4-克隆载体

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4人工染色体载体

4人工染色体载体

五、 cosmid克隆载体(自学P72)
❖ 常用的粘性粒有PHC79、PJB8、MUA-3和 KOSI等,它们大多具有一种或多种限制性 内切酶的单一酶切位点。采用这的 阳性检出率,而且极其适合高等真核基因 的克隆工作。
使用cosmid克隆载体的程序与使用λ噬菌 体克隆载体的程序有所不同 。
作为λ噬菌体克隆载体,线形重组λDNA分 子两端必须各有一个cos末端。而cosmid克隆载 体只有一个cos位点,因此必须先对cosmid克隆 载体进行适当处理,构成具有两个cos位点的二 联体线形DNA分子。
当外源DNA片段组入二联体线形DNA分子, 并且两个cos位点之间的DNA核苷酸序列达到足 够长时,两个cos位点可被A蛋白切割,产生具 有两个cos末端的重组λDNA分子,就能进行有 效的体外包装。
05.04.2021
27六、 构建cosmid应注意哪些问题❖ ①载体分子的自身连接,从而导致效率降低 或者失败。
载体自身只相当于可以插入片段的1/10左右
,因此往往会出现载体同载体自身连接,结
果在一个重组分子内可有几个柯斯质粒载体
连在一起。但用碱性磷酸酶处理,可阻止载
体分子自身连接;
05.04.2021
在成功构建pYAC4克隆载体的基础上,进一 步构建了人类人工染色体(HAC)克隆载体和哺乳 动物人工染色体(MAC)克隆载体。
选择标记--Sup4
❖ Sup4基因编码赭色抑制Trp-tRNA,抑制赭色 表型(成为白色)。
❖ 不含外源DNA片段的pYAC4载体转化酵母菌, 转化子的菌落呈白色。
❖ 带有插入的外源DNA片段的pYAC4重组载体, 其Sup4已经失活,结果转化酵母菌后所产生 的转化子形成赭色菌落。

拟南芥(Arabidopsis thaliana)DWF4基因克隆、生物学信息分析及过表达载体构建

拟南芥(Arabidopsis thaliana)DWF4基因克隆、生物学信息分析及过表达载体构建

^8S^•研究报告・拟南芥(Arabidopsis thaliana)DWF4基因克隆、生物学信息分析及过表达载体构建韦春,杨莉琴,秦利军(贵州大学农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室/生命科学学院,贵阳550025)摘要BRs(Brassinostcroids)是植物体内一种重要的类固醇激素,具有十分重要的生理功能。

DWF4是BRs生物合成的关键限速酶,显著影响BRs在植物体中的含量。

本研究以拟南芥(Araiidopsis thaliana)为材料,利用同源克隆技术从A.thaliana cDNA中克隆到全长为1542bp的特异性条带,测序结果表明该条带为ADWF4基因;生物学信息分析显示该基因可编码513个氨基酸(amino acid,aa),Proscalc在线预测该蛋白为亲水性蛋白,且SOPM分析表明DWF4蛋白含有c-螺旋(alpha-helix)、/?-折叠(beta-fold)、/?-转角(beta-angle)等多个二级结构。

同时,研究还构建了含AtDWF4基因的超量表达载体pRI201-RdI)wf4,并遗传转化烟草K326,已获得抗性愈伤组织及抗性芽。

本研究为进一步探究过表达ADWF4基因对烟草形态及抗逆胁迫能力的影响提供理想的实验材料。

关键词:拟南芥;BRs;DWF4基因;过表达载体构建DOI:10.16590,/ki.1001-4705.2021.01.001中图分类号:Q943.2文献标志码:A文章编号:1001-4705(2021)01-0001-06Cloning and Bioinformatics Analysis of Arabidopsis thaliana DWF4Gene and Construction of ADWF4-Overexpression VectorWEI Chun,YANG Liqin,QIN Lijun(Institute of Agro-Bioengineering,Key laboratory of Plant.Resources Conservation andGermplasm Innovation in Mountainous Region(Ministry of Education)and College ofLife Sciences,Guizhou University,Guiyang550025,China)Abstract:BRs(Brassinosteroids)is an important steroid hormone in plants,which has very importantphysiological functions.The DWF4is a key rate-limiting enzymein BRs biosynthesis,which signifi­cantly affects the content of BRs in plants.In this study,Arabidopsis thaliana was used as the mate­rial to clone the objective band.The results showed that a1542bp band from A.thaliana cDNA wascloned and the sequencing results showed that the band was AtDWF4gene.Bioinformatics analysisshowed that this gene encoded513amino acid(aa),and Proscale online predicted that this proteinwas a hydrophilic protein,and SOPM analysis showed that DWF4protein contained multiple second­ary structures,including tough-helix,format-fold,and format-angle,etc.Meanwhile,the overex­pression vector pRI201-RdDwf4containing AtDWF4gene was also constructed,and the resistant cal­lus and resistant buds were obtained after the genetic transformation of tobacco variety K326.ThispaperprovidesanidealexperimentalmaterialforfurtherstudyingtheinfluenceofoverexpressionofAtDWF4on tobacco morphology and stress tolerance.Key words:Arabidopsis thaliana;BRs;DWF4gene;overexpression vector construction收稿日期2020-08-26基金项目贵州省科技计划项目“因草钾离子通道蛋白及BR对植株抗非生物胁迫研究”(黔科合LH:2016]7449号);贵大人才培育项目“由菜素内酯介导的烟草抗TMV机理研究”(黔科合平台人才:2018]5781号)作者简介:韦春(1995—),女(壮族)广西河池人;在读硕士,主要从事植物基因工程相关研究(E-mail:*****************).通讯作者:秦利军(1982—)男(汉族)贵州遵义人;博士,副教授,硕士生导师,研究方向:植物生物技术与植物基因工程(E-nail:leequine_chin@126.com)。

4重组表达质粒的构建——基因的克隆

4重组表达质粒的构建——基因的克隆

重组表达质粒的构建——基因的克隆长片段基因在大肠杆菌中表达往往比较困难,作为抗原使用的重组蛋白可以考虑选择抗原性好的区段原核表达,前文已作阐述。

对整个蛋白结构研究,必须全长表达该蛋白,此时最好考虑真核表达系统,特别是含有跨膜区的蛋白。

选定要克隆的区段,需先富集纯化之后才方便插入载体,常用的富集方法是PCR或者质粒繁殖复制。

为了防止在PCR扩增过程中引入碱基错误或者碱基缺失,PCR扩增基因时候必须使用高保真Taq酶。

为了满足科研工作者不同实验需求,福因德生物将高保真Taq酶优化为即用型Mix,使用时直接加引物和模板就可以扩增。

除此之外,福因德生物还开发出LA Taq、S-Taq Mix以及SYBR荧光定量PCR Mix(需要更高品质的可选用SYBR PCR SuperMix)。

原核重组表达常用克隆技术主要有以下几种:1)酶切连接这个是目前应用最为广泛的的克隆技术,主要优点是技术稳定;缺点是周期长、步骤多,任何一个环节产生的误差都会影响克隆构建的成败。

如用酶切连接的策略进行载体批量构建,不同载体和不同外源基因尽可能选用相同的上下游酶切位点,比如,批量克隆基因到某个载体上,可一次性大量双酶切将载体线性化后保存备用,每次构建载体只需酶切外源基因片段,载体可直接取用,不必每次都酶切,省时省力(此处需特别留意的是基因内部不能有与上述所用冲突的酶切位点)。

2)TA克隆TA克隆必须使用商业的线性化载体,线性载体3´末端有一个T碱基,与PCR扩增产物3´末端A正好匹配。

这种克隆策略最大的优点是载体使用方便,扩增产物可以直接克隆到载体上,不需要酶切位点等冗余序列;缺点是:必须依赖商业化载体,载体选择受限;扩增外源片段所使用的Taq酶也必须是可以在3´末端加A,这种Taq酶的保真度不高;外源片段插入之后还必须鉴定方向。

目前,这种构建表达载体的策略已经逐渐被淘汰。

3)TOPO克隆TOPO克隆载体利用DNA拓扑异构酶I识别序列中的CCCTT松弛双螺旋并重新连接,同时兼具限制性内切酶和连接酶的功能。

第四章克隆载体的特征及类型

第四章克隆载体的特征及类型

吸附
LamB受体 注入
复制
包装
噬菌体或病毒DNA
大肠杆菌的 l 噬菌体DNA
受体细胞内,pBR322以多拷贝存在,一般一个细胞内可达到 50-100个,而在蛋白质合成抑制剂存在条件下,如氯霉素, 可达到1000-3000拷贝。 缺点: 有被动迁移的可能,不够安全。 抗生素标记插入失活筛选为负筛选法,比较麻烦。
Amp Tet
pBR322
插入片段
Tet平板
Amp平板
质粒
重要的大肠杆菌质粒载体
ColE1、pMB1 拥有相似的复制子结构,彼此不相容 p15A及其衍生质粒拥有相似的复制子结构,彼此不相容 亲缘关系密切的质粒;野生型质粒与其衍生的重组质粒。
质粒的基本特征
质粒
质粒的不相容性:分子机制
两种含有不同复制子结构的不同质粒,在复制时各受自己的 拷贝数控制系统的调节,致使两种质粒的最终拷贝数恒定, 因此在经过若干复制周期和细胞分裂周期后仍能共处于同一 细胞内(亲和性质粒) 两种含有相似复制子结构的不同质粒,在复制时受到同一种 拷贝数控制系统的干扰,致使两种质粒的最终拷贝数不同, 其中拷贝数多的质粒在以后的细胞分裂周期中更具优势
质粒的基本特征
4. 质粒的重组性
质粒
由rec基因控制,使质粒整合到染色体基因组上。 在基因工程应用的是重组缺陷型(rec–)的质粒和菌株。
质粒的基本特征
质粒
5. 携带特殊的遗传标记
野生型的质粒DNA上往往携带一个或多个遗传标记基因,这
使得寄主生物产生正常生长非必需的附加性状,包括:
物质抗性 抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物
黏性末端
cos
DNA合成控制基因

阻遏基因 早期控制基因

4第四章 基因克隆的载体-1质粒

4第四章 基因克隆的载体-1质粒
2、具有合适的选择标记,便于重组DNA分子的检测; 3、要有尽可能多种限制酶的切割位点,便于外源基因 插入;
4、载体分子中有一段不影响它们扩增的非必须区域, 插入其中的外源基因可以象载体的正常组分一样进行 复制和扩增; 5、具有较好的安全性,不能任意转移,避免基因非控 制性扩增。
载体的种类和特征
(二)根据质粒自身传递的性质分为两大类: 1、结合型质粒:能自我复制,含转移基 因组,可自我控制质粒从一个寄主细胞传到 另一个寄主细胞。 如:F质粒,部分R质粒、Col质粒。 2、非结合型质粒:能自我复制,不含转 移基因组,不能自主在细胞间传递。 如:R质粒、Col质粒
(三)根据质粒的复制特性分为两大类: 1、严紧型质粒:是一类低拷贝数的质粒, 每个细胞中仅含有一个或几个质粒; 拷贝(数)是指一种质粒在一个寄主细 胞中存在的数目。 2、松弛型质粒:是高拷贝数的质粒, >20拷贝/细胞。该类基因工程中常用。
Example: a. 在pBR322质粒的BamHⅠ或SalⅠ位点 插入外源DNA片断,切断了tetr基因编码 序列的连续性,使之失去活性,产生出 AmprTets表型的重组pBR322质粒,转化 入AmpsTets的大肠杆菌细胞。先涂布在 含氨苄青霉素的选择培养基上,筛选出 具Ampr菌落,再将它们涂布于含四环素 的选择性培养基上。插入外源片断的重 组质粒不能在这种培养基上生长。
它的分子量为4363bp。克隆载体的大小不要超 过10kb。 2、具有两种抗菌素抗性基因可供作转化子的
选择记号。
共有24种核酸内切酶识别位点(单一的)。其中7种 内切酶的识别位点在四环素抗性基因内部,2种识 别位点在于这个基因的启动区内,所以9个限制酶 切位点插入外源片断可以导致Tetr 基因的失活; 另外有3种限制酶在氨苄青霉素抗性基因Ampr有单一 的识别位点,

第一章 克隆载体

第一章 克隆载体

宿主细胞中λ噬菌体的包装过程 宿主细胞中 噬菌体的包装过程
头部: 头部 E蛋白占72%:头部主要组成成分 琥珀突变导致尾部蛋白积累 D蛋白占20%: DNA进入头部前体以及头部 成熟作用 琥珀突变导致头部蛋白积累
D基因缺失突变株(D-): 基因缺失突变株 基因缺失突变株 溶原菌菌株BHB2690
pMB1的特点: 含有ColE1的松弛型复制起始位点 缺少好的选择标记基因 缺少较好的克隆位点
pBR322的构建 的构建 (1)保留ColE1的松弛型复制起始位点 (2)pSF124中Apr (3)pSC101中Tcr 在抗性基因中带入合适的酶切位点 (4)缺失迁移蛋白mob基因,但保留了bom位点
筛选主要是营养缺陷型
YAC 载YAC平均插入片段一般为100~350kb
构建基因组时,只需要较少的克隆数便可以覆盖整 个基因组,使构建高等生物基因组遗传图谱和物理图谱 成为可能,基因组计划得以顺利实施。
IPTG(异丙基-β-D硫代半乳糖苷)诱导下, 作用底物X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳 糖苷) ,使菌落呈蓝色
2.农杆菌Ti质粒克隆载体构建 Ti质粒(tumer inducing plamid): 根瘤农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)含 有的一种质粒,当农杆菌与植物接触时, 会引发植物产生肿瘤(冠瘿瘤) 双链DNA分子,大小在200-250kbp之间
定位整合克隆载体的几种模式: 定位整合克隆载体的几种模式 (1)内源平台双交换置换克隆载体 (2)外源平台双交换置换克隆载体 (3)内源平台双交换插入克隆载体 (4)内源平台单交换插入克隆载体
定位整合克隆载体的定位整合效率
(1)受体细胞 (2)同源DNA片断长短

三四章分子克隆载体---答案_完_

三四章分子克隆载体---答案_完_

三四章分⼦克隆载体---答案_完_第三章分⼦克隆载体(Molecular cloning vectors)⼀、名词解析1.质粒:质粒是染⾊体外的遗传因⼦,能进⾏⾃我复制(但依赖于宿主编码的酶和蛋⽩质);⼤多数为超螺旋的双链共价闭合环状DNA分⼦(covalently closed circle , cccDNA),少数为线性;⼤⼩⼀般为1~200Kb,有的更⼤。

2.质粒拷贝数:质粒拷贝数(plasmid copy numbers)是指细胞中单⼀质粒的份数同染⾊体数之⽐值,常⽤质粒数/每染⾊体来表⽰。

不同的质粒在宿主细胞中的拷贝数不同。

3.质粒的不相容性:两个质粒在同⼀宿主中不能共存的现象称质粒的不相容性,它是指在第⼆个质粒导⼊后,在不涉及DNA 限制系统时出现的现象。

不相容的质粒⼀般都利⽤同⼀复制系统,从⽽导致不能共存于同⼀宿主中。

4.质粒的转移性:质粒具转移性。

它是指在⾃然条件下,很多质粒可以通过称为细菌接合的作⽤转移到新宿主内。

它需要移动基因 mob ,转移基因 tra ,顺式因⼦ bom 及其内部的转移缺⼝位点 nic。

5.穿梭质粒:既能在真核细胞中繁殖⼜能在原核细胞中繁殖的载体。

这类载体必须既有细菌的复制原点或质粒的复制原点,⼜含有真核⽣物的复制原点,还具备酶切位点和合适的筛选指标。

它⽤来转化细菌,⼜可以⽤于转化真核细胞。

6.α-互补:α-互补是指 lacZ 基因上缺失近操纵基因区段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的β-半乳糖苷酶(β -galactosidase ,由 1024 个氨基酸组成)阴性的突变体之间实现互补。

α-互补是基于在两个不同的缺陷β-半乳糖苷酶之间可实现功能互补⽽建⽴的7.温和噬菌体:既能进⼊溶菌⽣命周期⼜能进⼊溶源⽣命周期的噬菌体。

8.溶源性细菌:具有⼀套完整的噬菌体基因组的细菌叫溶源性细菌。

9.整合:如果噬菌体的DNA是被包容在寄主细菌染⾊体DNA中,便叫做已整合的噬菌体DNA。

克隆载体表达载体构建详细版

克隆载体表达载体构建详细版

克隆载体表达载体构建详细版一、稀释引物1、4℃,15min、13000转离心(先等离心机降温)2、根据OD值加DD水。

3、静置30min(冰上)4、准备1.5毫升EP管,并加90ulDD水。

5、向EP管中加10ul引物,震荡离心,-20℃保存。

二、跑MIX检测引物(20ul体系)、上引物0.8ul下引物0.8ulMix 10ulDNA(日本晴)1ulDD水7.4ul三跑高保真酶(50ul体系)DNAorCDNA 2ul上引物2ul下引物2ul5*buffer 10uldNTPs 5ulDD水28ulPfu(最后加)1ul四胶回收流程1、在紫外线下切胶,用牙签装入2ml的EP管中。

2、按量加XP2,放在55℃水浴锅中10min,每2min摇匀1次,涡旋,短离。

3、将液体冷却到室温,转移到平衡住中,离心10000转,1min30s,倒掉滤液。

4、加入xp2 300ul,离心10000r,1min30s,倒掉滤液。

5、加入spw700ul,离心10000r,1min,倒掉滤液(重复一次)6、空转2min,13000r,之后换1.5mlEP管。

7、套上保鲜膜放入37℃烘箱中,30min。

8、加入DD水10ul,静置2min,离心2min,13000r,重复3次,-20℃保存。

五、胶回收产物检测(10ul)体系上引物0.4ul下引物0.4ulMix 5ul回收产物1ulDD水 3.2ul六、构建blunt cloning 载体(克隆载体)(4ul 体系)胶回收产物 3.5ulBlunt cloning 0.5ul混匀后,PCR:25℃15min 盖子温度50℃之后转化1、提前5min从-70℃冰箱中拿出大肠杆菌感受态,冰上解冻5min。

2、将样品(4ul)加入感受态的大肠杆菌中,冰上30min,大约剩5min左右,打开水浴锅预热到42℃,并拿出SDC 培养基解冻(室温解冻)。

3、水浴锅42℃,60-90s迅速转移到冰浴2min,该过程中不要摇动离心管。

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具有若干限制酶单一 若干限制酶单一识别位点 (3)具有若干限制酶单一识别位点
这样的分子结构特性, 这样的分子结构特性,可以满足基因克隆的 需要,并且在其中插入适当大小的外源DNA DNA片段之 需要,并且在其中插入适当大小的外源DNA片段之 应该不影响质粒DNA的复制功能。 DNA的复制功能 后,应该不影响质粒DNA的复制功能。
(3)失控的质粒载体
有一些低拷贝数的质粒,它的复制控制是温度敏感型的, 有一些低拷贝数的质粒,它的复制控制是温度敏感型的, 在不同的温度下,拷贝数会有明显的变化。 在不同的温度下,拷贝数会有明显的变化。 pOC71: : 37℃ ℃ 42℃ ℃
(单拷贝) 单拷贝) 拷贝) (>1000拷贝 拷贝
改良质粒: 30℃下 每个寄主细胞只有少量的拷贝数, 改良质粒:在30℃下,每个寄主细胞只有少量的拷贝数,当温度升高 35℃时 质粒的复制便失去了控制,单个细胞中的拷贝数持续上升。 到35℃时,质粒的复制便失去了控制,单个细胞中的拷贝数持续上升。 这个时候,细胞正常的代谢活动开始受到影响,但仍然可以持续2 这个时候,细胞正常的代谢活动开始受到影响,但仍然可以持续2~3 个小时,最后失活,但是,在这个阶段,质粒DNA DNA的量已经得到了累 个小时,最后失活,但是,在这个阶段,质粒DNA的量已经得到了累 可以达到细菌总DNA 50%左右。 DNA的 积,可以达到细菌总DNA的50%左右。
多克隆位点(multiple cloning site,MCS) , )
多克隆位点最初是用在蓝白斑筛选的质粒载体 系列)上的。 (pUC 系列)上的。它实际上是一个改造过的 lacZ’ 基因,在基因编码区的前段含有多个限制 基因, 酶识别的位点, 酶识别的位点,目的基因只要插入其中一个或两 个位点之间, 基因的失活, 个位点之间,都会导致lacZ’ 基因的失活,可供 蓝白斑筛选。 蓝白斑筛选。 多克隆位点的应用, 多克隆位点的应用,使操作过程中限制性内切酶 的选择余地更大,方便操作。 的选择余地更大,方便操作。
目的蛋白绝大多数都是来自真核生物, 目的蛋白绝大多数都是来自真核生物,而真核基 因并不具备可以被大肠杆菌细胞的遗传体系所识 别的转录-翻译调控元件, 别的转录-翻译调控元件,并且超量表达外源蛋 白的时候常常会使宿主细胞致死。 白的时候常常会使宿主细胞致死。 表达载体是在常规克隆载体的基础上衍生而来的, 表达载体是在常规克隆载体的基础上衍生而来的, 主要增添了强启动子,以及有利于表达产物分泌、 主要增添了强启动子,以及有利于表达产物分泌、 分离或纯化的元件。 分离或纯化的元件。
分 解
蓝色产物
(5)克隆载体与表达载体
①克隆载体
在基因克隆的研究工作中, 在基因克隆的研究工作中,有时候是为 了获得大量的目的基因片段, 了获得大量的目的基因片段,这个时候用的 载体称为克隆载体。 载体称为克隆载体。 克隆载体主要用于扩增或保存 DNA 片 是最简单的载体。 段,是最简单的载体。
②表达载体
(2)低拷贝数的质粒载体
特点:体积小、拷贝数低, 特点:体积小、拷贝数低,与此相对应的基因剂 量也少。 量也少。 有些外源的DNA片段所编码的基因, 有些外源的DNA片段所编码的基因,当用高拷贝的 DNA片段所编码的基因 质粒作为载体的时候,外源蛋白的大量表达, 质粒作为载体的时候,外源蛋白的大量表达,会 严重的扰乱宿主细胞的正常的新陈代谢活动。 严重的扰乱宿主细胞的正常的新陈代谢活动。选 择低拷贝的质粒载体, 择低拷贝的质粒载体,使外源基因的蛋白产物对 宿主细胞的毒害作用降低到最低的程度。 宿主细胞的毒害作用降低到最低的程度。
氨卞青霉素和四环素双选择的载体,通过“影印 氨卞青霉素和四环素双选择的载体,通过“ 双选择的载体 平板培养” 平板培养”的方法进行筛选 。 蓝-白斑筛选
lacZ 基因是乳糖 lac 操纵子中编码 β-半乳糖苷酶的基因,乳糖及 半乳糖苷酶的基因, 其衍生物可诱导其表达。 异丙基硫代半乳糖苷(IPTG) 其衍生物可诱导其表达。 异丙基-β-D- 硫代半乳糖苷(IPTG)是乳 糖的衍生物, 操纵子的诱导物; 吲哚糖的衍生物,可作为 lac 操纵子的诱导物; 5-溴-4-氯-3-吲哚-β半乳糖苷( 操纵子的底物,以及生色剂, D-半乳糖苷(X-gal) 可作为 lac 操纵子的底物,以及生色剂,当它 半乳糖苷酶分解后可产生蓝色产物,使菌落或噬菌斑呈蓝色。 被 β-半乳糖苷酶分解后可产生蓝色产物,使菌落或噬菌斑呈蓝色。 X-gal lacZ 基因 IPTG诱导 诱导 β-半乳糖苷酶 半乳糖苷酶
2、质粒载体的选择记号
在基因克隆中采用的质粒载体的选择记号有很 多种,采用较多的是抗性特征 抗性特征。 多种,采用较多的是抗性特征。 一方面由于许多质粒本身就是带有此类抗性基 另一方面因为抗菌素的抗性特征便于操作, 因,另一方面因为抗菌素的抗性特征便于操作, 易于选择。 易于选择。
3、天然质粒用作克隆载体的局限性
(4)具有较小的分子量和较高的拷贝数
低分子量的质粒首先易于操作,克隆了外源DNA DNA片 ①低分子量的质粒首先易于操作,克隆了外源DNA片 段之后,仍然可以有效的转化受体细胞。 段之后,仍然可以有效的转化受体细胞。经验表 分子量大于10kb的分子, 10kb的分子 明,分子量大于10kb的分子,在纯化的过程中容 易发生断裂; 易发生断裂; 这类质粒往往含有比较高的拷贝数, ②这类质粒往往含有比较高的拷贝数,这不仅有利 于质粒DNA的提取, DNA的提取 于质粒DNA的提取,同时还会增加细胞中克隆基因 的剂量; 的剂量;
典型的大肠杆菌表达型质粒载体
必须包括大肠杆菌的启动子及操纵位点序列、 必须包括大肠杆菌的启动子及操纵位点序列、多 启动子 序列 克隆位点(MCS) 转录及翻译信号、 克隆位点(MCS)、转录及翻译信号、质粒载体的 复制起点以及抗菌素的抗性基因。 以及抗菌素的抗性基因 复制起点以及抗菌素的抗性基因。
ColE1
拷贝数高,但选择标记为免疫标记,重组子筛选工作量大。 拷贝数高,但选择标记为免疫标记,重组子筛选工作量大。
4、不同类型的质粒载体
(1)高拷贝数的质粒载体
克隆的目的仅仅是为了分离、 克隆的目的仅仅是为了分离、获得大量的克隆基因的 DNA片段,通常选择 片段, 片段 通常选择ColE1、pMB1或者是它们的派生质 、 或者是它们的派生质 粒。 特点:分子量低、拷贝数高, 特点:分子量低、拷贝数高,而且与大多数其他质粒不同 的是,他们在没有蛋白质合成的条件下仍然可以继续复制。 的是,他们在没有蛋白质合成的条件下仍然可以继续复制。
天然质粒: 天然质粒:没有经过以基因克隆为目标的体外修 饰改造的质粒。 pSC101
优点:有一个四环素抗性(Tetr)的选择记号,对于EcoR 优点:有一个四环素抗性( 的选择记号,对于 I限制酶只有一个识别位点,在这个位点插入外源DNA既不 限制酶只有一个识别位点, DNA既不 限制酶只有一个识别位点 在这个位点插入外源DNA 会影响载体本身的复制功能,也不会破坏抗性标记。 会影响载体本身的复制功能,也不会破坏抗性标记。 缺点:分子量比较大( ),拷贝数比较低 缺点:分子量比较大(9.09Kb),拷贝数比较低,只有一 ),拷贝数比较低, 个抗性基因,增加了重组子筛选的工作量。 个抗性基因,增加了重组子筛选的工作量。
比如,在处于对数生长期的含有 质粒的培养物中, 比如,在处于对数生长期的含有ColE1质粒的培养物中,加入适量的 质粒的培养物中 蛋白质合成抑制剂进行处理,可以阻断染色体DNA的复制(组蛋白 的复制( 蛋白质合成抑制剂进行处理,可以阻断染色体 的复制 的合成被阻断),而对质粒DNA的复制没有什么影响,于是,经过 的合成被阻断),而对质粒 的复制没有什么影响,于是, ),而对质粒 的复制没有什么影响 10~12小时的培养 每个细胞中的质粒拷贝数可以扩增到1000 小时的培养, 1000~ 10~12小时的培养,每个细胞中的质粒拷贝数可以扩增到1000~3000 个之多。所以,分离到的质粒DNA的产量可以达到 的产量可以达到1mg/L。 个之多。所以,分离到的质粒 的产量可以达到 。
按照特殊设计构建的, 按照特殊设计构建的,能使克隆在其中特定位点的外 源真核基因的编码序列, 源真核基因的编码序列,在大肠杆菌中正常转录并翻 译成相应蛋白质的克隆载体称为表达载体 译成相应蛋白质的克隆载体称为表达载体 (expression vectors) ) 表达载体可以分为表达型质粒载体和表达型噬菌体载 体两种。 体两种。
待表达的真核基因编码序列被克隆在紧靠启动子 待表达的真核基因编码序列被克隆在紧靠启动子(P, promoter)下游的多克隆位点上, promoter)下游的多克隆位点上,这样才能在启动子控制下 进行有效的转录 terminator)能够增进mRNA mRNA的数量和稳定性 转录终止子(T,terminator)能够增进mRNA的数量和稳定性 operator) 操纵位点(O,operator)则是通过与阻遏蛋白的结合来调节 转录反应 RBS, site) 核糖体结合位点(RBS,ribosome binding site)为克隆基因 mRNA的有效翻译提供了必要的序列信号 sequence) mRNA的有效翻译提供了必要的序列信号(SD sequence) 抗菌素基因提供选择标记 抗菌素基因提供选择标记
(4)插入失活型的双选择质粒载体
理想的质粒克隆载体应该具有两种或两种以上的 抗性标记,在重组的过程中,一个标记保持完整, 抗性标记,在重组的过程中,一个标记保持完整, 用来筛选转化子, 用来筛选转化子,而另一个标记则有插入失活的 效应。这样就可以在转化以后直接选出重组质粒, 效应。这样就可以在转化以后直接选出重组质粒, 减轻了实验的工作量,同时提高了选择的敏感性。 减轻了实验的工作量,同时提高了选择的敏感性。
第四章
克隆载体
一、质粒载体的特点及类型 二、噬菌体载体 黏粒、YAC与 三、黏粒、YAC与BAC 四、真核生物载体
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