浙江省主要水稻品种微卫星标记数据库的初步构建
利用微卫星标记分析浙江省近年来主要水稻品种的遗传多样性
利用微卫星标记分析浙江省近年来主要水稻品种的遗传多样性程本义;吴伟;夏俊辉;刘鑫;杨仕华【期刊名称】《中国水稻科学》【年(卷),期】2009(023)005【摘要】利用12个DNA微卫星标记分析了浙江省近年来主要的44个常规水稻品种和54个杂交水稻组合,共检测到等位基因68个,每个标记2～10个;带型数共127种,每个标记3～18种;平均多态性频率0.752,变幅为0.567～0.905.常规品种和杂交组合均表现为亚种间遗传差异明显、亚种内遗传差异较小,籼型遗传多样性高于粳型.平均遗传相似系数,常规品种籼型为0.672,粳型为0.711,籼粳间为0.103,杂交组合籼型为0.636,粳型为0.669,籼粳间为0.343.聚类分析显示,以遗传相似系数0.618为阈值将常规品种分成6类,以0.601为阈值将杂交组合分成7类,且多数同类型品种或组合聚为同一类.%Forty-four conventional rice varieties and 54 hybrid rice combinations in Zhejiang Province, China were assayed with a set of 12 microsatellite markers. A total of 68 alleles and 127 fingerprints from all tested materials were detected. The values of the frequency of polymorphism ranged from 0.567 to 0.905 with an average of 0.752. The conventional rice varieties and hybrid rice combinations both had obviously genetic difference among subspecies, but had less genetic difference within subspecies. The genetic diversity of indica type was higher than that of japonica type. The average genetic similarity coefficients within conventional indica, japonica and between indica and japonica rice varieties were 0.672, 0.711 and 0.103, respectively. Theaverage genetic similarity coefficient within indica, japonica, and between indica and japonica hybrid rice combinations were 0.636, 0.669 and 0.343, respectively. Cluster analysis results showed that the conventional rice varieties and hybrid rice combinations were classified into 6 and 7 groups, respectively. Most of varieties or combinations with same type gathered into same group.【总页数】4页(P551-554)【作者】程本义;吴伟;夏俊辉;刘鑫;杨仕华【作者单位】中国水稻研究所,浙江,杭州,310006;浙江省种子管理总站,浙江,杭州,310020;中国水稻研究所,浙江,杭州,310006;浙江省种子管理总站,浙江,杭州,310020;中国水稻研究所,浙江,杭州,310006【正文语种】中文【中图分类】Q943;S511.03【相关文献】1.微卫星分子标记鉴定黑龙江主要水稻品种及遗传多样性的研究 [J], 秦檬;陈颖;徐宝梁;唐英章;张青文2.利用微卫星标记分析军曹鱼养殖群体的遗传多样性 [J], 李伟强; 汤保贵; 陈刚; 马骞; 黄建盛; 施钢; 潘传豪; 周晖; 谢瑞涛; 张健东3.利用微卫星标记分析儋州鸡等5个地方种群遗传多样性 [J], 李义书;刘祎;侯冠彧;曹婷;周汉林;施力光;蔡克奇4.利用微卫星分子标记分析渤海湾的口虾蛄遗传多样性 [J], 谷德贤;王婷;许玉甫;吴宁;王娜;郝郁;王刚;李文雯;刘国山5.利用微卫星标记分析兰坪长毛山羊遗传多样性 [J], 朱兰;孙利民;袁跃云;洪琼花;马兴跃因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
【浙江省自然科学基金】_微卫星标记_期刊发文热词逐年推荐_20140811
科研热词 微卫星 est-ssr 遗传多样性 胡桃 引物 鮸鱼 重复类型 跨种扩增 豌豆 表达序列标签-微卫星标记 蚕豆 虎纹蛙 磁珠富集法 白条纹叶及白穗突变体 水稻 日本蟳 微卫星标记 多态性 基因组 基因定位 分布特征 亲缘关系
2009年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
科研热词 香稻 遗传多样性 近缘物种 聚类分析 聚合酶链反应 社鼠 样品保存 数据库查找 微卫星标记 微卫星位点 基因组dna 动物组织 分离方法 dna提取
推荐指数 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
2008年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
科研热词 长爪沙鼠 遗传监测 遗传多样性 花(鱼骨) 聚合酶链反应 结直肠肿瘤/遗传学 结直肠肿瘤/病理学 突变 微卫星dna 唇(鱼骨) 分子标记 优化 issr dna,卫星
推荐指数 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
推荐指数 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
2013年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16
2013年 科研热词 多态性 遗传结构 通用性 稻瘟菌 稻瘟病菌 稻瘟病 无毒基因 文蛤 散发性结直肠癌 微卫星不稳定 基因组 图位克隆 分子标记 g-ssrs est-ssrs cpg岛甲基化表型 推荐指数 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
推荐指数 4 3 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
浙江粳稻地方品种核心样品的构建方法
Ξ 国家“九五”重点科技攻关项目和国家“973”项目 收稿日期: 1999211219, 接受日期: 2000207218 R eceived on: 1999211219, A ccep ted on: 2000207218 © 1995-2005 Tsinghua Tongfang Optical Disc Co., Ltd. All rights reserved.
根据丁颖变种分类法[14], 将供试材料分层为若干不同的变种, 变种内采用聚类分组和随 机取样两种方法, 从每一变种类型组中抽取一定数量的品种构成核心样品, 对于小样品类型 (品种份数占总样品份数的比例低于5% 的变种类型) 人为确定入选核心样品的品种份数。同 时, 不同方法、不同比例所构成的每一核心样品中均优先确定5份早期大面积推广品种 (年种 植面积超过10万公顷)、重要亲本或重要的特色资源 (10509, 853, 老虎稻, 平湖老来青和香 粳稻) , 约占整个样品的0. 3%。
关键词 稻种资源; 核心样品; 粳稻
M ethods of D evelop ing a Core Collection for Zhejiang Trad itiona l J ap on ica R ice Germ pla sm
W E I X ing2H ua TAN G Sheng2X iang YU H an2Yong J IAN G Yun2Zhu
系统聚类分析, W ilcoxon 秩和检验和方差同质性测验均在 SPSS 统计软件的相应程序中
水稻基因组中的微卫星标记及其应用
水稻基因组中的微卫星标记及其应用何风华【期刊名称】《湖南农业大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2004(030)005【摘要】微卫星又叫简单重复序列,是指以少数几个核苷酸(多数为2～4个)为重复单位组成的串联重复序列,微卫星的两侧为保守的单拷贝序列.不同品种间微卫星基序重复次数的不同而形成了多态性,这种多态性可以通过设计PCR引物扩增检测出来,此即为简单序列长度多态性.微卫星标记具有共显性、高多态性、实验操作简单、快捷和检测结果稳定可靠等优点,是一种理想的分子标记.微卫星标记在水稻基因组中非常丰富,且分布均匀,水稻微卫星标记已发展了2 740多个.微卫星标记在水稻分子标记连锁图的构建、基因(QTL)定位、系谱分析和分子标记辅助选择、遗传多样性研究和种质鉴定等许多方面得到了广泛应用.【总页数】5页(P488-492)【作者】何风华【作者单位】华南师范大学生命科学学院,广东,广州,510631【正文语种】中文【中图分类】Q78;S511.03【相关文献】1.水稻细菌性条斑病抗性微卫星(SSR)标记的筛选及其在标记辅助选择中的应用 [J], 陈志伟;吴为人;周元昌;景艳军2.甜瓜中微卫星标记的形成及其在主要葫芦科作物中的应用 [J], NaokiChiba;KeitaSuwabe;谢国禄3.微卫星标记方法在大型猫科动物保护群遗传学研究中的应用与挑战 [J], 王萌;朱思雨;薛茂盛;刘霖;任迎丰;李立新;许青;姜广顺4.微卫星标记方法在大型猫科动物保护群遗传学研究中的应用与挑战 [J], 王萌;朱思雨;薛茂盛;刘霖;任迎丰;李立新;许青;姜广顺;5.线粒体NADH1基因和微卫星标记在棘球绦虫感染检测中的应用 [J], 吕凤军;陈云英;郭涛;王方;乌云花;张壮志;王冰洁;丁伟强;赵莉;班万里;段兰利;穆尼拉•特列吾汗;吴小霞;徐晶因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
用微卫星标记评估中国水稻主栽品种的遗传多样性
微卫星标记多态性指标采用多态性频率 （frequency polymorphisms，FP），其计算公式为[23]： n FP = 1-∑[mi×(mi-1)]/[m×(m-1)] i 式中，n 为检测到的微卫星标记带型总数，m 为供试 材料总数，mi 为具有第 i 种带型的材料数。同时，应 用软件 NTSYS[23]（Applied Biostatics Inc）、以共有 DNA 片段比例（软件中参数为 DICE）作为指标，计 算供试各对材料间的相似系数。然后用非加权平均数 UPGMA 方法（ Unweight Pair Group Method using Arithric Averages）进行聚类分析。
摘要： 【目的】为正确评估中国水稻(Oryza sativa L.)主栽品种的遗传多样性提供依据。 【方法】应用位于 水稻)12 条染色体上已筛选的 24 个微卫星(simple sequence repeats, SSR)标记组合（每条染色体 2 个） ，分析 63 个主栽常规稻品种和杂交稻组合亲本(2002 年推广面积达 6.67×104 ha（100 万亩）)的遗传变异。 【结果】共 检测到 135 个等位基因， 平均每个标记 5.6 个； 多态性频率 （frequency of polymorphisms, FP） 变动范围为 0.486～ 0.840，平均 0.682。水稻恢复系比保持系/不育系遗传差异大；与常规籼稻品种相比，常规粳稻品种的遗传多样 性较低。聚类分析表明，中国籼稻品种主要来自华南稻区和长江流域稻区，粳稻品种则分布于北方稻区和太湖流 域(江苏和浙江省)，表现出明显的地域分布特点。 【结论】作者认为，应用微卫星标记所作的中国水稻品种聚类分 析与传统系谱分析趋势一致，结果更为精确。 关键词：水稻；微卫星标记；遗传多样性；遗传关系
水稻微卫星标记与遗传多样性的检测
水稻微卫星标记与遗传多样性的检测吴秋花;李晓方;毛兴学【期刊名称】《分子植物育种》【年(卷),期】2005(3)5【摘要】遗传多样性是种内不同群体之间或一个群体内不同个体遗传变异的总和。
千百年来,人类就是利用遗传多样性来培育新的农作物品种以对抗新虫害、新病害以及适应多变的气候和环境条件。
检测手段从形态到分子水平的发展使得对遗传多样性的检测产生了质的飞跃,微卫星标记等位基因多态性高,通过PCR对其进行测定简单经济,作为第二代分子标记在检测物种的遗传多样性方面是一类很有应用价值的遗传标记。
本文概述了微卫星标记在检测水稻遗传多样性中的应用及其数理统计的方法。
【总页数】5页(P744-748)【关键词】遗传多样性;微卫星标记;检测手段;水稻;农作物品种;基因多态性;遗传变异;分子水平;遗传标记;分子标记【作者】吴秋花;李晓方;毛兴学【作者单位】广东省农业科学院水稻研究所【正文语种】中文【中图分类】S511;Q943【相关文献】1.用微卫星标记评估中国水稻主栽品种的遗传多样性 [J], 应杰政;施勇烽;庄杰云;薛庆中2.微卫星分子标记鉴定黑龙江主要水稻品种及遗传多样性的研究 [J], 秦檬;陈颖;徐宝梁;唐英章;张青文3.利用微卫星标记比较云南元阳哈尼梯田两个不同时期种植的水稻地方品种的遗传多样性 [J], 徐福荣;张红生;董超;杨文毅;汤翠凤;阿新祥;张恩来;杨雅云;张斐斐;戴陆园4.利用微卫星标记分析浙江省近年来主要水稻品种的遗传多样性 [J], 程本义;吴伟;夏俊辉;刘鑫;杨仕华5.基于新开发微卫星标记评价番红砗磲两个野生群体的遗传多样性及近缘种通用性检测 [J], 高红梅; 马海涛; 喻子牛; 张跃环; 肖述; 黄飘逸; 彭建军因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
杂交稻主要亲本的SSR分子身份证数据库的构建
11 1材料与来自法水稻材料 5个1 1 1 初步筛选 SSR 引物的 12 个水稻品种
籼型三系杂交稻 17 份 ( 编号为 122~ 138) 以及籼 型两系杂交稻 1 份 ( 编号为 139) ( 表 1) 。
恢复系 ( 明恢 86、蜀恢 527、 9311、明恢 63 、闽
表 1 供试的 139 份水稻品种材料 Table 1 139 rice cultivars used in this study
编号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 注: * 品种 测 64 早恢 80 早恢 100 早恢 89 鄂恢 928 晚三 明恢 63 明恢 69 明恢 72 明恢 75 明恢 77 明恢 81 明恢 82 明恢 86 航1号 明恢 88 泸恢 17 泸恢 6 号 盐恢 559 辐恢 718 辐恢 838 辐恢 101 198 蜀恢 881 编号 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 品种 蜀恢 527 绵恢 436 江恢 151 武恢 898 湖恢 福恢 016 福恢 964 中恢 8006 云恢 72 桂 99 蜀恢 537 宁恢 3111 宁恢 627 乐恢 188 密阳 46 先恢 207 恩恢 99- 64 南恢 511 岳恢 94 广恢 128 广恢 998 广恢 3550 闽恢 3129 闽恢 3139 编号 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 品种 闽恢 3229 闽恢 3301 闽恢 3119 闽恢 3189 闽恢 6118 榕恢 175 镇恢 084 绵恢 501 科恢 752 多恢 43 镇恢 129 闽恢 301* 闽恢 302* 编号 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 品种 渝恢 6078 173 恢 9810 中恢 2070 IR26 8L124 岗恢 22 蜀恢 162 蜀恢 524 gk1019 中恢 413 669 IR 58025B 闽丰 29B - 32A - 32 B 珍汕 97A 谷丰 A 谷丰 B 天丰 A 连丰 A 粤丰 B 绵香 1B 岳 4B 编号 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 品种 福伊 B 菲改 B 龙特甫 A 龙特甫 B 闽丰 1B 珍白 B 丰 008B 花 IB 博白 B 地香 B 中 9B 早冈 B 金 23B 协青早 B 优 IB D 702B D 62B D 297B V 20B T 55B IR688998B IR68902B IR 73328 B 广占 63S 编号 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 品种 9311( 扬稻 6 号 ) 优明 86 优 3301 优 3229 优 3139 优 3119 汕优 63 汕优 46 闽优 3301 天优 3301 天优 3229 谷优 3301 谷优 527 谷优 3139 谷优 3119 连优 6118 连优 3189 特优 3189 扬两优 6 号
微卫星标记分析我国南方常规水稻品种的遗传差异
微卫星标记分析我国南方常规水稻品种的遗传差异程本义;夏俊辉;沈伟峰;庄杰云;杨仕华【期刊名称】《核农学报》【年(卷),期】2009(23)1【摘要】利用12个DNA微卫星标记对2005—2007年参加南方稻区国家水稻品种区域试验的23个长江中下游早籼、晚粳和华南早籼常规品种进行标记检测，结果共检测到等位基因47个，平均每个标记3．9个，变幅2～7个，多态性频率（FP）平均值0．632，变幅0．403～0．842。
遗传差异分析表明：长江中下游早籼与长江中下游晚粳（平均遗传相似系数AGSC=0．036）、华南早籼与长江中下游晚粳（AGSC=0．125）品种间的遗传差异明显，长江中下游早籼与华南早籼（AGSC=0．449）品种间的遗传差异中等，华南早籼（AGSC=0．606）、长江中下游早籼（AGSC=0．682）、长江中下游晚粳（AGSC=0．761）品种间的遗传差异较小。
【总页数】5页(P7-11)【关键词】水稻;品种;微卫星标记;遗传差异【作者】程本义;夏俊辉;沈伟峰;庄杰云;杨仕华【作者单位】中国水稻研究所【正文语种】中文【中图分类】S858.31;S512.1【相关文献】1.微卫星(SSR)分子标记在杂交水稻不育系不同株系遗传差异分析中的应用 [J], 欧立军2.微卫星标记分析水稻地方品种30年的遗传变异 [J], 严红梅;董超;张恩来;汤翠凤;阿新祥;杨文毅;杨雅云;张斐斐;徐福荣3.利用微卫星标记分析浙江省近年来主要水稻品种的遗传多样性 [J], 程本义;吴伟;夏俊辉;刘鑫;杨仕华4.南方稻区国家水稻区域试验品种的微卫星标记分析 [J], 程本义;施勇烽;沈伟峰;庄杰云;杨仕华5.用微卫星DNA标记对我国杂交水稻主要恢复系遗传差异的检测分析 [J], 段世华;毛加宁;朱英国因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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浙江省水稻品种DNA指纹数据库的初步构建及其应用程本义1吴伟2*夏俊辉1刘鑫2庄杰云1杨仕华1(1中国水稻研究所，浙江杭州310006；2浙江省种子总站，浙江杭州310020；*通讯联系人，E-mail:wuwei1610@)摘要：利用前期研究建立的一套水稻品种DNA指纹检测技术体系，对2002-2006年浙江省主要的水稻品种98个、2007-2008年省区试水稻品种155个（181个次，含26个续试品种）进行了DNA 指纹检测，构建了279个次水稻品种×12个微卫星标记的DNA指纹图谱数据库。
系统分析了指纹库中各标记的多态性和品种的相似性。
基于构建的指纹数据库，对所有品种的特异性及区试续试品种年度间的一致性进行了鉴定。
关键词：水稻品种；微卫星标记；DNA指纹库；特异性Construction and Application of DNA Fingerprint Database of Rice Varieties in Zhejiang ProvinceCHENG Ben-yi1,WU Wei2,*,XIA Junhui1,LIU Xin2,ZHUANG Jie-yun1,YANG Shi-hua1(1China National Rice Research Institute,Hangzhou310006,China;2Zhejiang Provincial Seed Management Station,Hangzhou310020,China;*Corresponding author,E-mail:wuwei1610@)Abstract:A total of98major rice varieties in Zhejiang province from2002to2006 and155rice varieties in Zhejiang provincial regional trial from2007to2008were assayed with a set DNA fingerprint testing system on rice variety.A DNA fingerprint database containing genotypic data of279rice variety times at the12marker loci was constructed.The polymorphism of different markers and genetic similarity of varieties in the DNA fingerprint database were analyzed.Based on the DNA fingerprint database,the distinctness of all rice varieties and consistency of the same varieties in different years were identified.Key words:rice variety;microsatellite marker;DNA fingerprint database; distinctness特异性（Distinctness）是农作物新品种权申请和品种审（认）定的前提条件。
“九五”中后期以来，在种子产业快速发展的推动下，浙江省包括水稻在内的农作物品种数量明显增加，在促进农业生产发展的同时，也不同程度存在品种雷同、侵权等现象。
而目前，水稻品种特异性鉴定的主要方法是新品种DUS测试，该方法测试周期长、工作量大，难以及时高效地对浙江省大量水稻品种进行特异性鉴定，有必要寻求一种快速、准确、高效的新方法。
二十世纪九十年代以来，随着分子生物学的发展，以分子标记为基础的DNA指纹基金项目：浙江省“三农五方”科技协作项目（Sn200606）；中央级公益性科研院所专项资金项目（2006RG002）。
作者简介：程本义（1977-），男，浙江淳安人，助理研究员，主要从事水稻新品种评价和品种DNA指纹鉴定研究。
E-mail：cby_951019@。
技术日趋成熟，并逐渐应用于农作物品种鉴定领域。
在利用DNA指纹技术进行农作物品种鉴定时，若只针对少数特定品种，则可以同时鉴定，如少数品种的纯度、真假鉴定等[1-5]；若要进行品种特异性鉴定，则需要建立已知品种的DNA指纹数据库。
近年来，国内外主要农作物品种DNA指纹数据库的构建工作已逐步展开，如Röder[6]等用20个DNA微卫星标记构建了欧洲500多个小麦品种的指纹数据库；Bredemeijer[7]等用20个微卫星标记构建了欧洲500多个番茄品种的DNA指纹数据库；赵久然、王凤格[8-10]等进行了中国玉米新品种DNA指纹库构建的系列研究，旨在从DNA分子水平上给每个玉米品种一个身份证；庄杰云[11]等初步构建了我国主栽水稻品种的微卫星标记数据库。
本研究利用前期建立的一套水稻品种DNA指纹检测技术体系，对浙江省近期的主要水稻品种及2007-2008年参加省区试的水稻品种进行DNA指纹检测，建立了包含253个(279个次，含26个续试品种）水稻品种的DNA指纹图谱数据库。
并基于该指纹图谱数据库，对所有品种的特异性及区试续试品种年度间的一致性进行鉴定，为进一步规范和完善浙江省水稻品种区试、审定及管理工作提供技术支持。
1材料与方法1.1水稻材料依据浙江省农作物品种审定公告、农作物分品种推广面积统计等资料，征集2002-2006年通过浙江省审定、引种审批和国家审定适宜在浙江省推广种植以及2002年前通过审定且目前生产上仍有较大种植面积的水稻品种98个；依据浙江省水稻品种区域试验实施方案，收集2007-2008年参加省区试的水稻品种155个（181个次，含26个续试品种）。
本研究共收集到目标水稻品种253个（279个次，含26个续试品种），其中常规籼型43个、粳型55个，杂交籼型124个、粳型31个。
1.2指纹检测选取24个水稻DNA微卫星标记，每条染色体上2个，按推荐类型可分为首选标记12个，分别是RM297、RM71、RM85、RM5414、RM274、RM190、RM336、RM337、RM219、RM311、RM209和RM17；候补标记12个，分别是RM1195、RM208、RM232、RM273、RM267、RM253、RM18、RM72、RM278、RM258、RM224和RM19。
这些标记的基因组位置、引物序列、多态性片段大小等相关信息见文献[11]。
遵照前文[12]所述方法提取水稻品种的总DNA、进行PCR扩增、电泳分离扩增产物、记录指纹（带型）。
利用12个首选标记对所有水稻品种进行指纹检测，对12个首选标记座位上指纹表现一致的水稻品种进一步增加12个候补标记检测。
1.3数据分析以多态性频率（frequency of polymorphism，FP）描述微卫星标记的多态性，该参数表示微卫星标记在水稻品种间检测到差异性的频率。
其计算公式为：式中，n 为所分析的微卫星标记在水稻品种中检测到的不同带型总数，m 为水稻品种总数，m i 为具有第i 种带型的品种数。
同时，应用软件NTSYS [13]、以共有DNA 片断比例[14]（软件中参数为DICE）为指标计算各对水稻品种间的遗传相似系数，并按类型分析品种的相似性。
2结果与分析2.1DNA 指纹数据库的初步构建为了保证指纹检测的效果，所有品种的检测操作均由同一人完成、实验试剂均由同一厂商提供。
对于每个首选标记，按固定品种顺序，将所有279个次水稻品种的PCR 扩增产物上样于9块凝胶、电泳分离、银染显色，共计检测图版108个。
在胶版排列上，每块凝胶的最左侧泳道设置100bp DNA 分子量Marker，中间泳道设置带型标准对照（CK），两边泳道上样相同数目的待测品种，图1所示为35个水稻品种在RM336标记座位上的指纹表现。
在前期研究结果[15]中，按照带型清晰、稳定重现的原则，12个首选标记共认定了nFP =1-∑[m i ×(m i -1)]/[m ×(m-1)]i图1、35个品种在RM336标记座位上的指纹表现Fig.1Fingerprint performance of 35rice varieties at marker locus RM336.71个等位基因，并依据多态性片段分子量从大到小按1、2、3、4、5…对所有等位基因进行了编号。
在本研究的指纹检测过程中，有3个标记检测到新的多态性片段，分别是RM71在丰优香占和浙优9号品种中检测到1个（编号3），RM209在甬优2号和甬优4号品种中检测到1个（编号3），RM17在浙粳40、浙粳20、浙糯5号和航天36品种中检测到1个（编号5）。
最后，以认定的74个等位基因为基础记录所有品种的带型，并对带型数据进行整理，建立了279个次水稻品种×12个微卫星标记的DNA指纹图谱数据库。
表1为4个代表性水稻品种在12个首选标记座位上的指纹数据。
表14个代表性水稻品种在12个微卫星标记座位上的指纹数据Table1Fingerprint data of4representative rice varieties at12SSR loci.标记Marker 等位基因Allele浙101Zhe101浙粳40Zhejing40丰优香占Fengyouxiangzhan甬优2号Yongyou2标记Marker等位基因Allele浙101Zhe101浙粳40Zhejing40丰优香占Fengyouxiangzhan甬优2号Yongyou2RM29710000RM27411010 200002011130101RM337100004000021010500003010160000400007101050000 RM7110000RM21910000 2000020000 3*001030010400004000050001510006111160101 RM851101070000 2000080001300009000040101100000 RM541410000RM31110010 20111200003000030000410104000150001510106000060101 RM1901111170000 200008000031000RM209100004000020000 RM336100003*0001 2001041010300005011140000RM171000050000210106000030000 7000040000 810005*0100 9010160001 10000070000注：*表示本研究中新发现的等位基因。