质粒提取操作步骤

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质粒dna提取原理

质粒dna提取原理

质粒dna提取原理
质粒DNA提取原理是通过破坏细菌细胞壁和细胞膜结构,释
放质粒DNA,并利用化学方法提取纯化质粒DNA。

质粒DNA提取的步骤如下:
1. 细胞裂解:将细菌培养物经过离心,得到菌体沉淀,然后加入裂解缓冲液,破坏细菌细胞壁和细胞膜,释放质粒DNA。

2. 质粒DNA纯化:加入一定量的碱性溶液,使细菌染色体DNA变性沉淀,而质粒DNA仍溶于溶液中。

然后通过离心,将质粒DNA沉淀下来。

3. 质粒DNA沉淀:将溶液中的质粒DNA与乙醇混合,使质
粒DNA沉淀成片状。

通过离心,得到质粒DNA沉淀。

4. 质粒DNA溶解:将质粒DNA沉淀洗涤去除杂质,并用适
当的缓冲液将质粒DNA溶解,得到高浓度的质粒DNA。

质粒DNA提取的关键在于破坏细菌细胞结构,释放质粒DNA,然后利用沉淀和溶解等步骤进行纯化。

通过以上步骤,可以提取到纯化后的质粒DNA,用于后续实验或分析。

质粒提取的原理及步骤

质粒提取的原理及步骤

碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH 和 SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。

一、试剂准备1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。

1M Tris-HCl[t1] (pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。

在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃。

溶液Ⅰ50mM 葡萄糖/ 10mM EDTA / 25mM Tris-HCl,pH=8.0葡萄糖增稠,使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部;EDTA 抑制DNase的活性。

这一步溶液中还可以加入RNase,不受EDTA影响,并且可以在后续步骤中被除去2. 溶液Ⅱ:0.2N NaOH,1% SDS。

2N NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH2O至10ml。

使用前临时配置[t2]。

这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。

要新从浓NaOH稀释制备0.4N的NaOH,无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。

很多人不知道其实破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。

事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂,不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞,碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解,这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向 micelle(微囊)结构的相变化所导致。

用了不新鲜的0.4 N NaOH,即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌(不妨可以自己试一下),自然就难高效率抽提得到质粒。

如果只用SDS当然也能抽提得到少量质粒,因为 SDS也是碱性的,只是弱了点而已。

很多人对NaOH的作用误以为是为了让基因组DNA变性,以便沉淀,这是由于没有正确理解一些书上的有关DNA变性复性的描述所导致。

质粒提取步骤protcol

质粒提取步骤protcol

质粒提取步骤(去除内毒素的kit)准备:挑取单克隆后摇菌12-16小时‘异丙醇,无水乙醇,1.5毫升无酶EP管,无菌去离子水,涡旋在SOLUTION 1中加入RNASE A 保存在4度冰箱DNA W ASH buffer中加入无水乙醇,室温保存HBC Buffer 中加入异丙醇,室温保存检查SOLUTION 2是否沉淀,若有沉淀,加热到37度溶解N3缓冲液放在冰上热块加热到42 度,或者水浴锅,还有一个,加热到70度离心机转速5000XG微凉离心机13000XG步骤:1、摇菌2、收集菌液,5000XG,室温离心,10min3、弃掉上层培养基4、加入500ul SOLUTION 1/RNASE A ,涡旋或者抽吸,彻底混匀。

重悬完全能获得好的结果5、转移细胞到新的2ml离心管中6、加入500ul SOLUTION 2,涡旋或轻柔旋转数次,获得澄清裂解液,孵育2-3min,注意避免用力混合,否则会剪切染色体DNA,降低质粒纯度,不要让裂解液反应超过5min,SOLUTION 2要盖紧,防止空气中的CO2导致其酸化7、加入250ul冰浴预冷的N3 Buffer,轻柔颠倒数次,直到形成白色絮状沉淀(除蛋白)Buffer必须充分混合,如果混合液是粘的,棕色的,成团的,需要更多次混合完全中和SOLUTION。

完全中和绝对影响结果。

8、最大转速(大于13000XG),离心10min,形成白色沉淀,迅速进行下一步9、将清澈的裂解有转移到1.5ml EP管,量取清澈的裂解液的体积10、加入1/10的ETR溶液,此时会浑浊,颠倒EP管10次,彻底混匀如果转移500ul清澈裂解液,就加入50ulETR溶液11、冰上孵育10min,在孵育过程中,颠倒混匀数次,冰上裂解后悔澄清,2min/次12、裂解液42度孵育5min,裂解液又会出现浑浊13、25℃12000XG,离心3min,,ETR溶液在管底部14、将上层水相转移到一个新的1.5ml EP管中,加入1/2体积无水乙醇,轻柔颠倒6-7次,室温培养1-2min15、将小柱加入2ml管中,注意:选择性步骤:小柱是否处理16、将700ul混合液加入小柱中17、最大转速(大于13000XG),离心1min,18、弃去滤液,重新放回19、重复16-18,所有的东西都保存在柱里20、加入500ul HBC Buffer 注意加入异丙醇21、最大转速(大于13000XG),离心1min,22、弃去滤液,重新放回23、加入700ul DNA wash buffer 注意加入无水乙醇24、最大转速(大于13000XG),离心1min,25、弃去滤液,重新放回26、重复步骤23-25,27、最大转速空载离心2min,使管干燥,残余乙醇有干扰28、将滤柱放于1.5ml EP管中29、加入80ul洗脱缓冲液或者无酶水,直接加到中间,主要看穿着和穿着的悬液。

质粒提取 原理及步骤

质粒提取 原理及步骤

质粒提取原理及步骤质粒提取是分子生物学中的一项重要实验技术,被广泛应用于基因克隆、基因转染、基因表达等方面。

本文将重点介绍质粒提取的原理及步骤。

一、原理质粒提取的原理基于质粒和细胞的生化学性质差异。

质粒是一种独立复制的DNA分子,可以自主复制并传递给细胞的子代。

而在真核细胞中,大多数DNA都位于细胞核中,很难获得足够的DNA量进行实验。

质粒提取利用了这一差异,将大量的质粒从细胞中提取出来。

质粒提取的主要步骤如下:二、步骤1. 细胞培养首先需要选择适当的细胞类型并在培养基中培养,使细胞处于最佳生长状态。

对于大多数细胞类型,建议在对数生长期时采集,因为此时细胞数量最多且代谢活跃,可以有效提高质粒提取的DNA量和质量。

同时,还需注意避免细胞因为过于密集而形成聚集体或凝胶。

2. 细胞收获收获细胞的方法取决于细胞类型和实验的目的。

常见的方法包括用PBS或细胞培养液将细胞冲洗下来,或者用胶体离心等方法进行细胞收获。

收获的细胞量需要根据实验需求进行调整,一般建议在0.1-1g的范围内收获细胞。

3. 细胞裂解细胞裂解是质粒提取过程中最关键的步骤之一,它能有效破坏细胞膜和核膜,释放细胞内的DNA。

常用的细胞裂解剂包括SDS、Triton X-100和Tween-20等,同时还需要将细胞裂解液加入蛋白酶抑制剂和DNA酶切酶,以避免核酸降解和一些酶促反应的发生。

细胞裂解后,将细胞裂解液转移到离心管中,并进行离心分离,将细胞碎片等大分子杂质通过离心将其剔除。

4. DNA纯化DNA纯化是质粒提取的最后一步,目的是将提取得到的DNA从其他杂质中纯化出来。

不同的实验需求需要不同级别的DNA纯化,从而需要使用不同种类的DNA纯化试剂盒。

目前常用的DNA纯化试剂盒包括酚/氯仿提取法、离子交换柱纯化法、硅胶膜纯化法等。

在DNA纯化后,通过分析电泳和UV测定等方法进行检测,以确保提取的DNA质量和浓度满足实验需求。

总结质粒提取是分子生物学中非常基础和常用的实验技术,其所涉及的步骤包括细胞培养、细胞收获、细胞裂解和DNA纯化等步骤。

质粒提取方法

质粒提取方法

质粒提取:质粒是细胞染色体外弄够自主复制的很小的环状DNA分子。

1、将新鲜单菌落或液体培养物接种到5mL液体培养基中,32℃振荡培养至对数生长后期;(振荡速度250-300rpm)2.将菌液倒入1.5mL离心管中,4℃,10000rpm离心20秒,弃去上清液,将离心管倒置于吸水纸上,使上清液尽可能去尽。

为增加菌体的量,可重复操作2-3次;3.将收集的沉淀重悬于预冷的100μL溶液Ⅰ中,涡旋混匀,使充分悬浮,温室放置5分钟。

4.加入200μL溶液Ⅱ,颠倒混匀,冰浴5分钟。

(1、溶液变成半透明粘液;2、冰浴使染色体DNA片段不至于太小,质粒不容易开环;3、若SDS因温度太低析出,需微热使融)5.加入150μL溶液Ⅲ,混匀,冰浴5分钟,(DNA复性)6.12000rpm离心5分钟,将上清液移至1个新的1.5mL的离心管中,(上清液为复性的质粒,沉淀为缠绕的染色体及少量蛋白质)7.加入2倍体积无水乙醇颠倒混匀,室温放置10分钟,(无需-20℃)8.12000rpm离心10分钟,弃去上清液,将管口打开,倒置于吸水纸上,使所有液体尽可能流出。

9.加入1mL75%乙醇(洗去DNA表面的盐类),12000rpm离心5分钟。

10.弃去上清液,将离心管倒置于吸水纸上,使液体流尽,置通风厨中至液体挥干(乙醇需完全挥发)11.将沉淀溶于40μL含20μg/L(2%的浓度)的RNA酶的TE溶液中,38℃放置于10分钟,-20℃保存。

12.检验(DNA溶于水,不溶于酒精)质粒提取中溶液的配制(准备工作)1. 0.5M EDTA(pH=8.0)(10mL)称取1.8g Na2EDTA•2H2O加入约8mL的去离子水,充分搅拌均匀,用NaOH调节pH至8.0(约0.2gNaOH)pH值为8.0时,EDTA才能完全溶解,加入去离子水将溶液定溶至10mL,高温高压灭菌后室温保存。

2. 1M Tris-HCL(pH=8.0)10mL称量1.211g Tris,加入约8mL去离子水,充分搅拌溶解,加入0.42mL浓盐酸,定容至10mL,高温高压灭菌后,室温保存。

质粒dna提取步骤

质粒dna提取步骤

质粒dna提取步骤
质粒 DNA 提取是分子生物学实验中的一项基本技术,用于从细菌细胞中分离出质粒DNA。

以下是一般的质粒 DNA 提取步骤:
1. 收集细菌培养物:将含有质粒的细菌培养在适当的培养基上,直到培养物达到合适的密度。

可以使用离心或过滤的方法收集细菌细胞。

2. 细胞裂解:将收集的细菌细胞加入裂解缓冲液中,通过物理方法(如搅拌、超声处理等)或化学方法(如加入裂解酶等)使细胞破裂,释放出质粒 DNA 和其他细胞成分。

3. 去除细胞碎片:将裂解后的混合液通过离心或过滤的方法去除细胞碎片和其他杂质。

4. 沉淀 DNA:向裂解液中加入乙醇或异丙醇等沉淀剂,使质粒 DNA 沉淀。

通过离心将沉淀收集。

5. 洗涤沉淀:用 70%的乙醇洗涤沉淀,以去除残留的盐分和杂质。

6. 干燥沉淀:将洗涤后的沉淀离心,并去除上清液。

然后将沉淀在室温下干燥,以去除残留的乙醇。

7. 溶解 DNA:将干燥的沉淀加入适当的缓冲液中,使质粒 DNA 溶解。

可以在缓冲液中加入 RNA 酶以去除 RNA 杂质。

8. 纯化和浓缩 DNA:可以使用柱层析、电泳或其他方法对提取的质粒 DNA 进行进一步的纯化和浓缩。

9. 质量检测:使用琼脂糖凝胶电泳或其他适当的方法检测提取的质粒 DNA 的质量和完整性。

需要注意的是,具体的质粒 DNA 提取步骤可能因使用的试剂盒或实验条件而有所不同。

在进行质粒 DNA 提取之前,应仔细阅读所使用的试剂盒说明书或相关实验方案,并根据实际情况进行适当的调整和优化。

质粒DNA的提取实验报告

质粒DNA的提取实验报告

质粒DNA的提取一、实验方法碱裂解法抽提质粒DNA二、实验原理基于质粒DNA与染色体DNA变性与复性的差异。

三、实验步骤1)质粒提取1. 10,000g,1min离心收集1.5-5ml菌液沉淀于1.5ml离心管中。

2. 加入100μl溶液1,振荡至彻底悬浮。

3. 加入200μl溶液2,立即轻柔颠倒离心管6次,使菌体充分裂解,随后将离心管冰上放置3分钟4. 加入150μl溶液3,立即温和颠倒离心管数次,冰上放置3分钟,10,000g离心10min。

5. 将步骤4的上清转移至新的离心管(尽量去除杂质),加入等体积的苯酚/氯仿/异戊醇混合均匀10,000g离心5min。

6. 将步骤5的上清转移至新的离心管,加入2倍体积的无水乙醇,室温放置5-10min,沉降DNA7. 10,000g离心10分钟,弃乙醇,保留沉淀,加入1ml 70%的乙醇洗涤沉淀,10,000g离心5分钟8. 倒掉乙醇溶液,用吸水纸吸净管壁上的水珠,室温蒸发痕量乙醇9. 加入适量含RNase的TE或灭菌双蒸水溶解质粒DNA2)质粒鉴定→琼脂糖凝胶电泳灌胶:胶中加入荧光染料(SYBR Green I)加样:质粒+上样缓冲液→混匀电泳结果观察:UV灯下四、实验结果五、实验分析裂解细胞中除含有质粒DNA外,还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂类等物质,因此用碱裂解法除去杂质1、防止DNA裂解:Solution 11)、所含糖增加溶液黏度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切作用降解2)、所含EDTA抑制酶活性2、溶解与变性:Solution21)强碱使质粒DNA和染色体DNA变性2)离子型表面活性剂SDS可溶解膜蛋白3、沉降与复性:Solution31)质粒DNA复性2)在钾盐中,染色体DNA形成缠连的不溶性网状结构,和不稳定的大分子RNA以及变性的蛋白质和细菌碎片等一起沉淀预期结果为剩余质粒DNA4、琼脂糖凝胶电泳1)荧光染色染料分子可嵌入双链DNA分子配对碱基之间2)琼脂糖可起到电泳和分子筛的作用,因所带电荷、分子量大小和构型不同,泳动速度不同六、误差分析实验失败,本组实验出现4条带,3明1暗,明亮处应为DNA分子数最多的,为质粒DNA,质粒DNA前有较暗的两条带,推测其中一条为未复性质粒DNA,可能Solution2处变性过长,不易复性,或Solution3处时间过短,复性不充分。

质-粒-提-取-原理及步骤

质-粒-提-取-原理及步骤

质-粒-提-取-原理及步骤概述质粒提取,又称DNA提取,是一种分离和提取所需DNA的过程。

质粒提取在许多实验中都是非常重要的步骤,例如基因工程、分子生物学、遗传学和其他DNA相关实验。

本文将介绍质粒提取的原理及步骤。

原理DNA提取的过程通常包括细胞破碎、DNA纯化、DNA溶解和复性等步骤。

对于质粒提取,主要步骤通常包括以下内容:1.细菌培养:在质粒提取之前,需要将细菌培养在含有适当抗生素的培养基中,用于扩增质粒数量。

2.细胞破碎:使细胞破裂以释放出含有质粒的细胞内物质,此步骤需要进行严格的抗污染措施,以避免污染质粒样本。

3.除去污染物:除去细胞壁、蛋白质、核酸和其他污染物。

4.离心分离:将上述步骤中提取出的样本进行离心分离,使DNA沉淀,以便进一步纯化。

5.溶解:通过加入一定的缓冲液或去离子水,使DNA重新溶解。

步骤以下是一种常见的质粒提取步骤:1.处理样本:将含有所需质粒的细胞收集,并进行初始处理,包括细胞壁破裂、核酸纤维溶解等。

2.傅里叶纯化:通过傅里叶变换纯化,将细胞内杂质和有机污染物清除。

3.离心分离:将细胞样本离心,使DNA沉淀到底部,并且将上层样本移除。

4.乙醇沉淀:加入乙醇沉淀,将DNA纯化到上清液。

5.重振溶解:最后使用适当缓冲液重振重振溶解DNA,也可以使用去离子水重振。

以上就是质粒提取的原理和步骤,这是一个非常重要的操作,在DNA研究和实验中有着广泛的应用。

我们需要注意的是,在操作过程中需要进行高标准的质量控制,以确保实验结果的准确性。

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操作步骤:
本实验方法适用于从1-10ml过夜培养的大肠杆菌菌液中提取质粒。

提取量受菌株、质粒拷贝数、菌液体积和培养时间、培养基类型等因素的综合影响。

1.收菌:将过夜培养(37℃,12-16小时)的菌液于室温≧10,000g
离心1-2分钟,彻底弃除上清。

注意:高拷贝质粒建议使用≦5ml菌液;菌液用量过大不仅不能增加质粒产量,反而会因裂解不完全或杂质封闭硅胶膜而降低产量;培养时间不宜过长,否则会增加开环结构质粒的比例。

2.重悬:加入250µl含RNase A的细胞悬浮液(S1),充分混悬震荡
或用枪头反复抽打使细菌彻底分散悬浮。

3.裂解:加入250µl细胞裂解液(S2),轻轻上下颠倒混合5次,室
温静置1-5分钟,待细菌充分裂解,溶液变半透明。

注意:避免剧烈震荡导致基因组DNA裂解,裂解时间不能超过5分钟。

4.中和:加入350µl中和缓冲液(S3),轻轻上下颠倒混合5次,充
分混匀,避免剧烈震荡。

室温下≧12,000g离心10分钟。

5.DNA结合:小心吸取上清,转移到插入收集管的离心吸附柱内,室
温下≧12,000g离心1分钟,弃除收集管中的废液,将离心吸附柱重新插回收集管中。

6.清洗:加入500µl漂洗液(WB,请确认已加入乙醇!)于离心吸附
柱中,室温下≧12,000g离心30秒,弃除收集管中的废液,将离心吸附柱重新插回收集管中。

7.再次清洗:加入500µl漂洗液(WB)于离心吸附柱中,室温下≧
12,000g离心30秒,弃除收集管中的废液,将离心吸附柱重新插
回收集管中。

将离心吸附柱开盖再次离心2分钟,彻底除去残余漂洗液。

8.洗脱:小心取出离心吸附柱,将其套入一个新的1.5ml灭菌离心
管中。

向硅胶吸附膜的中央加入100µl洗脱缓冲液(EB),室温放置1分钟后,≧12,000g离心1分钟收集质粒DNA。

注意:为提高质粒浓度,最低可使用30µl的EB溶液,离心收集后壳将洗脱的质粒溶液再次加入离心吸附柱中重复洗脱;使用100µlEB溶液则无需二次洗脱;对6kb以上的质粒,可使用预先加热至55℃的EB溶液洗脱以提高产量;EB溶液不含EDTA,故不会影响荧光测序等后续反应;如必须使用无菌去离子水洗脱,需注意其pH值是否接近中性,否则应使用NaOH溶液将pH值调节至7.0-8.5之间。

9.储存:弃除离心吸附柱,纯化的质粒可直接用于后续反应或于
-20℃长期保存。

注意:经检测,本试剂盒从endA¯菌株(如DH5α,TOP10,XL1-blue等)中提取的质粒反复冻融20次无降解;如需在4℃长期保存或者保存从endA+菌株(如JM109,HB101,BL21等)中提取的质粒,可向每100µl质粒溶液中加入11µl的10×TE溶液,但含EDTA的质粒溶液不可用作荧光测序模板。

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