乳腺癌组织染色体17p13 的杂合性缺失分析
ｉ、 ●肿瘤｝１９９８年９月（第ｌＢ卷第５期） ３１９ 论著·
乳腺癌组织染色体１７ｐ１３的杂合性缺失分析
赵新泰蒋惠 万大方顾健人 目的 拴测乳脾癌组织在染色体Ｉ７ｐ１３区各位点的矗 台性缺失．用方法通过Ｓｏｕｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔ分析ＶＮＴＲ挥针 ＹＮＺ２２的杂台性缺失．用嗽扩增徽卫量ｔ复序列后．再 位素标记潼性肢分离分析徽卫量ｍａｒｋｅｒ的杂舍性缺失． 结果 ｌｌ例乳腺癌组织中有３例在染色体１７ｐ１３．３区有杂 舍性缺失．占２７ ．缺失的上限为紧部端粒的Ｄ１７Ｓ１８６６位 点，缺失至Ｄ１７Ｓ１８４０位点，缺失的下限尚特确定．位于辩色 体１７ｐ１３．Ｉ区的ＴＰ￥３位点有Ｉ例变化产生新长度的徽卫星 重复序列．４饲存在杂舍性缺失，其中２例在１７ｐ１３．３区也 有杂台性缺失．结论乳腺癌组织在染色体１７ｐ１３．３区有 较高的杂音性蛱失。预示谴区可能存在育关的抑癌基因． １７ｐ１３．１区的ＴＰ５３位点也有变化，说明ｐＳ３基园盈产袖在 乳腺癌的癌变过程中也起着一定的作用． 关键词乳裱肿癌杂舍性缺失染色体１７ｐ１３ ＡＮＡＬＹＳＩＳ ｏＦ Ｉ舯ＳＳ ｏＦ ＨＥＴＥＲｏＺＹＧｏｓｌＴＹ ｏＮ ＣＨＲｏ－ ＭＯＳＯＭＥ ＢＡＮＤ １７ｐ１３ ＩＮ ＢＲＥＡＳＴ ＣＡＲＣＩＮ０ＭＡ Ｚｈａｏ Ｘｉ￣ａｌ，Ｊｉａｎｇ Ｈ ．矸 凸ｚ ｇ．Ｇｕ Ｊ 啪．Ｎａｔｉ￣ Ｌａ￣ｒａｔｏｒｙ Ｏｎｃｏｇｅｎｅｓ ａｎｄ Ｒｅｌａｔｅｄ Ｇｅｎｅｓ，Ｓｈａｎｇｈａｉ Ｃａｎ－ ０ｃｒ ｌ’嘶ｔ；‘Ｉ‘．Ｓｈａｎｇｈａｉ ２０００３２ ０ｂｊｅｃｔｉｖｅ ｔＤｅｔｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｌｏｓｓ ｏｆ ｂｅｔｅｒｏｚｙｇｏｓｉｔ３ｒ（ＬＯＨ）０ｎ ｃｈｒ０１￣ｏｓ０ｎｔｅ ｂａ删１７ｐ１３ Ｉｎ ｂｒｅａｓｔ ｃａｒｃｉｎｏｍａ．Ｍｅｔｈｃ￣ｉｓ ｔ Ｌ０Ｈ ｏｆｔｈｅｌｅｃｔ ｏｉｔ １７ｐ１３ ｗａｓｕａｉｙｓｅｄ ｗｉｔｈＳｏｕｔｈ盯－ｈｙ－ ｂｒＩｄ／ｚａｔｌｏｎ ｂｙ吲ｎｇ ｐｒｏｂｅ ｏｆ ｗ ａｈｉｅ ｎｕｍｂｅｒ Ｕｔ］ａｄｅｍ ｒｅ－ ｐｅａｔｓ ＹＮＺ２２．ａｎｄ ｗｉｔｈ ＰｃＲ ｏｔ ｍｌｃｒｏｓａｔｅｌｌｌｔｅ ｍｒｌｋｅｒ￣． ｒａｄｉｏｉｓｏｔｏｐｅ ｌａｂｅｌｉｎｇ ａｎｄ ｓｅｐａｒａｔｉｏｎ“ｄｅｎａｔｕｒｉｎｇ ｐｏｌｙａｅｒｙ－ ｌ＿ ｄ．Ｉｅ】．Ｒｅｓｕｌｔｓｌ３／１１（２７ ）ｃ蜊ｏｆ ｂｒｅａｓｔ ｃ＿ｒｃｉｎｏｍ ｗｅｒｅ ｓｈｅｗｅｄ ＬＯＨ ｏＢ ｃｈｒｏｍ￣ｏｍｅ ｂａｎｄ １７ｐｌ３－３．Ｕｐｐｅｒ ｌｉｍｉｔ ｏｆ Ｌ０Ｈ ｉｓ］ｏｃａｌｅｄ ａｔ Ｄｌ７Ｓ１Ｓ“ｎｅａｒ ｔｈｅ ｔｅｌｏｍｅｒｅ ｏｆ ｓｈｏｒｔ＿ｍ ｏｆ ｃｈｗｍｅ １７．ｗｈｉｌｅ ｌｏｗ ｌｉｍｉｔ ｏｆ ＬＯＨ ｎｅｅｄｓ 协ｂｅ ｆｕａ＇ｔｈａｒ ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ． ｒｅ■ｎ ｎｅｗ ｌｅｎｇｔｈ．ｆ ｍｌ－ ｅｒｎｓａｔｅＵｉｔｅ ｒｅｐｅａｔｓ＊ｉｔ ｔｈｅ ＴＰＳ３ ｉｎｒｎｓ Ｏｎ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ ｂａｎｄ １７ｐ１３．１ｉｎ蚰ｅ ｃａｓｅｏｆ ｂｒｅａｓｔ ｃａｒｄｎｏｍ，ａｎｄ Ｌ０Ｈ＊ｔｔ ＦＡｔ１１１１ｅ ｌ０“￥ｌ￥ｓｈｏｗｅｄ ｉｎ ４ ｏｆ ｈｒｅａｓｔ ｃａｒｃｉｎｏｍａｓ ｗｈｉｌｅ Ｌ０Ｈ ａＩ曲 ｗａｓ ｄｅ／ｅｃｈ￣ｄ恤ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ ｂａｎｄ １７ｐ１３．３ｉｎ名ｏｆｔｈｅｍ． ＣｏｎｃＬｕｓｉｏｎ±Ｈｉｇｈ Ｊｎｃｔｄｅｕｇｅ ｏｆ ＬＯＨ Ｏｌｌ ｃｈｒａｍｏｓｔ￣ｍｅ ｂ矗｜ｄ ；了‘７口２．
１７ｐ１３－３ ｉｎ ｂｒｅａｓｔ￣ａｌ￣ｉｌｌｏｍａ ｗａｓ ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ．Ｔｈｉｓ ｌｍｐｌＩ∞ ｔｈａｔｔｌＮｒｅｉｓ－ｔｍｎｏｒ ｓｕｐｐｒｅｕｏｒ ｓａｎｅ ｏｉｔｔｈｉｓ ｒｅｇｉｏｎ－Ｔｂｅｒｅ ｔｔｒｌ￣ａｂｅｒｒａｔｉｏｎｓ ａｔ ＴＰ驺ｌｏｃｕｓ“ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ ｂａｎｄ １７ｐ１３． Ｉ－ｗｈｋｋｉｎｄｉｃａｔｅｔｈｅ ｐ５３ ｇｅｎｅ ａｎｄｉｔｓｐｒｏｄ ｈａｖｅ●ｒｅ］ｅｉｎ ｂｒｅａｓｔ ｃａｒｅｌｎｏｇｅｎｅｓ￣， Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ Ｂｒｅａｓｔ ｃａｒｃｉｎｏｍａ Ｌｅｓｓ．ｒ ｂｅｔｅｒｏｚｙｇｏｓｉｔｙ Ｃｂｒｏｍ￣ｏｍｅ ｂａｎｄ １７ｐ１３ 。ＴＵＭＯＲ（Ｓｈａｎｇｈａｉ）１９９８，１８：３１９ 杂合性缺失（ＬＯＨ）发生在人类恶性肿瘤中．根 据最近的癌变模型，肿瘤是由一十细胞因其渐进性 的遗传性改变导致不断增殖而发生的。杂合性缺失 反映了细胞遗传性的改变．一般认为，如果在某种肿 墙中有高频率（＞２０ ）的ＬＯＨ发生，璜示着在缺 失范围中有抑癌基因的存在。在许多肿瘤，如乳腺 癌、肝癌中都发现染色体１７ｐ１３．３区有ＬＯＨ口】 因 此．作者也进行了乳腺癌组织染色体１７ｐ１３的ＬＯＨ 分析。现将结果报告如下。 材料和方法 乳睫癌盈癌旁标本 ｕ例乳腺癌及癌旁组织来自上医大肿瘤医院． 手术中切除的组织速冻后，保存于一７Ｏ℃冰箱中 ＝、组织ＤＮＡ的提取 从低温冰箱中取出组织，置组织碾磨器中碾碎， 按ｓＤｓ／蛋白酶Ｋ．酚／氯仿抽提法０ 提取组织 ＤＮＡ。 三、杂台性映失（ＬＯＨ）分析 参照文献踟。 结 果 作者单位·上毒市肿瘤研究所 癌基因瘦相关基因目塞重点实验蛊‘上簿２０∞∞’ 实验中共检测了１１份乳腺癌及癌旁组织在染
巴 ３２０ ＴＵＭＯＲ（Ｓｈａｎｇｈａ１）Ｓｅｐｔｅｍｂｅｒ １９９８，Ｖｏ］·ｌｇ Ｎｏ·５ 色体ｌ７ｐ１３．３区９个位点和ｌ７ｐｌ３．１区１个位点的 杂合性缺失情况。每个样品在每个位点的ＬＯＨ情 况总结于表２中。一些分析结果。（见插页图）． 从表２中可见．有３份样品（Ｎｏ．２，４，９）在染色体 １７ｐ１３．３区的Ｄｌ７Ｓ１８４０位点至Ｄｌ７Ｓ１８６６位点均 有ＬＯＨ，但Ｎｏ．９样品在Ｄ１７Ｓ８４９位点保持杂合 性。虽然作者也检测了位于着丝粒方向的ＹＮｚ２２， Ｄ１７Ｓ６５４和Ｄ１７Ｓ５２５位点的ＬＯＨ情况，但这３份 样品在这３个位点均呈纯合子，无法判定是否有缺 失。其余８份样品在ｌ７ｐｉ３．３区均无ＬＯＨ。同时作 者还检测了乳腺癌样品在位于１７ｐ１３．１区的ＴＰ５３ 位点的ＬＯＨ情况，可以看到有４份样品（Ｎｏ．２，９， ｌＯ，ｌ１）在该位点有ＬＯＨ，其中包括两份在ｌ７ｐ１３．３ 区有ＬＯＨ的样品（Ｎｏ．２，９）和两份在１７ｐ１３．３区无 ＬＯＨ的样品（Ｎｏ．１０，ｕ）。１份样品（Ｎｏ．５）在ＴＰ５３ 位点有变化，产生了新的长度的微卫星重复序列。 表１位点名称、引物序列和ＰＣＲ退火疆度
表２乳腺癌组织在染色体１７ｐ１３；３盼杂台性缺失
（一） 无杂合性 失｝（－Ｉ－）·有杂音性蛱失ｌ（～）ｔ纯音于 （－），鬣卫星重复序刊长短政变 讨 论 本研究对乳腺癌组织进行了染色体１７ｐ１３．３区 ９个位点和１７ｐ１３．１区ＴＰ５３位点的杂合性缺失分 析．均发现有杂合性缺失。虽然检测的标本数不多， 在ｌｌ份标本中有３份自Ｄ１７Ｓ１８４０位点至 Ｄ１７Ｓ１８６６位点有ＬＯＨ，占２７％。这一比例与国外 报道近似。Ｄ１７Ｓ１８６６位点紧邻ｌ７号染色体端粒，可 以认为乳腺癌组织在１７ｐ１３． ３的缺失上限邻近端粒 处。Ｄ１７Ｓ１８４０位于１７ｐ１３．３的着丝粒方向．由于缺 失标本在Ｄ１７Ｓ１８４０至着丝粒间的ＹＮＺ２２， Ｄ１７Ｓ６５４和Ｄｌ７Ｓ５２５位点都呈纯合子，所以，本实 验尚无法确定乳腺癌组织在１７ｐ１３．３区的下限缺失 范围。通过扩大检测的标本数和位点数，将能进 步
确定缺失范围。作者在肝癌研究中，巳发现在染色体 ｛肿瘤￣１９９８年９月（第１８卷第５期） ３２１
短篇报道· 咽部脊索瘤２例报告
刘庆荣 ｌ 床资料倒ｌ女．３５岁．咽部肿胀半年伴吞 咽田难４月、呼吸田难２月。咽部检查见上腭部悬雍 垂后方之咽后壁悬垂状肿物约核桃大小，质硬。ｘ光 片提示肿块位于顼１～４椎体前，第２顼椎前缘骨质 破坏．术中见肿块位于咽后壁粘膜下，紧附于椎体 前，上起口咽悬雍垂下端，下至喉前庭正中，包膜不 完整．将肿块切除。大体检查：灰白与暗红色相问组 织二块，大者６ ｃｍ×３．５ ｃｍ×１．５ ｃｍ，小者５ ｃｍ× ３．５ ｃｍ×１．５ ｃｍ，无完整包膜，切面灰白色半透明， 有多个小囊腔，囊腔内含粘液样物． 例２女，３１岁。说话不清１年，咽部肿胀半月。 检查咽部见咽后壁半球状肿块约蚕豆大，上起鼻咽， 下至口咽部，界限清楚，质硬，不活动，术中见肿块位 于咽后壁牯膜下，表面光楫，有包膜。分离包膜见肿 块呈胶冻样，内有一囊腔，腔内含粘液样物。将肿块 分块切除。大体检查ｔ灰白色半透明胶冻样组织数 块ｔ总体积３ ｃｍ×３ ｃｍ×２ ｃｍ。 ＝、显傲镜括童 上述两例均显示瘤细胞圆形、大 小不一、核小、圆或卵圆形、深染。胞浆内含粘液，部 分瘤细胞呈空泡状胞浆的液滴状细胞（ｐｈｙｓａｌｉｆｅｒ－ ＯＵＳ ｃｅｌ１）或核偏一侧的印戒状细胞。瘤细胞排列呈 不规则之小叶状或条索状，其间为丰富的粘液样间 质ｔ有的小叶内充满大量粘液，当中仅散在少数瘤细 作者单位ｔ量州省＾昆医院扁理辩（量阳５５０００２） 胞索。ＰＡＳ染色瘤细胞胞浆（＋），脂肪染色（一）。病 理诊断，咽部脊索瘤． 三、讨论脊索瘤（ｃｈｏｒｄｏｍａ）为起源于脊索胚胎 残留组织的低度恶性肿瘤，电镜及免疫组化提示为 上皮源性，系外胚层来源，较为少见［“．报道约占全 都恶性肿瘤的０．４３ ，占骨肿瘤的０．２ 。由于脊 索终端弯曲且分支多，易于残留或迷离于椎体，故该 瘤主要发生在脑脊髓轴的两端，颅底占３５ ．骶尾 部占５０％口】．发生于咽部者罕见，仅见个案报道。 咽脊索瘤多见于成人，临床主要表现为无痛性 咽部肿块，生长埋慢．早期无明显症状或仅有吞咽痒 感或咽喉异物感．肫块长大后阻塞咽部可出现说话 不清，咽部肿胀、吞咽或呼吸田难。该瘤无完整包膜 或仅有假包膜，常浸润周围的软组织和骨组织。由于 手术不易切除干净，且对放疗不敏感，因此治疗上宣 采用手术彻底切除，术后追加放疗． 咽部脊索瘤术前不易诊断，主要靠病理确诊。病 理上主要与转移性粘液腺癌，脂肪肉瘤、软骨肉瘤鉴 别 】。本组２倒瘤细胞呈小叶状条索状排列；间质粘 液丰富｝瘤组织中均见特征性的液滴状细胞｛ＰＡＳ 染色瘤细胞浆（＋），脂肪染色（一），支持脊索瘤的诊 断。 参考文献 １米集，丁长林，向理科．等．２Ｏ倒脊童瘩的免疫组组化学＿醍超蠹 结构理禀．中华病理学甜卷ｔ１９９２，２１（２）ｔ１０６ ２陈京让，兰斌尚．２５刨青素窟临床病理理禀．临床与实验病理学 泵京－１９９０，６（２），９９ ３ Ｍｅ ＪＭ，Ｇｉｒａｌｄｏ ＡＡ．Ｃｈｏｒｄｏ￣ｈａ－ｎ ｉｍｍｕｎｏｈ［ｓｔｏｌｏｓｉｅａ］ｓｔｕｄｙ． ＨｕｍＰｓｔｈｏｌ－１９８６，１７ｌ７４４ ４武投医学院病理缸研宣．中山医学院病理缸研童主编．外科扁 理学上册．蕈１菔．鞠北Ｉ南｜匕＾匪出版桂．１９７ＢＩ ４３７ （牧稿ｔ１９９７—１１—１４）
HLA基因的杂合性缺失是肿瘤免疫逃逸的重要机制
HLA基因的杂合性缺失是肿瘤免疫逃逸的重要机制
Allele-Specific HLA Loss and Immune Escape in
LungCancer Evolution
Cell
概述
●肿瘤新抗原的识别是产生免疫应答的关键，而HLA的表达及结构的完整性是新抗原递呈的基础；
●作者开发了一种研究HLA LOH（loss of heterozygosity in
human leukocyte antigen）的分析方法，并通过独立的两种方式进行了验证；
●利用该方法在肺癌数据集中分析发现，40%的NSCLCs样品中均存在HLA LOH现象；
●结果证实：HLA LOH是导致肿瘤免疫逃逸的主因之一。
LOHHLA算法及验证
LOHHLA算法
算法概述：
1、提取比对到HLA基因上的reads，进行HLA分型；
2、将目标reads重新比对到分型参考序列上；
3、根据比对结果提取多态性位点信息；
4、统计每个多态性位点对应logR及BAF；
5、通过肿瘤纯度信息，估算各等位基因座对应的CNV。
●LOHHLA分析结果验证
3p杂合性缺失与非小细胞肺癌的相关性
・１０６０・
参考文献
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p53在胶质瘤中的研究进展
p53在胶质瘤中的研究进展
林香桃;谈顺
【摘 要】胶质瘤为起源于神经胶质细胞的肿瘤,是中枢神经系统最常见的原发性恶性肿瘤,呈浸润性生长,复发率高,治疗敏感性差,预后不佳.p53作为抑癌基因,通过诱导细胞凋亡、调控细胞周期、调节DNA修复及抑制血管生成等机制,在机体组织细胞的生长、发育和分化过程中起着重要作用.大量研究证实,p53突变与胶质瘤的发生、发展有关,对胶质瘤的治疗和评估预后具有重要意义,此文就p53在胶质瘤中的研究进展作一综述.%Glioma originates from glial cells, which is the most
common primary malignant tumor of the central nervous system. It is
characterized by invasive growth, high recurrence rate, poor treatment
sensitivity and poor progno-sis. p53, as a tumor suppressor gene, plays an
important role in the growth, development and differentiation of human
tis-sue cells by inducing cell apoptosis, regulating cell cycle, regulating
DNA repair and inhibiting angiogenesis. A large number of studies have
confirmed that p53 mutation is associated with the occurrence and
development of gliomas, which has great significance for the treatment
一例新生突变16p13.11微缺失综合征的思考
一例新生突变16p13.11微缺失综合征的思考
[摘要]目的探讨CMA在胎儿侧脑室增宽中应用价值，为临床遗传咨询提供指导价值。方法 患者孕25+5周，因“超声提示胎儿双肾盂分离（左侧7mm、右侧4mm）、侧脑室宽度（左侧10mm、右侧8.6mm）”于2021年1月12日在宁夏回族自治区银川市妇幼保健院产前诊断中心进行遗传咨询， 知情同意后抽取胎儿羊水，采用G显带染色体核型分析技术和染色体微阵列芯片技术（chromosomal
microarray，CMA），进行遗传学分析和产前诊断。结果 胎儿羊水样本CMA测序结果为：arr[GRCh37]16p13.11(15049829_16258367)x1，提示胎儿16号染色体p13.11处存在约1.21Mb缺失，为致病性拷贝数变；通过父母的CMA溯源，父亲未检测到样本16p13.11存在片段缺失，但检测到7号染色体上意义不明的拷贝数重复，表型正常；母亲检测未见异常，表型正常。经产前诊断遗传咨询后，本例孕妇及家属选择自愿终止妊娠。结论 对于产前超声提示侧脑室增宽的胎儿应建议CMA检测，进而发现更多染色体异常，指导预后，利于优生。 关键字16p13.11微缺失综合征；侧脑室增宽；CMA；产前诊断
染色体微缺失及微重复是指染色体细微片段发生缺失或者重复，使得正常基因发生剂量改变进而导致的临床表现较复杂的一种染色体疾病。16p13.11微缺失综合征是微缺失、重复综合征中较多见的一类染色体异常，是由于16号染色体短臂上的大片段基因缺失引起的染色体异常疾病，临床上具有广泛表型表现的多效性基因组变异，包括神经发育表型如孤独症、智力低下、癫痫和学习困难，以及非中枢神经系统表型如身体畸形和先天性异常[1]。染色体微阵列分析（Chromosomal Microarray Analysis, CMA）又称染色体芯片，可在全基因组范围内同时检测染色体微缺失、微重复等基因组失衡现象，且具有分辨率高、检测流程标准化、无需细胞培养，特异性、稳定性好等优点，目前已被作为产前、产后遗传病诊断中的一线诊断技术。 病例资料
散发性肾母细胞瘤中DNMT1基因多态性和1p、16q染色体杂合性缺失的临床价值
散发性肾母细胞瘤中DNMT1基因多态性和1p、16q染色体杂合性缺失的临床价值
白锐;胡晓丽;李艳芸;赵林胜;耿鑫;张维铭
【摘 要】目的 探讨散发性肾母细胞瘤(WT)中DNMT1基因rs75616428、rs165999593多态性及1 p、16q染色体杂合性缺失(LOH)的价值.方法 选择WT患者肾组织35份(观察组)及正常肾组织30份(对照组),应用聚合酶链反应一双向测序法及限制性片段长度多态性检测rs75616428和rs165999593的基因型；免疫组织化学技术单克隆抗体检测前120aa(裸区段)的表达情况；微卫星灶扩增一聚丙烯酰胺电泳—银染法检测不同临床分期1p、16q染色体LOH.结果 观察组rs16999593位点的多态性检测发现,杂合子22例,变异型纯合子3例.免疫组化显示,DNMT1蛋白前120aa裸区段在对照组肾组织以肾小管上皮着色为主,且在WT组织中表达略显升高.临床Ⅲ～Ⅳ期发生1p、16q LOH比例显著高于I～Ⅱ期(P＜0.05).结论 DNMT1基因rs16999593多态性可以评估胎儿WT发生的风险；1p、16q LOH检测可作为诊断WT的简易方法.
【期刊名称】《山东医药》
【年(卷),期】2011(051)049
【总页数】3页(P84-86)
【关键词】肾母细胞瘤;DNA甲基化转移酶-1;单核苷酸多态性;杂合性缺失
【作 者】白锐;胡晓丽;李艳芸;赵林胜;耿鑫;张维铭 【作者单位】天津医科大学基础医学院,天津300070;天津医科大学基础医学院,天津300070;天津医科大学基础医学院,天津300070;天津医科大学基础医学院,天津300070;天津医科大学基础医学院,天津300070;天津医科大学基础医学院,天津300070
【正文语种】中 文
【中图分类】R737
肾母细胞瘤(WT)是一种源于后肾胚胎组织、由间叶及上皮组织构成的恶性肿瘤，临床伴有多种器官发育畸形，占儿科肿瘤的87%［1］。DNMT1是DNA甲基化转移酶家族中的一个重要成员，其N端具有与DNA序列及多种蛋白如DMAP1、DNMT3a结合的特性，我们推测DNMT1蛋白在此区段的多态性可能会影响DNMT1与DMAP1、DNMT3a蛋白的结合。2010年8月～2011年10月，我们观察了35例WT患者肾组织DNMT1基因多态性，并探讨了DNMT1基因多态性及1p、16q染色体杂合缺失(LOH)与WT临床病理特征的关系。现报告如下。
广西散发性结直肠癌缺失基因突变及杂合性缺失的研究
・２ｌ６２・ 广东医学２０１１年８月第３２卷第１６期 Ｇｕａｎｇｄｏｎｇ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｊｏｕｒｎａｌ Ａｕｇ ２０１１，Ｖｏ１．３２，Ｎｏ．１６
广西散发性结直肠癌缺失基因突变及杂合性
缺失的研究珠
龙陈艳 ，徐艳松 ，李卫 ，高枫 ，唐卫中
广西医科大学第一附属医院 结直肠肛门外科， 儿科（南宁５３００２１）
【摘要】 目的通过分析ＤＣＣ基因突变和杂合性缺失，初步探讨ＤＣＣ基因在广西散发性结直肠癌发生发展 中的作用和意义。方法 用单链构象多态性和ＤＮＡ测序方法分析７３例散发性结直肠癌患者癌组织及其正常黏 膜组织ＤＣＣ基因第４、２８、２９号外显子点突变。用Ｍｓｐ Ｉ酶酶切及琼脂糖凝胶电泳分析Ｍｐ Ｉ酶切位点的杂合性 缺失（ＬＯＨ）。结果ＤＣＣ基因第４外显子２０１密码子（Ｃ＞Ｇ）突变６６例，发生率为９０．４％。第４内含子第８碱基 ｌ例Ａ＞Ｃ多态性改变，发生率为１．４％。第２８及２９号外显子未见异常。Ｍｓｐ Ｉ—Ｌ０Ｈ ７例，ＬＯＨ率为２９．２％。 结论２０１密码子（Ｃ＞Ｇ）为正常的多态现象，与结直肠癌的发生发展无关，不能作为结直肠癌的生物指标。内含 子ＮＴ＿０１０９６６：ｇ．１４５９４４３ Ａ＞Ｃ为偶见的多态性改变。而Ｍｓｐ Ｉ位点ＬＯＨ可能与晚期结直肠癌有关。 【关键词】ＤＣＣ基因；单链构象多态性；ＤＮＡ测序；突变；杂合性缺失
结直肠癌是最常见的消化道肿瘤之～，２００８年美
国约有１５万例新发病例，而同年估计将有４９ ９６０例患 者死于结直肠癌，其发病率和病死率分别居所有癌症 的第４位和第２位…。而抑癌基因的异常在结直肠癌
的发生、发展过程中起重要作用，结直肠癌缺失基因
（ｄｅｌｅｔｅｄ ｉｎ ｃｏｌｏｒｅｅｔａｌ ｃａｒｃｉｎｏｍａ，ＤＣＣ）是目前发现最大
的抑癌基因之一。本研究通过分析ＤＣＣ基因突变和
杂合性缺失（ＬＯＨ）来初步探讨ＤＣＣ基因在广西散发 性结直肠癌发生发展中的作用和意义。
p53基因突变检测方法的演进和趋势
p53基因突变检测方法的演进和趋势
张艳霞;杨学习
【摘 要】p53基因是肿瘤蛋白P53 (tumor protein p53)的编码基因,在维持基因组稳定、调控细胞周期和凋亡及抑制肿瘤血管生成中发挥着重要的作用.p53基因突变信息在肿瘤分子筛查诊断、预防、药物疗法选择等方面具有重要的参考价值.本文分析了p53基因与P53蛋白突变检测的重要性、突变检测方法的发展概况,如传统的DNA测序、限制性片段长度多态性(restriction fragment length
polymorphism,RFLP)、单链构像多态性(single-stranded conformation
polymorphism,SSCP)等8类实验室常规基因突变检测策略及酵母中分离的等位基因功能分析技术(separation of gene function analysis in yeast,FASAY),近年来新兴的技术包括生物传感器、芯片、高分辨率溶解曲线(high resolution
melting,HRM),及下一代测序技术,以期较为全面地展示现今p53及P53突变检测的整体情况,为p53或其他基因突变研究者选择突变检测方法提供参考.
【期刊名称】《分子诊断与治疗杂志》
【年(卷),期】2016(008)006
【总页数】5页(P424-428)
【关键词】p53基因;突变检测;下一代测序
【作 者】张艳霞;杨学习
【作者单位】广州市达瑞生物技术股份有限公司,广东,广州510665;南方医科大学检验与生物技术学院,广东,广州510515 【正文语种】中 文
1993年，P53被《科学》（science）杂志选为“年度分子”，具有“基因组卫士”的称号。作为一重要的转录因子，P53蛋白具有发现并暂停带有损伤DNA的细胞分裂、修复损伤DNA或激活损伤细胞的凋亡途径、调控细胞的正常分裂和分化、防止肿瘤发生的功能。然而，研究表明其突变几乎在所有肿瘤中是最高的，超过50％的恶性肿瘤存在p53突变［1］。p53基因（p53 gene）的高突变率，提示其
胃癌染色体7q31.1杂合性缺失的精细作图及其相关基因探讨
胃癌染色体7q31.1杂合性缺失的精细作图及其相关基因探讨
唐运莲;苏琦;程爱兰;王丽江;张杨;胡果宇;甘润良
【摘 要】目的 显微切割胃癌细胞检测染色体7q31.1区域的杂合性缺失(LOH),绘制胃癌7q31.1区域等位基因缺失图谱,确定其常见最小缺失区域,揭示胃癌细胞的分子遗传学改变,分析7q31.1杂合性缺失与胃癌临床病理特征的关系.方法 在胃癌组织石蜡切片上行显微切割获得胃癌细胞.采用Chelex-100方法分别抽提切割的胃癌细胞和相应正常对照细胞的DNA.利用高密度微卫星标志结合PCR技术,检测胃癌染色体7q31.1杂合性缺失,绘制胃癌染色体7q31.1等位基因的缺失图谱,确定其常见最小缺失区域.结果 胃癌染色体7q31.1至少有一个位点存在杂合性缺失者21例,占70.0%(21/30);D7S2459、D7S523、D7S2502、D7S486、D7S480、D7S650、D7S2486各位点杂合性缺失频率分别为10.0%、6.7%、23.3%、43.3%、26.7%、26.7%、20.0%;缺失图谱分析显示常见最小缺失区域位于D7S2502～D7S480之间.统计学分析表明这一区带微卫星位点的等位基因缺失阳性率与患者年龄、性别、原发灶位置、病理分期、分化程度以及淋巴结转移不相关(P>0.05).结论 胃癌染色体7q31.1常见最小缺失区域在D7S2502～D7S480之间,在D7S486附近可能存在与胃癌相关的抑癌基因.
【期刊名称】《重庆医学》
【年(卷),期】2010(039)020
【总页数】5页(P2700-2703,后插1)
【关键词】胃癌;显微切割;染色体7q31.1;杂合性缺失;微卫星标志
【作 者】唐运莲;苏琦;程爱兰;王丽江;张杨;胡果宇;甘润良 【作者单位】南华大学肿瘤研究所,湖南衡阳,421001;南华大学肿瘤研究所,湖南衡阳,421001;南华大学肿瘤研究所,湖南衡阳,421001;南华大学肿瘤研究所,湖南衡阳,421001;南华大学肿瘤研究所,湖南衡阳,421001;南华大学肿瘤研究所,湖南衡阳,421001;南华大学肿瘤研究所,湖南衡阳,421001
FHIT基因及其蛋白表达与乳腺癌发生发展相关性的研究进展
山东医药２００８年第４８卷第８期
ＦＨＩＴ基因及其蛋白表达与乳腺癌发生发展 相关性的研究进展
徐国萍，何萍青 （上海交通大学附属第六人民医院，上海２００２３３）
［关键词］ 脆性组氨酸三联体基因；抑癌基因；乳腺肿瘤，乳腺癌 ［中图分类号］ Ｒ７３７．９ ［文献标识码］ Ａ ［文章编号］ １００２－２６６Ｘ（２００８）０８－－０１１２－０２
在肿瘤发生、发展、侵袭和转移过程中，抑癌基因的失活 起重要作用。脆性组氨酸三联体基因（ＦＨＩＴ）是与乳腺癌相 关的一种抑癌基因，其定位于染色体３ｐ１４．２区，内包含染色 体脆性位点ＦＲＡ３Ｂ。乳腺癌中ＦＨＩＴ基因失活以杂合性缺 失、基因转录缺失或降低及异常甲基化为主。现将ＦＨＩＴ基 因的结构、功能及其在乳腺癌中的表达及意义作一综述。 １ ＦＨＩＴ的结构和特征 １．１ ＦＨＩＴ基因的结构１９９６年Ｏｈｔａ等利用定位克隆技术 及外显子捕获方法于染色体３ｐ１４．２区域内得到一ｅＤＮＡ序 列长约１．１ ｋｂ的基因，该基因编码的蛋白质是人类组氨酸 三联体家族的一员，因其易于断裂，故得名ＦＨＩＴ基因。该基 因由１Ｏ个外显子组成，其５ 端含一段长约３５０ ｂｐ的非编码 区，随后为位于外显子５—９的开放性阅读框架（ＯＲＦ），长约 ５００ ｂｐ，编码１４７个氨基酸。其３ 端有多聚腺苷酸共有序列 （ｐｏ１ｙ Ａ ｃｏＮｓｅＮｓｕｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅ）和一个ｐｏ１ｙ Ａ尾。人乳头状瘤 病毒１６（ＨＰＶ１６）整合于外显子５着丝粒侧。脆性位点 ＦＲＡ３Ｂ位于ＦＨＩＴ基因编码的第一个外显子（外显子５）的 两侧，跨越２００—３００ ｋｂ区域。３个起始外显子１—３位于ｔ （３；８）断裂着丝粒端前方，ｔ（３；８）移位可使ＦＨＩＴ基因表达 受到干扰。Ｌｅｅ等” 研究发现，在ＦＨＩＴ基因脆性区域端有 很多Ａｌｕ序列，富含ＡＴ，可能是ＤＮＡ复制起点；且外显子均 以ＡＧ序列结尾（常见的基因剪接受体位点序列），因此当某 些器官暴露于一些致癌因素（如吸烟等）便会使ＤＮＡ复制 受到干扰，从而引起此脆性位点的断裂，导致基因缺失。 １．２ ＦＨＩＴ蛋白的特征ＦＨＩＴ蛋白作为组氨酸三联体蛋白 家族中的一员，其１０９个核心氨基酸与酵母菌Ｓｅｈｉｚｏ—ｓａｃ— ｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ的Ａｐ４Ａ水解酶（二腺苷四磷酸不对称水 解酶）有５７个氨基酸相同（５２％），７６个氨基酸相似（６９％）。 Ａｐ４Ａ水解酶能将Ａｐ４Ａ底物不对称地分解为ＡＴＰ和ＡＭＰ。 ＦＨＩＴ蛋白与Ａｐ＿４Ａ水解酶间的相似性提示ＦＨＩＴ蛋白可能 亦是一种酶。Ｂａｒｎｅｓ等研究表示，ＦＨＩＴ蛋白为一典型的二 腺苷三磷酸水解酶（Ａｐ３Ａ），能区域特异地水解ＡｐｎＡ（１３．＝３ —６）成为ＡＤＰ和ＡＭＰ，ＦＨＩＴ蛋白所含的４个保守组氨酸可 使其保持完整的水解酶活性，其中任一个发生突变均可致酶 活性降低，其中第９６位组氨酸尤为重要。 ２ ＦＨＩＴ在乳腺癌组织中失活的机制 ｌ１ ２ ＦＨＩＴ基因失活机制主要有以下方面：①ＦＨＩＴ等位基因 杂合子缺失。Ｍａｉｔｒａ等报道４５例原发性乳腺癌，其３ｐ１４．２ 区杂和子缺失率为４５％。Ｓａｍｏｓ等 研究发现，２５例乳腺 癌中有６例出现ＦＨＩＴ基因杂合性缺失，其中４例伴随 ＢＲＣＡ１基因缺失。②基因转录异常致蛋白表达降低或缺 失 Ｊ。在肿瘤组织中由于外显子的丢失或插入引起ＦＨＩＴ 异常转录致ＦＨＩＴ蛋白在肿瘤（如肺癌、乳腺癌）中低水平表 达。其中多为外显子５的丢失及外显子３和４或外显子４ 和５间额外片段的插入，但异常转录发生机制尚不清楚。③ 增强子区域ＣｐＧ段的甲基化。抑癌基因启动子区域ＣｐＧ段 的异常甲基化是某些人类恶性肿瘤的频发事件¨Ｊ。Ｙａｎｇ等 在对４６例散发性浸润性导管癌分析中发现，ＦＨＩＴ基因的甲 基化率（４８％）高于杂合性缺失的百分率，提示乳腺癌组织 中ＦＨＩＴ基因异常甲基化是其失活的重要机制。据报道，乳 腺癌组织中ＦＨＩＴ基因甲基化率高于其对应的正常乳腺组 织，提示检测ＦＨＩＴ基因甲基化水平有助于乳腺癌诊断、治疗 及预防 。 ３ ＦＨＩＴ蛋自在乳腺癌组织中的表达 近年来，有报道ＦＨＥｒ蛋白低表达与乳腺癌的发生发展 密切相关，Ｇｕｌｎｕｒ等 研究发现，ＦＨＩＴ蛋白在乳腺浸润性导 管癌组织中表达明显降低，导管原位癌次之，正常乳腺组织 中则正常表达。冉桂萍等 检测了６６例乳腺癌组织中 ＦＨＩＴ蛋白表达率发现，５９．１％的ＦＨＩＴ表达明显下降，提示 ＦＨＩＴ蛋白低表达是乳腺癌发生中的高频事件，且ＦＨＩＴ基因 微卫星不稳定性与ＦＨＩＴ蛋白表达缺失有关。Ｇａｔａｌｉｃａ等对 ５Ｏ例正常乳腺上皮、增生上皮、不典型增生上皮及原位癌和 浸润性导管癌中ＦＨＩＴ蛋白进行了免疫组织化学检测，发现 在乳腺癌发生过程的不同阶段，ＦＨＩＴ蛋白的表达量在正常 上皮、增生上皮、不典型增生上皮、原位癌和浸润性癌中逐渐 降低，表明在乳腺癌发生的早期即存在ＦＨＩＴ蛋白丢失，且与 病变的发展呈正相关，此不仅说明ＦＨＩＴ基因是肿瘤抑制基 因，还进一步说明ＦＨＩＴ蛋白低表达参与了乳腺癌的发生发 展。 ４ ＦＨＩＴ蛋白与乳腺癌临床病理因素之间的关系 目前对ＥＨＩＴ蛋白在乳腺癌中表达与临床病理因素之 间的关系报道不一。可能与所选取的样本含量不同、种族、
三阴性乳腺癌基因拷贝数变异与患者临床病理特征及预后的关系
•论 著・
中国医药导报2021年2月第18卷第5期
三阴性乳腺癌基因拷贝数变异
与患者临床病理特征及预后的关系
李宇翔 丰锦春 吴涛 阿孜古丽•阿布都热合曼 郁璐月 朱丽萍
新疆医科大学附属肿瘤医院乳腺外科一病区
,新疆乌鲁木齐
830000
［摘要］目的了解三阴性乳腺癌组织与癌旁组织基因拷贝数变异
(CNV)的情况
，探讨
CNV与三阴性乳腺癌患者
临床病理特征和预后的关系。方法收集
2014年
1月一
2016年
1月新疆医科大学附属肿瘤医院行手术治疗的
86例三阴性乳腺癌患者的癌组织及癌旁组织标本。应用全外显子高通量平行测序技术检测样本中
CNV的情况
,
并结合临床病理资料与随访记录综合分析。结果截至
2020年
1月
，随访
5年
,患者复发率为
34.88%。
86对样
本中癌组织差异
CNV显著高于癌旁组织
，差异有高度统计学意义
(P < 0.01)。
8号染色体有最频繁的
CNV扩增
，
17号染色体有最频繁的
CNV丢失及杂合区域
;发生
8、
17号染色体
CNV患者的
5年生存率低于未出现
CNV的
患者
，差异有统计学意义
(P <0.05)o年龄、原发肿瘤大小、淋巴结转移情况与
CNV情况呈线性相关
(r = -0.87、
0.92,0.94,P < 0.05)
；TNM分期与
CNV情况呈正相关
(r = 0.83,P < 0.05)。
Cox多因素回归分析显示
,CNV情况、
TNM分期是三阴性乳腺癌患者预后的独立影响因素
(HR = 0.456,1.927,P < 0.05)。结论
TNBC患者癌组织、癌
旁组织的差异
CNV与年龄、原发肿瘤大小、淋巴结转移及
TNM分期相关。此外
,CNV情况及
TNM分期影响患者
预后。
［关键词］
三阴性乳腺癌；基因拷贝数突变；临床病理学特征;预后
［中图分类号］R73 ［文献标识码］A ［文章编号］1673-7210(2021)02(b)-0028-05
Associations between triple-negative breast cancer gene copy number vari