如何用PCR法检测基因的多态性

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采用PCR-CTPP检测白细胞介素2基因多态性

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中国实验诊断学２Ｏ年５Ｏ７月
第ｌ卷第５１期
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５９－— ６ — － —
文章编号：０７— ２７２Ｏ）５５９ｏ１０４８（Ｏ７Ｏ～０６一３
采用ＰＲＣＰＣ．ＴＰ检测白细介素２基因多态性胞
或Ｇ的单核苷酸的多态性，并与测序结果相符合。１１０位体检个体中Ｔ纯合子为４例（２６，Ｇ纯合子为ｌ例ｒ３４．％）Ｇ１

等位基因特异性PCR在ACE基因多态性检测中的应用

等位基因特异性PCR在ACE基因多态性检测中的应用目的：采用等位基因特异性PCR法对ACE基因多态性进行检测，并对脑血管疾病（CVD）与ACE基因多态性的相关性进行探讨。

方法：将2010年2月-2013年2月云南景颇族和傣族共73例CVD患者（CVD组）和43例健康人员（对照组）进行ACE基因多态性检测，并对结果进行分析。

结果：116例受检人员均获得扩增产物，CVD组患者73例扩增产物中，DD型14例（19.2%），II型30例，ID型29例；对照组43例扩增产物中，DD型5例（11.6%），II型19例，ID型19例，对照组中DD型基因频率低于CVD组，差异无统计学意义（P>0.05）。

结论：等位基因特异性PCR检测技术可对ACE基因多态性进行有效检测，对于CVD的防治具有重要的参考意义。

标签：等位基因特异性PCR；脑血管疾病；ACE基因多态性脑血管疾病（cerebrovascular disease，CVD）由脑血管病变所引起，主要高发于65岁以上人群，患者发病后易残留后遗症，导致劳动和生活能力丧失，也是人类死亡的重要原因之一。

CVD主要分为缺血性脑血管病和出血性脑血管病，其中以缺血性为多见。

CVD的产生由遗传因素和环境因素共同作用所引起，高血压、糖尿病、动脉粥样硬化等疾病是CVD发生的首要高危因素[1]，而血管紧张素转换酶（ACE）基因多态性与高血压等心血管疾病的发生有关[2]。

笔者选择等位基因特异性PCR技术对云南景颇族和傣族73例CVD患者的ACE基因多态性进行检测，以期为ACE基因多态性与CVD的相关性提供临床依据，现将结果报道如下。

1 资料与方法1.1 一般资料选取2010年2月-2013年2月云南景颇族和傣族46例健康人员（对照组）和73例CVD患者（CVD组），取早晨空腹静脉血10 ml，肝素抗凝后离心分离血浆，采用酚抽提法抽提患者外周血白细胞DNA模板，所有受检人员无血缘关系。

基因多态性的检测方法

基因多态性的检测方法一、直接方法1.目标基因测序：通过对目标基因进行测序，可以直接得到其等位基因的序列信息。

目前，高通量测序技术的发展使得测序成为一种常用的基因多态性检测方法。

2.杂交技术：杂交技术可以用于检测单核苷酸多态性（SNP）和小片段插入/缺失等变异。

常用的方法包括限制性片段长度多态性（RFLP）和串联重复片段多态性（VNTR）等。

3.聚合酶链反应（PCR）：PCR可以通过扩增目标片段的方法，检测基因多态性。

例如，引物在目标序列上的配对使得PCR扩增产物的长度与目标基因的等位基因有关。

通过测定扩增产物的长度变化，可以确定基因多态性。

4.克隆测序：克隆测序是一种将目标基因克隆到载体中，并对克隆的DNA进行测序的方法。

这种技术可以用于检测较大的插入/缺失变异以及基因拷贝数变异等。

二、间接方法1.单核苷酸多态性（SNP）芯片：SNP芯片是一种高通量并行检测SNP 的技术。

它通过固定在芯片上的特异性探针与待测样品中的SNP位点进行杂交，然后使用荧光信号检测方法来确定不同等位基因的存在情况。

2.DNA芯片：DNA芯片可以广泛用于基因多态性的检测。

它可以同时测定数百甚至数千个基因，快速、准确地检测多个等位基因的存在情况。

3.高分辨率融解曲线分析：高分辨率融解曲线分析可以用来区分等位基因之间的序列差异。

该方法通过双链DNA在升温过程中解旋变性的温度差异，来分析目标序列中的等位基因。

4. 二代测序技术：二代测序技术（如Illumina和Ion Torrent）基于多组重叠的小片段测序，可以用于高通量的基因多态性检测。

它可以同时测定数百万个SNP位点，识别多个等位基因的存在情况。

综上所述，基因多态性的检测方法涵盖了直接方法和间接方法。

这些方法可以用于检测单核苷酸多态性、插入/缺失变异、基因拷贝数变异等不同类型的基因多态性。

随着技术的不断发展，基因多态性的检测方法将变得更加高效、准确和经济。

如何用PCR法检测基因的多态性

如何用PCR法检测基因的多态性PCR法（聚合酶链反应法）是一种广泛应用于分子生物学领域的基因检测技术。

它能够在短时间内扩增特定序列的DNA片段，从而实现对基因多态性的检测。

以下是使用PCR法检测基因多态性的步骤：1.设计引物首先，需要根据目标基因的序列设计引物（寡核苷酸序列）。

引物一般包括一对前、后引物，它们各自与目标序列的两侧互补配对。

引物的设计应考虑到目标基因区域的多态性，以确保引物与所有可能的变体都能配对。

2.提取DNA从目标生物体的组织样本（如血液或组织）中提取DNA。

DNA提取方法可以选择物理法或化学法，如离心法和盐析法等。

3.PCR反应将提取到的DNA作为PCR反应的模板，加入引物、四个核苷酸和聚合酶等反应物，进行PCR反应。

PCR反应由多个循环组成，每个循环包括DNA的变性、引物的结合和DNA的扩增。

4.凝胶电泳分析将PCR反应产生的扩增产物进行凝胶电泳分析。

凝胶电泳是一种将DNA分子根据大小分离的方法。

将PCR产物加载到琼脂糖凝胶槽中，然后通过电场进行电泳。

根据其大小，DNA片段将在凝胶中移动到不同的位置。

通过与大小已知的DNA分子比较，可以确定PCR产物的大小。

5.基因型分析通过比较PCR产物的大小，可以检测到基因的多态性。

在不同基因型的个体中，PCR产物的大小可能会有所不同。

可以将PCR产物分成不同的等级，以进行基因型分析。

6.数据分析最后，对PCR结果进行数据分析和解释。

根据PCR产物的大小和基因型等信息，可以确定个体的基因型。

如果一些基因型与一种特定的表型相关联，那么可以推测该基因是多态的，并且可能与该表型相关。

除了上述步骤，还可以通过引入序列特异性的限制酶切位点、单特异性引物扩增等方法，进一步确定基因多态性。

此外，PCR法还可以与其他技术如测序、SNP分析等相结合，以获得更详细的多态性信息。

总之，PCR法是一种快速、敏感且广泛应用的检测基因多态性的方法。

通过合理的引物设计、PCR反应、凝胶电泳和数据分析等步骤，可以确定基因的多态性及其与表型相关性，为遗传研究和疾病诊断等领域提供重要信息。

PCR-单链构型多态性分析

银染原理
根据核酸分子带有多个氨基和亚氨基，一定条件下可以与银离子结合，在甲醛等还原剂的作用下，形成黑或褐色的银沉淀条带。
银染过程
凝胶
10%乙酸、30%乙醇固定10min
dH2O漂洗两次
0.1%AgNO3 染色10min
dH2O漂洗两次
2.5%碳酸钠-0.03%甲醛显色 1%乙酸终止 dH2O漂洗
PCR-SSห้องสมุดไป่ตู้P 的应用
1.基因点突变的监测 2.多态性检测 3. 外显子的筛查 4.cDNA筛查
2. 将提取的DNA在20l变性溶液（95% 甲酰胺、1mmol/L EDTA, 0.05%溴酚蓝、 0.05%二甲苯青），95℃ 10分钟，冰浴 3分钟。
3. 将混合液加到中性的聚丙烯酰胺凝胶板孔中，在含1xTBE的电泳液中，电泳。
4. 将凝胶中DNA片段转移到硝酸纤维薄膜上，烘干后以放射自显影拍摄记录。或银染色
SSCP原理
在SSCP凝胶中电泳时，单链DNA的泳动速率主要取决于二级空间结构，因此若DNA片段中碱基发生突变，将会引起单链DNA二级空间结构的改变，使 SSCP凝胶上出现异常移动的电泳带（即 SSCP 阳性）。
PCR-SSCP 操作步骤
1. 常规PCR扩增DNA片段或其他被标 DNA片段的提取。
影响PCR-SSCP的因素
1.DNA片段大小 2.复制错误发生 3.电泳条件 :（1）丙烯酰胺的浓度
（2）交联剂的浓度（3）电泳的物理环境（4）甘油浓度
PCR-SSCP与RFLP比较
无需特殊的限制性内切酶作用可测出理论上任何一个碱基突变位点操作简便，无需特殊的仪器设备及试剂电泳条件的改变容易影响SSCP
PCR-单链构型多态性分析

检测目的基因的方法

检测目的基因的方法现代基因检测技术逐渐成为生命科学领域重要的工具之一。

在检测目的基因时，科学家可以运用多种方法。

下面将介绍几种常见的目的基因检测方法。

1. 聚合酶链反应（PCR）PCR是一种常用的基因检测方法，通过扩增DNA片段来检测目的基因。

PCR 包括三个步骤：变性、退火和延伸。

变性过程中，高温将DNA双链分离；退火过程中，引物与目的DNA序列互补结合；延伸过程中，酶聚合物延伸引物，并复制目的DNA。

PCR可以在短时间内扩增特定DNA片段，为后续分析提供足够的样本。

PCR技术在医学、生物学和犯罪学等领域广泛应用。

2. 基因测序基因测序是确定DNA序列的方法，可用于检测目的基因是否存在突变或多态性。

测序技术包括传统的电泳测序和新兴的高通量测序。

传统电泳测序通过测量DNA链延伸过程中释放的辅助标记物（如荧光标记的二聚脱氧核苷酸）来确定序列。

高通量测序同时测定数百万个DNA片段，大大提高了测序速度和效率。

基因测序技术广泛应用于疾病诊断、遗传研究和基因组学研究。

3. 酶联免疫吸附测定法（ELISA）ELISA是一种常用的免疫学方法，通过检测目的基因的蛋白质水平来间接确定基因的表达情况。

ELISA主要分为直接ELISA和间接ELISA两种类型。

直接ELISA 将特异性抗体直接与目的基因相关的蛋白质结合，通过检测酶标记来定量检测目的基因的蛋白质水平。

间接ELISA则需要两个不同的抗体，一个与目的基因相关的抗体，另一个与第一个抗体结合的酶标记抗体。

通过间接ELISA，可以更加灵敏地检测目的基因的表达水平。

4. 基因芯片技术（Microarray）基因芯片是用于高通量基因检测的一种技术。

它可以同时检测数千个基因的表达水平，有助于揭示多基因与疾病发生和发展之间的关联。

基因芯片通常包括一系列具有不同基因特异性探针的微型孔洞，这些探针可以与待检测样本中的特定基因序列杂交。

然后，通过对信号的检测和分析，可以确定各个基因的表达水平。

PCR—RFLP技术检测RANTES基因启动子区-28C／G多态性的实验研究

ｐｉ（ＣｈｓｍＰＲ—ＲＬ）．ｔｏ．ＴｅｍｉｆｅｔｌａｔｓｅｅｄｔｃｅｙＰＲｉｓｒｌｏｃｎｒｔｎｇａＦＰＭｅｈｄｈａｎｉｌｎｉｃｏｒｅｅｔｄｂＣｅａｃｎｅｔｉｒ— ｎｕａｆｒｗｎｉａｏ
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昆明医学院学报
２００６，（）２— ５５：３３
ＣＮ３一ｌ４／５Ｏ９Ｒ
ＪｕｎｌｏｎｎｅｉａｌｇｏｒａｆＫｕｍｉｇＭｄｃｌＣｏｌｅｅ
论著
ＰＲ —ＲＬＣＦＰ技术检测ＲＴＳ基因启动子区一２ＣＧＡＮＥ８／
［ｙｗｏｄ］ＰｌｅａｅｃａａｔｎｅｔｃｏａｍｅｔｅｇｏｙｒｈｓＫｅｒｓｏｍｒｓｈｉｒｃｏ；Ｒｓｔｎｆｇｎｎｈｐｌｐｉｙｎｅｉｉｒｉｒｌｔｍｏｍ；ＲＮＥｅｅｘＡＴＳｇｎ；Ｅ —
Ｇｅｏｏｅｇｏ・２ｎｅＰｒｍｔｒＲｅｉｎ－８Ｃ／Ｇｌｍｏｐｉｍ－Ｐｏｙｒｈｓ

ＬＩＨｕｉ— ｆｎ ¨ ａｇ
，
ＬＩＨｕ，ＳＵａＯＮＤａ —ｐｉｇＤｉｎｎ¨
，
ＷＡＮＧＹｕ — ｍｉｇ）ｎ
对主要影响因素设系列浓度梯度进行ＰＲ后观察电泳结果，设置不同的体系对ＲＬＣＦＰ方法进行了研究．最适变性温度为９４℃；最适退火温度为６０ｏＣ；最适引物浓度为０６ＩｏＬ．ｍｌ；最经济有效的酶切体系为ｘ／最佳的实验条件的摸索是进行大批量实验研究的关键．［关键词］聚合酶链反应；限制性片段长度多态性；ＲＴＳ基因；实验条件ＡＮＥ［中图分类号］Ｒ９．；Ｒ８．３４３５７１［文献标识码］Ａ［文章编号］１０４０（０６５—０３００３— ７６２０）００２— ４

pcr分析方法

PCR分析方法一、引言PCR（Polymerase Chain Reaction）是一种广泛应用于生物学和医学领域的核酸分析技术。

PCR方法通过体外放大DNA片段，以便于后续的分析和研究。

PCR方法的引入，在遗传学、病原微生物检测、基因工程等领域都发挥了重要作用。

本文将介绍PCR方法的原理、步骤和应用。

二、PCR原理PCR方法是在体外复制DNA片段的技术，其原理基于DNA的双链不稳定性。

PCR 反应主要包括三个步骤：变性、退火和延伸。

首先，将待扩增的DNA样本加热至95℃，使其两个互补链解离，得到两条单链DNA模板。

然后，将PCR反应液温度降至较低的温度（50-60℃），引入引物（PCR的序列特异性引导）。

引物结合到DNA模板链的3’末端，形成DNA-引物复合物。

最后，在适宜的温度下（50-75℃），通过热稳定的DNA聚合酶（Taq DNA polymerase）的活性来合成新的DNA链。

Taq DNA聚合酶能够从引物末端向3’端延伸合成互补链。

通过反复的循环，PCR反应能够将目标DNA片段扩增为数以亿计的复制品。

这样，仅有微量的出发DNA，也能被PCR反应扩增至足够的数量，以便于后续分析。

三、PCR步骤PCR方法通常包括三个主要步骤：前处理、PCR反应和分析。

前处理步骤用于提取DNA样本并准备PCR反应所需的DNA模板。

通常使用化学或机械方法从细胞或组织中提取DNA。

提取的DNA样本经过纯化和浓缩之后，可以进入下一步的PCR反应。

2. PCR反应在PCR反应过程中，需要准备PCR反应液和合适的PCR条件。

PCR反应液需要包含DNA模板、引物、dNTPs（脱氧核苷三磷酸盐）、缓冲液和DNA聚合酶等成分。

根据不同的PCR应用，反应条件如温度、时间和循环次数等也会有所变化。

3. 分析PCR反应结束后，扩增产物可以通过多种方式进行分析。

常用的分析方法包括琼脂糖凝胶电泳、聚合酶链反应实时定量分析（qPCR）、变性高效液相色谱法（DHPLC）等。

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如何用PCR法检测基因的多态性多态性（polymorphism）是指处于随机婚配的群体中，同一基因位点可存在2种以上的基因型。

在人群中，个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为基因（DNA）的多态性(gene polymorphism)。

这种多态性可以分为两类，即DNA位点多态性(site polymorphism)和长度多态性(longth polymorphism)。

基因多态性的主要检测方法简述如下：1．限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP）：由DNA 的多态性，致使DNA 分子的限制酶切位点及数目发生改变，用限制酶切割基因组时，钠问亢兔扛銎蔚某ざ染筒煌此降南拗菩云纬ざ榷嗵裕贾孪拗破纬ざ确⑸谋涞拿盖形坏悖殖莆嗵晕坏恪W钤缡怯肧outhern Blot/RFLP方法检测，后来采用聚合酶链反应（PCR）与限制酶酶切相结合的方法。

现在多采用PCR-RFLP法进行研究基因的限制性片段长度多态性。

2．单链构象多态性（SSCP）：是一种基于单链DNA构象差别的点突变检测方法。

相同长度的单链DNA如果顺序不同，甚至单个碱基不同，就会形成不同的构象。

在电泳时泳动的速度不同。

将PCR产物经变性后，进行单链DNA凝胶电泳时，靶DNA中若发生单个碱基替换等改变时，就会出现泳动变位（mobility shift），多用于鉴定是否存在突变及诊断未知突变。

3．PCR-ASO探针法（PCR-allele specific oligonucleotide, ASO）：即等位基因特异性寡核苷酸探针法。

在PCR扩增DNA片段后，直接与相应的寡核苷酸探杂交，即可明确诊断是否有突变及突变是纯合子还是杂合子。

其原理是：用PCR扩增后，产物进行斑点杂交或狭缝杂交，针对每种突变分别合成一对寡核苷酸片段作为探针，其中一个具有正常序列，另一个则具有突变碱基。

突变碱基及对应的正常碱基匀位于寡核苷酸片段的中央，严格控制杂交及洗脱条件，使只有与探针序列完全互补的等位基因片段才显示杂交信号，而与探针中央碱基不同的等位基因片段不显示杂交信号，如果正常和突变探针都可杂交，说明突变基因是杂合子，如只有突变探针可以杂交，说明突变基因为纯合子，若不能与含有突变序列的寡核苷探针杂交，但能与相应的正常的寡核苷探针杂交，则表示受检者不存在这种突变基因。

若与已知的突变基因的寡核苷探针匀不能杂交，提示可能为一种新的突变类型。

4. PCR-SSO法：SSO技术即是顺序特异寡核苷酸法（Sequence Specific Oligonucleotide, SSO）。

原理是PCR基因片段扩增后利用序列特异性寡核苷酸探针，通过杂交的方法进行扩增片段的分析鉴定。

探针与PCR产物在一定条件下杂交具有高度的特异性，严格遵循碱基互补的原则。

探针可用放射性同位素标记，通过放射自显影的方法检测，也可以用非放射性标记如地高辛、生物素、过氧化物酶等进行相应的标记物检测。

5. PCR-SSP法：序列特异性引物分析即根据各等位基因的核苷酸序列，设计出一套针对每一等位基因特异性的（allele-specific）、或组特异性(group-specific)的引物，此即为序列特异性引物（SSP）。

SSP只能与某一等位基因特异性片段的碱基序列互补性结合，通过PCR特异性地扩增该基因片段，从而达到分析基因多态性的目的。

6. PCR-荧光法：用荧光标记PCR引物的5’端，荧光染料FAM和JOE呈绿色荧光，TAMRA呈红色荧光，COUM 呈兰色荧光，不同荧光标记的多种引物同时参加反应，PCR扩增待检测的DNA，合成的产物分别带有引物5’端的染料，很容易发现目的基因存在与否。

7. PCR-DNA测序：是诊断未知突变基因最直接的方法，由于PCR技术的应用，使得DNA 测序技术从过去的分子克隆后测序进入PCR直接测序。

PCR产物在自动测序仪上电泳后测序。

常用方法有：Sanger双脱氧末端终止法;Maxam-Gilbert化学裂解法；DNA测序的自动化。

目前DNA顺序全自动激光测定法是最先进的方法。

8. PCR指纹图法（PCR-fingerprints）：实用于快速的同种异型DR/Dw配型。

在DR/DW纯合子及杂合子个体中，每种DR单倍型及每种单倍型组合所产生的单链环状结构的大小、数目和位置各异，由于同质双链和异质双链之间的分子构象不同。

因此，在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳时，它们的迁移率各不相同，从而获得单倍型特异的电泳带格局即PCR指纹。

也有人用人工合成的短寡核苷酸片段作为探针，同经过酶切的人体DNA作Southern blot，可以得出长度不等的杂交带，杂交带的数目和分子量的大小具有个体特异性，除非同卵双生，几乎没有两个人是完全相同的，就象人的指纹一样，人们把这种杂交带图形称为基因指纹(gene finger-printing)。

9. 基因芯片法：又称为DNA 微探针阵列（Micro array）。

它是集成了大量的密集排列的大量已知的序列探针，通过与被标记的若干靶核酸序列互补匹配，与芯片特定位点上的探针杂交，利用基因芯片杂交图象，确定杂交探针的位置，便可根据碱基互补匹配的原理确定靶基因的序列。

这一技术已用于基因多态性的检测。

对多态性和突变检测型基因芯片采用多色荧光探针杂交技术可以大大提高芯片的准确性、定量及检测范围。

应用高密度基因芯片检测单碱基多态性，为分析SNPs提供了便捷的方法。

10. AFLP（Amplication Fragment Length Polymorphism）法AFLP技术是一项新的分子标记技术，是基于PCR技术扩增基因组DNA限制性片段，基因组DNA先用限制性内切酶切割，然后将双链接头连接到DNA片段的末端，接头序列和相邻的限制性位点序列，作为引物结合位点。

限制性片段用二种酶切割产生，一种是罕见切割酶，一种是常用切割酶。

它结合了RFLP和PCR技术特点，具有RFLP技术的可靠性和PCR技术的高效性。

由于AFLP扩增可使某一品种出现特定的DNA谱带，而在另一品种中可能无此谱带产生，因此，这种通过引物诱导及DNA扩增后得到的DNA多态性可做为一种分子标记。

AFLP可在一次单个反应中检测到大量的片段。

以说AFLP技术是一种新的而且有很大功能的DNA指纹技术。

11. DGGE（denaturing gradinent electrophoresis,DGGE）法变性梯度凝胶电泳法（）DGGE法分析PCR产物，如果突变发生在最先解链的DNA区域，检出率可达100％，检测片段可达1kb，最适围为100bp-500bp。

基本原理基于当双链DNA在变性梯度凝胶中进行到与DNA变性湿度一致的凝胶位置时，DNA发生部分解链，电泳适移率下降，当解链的DNA链中有一个碱基改变时，会在不同的时间发生解链，因影响电泳速度变化的程度而被分离。

由于本法是利用温度和梯度凝胶迁移率来检测，需要一套专用的电泳装置，合成的PCR引物最好在5`末端加一段40bp-50bp的GC夹，以利于检测发生于高熔点区的突变。

在DGGE的基础上，又发展了用湿度梯度代替化学变性剂的TGGE 法（温度梯度凝胶电泳temperature gradient gelelectrophoresis,TGGE）。

DGGE 和TGGE均有商品化的电泳装置，该法一经建立，操作也较简便，适合于大样本的检测筛选。

12. RAPD（Random amplified polymorphic DNA）法运用随机引物扩增寻找多态性DNA片段可作为分子标记。

这种方法即为RAPD( Random amplified polymorphic DNA，随机扩增的多态性DNA)。

尽管RAPD 技术诞生的时间很短, 但由于其独特的检测DNA多态性的方式以及快速、简便的特点,使这个技术已渗透于基因组研究的各个方面。

该RAPD技术建立于PCR技术基础上,它是利用一系列(通常数百个)不同的随机排列碱基顺序的寡聚核苷酸单链(通常为10聚体)为引物,对所研究基因组DNA进行PCR扩增.聚丙烯酰胺或琼脂糖电泳分离,经EB染色或放射性自显影来检测扩增产物DNA片段的多态性,这些扩增产物DNA片段的多态性反映了基因组相应区域的DNA多态性。

RAPD所用的一系列引物DNA序列各不相同,但对于任一特异的引物,它同基因组DNA序列有其特异的结合位点.这些特异的结合位点在基因组某些区域内的分布如符合PCR 扩增反应的条件,即引物在模板的两条链上有互补位置,且引物3'端相距在一定的长度范围之内,就可扩增出DNA片段.因此如果基因组在这些区域发生DNA片段插入、缺失或碱基突变就可能导致这些特定结合位点分布发生相应的变化,而使PCR产物增加、缺少或发生分子量的改变。

通过对PCR产物检测即可检出基因组DNA的多态性。

分析时可用的引物数很大,虽然对每一个引物而言其检测基因组DNA多态性的区域是有限的,但是利用一系列引物则可以使检测区域几乎覆盖整个基因组。

因此RAPD可以对整个基因组DNA进行多态性检测。

另外，RAPD片段克隆后可作为RFLP的分子标记进行作图分析基因多态性的主要检测方法多态性（polymorphism）是指处于随机婚配的群体中，同一基因位点可存在2种以上的基因型。