兴趣的蛋白质,阅读其
注释信息和相关文献,并通过数据库交叉链接,总结该蛋白质的研究进展。

5.序列条目注释信息
1)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目的注释信息包括哪几个主要类别。

2)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目中和序列及序列上不同位点相关的
信息主要包括哪些。

3)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目中和结构相关的信息主要包括哪些。

4)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明数据库交叉链接(Cross Reference)主要包括
哪些数据库。

1。

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