质粒DNA的提取
质粒dna提取原理

质粒dna提取原理
质粒DNA提取原理是通过破坏细菌细胞壁和细胞膜结构,释
放质粒DNA,并利用化学方法提取纯化质粒DNA。
质粒DNA提取的步骤如下:
1. 细胞裂解:将细菌培养物经过离心,得到菌体沉淀,然后加入裂解缓冲液,破坏细菌细胞壁和细胞膜,释放质粒DNA。
2. 质粒DNA纯化:加入一定量的碱性溶液,使细菌染色体DNA变性沉淀,而质粒DNA仍溶于溶液中。
然后通过离心,将质粒DNA沉淀下来。
3. 质粒DNA沉淀:将溶液中的质粒DNA与乙醇混合,使质
粒DNA沉淀成片状。
通过离心,得到质粒DNA沉淀。
4. 质粒DNA溶解:将质粒DNA沉淀洗涤去除杂质,并用适
当的缓冲液将质粒DNA溶解,得到高浓度的质粒DNA。
质粒DNA提取的关键在于破坏细菌细胞结构,释放质粒DNA,然后利用沉淀和溶解等步骤进行纯化。
通过以上步骤,可以提取到纯化后的质粒DNA,用于后续实验或分析。
质粒dna的提取步骤

质粒dna的提取步骤质粒DNA的提取步骤质粒DNA是细菌中的圆形DNA分子,与细胞染色体不同,可以在细菌中自主复制。
质粒DNA的提取是一项常规实验,可用于高效地分离纯化质粒。
在进行质粒DNA提取之前,需要准备一些必要的试剂和设备。
材料和试剂:1.细菌培养物2.经过钙离子或热处理的TTES缓冲液(10mM Tris-HCl [pH8.0],1mM EDTA [pH8.0],25%蔗糖溶液)3.蛋白酶K处理缓冲液(50mM Tris-HCl [pH8.0],100mM NaCl,10mM EDTA [pH8.0])4.醇5.异丙醇6.以太7.加拿大CFII列的紫外灯8.恒温振荡器步骤:1.收集培养物将培养物用无菌工具收集到1.5毫升离心管中。
通过离心将细胞沉淀到离心管底部。
2.细胞溶解添加500 μl TTES缓冲液到离心管中,并用Vortex或20号钢珠打破细胞壁。
将离心管放在水浴中恒温振荡器中,30分钟以70 rpm。
3.移除细胞碎片离心管离心2分钟,将浮于上层的无菌细胞断片去除(上清),移至另外的离心管。
4.蛋白酶K处理向上清中加入100 μl蛋白酶K处理缓冲液和15μl蛋白酶K,室温下静置10分钟,然后加入200 μl醇混合液(3:7乙醇:异丙醇),与上清混合均匀。
5.沉淀DNA的制备离心管离心2分钟,然后将上清倒出。
沉淀物将采用70%的醇作为清洗液,在沉淀物上滴入1 ml的70%醇,在打破后的沉淀物中短暂的搅拌。
离心管轻轻晃动,浮于上层的除去,再加1ml的70%酒精,将沉淀物中混合在一起。
6.沉淀物最佳溶解将沉淀物在无尘工作台上空气干燥(大约10~15分钟),直到酒精挥发。
将沉淀物用10毫升 TE缓冲液(10mM Tris-HCl [pH8.0],1mM EDTA [pH8.0])悬浮,经缓慢抽气镇静。
7.检测提取的DNA通过紫外光下的可见目标,如果质粒DNA等目标脱胶,就可以看到了。
通常设定为 OD260/OD280值为1.8-2.0。
质粒DNA的提取

4. 向离心管中加入250μl溶液P2,温和地上下翻转6-8次使菌体充分裂解。
注意:温和地混合,不要剧烈震荡,以免污染基因组DNA。此时菌液应变得清亮粘稠,所用时间不 应超过5min,以免质粒受到破坏。如果菌液没有变清亮,可能是由于菌体过多,裂解不彻底,应减 少菌体量。
注意:洗脱缓冲液体积不应少于50μl,体积过小影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大 影响。若后续做测序,需使用ddH2O做洗脱液,并保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降 低洗脱效率。且DNA产物应保存在-20℃,以防DNA降解。为了增加质粒的回收效率,可将得到的 溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2min,1200rpm离心2 min,将质粒溶液收集到离心管中。
7.向吸附柱CP3中加入600μl漂洗液PW (请先检查是否已加入无水乙醇)12,000 rpm 离 心30-60s,倒掉收集管中的ห้องสมุดไป่ตู้液,将吸附柱CP3放入收集管中。 8. 重复操作步骤7。 9. 将吸附柱CP3放入收集管中,12,000 rpm离心2 min,目的是将吸附柱中残余的 漂洗液去除。
注意:漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。为确保下游实验不受残留 乙醇的影响,建议将吸附柱CP3开盖,置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
10. 将吸附柱CP3置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50100μl洗脱缓冲液EB,室温放置2min,12,000 rpm离心2 min将质粒溶液收集到离 心管中。
5.向离心管中加入350 μl溶液P3,立即温和地上下翻转6-8次,充分混匀,此时会出现白色 絮状沉淀。12,000 rpm 离心10 min。
质粒DNA的提取

质粒DNA的提取方案一常规小量提取(碱裂解法)【实验目的】(1)掌握碱裂解法小量提取质粒DNA的原理及操作过程。
(2)掌握微量加样器的使用方法。
【实验原理】在NaOH存在的碱性环境(pH值12.0~12.6)中,线性的大分子量细菌染色体DNA变性,而共价闭环质粒DNA由于分子量小且缠绕紧密,仍为自然状态。
将pH值调至中性并有高盐浓度存在的条件下,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构,大部分DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA恢复可溶状态的。
通过离心,去除大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质等物质,上清液中的质粒DNA可用酚/氯仿抽提。
【实验试剂】(1)溶液I:50mmol/L葡萄糖25mmol/LTris-HCl(pH值8.0)10mmol/LEDTA(pH值8.0)溶液I可成比配制,每瓶约100ml,在6.9×10°Pa(10lbf/in²)高压下蒸汽灭菌15min,贮存于4℃下。
(2)溶液Ⅱ:0.2mol/LNaOH(临用前用10mol/L贮存液稀释)1%SDS(3)溶液Ⅲ:5mol/L乙酸钾60ml冰乙酸11.5ml水28.5ml(4)酚(pH值7.8~8.0)。
(5)氯仿。
(6)TE缓冲液。
(7)6×DNA上样缓冲液。
(8)0.8%琼脂糖。
(9)无水乙醇。
【实验器材】(1)低温高速离心机。
(2)旋涡振荡器。
(3)Eppendorf管(EP管)。
(4)微量移液器。
(5)移液器头。
(6)电泳仪与电泳槽。
(7)紫外透射仪。
【实验样本】细菌(含某种质粒)。
【实验步骤】(1)将5ml菌液分次装入同一1.5mlEP管中,3000r/min离心5min,以收集菌体。
(2)将细菌沉淀重悬于100μl用冰预冷的溶液I中,剧烈振荡5min。
(3)加200μl新配制的溶液Ⅱ,盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以混合内容物,不可强烈振荡,放置于冰上3min左右。
实验四 质粒DNA的提取

实验四质粒DNA的提取、电泳检测和酶切一、实验目的学会用碱裂解法小量制备质粒DNA。
二、实验原理质粒DNA是存在于细菌中的环状小分子DNA,不同于长链大分子的基因组DNA,游离于细胞质中。
由于细胞中的RNA可以被降解,大分子DNA可与细胞碎片一起沉淀而与质粒DNA分离。
质粒DNA的提取常用碱裂解法、煮沸法、SDS法、Triton-溶菌酶法等,其中以碱裂解法最为常用。
本方法有质粒DNA产量高、快速等优点。
其原理为:在碱性溶液中,双链DNA氢键断裂,DNA双螺旋结构遭破坏而发生变性,但由于质粒DNA分子量相对较小,且呈环状超螺旋结构,即使在高碱性pH条件下,两条互补链也不会充分分离,当加入中和缓冲液调时,染色体线性DNA和或有缺口的质粒DNA变性后双链分离,难以复性而形成缠绕的结构,与蛋白质—SDS复合物结合在一起;当K+取代Na+时,生成不溶的PDS, 这些复合物从溶液中沉淀下来。
通过离心沉淀,细胞碎片、染色体DNA及大部分蛋白质可被除去,而质粒DNA及小分子量的RNA则留在上清液中。
混杂的RNA可用RNA酶(RNAase)消除。
再用酚/氯仿处理,可去除残留蛋白质。
三、实验材料含有质粒pUC19的大肠杆菌菌株DH5a。
四、实验器具、药品试剂A、实验材料:•DH5a受体菌•pUC19B、实验仪器•高压灭菌锅•超净工作台•恒温摇床取•台式离心机(冷冻或非冷冻式)•旋涡振荡器•电泳仪•凝胶成像系统•培养用试管•量筒•冰盒•微量取液器(2ul,20ul,150ul,1000ul)•吸管头若干(2ul,20ul,150ul,1000ul)•EP管若干•一次性手套若干C、溶液药品:•LB培养基•氨苄青霉素(Amp,100 mg/ml)•20%SDS• 4 M NaOH•3M NaAc (pH5.2)•异丙醇•TE缓冲液(pH8.0)•RNAase A(10 mg/ml)•70%乙醇•无水乙醇•75%乙醇,•NEB 标准分子量片段(1kb DNA Ladder),•Eco R I及Dra I(Dra II?)限制性核酸内切酶(TaKaRa),•Eco RI酶解缓冲液(10×H buffer)•10%琼脂糖•电泳缓冲液•EB染色液•溶液I-GET缓冲液:50 mmol/L葡萄糖,10 mmol/L EDTA,25 mMTris-HCl pH8.0。
提取质粒dna的方法

提取质粒dna的方法提取质粒DNA的方法是一种从生物样品中提取DNA的方法,用于分析基因组学、遗传学或其他基因相关的研究。
它是所有DNA技术的基础。
提取质粒DNA的方法主要包括三个步骤:破解细胞壁、提取DNA片段和提取DNA片段。
第一步,破解细胞壁。
为了提取细胞内的DNA,必须先破坏细胞壁。
这一步可以通过使用植物激素、酶和其他破坏细胞壁的物质来完成。
第二步,提取DNA片段。
在破坏细胞壁之后,生物样品中的DNA就可以从细胞内被提取出来。
这一步通常是将样品加入一定的溶液,如洗涤溶液,然后用放大器去提取DNA片段。
第三步,提取DNA片段。
在提取DNA片段之后,必须对其进行纯化处理,以便提取的DNA片段不会受到其他物质的干扰。
一般情况下,这一步是通过使用离心机将DNA 片段从溶液中分离出来,然后用水冲洗去除其他物质,最后得到纯净的DNA片段。
提取质粒DNA的方法也可以用来提取植物细胞内的DNA。
与提取动物细胞中的DNA不同,植物细胞内的DNA要更加困难,因为植物细胞周围可能有多层细胞壁,而这些细胞壁很难被破坏。
因此,植物细胞内的DNA提取一般都是采用化学方法,即使用碱性有机溶液,以破坏细胞壁,然后再用放大器提取DNA片段。
此外,还有一些无细胞DNA提取的方法,如PCR法、小RNA测序、质粒提取等。
PCR法是用来检测和检验DNA的一种技术,可以扩增微量DNA,从而获取充足的DNA材料进行检测。
小RNA测序是一种新型的基因测序技术,可以检测植物和动物体内特定的RNA,检测特定靶基因的表达。
最后,质粒提取是一种从生物样品中提取DNA质粒的技术,可以用于分子生物学研究,如基因克隆、DNA测序等。
总之,提取质粒DNA的方法是一种常用的DNA提取技术,也是所有DNA技术的基础。
它可以用于从动物和植物样品中提取DNA片段,以及从无细胞DNA中提取DNA质粒,以用于各种基因组学、遗传学和分子生物学研究。
质粒dna的提取

质粒DNA的提取1. 引言质粒DNA提取是在分子生物学研究中常用的实验操作之一。
质粒是一类圆环状的DNA分子,存在于原核生物中。
质粒DNA提取的目的是为了获取纯度高的DNA样品,以便进行后续的实验操作,如聚合酶链式反应(PCR)、限制性酶切、测序等。
2. 实验材料在进行质粒DNA提取实验前,需要准备以下实验材料:•细菌培养液:含有所需质粒的培养液。
•碱裂解液:用于裂解细胞并释放质粒DNA的实验液。
•高盐含量的溶液:用于提取DNA。
•蛋白酶K:用于消化蛋白质。
•硅胶粉末:用于吸附DNA。
•乙醇:用于沉淀DNA。
•TE缓冲液:用于溶解和储存提取的质粒DNA。
3. 实验步骤3.1 细菌培养与收获首先,需进行细菌培养和收获,以获取含有所需质粒的培养液。
培养液中的细菌应为含有目标质粒的菌株,如大肠杆菌。
3.2 细胞破碎与质粒DNA释放将收获的细菌培养液进行离心,去除培养液并沉淀细胞。
然后将细胞重悬于碱裂解液中,用震荡器在适当的温度和时间条件下裂解细胞,释放质粒DNA。
3.3 蛋白质消化为了去除细胞中的蛋白质,加入适量的蛋白酶K,进行蛋白消化。
消化的时间和温度应根据实验要求进行调整。
蛋白消化完成后,通过离心将蛋白质沉淀分离。
3.4 DNA提取将消化液中的DNA溶液转移到其它离心管中,并加入高盐含量的溶液。
通过离心将DNA与其他杂质分离。
此步骤中,DNA会被溶液中的硅胶粉末吸附,以去除杂质。
3.5 DNA沉淀将去除杂质的DNA溶液转移到新的离心管中,加入冰冷的乙醇。
通过离心,将沉淀的DNA分离出来。
注意,在沉淀过程中,应避免DNA的过度离心,以免损坏DNA分子。
3.6 DNA溶解和储存将DNA沉淀后,溶解在适量的TE缓冲液中。
TE缓冲液具有适当的pH值和离子浓度,能够稳定DNA分子,并提供良好的保存条件。
4. 实验注意事项在质粒DNA提取实验中,需要注意以下几点:•操作过程应严格遵守无菌操作,避免外源性DNA的污染。
质粒dna提取步骤

质粒dna提取步骤
质粒 DNA 提取是分子生物学实验中的一项基本技术,用于从细菌细胞中分离出质粒DNA。
以下是一般的质粒 DNA 提取步骤:
1. 收集细菌培养物:将含有质粒的细菌培养在适当的培养基上,直到培养物达到合适的密度。
可以使用离心或过滤的方法收集细菌细胞。
2. 细胞裂解:将收集的细菌细胞加入裂解缓冲液中,通过物理方法(如搅拌、超声处理等)或化学方法(如加入裂解酶等)使细胞破裂,释放出质粒 DNA 和其他细胞成分。
3. 去除细胞碎片:将裂解后的混合液通过离心或过滤的方法去除细胞碎片和其他杂质。
4. 沉淀 DNA:向裂解液中加入乙醇或异丙醇等沉淀剂,使质粒 DNA 沉淀。
通过离心将沉淀收集。
5. 洗涤沉淀:用 70%的乙醇洗涤沉淀,以去除残留的盐分和杂质。
6. 干燥沉淀:将洗涤后的沉淀离心,并去除上清液。
然后将沉淀在室温下干燥,以去除残留的乙醇。
7. 溶解 DNA:将干燥的沉淀加入适当的缓冲液中,使质粒 DNA 溶解。
可以在缓冲液中加入 RNA 酶以去除 RNA 杂质。
8. 纯化和浓缩 DNA:可以使用柱层析、电泳或其他方法对提取的质粒 DNA 进行进一步的纯化和浓缩。
9. 质量检测:使用琼脂糖凝胶电泳或其他适当的方法检测提取的质粒 DNA 的质量和完整性。
需要注意的是,具体的质粒 DNA 提取步骤可能因使用的试剂盒或实验条件而有所不同。
在进行质粒 DNA 提取之前,应仔细阅读所使用的试剂盒说明书或相关实验方案,并根据实际情况进行适当的调整和优化。
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质粒DNA的提取一、原理采用碱变性发抽提取质粒DNA。
该法是基于染色体DNA与质粒DNA的变性预复性的差异而达到分离目的的。
在PH大于12的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开变性。
质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当以pH5.2的乙酸钠高盐缓冲液调节其pH至中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,保存在溶液中。
而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构。
通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
二、方法1.挑取一环在LB固体培养基平板上生长的含PUC57质粒的大肠杆菌,接在含有100μg/ml氨苄青霉素(Amp)的LB液体培养基(5ml/15ml试管)中,37℃震摇培养过夜。
2.将1.5ml菌液加入微离心管中,14000r/min,离心10秒,其取上清液。
反复数次,收集全部菌体。
3.倾去上清,滤纸吸干。
4.加30μlTE缓冲液(10mmol/L Tris—HCl,1mmol/L EDTA,pH8.0),振荡起菌体。
5.加30μlTENS溶液(10mmol/L Tris—HCl, pH8.0,1mmol/L EDTA,0.1mol/LNaOH,0.5%SDS),震荡10秒至溶液变粘稠。
6.加150μl 3.0mol/LnaAC,震荡3—5S,14000r/min,离心3分钟,沉淀细胞碎片及染色体DNA。
7.上清液转移至另一微离心管中,甲等体积胞和酚,混匀,12000r/min,离心2分钟。
8.上层水相转移至另一位离心管,加2倍量冷水乙醇,14000r/min,离心20分钟。
9.倾去乙醇,加入7o%冷乙醇淋洗。
10.倾去乙醇,滤纸吸于,真空抽吸2~3分钟。
lI.加人50μlTE缓冲液,溶解DNA。
12,加入1μl核糖核酸酶(10mg/m1),14000r/min,离心2s,使核糖核酸酶与管底液体混匀。
13.37℃水浴30min。
14.样品放一20℃冰箱保存备用。
三、试剂1.TE缓冲液(10mmol/L Tris—HCl,1mmol/L EDTA,pH8.0)配制方法:Tris 1.211gEDTA.Na 0.037g用800ml重蒸水溶解,用分析纯盐酸调整pH至8.0,加重蒸水定容至1000ml。
2.TENS溶液:(10mmol/L Tris—HCl, pH8.0,1mmol/L EDTA,0.1mol/L NaOH,0.5%SDS)配制方法:NaOH O.4 gSDS 0.5 g加80mlTE缓冲液溶解。
加TE缓冲液定容至lOOml.3.3.0mol/1醋酸钠溶液(pH5.2)配制方法:醋酸钠 24.6g用70ml重蒸水溶解,再用冰乙酸大约调pH至5.2,加重蒸水定容至100ml。
纯净的酚使用时不需要重蒸。
市售的酚一般为红色或黄色结晶体,使用之前必须重蒸,除去能引起DNA和RNA断裂和聚合的杂质。
将苯酚置于65℃水浴中溶解,重新进行蒸馏,当温度升至183℃时,开始收集在若干个棕色瓶中。
纯酚和重蒸酚都应贮存在-20℃使用前取一瓶重蒸酚于分液漏斗中,加入等体积的lmol/L Tris-HCI(pH8.0)缓冲液,立即加盖,激烈振荡,并加入固体Tris摇匀调pH(一般100ml苯酚约加l克固体Tris)分层后测上层水相pH至7.6一8.0。
从分液漏斗中放出下层酚相于棕色瓶中,并加一定体积0.1mol/L Tris-HCI(pH8.o)覆盖在酚相上,置4℃冰箱贮存备用。
酚是一种强腐蚀剂,能引起腐蚀性损伤,操作时应戴上眼镜和手套。
如果皮肤上溅上了酚,应用大量水冲洗或用肥皂水冲洗。
酚在空气极易氧化变红,要随时加盖,也可加入抗氧化剂o.1%8一羟基喹啉及o.2%β—巯基乙醇。
5.无水乙醇置-20℃冰箱中保存备用6.70%乙醇置-20℃冰箱中保存备用7.核糖核酸酶(10mg/ml)配制方法:称取l0mg核糖核酸酶A(RNaseA,美国SIGMA或中科院上海生物化学研究所东风试剂厂)。
于灭菌的微离心管内,加1 ml 100mmol/pH5.0的NaAC溶液(完全溶解),即为10mg/ml RNase,为了破坏脱氧核糖核酸酶(DNase,置80℃水浴中10min或100℃水浴2 min,然后置一20℃(或家用冰箱的冰格内)保存。
四、材料1.菌种:大肠杆菌(pUC57)2.培养基LB液体培养基精解蛋白胨 3g酵母浸出粉 1.5g氯化钠 3 g葡萄糖 0.6g按上述配方用重蒸水(ddH2O或dH2O表示,下同)溶解至300ml。
用10mol/LnaOH 调pH至7.2~7.4。
分装于15ml试管中,每支5ml。
然后置高压蒸汽消毒锅以1.1kg/cm2灭菌20min.l抗菌素:氨苄青霉素(Amp)临用时用无菌水配制在无菌有盖试管中,浓度为100mg/m1。
五、仪器:恒温振荡器。
低温冰箱-20℃真空泵。
台式高速离心机六、说明1.质粒DNA提取的方法很多,有碱变性法、羟基磷灰石柱层析法、溴化乙锭一氯化铯梯度超离心法等。
本次实验是一种小量快速提取法。
小量快速提取法也有多种,但基本原理和步骤是一致的.包括下述步骤:(1)裂解菌体细胞;(2)质粒和染色体DNA的分离;(3)除去蛋白质。
RNA及其他影响限制性酶活性的细胞成分;(4)除去提玑过程中使用的去垢剂、盐等。
2.在基因操作实验中.保存或提取DNA过程中,一般都采用TE缓冲液,而不选用其它的缓冲液。
虽然很多缓冲系统.如磷酸盐缓冲系统,硼酸系统都符合细胞内环境的生理范围,可以作为DNA的保存液,但在某些实验中,这些缓冲对会影响实验。
如在转化实验中,要用到Ca+,如果川磷酸盐缓冲液,磷酸根将与Ca2+产生Ca(PO4+沉淀;在各种工具酶反应时,不同的酶对辅助因子的种类及数量要求不同,有的要求高盐离子浓度,有的则要求低盐浓度,采用Tris—HCI缓冲系统,不存在金属离子的干扰作用;作中的EDTA是二价离子Mg2+、Ca2+等的螯合剂,可降低系统中的这些离子浓度,而这些离产是脱氧核糖核酸酶的辅助因子,所以EDTA可以抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用。
3、TENS中NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中稳定,怛当pH大于12或小于3 时,就会引起DNA两条链之间氢键的解离而变性。
TENS中有NaOH使其pH大于12,因而使染色体DNA与质粒DNA变性。
TENS中的SDS:SDS是离子型表面活性剂。
它主要功能有:(1)溶解细胞膜上的脂肪与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜;(2)解聚细胞中的核蛋白;(3)SDS能与蛋白质结合成为R1一O一SO3…R2+一蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。
但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去干净,防止在下一步操作中(用Rnase去除RNA时)受干扰。
4、3.0mol/L NaAC(pH5.2)使pH大于12的DNA抽提液回到中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。
染色体DNA不能复性(染色体DNA不存在超螺旋共价闭合环结构) 而高盐的3mol/L NaAC有利于变性的大分子染色体DNA、RNA、以及SDS—蛋白质复合物凝聚沉淀。
pH5.2也能中和核酸上的电荷,减少相互斥力而互相聚合。
同时,钠盐能与SDS一蛋白质复合物作用后,形成溶解度较小的钠盐形式复合物,使沉淀更完全。
5.饱和酚:酚是一种表面变性剂,属非极性分子。
水是极性分子。
当蛋白质溶液与酚混合合时,蛋白质分子之间的水分子被酚挤走,使蛋白质失去水合状态而变性。
经过离心。
变性蛋白质的密度比水的密度大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,酚比重更大,保留在最下层。
酚作为变性剂.也有一些缺点:(1)酚与水有一定程度的互溶,酚相中水的溶解可达大约10%~15%,溶解在这部分水相中有DNA会损失,(2)酚很容易氧化,变成粉红色,氧化的酚容易降解DNA,解决酚氧化和带水的办法是将酚重蒸,除去氧化的部分,再用Tris —HCl缓冲液饱和,使酚不至于夺去DNA中的水,带走部分DNA。
饱和酚中加上8一羟基硅啉及巯基乙醇,防止酚氧化,还是弱的螫合剂.可抑制DNase。
由于有颜色.溶解在酚中后,使酚带上颜色,便于酚相与水相的分肉,酚饱和后,表面盖上一层Tris水溶液,隔绝空气,阻止酚氧化。
6.关于无水乙醇沉淀DNA的说明:用无水乙醇沉淀DNA,是实验中最常用的沉淀DNA的方法。
乙醇的优点是具有极性,可以以任意比例和水相混溶,乙醇与核酸不会起化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。
乙醇之所以能沉淀DNA,是由于DNA溶液是以水合状态稳定存在的DNA,当加入乙醇.乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合沉淀,一般实验中,用2倍体积的无水乙醇与DNA相混合。
使乙醇的最终含量占67%左右。
由此可预见,也可用95%乙醇沉淀DNA,但是用95%乙醇使总体积增大.而DNA在醇溶液中总有一定程度的溶解。
因而DNA损失也增大,影响收率。
乙醇沉淀DNA溶液时,DNA溶液中应该有一定的盐浓度,中和DNA表面电荷。
如果溶液中盐浓度太低,要加NaAC或NaCl至最终浓度O.1一O.25mol/l在pH 8左右的DNA 溶液中,DNA分子带负电荷,加一定浓度的NaAC或NaCl使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀。
当加入的盐溶液浓度太低时。
只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全。
但当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好,在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须进行洗涤或重沉淀。
乙醇沉淀DNA.一般采用低温条件,这是由于在低温条件下.分子运动大大减少,DNA 易于聚合而沉淀。
为了使质粒DNA能充分沉淀,一般保存时间总是过长的,同时也要视样品的体积而异,在微量离心管中的样品要比40毫升离心管中DNA样品的量少,冷却就较迅速。
大量提取DNA时,目前习惯上常采用如下几种方法:保存在家用冰箱结冰盒内过夜保存在-2℃亡冰箱内过夜保存在-70℃冰箱内 30mm~2h放置干冰中(约-20℃) 30min放置干冰加酒精中(约-70℃) 16mm放置在液氮缸中液氮的气相内,不可以浸在液氮中(温度在-198℃左右)5~15min。
除了用乙醇外还可用1倍体积丙醇(相当于2倍体积乙醇)使DNA沉淀。
用异丙醇的好处是要求离心的液体体积小,但异丙醇挥发性不如乙醇,最终除区其残留部分的难度更大。
此外,异丙醇能促使蔗糖、氯化钠等溶质与DNA一起沉淀,在-70℃时,更易发生,所以一般以乙醇沉淀为宜,除非要求液体体积很小。
7.影响质粒DNA提纯质量和产率因素的说明。