丙酮酸氧化脱羧与三羧酸循环

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三羧酸循环(TCA)

三羧酸循环(TCA)
磷酸戊糖途径的概念:是G分解的另一条途径: 在6—P—G上直接氧化,再分解产生5—P—核糖。
磷酸戊糖途径PPP:Pentose Phosphate Pathway 己糖磷酸途径HMP:Hexose Monophosphate Pathway 磷酸己糖支路HMS:Hexose Monophosphate Shunt G直接氧化途径DOPG:Direct Oxidation Pathway of Glucose
净 生 成 2 × 1 ATP,2×3mol(NADH+H+),2×1 molFADH2,2×2 molCO2
由于氧化磷酸化,1mol(NADH+H+)可生成3molATP, 1 molFADH2可生成2molATP。
因此:第一阶段:净生成8molATP 第二阶段:净生成6molATP,2 molCO2 第三阶段:净生成24molATP,4 molCO2
低:大量的NADH抑制酶的活性,使TCA循环 减速。
2、ATP,琥珀酰CoA抑制柠檬酸合成酶、α—酮戊 二酸脱氢酶的活性,使TCA循环减速。
异柠檬脱氢酶受ATP抑制,被ADP激活。 3、丙酮酸脱氢酶系的调节见前
细胞中ATP浓度越高时,TCA速度下降; NAD+/NADH的比值越高时,TCA速 度越快。
就HMP而言,关键的调控位是:
6—P—G脱氢酶催化的不可逆反应。
(3-磷酸甘油醛异构、缩合与水解)
2
3-磷酸甘油醛
异 构 酶
醛缩酶
H2O Pi
二磷酸果糖酯酶
1,6-二 磷酸果糖
6-磷酸果糖
总反应式为: A式:6 6—P—G+12NADP++6H2O 6CO2+12(NADPH+H+)
4 6—P—F+2 3—P—G+
然后:2 3—P—G 6—P—F

三节糖有氧氧化与三羧酸循环

三节糖有氧氧化与三羧酸循环

例:天冬氨酸
草酰乙酸
丙酮酸…… G
一. 二、 糖异生的途径
4. 6-磷酸果糖至葡萄糖
6-磷酸果糖至葡萄糖经酵解途径逆向变成6-磷酸葡萄糖,再由葡萄糖6-磷酸
酶催 化水解成葡萄糖。
Mg2+
6-磷酸葡萄糖 + H2O
葡萄糖 + Pi
在肝的内质网上含有葡萄糖6-磷酸酶可催化此反应,而骨骼肌和脑组织细胞内
( 5-P核糖)
(5-P木酮糖 )
(7C)7-P景天酮糖
3-P甘油醛 (3C)
另1分子G-6-P CO2
(4C) 4-P赤藓糖
6-P果糖 (6C)
5-P木酮糖 3 C
3-P甘油醛 (3C)
2C
6-P果糖 (6C)
HMP总反应式为:
3(G-6-P)+ 6 NADP+ + 3 H2O
2(6-P果糖)+ 3 CO2 + 6(NADPH+H+) 3-P甘油醛
GTP + ADP
GDP + ATP
6. 6. 6、 琥珀酸脱氢生成延胡索酸:
第三步氧化还原反应,由琥珀酸脱氢酶催化,氢受体:酶的辅基FAD
7、延胡索酸水化成苹果酸:
延胡索酸酶具有立体异构特异性,OH只加在延胡索酸一侧,形成L-苹果 酸。
8. 苹果酸脱氢生成草酰乙酸:
TCA中第4次氧化还原反应,由L-苹果酸脱氢酶催化,NAD+是辅酶。
NADPH
NAD+
三.
七、乙醛酸循环
特殊生理意义:(1)将脂肪酸分解产生的乙酰辅酶A转变为琥珀酸,可合成糖;
(2)净结果为:2乙酰辅酶A
琥珀酸

论述三羧酸循环的反应过程

论述三羧酸循环的反应过程

论述三羧酸循环的反应过程三羧酸循环,也称为柠檬酸循环或Krebs循环,是生物体内进行细胞呼吸的关键过程之一。

它在线粒体的胞质中进行,通过氧化葡萄糖产生三氧化碳和能量。

本文将详细描述三羧酸循环的反应过程,以及每个反应的具体细节。

三羧酸循环共包含八个反应步骤,每个步骤都有特定的酶催化。

首先,我们来看看第一步骤,也是整个循环的起始点——乳酸脱氢酶。

在这一步骤中,乳酸被氧化成为丙酮酸,同时产生二氧化碳和NADH。

这个反应是氧化性的,也是三羧酸循环的入口。

接下来,丙酮酸在丙酮酸脱氢酶的催化下转化为乙酰辅酶A。

这个反应中,丙酮酸失去一个羧基,生成乙醛和NADH。

乙醛进一步与辅酶A结合形成乙酰辅酶A,这是循环的关键中间产物。

在第三步中,乙酰辅酶A与柠檬酸合成酶催化下发生反应,生成柠檬酸。

这个反应是一个羧基转移反应,乙酰辅酶A的乙酰基转移到草酰乙酸上,同时释放出辅酶A。

第四步是柠檬酸异构酶的催化下,柠檬酸转化为异柠檬酸。

这个反应是一个水合脱水反应,柠檬酸的羟基和羧基发生转位,形成异柠檬酸。

然后,异柠檬酸在异柠檬酸脱氢酶的作用下,转化为α-酮戊二酸。

这个反应中,异柠檬酸失去一个羧基,并产生NADH和二氧化碳。

第六步是α-酮戊二酸脱羧酶的催化下,α-酮戊二酸转化为琥珀酸。

这个反应是一个脱羧反应,α-酮戊二酸失去一个羧基,形成琥珀酸。

接下来,琥珀酸在琥珀酸脱氢酶的作用下,转化为琥珀酸半醛。

这个反应中,琥珀酸失去两个氢原子,并产生NADH和二氧化碳。

琥珀酸半醛通过琥珀酸半醛脱氢酶的催化,转化为戊二酸。

这个反应是一个氧化反应,琥珀酸半醛失去一个氢原子,形成戊二酸。

至此,三羧酸循环的八个反应步骤全部完成。

通过这一循环,每个葡萄糖分子可以产生六个二氧化碳分子、十个NADH分子、两个FADH2分子和两个ATP分子。

这些能量载体将在细胞呼吸的后续过程中进一步参与ATP的合成。

三羧酸循环是生物体内进行细胞呼吸的重要过程之一,它不仅产生能量,还参与合成各种代谢产物。

13-1三羧酸循环

13-1三羧酸循环
硫酯键和一般酯键比较,是富能的。这主要与共振稳定性有关。 π电子的重叠使C-O键有部分双键特征。 由于S原子比氧原子大,C和S之间的π电子不能 重叠,C = S这种形式基本上不存在。硫酯比一般酯不稳定,水解的△G0’增高。酰基辅 酶A的C-S键比一般酯键中的C-O键要弱。酰基很容易转移到其他中间代谢物。
硫辛酸(Lipoic acid)
6
5
4
3
2
1
O
硫辛酸的羧基与酶2(二氢硫辛酸乙酰转移酶)赖氨酸的ε-氨基形成酰氨键,产 生硫辛酰氨。 活化乙醛部分从TPP转移到硫辛酰氨C6的S上包括羟乙基的氧化和二硫的还原,这 在丙酮酸脱氢酶中产生一个乙酰基,这个乙酰基再转移到辅酶A。
丙酮酸 脂肪酸 e-
e第 二 阶 段
三羧酸循环
e-
ee-
还原的电子载体 NADH/FADH2
第 阶 段



呼吸的三阶段
第一阶段:乙酰基的产生,这是个活化的二碳片段,可与 辅酶A形成乙酰辅酶A ; 第二阶段:乙酰辅酶A在三羧酸循环中的氧化; 第三阶段:在三羧酸循环中产生的还原电子载体在氧化磷 酸化中再氧化,并伴随ATP的产生。
5.将草酰乙酸加入被丙二酸抑制的肌肉悬浮液中可以消除 对丙酮酸氧化的抑制,悬浮液中有柠檬酸积累。Krebs的解 释是丙酮酸氧化需消耗草酰乙酸,合成柠檬酸,若加入丙二 酸,由于不能再生成草酰乙酸,所以丙酮酸氧化被抑制。
6.由于环中每个有机酸的加入都可以使丙酮酸氧化量增加 数倍,每个有机酸的最大反应速度都与丙酮酸氧化的最大速 度相同,所以环状氧化是丙酮酸氧化的主要途径。 通过总结前人的实验和上述一系列实验,Krebs在1937年提 出了三羧酸循环。后来发现这一途径在动、植物,微生物中 普遍存在,不仅是糖分解代谢的主要途径,也是脂肪,蛋白 质分解代谢的最终途径,具有重要的生理意义。

丙酮酸氧化脱羧与三羧酸循环

丙酮酸氧化脱羧与三羧酸循环

反应的能量由乙酰CoA的高能硫酯键提供,所以 使反应不可逆。此为醇醛缩合反应,先缩合成柠檬 酰CoA,然后水解。
这步反应由 C4 → C6 。
1. 化学反应过程
二、TCA循环
Step 2. 柠檬酸异构化成异柠檬酸
Iron-sulfur (red), cysteines (yellow) and isocitrate (white)
E3 —— 二 氢 硫 辛 酸 脱 氢 酶 ( dihydrolipoyl dehydrogenase DLD)。催化还原型硫辛酸→氧化型。 具有辅基FAD。
一、丙酮酸氧化脱羧 整个过程涉及到的6个辅因子:TPP(焦磷酸硫胺素)、 SSL(硫辛酸)、FAD、NAD+、CoA、Mg2+等。
丙酮酸脱氢酶复合体呈圆球形,每个复合体含有: 6个PDH、24个TA、6个DLD 其中TA为复合物的核心,它的一条硫辛酸臂可以旋转。
a-酮戊二酸脱氢酶复合体与丙酮酸脱氢酶复合
体非常相似,也包含三种酶、五六种辅因子。
TPP
lipoate FAD
(E1, E2, E3)
Reaction 4
Decarboxylated first, then oxidized; the carbon released as CO2 is not from the acetyl group joined; The a-ketoglutarate dehydrogenase complex closely resembles the pyruvate dehyrogenase complex in structure and function (the two E1s and two E2s are similar, the two E3s are identical).

TCA

TCA
生物体中存在着及时补充草酰乙酸的反应,称 为回补反应。
六. 三羧酸循环的回补反应
1. 丙酮酸羧化
这是动物中最重要的回补反应,在线粒体中进行。
COOH C O
+ CO2
ATP+H2O
ADP+Pi
COOH C O
CH3
丙酮酸
丙酮酸羧化酶
CH2
COOH
草酰乙酸
(生物素)
六. 三羧酸循环的回补反应
2. 天冬氨酸转氨
2. 循环中的中间物为生物合成提供原料; 如草酰乙酸、 a- 酮戊二酸可转变为氨基酸,琥珀酰 CoA可用于合成叶绿素及血红素分子中的卟啉。 3. 是生物中的燃料分子氧化放能的最终的共同途径。 生物中的燃料分子(如糖、脂肪酸、氨基酸)大多以 乙酰CoA进入此循环而被氧化。
六. 三羧酸循环的回补反应
三羧酸循环的一个重要作用是它的中间物可以 为生物合成提供原料,但这些中间物必须得到补 充,以保证TCA循环运转。尤其是起始物草酰乙酸 ,缺乏它乙酰CoA就不能进入循环。
链将电子交给 O2,才能回复成氧化态,再去接受
TCA循环脱下的氢。 ∴ TCA 循环需要在有氧的条件下进行。否则
NADH 和 FADH2 携 带 的 H 无 法 交 给 氧 , NAD+ 及
FAD不能被再生,使TCA循环中的脱氢反应因缺乏 氢的受体而无法进行。
四. 三羧酸循环的化学计量
2. 乙酰CoA氧化的化学计量
对于原核生物:
碳源 能量 葡萄糖 → 2丙酮酸 → 6CO2 葡萄糖有氧酵解:2ATP + 2NADH → 7 ATP 共32 ATP
丙酮酸有氧氧化:12.5×2 = 25 ATP
四. 三羧酸循环的化学计量
4. 葡萄糖彻底氧化的化学计量

三羧酸循环

三羧酸循环

三羧酸循环一、三羧酸循环的概念三羧基循环(tricarboxylic acid cycle),简称TCA循环。

是一个由一系列酶促反应构成的循环反应系统,在该反应过程中,首先在有氧的情况下,葡萄糖酵解产生的丙酮酸氧化脱羧形成乙酰CoA。

乙酰CoA(主要来自于三大营养物质的分解代谢)与草酰乙酸缩合生成含3个羧基的柠檬酸(citric acid),再经过4次脱氢、2次脱羧,生成4分子还原当量(reducing equivalent)和2分子CO2,重新生成草酰乙酸的这一循环反应过程称为三羧酸循环因为在循环的一系列反应中,关键的化合物是柠檬酸,所以称为柠檬酸循环(tricarboxylic acid cycle)。

由于它是由H.A.Krebs(德国)正式提出的,所以又称Krebs 循环。

二、三羧酸循环的过程三羧酸循环的过程主要分三个阶段:第一阶段:丙酮酸的生成(胞浆)第二阶段:丙酮酸氧化脱羧生成乙酰 CoA(线粒体)第三阶段:乙酰CoA进入三羧酸循环彻底氧化(线粒体)(一)、丙酮酸的生成(胞浆)葡萄糖 + 2NAD+ + 2ADP +2Pi ——> 2(丙酮酸+ ATP + NADH+ H+ )(二)、丙酮酸氧化脱羧生成乙酰辅酶A多酶复合体:是催化功能上有联系的几种酶通过非共价键连接彼此嵌合形成的复合体。

其中每一个酶都有其特定的催化功能,都有其催化活性必需的辅酶。

(三)、乙酰CoA进入三羧酸循环彻底氧化(线粒体)(1)乙酰-CoA进入三羧酸循环乙酰CoA具有硫酯键,乙酰基有足够能量与草酰乙酸的羧基进行醛醇型缩合。

首先柠檬酸合酶的组氨酸残基作为碱基与乙酰-CoA作用,使乙酰-CoA的甲基上失去一个h+,生成的碳阴离子对草酰乙酸的羰基碳进行亲核攻击,生成柠檬酰-CoA中间体,然后高能硫酯键水解放出游离的柠檬酸,使反应不可逆地向右进行。

该反应由柠檬酸合成酶(citrate synthase)催化,是很强的放能反应。

三羧酸循环(TCA)

三羧酸循环(TCA)

二,生化历程 (一)不可逆的氧化阶段(1-----3) 不可逆的氧化阶段( -----3 1,6—P—G , 6—P葡萄糖酸内酯 葡萄糖酸内酯 可逆
2,6—P葡萄糖酸内酯水解生成 , 葡萄糖酸内酯水解生成6—P葡萄糖酸 葡萄糖酸内酯水解生成 葡萄糖酸 不可逆
3,6—P葡萄糖酸脱氢脱羧 , 葡萄糖酸脱氢脱羧 生成5—P 核酮糖(5—P—Ru) 不可逆 核酮糖( 生成 )
异构化反应 —H2O 可逆
通过2——3步,将柠檬酸异构化为 异柠檬酸.实质是将前者的—OH从C2 变到了后者的C3,成为仲醇(由叔醇变 为仲醇),更易氧化.
4—5,异柠檬酸氧化脱羧生成α—酮戊二酸 5 异柠檬酸氧化脱羧生成α 酮戊二酸
第一次脱氢脱羧
可逆
消耗1NAD+,生成 生成1NADH+H+,1CO2 消耗 +
因此:第一阶段:净生成8molATP 第二阶段:净生成6molATP,2 molCO2 第三阶段:净生成24molATP,4 molCO2 共净生成38molATP, 共净生成38molATP,6molCO2 38molATP 真核生物中,共净生成 真核生物中,共净生成36molATP,6molCO2 ,
3,磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶催化PEP生成草酰乙酸 ,磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶催化 生成草酰乙酸
心脏,骨骼肌中, 心脏,骨骼肌中,PEP羧激酶催化 羧激酶催化 PEP+CO2+GDPO=CCOOH +GTP
CH2COOH
ห้องสมุดไป่ตู้,由苹果酸酶,苹果酸脱氢酶催化使 ,由苹果酸酶, 丙酮酸生成草酰乙酸
原核, 原核,真核中广泛存在的苹果酸酶催化
不可逆
消耗1 生成1NADH+ 消耗1NAD+,生成1NADH+H+,1CO2
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2. TCA循环的总反应
二、TCA循环 循环
2. TCA循环的总反应
二、TCA循环 循环
每经历一次TCA循环 循环 每经历一次 个碳原子通过乙酰 进入循环, 有2个碳原子通过乙酰 个碳原子通过乙酰CoA进入循环,以后有 个 进入循环 以后有2个 碳原子通过脱羧反应离开循环。 碳原子通过脱羧反应离开循环。 对氢原子通过脱氢反应离开循环 有4对氢原子通过脱氢反应离开循环,其中 对 对氢原子通过脱氢反应离开循环,其中3对 NADH携带 1对由 携带, 对由FADH 携带。 由NADH携带,1对由FADH2携带。 分子高能磷酸化合物GTP,通过它可生成 产生1分子高能磷酸化合物 ,通过它可生成1 产生 分子高能磷酸化合物 分子ATP。 。 分子 消耗2分子水, 分别用于合成柠檬酸( 消耗 分子水,分别用于合成柠檬酸 ( 水解柠檬 分子水 酰CoA)和延胡索酸的加水。 )和延胡索酸的加水。
所以, 循环需要在有氧的条件下进行。 所以 , TCA循环需要在有氧的条件下进行。 否 循环需要在有氧的条件下进行
携带的H无法交给氧 无法交给氧, 则NADH和FADH2携带的 无法交给氧,即呼吸链 和 不能被再生, 氧化磷酸化无法进行, 不能被再生 氧化磷酸化无法进行 , NAD+及 FAD不能被再生, 使TCA循环中的脱氢反应因缺乏氢的受体而无法进 循环中的脱氢反应因缺乏氢的受体而无法进 行。
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 3. 异柠檬酸氧化脱羧
这阶段放出了1分子 产生1分子NADH 这阶段放出了1分子CO2,由 C6 → C5 ;产生1分子
NADP+(gold); Ca2+(red))
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 4. α-酮戊二酸氧化脱羧
α-酮戊二酸脱氢酶复合体与丙酮酸脱氢酶复合 酮戊二酸脱氢酶复合体与 非常相似,也包含三种酶、五六种辅因子。 体非常相似,也包含三种酶、五六种辅因子。
2. TCA循环的总反应
二、TCA循环 循环
产物NADH和FADH2的去路 和 的去路: 产物
循环产生的NADH和 FADH2 必须经呼 由 TCA循环产生的 循环产生的 和 吸链将电子交给O 才能回复成氧化态, 吸链将电子交给 2, 才能回复成氧化态 , 再去接 循环脱下的氢。 受TCA循环脱下的氢。 循环脱下的氢
TPP
lipoate FAD
(E1, E2, E3)
Reaction 4
Decarboxylated first, then oxidized; the carbon released as CO2 is not from the acetyl group joined; The α-ketoglutarate dehydrogenase complex closely resembles the pyruvate dehyrogenase complex in structure and function (the two E1s and two E2s are similar, the two E3s are identical).
这步反应由 C4 → C6 。
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 2. 柠檬酸异构化成异柠檬酸
IronIron-sulfur (red), cysteines (yellow) and isocitrate (white)
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 3. 异柠檬酸氧化脱羧
3.能量的化学计量 能量
二、TCA循环 循环
乙酰CoA通过 通过TCA循环脱下的氢由 循环脱下的氢由NADH及 乙酰 通过 循环脱下的氢由 及 FADH2经呼吸链传递给 2,由此而形成大量 经呼吸链传递给O 由此而形成大量 形成大量ATP
碳 源 乙酰CoA 乙酰CoA → 2CO2 1GTP → 1ATP 能 量 3ATP× 3NADH → 3ATP×3 = 9ATP 2ATP× 1FADH2 → 2ATP×1 = 2ATP 共 12ATP 12ATP
一、丙酮酸氧化脱羧 整个过程涉及到的6个辅因子:TPP(焦磷酸硫胺素 焦磷酸硫胺素) 整个过程涉及到的6个辅因子:TPP(焦磷酸硫胺素)、 CoA、 SSL(硫辛酸 硫辛酸) FAD、 SSL(硫辛酸)、FAD、NAD+、CoA、Mg2+等。
丙酮酸脱氢酶复合体呈圆球形,每个复合体含有: 丙酮酸脱氢酶复合体呈圆球形,每个复合体含有: PDH、24个TA、 6个PDH、24个TA、6个DLD 其中TA为复合物的核心,它的一条硫辛酸臂可以旋转。 TA为复合物的核心 其中TA为复合物的核心,它的一条硫辛酸臂可以旋转。
Pyruvate
CO2 Acetyl-CoA
Hydroxyethyl-TPP
E2 (dihydrolipoyl transacetylase): consisting the core, 24 subunits; E1 (pyruvate dehydrogenase): bound to the E2 core, 24 subunits; E3 (dihydrolipoyl dehydrogenase): bound to the E2 core, 12 subunits.
三羧酸循环(tricarboxylic acid cycle), 又叫 三羧酸循环 , 循环, 做 TCA循环 , 是由于该循环的第一个产物是柠檬酸 循环 它含有三个羧基,故此得名。 ,它含有三个羧基,故此得名。 该 循环 的提出 的主要 贡献者 是英国 生化学 家 Krebs,所以又称 ,所以又称Krebs循环。 循环。 循环
该循环还叫做柠檬酸循环。 该循环还叫做柠檬酸循环。 柠檬酸循环
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 1.乙酰CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸 乙酰CoA 乙酰CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸
An aldol condensation
The methyl carbon of acety-CoA joins the carbonyl carbon of oxaloacetate; citroyl-CoA is a transient intermediate; hydrolysis of the thioester bond releases a large amount of free energy.
二、TCA循环 循环
Step 8. 苹果酸至草酰乙酸(再生) 苹果酸至草酰乙酸(再生)
Oxaloacetate is regenerated!
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 8. 苹果酸至草酰乙酸(再生) 苹果酸至草酰乙酸(再生)
The active site of malate dehydrogenase. Malate is shown in red; NAD+ blue.
Coenzyme A (CoA-SH): discovered in 1945 by Lipmann, delivers activated acyl groups (with 2-24 carbons) for degradation or biosynthesis.
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 4. α-酮戊二酸氧化脱羧
这阶段又放出了1分子 这阶段又放出了1分子CO2,由 C5 → C4 ; , 又产生1分子 又产生 分子NADH;形成1个高能硫酯键。 分子 ;形成1个高能硫酯键。
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 5. 由琥珀酰CoA生成高能磷酸键 由琥珀酰CoA生成高能磷酸键 CoA
一、丙酮酸氧化脱羧
Pyruvate dehydrogenase complexes from E. coli: the electron micrograph
a huge multimeric assembly of three kinds of enzymes, having 60 subunits in bacteria and more in mammals.
Malonate (丙二酸) is a strong competitive inhibitor 这阶段合成了1分子高能磷酸化合物 这阶段合成了 分子高能磷酸化合物GTP 分子高能磷酸化合物
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 6. 琥珀酸氧化成延胡索酸
这一阶段的反应为 的变化; 这一阶段的反应为C4的变化; 反应为 的变化 产生1分子 分子NADH。 产生 分子FADH2、1分子 分子 、 分子 。
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
Step 1.乙酰CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸 乙酰CoA CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸
这步反应由 C4 → C6 。
Citrate synthase. Citrate is shown in green and CoA pink
1. 化学反应过程
二、TCA循环 循环
E2 E3
A model of the E. coli pyruvate dehydrognase complex showing the three kinds of enzymes and the flexible lipoamide arms covalently attached to E2
丙酮酸的氧化脱羧的部位: 丙酮酸的氧化脱羧的部位:线粒体
The oxidative decarboxylation of pyruvate in mitochondria: the overall chemical transformation, involving five cofactors and three enzymes.
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