染色体微阵列分析
染色体微阵列分析技术在2600例流产物中的应用
染色体微阵列分析技术在2600例流产物中的应用
彭继苹,袁海明
1. 北京金域医学检验实验室有限公司,北京 100010 2. 广州金域医学检验中心有限公司,广州 510330
流产组织发生嵌合体 A：Copy Number State是CMA检测出的CNV片段的拷贝数,正常常染色体DNA拷贝数是2,当片段拷贝数为1或0时表示发生缺失,当片段拷贝数为 3或4时表示发生重复,图中DNA拷贝数是2或3,表示嵌合三体。B：Smooth Signal是拷贝数的真实反映,即患者的15号染色体的DNA拷贝数为2.5。C：Allele Difference是 DNA等位基因分布图,正常应该是3条信号带,分别在0、-1、1对应的位置,图中出现了4条信号带,中间2条信号带的位置分别在0~0.5和0~-0.5之间,而发生三体变异类型 时中间2条信号带应该在0.5和-0.5处;所以此图表示染色体发生嵌合体时拷贝数和等位基因分布图的具体情况。D：从染色体层面直观反映嵌合重复的现象。 遗传,2018,40(9),779-788.DOI:10.16288/j.yczz.18-120
染色体微阵列技术在神经遗传病诊断的应用
分类
神经系统遗传病分为四大类 4. 染色体病 染色体数目&结构异常所致 先天愚型体细胞中多一个21号染色体(21三体)
染色体微缺失或微重复
症状 体征&诊断
1. 神经系统遗传病症状体征多样 包括共同性&特征性症状
(1) 共同性症状&体征
智能发育不全\痴呆&行为异常 语言障碍\痫性发作&眼球震颤 不自主运动\共济失调&行动笨拙 瘫痪\肌张力增高\肌萎缩&感觉异常 面容异常\五官畸形\脊柱裂&弓形足 指趾畸形\皮肤毛发异常&肝脾肿大
常用的检测方法
染色体数量&结构 \DNA分析 \基因产物检测
染色体检查: 数目异常&结构畸变 染色体>&<23对 染色体断裂后导致缺失\倒位\重复\易位等畸变 检查: 先天愚型患儿&双亲 精神发育迟滞伴体态异 常 多次流产的妇女&丈 夫 生过先天畸形病儿的
双亲
遗传病诊断
可检出
DNA缺失\重复
(4) 遗传物质&基因产物检测
DNA双螺旋结构模型; 第一代测序技术
第二代、第三代、第四代测序技术
遗传学发展史
1956年 1970年 1980年 1986年 1992年 1997 年
• 确认正常人体细胞有46条染色体
• 染色体带型显现技术出现。
• 染色体高分辨率分析技术出现
• 荧光原位杂交技术( FISH )应用于染色体分 析
神经遗传代谢病？
同胞或近亲中发现相同类型的神经性疾病 复发性、发作性意识障碍 不能解释的痉挛步态、小脑共济失调和锥体外系异常综合
征症状 进行性发展的神经性疾患 一个同胞或近亲有精神发育不全 不伴先天躯体异常的精神发育迟缓
核型分析联合染色体微阵列分析在胎儿超声异常中的应用
《中国产前诊断杂志（电子版）》 ２０２３年第１５卷第２期·论著· 核型分析联合染色体微阵列分析在胎儿超声异常中的应用刘建珍 林铿 许碧秋 陈鸿桢 （广州市花都区妇幼保健院，广东广州，５１０８００）【摘要】 目的 探讨核型分析联合染色体微阵列分析（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌｍｉｃｒｏａｒｒａｙｓ，ＣＭＡ）技术在胎儿超声异常的应用价值。
方法 分析２０２０年１月至２０２２年６月就诊于广州市花都区妇幼保健院的２２０例胎儿超声异常病例的核型分析和ＣＭＡ结果，按超声情况分为单发结构异常、多发结构异常、结构异常合并软指标异常、单项软指标异常、多项软指标异常共五组，分析各组染色体异常情况。
结果 核型分析、ＣＭＡ在胎儿超声异常病例的染色体异常检出率分别为８．１８％（１８／２２０）、１１．３６％（２５／２２０），两种技术对于胎儿染色体异常的检出率差异无统计学意义（χ２＝１．２６，犘＝０．２６）。
核型分析较ＣＭＡ额外检出２例平衡易位，ＣＭＡ较核型分析额外检出６例拷贝数变异（ＣＮＶｓ）和３例纯合区域（ＲＯＨ）。
单发结构异常、多发结构异常、结构异常合并软指标异常、单项软指标异常、多项软指标异常的染色体异常检出率分别为１１．１１％（４／３６）、２５．００％（２／８）、１６．６７（２／１２）、１０．２６％（１６／１５６）、５０．００％（４／８）。
多发结构异常的胎儿染色体异常率高于单发结构异常，多项软指标异常胎儿染色体异常率显著高于单项软指标异常，差异有统计学意义（χ２＝１１．２３，犘＝０．００）。
结论 胎儿超声异常与染色体异常的关系密切，多项超声异常的胎儿染色体异常风险增加。
核型分析能有效检出染色体平衡易位，ＣＭＡ对ＣＮＶｓ和ＲＯＨ检测效能高，两者联合能提高胎儿超声异常的染色体异常检出率，明确致病片段来源及性质，并使异常结果得到验证。
【关键词】 胎儿超声异常；核型分析；染色体微阵列分析【中图分类号】 Ｒ７１４．５５ 【文献标识码】 Ａ犇犗犐：１０．１３４７０／ｊ．ｃｎｋｉ．ｃｊｐｄ．２０２３．０２．００５ 通信作者：陈鸿桢，Ｅｍａｉｌ：５２７５３８０５３＠ｑｑ．ｃｏｍ犃狆狆犾犻犮犪狋犻狅狀狅犳犽犪狉狔狅狋狔狆犻犮犮狅犿犫犻狀犲犱犮犺狉狅犿狅狊狅犿犪犾犿犻犮狉狅犪狉狉犪狔狊犻狀犳犲狋犪犾狌犾狋狉犪狊狅狌狀犱犪犫狀狅狉犿犪犾犻狋犻犲狊犔犻狌犑犻犪狀狕犺犲狀，犔犻狀犓犲狀犵，犡狌犅犻狇犻狌，犆犺犲狀犎狅狀犵狕犺犲狀 （犎狌犪犱狌犕犪狋犲狉狀犻狋狔犪狀犱犆犺犻犾犱犎犲犪犾狋犺犮犪狉犲犎狅狊狆犻狋犪犾，犌狌犪狀犵狕犺狅狌犌狌犪狀犵犱狅狀犵，５１０８００，犆犺犻狀犪）【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Ｔｏｅｘｐｌｏｒｅｔｈｅａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆｋａｒｙｏｔｙｐｉｃｃｏｍｂｉｎｅｄｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌｍｉｃｒｏａｒｒａｙｓ（ＣＭＡ）ｉｎｆｅｔａｌｕｌｔｒａｓｏｕｎｄａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ．犕犲狋犺狅犱狊 ＡｎａｌｙｚｅｄｔｈｅｋａｒｙｏｔｙｐｉｎｇａｎｄＣＭＡｒｅｓｕｌｔｓｏｆ２２０ｆｅｔａｌｕｌｔｒａｓｏｕｎｄａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｖｉｓｉｔｅｄｉｎｏｕｒｈｏｓｐｉｔａｌｆｒｏｍＪａｎｕａｒｙ２０２０ｔｏＪｕｎｅ２０２２，ａｎｄｔｈｅｕｌｔｒａｓｏｕｎｄｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓｗｅｒｅｄｉｖｉｄｅｄｉｎｔｏｆｉｖｅｇｒｏｕｐｓ：ｓｉｎｇｌｅｓｔｒｕｃｔｕｒａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ｍｕｌｔｉｐｌｅｓｔｒｕｃｔｕｒａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｃｏｍｂｉｎｅｄｗｉｔｈｓｏｆｔｉｎｄｅｘａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ｓｉｎｇｌｅｓｏｆｔｉｎｄｅｘａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ａｎｄｍｕｌｔｉｐｌｅｓｏｆｔｉｎｄｅｘａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ａｎｄｔｈｅｄｅｔｅｃｔｉｏｎｏｆｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｉｎｅａｃｈｇｒｏｕｐｗａｓａｎａｌｙｚｅｄ．犚犲狊狌犾狋狊 ＴｈｅｄｅｔｅｃｔｉｏｎｒａｔｅｓｏｆｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｉｎｕｌｔｒａｓｏｕｎｄｆｅｔａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｂｙｋａｒｙｏｔｙｐｅａｎａｌｙｓｉｓａｎｄＣＭＡｗｅｒｅ８．１８％（１８／２２０）ａｎｄ１１．３６％（２５／２２０），ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ，ａｎｄｔｈｅｒｅｗａｓｎｏｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｉｎｔｈｅｄｅｔｅｃｔｉｏｎｒａｔｅｏｆｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｂｅｔｗｅｅｎｔｈｅｔｗｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ（χ２＝１．２６，犘＝０．２６）．Ｋａｒｙｏｔｙｐｅａｎａｌｙｓｉｓｄｅｔｅｃｔｅｄ２ａｄｄｉｔｉｏｎａｌｃａｓｅｓｏｆｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍｔｒａｎｓｌｏｃａｔｉｏｎ，６ａｄｄｉｔｉｏｎａｌｃａｓｅｓｏｆｃｏｐｙｎｕｍｂｅｒｖａｒｉａｔｉｏｎ（ＣＮＶｓ）ａｎｄ３ａｄｄｉｔｉｏｎａｌｃａｓｅｓｏｆｈｏｍｏｚｙｇｏｕｓｒｅｇｉｏｎ（ＲＯＨ）ｃｏｍｐａｒｅｄｗｉｔｈＣＭＡａｎａｌｙｓｉｓ．Ｔｈｅｄｅｔｅｃｔｉｏｎｒａｔｅｓｏｆｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｏｆｓｉｎｇｌｅｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ３２Copyright ©博看网. All Rights Reserved.·论著·《中国产前诊断杂志（电子版）》 ２０２３年第１５卷第２期ａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ｍｕｌｔｉｐｌｅｓｔｒｕｃｔｕｒａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｃｏｍｂｉｎｅｄｗｉｔｈｓｏｆｔｉｎｄｅｘａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ｓｉｎｇｌｅｓｏｆｔｉｎｄｅｘａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ａｎｄｍｕｌｔｉｐｌｅｓｏｆｔｉｎｄｅｘａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｗｅｒｅ１１．１１％（４／３６），２５．００％（２／８），１６．６７（２／１２），１０．２６％（１６／１５６）ａｎｄ５０．００％（４／８），ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ｔｈｅｆｅｔａｌｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｙｒａｔｅｏｆｍｕｌｔｉｐｌｅｓｔｒｕｃｔｕｒａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｗａｓｈｉｇｈｅｒｔｈａｎｔｈａｔｏｆｓｉｎｇｌｅｓｔｒｕｃｔｕｒａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ａｎｄｔｈｅｆｅｔａｌｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｏｆｍｕｌｔｉｐｌｅｓｏｆｔｉｎｄｅｘａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｗｅｒｅｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙｈｉｇｈｅｒｔｈａｎｔｈａｔｏｆｓｉｎｇｌｅｓｏｆｔｉｎｄｅｘａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ａｎｄｔｈｅｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｗａｓｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌｌｙｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ（χ２＝１１．２３，犘＝０．００）．犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 Ｆｅｔａｌｕｌｔｒａｓｏｕｎｄａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓａｒｅｃｌｏｓｅｌｙｒｅｌａｔｅｄｔｏｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ａｎｄｔｈｅｒｉｓｋｏｆｆｅｔａｌｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｉｎｃｒｅａｓｅｓｗｉｔｈｍｕｌｔｉｐｌｅｕｌｔｒａｓｏｕｎｄａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ．Ｋａｒｙｏｔｙｐｅａｎａｌｙｓｉｓｃａｎｅｆｆｅｃｔｉｖｅｌｙｄｅｔｅｃｔｔｈｅｂａｌａｎｃｅｄｔｒａｎｓｌｏｃａｔｉｏｎｏｆｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ，ａｎｄＣＭＡｈａｓｈｉｇｈｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙｉｎｔｈｅｄｅｔｅｃｔｉｏｎｏｆＣＮＶｓａｎｄＲＯＨ．Ｔｈｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｔｗｏｃａｎｉｍｐｒｏｖｅｔｈｅｄｅｔｅｃｔｉｏｎｒａｔｅｏｆｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓｉｎｆｅｔａｌｕｌｔｒａｓｏｕｎｄａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ，ｉｄｅｎｔｉｆｙｔｈｅｓｏｕｒｃｅａｎｄｎａｔｕｒｅｏｆｐａｔｈｏｇｅｎｉｃｆｒａｇｍｅｎｔｓ，ａｎｄｖａｌｉｄａｔｅｔｈｅａｂｎｏｒｍａｌｒｅｓｕｌｔｓ．【犓犲狔狑狅狉犱狊】 Ｆｅｔａｌｕｌｔｒａｓｏｕｎｄａｂｎｏｒｍａｌｉｔｉｅｓ；Ｋａｒｙｏｔｙｐｅａｎａｌｙｓｉｓ；Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｍｉｃｒｏａｒｒａｙａｎａｌｙｓｉｓ 超声异常包括结构异常和软指标异常，胎儿超声异常与染色体异常密切相关［１］。
染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用
·综述·《中国产前诊断杂志（电子版）》 ２０１６年第８卷第３期染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用顾莹１ 黄欢２ 孙丽洲２（１．连云港市妇幼保健院生殖遗传科，江苏连云港 ２２２００６；２．江苏省妇幼保健院产科，江苏南京 ２１００３６）【摘要】 染色体微阵列分析（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌｍｉｃｒｏａｒｒａｙａｎａｌｙｓｉｓ，ＣＭＡ）技术是一种通过对染色体进行全基因组扫描，发现染色体组的数目和结构异常的检测技术。
ＣＭＡ以其高分辨率、高效率、高自动化操作等优点，不仅能有效检测传统核型分析技术所能检测的染色体数目异常及非平衡性结构异常，还能检测染色体组亚显微结构水平上不平衡重排引起的拷贝数变异（ｃｏｐｙｎｕｍｂｅｒｖａｒｉａｔｉｏｎ，ＣＮＶ），成为现代临床遗传学常规诊断工具，并被引入到产前胎儿遗传疾病检测中。
本文将就产前胎儿遗传病、胎儿遗传病检测的技术回顾、ＣＭＡ技术的发展及在胎儿遗传病检测中的应用、优势和面临的挑战等做一个详细的综述。
【关键词】 染色体微阵列分析；产前诊断；遗传病；遗传咨询【中图分类号】 Ｒ７１４．５３ 【文献标识码】 Ａ犱狅犻：１０．１３４７０／ｊ．ｃｎｋｉ．ｃｊｐｄ．２０１６．０３．０１１ 遗传病指人体遗传物质（包括细胞核ＤＮＡ和核外线粒体ＤＮＡ）发生变异或可遗传性修饰而导致的疾病，可由亲代遗传给子代，故称遗传病。
在产前胎儿检测的遗传性疾病中主要包括染色体病、基因病、线粒体病等。
目前已发现的人类染色体异常超过１００００种［１］，主要包括数目异常，如唐氏综合征２１号染色体比正常多一条，女性先天卵巢发育不全缺少一条Ｘ染色体；部分染色体大片段结构变异，罗氏易位等；染色体亚显微结构的微缺失或重复，如１７ｑ２１．３１微缺失综合征和２２ｑ１ｌ．２微重复综合征。
染色体病对胎儿的危害尤其巨大，除极少数三体和性染色体异常可以存活下来，大多数的染色体数目异常均以流产、死胎而告终，而染色体结构异常则是引起新生儿出生缺陷非常重要的原因，包括智力低下、发育迟缓、多器官畸形等［２］，而目前尚无有效的治疗措施，因此需要及早准确检测和积极干预。
cma基因芯片
cma基因芯片
CMA基因芯片是一种常规的染色体微阵列芯片，用于检测和分析染色体异常。
它基于Comparative Genomic Hybridization （比较基因组杂交技术），可以同时检测大量的目标序列和参照序列。
CMA基因芯片通常用于研究遗传性疾病、先天性缺陷和肿瘤的基因组结构异常。
它可以检测插入、缺失、重复和平衡性易位等染色体异常，并帮助诊断和研究这些疾病的底层机制。
使用CMA基因芯片进行分析时，研究者将待测样品和参照样品一起杂交到芯片上，然后测量荧光信号的强度来判断目标序列与参照序列之间的拷贝数差异。
通过比较信号的强度，可以确定目标序列的变异情况。
总之，CMA基因芯片是一种高通量、高分辨率的技术，可以帮助研究人员快速、准确地检测和分析染色体异常。
它在临床诊断和基础研究领域具有广泛的应用前景。
染色体微阵列分析技术(CMA)在产前诊断中的应用
3. VOUS：应建议父母行CMA 检测，通过家系综合分析以协助对胎儿检测结 11 果的判断。
（1）新发CNV：若有证据表明该区域内有疾病表型相关的功能基因，通常 认为是可能致病性；若该区域内无基因，通常认为是可能良性，也有可能目 前未发现其临床意义。 （2） 遗传性CNV： ①若胎儿父母有临床表型，且该区域内有疾病表型相关的功能基因，通常认 为该CNV 为可能致病性。 ②若胎儿父母无临床表型，通常情况下，可判断该CNV 为家族性良性CNV； 若胎儿CNV与亲代CNV 大小不同，且缺失或重复的范围扩大了，则应考虑 为可能致病性。此外，还需考虑不完全外显、临床表型差异（父母可能有亚 临床表现精选）ppt课的件 可能。
CMA芯片平台选择
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基于微阵列的比较基因组杂交技术(aCGH)
优势：用户可根据需要设计并制作芯片 可针对特定区域设计高密度探针 以增加在该区域的检测灵敏度和特异性
单核苷酸多态性微阵列技术(SNP array)
优势：SNP 芯片除了带有拷贝数信息外， 还带有SNP 分型的信息； 可检测杂合性缺失（loss of heterozygous，LOH），从而用于检测
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精选ppt课件
2 主要内容
➢ CMA在产前诊断中的应用概况 ➢ CMA芯片平台选择 ➢ CMA应用于产前诊断的临床指征 ➢ CMA检测前后的遗传咨询及结果解释
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CMA在产前诊断中的应用概况
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精选ppt课件
CMA在产前诊断中的应用概况
4 2013 年Hillman 等的meta 分析共涉及25 篇文献共18 113 例个体:
精选ppt课件
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CMA检测前的遗传咨询
3. 检出疾病的遗传异质性：所检出的某些遗传性疾病由于外显率和表现度的差异， 在不同患者间临床表现可能存在很大的变异。 4. 可能检出与临床表型不相关的CNV：通过CMA 技术检测可能发现非亲生父亲、 近亲婚配、迟发性的遗传病或成人期发病的遗传病（如肿瘤），这些结果应该让孕 妇及家属选择是否被告知。
临床基因组学检验：染色体微阵列技术原理 与临床应用
Genetic/Genomic Disorders
Genomic disorders (number) Trisomy 21 Trisomy 18 Trisomy 13 Mosaic trisomies of other chromosomes
Genomic disorders (structure) More than 400 known disorders
longevity
More than 150 genes prevents cholesterol buildup
精确控制胚胎发育和分化的每一个步骤; 决定了个体的所有生命特征; 决定了个体患各种疾病的可能性.
遗传病：遗传物质发生突变所引起的疾病。 种类：确定的遗传疾病超过7000种。 1、单基因病--涉及一对基因，AR、AD、XR、XD、Y连 锁遗传病。隐性遗传4000，显性遗传3000。 2、多基因病--多对基因和环境共同作用所导致的疾病。 3、染色体病--数目异常及结构异常引起的疾病。 4、体细胞遗传病--体细胞突变如肿瘤。 5、线粒体病--线粒体功能异常为主要起因的一大类疾病。 特征：垂直传递、终生性、发病率低、危害严重、家族性 发病、多无有效治疗。成为危害人类健康的主要疾病。
出生缺陷
出生缺陷
遗传因素
染色体异常（所有新生儿中，染色 体异常占0.92%，多为新发而非遗 传）
单基因突变（多为孟德尔遗传，少 数为新发）
环境因素（理、化、生物因素、生活方式）
遗传+环境因素
基因组：细胞核DNA成分和线粒体DNA分子的总和 基 因: 基因组内一个个具体的结构和功能单位 染色体：基因的载体
复，被収现广泛存在于人类基因组中[1,2]。已有大量研究证实CNVs
染色体微阵列分析在胎儿右位主动脉弓中的临床应用
染色体微阵列分析在胎儿右位主动脉弓中的临床应用郭珍;章春泉;阳彦;周欣;戴琳;肖晓娟;李欢【摘要】目的探讨染色体微阵列分析技术(CMA)在产前超声诊断胎儿右位主动脉弓(RAA)中的临床应用价值.方法研究近两年在江西省妇幼保健院产前超声诊断为RAA并分娩后确认者胎儿30例,30例样本中羊水23例,脐带血5例,引产胎儿组织2例.对样本分别进行传统染色体核型分析和CMA,并比较两种检测方法的检出率,评估不同类型RAA患者携带基因组拷贝数变异(CNVs)的差异.结果 30例胎儿RAA中(1)传统染色体核型分析共检出3例染色体核型异常标本(47,XX+21;45,X;47,XY+18),检出率为10％(3/30);(2)CMA共检出7例异常,检出率为23.3％(7/30),2例胎儿检测出22q.11.2微缺失(6.7％),2胎例儿检出其他具有临床意义的拷贝数变异(6p21.3微缺失9q31.2微缺失).CMA检测技术对RAA胎儿染色体异常的检出率比传统染色体核型分析检出率提高了13.3％,差异无统计学意义(χ2=1.92,P=0.166);(3)24例孤立性RAA检出拷贝数变异3例(12.5％);6例非孤立性RAA胎儿检出拷贝数异常4例(66.7％).非孤立性RAA的致病性CNVs 率高于孤立性RAA,差异有统计学意义(P=0.016).结论 CMA可以检测传统染色体核型分析无法检测的染色体异常,当产前超声提示胎儿RAA时,强烈建议进行胎儿核型分析和基因检测,该技术的临床应用对产前咨询以及产后风险评估有重要意义.【期刊名称】《实用医学杂志》【年(卷),期】2019(035)008【总页数】4页(P1278-1281)【关键词】产前诊断;胎儿;右位主动脉弓;染色体微阵列分析技术;拷贝数变异【作者】郭珍;章春泉;阳彦;周欣;戴琳;肖晓娟;李欢【作者单位】江西省妇幼保健院南昌330006;南昌大学第二附属医院南昌330000;江西省妇幼保健院南昌330006;江西省妇幼保健院南昌330006;江西省妇幼保健院南昌330006;江西省妇幼保健院南昌330006;江西省妇幼保健院南昌330006【正文语种】中文右位主动脉弓（right aortic arch，RAA）是胎儿主动脉弓异常中最常见的一种类型，指主动脉弓位于气管、食管的右侧，是胚胎时期配对主动脉弓异常退化形成的，占总妊娠的0.1%［1］，占先天性心脏病的约1%～3%［2］。
染色体微阵列分析技术在2600例流产物中的应用
染色体微阵列分析技术在2600例流产物中的应用彭继苹;袁海明【摘要】染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)是一种通过对染色体进行全基因组扫描来筛查染色体数目和结构异常的检测技术,是儿科和产前遗传诊断的常规工具,已被应用于流产病因分析.本研究应用CMA技术在全基因组水平分析引起流产的染色体异常情况,并评估该技术在临床流产中的应用价值.对收集的2600例流产样本进行CMA技术检测,成功检测了2505例,成功率高达96.3％,其中1021例用CytoScan Optima芯片进行检测,1211例用CytoScan 750K芯片进行检测,273例用CytoScan HD芯片进行检测.利用这3种芯片共检出967例(38.60％)样本发生染色体异常,其中通过CytoScan Optima芯片检出506例(50.00％),CytoScan 750K芯片检出388例(32.00％),CytoScan HD芯片检出73例(26.74％).在967例染色体异常中,有801例(82.83％)发生染色体数目异常,94例(9.72％)发生染色体结构异常,56例(5.79％)发生嵌合体,16例(1.65％)检出纯合区域.本研究结果表明,CMA可应用于临床流产物的遗传学诊断,是一种可靠、稳定、高分辨的技术,其检测结果能够对再生育风险评估提供指导.【期刊名称】《遗传》【年(卷),期】2018(040)009【总页数】10页(P779-788)【关键词】流产;染色体微阵列分析;染色体数目异常;染色体结构异常;嵌合体;染色体纯合区域【作者】彭继苹;袁海明【作者单位】北京金域医学检验实验室有限公司,北京 100010;广州金域医学检验中心有限公司,广州 510330【正文语种】中文自然流产是指妊娠不到28周、胎儿体重不足1000 g、胎儿及其附属物脱离母体而妊娠自行终止者。
妊娠12周之内终止者称为早期流产，临床上自然流产多表现为胎儿发育的停止。
染色体微阵列技术在产后遗传病诊断的应用
基因芯片结果 chr17p11.2 3.6Mb缺失
诊断：Smith-Magenis Syndrome 临床表现：发育迟缓，轻度到中度智力低下，语言发育迟缓，特殊 面容，行为异常
病例2
女 1岁 癫痫反复发作 精神运动发育迟缓
基因芯片结果： 2q24.3 SCN1A、SCN2A和SCN3A基因缺失 CNV大小：1.3Mb
遗传病的诊断
➢ 核型分析Karyotyping ➢荧光原位杂交 Fluorescence In Situ Hybridization (FISH)
❖ Locus-specific FISH ❖ Chromosome genome painting ➢PCR, Southern, Northern blots, etc. ➢DNA 测序技术 ❖ First-generation-Sanger method ❖ Novel sequencing techniques ➢ CMA芯片技术
探 针又会面临准确性下降的问题。 ➢ 对植入前胚胎的检测，缺乏覆盖全基因组检测的能力
CMA技术
优势
全基因组范围内同时检测染色体数目异常和结构异常如微缺失（deletion ） 和微重复（duplication）并能较准确的测定其大小，并精确定位。 不需要细胞培养，可直接检测血液、羊水(amniotic fluid, AF)和绒毛膜绒 毛(chorionic villus sampling, CVS) 样本，出报告速度更快，结果更加准确 可靠。
传统核型分析技术
是目前较为成熟的遗传性疾病诊断技 术
染色体数量变化、平衡、不平衡易位、转位和显微镜下 可见的大片段缺失和重复。
绒毛活检取材
孕中期羊膜腔穿刺羊水 细胞培养
染色体核型分析
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染色体微阵列分析
染色体微阵列分析是一种常用的遗传学检测方法，用于检测染色体序列的变异和异常。
它可以帮助医生和研究人员了解遗传疾病的发生机制，并为病人提供个性化的诊断和治疗方案。
本文将介绍染色体微阵列分析的原理、应用和潜在的风险。
染色体微阵列分析的原理是基于DNA微阵列技术，它可以同时检测数千个基因的表达量和染色体上的拷贝数变异。
在染色体微阵列分析中，首先需提取被检测者的DNA样本，然后将其转化为标记有荧光物质的cRNA（互补RNA）。
接下来，将cRNA与染色体上的DNA序列片段进行杂交反应。
最后，使用显微镜观察染色体上的荧光信号，以确定基因的表达量和染色体的结构变异。
染色体微阵列分析在临床应用中有着广泛的应用。
首先，它可以用于检测染色体异常，如染色体缺失、重复和倒位等。
这些异常往往与遗传疾病的发生密切相关，通过染色体微阵列分析可以及早发现这些异常，从而指导临床诊断和治疗。
其次，染色体微阵列分析可以用于评估肿瘤患者的染色体变异情况，以指导治疗方案的制定和预后的判断。
此外，它还可以用于检测染色体序列的失衡情况，如染色体局部缺失和重复，这对研究人员来说是非常有价值的。
然而，染色体微阵列分析也存在一定的风险。
首先，该技术需要高度专业的实验操作和数据解读能力，否则可能会导致错误结果的产生。
其次，因为染色体微阵列分析是通过检测基因的表达量和染色体序列的拷贝数来判断异常的，所以它可能无法检测一些基因变异，如染色体点突变和基因结构变异。
此外，染色体微阵列分析也存在着一定的伦理和隐私问题，因为它可以揭示被检测者的遗传信息，可能对个人和家庭产生潜在的影响。
因此，在进行染色体微阵列分析之前，需要对潜在的风险和益处进行综合评估，并充分考虑被检测者和家族的意愿。
同时，也需要进行必要的知情同意和隐私保护措施，以确保被检测者的权益和数据的
安全。
综上所述，染色体微阵列分析是一种常用的遗传学检测方法，具有广泛的临床应用前景。
它可以帮助医生了解疾病的发生机制，并为病人提供个性化的诊断和治疗方案。
然而，染色体微阵列分析也存在一定的风险和限制，需要在专业和伦理的指导下进行应用。
未来，随着技术的不断进步和应用的推广，染色体微阵列分析有望为遗传疾病的预防和治疗提供更加有效的手段。