鼠尾藻微卫星标记开发及青岛群体遗传多样性分析
微卫星DNA标记分析野生鲤鱼群体的遗传多样性(英文)
微卫星DNA标记分析野生鲤鱼群体的遗传多样性(英文)李大宇;康大海;殷倩茜;孙效文;梁利群【期刊名称】《遗传学报：英文版》【年(卷),期】2007(34)11【摘要】利用30个微卫星分子标记对海南鲤(HN)、长江鲤(CY)、月亮湖鲤(YL)、黑龙江鲤(FY)、呼伦湖鲤(ZL)、贝尔湖鲤(BR)6个野生鲤鱼群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,χ2检验估计Hardy-Weinberg平衡,用近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化及其来源。
同时,使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA进化树。
6个群体共检测到8,136个扩增片段,长度在125bp～414bp,30个基因座扩增出等位基因数从3～13个不等,共计210个等位基因,平均每个基因座扩增得到7个等位基因。
结果显示:(1)6个野鲤群体的多态性指标均适中,多态信息含量依次0.44、0.52、0.53、0.57、0.63和0.64,有效等位基因数1.04～4.72个不等,平均有效等位基因数依次为2.19、2.60、2.42、2.43、2.45和2.33,无偏期望杂合度平均值为0.50、0.59、0.56、0.56、0.57和0.54;(2)遗传相似系数BR与ZL最高(0.8511),BR与HN最低(0.6688),聚类结果与地理分布呈一定相关性。
【总页数】10页(P984-993)【关键词】分子标记;微卫星;群体多样性;鲤鱼【作者】李大宇;康大海;殷倩茜;孙效文;梁利群【作者单位】黑龙江水产研究所北方鱼类生物工程育种重点开放实验室;大连水产学院生命科学与技术学院【正文语种】中文【中图分类】Q943【相关文献】1.斑节对虾3个野生群体遗传多样性的微卫星标记分析 [J], 赵志英;梁丽运;白丽蓉2.山东省三个鲤鱼群体遗传多样性及亲缘关系的微卫星标记分析 [J], 马洪雨;岳永生;郭金峰;公维华;王慧3.许氏平鲉(Sebastes schlegeli)微卫星标记开发及野生、养殖群体遗传多样性分析 [J], 韩承慧;马海涛;姜海滨;刘阳;韩慧宗;王斐4.用微卫星标记分析湘华鲮野生群体遗传多样性 [J], 刘明求;刘臻;李传武;卞伟;余长生;鲁双庆5.运用微卫星DNA标记分析我国野生鹌鹑遗传多样性 [J], 常国斌;常洪;刘向萍;王惠影;徐伟;赵文明;王庆华因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
利用微卫星标记分析不同地理亚群香螺群体的遗传多样性的开题报告
利用微卫星标记分析不同地理亚群香螺群体的遗传多样性
的开题报告
问题背景：
香螺是一种重要的经济水产品，广泛分布于中国南部海岸线的潮间带和浅海区域。
近年来，随着人类活动的持续增加，香螺群体的自然环境和生存条件受到了很大的威胁。
因此，如何保护和维护香螺群体的遗传多样性和遗传稳定性，成为了一个重要的
研究领域。
研究目的：
本研究旨在通过利用微卫星标记，对不同地理亚群香螺群体进行遗传多样性分析，探究不同群体间的遗传关系以及群体遗传多样性状况，并为香螺资源的保护提供科学
依据。
研究内容：
1. 样品采集与DNA提取：在中国南部海岸地区随机采集一定数量的香螺样品，
采用常规方法提取DNA。
2. 微卫星PCR扩增：根据已发表的香螺微卫星标记序列，选择适当的标记进行PCR扩增，得到香螺DNA微卫星遗传位点。
3. 电泳分析与数据处理：将PCR扩增得到的香螺DNA微卫星片段进行电泳分析，根据电泳图谱结果，计算不同群体的遗传多样性指标，并进行遗传聚类分析。
4. 统计结果分析：将遗传多样性分析的结果进行统计分析，探究不同地理亚群之间的遗传关系以及群体遗传多样性状况，并对结果进行具体解释。
预期成果：
本研究预期得到不同地理亚群香螺群体的微卫星遗传多样性分析结果，了解不同群体之间的遗传关系和群体遗传多样性状况，为香螺资源的保护和利用提供科学依据。
基于微卫星标记整合长牡蛎遗传图谱
基于微卫星标记整合长牡蛎遗传图谱郭香;李琪;孔令锋;于红【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2013(037)006【摘要】为了提高长牡蛎遗传图谱上的微卫星标记密度,实验采用6个家系图谱间的共有微卫星标记作为锚定标记,构建了长牡蛎的整合图谱.该整合图谱共有161个微卫星标记,覆盖10个连锁群,图谱长度和平均间距分别为615.4和3.8 cM.各连锁群的标记数介于10 ～ 24个之间,连锁群长度为47.3～73.3 cM,是目前密度最高的长牡蛎微卫星图谱.不同作图家系连锁群上的标记分组保持一致,但标记顺序出现差异,可能与长牡蛎自然群体中存在大量的染色体重排现象有关.结果表明,该图谱可以为今后长牡蛎的遗传育种研究提供新的遗传工具.%In order to improve the density of microsatellite markers,a consensus map of C.gigas was constructed based on common microsatellite markers among six mapping populations.The consensus map contained 161 microsatellite markers,spanning 10 linkage groups.The map length and average genetic distance is 615.4 cM and 3.8 cM respectively.The number of loci on linkage group ranged from 10 to 24 and the genetic length of linkage group varied from 47.3 to 73.3 cM.At present,this consensus map is the densest SSR-based map of C.gigas.Among different mapping populations,the grouping of markers is consistent;however,the order of markers is a little different,which is likely attributed to polymorphism for chromosomal rearrangements in the natural population of Pacific oysters.The resultsshow that the consensus map will provide a new reference tool for genetics and breeding of C.gigas in the future.【总页数】7页(P823-829)【作者】郭香;李琪;孔令锋;于红【作者单位】中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室,山东青岛 266003;中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室,山东青岛 266003;中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室,山东青岛 266003;中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室,山东青岛 266003【正文语种】中文【中图分类】Q785;S917.4【相关文献】1.牙鲆微卫星标记遗传连锁图谱的构建 [J], 宋文涛;梁卓;田永胜;陈松林;张潇峮;廖小林;邵长伟;王磊;庞仁谊;牛余泽;赵永伟;李文龙2.利用BAC、BIBAC文库整合构建陆地棉遗传标准系TM 1全基因组的遗传、物理图谱：BAC及BIBAC文库构建，SSR标记开发和物理/遗传图谱整合 [J], John Z. YU;Russell J. KOHEL;Hong-bin ZHANG;Jian-min DONG;Shu-kuSUN;Nicole L. STEELE3.绒山羊X染色体7个微卫星标记的遗传连锁图谱的构建 [J], 徐磊;王敏;呼都特;孟克格日乐;姚继广;杨子森;赖双英;张文广;李金泉;吴萍;王志新;乔峰4.长牡蛎（Crassostrea gigas）壳宽快速生长选育群体遗传多样性及遗传结构的微卫星标记分析 [J], 张荣良;王卫军;冯艳微;杨建敏;唐海田;纪仁平5.半滑舌鳎微卫星标记遗传连锁图谱的构建 [J], 赵永伟;宋文涛;廖小林;牛余泽;庞仁谊;高峰涛;沙珍霞;陈松林因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
应用微卫星标记分析4个黄颡鱼群体的遗传多样性
应用微卫星标记分析4个黄颡鱼群体的遗传多样性王婷婷;宋学宏;许爱国;张磊磊;孟祥雨;张红英【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2012(040)004【摘要】利用微卫星标记技术对湖州(HZ)、澄湖(CH)、太湖(TH)和四川(SC)4个黄颡鱼群体的遗传多样性及其亲缘关系进行研究.通过筛选12对引物,获得7对有效引物,在4个群体中共检测到22个等位基因,平均等位基因数约为3.14个.统计结果显示:(1)4个黄颡鱼群体的多态性指标处于中等水平,HZ、CH、TH和SC的平均多态性信息含量PIC分别为0.425、0.369、0.433、0.406.(2)群体间遗传分化不明显,各基因座遗传分化系数(Fst)均值为0.04,基因流(Nm)的均值为7.847;(3)4个群体的亲缘关系较近,其中HZ和TH两个群体的遗传相似系数最高(0.985),CH和SC群体的遗传相似系数最低(0.930).【总页数】5页(P41-45)【作者】王婷婷;宋学宏;许爱国;张磊磊;孟祥雨;张红英【作者单位】苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,江苏苏州 215123;苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,江苏苏州 215123;苏州市水产养殖场有限公司,江苏苏州 215127;苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,江苏苏州 215123;苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,江苏苏州 215123;苏州市水产养殖场有限公司,江苏苏州 215127【正文语种】中文【中图分类】Q953【相关文献】1.应用微卫星DNA标记进行边鸡群体遗传多样性分析 [J], 白文林;尹荣焕;杨桂芹;赵素君;宫艳秋;罗光彬2.应用微卫星标记分析长江流域长吻能4个群体的遗传多样性 [J], 王红莹;黄文清3.应用微卫星标记分析一个日本锦鲤人工养殖群体的遗传多样性 [J], 陈万光;崔智峰;董彬;王慧4.利用微卫星标记分析东平湖黄颡鱼的遗传多样性 [J], 马洪雨;姜运良;郭金峰;岳永生5.三个黄颡鱼群体遗传多样性及亲缘关系的微卫星标记分析 [J], 郭金峰;王玉;马洪雨;岳永生因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
微卫星标记及其在贝类中的应用
微卫星标记及其在贝类中的应用
刘瑾;舒妙安
【期刊名称】《水利渔业》
【年(卷),期】2007(27)2
【摘要】微卫星广泛存在于真核生物基因组中,具有多态性高、共显性遗传、实验操作简单和结果稳定可靠等优点.微卫星标记是一种DNA分析手段,是种群遗传学
研究中广泛应用的分子遗传标记.微卫星标记技术已经应用于贝类遗传多样性评估、种质资源保护、群体遗传结构分析以及遗传连锁图谱的构建等方面.
【总页数】3页(P17-19)
【作者】刘瑾;舒妙安
【作者单位】浙江大学动物科学学院,杭州,310029;浙江大学动物科学学院,杭
州,310029
【正文语种】中文
【中图分类】Q33;Q75
【相关文献】
1.水稻细菌性条斑病抗性微卫星(SSR)标记的筛选及其在标记辅助选择中的应用 [J], 陈志伟;吴为人;周元昌;景艳军
2.微卫星标记在海洋经济贝类中的应用 [J], 姚红伟;陈国栋;宋晶
3.微卫星标记及其在贝类遗传选育研究中的应用 [J], 刘芳;刘卫东;王强;刘晓慧;赫
崇波;侯林
4.海洋贝类微卫星DNA标记的开发及其在遗传学研究中的应用 [J], 李琪
5.微卫星标记在贝类遗传学研究中的应用还处于初级阶段 [J], 钱锦
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水产生物微卫星标记技术研究进展及其应用
水产生物微卫星标记技术研究进展及其应用孙效文;张晓锋;赵莹莹;张研;贾智英;常玉梅;鲁翠云;梁利群【期刊名称】《中国水产科学》【年(卷),期】2008(15)4【摘要】微卫星标记的发展和利用极大地扩展了DNA分子标记应用的深度和广度,使探索生物性状遗传本质的研究发生了革命性变化.本文简要介绍了微卫星标记技术的发展及其在水产遗传与育种研究中的应用.首先回顾了微卫星克隆技术的发展,尤其是水产生物微卫星标记及技术的发展过程,以及水产生物微卫星序列的主要来源,并对微卫星标记与其他DNA分子标记在使用范围、难易程度等方面做了比较;其次探讨了微卫星标记在遗传连锁图谱的制备、性状分析及QTL定位、群体遗传学、进化遗传、种质鉴定与亲权分析、品种培育等6个研究领域的应用;本文还对几种DNA分子标记在操作上的难易程度、多态性程度、重复性与可比性等方面进行了比较,同时还分别阐述了微卫星和其他DNA分子标记应用于水产生物研究中的适用性,并对微卫星标记的应用前景做了展望.本文旨在为微卫星标记技术在水产生物中的有效应用提供理论依据.【总页数】15页(P689-703)【作者】孙效文;张晓锋;赵莹莹;张研;贾智英;常玉梅;鲁翠云;梁利群【作者单位】中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种实验室,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种实验室,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种实验室,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种实验室,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种实验室,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种实验室,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种实验室,黑龙江哈尔滨150070;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,农业部北方鱼类生物工程育种实验室,黑龙江哈尔滨150070【正文语种】中文【中图分类】S917【相关文献】1.微卫星标记技术在水产动物中的研究进展 [J], 肖蓉;黄生强;刘湘毅2.微卫星分子标记技术在遗传学实验教学中的应用--科研转化为实验教学的实践和探索 [J], 李洁;梁前进;靳溪;王红芳3.微卫星标记技术的研究进展及其在家兔研究中的应用 [J], 朱玉峰;王元占;杨培梁4.紫花苜蓿微卫星(SSR)标记技术在草学本科遗传学实验教学中的应用 [J], 王小山; 王炳盛; 刘隆阳5.紫花苜蓿微卫星(SSR)标记技术在草学本科遗传学实验教学中的应用 [J], 王小山; 王炳盛; 刘隆阳因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
微卫星DNA标记技术及其在海洋生物遗传学中的应用
微卫星DNA标记技术及其在海洋生物遗传学中的应用胡则辉;周志刚【期刊名称】《海洋湖沼通报》【年(卷),期】2006()1【摘要】DNA简单重复序列从1974年在海洋生物中被发现,到1989年“微卫星”术语开始使用这段时间是这种新型分子标记技术的发展阶段。
伴随着PCR技术的发明、成熟与拓展,微卫星DNA以其多态性高、随机分布、共显性遗传、重复性好等特点在生物学的个体及系统发育方面得到很广泛的应用。
本文从微卫星DNA的发展简史开始,较详细地介绍了它的原理、方法及策略,然后概括了在海洋动、植物的遗传学中,微卫星DNA在遗传多样性分析、遗传图谱构建、基因鉴定和标记以及系谱认证等领域的研究,展望了其在海洋生物分子育种、基因克隆、生物保护等方面的应用前景。
【总页数】9页(P37-45)【关键词】分子标记;微卫星DNA;遗传多样性;遗传图谱;系谱认证【作者】胡则辉;周志刚【作者单位】上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室【正文语种】中文【中图分类】Q523【相关文献】1.微卫星分子标记技术在遗传学实验教学中的应用--科研转化为实验教学的实践和探索 [J], 李洁;梁前进;靳溪;王红芳2.微卫星标记技术在虾类分子遗传学研究中的应用 [J], 孙悦娜;冯建彬;李家乐3.DNA标记技术在海洋生物种质资源开发和保护中的应用 [J], 刘萍4.紫花苜蓿微卫星(SSR)标记技术在草学本科遗传学实验教学中的应用 [J], 王小山; 王炳盛; 刘隆阳5.紫花苜蓿微卫星(SSR)标记技术在草学本科遗传学实验教学中的应用 [J], 王小山; 王炳盛; 刘隆阳因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
大叶藻居群微卫星遗传多样性研究
大 叶藻（ Ｚ ｏ ｓ ｔ ｅ ｒ ａ ｍ ａ ｒ ｉ ｎ ａ Ｌ ． ） 是 北半球 广泛分 布 的
一
够 的 信 息 量 ，不 能 清 楚 地 反 映 大 叶藻 居 群 遗 传 分
种 海草 ，能生 长在 亚 热带 到冷 温 带 ，甚 至是 亚寒
化、 遗 传结构 与其生 殖策 略和空 间分 布的关系 ［ ５ ， 。
因此 ，大 叶藻 居群 的遗 传结 构有 待 于应用 多态 性 和
灵敏度 更高 的分子标 记进行 探讨 。 微卫 星（ Ｓ Ｓ Ｒ ） 标 记
带 的沿 岸浅 水 区 ［ １ ］ 。大 叶藻 可为 一些 重要 的经 济 鱼 类 、贝类 、棘 皮 动物等 提供 直接 的食物 来源 、栖 息 场 所 、隐蔽场 所 和育幼 场 ， 还 能 缓 冲洋 流和潮 汐对
大 叶藻居 群微 卫星遗传 多样性研 究
孙典 荣 李 渊２ 李文 涛２ 高天 翔２
（ １ ．中国水产科学研究 院南海水产研究所，广州 ５ １ ０ ３ ０ ０ ； ２ ．中国海洋 大学
海 洋 生物 多 样 性 与 进化 研 究 所 ，青 岛 ２ ６ ６ ０ ０ ３ ）
摘要 ： 采用 ４ 对 微卫 星引物 对大 叶藻 的 ７ 个地理 居群 进行 了遗传多样 性与 遗传结 构分析 。 扩增 １ ４ ８ 株 大 叶藻 得到 ５ ７个等位 基 因， 每个位 点平 均等位 基 因数 为 ６ ，大 叶藻 居群 的平均期 望杂合 度（ 胁） 为 ０ ． ６ ８ ７ ，平均观 测
海 底基 质 的扰 动，并 且从 洋 流 中过滤 悬浊 物 和营养
具有 多态性 高 、突变快 、杂合度 高 、共显 性等 特点 ， 已被 广泛应 用于海 洋生物遗 传多样 性研 究【 １ 刚 。迄今 ，
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鼠尾藻微卫星标记开发及青岛群体遗传多样性分析
汤志宏;刘振羽;王军;张宁;毛玉峰;郭栗;杨官品
【期刊名称】《中国海洋大学学报（自然科学版）》
【年(卷),期】2015(045)001
【摘要】分离了鼠尾藻14个微卫星标记并用这些标记分析了鼠尾藻青岛群体遗传多样性和遗传结构.开发的14个标记在青岛群体中共检测到45个等位基因,各标记位点等位基因数在2和6之间,平均3.2个,平均有效等位基因2.1个,群体香农信息指数、观测杂合度、基因多样性指数、多态信息含量分别为0.799、0.449、
0.466和0.406.青岛鼠尾藻种群体遗传多态性中等偏高.青岛4个鼠尾藻采集点的56个鼠尾藻个体在聚类图上无明显聚群和谱系.开发的标记将促进鼠尾藻遗传资源评价、保护和开发利用.
【总页数】6页(P35-40)
【作者】汤志宏;刘振羽;王军;张宁;毛玉峰;郭栗;杨官品
【作者单位】中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003
【正文语种】中文
【中图分类】S917.3;Q322
【相关文献】
1.许氏平鲉(Sebastes schlegeli)微卫星标记开发及野生、养殖群体遗传多样性分析 [J], 韩承慧;马海涛;姜海滨;刘阳;韩慧宗;王斐
2.蛇鳄龟微卫星标记的开发及一个养殖群体的遗传多样性分析 [J], 刘丽;刘海情;郭昱嵩;王中铎;刘楚吾
3.半滑舌鳎养殖群体和减数分裂雌核发育群体的微卫星标记遗传多样性分析 [J], 徐营;邵长伟;邓寒;陈松林
4.海蜇微卫星标记开发及自然、养殖群体遗传多样性分析 [J], 卢彦先;狄明玉;李云峰;周遵春;侯红漫;赫崇波;王绍政;高美玲
5.基于微卫星标记的7个番鸭群体遗传多样性分析 [J], 杨速;陈黎;毛长国;卢立志;操勇清;顾丽红;李丽;曾涛;沈军达;田勇;李国勤;陶争荣
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