circrna与癌症最全癌症相关circrna明星分子总结
circrna与癌症最全癌症相关circrna明星分子总结
BioWorld前不久推送过一篇LncRNA明星分子的总结，受到大家的热烈欢迎，LncRNA与癌症：最全LncRNA明星分子总结。
此次BioWorld做了与癌症相关的circRNA明星分子的总结。
关于circRNA，点击右边查看：circRNA：环状RNA的前世今生以及临床研究思路。
对circRNA的介绍很详尽。
2017
年8月，丹麦奥胡斯大学的LS Kristensen等人在Oncogene 杂志发表题为：Circular RNAs in cancer: opportunities and challenges in the field 的综述文章（图1），总结分析了与癌症相关的circRNAs。
图1circRNA的剪接模式
图2--circRNA的剪接模式circRNA在癌症中的潜在作用
a.miRNA海绵或诱捕物miRNAs是几乎所有人类癌症的发病机制中的重要参与者。
因此，circRNAs作为miRNA的活性调节剂可能参与癌症。
迄今为止只有少数circRNAs与单个miRNA的多个结合位点被发现。
因此大多数circRNAs可能有除调节miRNA外的其他的功能。
越来越多的circRNAs被证实在癌症中具有miRNA抑制功能。
b.影响剪接和转录外显子-内含子circRNAs已被证明与RNA聚合酶II通过U1 snRNP作用，增强其母基因的转录。
许多基因的剪接和转录也可以通过正向剪接和反向剪接之间的竞争间接调控。
这可
能是影响circRNA和典型线性剪接之间平衡的一大未知因素。
c.蛋白支架对酶与底物结合基序的circRNAs可以作为支架促进共定位和反应动力学。
d.蛋白海绵或诱捕物和RNA结合蛋白结合，从而调节它们的活性。
e.翻译功能一些内源性circRNAs含有AUG位点和IRES，但目前对于circRNAs在体内进行翻译的证据有限。
已经表明一些circRNAs在一定的条件下会在某些组织中翻译，但这种关联性尚未在癌症中显现。
图3--circRNA在癌症中的潜在作用
与癌症密切相关的circRNAs和他们可能的功能图4--与癌症相关的circRNAs。
癌症缩写对照表
癌症缩写对照表癌症是一种严重的疾病，其发病率和死亡率不断增加。
在临床诊断和治疗过程中，医生和患者常常会遇到一些缩写词，这些缩写词代表了具体类型的癌症。
为了帮助大家更好地了解这些缩写词的含义，这里提供一个简要的癌症缩写对照表。
1. 常见癌症类型的缩写：- 非小细胞肺癌 (NSCLC)- 小细胞肺癌 (SCLC)- 结直肠癌 (CRC)- 乳腺癌 (BC)- 前列腺癌 (PCa)- 卵巢癌 (OC)- 宫颈癌 (CC)- 胰腺癌 (PDAC)- 胃癌 (GC)2. 癌症相关疗法和治疗方式的缩写：- 化学治疗 (CT)- 放射治疗 (RT)- 靶向治疗 (TT)- 免疫治疗 (IT)- 激素治疗 (HT)- 外科手术 (Sx)- 细胞活化治疗 (CAR-T)- 冷冻治疗 (Cryo)- 高强度聚焦超声治疗 (HIFU)3. 遗传基因突变和检测相关的缩写：- 表皮生长因子受体 (EGFR)- 丝裂素 (p53)- 肿瘤蛋白质 (TP53)- 基因序列变异 (SNP)- 脱氧核糖核酸 (DNA)- 基因突变检测 (GBT)- 质谱分析 (MS)- 基因组学 (Genomics)- 蛋白质组学 (Proteomics)4. 检查和测试方法的缩写：- 影像学 (Imaging)- 放射线透视 (X-ray)- 核磁共振 (MRI)- 磁共振成像 (Magnetic Resonance Imaging) - 胸部 CT 扫描 (CT scan)- 病理学检查 (Pathology)- 组织病理学检查 (Histopathology)- 脑电图 (EEG)- 血液学检查 (Hematology)5. 癌症研究和治疗机构的缩写：- 美国国立癌症研究所 (NCI)- 世界卫生组织国际癌症研究机构 (IARC) - 癌症研究英国 (CRUK)- 欧洲癌症研究组织 (ECCO)- 癌症研究中心 (Cancer Center)- 美国癌症学会 (ASCO)- 癌症预防与控制中心 (CDC)- 癌症护理协会 (ONS)- 世界癌症大会 (WCC)这些只是癌症缩写对照表中的一部分，还有许多其他的缩写词在临床实践中使用。
分子生物学第二十二章癌基因、抑癌基因
癌基因和抑癌基因
1
肿瘤的发生是细胞生长和细胞分化紊乱 所致的细胞无节制增殖的结果。
癌基因—细胞正增殖信号 抑癌基因（肿瘤抑制基因）—细胞负增殖信号 基因组维护基因
2
癌基因和肿瘤抑制基因在细胞增殖中的作用 3
癌基因、抑癌基因与细胞生长
抑癌基因 癌基因
产物
负调控 正调控
细胞
生长因子
4
第一节
增强。 2．表达融合蛋白
慢性粒细胞性白血病:bcr-abl融合基因 9号染色体ABL → 22号染色体BCR → BCR-ABL融合基因→融合蛋白BCR-ABL
(TPK活性)
20
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（四）原癌基因获得启动子或增强子而激活
原癌基因的上游插入外源性启动子或增强子， 可激活原癌基因，使其表达产物增多。 例：禽白血病病毒（ALV）感染细胞后诱发
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（三）BCR-ABL慢性粒细胞白血病治疗的重要分子靶点
慢性粒细胞白血病患者的9号染色体与22号染 色体之间发生易位，从而融合产生了癌基因BCRABL，编码的蛋白质BCR-ABL具有持续活化的蛋白 酪氨酸激酶活性，能促进细胞增殖，并增加基因 组的不稳定性。
例如： 在95%的慢性粒细胞白血病患者中都伴随有
节细胞生长与分化的多肽类物质。
28
作用模式 内分泌 (endocrine) 旁分泌 (paracrine) 自分泌 (autocrine)
29
30
二、生长因子作用机制
与膜受体结合
与胞内受体结合
酪氨酸激酶活化
胞内相关蛋白 质被磷酸化
产生相应第二信使
生长因子–受体
蛋白激酶活化 复合物，活化
相关基因
启动因子
原位癌基因位点
原位癌基因位点
原位癌基因位点是指与原位癌发生和发展相关的基因位点。
这些位点通常与癌症的发生、发展、转移和预后等方面有关。
以下是一些常见的原位癌基因位点：
1.BRCA1和BRCA2基因：这些基因与乳腺癌和卵巢癌的发生有关。
2.TP53基因：该基因与多种癌症的发生有关，包括乳腺癌、肺癌、胃肠道肿
瘤等。
3.PTEN基因：该基因与子宫内膜癌、黑色素瘤、脑瘤等的发生有关。
4.KRAS基因：该基因与结直肠癌、胰腺癌等的发生有关。
5.EGFR基因：该基因与肺癌、结直肠癌、乳腺癌等的发生有关。
6.HER2基因：该基因与乳腺癌的发生有关。
这些基因位点可以通过基因检测进行检测，从而帮助医生评估患者患癌症的风险，并制定相应的预防和治疗方案。
免疫组化转移相关maker
免疫组化转移相关maker
免疫组化是一种用于检测细胞内蛋白质的技术，而转移相关标记物（marker）则是指与肿瘤转移相关的生物标志物。
以下是一些免疫组化转移相关标记物：
1.CD44：是一种与细胞黏附和肿瘤转移相关的分子，可以作为胰腺癌和肺癌的免疫组化标记物。
2.CA19-9：是一种在胰腺癌和胆道癌中表达的糖蛋白，可以作为胰腺癌和胆道癌的免疫组化标记物。
3.E-cadherin：是一种细胞黏附分子，在正常上皮细胞中表达，但在许多肿瘤中失表达，可以作为胃癌、乳腺癌、卵巢癌等肿瘤的免疫组化标记物。
4.Vimentin：是一种中间丝蛋白，在间充质细胞中表达，但在许多上皮性肿瘤中表达增强，可以作为乳腺癌、卵巢癌等肿瘤的免疫组化标记物。
5.N-cadherin：是一种与细胞迁移和肿瘤转移相关的分子，可以作为乳腺癌、卵巢癌等肿瘤的免疫组化标记物。
6.Twist：是一种与细胞迁移和肿瘤转移相关的分子，可以作为乳腺癌、卵巢癌等肿瘤的免疫组化标记物。
7.Snail：是一种与细胞迁移和肿瘤转移相关的分子，可以作为乳腺癌、卵巢癌等肿瘤的免疫组化标记物。
8.FOXC2：是一种与细胞迁移和肿瘤转移相关的分子，可以作为乳腺癌、卵巢癌等肿瘤的免疫组化标记物。
9.PD-L1：是一种与免疫检查点相关的分子，在许多肿瘤中表达增强，可以作为免疫检查点治疗的相关标记物。
这些标记物可以帮助研究者更好地理解肿瘤的性质、生物学行为和预后情况。
但请注意，这仅是一个简要列表，且存在一定的限制，具体情况应结合文献和其他相关数据来获取更全面和准确的信息。
靶向位于线粒体的circRNA SCAR通过减少mROS输出缓解NASH
靶向位于线粒体的circRNA SCAR通过减少mROS输出缓解NASH导读在免疫代谢疾病中发挥核心作用的线粒体拥有自己的基因组。
然而，由于缺乏特定的传递系统，线粒体定位的非编码RNA的功能在很大程度上是未知的。
通过对非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者的肝成纤维细胞中环状RNA(circRNA)表达谱分析，研究发现，在NASH成纤维细胞中，下调的circRNA中大多数为线粒体circRNA。
通过构建靶向线粒体的纳米颗粒，研究观察到，位于线粒体中的脂肪肝相关circRNA ATP5B调节因子(SCAR)抑制了线粒体ROS (mROS)的输出和成纤维细胞的激活。
circRNA SCAR 由PGC-1α介导，与ATP5B结合，通过阻断CypD-mPTP相互作用而关闭mPTP。
过多脂质通过内质网(ER)应激诱导的CHOP而抑制PGC-1α。
在人体内，靶向circRNA SCAR可以减轻高脂肪饮食引起的肝硬化和胰岛素抵抗。
临床上，circRNA SCAR与脂肪变性到NASH这一发展过程相关。
总之，研究确定了一种线粒体circRNA，它促进代谢性炎症并作为NASH的治疗靶点。
实验设计结果1 脂质暴露的成纤维细胞的促炎性表型需要mROS成纤维细胞介导多种疾病的纤维化。
其中，NAFLD影响了全球25%的人口。
为了研究NAFLD 患者成纤维细胞的线粒体代谢，本研究从NASH肝硬化和非NAFLD患者的肝组织中分离出成纤维细胞。
利用海马细胞外通量分析仪，研究观察到与正常成纤维细胞相比，NASH成纤维细胞中细胞外酸化速率(ECAR)和耗氧率(OCR)增加(图1A)。
然而，NASH成纤维细胞中ECAR/OCR比值显著升高(图1B)。
同样，棕榈酸盐处理的正常成纤维细胞的ECAR/OCR比值也明显增加(图1C)，这概述了体外脂质暴露。
另外，棕榈酸盐处理略微增加了成纤维细胞的凋亡(图S1A)。
总之，这些数据表明，在脂质负担下，成纤维细胞中ATP的产生从线粒体氧化磷酸化转变为糖酵解。
癌基因、抑癌基因、生长因子
癌基因、抑癌基因和生长因子肿瘤的发生是由于细胞的增殖与分化失常所导致的恶性生长现象。
在正常情况下，细胞的增殖受到多种因素的调控，调控失衡可能引起异常的增殖和持续的分裂。
细胞的正常生长与增殖是由两大类基因来调控的，一类是正调节信号，促进细胞生长和增殖，并阻止其发生终未分化，调控失常时表现为肿瘤细胞的恶性生长，现已知多数癌基因（oncogene）起这一作用；另一类为负调节信号，抑制增殖，促进分化、成熟和衰老，最后调亡（apoptosis），抑癌基因（ancer suppressive gene，anti-oncogene）则在这方面发挥作用。
当这两类信号在细胞内产生的效应相互拮抗，维持平衡，对正常细胞的生长、增殖和衰亡进行精确地调控。
当这两类基因中任何一种或它们共同的变化，即有可能引起细胞增殖失控导致肿瘤的发生。
癌基因与抑癌基因的作用机制涉及基因表达调控及细胞分裂，分化过程。
这些生物学效应又与癌基因表达产物——类生长因子多肽及其受体有着极为密切的关系；癌基因可以编码类生长因子多肽及其受体分子，通过细胞内信息传递系统刺激细胞增殖。
由此可见，肿瘤的发生与癌基因、抑癌基因及生长因子三者的功能是密切相关的。
第一节癌基因癌基因最初的定义是指能在体外引起细胞转化、在体内诱发肿瘤的基因。
它是细胞内总体遗传物质的组成部分，人们将这类存在于生物正常细胞基因组中的癌基因称为原癌基因（proto －oncogenes，pro－onc）或称细胞癌基因（Cellular－oncogene，c－onc）。
在正常情况下，这些基因处于静止或低表达的状态，不仅对细胞无害，而且对维持细胞正常功能具有重要作用；当其受到致癌因素作用被活化并发生异常时，则可导致细胞癌变。
癌基因的名称一般用3个斜体小写字母表示，如 myc、 ras、 src等。
一、病毒癌基因肿瘤病毒是一类能使敏感宿主产生肿瘤或使培养细胞转化成癌细胞的动物病毒，根据其核酸组成分为DNA病毒和RNA病毒（即逆转录病毒retrovirus）。
非编码rna基因名词解释
非编码RNA（Non-Coding RNA，ncRNA）是指在细胞中转录而成的，但不编码蛋白质的RNA分子。
相对于编码蛋白质的mRNA（messenger RNA），ncRNA在过去被认为是"噪音"或"废物"，但随着研究的深入，发现它们在细胞生物学中扮演着关键的角色。
以下是一些与非编码RNA相关的术语的解释：1.miRNA（MicroRNA）：▪微小RNA，长度约为20-25个核苷酸，能够通过与mRNA结合，调控目标基因的表达。
它参与了许多生物学过程，如细胞周期调控、细胞分化和凋亡。
2.siRNA（Small Interfering RNA）：▪小干扰RNA，与miRNA相似，也是长度约为20-25个核苷酸的RNA分子，主要通过RNA干扰途径抑制目标基因的表达。
它可以用于实验室研究中的基因沉默。
3.lncRNA（Long Non-Coding RNA）：▪长非编码RNA，相对于miRNA和siRNA，lncRNA更长，一般指超过200个核苷酸。
lncRNA具有多样的功能，包括调控基因表达、染色体结构和细胞周期等。
4.piRNA（Piwi-Interacting RNA）：▪Piwi相互作用RNA，是一类长度约为24-31个核苷酸的小RNA，主要与Piwi蛋白相互作用，参与调控生殖细胞发育和维护基因组稳定性。
5.snRNA（Small Nuclear RNA）：▪小核RNA，主要存在于细胞核中，与蛋白质结合形成小核糖核蛋白颗粒，参与剪接体的形成和催化。
6.snoRNA（Small Nucleolar RNA）：▪小核仁RNA，主要存在于细胞核仁中，参与核仁的形成和核糖体RNA的修饰。
7.circRNA（Circular RNA）：▪环状RNA，是一类闭环结构的RNA分子，其结构相对稳定，具有较长的半衰期。
circRNA参与多种生物学过程，包括调控基因表达和作为miRNA的“海绵”调节miRNA的活性。
胰腺癌
诊
断
胰腺癌的诊断目的： 明确诊断 术前判明临床分期 确定有无剖腹手术必要 估计根治或姑息手术相对可能性
诊断程序
安全－有效、费用－效果 、互补－深入 首选B超或CT进行检查 胰头癌：CT发现肿块，并有胆管扩张存在，可 直接手术，而不必再做FNA或其他检查 胰体、尾癌：CT检查阳性并伴有转移者，可通 过FNA获得确诊，从而可避免不必要的手术 CT检查结果不典型或正常，但仍有可疑者，可 再进一步通过ERCP或／和FNA检查以明确诊断
胰癌相关抗原（PCAA） 从胰腺癌病人腹水中分离出来的一种糖蛋 白 正常血清PCAA上限为16.2 µg/L 胰腺癌患者PCAA阳性者占53％，其中I期患 者阳性率为50％ 但慢性胰腺炎和胆石症患者的阳性率亦分 别高达50％和38％ 提示PCAA诊断胰腺癌的特异性较差
实验室检查
酒精致癌物质（亚硝胺）
致癌
病因与发病机制
饮食因素 高甘油三酯
高胆固醇
低纤维素
胰腺癌 咖啡饮料
病因与发病机制
环境因素 某些金属 焦碳 煤气厂工作 石棉 干洗中应用祛脂剂 β-萘酚胺、联苯胺、甲基胆蒽、N-亚硝基甲 胺、乙酰氨基芴、烃化物
病因与发病机制
胰腺炎 糖尿病 内分泌功能紊乱
胰腺癌 Pancreatic Carcinoma
昆明医学院第三附属医院 腹外二科
杨步荣
概
述
胰腺癌主要指胰腺外分泌腺腺癌 (约占90％) 全身各种癌肿1％～4％ 消化道恶性肿瘤8％～10％ 发病率达6.1/10万 居恶性肿瘤发病率的第 6 位 发病年龄以45～65岁最为多见 男:女 国外为1.3:1 国内为1.8:1
环状RNA
Anchor alignments can be extended such that the orginal read sequence aligns completely
The inferred breakpoint is flanked by GU/AG splice signal
Identify that circRNAs are not just rare and specifically expressed
Map the terminal parts of each candidate read independently to the genome to find unique anchor positions
Anchor alignments can be extended such that the orginal read sequence aligns completely The inferred breakpoint is flanked by GU/AG splice signal
Sequence conservation within circRNAs
qPCR test circRNA
DigesLeabharlann with RNase R• 24h after blocking transcription circRNAs were highly stable, exceeding the stability of the housekeeping gene GAPDH.
27 February 2013 Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency Sebastian Memczak, Marvin Jens, Antigoni Elefsinioti, Francesca Torti, Janna Krueger, + et al. Nature 495, 333-338 doi:10.1038/nature11928
癌基因名词解释细胞生物学
癌基因名词解释细胞生物学在细胞生物学中，癌基因（Oncogene）是一类与肿瘤形成和发展相关的基因。
它们是正常细胞基因的变异形式，当发生突变或异常表达时，会促进细胞增殖和生长，导致癌症的发展。
以下是对癌基因相关术语的解释：
1. 活化突变（Activating mutation）：这是指癌基因发生的突变，使其产生过度活化或异常激活的状态。
活化突变可以导致癌基因持续地发送促进细胞生长和增殖的信号。
2. 前体癌基因（Proto-oncogene）：前体癌基因是指正常情况下在细胞内起调控细胞生长和分化等正常功能的基因。
当前体癌基因发生突变或异常表达时，可能转化为致癌基因（Oncogene）。
3. 增殖信号通路（Proliferation signaling pathway）：增殖信号通路是一系列信号分子和细胞因子参与的复杂网络，调控细胞生长和分裂。
癌基因的突变可能会导致增殖信号通路过度激活，促进细胞异常增殖和癌症发展。
4. 癌基因激活（Oncogene activation）：癌基因激活是指癌基因发生突变或异常表达，导致其功能失调并促进肿瘤的形成。
这可能包括增强细胞生长、抑制凋亡（细胞自我死亡）或增加血管生成等异常生物学过程。
5. 癌基因抑制（Oncogene suppression）：癌基因抑制是指通过特定机制来抑制癌基因的异常活性或表达，以减缓肿瘤的发展。
这可以通过药物、基因治疗或其他方法来实现。
癌基因的研究对于理解癌症的发生机制、诊断和治疗具有重要意义。
通过深入研究癌基因及其调控通路，科学家们努力寻找新的治疗
策略，以便更好地控制癌症的发展和提供更有效的治疗选择。