PubMed
PubMed检索

一、PubMed简介
内容涵盖基础医学、临床医学、护理学、 口腔医学、兽医学、营养卫生、卫生保健 系统、药理和药剂学、卫生管理、医学信 息学等领域,目前网上免费检索MEDLINE数 据库的网站有30多个,PubMed是其中使用 频率最高、影响力最大、最具权威性的医 学网站。
一、PubMed简介
1.进入 主题词 数据库
2.输入FK506 并进行检索
3.点击主题词
主题词轮排表
主题词细节屏 (上)
词义注释
历史注释
可 组 配 的 副 主 题 词 不扩展检索
加权检索
主题词细节屏 (下)
入口词(同义词)
曾用词
药理作用:免疫抑制剂
树状结构
4.选择副 主题词
5.添加至检索生成 器,选择逻辑组 配模式(此例应 为AND),再点 击检索PubMed
三、检索结果处理
1.检索结果显示(可以查看MeSH字段) 2.检索结果保存 3.检索结果进一步限定 4.检索策略显示(PubMed自动采取的策略) 5.获取全文
1.检索结果的显示
记录显 示格式
每页显示 记录数
排序方式
纯文本方式 显示记录
例1
这条记录包括几个什么字段?
Expression of pro- and anti-inflammatory cytokines in relation to apoptotic genes in Egyptian liver disease patients associated with HCV-genotype-4. Zekri AR, Bahnassy AA, Abdel-Wahab SA, Khafagy MM, Loutfy SA, Radwan H, Shaarawy SM. J Gastroenterol Hepatol. 2008 Nov 27. [Epub ahead of print] PMID: 19054267 [PubMed - as supplied by publisher] Related Articles
pubmed 检索结果 分类

pubmed 检索结果分类
PubMed检索结果分类如下:
学术期刊文章。
是PubMed数据库中最常见的文献类型,通过同行评议系统审核认可并发表在各个专业期刊上的研究成果。
综述文章。
基于已有文献进行总结、分析和评价的文献类型,提供了对某一特定领域或话题的综合概述,帮助读者了解该领域的最新进展和相关研究方向。
临床试验报告。
关于药物、疗法或治疗策略实施的科学实验的详细描述,旨在评估特定治疗方法的有效性和安全性,为临床实践提供证据支持。
病例报告。
描述了罕见或特殊疾病病例的详细信息,通常与临床医生分享特殊病例的经验,并提供对诊断和治疗的有价值的洞察。
技术方法论。
介绍了测试、实验和数据分析等方法的具体细节,对于其他研究人员的实验设计和数据解释非常有用。
调查研究。
指收集和分析某一群体或特定情境中的数据以回答特定问题的研究,旨在了解和评估一种疾病、健康问题或医学实践的流行状况、风险因素及其影响。
论文评论。
对已经发表的文献进行深入分析和批判性评论的文章,提供对原始研究结果的进一步解释和解析,有助于学术界对该领域的理解。
pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。
例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。
PubMed检索

发展历程
NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物 《医学索引》(Index Medicus ,IM)
从1964年起,采用计算机进行电子编辑和排版,在此 基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis & Retrieval System),即著名 的MEDLARS系统
MeSH转换表 Vitamin h→ "biotin"[MeSH Terms] OR "biotin"[All Fields] OR "vitamin h"[All Fields]
期刊转换表 new england journal of medicine → "N Engl J Med"[Journal] OR "new england journal of medicine"[All Fields]
临床查询(Clinical Queries)
Clinical Study Categories(临床研究类文献) Systematic Reviews(系统评价) Medical Genetics(医学遗传学)
MeSH: Clinical Queries
结果限定选项
直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、 Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索
PubMed每条记录均有惟一的识别号 PMID(PubMed Unique Identifier) 。
❖ MEDLINE: PubMed主体部分,记录均标有 [PubMed-indexed for MEDLINE]
关于pubmed的字段的描述 -回复

关于pubmed的字段的描述-回复1. 什么是PubMed?PubMed是美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)开发的一个生物医学文献数据库,旨在为医学研究人员和医疗保健专业人士提供全球范围内最新的生物医学科学文献。
PubMed免费开放,并且包含了各种医学领域的学术期刊、书籍章节、会议论文和硕博士论文等。
2. PubMed的主要字段有哪些?在PubMed中,每篇文章都有一些特定的字段,用于描述和组织文献信息。
以下是PubMed的主要字段:- Title(标题):文章的标题,通常概括了研究的主题。
- Authors(作者):文章的作者或作者团队的姓名。
- Affiliation(机构):作者所属的机构或组织。
- Abstract(摘要):文章的摘要,用于简要描述研究目的、方法、结果和结论。
- Keywords(关键词):反映文章主题的关键词或术语。
- Journal(期刊):文章所发表的期刊名称。
- Year(年份):文章的发表年份。
- Volume(卷号):文章所在期刊的卷号。
- Issue(期号):文章所在期刊的期号。
- Page(页码):文章在期刊中的页码范围。
- DOI(数字对象标识符):文章的唯一标识符,用于确保持久性链接。
3. 如何使用PubMed的字段进行文献检索?使用PubMed进行文献检索时,可以利用以上字段的组合来进行精确的筛选和搜索。
以下是一些常用的文献检索技巧:- 标题和摘要检索:通过在“Title/Abstract”字段中输入关键词或术语,可以快速筛选出相关主题的文章。
- 作者和机构检索:通过在“Authors”或“Affiliation”字段中输入作者或机构的名称,可以找到特定作者或机构的文献。
- 期刊和年份检索:通过在“Journal”和“Year”字段中输入期刊和年份,可以限定搜索结果范围在某个期刊或特定年份内。
- DOI检索:通过在“DOI”字段中输入文章的DOI,可以直接访问或引用该文章。
pubmed

考虑到作者姓名的不同形式,PubMed采用自动 转换功能进行作者姓名检索,如:smith j将检索 成smith ja,smith jm,smith jr 等。
精确检索避免 PubMed自动 词汇转换。
(7)杂志名称检索
在检索框中键入期刊名,如:ACCOUNTS OF CHEMICAL RESEARCH ,系统的“自动词语匹配” 功能会将它转换成"Acc Chem Res"[Journal]进行检 索。 也可以直接输入Medline的期刊标准缩写形式,如: mol biol cell,或者是输入刊物的ISSN(国际标准出 版物代码)进行检索,如:1059-1524。 如果一个杂志名恰好是主题词或关键词,如:cancer, science,cell等,PubMed会首先将这些词转换成 MeSH词表中的主题词进行检索。因此,需要将检索 请求进行标准化处理,即在杂志名后面加[TA]。如: "cell"[ta]
(2)In Process Citations
是临时性的医学文献数据库,最新的MEDLINE处理 中数据,未标引,无MeSH字段,日更新。
记录标注:[PubMed-in process]。
In Process Citations 中的数据经标引部门标引主 题词、文献类型、GenBank获取号等标引数据后加 入到Medline数据库之中。标识改为:[PubMedindexed for MEDLINE]。
PubMed将自动地利用它的“自动词汇匹配”功能将不 规范的词语转换成MeSH词表中规范的用词进行检索。
(2)精确检索(强制检索)
PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。
如:在PubMed主页的检索提问框中键入“gene therapy”,并用双引号引起来。点击“search”按 钮,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的 全部字段中进行检索。
pubmed引文检索

pubmed引文检索
在PubMed上进行引文检索(Citation Search)是一种查找特定文献的方法。
这允许你查找引用了或被引用了某一篇文章的其他文章。
以下是在PubMed上执行引文检索的一般步骤:
1.搜索原始文章:进入PubMed,使用文章的标题、作者或PMID(PubMed唯一标识符)等信息,找到你感兴趣的原始文章。
2.进入文章页面:点击文章标题,进入文章的详细页面。
3.找到引文选项:在文章详细页面中,查找引文或相关记录的选项。
通常,这个选项位于页面的右侧或下方。
4.进行引文检索:点击引文或相关记录的链接,这将显示引用了或被引用了原始文章的其他文章列表。
5.筛选和浏览引文:根据需要,你可以使用PubMed提供的筛选选项来缩小结果,例如按日期、文章类型等。
浏览引文列表,找到你感兴趣的文献。
6.查看引文详细信息:点击引文列表中的文献标题,以查看有关该文献的详细信息。
请注意,有时不是所有的引文信息都会在PubMed中显示,这取决于文献的可用性和PubMed数据库的更新。
此外,引文检索的准确性也受到引用格式和文献数据库互操作性的影响。
第五讲 PUBMED

“N Engl J Med”[Journal]
2.词汇自动转换
3. Phrase List
该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文 词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概 念(物质)名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。 如果PubMed 系统在MeSH词表和刊名转换表中未发 现与检索词相匹配的词,就会查找该短语表。
三、检索方法与技巧
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 主题检索 - MeSH Database 检索结果过滤—Choose additional filter
(二)高级检索 界面
生成检索表达式 显示区域 检索表达式 生成器
检索历史
三、检索方法与技巧
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 主题检索 - MeSH Database 检索结果过滤—Choose additional filter
(三)主题检索
(三)主题检索
问题:PubMed本身具有自动智能功能为什么 还需要单独用MeSH进行检索呢?
对话框中的AND OR NOT in builder是直接 选择逻辑关系进行组配
高级检索——检索历史
高级检索——检索历史
显示检索结果
高级检索——检索历史
Show search details
高级检索——检索历史
功能:将检索表达式保存到my ncbi 中,需要注册MY NCBI,并登录
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- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
主题索引(Subject Index)将所收录内容分为6 个大类: Diseases and Conditions, Specialties, Institutions, Publishing and Publications, Alternaive and Complementary Medicine, Geography and Geotraphical,
检索式构造术
Au=ncaster lung cancer and gene Mammal+ ( mammals) Col? Wom#n
第二部分 医学检索引擎
医学Web检索工具
医源MedMatrix medwebplus
医源MedMatrix
)
不能限定副主题词或进行其他修饰检索
Detailed display 副主题词、扩展、主要主题词
例:系统性硬皮病(systemic scleroderma)的药物 疗法
附加检索
引文匹配器(Citation Matcher) 期刊浏览器(Journal Browser) 临床问题(Clinical Queries) 临床警示(Clinical Alert):
PubMed 与MEDLINE的区别
收录范围广:MEDLINE收录的部分生命 科学相关文章的非医学专业期刊(物理、 天文、化学等) 收录记录新:在MEDLINE数据标引前的 最新题录 文献类型全:提供电子原文链接(部分 免费)
检索栏 特征栏
侧栏
二.PubMed 基本检索功能
在检索栏中输入:
修改检索策略
1.检索框中随时修改 2.“Limit” 、 “Preview/index”、 “History” “Details”功能键实现。
四.检索结果输出
显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果
显示格式选择(Display)
Abstract report:来源期刊、标题、著者、 著者地址、记录性质、文献类型、勘误、 评论、PMID或UI、摘要。
临床警示(Clinical Alert):
1991年开始,NIH美国卫生健康研究所 不定期公布能引起死亡率和致病率升高 的临床试验项目重要新闻稿。
Pubmed习题
1 查找肾功能衰竭的饮食疗法的文献, 写出作者Rao M所写文献所涉及的化学 物质 2 已知:第一作者是Challis DE,出处是 Pediatric Research,2000,47(3):309~15。 要求写出其他合著者
每一大类下又会进一步细分为若个个二 级主题 如Diseases and Conditions之下,分为艾 滋病、黄热病等242个主题; Specialties之下分泌尿学、病毒学等109 个学科。
Medwebplus ()
地理索引(Location Index)提供通过地 理位置进行查找的途径。一共分为北美 洲、欧洲、亚洲、澳洲和大洋洲、南美 洲、非洲六个部分。 通过关键词途径进行检索只需在检索内 输入检索词即可。
自动对照规范词表,期刊名表,短语, 著者名索引, 依次寻找转换, 短语寻找转换,改成单词转换 单词在上述四个字段寻找转换,在所 有字段中转换
如:输入placenta growth oxygen 系统转换为——((("placenta"[MeSH
Terms] OR placenta[Text Word]) AND (("growth and development"[Subheading] OR "growth"[MeSH Terms]) OR growth[Text Word])) AND ((("oxygen"[MeSH Terms] OR "oxygen inhalation therapy"[MeSH Terms]) OR "Oxygen"[MeSH Terms]) OR oxygen[Text Word]))
截词检索:treat* 强迫短语检索:“brca 1”(不再 自动转换匹配和扩展检索)
自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行 扩展检索,如: 输入“hypertension therapy,系统自 动将高血压的药物治疗、饮食疗法,
三.PubMed的特征栏
Limits(检索限制选择) 字段限制:著者、刊名、篇名等 数据输入时间:默认检索可回溯到1966 年,限制选择30天-10年 7种文献类型限制: 7种语种: 12种子文档:(01年新增2种Space Life Sciences and Bioethics )
New FirstSearch 可检索80多个数据库, 其中有30多个可检索到全文, 免费检索13个数据库(包含MEDLINE) 这些数据库涉及广泛的主题范畴,覆盖 了各个领域和学科
/FSIP (属wilsonselectplus)数据库中的数据 可提供全文)800多种期刊,94年至今的 资料。
关键词检索 分类检索
Medwebplus ()
1998年从MedWeb分化出来,现版权属 y-DNA公司。 Medwebplus提供了二种检索方法:主题 索引、地理索引。
Medwebplus ()
save
Pubmed允许存储5000条题录(选用系 统默认显示格式)尽量采用相同格式 多项检索用clipboard 注:
选用Pubmed save按钮 可保存全部所检记录 文件名后加 .txt 可在写字板或word中打开 (如china.txt) 选用浏览器文件-另存为 保存当前页
保存检索策略
Healthgate Medline
()
PubMed
数据库主建单位:美国生物技
术信息中心(NCBI)研制的数据库。
数据类型:期刊论文、综述、
以及与其他数据资源链接。
特点:提供原文获取余种生物医学期刊,内容涉及医学、 护理、牙科、兽医、健康保健系统、前 临床医学等学科。这些期刊来源于美国 和世界上70多个国家和地区。 文献量达1千1百万条记录,并回溯到 1966年。
Medwebplus 特点
概念检索 出版物检索 机构检索 全文部分免费获取
一个 或多个 检索词 (系统默认空格为
AND检索) 著者姓名,姓在前,名在后, 如:smith ab 刊名可输全称,或MEDLINE认可的标 准缩写形式 布尔逻辑运算式: (运算符须大写) 如 (hepatitis b OR hepatitis c) AND gene
自动转换检索词(automatic term mapping)
Previw/index(检索策略预览)
浏览检索式 改变检索式 (可用检索式编号#1 OR #2) 浏览索引(index)
Index(索引字顺表)
选择限制字段 输入检索词(词根) 在字顺表中选择检索词 选用逻辑算符建立检索式 点击GO
History 检索式回顾 编辑检索式 如#3 AND child
引文匹配器 (Citation Matcher):
输入题录信息,查找特定文献进行
补缺。 刊名要准确,缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如查找:Taiwan I Hsueh Hui Chih由 Chang PY(taiwan yi xue za zhi ) 撰 写、 1975 发表文献的其他著者
第一部分 因特网上免费MEDLINE
一.历史与背景
INDEX MEDCUS MEDLARS ONLINE MEDLINE CD MEDLINE WEB
MDLINE Web (Free) 检索特点:
免费提供题录和文摘 可与提供原文的网址链接 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷
Citation Report: 显示除上述内容外,加 MeSH叙词、化学物质名称、资助项目 号等字段。 MEDLINE Report:
显示记录选择 单一记录:著者姓名 所有记录:选格式、点按display 选定记录: 方框内打钩
保存检索结果
Clipboard(剪贴板)(Clip) 允许存储500条题录(01年增加到1000条) 选中题录(或文摘) 点击 clip Add 多项检索后一起保存
五.获取原文及相关资源
1.联机获取原文(文摘中超链) 2.向NLM索取原文(order)(由 图书馆出面向成员馆订购) 3.相关文献查找(related article) 4.其他数据库资源(生物信息学 等)
六.侧栏上的其他功能
Mesh Browser 功能: 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 Simple display
期刊浏览器 (Journal Browser):
通过输入刊名、缩写名、等浏览期刊文 献。 提供电子原文的超链键。
临床问题 (Clinical Queries):
专门检索临床研究方法学文献,主要涉 及治疗、诊断、病因、和预后四个分类, 并提供强调选择,即敏感度(强调查全) 或专指度(强调查准)。
In process citation 提供MEDLINE尚未经规范处理的数 据。 获MeSH词后,再加入MEDLINE。 记录中[record in process]的标记。