北京基因型结核分枝杆菌与耐部分一线抗结核药结核病相关性的Meta分析
北京基因型结核分枝杆菌与耐部分一线抗结核药结核病相关性的Meta分析
发表时间:2018-08-24T16:20:51.113Z 来源:《健康世界》2018年12期 作者: 周华 陈依江 张铭 王丽
[导读] 应用Meta分析方法评价北京基因型结核分枝杆菌与耐部分一线抗结核药结核病的相关性
贵州省疾病预防控制中心结核病防治研究所 贵州贵阳 550004
摘要:目的:应用Meta分析方法评价北京基因型结核分枝杆菌与耐部分一线抗结核药结核病的相关性。方法:应用RevMan5.0软件分析纳入的15个独立研究。结果:北京基因型结核分枝杆菌与异烟肼耐药、利福平耐药、乙胺丁醇耐药及MDR的合并OR值及其置信区间分
别为1.83(95%CI1.22~2.72)、3.05(95%CI1.98~4.69)、2.12(95%CI1.29~3.49)及3.01(95%CI1.85~4.91)。结论:北京基因
型结核分枝杆菌与异烟肼耐药、利福平耐药、乙胺丁醇耐药及MDR存在相关性,与链霉素耐药的相关性有待进一步研究。
关键词:北京基因型;结核分枝杆菌;耐药结核病;Meta分析
北京基因型结核分枝杆菌家族是一个遗传关系接近的结核分枝杆菌家族,目前可通过插入序列6110限制性片段多态性(IS6110)、多位点可变数目串联重复序列分析(VNTR)、间隔区寡核苷酸(Spoligotyping)等方法进行菌株分型;该家族结核分枝杆菌在我国及东南
亚、前苏联等国家和地区广为流行,近年来有大量文献报道其与耐一线抗结核药结核病的相关性,本研究应用Meta分析的方法汇集多个独
立研究,探讨二者的相关性。
1 资料和方法
1.1 资料来源
通过自由检索词“Beijing genotype tuberculosis”、“北京基因型”和“耐药结核病”等在PubMed、CNKI等数据库检索到1995年至今共相关文献70篇。
1.2 纳入和排除标准
1.2.1 纳入标准
①研究的对象为无合并症的疑似或确诊的肺及肺外结核病人;②研究对象的年龄为中青年或老年;③菌株耐药检测采用表型检测方法;④ “MDR”是耐多药结核病,定义为结核分枝杆菌分离株至少同时耐异烟肼和利福平两种药,“耐异烟肼、耐利福平、耐链霉素、耐乙胺
丁醇”分别指“至少耐异烟肼、至少耐利福平、至少耐链霉素、至少耐乙胺丁醇”;⑤同一地区或同一作者的两篇文献的研究对象无重复或交
叉;⑥文献对研究过程、研究结果、讨论描述清晰、信息完整,并能提取到适合本研究分析的数据。
1.2.2 排除标准
①研究对象合并有HIV感染或糖尿病等其他疾病;②研究对象为儿童;③对耐药类型定义不清晰;④与同一地区或同一作者的另一篇文献的研究对象有重复或交叉;⑤文献信息不完整,无法提取到适合本研究分析的数据。
2 结果
2.1 纳入文献
通过以上纳入及排除标准,从检索到的70篇文献中共纳入15篇。
2.2 北京基因型结核分枝杆菌与耐药结核病的相关性
应用Meta分析软件RevMan5.0进行研究间异质性检验、统计量合并分析得出:北京基因型结核分枝杆菌与异烟肼耐药、利福平耐药、乙胺丁醇耐药及MDR的合并OR值及其置信区间分别为1.83(95%CI1.22~2.72)、3.05(95%CI1.98~4.69)、2.12(95%CI1.29~
3.49)及3.01(95%CI1.85~4.91)。
3 讨论
关于北京基因家族结核分枝杆菌与耐药结核病的相关性,之前也有作者进行过系统综述或Meta分析,Glynn JR等2002年报道纽约、古巴、爱沙尼亚和越南的菌株与耐药有较强相关性,其他地区相关性弱或不相关;Glynn JR等2006年报道古巴、前苏联、越南、南非及西
欧部分地区北京家族与耐药相关,东亚及美国部分地区二者不相关,马拉维及阿根廷北京家族与药敏相关,欧洲部分地区及非洲未发现北
京家族;刘彬彬等]2012年报道在中国北京基因型与利福平耐药、乙胺丁醇耐药和MDR相关,在俄罗斯和越南北京基因型与异烟肼耐药、
利福平耐药、乙胺丁醇耐药和MDR相关,在其他国家北京基因型与异烟肼耐药、利福平耐药、链霉素耐药、乙胺丁醇耐药和MDR相关。前
两篇系统综述,做了描述性分析,没有做Meta分析进行统计量的量化合并,后一篇Meta分析由于纳入的研究间存在异质性,只能按国家或
地区间分组进行亚组分析,本作者认为虽然系统描述和亚组分析能客观显示北京基因型菌株的的局部流行特征及其与耐药结核病相关性的
局部特征,但既然北京基因家族菌株具有相似的分子水平结构,那么不同地区北京家族菌株与耐药结核相关性上是否存在共性也是我们应
该了解的问题,本文纳入了15个研究(11个分布在亚洲,4个分布在前苏联),通过异质性检验后合并OR值,结果显示在亚洲和前苏联北
京基因型菌株与异烟肼耐药、利福平耐药、乙胺丁醇耐药和MDR有相关性,链霉素耐药由于研究间存在异质性不能合并,故北京家族基因
型菌株与链霉素耐药有待进一步研究。
由于本文纳入的15个研究局限在亚洲和前苏联,今后有待纳入欧洲、美洲及其他地区的研究进行Meta分析以探索北京基因家族型菌株与耐药结核病相关性的共性。另外,为什么北京家族基因型菌株存在地区间与耐药结核病相关性差异、北京基因家族结核分枝杆菌的耐药
机制等问题有待今后进一步研究。
参考文献:
[1]Wang J,Liu Y,Zang CL,etal.Genotypes and Characteristics of Clustering and Drug Susceptibility of Mycobacterium tuberculosis
Isolates Collected in Heilongjiang Province,China[J].J Clin Microbiol,2011,49(4):1354–1362
[2]Zhao Y,Li H,Xing J,etal.Molecular typing of Mycobacterium tuberculosis isolates circulating in Henan,central China[J].Exp Ther
Med,2012,4(5):949-953
[3]Tian LL,Si HY,Mu TJ,etal.Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Gansu province of China[J].Chin Med J,2012,125(10):3458-3464
[4]Anh DD,Borgdorff MW,Van LN,etal.Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype emerging in Vietnam[J].Emerg Infect Dis,
2000,6(3):302–305
[5]Buu TN,Huyen MNT,Soolingen DV,etal.The Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype Does Not Affect Tuberculosis
Treatment Failure in Vietnam[J].Clin Infect Dis,2010,51(8):879-886
北京市耐多药肺结核控制5年结果分析
北京市耐多药肺结核控制5年结果分析
洪峰;高志东;李波;孙闪华;赵鑫
【期刊名称】《中国防痨杂志》
【年(卷),期】2013(035)009
【摘 要】目的 调查北京市疑似耐多药肺结核(multidrug-resistant
tuberculosis,MDR-TB)患者中抗结核药物耐药谱,评估国产药物组方化疗MDR-TB患者的疗效,探索适合北京市的MDR-TB控制策略.方法 2008年4月至2013年3月,全市各结核病防治(简称“结防”)机构对21651例活动性肺结核患者治疗管理中,通过痰培养发现的1124例疑似MDR-TB患者.对885例属结核分枝杆菌复合群的疑似MDR-TB患者的阳性培养物开展抗结核药物药敏试验.确诊的277例MDR-TB患者,进行国产药物组方化疗,根据患者情况分类选择治疗管理方式,观察其不良反应和治疗效果.结果 5年间,属结核分枝杆菌复合群的疑似MDR-TB患者中,284例MDR-TB患者(7例为治疗期间重做药敏,实际发现为277例患者)占32.1%(284/885),对一、二线药物全敏感者占21.4%0(133/620).对277例MDR-TB患者采用分类治疗管理的方法,其中在结防机构使用二线MDR-TB方案治疗者占45.9%(127/277),其中59.8%(76/127)的患者出现不良反应,已获得转归信息患者的治愈率为63.4%(59/93);维持原方案治疗及转诊专科医院的比率分别为17.7%(49/277)和13.0%(36/277).结论 及时对发现的疑似MDR-TB患者进行一、二线抗结核药物药敏试验非常必要.北京市MDR-TB患者分类治疗管理的效果较为理想.
【总页数】5页(P706-710)
【作 者】洪峰;高志东;李波;孙闪华;赵鑫 【作者单位】100035 北京结核病控制研究所办公室;100035 北京结核病控制研究所防控科;100035 北京结核病控制研究所防控科;100035 北京结核病控制研究所防控科;100035 北京结核病控制研究所防控科
结核分枝杆菌部分耐药相关基因的突变特点
结核分枝杆菌部分耐药相关基因的突变特点
韩喜琴;李传友;高微微;张宗德;黄学锐;谢莉;陈曦;马玙
【期刊名称】《结核病与胸部肿瘤》
【年(卷),期】2008(000)002
【摘 要】目的分析结核分枝杆菌耐药相关基因的突变特点,评价DNA序列分析用于结核分枝杆菌快速耐药性检测的应用价值。方法利用DNA序列分析检测结核分枝杆菌的KatG、rpoB和gyrA基因片段。结果8681%(79/91)异烟肼耐药株存在katG基因的点突变和/或单碱基插入,最常见的突变形式为R463L,占76.92%(70/91)。90.38%(94/104)的利福平耐药株rrpoB基因耐药决定区(RRDR)发生突变,突变类型有26种,涉及11种氨基酸,突变集中在密码子507~533位。70.49%(86/122)氧氟沙星耐药株在gyrA基因耐药决定区(QRDR)发生突变,突变主要形式为A90V、D94Y、D94N、D94H及S91P。结论耐药相关基因突变的检测可作为临床快速检测结核分枝杆菌耐药性的方法之一。
【总页数】5页(P99-103)
【作 者】韩喜琴;李传友;高微微;张宗德;黄学锐;谢莉;陈曦;马玙
【作者单位】北京胸科医院结核内科;北京市结核病胸部肿瘤研究所细菌免疫研究室;北京市结核病胸部肿瘤研究所结核病分子生物学研究室
【正文语种】中 文
【中图分类】R378.911 【相关文献】
1.结核分枝杆菌部分耐药相关基因的突变特点 [J], 韩喜琴;李传友;高微微;张宗德;黄学锐;谢莉;陈曦;马玙
2.耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征分析 [J], 孟庆琳;王玉峰;逄宇;赵雁林
3.结核分枝杆菌对氨基糖苷类药物耐药相关基因突变特征分析 [J], 车洋;杨天池;平国华;林律
4.青海地区结核分枝杆菌异烟肼耐药相关基因突变特征 [J], 王兆芬;王朝才;王卫军;李会茹;申秀丽;李斌;张媛媛;蒋明霞;陈虹汝;马斌忠;汪海静;李咏雪
耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征分析
耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征分析
孟庆琳;王玉峰;逄宇;赵雁林
【期刊名称】《中国防痨杂志》
【年(卷),期】2016(038)002
【摘 要】目的 分析耐多药结核分枝杆菌不同基因型构成以及耐药相关基因突变特征.方法 2007年全国耐药基线调查共收集结核分枝杆菌临床分离株4017株,经比例法药物敏感性试验鉴定获得376株耐多药菌株纳入本研究.采用RD105缺失基因检测法鉴定北京基因型菌株和非北京基因型菌株.对所有耐多药菌株利福平耐药相关基因(rpoB)和异烟肼耐药相关基因(katG,inhA和oxyR-ahpC)进行测序,分析耐药相关基因突变的特征.结果 在376株耐多药菌株中,有261株(69.4%,261/376)属于北京基因型,其余115株(30.6%,115/376)属于非北京基因型.北京基因型菌株中氧氟沙星耐药率(31.8%,83/261)和前广泛耐药率(30.7%,80/261)明显高于非北京基因型菌株的氧氟沙星耐药率(17.4%,20/115)和前广泛耐药率(15.7%,18/115),差异均有统计学意义(x2值分别为8.33和9.32,P值均<0.05).比较北京基因型菌株和非北京基因型菌株不同位点的突变频率,发现北京基因型菌株rpoB基因第531位点(67.4%,176/261)和katG基因(66.3%,173/261)的突变频率明显高于非北京基因型(rpoB:54.1%,62/115,x2=6.28,P=0.010;katG:50.4%,58/115,x2=8.46,P=0.000),而非北京基因型菌株未发生rpoB基因突变的菌株比例(14.8%,17/115)明显高于北京基因型菌株(1.1%,3/261),差异有统计学意义(x2=29.46,P=0.000).结论 北京基因型耐多药菌株与氧氟沙星耐药高度相关,与非北京基因型耐多药菌株相比,rpoB基因的第531位点和katG基因突变更多发生于北京基因型菌株中. 【总页数】6页(P116-121)
结核分枝杆菌的耐药性及检测方法
结核分枝杆菌的耐药性及检测方法
结核病是一种由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)引起的慢性传染病,主要累及肺部,但也可侵犯其他器官。然而,近年来出现了结核分枝杆菌对抗生素的耐药性问题,给结核病的防治带来了巨大挑战。本文将就结核分枝杆菌的耐药性机制以及常用的检测方法进行论述。
一、耐药性机制
1.多重耐药(MDR)
多重耐药是指结核分枝杆菌对两种最主要的抗结核药物——异烟肼和利福平同时产生耐药现象。这种耐药形式使得传统治疗手段无法有效控制感染,并且增加了传播风险。
2.延迟耐药(XDR)
延迟耐药是在MDR基础上,又产生对氟喹诺酮类等二线抗结核药物的耐药性。这使得治疗选择更加有限,且通常需要使用更昂贵和毒副作用更大的抗结核药物。
3.全耐药(TDR)
全耐药是指对所有一线和二线抗结核药物都产生耐药现象,这种情况下仅能依靠其他的药物才能进行治疗。然而,这些替代治疗方案费用昂贵且可行性有限。
二、检测方法
1.传统的抗生素敏感性测试
传统的抗生素敏感性试验使用培养分枝杆菌,并将其接种于含有抗生素的琼脂平板上。通过观察细菌在不同浓度抗生素下的生长情况来判断其对该抗生素是否具有耐药性。尽管这种方法简单易行,但其确诊时间较长,且容易出现误判。 2.分子检测方法
随着分子生物学技术的进步,利用PCR技术可以更快速地检测结核分枝杆菌的耐药基因突变。这种方法通过检测与耐药性相关基因序列的存在与否来确定细菌对特定抗生素是否具有耐药性。由于PCR技术高灵敏度和高特异性,它已成为常用的结核分枝杆菌耐药性检测方法之一。
3.流式细胞术
流式细胞术利用荧光标记的结核分枝杆菌单个细胞对特定抗生素的反应进行测定。通过测量细胞内荧光信号的变化来判断其对抗生素是否产生了耐药性。这种方法具有高通量和快速的优势,但需要对样本进行前期处理以获得单个菌落。
4.质谱法
质谱法利用MALDI-TOF质谱仪检测结核菌代谢产物图谱与数据库匹配,从而快速确定结核分枝杆菌的耐药类型。这是一种新兴的方法,有望成为检测结核分枝杆菌耐药性的有效手段。
54_例复治利福平耐药结核病患者菌株遗传特征及耐多药基因分析
山东医药2024 年第 64 卷第 11 期
54例复治利福平耐药结核病患者菌株
遗传特征及耐多药基因分析
张洁,任怡宣,杨新宇,田丽丽,易俊莉,丁北川
北京市疾病预防控制中心,北京100013
摘要:目的 分析54例复治利福平耐药结核病(RR-TB)患者的结核分枝杆菌(MTB)菌株遗传特征及耐多药基因突变情况。方法 选择同时留存有初治及复治MTB菌株的复治RR-TB患者54例,取其初治及复治时的MTB共54对(108株),采用RD105基因缺失法检测其基因型,15位点可变数目串联重复序列基因分型实验(MIRU-VNTR)
判断其复治发病原因;取复治时的MTB 54株,通过MIRU-VNTR结果构建最小生成树(MST),分析群体遗传特征;采用分子线性探针药敏实验分析复治MTB的耐多药基因(利福平耐药rpoB基因及异烟肼耐药katG、inhA基因)突变情况。结果 108株复治RR-TB患者的MTB均为北京基因型,内源性复燃占比77.8%(42/54)、外源性再感染占比22.2%(12/54)。MST显示,54株复治MTB分为3个克隆复合群(CC1、CC2、CC3)和13个独特基因型;共48种基因
型,成簇率为11.1%。分子线性探针药敏试验结果显示,异烟肼耐药katG、inhA基因突变40株,耐多药率为74.1%(40/54);利福平耐药rpoB基因以S531L位点突变为主(63.0%,34/54),异烟肼耐药katG基因以S315T1位点突变为主(75.0%,30/40)。结论 北京地区复治RR-TB患者发病原因主要是内源性复燃,主要流行菌株为北京基因型,呈现出较高的遗传多样性,成簇率较低,MTB耐多药基因突变位点多为rpoB基因S531L及katG基因S315T1。关键词:结核分枝杆菌;结核病;内源性复燃;耐药基因;利福平;异烟肼doi:10.3969/j.issn.1002-266X.2024.11.006 中图分类号:R521 文献标志码:A 文章编号:1002-266X(2024)11-0027-04
基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值
基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值
目的 探讨基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值。方法 回顾性分析685例结核病临床疑似病例的临床资料,采用晶芯结核分枝杆菌生物芯片技术进行检测。 结果 本组685例临床疑似病例中,阳性135例,阳性率为19.7%,基因芯片检测结果显示结核131例,非结核4例,阳性率为19.1%。耐药基因检测68例,利福平和异烟肼基因突变12例,总突变率为17.6%,其中11例为利福平和异烟肼均耐药,双重基因突变率为16.2%,另1例只耐利福平。利福平总突变率为17.6%,异烟肼总突变率为16.2%,耐多药率为16.2%。 结论 晶芯结核分枝杆菌生物芯片技术用于临床诊断结核病及其耐药性,能够缩短诊断时间,提高临床时效性,值得推广应用。
标签: 结核分枝杆菌;基因芯片;结核病诊断
国内每年有将近13万人因结核病死亡[1],且有将近12万新发耐多药结核病患者,未来数年内可能出现耐药菌为主的流行态势[2]。目前,结核病诊断的标准方法主要包括分枝杆菌分离培养、抗酸菌痰涂片镜检、菌种鉴定和药敏试验等,但是其普遍存在特异性差、灵敏度低或需时长的缺点[3],本院引进国内最新的结核诊断技术——晶芯结核分枝杆菌生物芯片诊断系统,是近年发展起来的进行大规模遗传多态性检测的新方法[4],其应用于临床诊断结核病,提高了时效性,现报道如下。
1 资料与方法
1.1 一般资料
本院2013年3月1日~2013年9月30日接受诊治的结核病临床疑似病例共685例,其中男性363例,女性322例;年龄9~76岁,平均(34.51±2.28)岁;其中临床诊断结核病病例681例,包括185例痰结核菌培养阴性肺结核,157例痰结核菌培养阳性肺结核,193例结核性脑膜炎,95例结核性胸膜炎,51例骨结核。非结核分枝杆菌病4例。
1.2 试剂与仪器
Extractor 36核酸提取仪、BioMixerⅡ芯片杂交仪、Slider Washer芯片洗干仪、LuxScan 10 K-B芯片扫描仪、晶芯分枝杆菌菌种鉴定试剂盒、晶芯结核分枝杆菌耐药基因检测试剂盒,均购自博奥生物有限公司。
北京基因型结核杆菌播散致病的相关性研究
国际检验医学杂志2012年1月第33卷第1期Im J Lab ! ! :塑:
[143 Ancona V,Appel DN,de Figueiredo P.Xylella fastidiosa:a model for analyzing agricultural bioseeurity[J].Biosecur Bioterror,
2O10,8(2):171—182. [1 5]Jin DZ,Liu GC,Wen SY,et a1.DNA microarrays assay for simul— taneous detection and identification of multiple common intestinal pathogens[J].Molecular ̄Cellular Probes,2008,89(20):337— 347.
・综 述・ ・ 53 ・
[16]瞿良,王惠萱,谭德勇,等.金黄色葡萄球菌的基因芯片检测研究
I-j].国际检验医学杂志,2O10,31(8):773—775. [1 73 Niotis AE,Mastichiadis C,Petrou PS,et a1.Dual cardiac marker capillary waveguide fluoroimmunosensor based on tyramide signal
amplification[J].Anal Bioanal Chem,2010,396(3):1187—1196.
北京基因型结核杆菌播散致病的相关性研究
张运玲综述,朱朝敏审校
(重庆医科大学附属儿童医院感染消化科400014) (收稿日期:201l_11-01)
关键词:抗药性; 北京基因型; 结核杆菌
DOI:10.3969/j.issn.1673—4130.2012.01.023 文献标识码:A 文章编号:1673—4130(2012)01—0053—03
世界卫生组织《结核分枝杆菌耐药相关基因突变目录(第2版)》解读
世界卫生组织《结核分枝杆菌耐药相关基因突变目录(第2版)》解读
裴少君;欧喜超
【期刊名称】《中国防痨杂志》
【年(卷),期】2024(46)3
【摘 要】耐药结核病是2035年实现全球终结结核病流行目标的巨大障碍。世界卫生组织(World Health Organization,WHO)倡导采用快速分子药物敏感性检测技术进行耐药结核病早期诊断,而覆盖全面可靠的耐药检测靶标是提高分子药物敏感性检测技术可靠性的关键。WHO于2023年11月发布《结核分枝杆菌耐药相关基因突变目录(第2版)》,目的是基于更广泛的全球数据汇总形成更为全面准确的耐药相关基因突变目录,为开发与完善基于测序或其他方法的新型分子药物敏感性检测技术提供支持。本文对第2版目录相较于第1版目录在分析流程与耐药突变等内容的更新进行了详细的解读,并对未来目录完善的方向进行了展望。
【总页数】7页(P260-266)
【作 者】裴少君;欧喜超
【作者单位】北京大学公共卫生学院全球卫生学系;中国疾病预防控制中心传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室结核病预防控制中心
【正文语种】中 文
【中图分类】R378.91;R446
【相关文献】 1.耐药结核分枝杆菌与耐药基因突变的相关性分析2.结核分枝杆菌中利福平和异烟肼耐药相关基因突变与耐药水平的相关性研究3.重庆地区结核分枝杆菌异烟肼和丙硫异烟胺耐药及其交叉耐药相关基因突变研究4.世界卫生组织《结核分枝杆菌耐药相关基因突变目录及其临床应用指南》解读5.结核分枝杆菌异烟肼耐药基因突变与其他抗结核药物耐药的相关性
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