凝胶回收

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生物学实验之凝胶回收基础及操作

生物学实验之凝胶回收基础及操作
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耗材 移液枪
枪头 离心管
设备 凝胶成像系统
离心机 水浴锅 水平电泳仪
胶回收标准实验流程-实验流程
1柱平衡 步骤
1
向吸附柱 CA2柱 加入500μL 平衡液BL
2
12000rpm, 离心1min
2切胶
1
将目的条 带从琼脂糖 凝胶中切下
2
放入干净的 离心管中
3
弃废液,将 吸附柱重新放回
收集管中
3
称取重量
注:1.如果凝胶重0.1g,其体积可视为100μL,则加入100μL溶液PN。 2.若胶块未完全溶胶,可继续放置几分钟或补加一些溶胶液,直
至胶块完全溶解。
22
4.1 实验流程
4.1.4 吸附DNA
1
2
将所得溶液加入 一个吸附柱CA2中,
室温放置2min
12000rpm, 离心30~60sec
3
弃废液,将吸附柱 重新放回收集管中
4.2 结果分析—琼脂糖凝胶电泳
➢ 将电泳结束后的凝胶放在凝胶成像 系统中拍照保存。
➢ 对结果进行分析: ① 看有无目的带 ② 看是否存在非特异带 ③ 看条带亮度
30
切割 回收
4.2 注意事项
1.洗脱体积不应小于30μL,体积过少 影响回收效率。洗脱液的pH值对于 洗脱效率有很大影响。若后续做测序, 需使用ddH2O做洗脱液,并保证其 pH值在7.0~8.5范围内,pH值低于 7.0会降低洗脱效率。
生物学实验之凝胶回 收基础及操作
目录
一 胶回收基础知识 二 方法及应用 三 试剂耗材与设备 四 操作流程 五 常见问题解答
目录
一 胶回收基础知识 二 方法及应用 三 试剂耗材与设备 四 操作流程 五 常见问题解答

DNA凝胶回收操作流程

DNA凝胶回收操作流程

DNA凝胶回收QIAquick Gel Extraction Kit① (提前记录1.5ml离心管重量)在紫外灯光下切下含有目的DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸干凝胶表面液体并切碎(方便融化),计算凝胶重量(重量作为凝胶体积,100mg≈100μl体积)②入3个凝胶体积的Buffer QG ,每个吸附柱的最大量为400mg。

对于>2%凝胶浓度,加入6个凝胶体积的Buffer QG。

③混个均匀后于50℃加热10min(或者直至凝胶全部溶解),每2-3min间断混合以助溶解,凝胶完全融化后,确认混合液的颜色为黄色(类似于Buffer QG没加入溶解的凝胶之前的颜色)。

如果混合液的颜色是橙色的或者紫色的,加入10μL 3M sodium acetate(醋酸钠), pH5.0,混合。

混合液转变为黄色。

④加入一个体积的异丙醇于样品中,混合。

⑤将QIAquick吸附柱置于2ml 收集管中,为了吸附DNA,将样品置于吸附柱中, 17900×g(13000rpm) 离心1min。

弃去液体,将QIAquick吸附柱置于相同的收集管上。

⑥如果DNA用于后续测序,体外转录,显微注射,加入500μL Buffer QG于吸附柱上,离心1min,弃去液体,将吸附柱置于新的收集管上。

⑦洗涤,加入750μL Buffer PE于吸附柱中,离心1min,弃去液体,将吸附柱置于新的收集管上。

注意:如果将DNA用于盐敏感型应用(例如,测序,平末端连接反应中),加入Buffer PE后静置2-5min。

为了去除残留液体,继续离心1min。

⑧将收集柱置于新的1.5mL离心管中。

⑨为了洗提DNA,加入50μL Buffer EB(10mM Tris·Cl, pH 8.5),加入膜中央,离心1min。

为了增加DNA浓度,加入30μL Buffer EB于膜中央,静置1min,离心1min。

孵育50℃最多4min,可提高DNA提取效率。

DNA凝胶回收试剂盒产品说明书

DNA凝胶回收试剂盒产品说明书

北京四正柏生物科技有限公司网站: 客服热线:400-7060-959技术支持:DNA 凝胶回收试剂盒产品编号规格MDN3066-5050次MDN3066-100100次保存条件及效期:常温运输和保存,保质期一年。

产品描述:本试剂盒用于从琼脂糖凝胶中或DNA 反应体系中(如PCR 反应)回收DNA 片段。

试剂盒采用可以高效、专一结合DNA 的硅胶膜和独特的溶胶体系,或DNA 反应体系中回收的单链、双链及环状DNA ,回收效率可达50-90%(跟片段大小相关)。

得到的DNA 可直接用于连接、转化、酶切、测序、杂交等分子生物学实验。

产品组分:使用方法:1.凝胶回收:切取含DNA 片段的琼脂糖凝胶(100mg 左右,尽可能多地把多余的胶切除,否则会影响回收效率),放入一干净的1.5ml 塑料离心管(自备)中,用移液枪头捣碎,按重量比为1:3到1:5的比例加入通用溶胶液(100mg 琼脂糖凝胶需要加入300μl-500μl 通用溶胶液)。

PCR 产物回收:直接在PCR 反应管中加3-5倍体积的通用溶胶液,混匀,然后跳过第2步、直接从第3步做起。

如果PCR 反应中使用了石蜡,需要预先去除。

2.50℃保温使胶完全溶化(一般需要5分钟),其间可以振荡数次以促进琼脂糖凝胶的溶化。

如果片段长度在300bp 成份50次包装100次包装通用溶胶液25ml 50ml 吸附柱活化液25ml 50ml 通用洗柱液50ml 100ml 离心吸附柱50套100套DNA 洗脱液10ml 10ml 说明书1份1份以下,建议不要加热,以免DNA变性,影响回收率。

3.在等待期间,活化离心吸附柱。

在离心吸附柱中加入0.5mL吸附柱活化液,套上收集管后室温放置2分钟,然后12,000rpm离心2分钟,倒弃穿透液,再将吸附柱套上收集管后待用。

活化后的离心吸附柱必须在当天使用。

4.在上柱前,在溶化的胶中加入相当于胶块体积1/2的异丙醇(对100mg胶块,加50uL),快速振荡10秒混匀。

dna凝胶回收原理

dna凝胶回收原理

dna凝胶回收原理
DNA凝胶回收是一种将DNA物质从凝胶中提取出来的技术,其原理主要涉及DNA凝胶的消化、电泳分离和提取等步骤。

首先,需要将含有DNA样品的凝胶切割成小片或小块。

这可以通过将凝胶放在紫外线灯下照射,使其出现亮蓝色荧光,并用刀、剪刀或专用切割工具进行切割。

然后,将DNA凝胶片放入一个离心管或离心管盒中,并加入几倍体积的溶剂(例如Tris-HCl缓冲液)。

随后,将离心管置于37°C的温水浴中,使凝胶片中的DNA溶解。

接下来,通过离心将溶解后的DNA凝胶物质与溶剂分离。

在离心过程中,DNA分子被推到溶剂中,而凝胶片被离心力推到离心管的底部。

最后,将上清液转移到一个新的离心管中,这个上清液即为含有DNA物质的溶液。

这样,DNA物质就从凝胶中回收提取出来了。

需要注意的是,在DNA凝胶回收的过程中,凝胶溶解液的选取和温度控制非常关键。

溶解液的成分和浓度应该适合DNA 的溶解,同时温度的控制也要符合DNA的稳定性,以避免DNA的降解或损伤。

实验十一DNA凝胶回收

实验十一DNA凝胶回收
3. 加 0.5倍Buffer DE-A 体积的 Buffer DE-B,混合均匀。当分 离的 DNA 片段小于 400bp 时,需再加入 1个凝胶体积的 异丙醇。
加Buffer DE-B后混合物颜色变为黄色,充分混匀以保证形成均一的黄色 溶液。
4. 吸取步骤3中的混合液,转移到DNA制备管(置于2 ml(试剂盒内 提供)离心管)中,12,000×g离心 1 min。弃滤液。
一、实验原理
通过一定的方法将琼脂糖凝胶上 需要的目的DNA带回收下来,用 于下游实验。
琼脂糖凝胶电泳片断回收的常用方法
1.柱回收试剂盒
是目前最简单快速的回收方法,只需要将电泳凝胶中 的产物条带切下,用溶解Buffer彻底溶解,上包埋有纯化 填料的纯化柱,离心,再洗涤一次,离心后用洗脱缓冲 液洗脱。全程不过10多分钟,得到的产物溶液可以直接 用于后继实验。这个方法几乎不需要什么技巧就能得到 稳定的结果,也是目前最多商品化试剂盒选择的方法。 但是这个方法不适合用于大片断的回收。
1.在紫外灯下切下含有目的 DNA 的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽 凝胶表面液体并切碎。计算凝胶重量(提前记录 1.5 ml 离 心管重量) ,该重量作为一个凝胶体积(如 100 mg=100 μl 体积) 。
2. 加入 3倍凝胶体积的 Buffer DE-A,混合均匀后于 75°C加 热(低熔点琼脂糖凝胶于 40ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱC加热) ,间断混合(每 23 min) ,直至凝胶块完全熔化(约 6-8 min) 。 * Buffer DE-A为红色溶液。在熔化凝胶的过程中,可以帮 助观察凝胶是否完全熔化。
二、实验目的
1. 从含有目的基因片段凝胶块上回收 DNA。
2.回收目的基因片段为下步连接反应 作准备

凝胶dna回收实验报告

凝胶dna回收实验报告

凝胶dna回收实验报告1. 理解DNA凝胶电泳的原理和方法;2. 学习DNA凝胶回收的方法和步骤。

实验材料:1. DNA凝胶电泳仪;2. DNA样品;3. DNA凝胶;4. DNA染料。

实验步骤:1. 准备DNA样品:从细菌或真核生物中提取DNA并纯化。

2. 制备DNA凝胶:根据DNA样品大小选择合适的琼脂糖浓度和电泳缓冲液,将琼脂糖溶解于电泳缓冲液中,加热溶解后,在凝固前加入DNA样品,并将其转移到电泳槽中。

3. 进行DNA凝胶电泳:将DNA凝胶置于电泳仪中,接通电源,设定适当的电流和电压,进行电泳分离。

根据不同的目的和需求,可以选择不同的电泳方法,如平行电泳或垂直电泳。

4. 理解DNA凝胶图谱:观察DNA在凝胶中的迁移情况,根据分离程度和片段大小推断DNA的特性和组成。

5. 染色:使用DNA染料将凝胶中的DNA染色,以便观察和记录。

6. 回收DNA:使用切割刀将感兴趣的DNA片段从凝胶中割下,转移到离心管中。

7. 纯化和测定:使用DNA纯化试剂盒或其他方法纯化回收的DNA,并通过测序或其他技术确认其准确性和纯度。

实验结果:1. DNA凝胶图谱:根据分离情况和染色结果,可以观察到DNA片段的迁移情况和大小分布。

2. 回收的DNA样品:经过回收和纯化后,获得从凝胶中割下的DNA片段。

实验讨论:1. 实验中电泳条件的选择对于DNA凝胶分离的效果和准确性至关重要。

2. 切割凝胶时需要注意避免外源性DNA污染和片段交叉污染。

3. 回收的DNA样品需要经过纯化和测定,以确保其准确性和纯度。

实验结论:1. 通过凝胶DNA回收实验,我们可以将感兴趣的DNA片段从凝胶中割下,并进行后续的纯化和分析。

2. DNA凝胶电泳是一种常用的DNA分离和分析方法,可以用于研究DNA的大小、构成和数量。

3. 正确选择电泳条件,合理操作和纯化步骤,能够获得准确和高质量的回收DNA样品。

实验改进:1. 优化电泳条件,提高凝胶分离效果。

快速凝胶回收实验报告

快速凝胶回收实验报告

一、实验目的本实验旨在通过快速凝胶回收方法,从琼脂糖凝胶中回收目的DNA片段,为后续的PCR扩增、酶切、连接等分子生物学实验提供高质量的模板DNA。

二、实验原理凝胶回收是分子生物学实验中常用的技术之一,主要用于从琼脂糖凝胶中回收目的DNA片段。

本实验采用的方法是利用琼脂糖凝胶中的DNA片段在低盐、高pH值条件下,可被特定的吸附剂(如硅胶膜、磁珠等)特异性吸附的特性,通过简单的操作步骤,将目的DNA片段从凝胶中分离、纯化。

三、实验材料1. 琼脂糖凝胶2. 目的DNA片段3. DNA回收试剂盒(含吸附剂、缓冲液等)4. 1.5 mL离心管5. 离心机6. 电泳仪7. 凝胶成像系统四、实验方法1. 准备琼脂糖凝胶电泳,将目的DNA片段与载体DNA混合,加入琼脂糖凝胶中,进行电泳分离。

2. 将电泳后的凝胶在紫外灯下观察,确定目的DNA片段的位置。

3. 使用DNA回收试剂盒中的吸头,将目的DNA片段从凝胶中剪下。

4. 将剪下的凝胶片段放入1.5 mL离心管中,加入适量的缓冲液,用吸头充分混匀。

5. 将混匀后的离心管置于离心机中,以12,000 rpm离心5分钟,使DNA片段吸附在吸附剂上。

6. 弃去上清液,用缓冲液洗涤吸附剂,重复洗涤步骤2次。

7. 将洗涤后的离心管置于离心机中,以12,000 rpm离心3分钟,使DNA片段充分沉淀。

8. 弃去上清液,加入适量的TE缓冲液,用吸头充分混匀,使DNA片段溶解。

9. 使用凝胶成像系统观察DNA片段的回收情况。

五、实验结果与分析1. 电泳结果显示,目的DNA片段成功从琼脂糖凝胶中回收。

2. 凝胶成像系统显示,回收的DNA片段大小与预期相符。

3. 回收的DNA片段纯度较高,可用于后续的PCR扩增、酶切、连接等分子生物学实验。

六、实验讨论1. 本实验采用快速凝胶回收方法,操作简便,节省时间,适用于大量样品的回收。

2. 实验过程中,应注意以下几点:a. 凝胶回收时,应确保目的DNA片段在凝胶中的位置准确。

DNA凝胶回收方法

DNA凝胶回收方法

DNA凝胶回收方法
一、材料:
1.5ml的离心管,离心管架
二、设备:
移液枪,离心机
三、试剂:
溶胶液,75%乙醇
四、操作步骤:
1. 切胶回收后,称重,在离心管中用1ml的枪头捣碎。

2. 加入等体积的溶胶液(如胶为100mg,则加100ul的溶胶液),颠倒混匀。

3. 55℃恒温加热直到凝胶完全融化(约10分钟),每隔2-3分钟需将管内混悬液混匀一次,以加速凝胶溶解。

4. 加入到回收柱中,室温放置1分钟。

5. 12000rmp离心1分钟,倒弃收集管中的液体。

6. 在DNA回收柱中,加入700ul的75%的乙醇,倒弃收集管中的液体。

7. 重复步骤6。

8. 12000rmp离心1分钟,除去残留的液体。

9. 室温放置5-10分钟,让残留的乙醇充分挥发。

10. 将DNA回收柱置于1.5ml的离心管上,加入30ul的洗脱夜(TE缓冲液),放置1分钟,12000rmp离心1分钟,所得的液体即为回收的DNA。

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AxyPrep DNA 凝胶回收试剂盒
本试剂盒适合从各种琼脂糖凝胶中回收多至8μg DNA(70bp-10Kb),回收率为60-85%。

琼脂糖凝胶在温和的缓冲液(DE-A 溶液)中熔化,其中的保护剂能防止线状DNA 在高温下降解,然后在DE-B 溶液的作用下使DNA 选择性结合到膜上。

纯化的DNA 纯度高,并保持片断完整性和高生物活性,可直接用于连接、体外转录、PCR 扩增、测序、微注射等分子生物学实验。

一、试剂盒组成、贮存、稳定性
2ml离心管1.5ml离心管说明书
Buffer DE-A:凝胶熔化剂,含DNA 保护剂,防止DNA 在高温下降解。

室温密闭贮存。

Buffer DE-B:结合液(促使大于70bp 的DNA 片段选择性结合到DNA 制备膜上)。

室温密闭贮存。

Buffer W1:洗涤液,室温密闭贮存。

Buffer W2 concentrate:去盐液,使用前,按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇(用100%乙醇或95%乙醇),混合均匀,室温密闭贮存。

Eluent:洗脱液,室温密闭贮存。

二、注意事项
1. Buffer DE-A(含有β-巯基乙醇)、Buffer DE-B 和Buffer W1 含刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套和眼镜,避免沾染皮肤、眼睛和衣服,谨防吸入口鼻。

若沾染皮肤、眼睛时,要立即用大量清水或生理盐水冲洗,必要时寻求医疗咨询。

2. 在步骤1 中,将凝胶切成细小的碎块可大大缩短凝胶熔化时间(线型DNA 长时间暴露在高温条件下易于水解),从而提高回收率。

勿将含DNA 的凝胶长时间地暴露在紫外灯下,减少紫外线对DNA造成的损伤。

3. 在步骤2 中凝胶必须完全熔化,否则将严重影响DNA 回收率。

4. 将Eluent 或去离子水加热至65°C,有利于提高洗脱效率。

5. DNA 分子呈酸性,建议在2.5 mM Tris-HCl,pH 7.0-8.5 洗脱液中保存。

三、实验准备
1. 第一次使用前,Buffer W2 concentrate中加入指定体积的无水乙醇。

2. 准备无核酸和核酸酶污染的Tip头、离心管。

3. 准备75°C水浴。

4. 使用前,检查Buffer DE-B是否出现沉淀,若出现沉淀,应于70°C温浴加热熔化并冷却至室温后再使用。

四、操作步骤
1. 在紫外灯下切下含有目的DNA 的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面液体并切碎。

计算凝胶重量(提前记录1.5 ml 离心管重量),该重量作为一个凝胶体积(如100 mg=100 μl 体积)。

2. 加入3 个凝胶体积的Buffer DE-A,混合均匀后于75°C 加热(低熔点琼脂糖凝胶于40°C 加热),间断混合(每2-3 min),直至凝胶块完全熔化(约6-8 min)。

* Buffer DE-A 为红色溶液。

在熔化凝胶的过程中,可以帮助观察凝胶是否完全熔化。

3. 加0.5 个Buffer DE-A 体积的Buffer DE-B,混合均匀。

当分离的DNA 片段小于400bp 时,需再加入1 个凝胶体积的异丙醇。

* 加Buffer DE-B 后混合物颜色变为黄色,充分混匀以保证形成均一的黄色溶液。

步骤4-6 可以选择负压法或离心法。

A. 负压法
4A. 正确连接负压装置,将DNA 制备管插到负压装置的插口上。

吸取步骤3 中的混合液,转移到制备管中,开启并调节负压至-25-30 英寸汞柱,缓慢吸走管中溶液。

5A. 加500 μl Buffer W1,吸尽管中溶液。

6A. 加700 μl Buffer W2,吸尽管中溶液。

以同样的方法再用700 μl Buffer W2 洗涤一次。

* 确认在Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。

* 两次使用Buffer W2 冲洗能确保盐份被完全清除,消除对后续实验的影响。

7A. 将制备管置于2 ml 离心管(试剂盒提供)中,12,000×g 离心1 min。

B. 离心法
4B. 吸取步骤3 中的混合液,转移到DNA 制备管(置于2 ml(试剂盒内提供)离心管)中,12,000×g
离心1 min。

弃滤液。

5B. 将制备管置回2 ml 离心管,加500 μl Buffer W1,12,000×g 离心30 s,弃滤液。

6B. 将制备管置回2 ml 离心管,加700 μl Buffer W2,12,000×g 离心30 s,弃滤液。

以同样的方法再用700 μl Buffer W2 洗涤一次12,000×g 离心1 min。

* 确认在Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。

* 两次使用Buffer W2 冲洗能确保盐份被完全清除,消除对后续实验的影响。

7B. 将制备管置回2 ml 离心管中,12,000×g 离心1 min。

8. 将制备管置于洁净的1.5 ml 离心管(试剂盒内提供)中,在制备膜中央加25-30 μl Eluent 或去离子水,室温静置1 min。

12,000×g 离心1 min 洗脱DNA。

* 将Eluent 或去离子水加热至65℃将提高洗脱效率。

六、常见问题分析
(一)、回收率低
1. 目的片段结合量低
1) 琼脂糖凝胶未完全熔化时目的片段只有部分结合到膜上,导致其余的片段在后续洗涤过程中丢失以及出现制备管堵塞现象,最终影响回收效率。

建议:在切胶时尽可能去除不含目的片段的琼脂糖,确保buffer DE-A 的正确用量。

在熔胶过程中要仔细检查确保无固体琼脂糖残留,间隔性的对样品进行摇晃促进凝胶的充分熔化。

2) 小于400bp 的片段未加异丙醇
建议:务必确保已加入1 倍凝胶体积的异丙醇(100%)
3) 电泳缓冲液pH 值过高,影响目的片段的结合
建议:建议加入10μl 3M NaAc 中和。

2. 结合的DNA片段过早的被洗脱
Buffer W2 中未加无水乙醇或者乙醇浓度不是95-100%的
建议:确保加入正确的乙醇量。

每次使用后应拧紧瓶盖,以免乙醇挥发,降低回收率。

3. 洗脱效率低
建议:最后一次Buffer W2 洗涤完后不要将制备管放于负压装置上抽得过干。

洗脱液或者去离子水65°C 预热以及增加洗脱前静置时间至5min,都可提高洗脱效率。

选用合适浓度的琼脂糖凝胶电泳,上样量不超过制备管的最大结合量(8μg)(二)、后续酶促反应不理想
1. 盐污染
建议:确保用Buffer W2 洗涤2 次。

2. 乙醇污染
建议:在最后一次Buffer W2 洗涤后可将制备管离心时间由原来1min 增加至2min。

3. 琼脂糖残留
建议:切胶时尽可能去除不含有DNA 片段部分的凝胶以便于对琼脂糖的处理,确保琼脂糖块在Buffer DE-A中完全熔化。

4. 洗脱产物中含有ssDNA
将洗脱产物95℃加热2min,慢慢冷却至室温,使单链DNA 重新退火即可。

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