肺癌血清蛋白质组学研究及应用进展
诊断蛋白质组学及其在肺癌生物标记物中的研究进展

鉴 定技 术。 文就 目前 常用 的诊 断蛋 白质 组 学研 究技 术 以及 本 其在 肺癌 生物标 记物研 究 中的应 用作一 综述
1 蛋 白质 组 分 离 技 术 11 双 向 凝 胶 电 泳 技 术 该 方 法 根 据 不 同 蛋 白 质 之 间 的 等 .
电点 和 分 子 量 差 异 而建 立 . 块 双 向 凝胶 能分 离 10 0~ 一 0
30 0个 蛋 白 质 点 。 多可 达 1 0 0 最 00 0个 蛋 白质 点 [ 双 向凝 胶 。
电泳技 术 凭着其 高通 量 、 高的 分辨 率和 重复性 好并 能很 好 较
地 与质谱鉴 定 方法 匹配等优 势 . 成为 了最 经典 的蛋 白质 分 离 技 术。C e h n等[运 用双 向凝胶 电泳联合 质谱鉴 定技 术 。 过 ] 通 对 9 3例 肺 腺 癌 组 织 和 l 0例 正 常 组 织 的 蛋 白 质 组 学 对 比 研
寻找肿 瘤特 异性标 记物 , 以期 对 恶性肿 瘤进行 早期 诊 断 是蛋 白质组 学一项 重要 的任务 。 的疾病 状 态生物标 志物 的 新 发现 , 有助 于加 深 对疾 病发 生发展 过 程 的理 解 。 找到 更 多的
质 荷 比 ( Z) 差 异 来 分 离并 确 定 分 子 质 量 。 由 最 基 本 的 M/ 的 三 个 部 分 组 成 :样 品 离子 化 装 置 、质 量 分 析 器 以 及 离 子 检
究 , 现 了抗 氧 化 酶 A E 7 、 1 发 O 3 2 A ’ 酶 亚 基 d A P D) p , P合 ( T 5 、 l
子 阱质 谱 、 线性 离子 阱质谱 和 傅 立叶 变换 离子 回旋 共振 质
谱等。
21 基 质 辅 助 激 光 解 吸 电 离一 行 时 间 质 谱 ( L I O ) . 飞 MA D . F T
利用蛋白质组学技术从头测序、蛋白鉴定研究新型抗NSCLC蛋白PFAP

BTP项目文章 | 利用蛋白质组学技术从头测序、蛋白鉴定研究新型抗NSCLC蛋白PFAP非小细胞肺癌(NSCLC)是最常见的肺癌类型,约占肺癌病例的85%。
同时,有超过30%的NSCLC患者被诊断为晚期。
然而,尽管目前存在放化疗技术和新的辅助免疫治疗,但对于提高晚期NSCLC患者的生存率仍未达到理想效果,放化疗后的5年生存率仍然维持在10-15%之间。
与传统药物不同,蘑菇因其免疫调节、抗炎和抗肿瘤的特性备受瞩目。
蘑菇不仅可以直接抑制癌细胞,还可以作为辅助治疗的选择,有助于改善因癌症引起的恶心、呕吐、腹泻、疲劳和失眠等症状,并增强人体免疫系统功能。
因此,基于蘑菇中的抗癌活性化合物,开发新的针对NSCLC的药物具有极大的前景和潜力。
2023年7月,南开大学和香港中文大学的科研团队在International Journal of Biological Macromolecules杂志(IF=8.025)上发表了题为“New fungal protein from Pleurotus ferulae lanzi induces AMPK-mediated autophagy and G1-phase cell cycle arrest in A549 lung cancer cells”《阿魏蘑菇中的新型蛋白PFAP通过AMPK调节的自噬和G1期细胞周期阻滞诱导A549肺癌细胞》的研究成果。
该研究从阿魏蘑菇(Pleurotus ferulae lanzi)中分离出一种新型的抗非小细胞肺癌(NSCLC)蛋白PFAP,并采用蛋白质组学技术对其进行了鉴定和抗肿瘤机制研究。
通过从头测序的分析结果显示,PFAP是由135个氨基酸残基构成的蛋白质,其理论分子量为14.81 kDa。
通过串联质谱标记(TMT)™定量蛋白质组学分析,研究表明PFAP能够通过调节AMPK / mTOR途径并抑制A549肺癌细胞的G1期细胞周期来诱导自噬作用。
蛋白质组学综述

蛋白质组学在肿瘤研究中的应用摘要:随着人类基因组全序列草图的完成,从基因水平向蛋白质水平的深化,已成为生命科学研究的迫切需要和新的任务。
蛋白质组学的建立为研究蛋白质水平的生命活动开辟了更为广阔的前景,提供了新型有效的研究手段。
从蛋白质整体水平上研究肿瘤的发生与转移,寻找与肿瘤发生及转移相关的新的蛋白质、肿瘤特异性的标志物及肿瘤药物治疗的靶标,对肿瘤的诊治将起到重要作用。
本文对肿瘤蛋白质组学的研究进展进行了简要综述。
关键词蛋白质组学蛋白质组肿瘤研究进展人类基因组计划全基因组测序的完成,标志着后基因组时代的到来,其主要任务是分析细胞全部蛋白质的结构、功能和相互作用,即蛋白质组学。
恶性肿瘤是危害人类的主要疾病之一,但其发生发展机制仍不清楚,诊断、治疗效果也不理想,而蛋白质组学方法可望为肿瘤发生机制的研究和防治带来新的突破。
本文将蛋白质组学基本概念、研究技术和肿瘤蛋白质组学研究进展作一综述。
1. 蛋白质组和蛋白质组学概念蛋白质组(proteome)的概念最早是由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins等于1994年在意大利的一次科学会议上提出的,他们对蛋白质组的定义:“蛋白质组指的是一个基因组所表达的蛋白质”;即“proteome”是由蛋白质的“prote”和基因组的“ome”字母拼接而成。
它是对应于一个基因组所有蛋白质构成的整体,而不是局限于一个或者几个蛋白质。
由于同一基因组在不同细胞、组织中的蛋白质表达情况各不相同,即使是同一细胞,在不同的发育阶段、不同的生理病理条件下甚至不同的环境影响下,其蛋白质的存在状态也不尽相同。
因此,蛋白质组是一个在时间和空间动态变化着的整体。
蛋白质组学(proteomics)是指以蛋白质组为研究对象,从整体的角度,分析细胞内动态变化的蛋白质组成与活动规律。
蛋白质组学研究主要包括:①表达蛋白质组学(expression proteomics),研究细胞或组织中蛋白质表达的质和量的变化,以及不同时间基因表达谱的改变;②功能蛋白组学(functional proteomics),研究在不同生理和病理条件下,细胞中各种蛋白质之间的相互作用关系及其调控网络,以及蛋白质的转录后修饰等;③结构蛋白组学(structure proteomics),以阐明生物大分子蛋白质的三维结构特性为目的[1]。
人类肺癌的分子病理学研究

人类肺癌的分子病理学研究肺癌是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,其发病率不断增加,已成为影响人类健康和生命的重要卫生问题。
人类肺癌的分子病理学研究是肺癌研究中的一个重要方面。
本文将从肺癌的基本概念入手,介绍肺癌的分子病理学研究的主要内容、方法及进展,并展望其未来研究方向。
一、肺癌的基本概念和流行病学肺癌是指肺组织中恶性细胞的异常增生和扩散。
根据病理及组织学特征,肺癌可分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌两大类。
其中非小细胞肺癌包括腺癌、鳞癌、大细胞癌等亚型,约占肺癌的85%以上,小细胞肺癌占肺癌的15%左右。
肺癌是全球各国家和地区死亡率最高的癌症之一。
根据世界卫生组织发布的数据,肺癌每年导致50万人死亡,其中中国就有27万人之多。
此外,肺癌的发病率仍在迅速增加,给全球健康带来了巨大的挑战。
二、肺癌的分子病理学研究的主要内容肺癌的分子病理学研究主要关注以下几个方面:(一)肺癌的致癌基因和抑癌基因肺癌的致癌基因主要包括KRAS、EGFR、ALK等基因。
这些基因发生突变后会导致细胞增殖、分化和癌变等异常生物学行为。
同时,肺癌中也存在多个抑癌基因,如P53、LKB1等,它们失活后会促进肿瘤的形成和发展。
(二)肿瘤微环境肺癌的形成和发展不仅仅是细胞内基因突变所导致的结果,还与肿瘤微环境密切相关。
肿瘤微环境包括肿瘤细胞周围的细胞、外基质分子、血管和免疫细胞等多个因素,它们共同作用影响着肺癌细胞的生长和扩散。
(三)肿瘤耐药机制肺癌治疗的效果高度受限于肿瘤细胞的药物敏感性。
然而,在化疗或靶向治疗过程中,肿瘤细胞往往会产生耐药性,致使治疗效果降低。
因此,深入研究肺癌细胞产生耐药的机制是十分必要的。
(四)遗传与表观遗传学遗传和表观遗传学方面也是肺癌分子病理学研究的重要部分。
肺癌的发生和发展往往与遗传因素有关,而表观遗传机制如DNA甲基化和组蛋白修饰则影响了基因的表达和激活,从而影响肺癌的发展。
三、肺癌的分子病理学研究的方法为了深入了解肺癌的分子病理学机制,研究人员采用了多种方法进行研究:(一)基因测序通过对肺癌组织样本和正常组织样本的基因测序,可以寻找肺癌的致癌基因和抑癌基因的突变信息。
蛋白质组学技术及其在肺癌诊断研究中的应用进展

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蛋 白质 组 学 技 术 及 其 在 肺 癌 诊 断 研 究 中 的 应 用 进 展
潘 俊 刘延 盛 , 综述 , 陈海泉 曾 嵘 , 审校
(. 1上海 交通 大学 医学 院 附属第 六人 民医 院胸外 科 , 上海 20 3 ; . 国科 学 院上 海 生命 科 学 院 02 3 2 中 蛋 白质组 实 验室 , 海 20 3 ; . 上 00 2 3 复旦 大 学附 属肿 瘤 医院胸 外科 , 海 20 3 ) 上 00 2
在 肺 癌蛋 白质 组 学 研 究 中 的最 新 进 展 。
关键 词 : 蛋 白质组学 ; 肺癌 ; 早期诊断
中 图 分 类 号 : R 3 . 74 2 文献标识码 : A 文 章 编 号 : 10 -19 20 )60 5 - 0 88 9 (0 8 0 -6 20 5
P oemi cn lg n sa piaini eerydan s fu gcne rto ct h ooya di p l t t al ig oi o n a cr e t c o nh s l
维普资讯
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62・ 5
第2卷 1
第 6期
医 学 研 究 生 学 报
J u n lo d c lP sg a u ts o r a fMe ia o tr d ae
Vo _ No 6 l 21 .
20 0 8年 6月
综 述 ・
J n 20 u .08
摘要 : 肺 癌是 目前最常见 的恶性肿 瘤 , 由于缺乏有效 的早期诊断手段 , 死亡率高 , 预后 差。恶性 肿瘤 与正常组织 或血 清蛋 白质组学 的研究 , 可直接 比较两者 之 间蛋 白质 组学 的表达 差异 , 为我 们发现 新 的肿瘤 标记 物提 供 了可 能, 从而为肺癌 的早期诊 断提 供一条新 的途径 。现简要介 绍 目前 常用 的诊 断蛋 白质组 学研 究方法 及其各 种方法
蛋白质组学及其在肺癌研究中的应用

防护领域采用蛋 白质组学技 术对辐射致肺癌进行 系统 的研究 分析奠定 了基础 。本文介绍 了蛋 白质组学 及其技术平 台, 以及 蛋 白质组学在肺癌研究 中的应用现状和展望 。 关键词 : 蛋 白质组学 中图分类号 :Q 9 61 肺癌 辐射 防护 文献标识 码 : A 文章编 号 : 0465 (0 10—0 1 5 10-36 2 1)503— 0
( ) 白质鉴定。利 用 2 E电泳并 结合蛋 1蛋 - D 白质 印记 等技 术 , 用蛋 白质 芯 片 和抗 体 芯 片及 利
免疫 共沉 淀等 技术 对蛋 白质进行 鉴定 研究 。 ()翻译 后 修饰 。很 多 m N 2 R A表 达 产 生 的 蛋
白质要经历翻译后 修饰 , 如磷酸化 , 糖基化 , 原 酶 激 活等才 能表 现 出生 物学 活性 。 翻译 后 修饰 时 蛋
根 据不 同 的 目的 和 采 用 不 同 的技 术 , 白质 蛋
2 蛋 白质 组 学
2 1蛋 白质 组学 的研 究 内容及 分 类 . 蛋 白质组 学 的研究 内容 主要包 括 以下方 面 :
组 学分 为 以下 类 型 :
( ) 达 蛋 白质 组 学 : 于 不 同样 品 中 的蛋 1表 对 白质 进行 定量 分 析 , 发 现信 号 转 导 或 与疾 病 相 以
胞 内部 位 的蛋 白质 及 蛋 白质 复 合 体 中 的蛋 白质 分 热 门 的系统 生 物学研 究 的重 要基 石 j 。 子结 构 的研究 。 2 2 4蛋 白质组 研 究 的新 技 术 .. ()功 能 蛋 白质 组 学 : 3 阐明 生 物 体 内 的 信 号 目前 , 维 色 谱 (DL 、 维 毛 细 管 电 泳 二 2 —C) 二 转 导 的机 制 、 病 发 生 的 机 制 , 及蛋 白. 物 之 (D C )液相色谱一 疾 以 药 2 —E 、 毛细管电泳 (CC ) L .E 等新型分 间 的相 互 作用 。 离技 术都 有 补充 和取 代双 向凝胶 电泳 之 势 。另 一
蛋白质组学的研究方法和进展

2021/10/6
18
样品预分级的主要依据
蛋白质溶解性:可溶性蛋白、非溶性蛋白等 蛋白质定位:膜蛋白、核蛋白等 蛋白质细胞器定位:线粒体、高尔基体、叶
绿体等
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组织水平蛋白质组样品制备
原因:临床样本都是各种细胞或组织混杂, 而且状态不一,如肿瘤中癌变的上皮类细胞 总是与血管、基质细胞等混杂。
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科技部已将疾病蛋白质组研究列入我 国“973”计划项目和“863”计划项目; 国家自然科学基金委员会也将“蛋白质 组研究”列为重点项目。
我国在鼻咽癌、白血病、肝癌和肺癌 蛋白质组研究方面取得了较大进展。
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第二节 蛋白质组学研究方法概述
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H3 High-grade
Apoliprotein A-I (H4) H4 H4
40 Low-grade
40 High-grade
Peroxiredoxin 6 (H5)
13 48
H5 Low-grade
13 48
H5 High-grade
33
二维电泳优点
可分离10~100 kD 范围内蛋白质 高灵敏度和高分辨率 便于计算机进行图像分析处理 与质谱分析匹配
克服了载体两性电解质阴极漂移等缺点。 可以精确设定pH梯度。
尤其可在较窄的pH范围内进行第二轮分析, 大大提高了分辨率及重复性。
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第二向SDS-PAGE电泳
双向凝胶垂直电泳 双向电泳后的凝胶经染色后蛋白呈现二
维分布图:水平方向反映出蛋白在pI上的 差异,垂直方向反映分子量上的差别。
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分子诊断在肺癌检测中的作用及进展

分子诊断在肺癌检测中的作用及进展随着现代医学技术的不断发展,肺癌已经成为了人们面临的一大健康威胁。
环境污染,生活习惯的改变,以及人们所处的工作环境等各种因素都会导致肺癌的发生,给人们的身体带来了严重的损害。
在临床上,要想进行准确的肺癌检测,分子诊断技术目前已经扮演着必不可少的角色,并不断呈现新的进展。
一、分子诊断技术的发展现状近些年来,分子诊断技术在肺癌检测的作用愈发重要。
其主要基于特定的分子标记物,来确定肺癌是否存在以及它的类型、分布、大小等信息。
主要技术手段包括了基因测序、蛋白组学、细胞学以及代谢组学等等。
其中,基因测序是目前使用最广泛的一种技术,其优势在于对不同个体基因组的比较和检测。
同时,肺癌影像诊断也有了飞速的发展,CT、MRI等影像学技术都极大地便利了肺癌诊断的准确性。
通过分子诊断技术和影像学技术的有机结合,肺癌的诊断水平大大提高,为病患者的治疗提供了更为准确的依据。
二、分子诊断技术的优点分子诊断技术具有诸多优点,主要有以下几个方面:1.非侵入性检测分子诊断技术与传统的肺癌检测方法不同,其所采用的科学思路是从人体内部的生物标记物中获取有关肺癌的信息,其检测过程中不需要进行切片、组织取样等一系列侵入性操作,对患者自身的伤害大大降低。
这一点对于部分年龄较大、身体情况较为虚弱的病患来说尤为重要。
2.准确性高相较于传统的肺癌诊断方法,分子诊断技术的准确性要更高。
在分子水平上,肺癌形成机理的深入研究为分子诊断技术提供了较为可靠的依据。
分子标记物在肺癌的早期诊断中有着不可忽视的作用,在协助医生判定病人患病程度以及病变位置、大小等方面具备较高的精确性。
3.适用于个体化治疗分子诊断技术是一种个体化的检测手段,可以根据不同的肺癌分子标记物来为每位患者提供更为准确的治疗方案。
由于肺癌的类型种类繁多,而且患病人口年龄差异大,因此肺癌的治疗方案应该因人而异,对于特定的病种和病变程度使用针对性的治疗手段方能尽早治愈患病人群。
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( 收稿 日期 : 0 卜1 - 8 2 1 22 )
综
述 ・
肺 癌血 清 蛋 白质 组学 研ห้องสมุดไป่ตู้究及应 用 进展
a o i o r t i e n p te t t h t b l y d o p l p o en A5 g ne i a i n s wih t e me a o i s n r me p c
基因多态性 与血 脂 代谢 和 胰 岛 素抵抗 的关 系研 究 E ] J .遗传 ,
示对 于 l床 高度 怀 疑 肺 癌 但 无 法 取 得 病 理 证 实 的患 者 , 清 蛋 』 缶 血 白质 组 检 测具 有 一 定 的参 考 价值 。 肺 癌 患 者 、 康 人 及 肺 部 良性 疾 病 患 者 的 血 清 差 异 蛋 白质 健 组 学 研 究 有 助 于 筛 选 、 定 差 异 蛋 白 质 , 能 以此 为依 据 建 立 鉴 若 分 类 树 诊 断 模 型 , 诊 断 灵 敏 度 及 准 确 性 大 大 高 于 传 统 方 其 法 l 。周 继 红 等 [ 5 用 S I I F Ms技 术 、 阳离 子 交 换 蛋 E — D TO — 弱 白质 芯 片 , 测 肺 癌 和 肺 部 良性 病 变 患 者 的 血 清 蛋 白 质 质 谱 检 图 , Bon re at n软 件 分 析 差 异 蛋 白 质 并 建 立 其 诊 断 用 irak r te P r 模 型 , 果 发现 有 2 个 蛋 白 质 峰 有统 计 学 差异 , 中 肺 癌 患 者 结 O 其 血清 高 表 达 蛋 白质 峰 l 个 , 表 达 蛋 白质 峰 6个 , 断 肺 癌 的 4 低 诊 灵敏 度 和特 异 度 分 别 为 8 和 9 。Y n 8 5 a g等 对 肺 癌 患 者 和健 康 对 照者 血 清 进 行 分 析 , 发现 了 l 8个 蛋 白质 峰 异 常 表 达 。 选 其 中 5 蛋 白质 峰 建 立 肿 瘤 标 志 物 图谱 。 经 盲 法 检 测 发 现 个 其诊 断非 小 细胞 肺 癌 ( S L ) 灵 敏 度 达 9 . 。对 于 早 期 N C C的 14 肺 癌 ( Ⅱ期 ) 诊 断 灵 敏 度 为 7 . , 超 过 了 目前 临 床 使 I/ 的 91 远
B o h s Ae a, 0 , 7 2( : 5 6 i p y t 2 07 1 7 3) 3 5 3 3
.
i ]Grl r H , el irEM , t e 1AP f0 2 al t Sdme e e Huh C, ta. OA5vrat n aJnsa d
mea oisn rmei acs n  ̄]JLpdRe,0 7 4 ( 2 : tb l y do C uai sJ . ii s2 0 ,8 1 ) c n a
李 克 , 刘 辉 综述 , 汪俊 军 审校 ( 南京军 区南京 总 医院检 验科 , 南京 2 0 0 ) 1 0 2
关 键 词 : 白 质 组 学 ; 肺 肿 瘤 ; 血 清 ; 综述 蛋
D I 1 . 9 9 jis . 6 34 3 . 0 2 0 . 2 O :0 3 6 /.sn 1 7 — 1 0 2 1 . 5 0 1 文献标识码 : A 文 章 编 号 : 6 34 3 ( 0 2 0 — 5 60 1 7 1 0 2 1 ) 50 5 — 3
・
56 5 ・
国堕 堕堕堂塑查 21年 3 o2 月第 3 卷第 5 It a e, a h 02V1 3N. 3 期 nJ b dM r 1,o3,o5 L M c2 .
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t e a o i o r t i g n t h t b lc s n r me i i h p l p o e n AS e e wih t e me a o i y d o n Ch p
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[ 3 of ie , opr A,tp esJ ,ta T eef t f OA 2 ]D r s r C o e Sehn W e 1 h f c me t B J . e o AP 5
肺 癌 是 严 重 危 害 人 类 健 康 和 生 命 的 恶性 肿瘤 之一 , 发 病 其 率 和 患 者 死 亡 率 呈 上 升 趋 势 。 现有 的影 像 学 、 织 ( 胞 ) 理 组 细 病 学 、 气 管 镜 检 等检 测 难 以实 现 肺 癌 早 期 诊 断 。对肺 癌 发 病 机 支 制 、 癌 细 胞抗 药性 及 肺 癌进 程 所 涉 及 细 胞 通 路 的认 识 均 不 够 肺 深 入 。更 重 要 的 是 , 尚未 能发 现 预 测 肺 癌 进 程 和 疾 病 分 期 的 可
检 测 肺癌 和健 康人 血清 样 本 后 发 现 , 癌 患 者 有 3 蛋 白质 峰 肺 个 表 达 明 显 降 低 , 其 为诊 断标 志 进 行 酶 联 免 疫 吸 附 试 验 , 分 以 区
肺 癌 患 者 与健 康 人 的 灵 敏 度 为 7 . , 异 度 为 7 . 。 提 85 特 75
2 42 2. 61 — 6 1
[4 翟 光 华 , 平 , 兰 芳 , .Ⅱ型 糖 尿 病 患 者 A OA513 2] 闻 郭 等 P —1 1T> C
[1 2 ]Ki ai Mo d , dz A, ta. poy ea ayi o h s lP, h sM Mas e 1Haltp n ls fte f s
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