生物学实验 质粒DNA的提取

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质粒DNA的提取

质粒DNA的提取

质粒DNA的提取一、原理采用碱变性发抽提取质粒DNA。

该法是基于染色体DNA与质粒DNA的变性预复性的差异而达到分离目的的。

在PH大于12的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开变性。

质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当以pH5.2的乙酸钠高盐缓冲液调节其pH至中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,保存在溶液中。

而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构。

通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。

二、方法1.挑取一环在LB固体培养基平板上生长的含PUC57质粒的大肠杆菌,接在含有100μg/ml氨苄青霉素(Amp)的LB液体培养基(5ml/15ml试管)中,37℃震摇培养过夜。

2.将1.5ml菌液加入微离心管中,14000r/min,离心10秒,其取上清液。

反复数次,收集全部菌体。

3.倾去上清,滤纸吸干。

4.加30μlTE缓冲液(10mmol/L Tris—HCl,1mmol/L EDTA,pH8.0),振荡起菌体。

5.加30μlTENS溶液(10mmol/L Tris—HCl, pH8.0,1mmol/L EDTA,0.1mol/LNaOH,0.5%SDS),震荡10秒至溶液变粘稠。

6.加150μl 3.0mol/LnaAC,震荡3—5S,14000r/min,离心3分钟,沉淀细胞碎片及染色体DNA。

7.上清液转移至另一微离心管中,甲等体积胞和酚,混匀,12000r/min,离心2分钟。

8.上层水相转移至另一位离心管,加2倍量冷水乙醇,14000r/min,离心20分钟。

9.倾去乙醇,加入7o%冷乙醇淋洗。

10.倾去乙醇,滤纸吸于,真空抽吸2~3分钟。

lI.加人50μlTE缓冲液,溶解DNA。

12,加入1μl核糖核酸酶(10mg/m1),14000r/min,离心2s,使核糖核酸酶与管底液体混匀。

质粒dna提取及电泳检测实验报告

质粒dna提取及电泳检测实验报告

质粒dna提取及电泳检测实验报告质粒DNA提取及电泳检测实验报告引言质粒DNA提取及电泳检测是生物学实验中常用的技术手段,用于分离和检测质粒DNA样本中的目标序列。

本实验旨在通过提取质粒DNA并进行电泳检测,验证提取的质粒DNA的纯度和完整性。

材料与方法1. 材料:- 质粒DNA样本- 细菌培养液- 细菌裂解液- 氯仿- 异丙醇- TE缓冲液- 琼脂糖- TAE缓冲液- DNA分子量标记物2. 方法:1. 质粒DNA提取:a. 将细菌培养液中含有质粒DNA的细菌进行离心,收集细菌沉淀。

b. 加入适量的细菌裂解液,裂解细菌细胞,释放质粒DNA。

c. 加入氯仿,离心分离上清液和有机相。

d. 收集上清液,加入异丙醇,使DNA沉淀。

e. 用TE缓冲液溶解DNA,得到质粒DNA提取物。

2. 质粒DNA电泳检测:a. 准备琼脂糖凝胶,加入TAE缓冲液,制备电泳槽。

b. 加载质粒DNA提取物和DNA分子量标记物于琼脂糖凝胶孔中。

c. 连接电源,进行电泳分离。

d. 观察电泳结果,记录质粒DNA的迁移情况和分子量。

结果与讨论通过质粒DNA提取及电泳检测实验,我们成功地提取到质粒DNA,并进行了电泳分离和检测。

在电泳结果中,我们观察到质粒DNA 片段在凝胶中呈现出带状分布,且迁移距离与分子量呈正相关关系。

根据电泳结果,我们可以初步判断质粒DNA的纯度和完整性。

如果质粒DNA在电泳过程中呈现单一的清晰带状分布,且没有明显的附加杂带,说明质粒DNA的纯度较高,没有明显的污染物。

而如果质粒DNA呈现模糊或多条不清晰的带状分布,可能存在其他DNA片段或杂质的污染。

通过电泳结果中质粒DNA片段的迁移距离,我们可以估算出质粒DNA的大致分子量。

通过与DNA分子量标记物的比对,我们可以初步判断质粒DNA的大小和可能的构造。

这对于进一步的研究和应用具有重要意义。

结论通过质粒DNA提取及电泳检测实验,我们成功地提取到质粒DNA,并验证了其纯度和完整性。

质粒dna的提取实验报告

质粒dna的提取实验报告

质粒dna的提取实验报告质粒DNA的提取实验报告引言:DNA提取是分子生物学研究中的基础实验之一,通过提取DNA可以进一步进行PCR扩增、基因克隆等实验。

本实验旨在提取质粒DNA,质粒DNA是存在于细菌细胞质中的环状DNA分子,具有重要的研究价值。

本文将详细介绍实验的步骤、原理以及结果分析。

材料与方法:1. 细菌培养液:选择含有目标质粒的细菌进行培养,如大肠杆菌。

2. 细菌培养基:选择适宜的培养基,如LB培养基。

3. 细菌培养器具:如培养皿、离心管等。

4. DNA提取试剂盒:选择适合的DNA提取试剂盒,如酚/氯仿法或硅胶柱法。

5. 离心机:用于离心细菌培养液以获取细菌沉淀。

6. 紫外可见分光光度计:用于检测DNA的纯度和浓度。

实验步骤:1. 细菌培养:将含有目标质粒的细菌接种于LB培养基中,培养过夜,使细菌充分繁殖。

2. 收集细菌:将培养液离心,以12000转/分钟离心10分钟,将细菌沉淀收集。

3. 细胞裂解:加入适量的细胞裂解缓冲液,使细菌细胞裂解,释放DNA。

4. 蛋白质沉淀:加入酚/氯仿混合液,离心分离上层的DNA溶液和下层的蛋白质。

5. DNA沉淀:将DNA溶液转移至新的离心管中,加入等体积的冷乙醇,轻轻倒置离心管,使DNA沉淀出来。

6. DNA洗涤:用70%的乙醇洗涤DNA沉淀,去除残余的盐和杂质。

7. DNA溶解:用适量的去离子水溶解DNA沉淀,得到纯净的DNA溶液。

8. DNA浓度检测:用紫外可见分光光度计检测DNA的浓度和纯度。

结果与分析:通过实验,成功提取了质粒DNA,并进行了浓度检测。

根据实验结果,我们可以得到DNA的浓度和纯度信息,这对于后续的实验设计和操作非常重要。

此外,实验中还可以通过凝胶电泳等方法对提取的DNA进行进一步的分析,如确定DNA的大小和完整性。

结论:本实验成功提取了质粒DNA,并获得了纯净的DNA溶液。

通过浓度检测和进一步的分析,我们可以进一步了解DNA的特性和应用。

质粒dna的提取与鉴定实验报告

质粒dna的提取与鉴定实验报告

质粒DNA的提取与鉴定实验报告引言质粒DNA的提取与鉴定是分子生物学实验中常用的技术之一。

质粒DNA是一种圆形的DNA分子,广泛存在于细菌和真核生物中。

提取和鉴定质粒DNA能够帮助研究人员进行基因克隆、基因表达调控等实验。

本实验旨在介绍质粒DNA的提取与鉴定步骤,以供初学者了解和学习。

实验材料•细菌培养物•质粒DNA提取试剂盒•去离子水• 1.5 mL离心管•微量离心管•离心机实验步骤步骤一:培养细菌并收获培养物1.取一支含有目标质粒的细菌培养物,将其接种至含有适当抗生素的培养基中。

2.在37℃恒温摇床上培养过夜,确保细菌得到充分生长。

步骤二:收获细菌培养物1.将培养基离心机中以12000转/分钟离心2分钟,以沉淀细菌细胞。

2.弃去上清液,将细菌细胞沉淀保留在离心管中。

步骤三:质粒DNA的提取1.选择一款质粒DNA提取试剂盒,按照说明书中的步骤操作。

不同试剂盒所用方法有所差异,详细操作请参照试剂盒说明书。

2.在质粒DNA提取试剂盒提供的试剂中加入细菌细胞,充分混合。

3.通过离心将细菌细胞裂解,释放出质粒DNA。

不同试剂盒所用离心条件有所不同,一般为高速离心1-3分钟。

4.弃去上清液,留下含有裂解细胞的混悬液。

步骤四:质粒DNA的纯化1.将质粒DNA混悬液转移到新的离心管中。

2.加入适量的洗涤缓冲液,充分混合。

3.通过离心将质粒DNA沉淀,弃去上清液。

4.加入适量的洗涤缓冲液,充分混合。

5.通过离心将质粒DNA沉淀,弃去上清液。

6.加入适量的洗涤缓冲液,充分混合。

7.通过离心将质粒DNA沉淀,弃去上清液。

8.加入适量的洗涤缓冲液,充分混合。

9.通过离心将质粒DNA沉淀,弃去上清液。

10.加入适量的洗涤缓冲液,充分混合。

11.通过离心将质粒DNA沉淀,弃去上清液。

12.使用去离子水溶解沉淀的质粒DNA,使其浓度适宜。

步骤五:质粒DNA的鉴定1.使用紫外可见光分光光度计测定溶解后的质粒DNA的浓度。

2.准备一份对照组,即只含有去离子水的样品。

质粒dna提取实验报告

质粒dna提取实验报告

质粒dna提取实验报告实验目的:本实验旨在通过提取细菌质粒DNA,了解细菌质粒的结构、基因组成和使用纯度较高的质粒DNA的重要性,为后续分子生物学实验打下基础。

实验器材:- 细菌- LB液体培养基- 1.5mL微量离心管- 离心机- 动态温度水浴仪- 恒温振荡器- 超声波清洗器- 洁净平台和无菌技术用品- 始终细切割刀和取样刷- 蒸馏水、2% SDS、醋酸铵、90%乙醇、异丙醇和干燥机实验步骤:1. 制备细菌:在LB液体培养基中培养要提取质粒DNA的细菌,由于质粒DNA在对数生长期达到最高含量,因此在显微镜下观察到对数生长期的细菌时进行取样。

2. 细胞打破和溶解质粒:离心细胞,倒去培养基,加入10mL蒸馏水,用振荡器在4℃下以300rpm摇晃3小时。

然后沉淀细胞,在70℃下干燥30分钟。

随后加入150μL1%SDS和其他化学试剂混合物,使用至少15次的起始细切割刀切成绒毛状的颗粒,浸泡在低盐度醋酸铵中2小时以上。

3. 质粒DNA纯化:将浸泡了细菌绒毛颗粒的混合物离心,抽取上清液,将其加入2x体积的异丙醇与等体积的75%,然后用再生明胶抑制蛋白质在异丙醇中凝聚。

离心,除去异丙醇上清液,加入70%乙醇洗涤。

最后用干燥机吸干。

4. 质量分析:分析提取到的质粒DNA的浓度和纯度,使用分光光度计对其进行光谱分析,以检测质粒DNA的A260/A280比例和A260/A230比例。

通过比较纯度,然后将质粒DNA冻保存至-20℃或-80℃。

实验结论:本实验成功提取了细菌的质粒DNA,并进行了纯化和分析。

质粒DNA的提取和纯化是基于一系列物理和化学方法和技术的,实际操作中需要仔细操作,耐心等待,严格注意洁净操作,才能达到最佳的提取和纯化效果。

通过本实验,我进一步了解了在分子生物学和遗传学中质粒DNA的重要性,它可适用于多种研究项目和应用,例如质粒克隆、基因编辑、基因表达、和质粒蛋白质互作等。

质粒dna的提取

质粒dna的提取

质粒DNA的提取1. 引言质粒DNA提取是在分子生物学研究中常用的实验操作之一。

质粒是一类圆环状的DNA分子,存在于原核生物中。

质粒DNA提取的目的是为了获取纯度高的DNA样品,以便进行后续的实验操作,如聚合酶链式反应(PCR)、限制性酶切、测序等。

2. 实验材料在进行质粒DNA提取实验前,需要准备以下实验材料:•细菌培养液:含有所需质粒的培养液。

•碱裂解液:用于裂解细胞并释放质粒DNA的实验液。

•高盐含量的溶液:用于提取DNA。

•蛋白酶K:用于消化蛋白质。

•硅胶粉末:用于吸附DNA。

•乙醇:用于沉淀DNA。

•TE缓冲液:用于溶解和储存提取的质粒DNA。

3. 实验步骤3.1 细菌培养与收获首先,需进行细菌培养和收获,以获取含有所需质粒的培养液。

培养液中的细菌应为含有目标质粒的菌株,如大肠杆菌。

3.2 细胞破碎与质粒DNA释放将收获的细菌培养液进行离心,去除培养液并沉淀细胞。

然后将细胞重悬于碱裂解液中,用震荡器在适当的温度和时间条件下裂解细胞,释放质粒DNA。

3.3 蛋白质消化为了去除细胞中的蛋白质,加入适量的蛋白酶K,进行蛋白消化。

消化的时间和温度应根据实验要求进行调整。

蛋白消化完成后,通过离心将蛋白质沉淀分离。

3.4 DNA提取将消化液中的DNA溶液转移到其它离心管中,并加入高盐含量的溶液。

通过离心将DNA与其他杂质分离。

此步骤中,DNA会被溶液中的硅胶粉末吸附,以去除杂质。

3.5 DNA沉淀将去除杂质的DNA溶液转移到新的离心管中,加入冰冷的乙醇。

通过离心,将沉淀的DNA分离出来。

注意,在沉淀过程中,应避免DNA的过度离心,以免损坏DNA分子。

3.6 DNA溶解和储存将DNA沉淀后,溶解在适量的TE缓冲液中。

TE缓冲液具有适当的pH值和离子浓度,能够稳定DNA分子,并提供良好的保存条件。

4. 实验注意事项在质粒DNA提取实验中,需要注意以下几点:•操作过程应严格遵守无菌操作,避免外源性DNA的污染。

质粒dna提取步骤

质粒dna提取步骤

质粒dna提取步骤
质粒 DNA 提取是分子生物学实验中的一项基本技术,用于从细菌细胞中分离出质粒DNA。

以下是一般的质粒 DNA 提取步骤:
1. 收集细菌培养物:将含有质粒的细菌培养在适当的培养基上,直到培养物达到合适的密度。

可以使用离心或过滤的方法收集细菌细胞。

2. 细胞裂解:将收集的细菌细胞加入裂解缓冲液中,通过物理方法(如搅拌、超声处理等)或化学方法(如加入裂解酶等)使细胞破裂,释放出质粒 DNA 和其他细胞成分。

3. 去除细胞碎片:将裂解后的混合液通过离心或过滤的方法去除细胞碎片和其他杂质。

4. 沉淀 DNA:向裂解液中加入乙醇或异丙醇等沉淀剂,使质粒 DNA 沉淀。

通过离心将沉淀收集。

5. 洗涤沉淀:用 70%的乙醇洗涤沉淀,以去除残留的盐分和杂质。

6. 干燥沉淀:将洗涤后的沉淀离心,并去除上清液。

然后将沉淀在室温下干燥,以去除残留的乙醇。

7. 溶解 DNA:将干燥的沉淀加入适当的缓冲液中,使质粒 DNA 溶解。

可以在缓冲液中加入 RNA 酶以去除 RNA 杂质。

8. 纯化和浓缩 DNA:可以使用柱层析、电泳或其他方法对提取的质粒 DNA 进行进一步的纯化和浓缩。

9. 质量检测:使用琼脂糖凝胶电泳或其他适当的方法检测提取的质粒 DNA 的质量和完整性。

需要注意的是,具体的质粒 DNA 提取步骤可能因使用的试剂盒或实验条件而有所不同。

在进行质粒 DNA 提取之前,应仔细阅读所使用的试剂盒说明书或相关实验方案,并根据实际情况进行适当的调整和优化。

生物学实验 质粒DNA的提取

生物学实验   质粒DNA的提取

实验8 质粒DNA的提取(碱裂解法)一、实验目的了解碱裂解法提取质粒的基本原理和主要应用,掌握碱裂解法提取质粒的实验方法和各种试剂在提取过程中的作用。

二、实验原理碱裂解法是利用细菌染色体DNA与质粒DNA结构的大小差异来分离质粒DNA的。

碱性(pH 12.0~12.5)条件可以破坏碱基配对,宿主和质粒DNA的碱基之间的氢键被破坏。

当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),共价闭合环状的质粒DNA会迅速准确地恢复配对,重新形成完全天然的超螺旋分子;而较大的细菌染色体DNA分子则难以复性,会交联形成不溶于水的线团结构,缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来,而质粒DNA则留在上清液中,用异丙醇沉淀、70 %乙醇洗涤即可获得质粒DNA。

三、仪器设备微量取液器(2 μL;20 μL;200 μL;1 000 μL),tip头,手掌型离心机,1.5 mL离心管, 恒温水浴,制冰机,超净工作台,恒温培养箱。

振荡器,离心机,金属浴,电泳仪,凝胶成像仪。

四、实验试剂(1)溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖;20 mmol/L Tris·HCl(pH = 8.0);10 mmol/L EDTA(pH=8.0),高压蒸汽灭菌(121 ℃,0.105 Mpa)20 min。

4 ℃贮存。

(2)溶液Ⅱ(现用现配):0.2 mol/L NaOH;1 g / L SDS。

(3)溶液Ⅲ(pH 4.8):每100 mL溶液中含5 mol/L乙酸钾60 mL;冰乙酸11.5 mL;H2O 28.5 mL。

(4)RNase(10 mg / mL),LB液体培养基,氨苄青霉素,异丙醇,70 %(V / V)乙醇,无菌水。

五、实验方法(1)分装3 mL LB液体培养基和3 μL氨苄青霉素(50 mg/mL)于15 mL玻璃试管中。

(2)用灭菌牙签挑取一白色单克隆,放入玻璃管内,置37 ℃恒温摇床中以200转/min培养,至OD600=2.0。

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实验8 质粒DNA的提取(碱裂解法)
一、实验目的
了解碱裂解法提取质粒的基本原理和主要应用,掌握碱裂解法提取质粒的实验方法和各种试剂在提取过程中的作用。

二、实验原理
碱裂解法是利用细菌染色体DNA与质粒DNA结构的大小差异来分离质粒DNA的。

碱性(pH 12.0~12.5)条件可以破坏碱基配对,宿主和质粒DNA的碱基之间的氢键被破坏。

当条件恢复正常时(加入酸性试剂中和),共价闭合环状的质粒DNA会迅速准确地恢复配对,重新形成完全天然的超螺旋分子;而较大的细菌染色体DNA分子则难以复性,会交联形成不溶于水的线团结构,缠绕附着在细胞壁碎片上,离心时易被沉淀下来,而质粒DNA则留在上清液中,用异丙醇沉淀、70 %乙醇洗涤即可获得质粒DNA。

三、仪器设备
微量取液器(2 μL;20 μL;200 μL;1 000 μL),tip头,手掌型离心机,1.5 mL离心管, 恒温水浴,制冰机,超净工作台,恒温培养箱。

振荡器,离心机,金属浴,电泳仪,凝胶成像仪。

四、实验试剂
(1)溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖;20 mmol/L Tris·HCl(pH = 8.0);10 mmol/L EDTA(pH=8.0),高压蒸汽灭菌(121 ℃,0.105 Mpa)20 min。

4 ℃贮存。

(2)溶液Ⅱ(现用现配):0.2 mol/L NaOH;1 g / L SDS。

(3)溶液Ⅲ(pH 4.8):每100 mL溶液中含5 mol/L乙酸钾60 mL;冰乙酸11.5 mL;H2O 28.5 mL。

(4)RNase(10 mg / mL),LB液体培养基,氨苄青霉素,异丙醇,70 %(V / V)乙醇,无菌水。

五、实验方法
(1)分装3 mL LB液体培养基和3 μL氨苄青霉素(50 mg/mL)于15 mL玻璃试管中。

(2)用灭菌牙签挑取一白色单克隆,放入玻璃管内,置37 ℃恒温摇床中以200转/min培养,至OD600=2.0。

(3)取菌液1.0 mL于1.5 mL的Eppendorf 管中,将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速3 500 g,离心5 min,收集细菌。

弃上清,倒置于吸水纸上,沥干残液。

(4)每离心管中加入冰上预冷的溶液Ⅰ200 µL,置振荡器上剧烈震荡,悬浮菌体。

(5)加入新配制的溶液Ⅱ400 µL,翻转10次。

冰上放置。

(6)冰浴3 min内迅速加入300 µL溶液Ⅲ,温和翻转10次,冰浴10 min。

(7)将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速12 000 g,离心5 min。

取上清液于新管中,同时加入Rnase(10 mg/mL)10 µL,混匀,37 ℃保温2 hr。

(8)加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),置摇床上震荡5 min,将离心管放入冷冻离心机,调温至4℃,转速12000 g,离心10min。

(9)取上清液于新的离心管内,加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),摇床震荡5 min。

(10)将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速12 000 g,离心10 min。

取上清,加入等体积异丙醇,迅速翻转5次,冰上放置10 min。

(11)将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速12 000 g,离心10 min。

弃上清,倒置于吸水纸上。

加入500 μL 70 %的乙醇轻振,洗涤沉淀。

(12)将离心管放入冷冻离心机,调温至4 ℃,转速12 000 g,离心10 min。

弃上清,室温干燥沉淀30 min。

(13)加入20 μL无菌水溶解DNA,电泳检测。

六、实验结果
质粒DNA电泳图
七、提取质粒DNA过程中应该注意的问题
(1)细菌细胞的裂解是分离质粒DNA的关键步骤。

通常可以加入溶菌酶或SDS促使大肠杆菌细胞裂解。

如果细菌细胞没有完全裂解,会明显降低质粒DNA的回收率。

理想的状况是每一个细菌细胞都能够被充分破裂使质粒DNA顺利溢出,而又没有污染过多的染色体分子。

(2)质粒提取过程中,除规定的实验条件外,应尽量保持低温,避免过酸过碱,操作过程中手法要温和,尽可能避免脱氧核糖核酸酶(DNase)对质粒DNA的降解和破坏。

(3)电泳时上样孔中如果有白色物质,是由于蛋白质没有去除干净。

(4)质粒共有三种构型:
共价闭合环形DNA(cccDNA):质粒的两条多核苷酸链均保持着完整的环形结构,这样的DNA通常呈现超螺旋的SC构型;开环DNA(ocDNA):质粒的两条多核苷酸链中一条保持着完整的环形结构,另一条链出现有一或数个缺口,即OC构型;线性分子(l DNA):质粒DNA经过适当的核酸限制内切酶切割之后,发生双链断裂而形成线性DNA分子,通称L 构型。

相同分子质量质粒的三种构型在正常情况下电泳时,迁移速率分别是:超螺旋
DNA比线性的DNA迁移率大,线性DNA比开环DNA迁移率大。

八、作业
(1)按要求认真撰写报告,包括实验目的、实验原理、实验用品及药品、实验步骤等,要详细阐述质粒提取的基本原理。

(2)提取质粒DNA过程中应该注意的问题是什么?
(3)质粒DNA的三种构型及在正常电泳条件下的迁移情况如何?。

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