大肠杆菌_半乳糖苷酶ED和EA的克隆_表达及活性测定
大肠杆菌的原核表达实验过程结果

大肠杆菌的原核表达实验过程结果
大肠杆菌的原核表达实验一般分为以下几个步骤:
1. 构建表达载体:将待表达的基因克隆到适当的表达载体上,如常用的pET、pGEX等载体中。
2. 转化大肠杆菌:将表达载体转化到大肠杆菌细胞中。
可以通过化学方法、电转化、冷冻复苏、热激转化等方法进行。
3. 诱导表达:在大肠杆菌细胞进行生长至适当时期后,添加适宜浓度的诱导剂,如IPTG等,诱导待表达基因蛋白的合成。
4. 细胞收获和破碎:诱导一定时间后,收获大肠杆菌细胞并进行破碎,以获得待表达蛋白。
5. 蛋白提取:对细胞破碎物进行离心、超滤等步骤,去除残余细胞构成和杂质,得到含有待表达蛋白的上清液。
6. 纯化和分析:将上清液进行分离、纯化、鉴定,以确定表达蛋白相应的分子量、酶活性等。
在以上步骤中,实验者需要进行质控和评估,确认实验步骤是否正确和表达蛋白是否达到预期,以确保实验结果的可靠性和准确性。
大肠杆菌K88ac菌毛操纵子fae全基因的克隆、表达及生物学活性初步研究

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系 黏 附 和 黏 附 抑制 实验 结 果 表 明重 组 E P茵和 野 生菌 株 一 样 具 有 较 强 的黏 附猪 小肠 上 皮 细 胞 系 的 能 力 , 且 提 纯 重 组 茵 毛 而
制 备 出的 鼠 抗血 清 能有 效 抑 制 上 述 重 组 茵或 野 生 菌株 对 猪 小 肠 上 皮 细 胞 系 的 黏 附 结合 。
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[ 键 词 】 肠产 毒性 大 肠 杆 菌 ; 8 关 K 8茵 毛 i 结 构 基 因 ; 隆 ; 达 ; 物 活性 克 表 生
大肠杆菌的检测:大肠菌群测定的操作细则(中英文对照版)

大肠杆菌的检测:大肠菌群测定的操作细则大肠菌群系指一群能发酵乳糖、产酸产气、需氧和兼性厌氧的革兰氏阴性无芽胞杆菌。
该菌主要来于人畜粪便,故以此作为粪便污染指标来评价食品的卫生质量,推断食品中有否污染肠道致病菌的可能。
食品中大肠菌群数系以100mL(g)检样内大肠菌群最可能数(MPN)表示。
1 设备和材料1.1 温箱:36±1℃。
1.2 冰箱:0~4℃。
1.3 恒温水浴:44.5±0.5℃。
1.4 天平。
1.5 显微镜。
1.6 均质器或乳钵。
1.7 平皿:直径为90mm。
1.8 试管。
1.9 吸管。
1.10 广口瓶或三角烧瓶:容量为500mL。
1.11 玻璃珠:直径约5mm。
1.12 载玻片。
1.13 酒精灯。
1.14 试管架。
2 培养基和试剂2.1 乳糖胆盐发酵管:按GB 4789.28中4.9规定。
2.2 伊红美蓝琼脂平板:按GB 4789.28中4.25规定。
2.3 乳糖发酵管:按GB 4789.28中4.10规定。
2.4 EC 肉汤:按GB 4789.28中4.11规定。
2.5 磷酸盐缓冲稀释液:按GB 4789.28中3.22规定。
2.6 生理盐水。
2.7 革兰氏染色液:按GB 4789.28中2.2规定。
3.1 检样稀释3.1.1 以无菌操作将检样25mL(或g)放于有225mL灭菌生理盐水或其他稀释液的灭菌玻璃瓶内(瓶内予置适当数量的玻璃珠)或灭菌乳钵内,经充分振摇或研磨做成1:10的均匀稀释液。
固体检样最好用均质器,以8 000-10 000 r/min的速度处理1min,做成1:10的均匀稀释液。
3.1.2 用1mL灭菌吸管吸取1:10稀释液1mL,注入含有9mL灭菌生理盐水或其他稀释液的试管内,振摇试管混匀,做成1:100的稀释液。
3.1.3 另取1mL灭菌吸管,按上条操作依次做10倍递增稀释液,每递增稀释一次,换用1支1mL灭菌吸管。
3.1.4 根据食品卫生标准要求或对检样污染情况的估计,选择三个稀释度,每个稀释度,接种3管。
β-半乳糖苷酶(LACZ)酶活测定

β-半乳糖苷酶(LACZ)酶活测定警示:在我们的手册中介绍的实验可能具有潜在的危险性,要求操作人员具有相当的安全训练、特殊装备、以及相关安全部门的监督。
作为实验操作员的你承担全部的责任、义务和由于实施安全步骤和措施带来的危险。
麻省理工大学没有责任、义务或承担由于实施本材料中内容所引起的危险。
法律声明β-半乳糖苷酶(LAC Z)酶活测定1. 在冰上解冻样品,同时准备裂解液(见下面关于裂解液样品的收集和准备的注意事项)。
2. 准备若干(至少每个样品3个和空白一支)透明的塑料比色皿,每支装有500μl的碳酸钠终止液。
你可以在比色皿上标明测试样品的名称和使用的时间。
3. 在微量离心试管中加入如下试剂:400μl 磷酸钠盐缓冲液(pH 7.5)133μl ONPG溶液6μl 镁离子溶液4. 把反应混合物放置在37°C的水浴中或者加热垫上预温育。
5. 一旦预热后,加入如下物质:60μl 细胞萃取物比较明智的做法是同时做阴性对照,即用抽提物或不表达β-半乳糖苷酶的细胞抽提物代替前述的细胞抽提物。
6. 留心观察每个反应试管里黄色(o-硝基酚)的出现,在适当的时间点,从每种反应混合物中等量移取100μl的溶液,把它加到装有碳酸钠终止液的比色皿中。
7. 当完成所有时间点测定后,在420 nm处测光密度,记录吸光值,并且计算吸光值与时间的斜率。
斜率和β-半乳糖苷酶的活性成正比。
注意:若在420nm处吸光值高于1.0,则不能采信。
8. 在计算其实际活性时,先制作o-硝基酚标准曲线图,然后根据样品的吸光值在曲线上找出对应的浓度。
一个酶活力单位是指酶在37oC每分钟可催化产生1 μmol的o-硝基酚。
收集和裂解细胞的注意事项细胞培养物的收集1. 在适当的培养时间,取出1.6 ml的培养物放入微量离心管中,并把它置于冰上。
2. 迅速将1.6 ml样品在涡旋混匀器上振荡,然后移出100μl放入已装有900 μL新鲜培养基的比色皿中。
凝结芽孢杆菌中β-半乳糖苷酶基因的克隆及表达

第39卷㊀第6期2015年11月南京林业大学学报(自然科学版)JournalofNanjingForestryUniversity(NaturalSciencesEdition)Vol.39,No.6Nov.,2015doi:10.3969/j.issn.1000-2006.2015.06.007㊀收稿日期:2015-03-25㊀㊀㊀㊀修回日期:2015-08-25㊀基金项目:国家自然科学基金青年基金项目(31300487,31200443);江苏省自然科学基金青年项目(BK20130970);江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)㊀第一作者:郑兆娟,讲师,博士㊂∗通信作者:欧阳嘉,教授㊂E⁃mail:hgouyj@njfu.edu.cn㊂㊀引文格式:郑兆娟,徐颖,石磊,等.凝结芽孢杆菌中β-半乳糖苷酶基因的克隆及表达[J].南京林业大学学报:自然科学版,2015,39(6):35-39.凝结芽孢杆菌中β-半乳糖苷酶基因的克隆及表达郑兆娟,徐㊀颖,石㊀磊,欧阳嘉∗(南京林业大学化学工程学院,江苏省生物质绿色燃料与化学品重点实验室,江苏㊀南京㊀210037)摘要:从1株快速水解乳糖发酵产酸的凝结芽孢杆菌NL01的基因组上克隆获得了1个新的β-半乳糖苷酶基因,该基因长度为1998bp,其编码的氨基酸序列与已经报道的β-半乳糖苷酶相似度低于40%㊂将该β-半乳糖苷酶基因整合到表达载体pETDuet-1上,并在大肠杆菌BL21(DE3)中进行重组表达,β-半乳糖苷酶粗酶酶活为119 0μmol/(min㊃mg),经镍柱纯化获得的重组β-半乳糖苷酶酶活为666 4μmol/(min㊃mg)㊂利用该重组β-半乳糖苷酶水解乳糖,经TLC和HPLC分析显示该酶具有将乳糖水解为葡萄糖和半乳糖的活力,是一种新型的β-半乳糖苷酶㊂关键词:凝结芽孢杆菌;β-半乳糖苷酶;表达纯化;乳糖水解中图分类号:Q815;TQ93㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀文献标志码:A文章编号:1000-2006(2015)06-0035-05Molecularcloningandexpressionofanovelβ-galactosidasefromBacilluscoagulansZHENGZhaojuan,XUYing,SHILei,OUYANGJia∗(CollegeofChemicalEngineering,NanjingForestryUniversity,JiangsuKeyLabofBiomass-BasedGreenFuelsandChemicals,Nanjing210037,China)Abstract:Anovelβ-galactosidasegenewasclonedfromBacilluscoagulansNL01whichhadabilitytohydrolyzelactoseintoglucoseandgalactoseinthisstudy.Thelengthoftheβ-galactosidasegenewas1998bp,anditscodingsequenceshowedverylowidentitywithotherreportedβ-galactosidase.ThegenewasclonedintopETDuet-1andexpressedinEscherichiacoliBL21(DE3).Thecrudeenzymeactivitywas119.0μmol/(min㊃mg),andthepurifiedenzymeactivitywas666.4μmol/(min㊃mg)afterNi-NTApurification.Itwasindicatedfromtheanalysisresultsofthehydrolysisprod⁃uctobtainedbythepurifiedβ-galactosidasethatthisnovelβ-galactosidasepresentedhighactivitytowardlactosecon⁃versionintoglucoseandgalactose.Keywords:Bacilluscoagulans;β-galactosidase;expressionandpurification;lactosehydrolysis㊀㊀β-半乳糖苷酶(EC3.2.1.238),学名为β-D-半乳糖苷半乳糖水解酶,常用名为乳糖酶,广泛存在于微生物㊁植物及哺乳动物的肠道中,能水解乳糖中的β-1,4-糖苷键,使其生成葡萄糖和半乳糖[1-3]㊂β-半乳糖苷酶广泛应用于乳制品行业,在液态奶类和乳制品加工过程中,加入β-半乳糖苷酶,使其消化为葡萄糖和半乳糖,相应的产品被称作低乳糖液态奶和低乳糖乳制品㊂低乳糖奶不仅可以满足正常消费者的需要,更可以满足乳糖不耐症者和先天性β-半乳糖苷酶缺乏者对乳制品中营养充分吸收的需要㊂β-半乳糖苷酶来源广泛,目前已经商品化的β-半乳糖苷酶主要来源于微生物,包括大肠杆菌(Escherichiacoli)㊁黑曲霉(Aspergillusniger)㊁米曲霉(Aspergillusoryzae)㊁克鲁维酵母(Kluyveromyces)㊁脆壁酵母(Saccharomycesfragilis)等[4],这些微生物的最适生长温度在30ħ左右,其活性大多由常温β-半乳糖苷酶表征㊂目前市场上耐热β-半乳糖苷酶产品较少,耐热的β-半乳糖苷酶不仅能够有效降低生产工艺中微生物污染的风险,也能够提高反应速度,在乳品生产工艺中有显著优势,因此研究者们将对β-半乳糖苷酶的来源研究转向高温微生物[3,5]㊂凝结芽孢杆菌(Ba⁃cilluscoagulans)是经美国FDA批准的一种 普遍南京林业大学学报(自然科学版)第39卷认为安全(GenerallyRecognizedasSafe) 的乳酸菌,其最适生长温度在50 55ħ[6-8]㊂乳糖发酵实验表明,凝结芽孢杆菌具有快速水解乳糖发酵产酸的特性,但目前还没有来自凝结芽孢杆菌的β-半乳糖苷酶基因被克隆表达的报道㊂笔者参照Gen⁃Bank中凝结芽孢杆菌基因组上假定的β-半乳糖苷酶基因信息,设计引物,通过PCR技术从江苏省生物质绿色燃料与化学品重点实验室保存的1株能以乳糖为唯一碳源的凝结芽孢杆菌NL01中克隆获得了β-半乳糖苷酶基因,构建到原核表达载体pETDuet-1上,在大肠杆菌表达宿主中高效诱导表达,并对重组蛋白的乳糖水解和转糖基活性进行了进一步的分析㊂1㊀材料与方法1.1㊀供试材料基因来源菌株B.coagulansNL01㊁克隆宿主菌E.coliMach1-T1㊁表达宿主菌E.coliBL21(DE3)由江苏省生物质绿色燃料与化学品重点实验室保存㊂克隆载体pEASY-Blunt㊁PFUDNA聚合酶购自北京全式金生物技术有限公司;表达载体pETDuet-1购自Novagen公司;限制性内切酶㊁T4DNA连接酶购自Fermentas公司;胰蛋白胨㊁酵母浸粉购自Oxoid公司;基因组提取试剂盒㊁质粒提取试剂盒和DNA胶回收试剂盒购自上海捷瑞生物工程有限公司;乳糖㊁葡萄糖㊁半乳糖和邻硝基苯β-D-半乳吡喃糖苷(oNPG)购自Sigma公司;其他生化试剂为进口产品或国产分析纯产品㊂1.2㊀引物设计参考GenBank中已完成全基因组注释的凝结芽孢杆菌36D1(GenBank登录号:NC_016023.1)和2-6(GenBank登录号:NC_015634.1)的全基因组DNA序列,应用Oligo6引物设计软件设计上下游引物,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成㊂上游引物:5ᶄ-GAATTCGATGTTAAAAAAA⁃CAAGAAAAATTTTATTATG-3ᶄ(斜体表示EcoRI酶切位点,下划线部分表示起始密码子)㊂下游引物:5ᶄ-GTCGACCTATTTTTCAATTACCTGCAAAATTTTCA-3ᶄ(斜体表示SalI酶切位点,下划线部分表示终止密码子)㊂1.3㊀培养基及培养条件LB培养基包含胰蛋白胨10g/L,NaCl10g/L,酵母浸粉5g/L㊂必要时添加终质量浓度为100μg/mL的氨苄青霉素,在37ħ㊁200r/min条件下振荡培养㊂凝结芽孢杆菌液体培养基为葡萄糖20g/L,酵母浸粉10g/L,在50ħ㊁100r/min条件下振荡培养㊂1.4㊀目的基因PCR扩增、克隆及测序将培养至对数中期的凝结芽孢杆菌NL01离心收集菌体,利用基因组提取试剂盒提取其全基因组,作为PCR反应的模板㊂PCR扩增体系为:5ˑBuffer20μL㊁dNTPs10μL㊁上下游引物各2μL㊁模板DNA0.5μL㊁PFUDNA聚合酶2μL,用去离子水补充至总体积为100μL㊂PCR反应条件为:预变性95ħ2min;变性95ħ20s㊁退火60ħ20s㊁72ħ1min,35个循环;72ħ延伸10min㊂扩增产物经1%琼脂糖凝结电泳鉴定后,连接至pEASY-Blunt载体,转化E.coliMach1-T1,在抗生素平板上挑选阳性克隆并提取重组质粒㊂将重组质粒命名为Blunt-gal,经双酶切验证后送上海华大基因科技有限公司测序㊂1.5㊀重组β-半乳糖苷酶的表达与纯化利用限制性内切酶EcoRI和SalI同时双酶切重组质粒Blunt-gal和表达载体pETDuet-1,利用T4DNA连接酶连接后转化E.coliBL21(DE3),在抗生素平板上挑选阳性克隆并提取重组质粒进行双酶切验证,将验证正确的重组菌株命名为E.coliBL21(pETDuet-gal)㊂培养E.coliBL21(pET⁃Duet-gal)至OD600nm值达到0.6时加入IPTG诱导表达剂,继续培养5h㊂收集诱导表达的菌体,用生理盐水洗涤后重悬于结合缓冲液(20mmol/L磷酸钠㊁500mmol/L氯化钠㊁20mmol/L咪唑,pH7.4)中,在冰水浴中用超声波破碎菌体,将破碎后的菌体离心,所得上清即为粗酶液㊂粗酶液通过Ni2+亲和柱进行纯化,用不同梯度的洗脱缓冲液(20mmol/L磷酸钠㊁500mmol/L氯化钠㊁500mmol/L咪唑,pH7 4)洗脱,收集目的蛋白组分,SDS-PAGE检测纯化效果㊂1.6㊀酶活及酶解产物分析方法1)β-半乳糖苷酶酶活测定方法:反应体系总体积为1mL,依次加入700μL去离子水,100μL500mmol/LpH7.0的磷酸钾缓冲液,100μL20mmol/L的oNPG,先37ħ水浴5min后,再加入100μL经适当稀释的酶液,混匀后37ħ温水浴10min,立即加入2mL0.5mol/L的Na2CO3终止反应㊂用分光光度计测量410nm处的吸光值,由测得的吸光值根据oNPG标准曲线确定oNPG的生成量,定义1min水解生成1μmoloNPG所需酶量为1个活力单位[9]㊂采用Brandford法以牛血清蛋63㊀第6期郑兆娟,等:凝结芽孢杆菌中β-半乳糖苷酶基因的克隆及表达白作为标准品测定蛋白浓度[10]㊂2)TLC法分析酶解产物:将反应混合物点样于硅胶薄板,用正丁醇㊁乙醇㊁水以体积比为5ʒ3ʒ2作为展层剂,置于层析缸中展开㊂配置0.5%(w/v)的3,5-二羟基甲苯溶于20%的浓硫酸中作为显色剂,105ħ加热10min显色[11]㊂3)HPLC法分析酶解产物:采用Agilent1200型高效液相色谱仪,AminexHPX-87液相色谱柱,以5mmol/L硫酸为流动相,流速为0.6mL/min,柱温55ħ,示差折光检测㊂2㊀结果与分析2.1㊀β-半乳糖苷酶基因的PCR扩增、克隆与测序结果㊀㊀提取凝结芽孢杆菌NL01的基因组DNA,经琼脂糖凝胶电泳检测显示其条带单一,基因组没有降解,可以作为后续PCR实验的模板㊂以凝结芽孢杆菌NL01基因组DNA为模板,PCR扩增得到β-半乳糖苷酶全基因,约2000bp㊂将该扩增条带连接至pEASY-Blunt后转化E.coliMach1-T1,从抗性筛选平板上选取6个转化子,进一步提取重组质粒Blunt-gal并双酶切(EcoRI和SalI)验证,结果如图1所示,其中5号转化子在3900bp和2000bp附近出现条带,说明此转化子含有正确质粒,送样测定核苷酸序列㊂图1㊀重组质粒Blunt-gal的双酶切验证Fig.1㊀IdentificationoftherecombinantplasmidBlunt⁃galbydigestion㊀㊀注:泳道1 6的重组质粒来自6个不同转化子㊂Note:Theplasmidsforlane1to6arefromsixdifferentrecombi⁃nantstrains.2.2㊀β-半乳糖苷酶序列分析来源于凝结芽孢杆菌NL01的β-半乳糖苷酶基因序列全长1998bp,GenBank,登录号为KM216751,编码665个氨基酸,分子质量为76ku,等电点为6.1㊂根据Henrissat建立的糖苷水解酶家族分类方法,β-半乳糖苷酶分属于糖苷水解酶家族GH-1㊁GH-2㊁GH-35和GH-42(www.cazy.org)[12-13]㊂目前已经分离纯化鉴定的β-半乳糖苷酶多来源于GH-2和GH-35家族[1-3,14-19],该研究中的β-半乳糖苷酶属于GH-42家族㊂由氨基酸序列的同源性比对发现,该蛋白与目前已经报道的微生物来源的β-半乳糖苷酶(例如来源于Lac⁃tobacillusbulgaricusATCC11842(GenBank登录号为WP_003619632)[14]㊁EnterobactercloacaeB5(GenBank登录号为ABB73039)[15]㊁Penicilliumex⁃pansumF3(GenBank登录号为ACD75821)[16]㊁Ba⁃cillusmegaterium2-37-4-1(GenBank登录号为ABN13675)[17]和两种土壤未培养微生物(GenBank登录号为ADD69785和AFD21844)[18-19])的相似性都低于40%;与凝结芽孢杆菌36D1和2-6基因组上注释的假定β-半乳糖苷酶同源性均大于90%㊂同源性比对数据说明此次研究中来源于凝结芽孢杆菌NL01中的β-半乳糖苷酶是一个新型的β-半乳糖苷酶,该酶在不同凝结芽孢杆菌菌株中普遍存在㊂2.3㊀重组表达质粒pETDuet-gal的构建选择具有强启动子的pETDuet-1为表达载体,构建重组表达质粒pETDuet-gal㊂用EcoRI和SalI同时双酶切pETDuet-1和Blunt-gal,回收相应片段后连接并转化E.coliBL21(DE3),从抗性筛选平板上选取5个转化子,进一步提取重组质粒pETDuet-gal并双酶切(EcoRI和SalI)验证,结果如图2所示,其中4号和5号转化子在5400bp和2000bp附近出现条带,说明此转化子含有正确质粒㊂图2㊀重组质粒pETDuet-gal的双酶切验证Fig.2㊀IdentificationoftherecombinantplasmidpETDuet-galbydigestion㊀㊀注:泳道1 5的重组质粒来自于5个不同转化子㊂Note:Theplasmidsforlane1to5arefromfivedifferentrecom⁃binantstrains.73南京林业大学学报(自然科学版)第39卷2.4㊀重组β-半乳糖苷酶的诱导与纯化结果重组目的蛋白的N端具有His标签,便于融合蛋白纯化㊂将诱导表达的重组菌E.coliBL21(pETDuet-gal)经超声波破碎后,利用镍柱对重组β-半乳糖苷酶进行纯化,结果如图3所示㊂由图3可知,诱导蛋白分子质量约为70ku,与目的蛋白大小相符㊂粗酶比酶活为119.0μmol/(min㊃mg),纯酶比酶活为666.4μmol/(min㊃mg),纯化倍数为5.6倍㊂图3㊀重组β-半乳糖苷酶的SDS-PAGE分析Fig.3㊀SDS-PAGEanalysisofrecombinantβ-galactosidase㊀㊀注:泳道M为标准蛋白分子质量,ku;泳道1为含有质粒pETDuet-1的重组大肠杆菌诱导后的破碎液;泳道2为含有质粒pETDuet-gal的重组大肠杆菌诱导后的破碎液;泳道3为纯化的重组β-半乳糖苷酶㊂Note:M.proteinmarker;lane1.cell-freeextractofBL21(DE3)harboringpETDuet-1;lane2.cell-freeextractofBL21(DE3)harboringpETDuet-gal;lane3.purifiedβ-galactosidase.2.5㊀重组β-半乳糖苷酶水解产物的TLC和HPLC法分析㊀㊀用50mmol/L㊁pH6.0的磷酸氢二钾-磷酸二氢钾缓冲液配置20g/L的乳糖溶液,加入5μmol/(min㊃g)的β-半乳糖苷酶,55ħ下反应60min后,沸水浴加热使其停止反应,对水解液产物进行TLC分析,结果见图4㊂从图4可以看出,样品中的乳糖完全被降解为葡萄糖和半乳糖㊂同时,以40g/L的乳糖为底物,加入过量β-半乳糖苷酶酶液在50ħ下反应,2h后以HLPC检测反应结果,HPLC结果显示乳糖剩余量为0.7g/L,葡萄糖和半乳糖的生成量分别为19 7g/L和19 5g/L㊂TLC和HPLC数据都说明该研究中被克隆的基因确为β-半乳糖苷酶基因㊂β-半乳糖苷酶具有两种活性,即水解活性和转糖基活性,不同来源的β-半乳糖苷酶的这两种活性差异较大㊂水解活性高的β-半乳糖苷酶主要用于水解牛奶等乳制品中的乳糖,而转糖基活性高图4㊀酶水解乳糖产物的TLC图Fig.4㊀TLCprofilesofthehydrolysisproductsoflactose㊀㊀注:泳道1 3分别为乳糖㊁半乳糖㊁葡萄糖标准品;泳道4为乳糖水解后样品㊂Note:lane1.standardlactose;lane2.standardgalactose;lane3.standardglucose;lane4.sampleoflactoseafterhydrolysis.的β-半乳糖苷酶主要用于低聚半乳糖的合成㊂例如,陆文伟等[20]分析了来自于发酵乳杆菌的β-半乳糖苷酶,其TLC结果除了检测到半乳糖和葡萄糖外,还检测到了相应的低聚半乳糖,在不同条件下该酶都具有较强的转糖基活性㊂Nguyen等[14]克隆了来自保加利亚乳杆菌DSM20081的β-半乳糖苷酶基因并在植物乳杆菌中进行表达分析,其水解和转糖基实验表明该酶也是以转糖基活性为主㊂与上述β-半乳糖苷酶相比,该研究中来源于凝结芽孢杆菌的β-半乳糖苷酶以水解活性为主,同时考虑其耐高温的特性,该酶在乳品生产工艺中具有显著优势㊂3㊀结㊀论1)从凝结芽孢杆菌NL01基因组DNA上扩增得到β-半乳糖苷酶基因,长1998bp㊂该β-半乳糖苷酶属于糖苷水解酶GH-42家族,与已经报道的其他微生物来源的β-半乳糖苷酶相似性低于40%㊂2)以大肠杆菌为表达宿主,利用表达质粒pETDuet-1成功异源表达了具有生物活性的β-半乳糖苷酶,并利用镍柱纯化获得电泳纯的重组蛋白,纯酶比酶活为666.4μmol/(min㊃mg)㊂参考文献(References):[1]MlichovaZ,RosenbergM.Currenttrendsofβ-galactosidaseap⁃plicationinfoodtechnology[J].JournalofFoodandNutritionResearch,2006,45(2):47-54.[2]ParkAR,OhDK.Galacto⁃oligosaccharideproductionusingmi⁃crobialβ-galactosidase:currentstateandperspectives[J].Ap⁃83㊀第6期郑兆娟,等:凝结芽孢杆菌中β-半乳糖苷酶基因的克隆及表达pliedMicrobiologyandBiotechnology,2010,85(5):1279-1286.[3]AnsariSA,SatarR.Recombinantβ-galactosidases⁃Past,presentandfuture:Aminireview[J].JournalofMolecularCa⁃talysisB:Enzymatic,2012,81:1-6.[4]PanesarPS,PanesarR,SinghRS,etal.Microbialproduction,immobilizationandapplicationsofβ-D⁃galactosidase[J].JournalofChemicalTechnologyandBiotechnology,2006,81(4):530-543.[5]董艺凝,陈海琴,刘小鸣,等.耐热β-半乳糖苷酶的研究进展[J].食品工业科技,2012,33(1):384-387.DongYN,ChenHQ,LiuXM,etal.Researchprogressinthermostableβ-galactosidases[J].ScienceandTechnologyofFoodIndustry,2012,33(1):384-387.[6]OuyangJ,MaR,ZhengZJ,etal.OpenfermentativeproductionofL-lacticacidbyBacillussp.strainNL01usinglignocellulosichydrolyzatesaslow⁃costrawmaterial[J].BioresourceTechnology,2013,135:475-480.[7]张刚.乳酸细菌-基础㊁技术和应用[M].北京:化学工业出版社,2007.ZhangG.Lacticacidbacteria⁃basic,technologyandapplication[M].Beijing:ChemicalIndustryPress,2007.[8]凌代文,东秀珠.乳酸细菌分类鉴定及实验方法[M].北京:中国轻工业出版社,1999.LingDW,DongXZ.Classificationandidentificationoflacticacidbacteriaandexperimentalmethod[M].Beijing:ChinaLightIndustryPress,1999.[9]SunXJ,DuanXG,WuD,etal.CharacterizationofSulfolobussolfataricusβ-galactosidasemutantF441YexpressedinPichiapastoris[J].JournaloftheScienceofFoodandAgriculture,2014,94:1359-1365.[10]BradfordMM.Arapidandsensitivemethodforthequantitationofmicrogramquantitiesofproteinutilizingtheprincipleofprotein⁃dyebinding[J].AnalyticalBiochemistry,1976,72:248-254.[11]LiZY,XiaoM,LuLL,etal.Productionofnon⁃monosaccharideandhigh⁃puritygalactooligosaccharidesbyimmo⁃bilizedenzymecatalysisandfermentationwithimmobilizedyeastcells[J].ProcessBiochemistry,2008,43(8):896-899.[12]HenrissatB,BairochA.Aclassificationofglycosylhydrolasesbasedonaminoacidsequencesimilarities[J].BiochemJ,1991,280:309-316.[13]HenrissatBairochA.Newfamiliesintheclassificationofglycosylhydrolasesbasedonaminoacidsequencesimilarities[J].Bio⁃chemicalJournal,1993,293:781-788.[14]NguyenTT,NguyenHA,ArreolaSL,etal.Homodimericβ-galactosidasefromLactobacillusdelbrueckiisubsp.bulgaricusDSM20081:expressioninLactobacillusplantarumandbiochemicalcharacterization[J].JournalofAgriculturalandFoodChemistry,2012,60(7):1713-1721.[15]LuLL,XiaoM,LiZY,etal.Anoveltransglycosylatingβ-gal⁃actosidasefromEnterobactercloacaeB5[J].ProcessBiochemistry,2009,44(2):232-236.[16]LiYM,LuLL,WangHM,etal.Cellsurfaceengineeringofaβ-galactosidaseforgalactooligosaccharidesynthesis[J].AppliedandEnvironmentMicrobiology,2009,75(18):5938-5942.[17]LiYM,WangHM,LuLL,etal.Purificationandcharacteriza⁃tionofanovelβ-galactosidasewithtransglycosylationactivityfromBacillusmegaterium2-37-4-1[J].AppliedBiochemistryandBiotechnology,2009,158(1):192-199.[18]WangK,LiG,YuSQ,etal.Anovelmetagenome⁃derivedβ-galactosidase:genecloning,overexpression,purificationandcharacterization[J].AppliedMicrobiologyandBiotechnology,2010,88(1):155-165.[19]ZhangX,LiH,LiCJ,etal.Metagenomicapproachfortheiso⁃lationofathermostableβ-galactosidasewithhightoleranceofga⁃lactoseandglucosefromsoilsamplesofTurpanBasin[J].BMCMicrobiology,2013,13:237.[20]陆文伟,孔文涛,孔健,等.发酵乳杆菌β-半乳糖苷酶转糖基活性研究[J].山东大学学报:理学版,2008,43(7):83-87.LuWW,KongWT,KongJ,etal.Transgalactosylationactivityofbeta⁃galactosidaseproducedbyLactobacillusfermentumK4[J].JournalofShandongUniversity:NaturalScience,2008,43(7):83-87.(责任编辑㊀刘昌来)93。
大肠埃希菌的检验原理

大肠埃希菌的检验原理
大肠埃希菌的检验原理主要是基于大肠埃希菌能够产生酶、产生特定代谢产物以及具有一定生理特征等方面进行检测。
1. 酶的检测:大肠埃希菌能够产生β-半乳糖苷酶和大肠埃希菌酶等酶。
常用方法是利用含有染色底物的培养基,如培养基中加入苔藓素和半乳糖时,大肠埃希菌能够分解底物产生酶,使底物变色。
这样可以通过颜色变化来判断培养基中是否存在大肠埃希菌。
2. 代谢产物的检测:大肠埃希菌在产酸过程中会产生大量的氢离子,降低培养基的pH值,可以使用酚红指示剂来检测pH值的变化。
另外,大肠埃希菌还会产生气体,如二氧化碳和氢气,在含有较少营养物质的培养基上可以形成气泡。
这些变化可以作为大肠埃希菌存在的判断依据。
3. 生理特征的检测:大肠埃希菌有一些特有的生理特征,如能够产生胆红素,对产酸、反应pH等均有一定特殊性。
对大肠埃希菌进行生理生化反应、鉴定和分析可以通过不同试剂和培养基来进行。
综合上述三个方面的检测方法,能够较准确地鉴定出是否存在大肠埃希菌。
当然,最常用的方法是利用尿液或食物中的大肠埃希菌进行培养,并在培养基上观察酶活性、产酸、产气等特征变化。
酶底物法(科立得)检测总大肠菌和大肠埃希 菌(或粪大肠菌)技术参数
酶底物法(科立得)检测总大肠菌群和粪大肠杆菌(或大肠埃希菌)一、适用范围:用于水样中的总大肠菌群和粪大肠杆菌(或大肠埃希菌)的同步定量分析。
二、工作环境:(a)室内使用:环境温度 -10°C~50°C(b)电源供给:220V±10%,50HZ(c)相对湿度:25%~85%,无凝结三、原理:1,大肠菌群细菌能特异性产生β-半乳糖苷酶(β-D-galactosidase),该生物酶可以分解ONPG(Ortho-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside,β-半乳糖醛苷),使培养液呈黄色。
(注:检测粪大肠菌的培养温度为44.5°C;检测总大肠菌的培养温度为:36±1℃)2,大肠埃希氏菌能特异性产生β-葡萄糖醛酸酶(β-glucuronidase),分解MUG(4-甲基-伞形葡萄糖苷酸,4-methyl-umbelliferyl-β-D-glucuronide),使培养液在波长366nm紫外光下产生荧光。
利用该原理,来判断水样中是否含有大肠菌群及大肠埃希氏菌(或粪大肠菌)。
四、仪器技术参数:1、国产程控定量封口机# 技术指标性能(1)可靠性无漏液,无破孔(2)噪音 <50 dba @ 2 ft.(3)重量 <17公斤.(4)处理速度 <15秒/样品(5)预热时间 <15分钟(6)加热温度(内辊) 200°C +/- 10°C(7)外罩温度 <40°C(8)工作电压 220V±10%(9)工作环境温度 -10°C~50°C(10)带51孔及97孔定量盘橡胶托垫2、紫外灯(1)6W 365 nm长波紫外灯,含灯管.(2)尺寸:(9 cm x 7 cm x 27 cm)(3)电源:220V四、技术参数指标:(1)量程范围: 0-200个/100mL 或0-2419个/100mL(2)绝对检出限:0个(3)培养基:ONPG-MUG(4)样品体积: 100mL(5)检测周期: 24小时五、系统配置及性能指标:本配置能够简单快捷地同时测定水中总大肠菌群和粪大肠菌群(或大肠埃希菌);应包括所有能正常分析的仪器设备及消耗品:1 、消耗品:应能保证1000个水样常规检测所需的消耗品(1)DST酶底物法24小时Colilert试剂( ONPG-MUG培养基):200个/盒;(2)取样瓶:独立密封包装;(3)定量盘:51孔或97孔;2 、程控定量封口机(带51孔及97孔定量盘橡胶托垫);3 、6瓦特紫外灯,220v,366nm;。
β-半乳糖苷酶在枯草芽孢杆菌中的分泌表达
。枯草芽孢杆菌是一
种传统的酶制剂工业生产菌株, 其遗传背景清楚, 蛋白 分泌机制健全, 生长迅速, 培养简便, 其细胞壁结构简 单, 不分泌 内 毒 素, 可直接将表达产物分泌到培养基 中, 具有较 好 的 生 物 安 全 性, 是美国食品药物管理局 ( F D A ) 和中国农业部批准使用的安全菌株, 也是分泌
4 2 0 n m的 A值, 以A 值为纵坐标, 酶的活性单位为横坐 4 2 0 标, 采用 S P S S 1 0 软件绘制标准曲线。样品中酶活性测定
2 0 0 8 , 2 8 ( 5 )
陈晓月 等:β 半乳糖苷酶在枯草芽孢杆菌中的分泌表达 ?
1 1 3
2 . 2 β 半乳糖苷酶的表达和检测 ? 2 . 2 . 1 固体培养基中 β 半乳糖苷酶活性检测 阳性 ? g a l 的氯霉素琼脂 菌和阴性对照菌分别划线于含有 X ? 3 7 ℃避光培养 2 4h 后, 为充分显色, 将平板置 4 ℃ 平板, 避光放置过夜。取出培养板观察, 可见阳性重组菌的 菌落呈现明显的蓝色, 而阴性对照菌的菌落仍为乳白 色, 没有出现颜色变化( 图2 a , 2 b ) 。 2 . 2 . 2 液体培养基中 β 半乳糖苷酶的检测 液体培 ? 养基中, 每培养 2 h 取1 m l 细菌培养液, 1 2 0 0 0 r / m i n 离心, 分别收集上清和菌体沉淀, - 2 0 ℃保存备用。采用 β 半 ? 乳糖苷酶活性检测试剂盒分别检测培养液上清和菌体裂 解液在 4 2 0 n m的 A值, 根据标准曲线得出相应的酶的活 标注误表示( 表1 ) 。同时设立携 性。结果采用平均值 ± 带空载体 p G P S T的 A S 1 7 0 0 为阴性对照组( 图3 ) 。
DH5α大肠杆菌克隆菌株
产品信息:
货号
名称
产品形式
规格
储存
P1435
DH5α Strain
100μl
-20℃
基因型:
F-φ80 lac ZΔM15 Δ(lacZYA-arg F) U169 endA1 recA1 hsdR17(rk-,mk+) supE44λ- thi -1 gyrA96 relA1 phoA
基本信息:
抗性:无
培养基:LB
菌株类别:大肠杆菌克隆菌
培养条件:37℃,有氧,LB
质粒转化:42℃热激
保存方式:20%甘油,-20℃
基本应用:用于基因克隆
备注:
菌株简介:
DH5α菌株是实验室最常用的菌株。缺失核酸内切酶(endA),提高了质粒DNA的产量和质量;重组酶缺陷型(recA)减少插入片段的同源重组概率,保证了插入DNA的稳定性;DH5α在使用pUC系列质粒载体进行DNA转化时,由于载体DNA产生的LacZa多肽和DH5α编码的lacZ△M15相结合,从而显示β-半乳糖苷酶活性(α-互补性),使DH5α可用于蓝、白斑筛选。DH5α可以用于制作基因库、进行亚克隆,同时于DH5α具有deoR变异,可以作为较大质粒的宿主菌使用。DH5α菌株的缺点是生长缓慢,37℃需培12-14小时才能看见克隆。
β-半乳糖苷酶的诱导合成
2019/2/24
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在环境中没有乳糖或其他 - 半乳糖苷时, 大肠杆菌合成 -半乳糖苷酶量极少,加入乳糖 2-3 分钟后,细菌大量合成 - 半乳糖苷酶,其 量可提高千倍以上,在以乳糖作为唯一碳源时, 菌体内的 -半乳糖苷酶量可占到细菌总蛋白量 的3%。
在上述二阶段生长细菌利用乳糖再次繁殖前, 也能测出细菌中 -半乳糖苷酶活性显著增高的 过程。
在环境没有乳糖存在的情况下, R 形成分 子量为 152,000 的活性四聚体,能特异性与操 纵区o紧密结合,从而阻止利用乳糖的酶类基 因的转录,所以R是乳糖操纵子的阻遏蛋白;
2019/2/24 53
当环境中有足够的乳糖时,乳糖与R结合, 使R的空间构像变化,四聚体解聚成单体,失 去与操纵区特异性紧密结合的能力,从而解除 了阻遏蛋白的作用,使其后的基因得以转录合 成利用乳糖的酶类。
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虽然不同的启动子序列有所不同,但比较 已经研究过的上百种原核生物的启动子的序列, 发现有一些共同的规律,它们一般长 40-60bp, 含 A-T bp 较多,某些段落很相似的,有保守性, 称为共有性序列(consensus sequences)。 启动子一般可分为识别 (R , recognition) 、 结合 (B , binding) 和起始 (I , initiation) 三个 区段。
2. 操纵子的基本组成
乳糖操纵子模型已被许多研究实验所证 实,对其有了更深入的认识,并且发现其他 原核生物基因调控也有类似的操纵子组织, 操纵子是原核基因表达调控的一种重要的组 织形式,大肠杆菌的基因多数以操纵子的形 式组成基因表达调控的单元。
下面就以乳糖操纵子为例子说明操纵子 的最基本的组成元件(elements)。
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[文章编号] 16712587Ⅹ(2010)0120040205
[收稿日期] 2009210228[基金项目] 吉林省科技厅重点项目资助课题(2006041721,2008043521);吉林省长春市科技局计划项目资助课题(长科技合2008254号,08YJ37
)
[作者简介] 许淑芬(1963-),女,吉林省长春市人,副主任技师,主要从事免疫与分子生物学实验技术的研究。[通信作者] 谭 岩(Tel:0431285668196,E2mail:tanyan49@hotmail1com)
大肠杆菌β2半乳糖苷酶ED和EA的克隆、表达及活性测定许淑芬,刘 磊,孙牧男,赵 帅,方艳秋,谭 岩(吉林大学第一医院中心实验室,吉林长春130021)
[摘 要] 目的:制备大肠杆菌β2半乳糖苷酶(β2galactosidae)酶供体(ED)和酶受体(EA)片段,获得具有全酶活性的β2半乳糖苷酶。方法:以pSV2β2galactosidasecontrolvector为模板设计引物,用PCR方法获得ED和EA片段DNA序列,插入克隆载体pGEM2T2easy中,获得重组质粒,经酶切、PCR及测序鉴定正确后,将酶切目的片段分别插入原核表达载体pET20b
+
,并转化大肠杆菌BL21,通过IPTG诱导表达出ED、EA融合
蛋白,以亲和层析纯化蛋白,通过ED与EA蛋白形成β2半乳糖苷酶、全酶活性试验来判断ED、EA的功能。结果:获得与pSV2β2galactosidasecontrolvector一致的ED、EA碱基序列,构建了重组表达质粒pET20b2ED及pET20b2EA,并分别转化入大肠杆菌DE3,以IPTG诱导行SDS2PAGE电泳,在相对分子质量为14000及116000处分别可见ED蛋白和EA蛋白条带,应用镍凝胶亲和层析纯化获得目的蛋白。结论:成功地制备了ED、EA蛋白,形成全酶活性的β2半乳糖苷酶。[关键词] β2半乳糖苷酶;酶受体;酶供体;免疫测定[中图分类号] R69613;Q78 [文献标志码] A
Cloning,expressionandactivityassayofED/EAofβ2galactosidaseinE1coli
XUShu2fen,LIULei,SUNMu2nan,ZHAOShuai,FANGYan2qiu,TANYan(CentralLaboratory,FirstHospital,JilinUniversity,Changchun130021,China)
Abstract:Objective Toobtainrecombinantenzymedonor(ED)andenzymeacceptor(EA)fragmentsofβ2galactosidaseinE1coliandestablishnewclonedenzymedonorimmunoassays(CEDIA)forclinicaluse1
Methods TheencodingsequencesofEDandEAfragmentswereamplifiedwithpSV2β2galactosidasecontrolvectorastemplateandinsertedintopGEM2Teasyvector,thetargetgenewaschosenbydoubledigestion,PCRandsequencing,thenEDandEAfragmentswereinsertedintotheexpressionvectorpET20b+1Thecompetentcellsof
hoststrainofBL21weretransformedbytherecombinantplasmid.TheexpressionofthetargetproteinwasinducedwithIPTGandpurifiedbyNi2+2NTAagarosecolumn.Theβ2galactosidaewithactivityisformed.Results The
clonedfragmentsofEDandEAwere100%consistentwiththatofpSV2β2galactosidasecontrolvector.TheexpressionvectorpET20b2EDandpET20b2EAwereconstructedandexpressed.ThetargetproteinwaspurifiedbyNi2+2NTAagarosecolumn.Theexpressedfusion2proteinEDfragmentwas14000andEAfragmentwas116000in
SDS2PAGEasexpected.Conclusion EDandEAproteinsarepreparedsuccessfullyandβ2galactosidasewithactivityisformed.Keywords:β2galactosidase;enzymeacceptor;enzymedonor;immunoassay
04第36卷 第1期2010年1月吉 林 大 学 学 报 (医 学 版)JournalofJilinUniversity(MedicineEdition)Vol.36No.1 Jan.2010 美国学者[122]对β2半乳糖苷酶(β2galactosidase)的结构及α2互补特性进行了很多的基础性研究,其中α2受体和α2供体是CNBr2及M15蛋白。此后有学者提出的酶供体(enzymedonor,ED)、和酶受体(enzymeacceptur,EA)蛋白对都是在此基础上设计的。Henderson等[3]在1986年利用基因工程技术生产大肠杆菌β2半乳糖苷酶EA和ED,并利用其α2互补功能创立了克隆ED免疫分析技术。大肠杆菌β2半乳糖苷酶(E1C131211123)是由4个相同亚基组成的四聚体。每一个亚基可分成大小2个片段,大片段被称为EA,小片段被称为ED。每种片段在分开时没有酶活性,但当两者在一起时就可以形成β2半乳糖苷酶亚基,进而聚合成具有酶活性的四聚体。β2半乳糖苷酶的EA、ED这种α2互补性己被广泛用于分子生物学研究、蛋白质与蛋白质相互作用的研究、克隆ED均相免疫分析技术等[326]。本实验室在上述研究的基础上,制备了EA、ED蛋白,并在体外获得了β2半乳糖苷酶全酶活性,为进一步开展克隆酶供体免疫测定(clonedenzymedonorimmunoassay,CEDIA)技术检测小分子蛋白研究提供实验基础。1 材料与方法111 主要材料 大肠杆菌JM109、DH5α(本室保存),原核表达质粒pET20b+(TransGenBiotech公司),AMV、pGEM2T2easy载体(promega公司,美国),限制性核酸内切酶NocⅠ、SalⅠ、T4DNA连接酶(Takara公司),Trizol试剂(Ivitrogen公司),镍离子亲和层析柱(Ni2+2NTA)(Qiagen公司),质粒提取试剂盒、DNA凝胶回收试剂盒(Vitagene公司)。112 寡核苷酸引物设计与合成 以PSV2β2galactosidasecontrolvector为模板设计两对引物:P1,5′2GCCCATGGCCGTAGTTTTACAACG23′;P2,5′2TGTCGACTTAACAACCGTGCATCTG2CCA23′;P3,5′2TAACCATGGATCGCCCTTC2CCAACAATTGCGCAGC23′;P4,5′2CGCGGTC2GACTTATTTTTGACACCACACCAACTGG23′(划线部分为酶切位点)。委托大连宝生物工程公司合成。113 PCR扩增及测序 以pSV2β2galactosidasecontrolvector为模板,以P1、P2引物扩增ED片段,PCR参数:94℃预变性5min,94℃变性45s,55℃退火45s,72℃延伸1min,30个循环;72℃终延伸10min。以P3、P4引物扩增EA片段,PCR参数:94℃预变性5min;94℃变性90s,55℃退火90s,72℃延伸2min,30个循环;72℃终延伸15min。1%琼脂糖凝胶电泳鉴定并分别回收PCR产物,将纯化后的PCR产物克隆至pGEM2T2easy载体,获得克隆质粒pGEM2T2ED和pGEM2T2EA,分别转化大肠杆菌感受态细菌JM109,经过蓝白筛选、酶切鉴定、PCR鉴定初筛阳性克隆菌株,委托大连宝生物工程公司测序。114 重组表达载体的构建 将测序正确的重组克隆质粒和表达质粒pET20+分别进行双酶切和凝胶回收处理,切取的ED、EA片段经T4DNA连接酶插入pET20b
+
,构建出重组表达质粒pET20b2
ED、pET20b2EA,将重组表达质粒转化大肠杆菌DE3感受态细胞,经抗生素耐药性筛选、酶切鉴定、PCR鉴定筛选出阳性克隆。115 ED和EA菌株的诱导表达 阳性克隆菌接种于LB固体培养基,挑选4个重组菌单菌落分别接种于2mLLB液体培养基,37℃、60r・min-1振摇过夜,次日以1∶50接种于2mLLB液体培养基中,37℃、230r・min-1振荡培养至A600值为016时,加入终浓度为1mmol・L-1的IPTG诱导
培养5h,继续培养4h,4℃、12000g离心1min,收集菌体,进行SDS2PAGE电泳。116 ED和EA蛋白纯化 诱导200mL阳性表达菌液,离心收集菌体沉淀,加入超声裂解液,
-70℃反复冻融3次,离心上清4℃保存,得到的包涵体用变性裂解缓冲液重悬。分别对裂解上清和包涵体进行SDS2PAGE电泳,经镍凝胶亲和层析法纯化目的蛋白。117 ED和EA形成β2半乳糖苷酶全酶活性测定 采用微量反应板法,总体积为200μL,含011mol・L-1PBS(pH710),1mmol・L-1MgSO4,5mmol・L-1DTT,1g・L-1ONPG,不同浓度的EA/ED蛋白,37℃反应,在不同时间读取A404值。
2 结 果211 ED和EA基因片段的克隆及测序结果 PCR扩增电泳结果见图1(ED约260bp)及图2(EA
约2940bp),测序结果与PSV2β2galactosidase
controlvector比较有98%的同源性,氨基酸无变化。212 重组表达质粒鉴定 构建出重组表达质粒
14许淑芬,等1 大肠杆菌β2半乳糖苷酶ED和EA的克隆、表达及活性测定