皮肤T细胞淋巴瘤皮损与外周血中TCRγ基因重排的检测

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淋巴瘤基因克隆性重排检测

淋巴瘤基因克隆性重排检测

专注分子诊断 精|选 引领精准医学
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基于不同方法的产品系列-Invivoscribe公司
基于PCR检测技术,简便、快 速、成本较低,所需DNA量少, 对DNA质量要求不高。灵敏度 高于10%,需配制胶,安全清 洁性较差。
基于PCR-毛细管电泳检测技术, 敏感性高,检测周期较长,结 果更加直观可靠
目前市场最被接受的检测方法。 灵敏度无法满足MRD要求,难 以定量和得到序列。
恶性淋巴瘤发生的过程
单克隆性
突出单一形式的基因重排
IGH, TRB & TRD: V, D, and J IGK, IGL, and TRG: V and J regions
专注分子诊断 精|选 引领精准医学
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淋巴细胞克隆性基因重排检测的临床意义
5%~15%的病例表现复杂,即使做了大量的免疫标志也可能难以鉴别其良恶性,需要进一步的手段区分。 利用分子生物学手段分析Ig和TCR基因的克隆性重排被WHO公认为该疾病诊断手段的重要补充。
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Biomed-2研究项目(IGH为例)
专注分子诊断 精|选 引领精准医学
van Dongen, J. J. M., et al. (2003). Leukemia 17: 2257.
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Biomed-2研究项目(IGH为例)
专注分子诊断 精|选 引领精准医学
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IdentiCloneTM系列产品具有精心优化的标 准化试剂组成,具有最丰富的阳性对照,涵盖 各种T\B细胞重排类型,经过了超过400例的临 床样本验证,按照临床产品的标准进行质检和 质控,反应体系稳定,结果可靠。

t细胞淋巴瘤tcrγ基因重排特征的分析及检测方法优化

t细胞淋巴瘤tcrγ基因重排特征的分析及检测方法优化

T细胞淋巴瘤TCRT基N重排特征分析及检测方法的优化摘要研究背景与目的淋巴瘤在组织和细胞形态学方面与高度反应增生性淋巴组织的鉴别诊断十分困难,容易造成误诊。

淋巴瘤病理诊断是临床病理工作的难题之一。

目前国内主要依靠以形态学为主、免疫组化为辅的诊断手段。

随着分子生物学的发展,从基因水平研究和分析诊断疾病的技术不断出现并且日趋成熟,为淋巴瘤诊断提供了有效工具。

淋巴瘤是由单克隆淋巴细胞增生所致,而反应增生性淋巴组织则来自于多克隆淋巴细胞,这是二者的重要区别。

编码免疫球蛋白(Ig)或T细胞受体(TCR)的基因经过重排以后,不同克隆之间的重排基因互不相同,因此,基因重排对淋巴瘤的诊断具有特异性价值。

以PCR技术为基础的方法以其简便、高效、廉价及适用面广而在淋巴瘤基因重排研究方面越来越受重视。

但不同研究文献中所采用的引物、PCR条件、PCR产物检测方法等都不尽相同,结果也有差异。

因此,难以找到适于常规临床病理诊断之用的标准程序。

Jurkat细胞是T细胞淋巴瘤基因重排研究中常用的阳性对照细胞,但有关Jurkat细胞基因重排的详细情况也未见报道。

假基因是Ig和TCR胚系DNA中常见的基因,有关假基因参与重排的情况以及在设计引物方面是否应将假基因包括在内也未见有关研究报道。

本实验以TCR基因重排为研究对象,通过优化引物选择、PCR条件及PCR产物的检测方法等,分析T细胞淋巴瘤基因重排检测的最佳方法。

同时,分析TCR基因重排的特点,为进一步研究TCR基因重排提供理论和技术支持。

方法1以TCRy基因重排为研究对象,选用通用引物TVG、VvI及TCR7家族特异性引物为工具。

用正交设计实验优化ⅥI引物的PCR条件。

另选一对TCR[j通用引物作为TCRy引物的补充和比较。

2利用PCR和测序研究Jurkat细胞基因重排情况,分析TCR基因重排的基本特点。

3PCR产物检测方法①利用TCR通用引物检测淋巴瘤克隆性基因重排阳性率,分别用琼脂糖电泳和SSCP分析PCR产物;②将PCR产物分别进行直接测序和克隆后测序,分析TCR基因重排的特点及探索测序方法在基因重排检测中的应用;⑧分析PCR产物中DNA的克隆数与SSCP中条带数目的关系。

TCR基因重排检测在T细胞淋巴瘤病理诊断中的作用

TCR基因重排检测在T细胞淋巴瘤病理诊断中的作用

TCR Gene Rearrangement in the Pathologic Diagnosisof T-cell LymphomaDissertation Submitted toNorth China University of Science and Technology in partial fulfillment of the requirementfor the degree ofMaster of MedicinebyJia Wen(Pathology and Pathophysiology)Supervisor:Ph.D Ma XiaobingJune,2015独创性说明本人郑重声明:所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。

尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写的研究成果,也不包含为获得华北理工大学以外其他教育机构的学位或证书所使用过的材料。

与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中做了明确的说明并表示了谢意。

论文作者签名:日期:2015年6月10日关于论文使用授权的说明本人完全了解华北理工大学有关保留、使用学位论文的规定,即:已获学位的研究生必须按学校规定提交学位论文,学校有权保留、送交论文的复印件,允许论文被查阅和借阅;学校可以将学位论文的全部或部分内容采用影印、缩印或编入有关数据库进行公开、检索和交流。

作者及导师同意论文公开及网上交流的时间:□自授予学位之日起;□自年月日起。

作者签名:导师签名:签字日期:2015年6月10日签字日期:2015年6月10日√摘要摘要目的探讨T细胞抗原受体(T cell receptor,TCR)基因重排在T细胞淋巴瘤中的特异性及其在病理诊断中的价值。

由于淋巴瘤在临床病理诊断中难度较大,仅凭HE和免疫组织化学特点得出的结论易造成误诊和漏诊。

在恶性淋巴瘤的分类中,T细胞淋巴瘤是一种临床上相对少见且异质性较高的肿瘤,准确做出诊断给病人的治疗和预后带来不可或缺的价值。

外周T细胞淋巴瘤诊疗规范

外周T细胞淋巴瘤诊疗规范

外周T细胞淋巴瘤(非特指型)诊疗规范(征求意见稿)苏州大学附属第一医院血液科1. 概述外周T细胞淋巴瘤(Peripheral T-cell lymphoma, PTCL)是一组起源于胸腺后成熟T淋巴细胞的淋巴系统恶性肿瘤。

NCCN2014版明确指出PTCL包括4类亚型:外周T细胞淋巴瘤-非特指型(Peripheral T-cell lymphoma, not otherwise specified, PTCL-NOS),血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(angioimmunoblastic T-cell lymphoma, AITL),间变大细胞淋巴瘤(anaplastic large cell lymphoma, ALCL)和肠病相关T细胞淋巴瘤(Enteropathy associated T-cell lymphoma, EATL)。

外周T细胞淋巴瘤,非特指型(PTCL-NOS)是PTCL中最常见的亚型。

所谓“非特指型”,是强调这一亚型与已明确的各种独立的成熟T细胞淋巴瘤均不符合,即PTCL-NOS其实是一大组不属于已明确的任何一类独特亚型的成熟T细胞淋巴瘤。

PTCL-NOS是一类异质性疾病,在细胞形态学、遗传学、分子生物学和临床表现等方面均无特异性。

本病属于排除性诊断,即只有在排除其它独立分型的T细胞淋巴瘤后,方能做出PTCL-NOS 的诊断。

本病临床表现为侵袭性病程,对化疗不敏感,易复发,5年生存率仅为25~45%。

2. 流行病学PTCL-NOS是最常见的T细胞淋巴瘤亚型。

在西方国家,PTCL-NOS占所有NHL的7%~10%,占PTCL发病的30%。

而亚洲国家发病率更明显高于欧美,占所有NHL的15%~22%,占PTCL发病的50%。

发病常见于中老年人,中位年龄55岁,儿童少见。

男性多见,男女比例约为2:1。

3. 病因及发病机制本病病因尚未明确,可能与EBV感染有一定关系,也可能与自身免疫功能降低或周围环境影响有关。

淋巴瘤基因克隆性重排检测

淋巴瘤基因克隆性重排检测

淋巴瘤应用基因重排检测进行辅助/鉴别诊断的方案
注意事项
▪ 检测到克隆性重排未必一定发生恶性病变 某些良性增生也可呈克隆性重排,如CD8+T细胞淋巴增 生性病变、良性单克隆性丙种球蛋白病、皮肤淋巴瘤样 丘疹病、免疫缺陷患者严重的EB病毒感染等;
▪ 检测不到克隆性重排也不能排除恶性病变 某些明确恶性病变的免疫缺陷患者中偶尔检测不到克隆 性重排,NK/T细胞淋巴瘤中IG和TCR基因呈胚系结构, 即也无克隆性重排。
▪ 辅助诊断:少见类型淋巴瘤,如肝脾T细胞淋巴瘤 ▪ 亚类分析:明确是B淋巴恶性增殖还是T细胞恶性增殖 ▪ 区分同一患者两种淋巴细胞恶性肿瘤,包括复发与继发淋巴瘤 ▪ 微小残留病灶监测,评估治疗效果或复发风险(NGS方法) ▪ 细胞免疫治疗监测,监测回输T细胞增殖状况和淋巴组织来源肿
瘤细胞清除效果(NGS)
淋巴瘤基因克隆性重排和 IGHV体细胞超突变检测
血液肿瘤(常规肿瘤)检测方案-
MICM综合分子检测(旌准方案)
形态学
(Morphology)
分子生物学
(Molecular) • 聚丙烯酰胺凝胶电泳 (PAGE) • 毛细管凝胶电泳(CE) • 荧光实时定量 PCR(RTQT-PCR) • 一代测序(Sanger) • 二代测序(NGS)

B-Cell Receptors (BCR) /Immunoglobulins (Ig) T-Cell Receptor (TCR)
蛋白
Ig重链 Ig轻链 Ig轻链
基因
IGH IGK IGL
染色体定 位
14q32 2p12 22q11
蛋白
TCRα TCRβ TCRγ TCRδ
基因 染色体定 位
TRA 14q11

皮肤假性淋巴瘤组织病理与基因重排特点

皮肤假性淋巴瘤组织病理与基因重排特点
A C一 3 ; R —t e : ’ A C A C G G ’ TC ? v 5 一 G C TG A C R Cr G C r GT C一 3 。 预 期 DN 片 段 为 6 —7 b 。 G ’ ¨, A 0 0 p
合临 床 、 织病 理 、 组 免疫 组 化 和( ) 因重 排 与长期 或 基 随访 , 以鉴别 本 课 题 旨在 应 用 聚 合 酶链 式 反 J 加 立
瘤 转化 的可 能 , 判断 预后 和 临床 随访 提供 依据 。 为
C TT G C CC C G C AG一3 , 期 D ’ 预 NA 片段 为 8 0 一1 0 p 内参 照 用 I一肌 动蛋 白。 反 应 条 件 见 参 2b。 3
考 文 献 _ j 电泳 分 析 : 上 述 P R 产 物 1 , 1 。 取 C 0 l加
据 处理 , 用 S S 1 . 统 软 件 分析 , 采 P S 3 0系 P<0 0 . 5表 示 有统 计 学意义 。
2 结 果
公司 ) 3例 皮 肤 假 性 淋 巴 瘤 标 本 为 1 9 。1 9 9—2 0 07
( C 方 法 , 究 C I患 者 石 蜡 标 本 组 织 T 细 胞 受 P R) 研 P
IH 基 因 引 物 序 列 为 F R 5’ g 3 A: 一AC ( C A C; C G G F 7 A C q _3 , J 5 ~ I A GG C G ’ TT A T G 、 ’I H: ’ ' A GA G
具 有重要 价值 。
关 键 词 皮 肤 假 性 淋 巴 瘤 ; 织 病 理 学 ; 疫 组 化 ; 因 重排 ; 合 酶 链 式 反 应 组 免 基 聚 皮肤假 性淋 巴瘤 是一 组 由多 种 因素刺 激 引起 的 D NA。 P R 扩 增 : C C T R一口基 因 引 物 序 列 为 T R一 C

T细胞性淋巴瘤诊断中TCR基因重排检测的应用

T细胞性淋巴瘤诊断中TCR基因重排检测的应用

T细胞性淋巴瘤诊断中TCR基因重排检测的应用潘鑫艳;杨长绍;黎贵芸;杨举伦;王丽【摘要】目的:探讨T细胞受体( T cell receptors, TCR)基因重排检测对T细胞性淋巴瘤诊断的价值。

方法收集T细胞性淋巴瘤30例和淋巴反应性增生组织30例,提取DNA,应用BIOMED-2引物系统中的56条引物进行PCR扩增,核酸分子异源双链凝胶电泳分析结果。

结果30例T细胞性淋巴瘤标本中TCRβ、TCRγ、TCRδ的检出率分别为83.3%(25/30)、93.3%(28/30)、13.3%(4/30),三者联合检测的检出率为96.7%(29/30),30例淋巴反应性增生组织中均未检测出TCR 基因重排。

结论利用BIOMED-2引物系统检测TCR 基因重排可作为T细胞性淋巴瘤的辅助诊断工具。

%Purpose To discuss the TCR gene rearrangements in the diagnosis of T-cell lymphomas. Methods Formalin-fixed and paraffin-embedded samples including 30 cases of T-cell lymphomas and 30 cases of reactive lymphoid hyperplasia were chosen for ex-tracting genomic DNA and PCR amplification using 56 BIOMED-2 primers. PCR products were analyzed by heteroduplex and polyacryl-amide gel electrophoresis. Results In all 30 cases of T-cell lymphomas, 25 cases (83. 3%) showed TCRβ gene monoclonal rear-ran gements, 28 cases (93. 3%) of TCRγ gene monoclonal rearrangements, 4 cases (13. 3%) of TCRδ gene monoclonal rearrange-ments. 29 cases (96. 7%) with TCRβ+TCRγ+TCRδ gene monoclonal rearrangements were detected. but no clonal TCR gene rear-rangements were found in 30 cases of reactive lymphoid hyperplasia. Conclusions The detection of TCR gene rearrangements using BIOMED-2 primers is a useful assistant method for the diagnosis of T-cell lymphomas.【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》【年(卷),期】2015(000)004【总页数】4页(P400-403)【关键词】T细胞性淋巴瘤;基因重排;BIOMED-2;TCR基因【作者】潘鑫艳;杨长绍;黎贵芸;杨举伦;王丽【作者单位】成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032【正文语种】中文【中图分类】R733.4非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma,NHL)包括B细胞性淋巴瘤(B-cell lymphoma)和T细胞性淋巴瘤(T-cell lymphoma),因T细胞性淋巴瘤种类繁多,分类复杂,病理诊断较难。

淋巴瘤的分子生物学诊断知识点

淋巴瘤的分子生物学诊断知识点

淋巴瘤的分子生物学诊断知识点淋巴瘤是一种以淋巴细胞增生异常为特征的恶性肿瘤,包括多种亚型,具有不同的生物学特征和临床表现。

分子生物学诊断技术在淋巴瘤的分类、预后评估和治疗选择等方面起到了重要的作用。

本文将介绍淋巴瘤分子生物学诊断的一些重要知识点。

一、免疫组织化学检测(IHC)免疫组织化学检测通过检测肿瘤细胞表面或细胞内的特定分子标志物,帮助确定淋巴瘤的亚型和对应的治疗策略。

例如,CD20和CD79a是B细胞标志物,CD3是T细胞标志物,CD30是霍奇金淋巴瘤的标志物等。

免疫组织化学检测可以通过染色的强度和分布情况来判断特定标志物的阳性率,并结合其他临床和病理学特征进行综合分析。

二、基因重排检测淋巴瘤的发生和发展与基因重排异常密切相关。

通过检测重排的免疫球蛋白(Ig)和T细胞受体(TCR)基因,可以帮助确定淋巴瘤的亚型和起源。

例如,典型的霍奇金淋巴瘤患者常存在免疫球蛋白基因的重排。

PCR和Southern blot是常用的基因重排检测方法,可以通过扩增和分析特定基因区域的DNA序列来判断重排情况。

三、染色体异常检测淋巴瘤中常伴随着染色体异常,如染色体重排、整倍体性改变和部分染色体缺失等。

通过检测染色体异常,可以帮助确定淋巴瘤的亚型、预后风险和治疗选择。

常用的染色体异常检测方法包括常规染色体核型分析、荧光原位杂交(FISH)和比较基因组杂交(CGH)等。

FISH 可以通过探针标记的染色体特定区域来检测染色体重排和缺失。

而CGH则可以全基因组范围内分析基因拷贝数变异。

四、新一代测序技术随着新一代测序技术的发展,淋巴瘤分子生物学诊断也得到了进一步的提升。

新一代测序技术可以高效地获得淋巴瘤患者的全基因组、外显子组、转录组和甲基化组等信息。

这些信息可以帮助识别新的突变驱动基因和疾病相关的生物学过程,为个体化治疗提供重要依据。

总结:以上介绍了淋巴瘤分子生物学诊断的一些重要知识点,包括免疫组织化学检测、基因重排检测、染色体异常检测和新一代测序技术。

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皮肤T细胞淋巴瘤皮损与外周血中TCRγ基因重排的检测薛峰;沈小雁;施若非;李霞;陈小英;郑捷
【期刊名称】《临床皮肤科杂志》
【年(卷),期】2008(37)12
【摘要】目的:了解已确诊为皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)患者的皮损和外周血中T细胞受体γ链基因重排(TCRγGR)情况。

方法:利用PCR测定21例CTCL患者皮损及外周血TCRγGR,扩增产物经琼脂糖及变性梯度凝胶电泳检测。

结果:CTCL患者皮损中TCRγGR阳性率显著高于外周血(P<0.05);病程≥12个月的患者外周血中TCRγGR阳性率显著高于病程<12个月的患者(P<0.05);年龄≥60岁患者皮损和外周血中TCRγGR阳性率显著高于<60岁患者(P<0.05)。

结论:在CTCL患者中存在TCRγGR,早期出现在皮损中的TCRγGR可作为CTCL辅助诊断,并有益于CTCL的早期诊断,外周血中检测出TCRγGR可作为皮损阳性结果的补充。

【总页数】3页(P766-768)
【关键词】淋巴瘤,T细胞,皮肤;受体,T细胞;γ链基因重排
【作者】薛峰;沈小雁;施若非;李霞;陈小英;郑捷
【作者单位】上海交通大学医学院附属瑞金医院皮肤科,瑞金-耶鲁皮肤淋巴瘤治疗中心
【正文语种】中文
【中图分类】R730.263
【相关文献】
1.TCR基因重排检测在T细胞淋巴瘤病理诊断中的作用 [J], 贾雯;马小兵;
2.副银屑病皮损及外周血TCRγ基因重排的检测及其临床意义探讨 [J], 王晓明;薛峰;郑捷
3.TCR基因重排在皮肤T细胞淋巴瘤中的应用 [J], 马一平;卢宪梅
4.T细胞性淋巴瘤诊断中TCR基因重排检测的应用 [J], 潘鑫艳;杨长绍;黎贵芸;杨举伦;王丽
5.皮肤T细胞淋巴瘤皮损和外周血T细胞受体γ基因重排的研究 [J], 宋丽新;张士发;高兴华
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