微卫星标记与猪部分肉质性状相关分析

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微卫星标记预测猪部分经济性状杂种优势的研究

微卫星标记预测猪部分经济性状杂种优势的研究

微卫星标记预测猪部分经济性状杂种优势的研究黄生强;柳小春;晏光荣;施启顺【期刊名称】《湖南农业大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2007(033)005【摘要】为探明微卫星标记与猪经济性状杂种优势的相关关系,采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳,筛选应用6个猪微卫星标记估测了长白公猪×大白母猪(长大)、大白公猪×长白母猪(大长)、大白公猪×长大母猪(大长大)和杜洛克公猪×长大母猪(杜长大)4个不同杂交组合亲本间的遗传距离,分析了它与猪杂交后代经济性状杂种优势率的相关关系.结果表明:亲本间微卫星标记遗传距离与杂交后代日增重、料肉比等生产性状均呈强正相关关系,相关系数分别为0.627 6,0.389 9,与瘦肉率、眼肌面积、后腿比率和熟肉率等胴体性状均呈强负相关关系,相关系数分别为-0.835 9,-0.539 6,-0.993 0和-0.667 9,因而可作为预测这些性状杂种优势的指标.【总页数】3页(P592-594)【作者】黄生强;柳小春;晏光荣;施启顺【作者单位】湖南农业大学,动物科学技术学院,湖南,长沙,410128;湖南农业大学,动物科学技术学院,湖南,长沙,410128;湖南农业大学,动物科学技术学院,湖南,长沙,410128;湖南农业大学,动物科学技术学院,湖南,长沙,410128【正文语种】中文【中图分类】S828.2【相关文献】1.有效微卫星标记预测猪部分经济性状杂种优势 [J], 晏光荣;柳小春;黄生强;施启顺2.大约克夏猪群遗传结构及其经济性状生化遗传标记筛选研究Ⅰ.大约克夏猪血浆酶活性与部分经济性状的关系 [J], 黄生强;柳小春;施启顺;贺长青3.青格里绒山羊微卫星标记遗传多态性及其与部分经济性状相关关系的研究 [J], 古丽尼沙·吐拉甫;王琼;努孜古丽·图尔荪;刘武军4.微卫星标记对杂种优势研究杂交猪群的遗传评价 [J], 张敬虎;郑嵘;熊远著;邓昌彦;蒋思文;雷明刚;左波;徐德全;李家连;李凤娥5.利用AFLP标记遗传距离预测猪经济性状杂种优势的研究 [J], 苟本富因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

侯建国 , 李加琪 , 陈瑶生 , 王 羽中

侯建国 , 李加琪 , 陈瑶生 , 王 羽中

收稿日期:2002-10-16 作者简介:侯建国(1977-),男,硕士,现在广东省农业科学院情报所工作.通讯作者:李加琪(1965-),男,副教授,硕士.基金项目:国家自然科学基金资助项目(39800103);广东省自然科学基金资助项目(980153)微卫星DNA 标记与猪肉质性状的相关分析侯建国,李加琪,陈瑶生,王 羽中(华南农业大学动物科学学院,广东广州,510642)摘要:测定了长蓝参考家系F 2代个体的肉色、大理石纹、pH 值和系水力4个肉质性状,同时测定了6号染色体的23个微卫星DNA 标记,将不同基因型与4个肉质性状进行方差分析与多重比较.结果表明:肉色与大理石纹、pH 值、系水力间的相关系数分别为-01322、01419、01468,pH 值和系水力间的相关系数最高,为01737,差异极显著;M N006座位与影响pH 值性状的QT L 连锁,加性效应为01108,M N004座位与影响大理石纹性状的QT L 连锁,加性效应为01125.关键词:猪;微卫星DNA 标记;肉质性状;QT L中图分类号:S82812 文献标识码:A 文章编号:1001-411X (2003)02-0063-04 随着人民生活水平的提高,猪肉质性状的选育已经逐渐为育种工作者所重视,猪肉质性状是一综合性状,包括肉色、大理石纹、pH 值、系水力、肌内脂肪含量、滴水损失和品尝鉴定等.其中肉色是评定猪肉品质的重要性状,虽然肉色本身对风味没有影响,但对公众的感官反应有很大的影响;大理石纹是主观评定肌内脂肪含量的指标,而肌内脂肪含量是猪肉嫩度与食用品质的重要决定因素,直接影响到猪肉的嫩度、风味和多汁性;pH 值则是肉质评定中最广泛应用的指标之一,是反映宰后体内糖原酵解速率最重要的指标;系水力与滴水损失也是判定肉质的重要指标,它反映了猪肉的货架期长短[1].猪肉质性状为宰后测定的性状,因此,其选择在选育实践中难于进行,标记辅助选择是猪肉质性状选择的有效途径,但这首先应寻找与肉质性状紧密连锁的遗传标记或控制肉质性状的数量性状位点(QT Ls ),而目前对肉质性状连锁与QT L 定位的报道不多[2~4].本研究的目的是通过分析猪第6号染色体的微卫星DNA 标记基因型与猪肉质性状的关系,为猪肉质性状的QT L 定位与标记辅助育种提供依据.1 材料与方法111 试验群体以长白猪为父本,蓝塘猪为母本,按照F 2代设计建立长×蓝资源群体,以该资源群体96头F 2代群体为试验材料.112 微卫星引物参照R obic 等[5],Zhao 等[6]以及Ambady 等[7]的报道,由上海生工生物工程公司合成了23对引物,其碱基序列见表1.113 性状测定方法肉色:宰后1h 测定第4~6胸椎间背最长肌切面的颜色,采用美国和日本的标准比色板测定法,肉色分5级.大理石纹:采用美国NPPC 的5级评分制评分.pH 值:宰后1h 左右用pH 计直接测定背最长肌的pH 值.系水力:采用重量加压测定法测定.称10g 左右背最长肌,用12层滤纸包好,持续施加25kg恒定的压力,然后再称肉样,前后之差即为失去的水分,再计算系水力[1].114 基因组DNA 的抽提及模板的制备取前腔静脉血液,加1/10体积w =2%E DT A 抗凝剂,轻轻摇匀.采用常规的苯酚氯仿抽提方法,将抽提出的DNA 原液3μL 与3μL 溴酚蓝混合,点样于01008g/m L 的琼脂糖凝胶(内含015μg/m L E B )中,5V/cm 电泳30min 后观察结果.取少量分装,稀释到50ng/μL 备用.原液-70℃保存.115 PCR 扩增体系及基因型检测PCR 扩增反应体系参照R obic 等[5],Zhao 等[6]以及Ambady 等[7]的报道.用W AVE 核苷酸片段分析系统检测判定基因型.W AVE 核苷酸片段分析系统是美国TRANSGE NOMIC 公司的产品,近年来在分析单核苷酸多态性(S NP )和微卫星的研究中广为应用.其原理是DNA 片段经过洗脱,不同的DNA 片段产生停滞时间(retention time )不同的波峰,根据停滞时间第24卷第2期 2003年4月 华南农业大学学报(自然科学版)Journal of S outh China Agricultural University (Natural Science Edition ) V ol.24,N o.2 Apr.2003来判断波峰是否是目标片段.该仪器的精确度比较高,可以区分在琼脂糖胶上不能区分的片段.116 数据统计方法采用S AS软件的G LM过程和C ORR过程分析.表1 微卫星引物(6号染色体)T ab.1 Microsatellite primers(Chr.6)标记marker上游引物forward primer下游引物reverse primert(退火)annealtemperature/℃等位基因数number of alleles片段大小(bp)size rangeS0121TTG T AC AAT CCC AG TGG AAT CC AAT AGGG C ATG AGGG TG TTTG A555173S0059C AGGG T AG CC AAAAAAG AG T AAA TG C AC ACCTTG TG AACG T AG TT5514148M N001T AAAACTTT AACC AG ACCTT C AT ATG C AC AG AAG TT AG CTTTG507132~154 M N002G AG C AAC AT C AG CTT AG T CC G AT AG C ACC AT ATG TGGG AC583118~124 M N003T AACC ATG AACG ACCTGG G CG TG AT ATG TG TTTT AG TG T C583145~149 M N004C AG T AG CC AGG T ATGG AAG TTT AATGG CT CG T AAT ACT C585148~165 M N005AACTG CCG TG AG TT AC ATT C C AGG CTG TG ACCC ATT AG584190~202 M N006CT CT C ATT C AG AG AAT AG AGG C C AAAAG T CCT AGG TG CTT AT C584178~194 M N007ACC AG TT CC AAGGG ACT C T CTG TG TG T AT CTT C ACCTG TG584118~133 M N008G AT CT C ATTT ATTG AAAT CT AA GG AAG TTTG T ACCTTTTG ACT C555120~134 M N009CC AG TT CC AT CTT AAATGGG G ATGGG C AC AAG AC AAT C585221~231 M N10CC AAG ACCC AG C AT C AGG CG TG C AG AC ATGG AAACG606114~126 M N11G TGG TTTGG AGG ATG CTTG CTTGGG T AG AT ACC AAGG CC557129~149 M N12CTG T AATT CCTG TGGG TTGG TG ATGG TGG ACCGG C AT AAG555159~181 M N13CTG AAAC AG AGG CTT ACTG T CTG AG ATG ACTGG ACG AC553135~141 M N14CCT AGG C AGG C AG CT C AG AG C AG CTTG CGG CT CT C604156~166 M N15C AAC AAATG CTG CG TG TT CC CC ATG T C ACTTG TTG TT CT C5510115~147 M N16GGG TT AATGG ATG AATGG T CC ATT ATG T CT AG AC AC571082~108 M N17AT ACCTTG CC AG TG AGGG AC TG CT ATGG TTG TGG TG AAGG578131~155 M N18GGG AG AG AG T CTG C AAGG CTG TG CCCT C AG AGG AAG604137~143 M N19CT CC ACT C AT C AT AAC G ATG ATG AG TT ATG AG TG TG554119~130 M N20G AT ATG TG T CCC AC AG ATG C CGGG AG ATTTG AGG ATG576147~161 M N21CT CC AG AAT CT AAG CT CT C AGG ACT CCG TG AG AG TT CT C6014137~1932 结果与分析211 肉质性状间的表型相关分析 表2列出了4个主要猪肉质性状间的表型相关,结果表明肉色、pH值和系水力之间都存在正相关,肉色和大理石纹呈负相关,差异极显著;pH值与系水力之间的相关系数最高,达01737.其余性状间的相关系数都很小,且差异不显著.表2 肉质性状之间的相关系数1)T ab.2 correlation coefficient betw een meat qu ality traits性状traits 肉色(92)meat color大理石纹(92)marblepH值(96)pH value系水力(96)water2holding capacity肉色(92)meat color 1.000(0.0000)-0.322(0.0020)330.419(0.0001)330.468(0.0001)33大理石纹(92)marble 1.000(0.0000)0.049(0.6435)0.023(0.8276) pH值(96)pH value 1.000(0.0000)0.737(0.0001)33系水力(96)water2holding capacity 1.000(0.0000) 1)33表示差异极显著(P<0101),相关系数后括号中为P值,项目栏中括号内为样本含量.212 标记基因座与肉质性状的相关分析不同标记基因型对4个肉质性状的方差分析结果表明,在所测定的23个微卫星DNA标记座位中,只有M N004标记的基因型在大理石纹表型值上差异显著(表3),M N006标记的基因型在pH值表型值上差异显著(表4).这说明在M N004座位附近可能存46 华 南 农 业 大 学 学 报 (自 然 科 学 版)第24卷在影响大理石纹的QT L;M N006座位附近存在影响pH值性状的QT L.表3 MN004座位大理石纹性状的方差分析1)T ab13 The analysis of variance for m arbling at locus MN004变异来源s ource 自由度DF平方和sum of squares均方mean squaresF值F value基因型间genotypes20.7020.351 2.783误差error8210.3700.126 1)3表示差异显著(P<0.05)表4 MN006座位pH值性状的方差分析结果1) T ab.4 The analysis of variance for pH at locus MN006变异来源s ource 自由度DF平方和sum of squares均方mean squaresF值F value基因型间genotypes2 1.0970.549 4.1333误差error9212.2280.133 1)33表示差异极显著(P<0.01)2.3 标记基因的效应分析M N004座位不同基因型对大理石纹的影响见表5,AB基因型与BD基因型之间的差异显著,BB基因型与BD基因型之间的差异显著,从平均数中可以看出BD基因型比BB基因型在表型效应上高出01207, BD基因型比AB基因型在表型效应上高出01226,而AB和BB基因型之间效应基本相似,因此D基因与控制大理石纹性状的有利QT L基因连锁,其加性效应值为01108.表5 MN004座位大理石纹性状的多重比较T ab.5 Multiple range test of m arbling at locus MN004平均数1) means样本含量number of sample基因型genotype3.435a20BD3.228b43BB3.209b22AB 1)上标字母相同,表示差异不显著,上标字母不相同,表示差异显著 M N006座位不同基因型对pH值的影响见表6, M N006座位的AB基因型与AA基因型之间的差异显著,BB基因型与AA基因型之间的差异显著.在表型效应上,AA基因型比AB基因型高出0.20左右,AA基因型比BB基因型高出0.25左右,而AB型稍高于BB型,因此A基因与控制pH值性状的有利QT L基因连锁,其加性效应值为0.125.表6 MN006座位pH值性状的多重比较T ab.6 Multiple range test of pH value at locus MN006平均数1)means样本含量number of sample基因型genotype6.354a39AA6.157b38AB6.102b18BB 1)上标字母相同,表示差异不显著,上标字母不相同,表示差异显著3 讨论与结论肉质性状是一类综合性状,应评定的指标很多,其中肉色、大理石纹、pH值和系水力是反映猪肉品质最重要的指标,根据不同肉质性状间的相关进行猪肉质改良的间接选择,对减少选择性状数,提高选择效率有重要的意义.本研究的结果表明,pH值与系水力的相关系数最高,肉色也与pH值和系水力存在正相关,因此,育种实践中可以只对其中的一个性状进行选择.但肉色与大理石纹呈负相关,肉质的改良仍然应对大理石纹进行选择.标记基因座与肉质性状的方差分析显示M N006座位与pH值性状有关,M N004座位与大理石纹性状有关.M N004标记位于第6染色体113cM附近, Cristina ovilo等[2]将与大理石性状有关的QT L定位于第6染色体的97~98cM处,和RY R1基因相距30 cM.而G erbens等[3]则定位在第6染色体的149cM 处.也有报道认为在SW871和S0175标记附近的QT L和大理石纹有关[4].M N006标记位于第6染色体129cM附近,和SW824标记紧密连锁.国外有研究将与pH值性状有关的QT L定位在RY R1区域,和标记M N006相距60cM[4],也有报道定位于2和12号染色体[8].M N004与M N006标记基因型的多重比较表明: M N004座位的BD基因型比BB和AB基因型的大理石纹表型值高,这说明D等位基因和控制大理石纹的QT L有利基因是紧密连锁的,其加性效应值为01108.M N006座位的AA基因型比AB和BB基因型的pH值表型值高,这说明A等位基因和控制pH值的QT L有利基因是紧密连锁的,其加性效应为01125.因此,猪肉质改良实践中可以应用M N004与M N006标记进行标记辅助选择或早期选择.参考文献:[1] 毕英佐,傅伟龙.动物科学进展[M].北京:中国农业出版社,2000.114-129.[2] CRISTI NA O,MIG UE L P E,C ARME N B,et al.A QT L forintramuscular fat and back fat thickness is located on porcine56第2期侯建国等:微卫星DNA标记与猪肉质性状的相关分析 chrom os ome6[J].Mammalian G enome,2000,11:344-346.[3] GER BE NS F,de K ONI NG D J,H ARDERS F L,et al.Theeffect of adipocyte and heart fatty acid-binding protein genes on intramuscular fat and back fat content in meishan crossbred pigs[J].J Anim Sci,2000,78:552-559.[4] 亓开兴,连林生.猪数量性状位点定位的研究现状[J].动物科学与动物医学,2000,17(5):23-25.[5] ROBIC A,PARROU J L,YER LE M,et al.Pig microsatel2lites is olated from cosmids revealing polym orphism and local2 ized on chrom os omes[J].Animal G enetics,1995,26:1-6.[6] ZH AO F,AM BADY S,PONCE de LE ON F A,et al.Mi2crosatellite markers from a microdissected swine chrom os ome6 genomic library[J].Animal G enetics,1999,30:251-255.[7] AM BADY S,ME NDI O LA J R,LOUIS C F,et al.Develop2ment and use of a microdissected swine chrom os ome6DNA li2 brary[J].Cytogenetics and Cell G enetics,1997,76:27-33.[8] ROTHSCHI LD M F.猪数量性状座位和候选基因探测研究进展及展望[J].刘荣宗译.国外畜牧科技,1998,25(5):35-37.R elationships Betw een Microsatellite DNA Markers and Pork Q uality TraitsH OU Jian2guo,LI Jia2qi,CHE N Y ao2sheng,W ANG Chong(C ollege of Animal Science,S outh China Agric.Univ.,G uangzhou510642,China)Abstract:P ork quality traits,color,marbling,pH and water2holding capacity,were measured in F2population of Lan2 drace×Lantang swine reference family by genotyping23microsatellite DNA markers at chrom os ome6.The results showed that the correlation coefficients between pork color and marbling,pH,water2holding capacity were-01322, 01419,01468respectively,and0.737between pH and water2holding capacity.The additive effect of QT L linkage with D allele at M N006locus is0.108for pH,and the additive effect of QT L linkage with A allele at M N004locus is0.125for marbling.K ey w ords:swine;microsatellite DNA markers;pork quality traits;QT L【责任编辑 柴 焰】(上接第18页)Studies on E ffects of Combined Chemo2Biological Technique on Rice Stra wDecomposition and Its IR CharacteristicsFE NG X in,K ONG Wei2dong,M AO X iao2yun,LI AO Z ong2wen(New Fertilizer Res ources Research Lab,S outh China Agric.Univ.,G uangzhou510642,China)Abstract:Decom position of rice straw was studied by applyinga combined chemio2biological technique.The results showed that the treated rice straw turned deeply black,was easily drawn apart and gave out strong odor.The water sub2 merging the treated rice straw became black too.The treated rice straw was studied with FTIR technique.The results in2 dicated that there was an increase in the contents of phenylic2and alcohol hydroxy and methyl radicals.The fatty group com pounds were partly decom posed.Carboxylic acid lipid com pounds and ketone com pounds were hydrolyzed.There was an obvious process of organic nitrogen being changed into inorganic nitrogen in the form of amm onium ion.Available sili2 con existing in am orphous form was obtained from the decom position of polymeric silicon and even brought into accumula2 tion.Oxidation and condensation of the organic com pounds were intensified and the contents of aryl com poonds inereased.The structural variation of the treated rice straw showed that the decom position of rice straw was accelerated by the combined chem o2biological technique.K ey w ords:rice straw;quick decom position;IR spectrum【责任编辑 周志红】66 华 南 农 业 大 学 学 报 (自 然 科 学 版)第24卷。

微卫星与金华猪生长性状关系的研究

微卫星与金华猪生长性状关系的研究

微卫星与金华猪生长性状关系的研究罗玉衡;张金枝;孙万元;徐宁迎;蒋涛【期刊名称】《畜牧与兽医》【年(卷),期】2005(37)7【摘要】采用微卫星标记多重扩增结合荧光标记检测技术,对152头金华猪种群的30个微卫星位点的不同基因型与生长发育性状的关系进行了初步分析和显著性检测。

结果显示SW 2476、SW 0215、SW 24等3个微卫星位点不同基因型间的出生重差异显著;SW 902、S0143、SW 0215、S0228、SW 24等5个微卫星位点不同基因型间的60日龄重差异显著;S0178、S0218、S0255、S0155、SW 951等5个微卫星位点不同基因型的4月龄重差异显著;而S0217微卫星位点的不同基因型的6月龄重差异显著。

【总页数】4页(P12-15)【关键词】微卫星;金华猪;生长性状【作者】罗玉衡;张金枝;孙万元;徐宁迎;蒋涛【作者单位】浙江大学动物科学学院【正文语种】中文【中图分类】S828.2【相关文献】1.猪应激性状QTL微卫星标记与运输应激后肉质性状关系的研究 [J], 王晓娜;汪秀星;赵茹茜;刘香;薛春阳;陈杰2.微卫星变异及其与鸡的生长、产蛋和免疫活性等性状的关系研究 [J], Rudranath chatterjee;晋大鹏3.金华猪采食性状与生长性状的研究 [J], 章啸君;项云;郭晓令;楼芳芳;屠平光;胡旭进;杜喜忠4.猪13号染色体部分微卫星标记与肉质性状关系的研究 [J], 邵根宝;贾超;赵茹茜;陈杰;杨晓静;黄瑞华;徐银学;刘红林5.猪12号染色体几个微卫星标记与部分生产性状的关系研究 [J], 赵书红;杨晓鹏;刘榜;李奎;彭中镇;张建生;孙仕铨;顾建平因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

家猪1号染色体微卫星标记与背膘厚的相关性

家猪1号染色体微卫星标记与背膘厚的相关性
关 键 词: 家猪 ; 背骠厚 ; 傲卫星标记 ; 相关
中图分类号 :8 8 2 ¥ 2.
文献标 识码 : A
As o ito fSS 1 M ir s tl t a ke s s ca in o C c o a el e M r r i wi c a ik e si g t Ba kf tThc n s n Pi s h
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第2 8卷第 2期
湖南农业大学学报( 自然科 学版)
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V0 . 8 No 2 12 . Ap . 2 0 r 02
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微卫星DNA标记技术在养猪业中的应用

微卫星DNA标记技术在养猪业中的应用

10 kb 的 DNA 序列中就会出现一个微 取质粒后利用载体插入位点两端的已知
微卫星 DNA 的长度一般为 200 bp
卫星序列 [3]。
序列设计引物,再测定插入片断的序列, 左右,很容易进行 PCR 扩增。PCR 扩
2 微卫星DNA标记的特点
即可知道某一微卫星位点及其侧翼序列 增的高度灵敏性、高度特异性及操作简
设定的连锁遗传距离越大,则找到一个 对其进行操作和利用。
状位点 (QTL) 间的连锁分析 [J]. 农业生
与生产性状主效基因连锁的标记位点的 3.3 鉴定个体亲缘关系或品系间的
物技术学报 , 1994,(2):17-24.
可能性就越大。利用 QTL 微卫星标记 遗传结构
[7] M a t t a p a l l i l M J . A n a l y s i s o f
串联序列 [1],其中最常见的是 2 个碱基 一种是对于已经发现的微卫星 DNA,可 递给下一代,并且等位基因间呈共显
的双核苷酸重复ห้องสมุดไป่ตู้即 (TG)n 和 (CA)n, 在数据库中直接寻找合适的引物,对基 性遗传,容易区分出纯合型和杂合型。
每个微卫星 DNA 的核心序列结构相同, 因组进行 PCR 扩增和测序来分析微卫星 这使其在物种起源、遗传图谱、连锁
卫星 DNA 多态性的研究可在生产中选 产物表现多态,而在马和人中则未扩增 是不均衡的,这些基因中有的是主效基
取数个与生产性能相连锁的微卫星标 出多态产物。龚明川 [8] 利用 16 对鼠微 因,有的是辅助基因。微卫星在染色体
记,在这些位点上对所研究的品种或品 卫星位点的引物,以家兔的基因组为模 上是随机分布的,如果某一微卫星位点
与某些功能基因或 QTL 间的连锁关系,

猪4、8和13染色体上肉质性状的QTL定位

猪4、8和13染色体上肉质性状的QTL定位

猪4、8和13染色体上肉质性状的QTL定位张敬虎;熊远著;左波;雷明刚;蒋思文;李凤娥;郑嵘;李家连;钱辉跃【期刊名称】《畜牧兽医学报》【年(卷),期】2007(38)10【摘要】214头猪(180头F2个体)组成的资源家系中,在猪的第4、8和13染色体上共选取23个微卫星标记,对11种肉质性状做了QTL定位,这些肉质性状包括:背最长肌肌内脂肪率(IMF) 、背最长肌含水量(WM) 、背最长肌系水力(WHC)、背最长肌失水率(DLR)、背最长肌pH (pH1)、股二头肌pH (pH2)、头半棘肌pH (pH3)、背最长肌肉色值(MCV1)、股二头肌色值(MCV2)、背最长肌大理石纹评分(MMS1) 和股二头肌大理石纹评分(MMS2).结果表明:检测到2个染色体极显著水平的QTL(P≤0.01),它们是定位在SSC13上55 cM处的IMF QTL,和定位在SSC4上10 cM处的WM QTL;4个染色体显著水平的QTL(P≤0.05),它们是2个MCV2 QTL (SSC8上110 cM处和SSC13上70 cM处)、1个MMS1 QTL (SSC8上185 cM处)和1个MMS2 QTL (SSC8上 185 cM处).上述QTL解释的表型变异从0.16% (SSC8上MCV2 QTL) 到 17.84% (SSC8上MMS2 QTL).【总页数】6页(P1009-1014)【作者】张敬虎;熊远著;左波;雷明刚;蒋思文;李凤娥;郑嵘;李家连;钱辉跃【作者单位】华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070;漳州师范学院生物科学与技术系,漳州,363000;华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070;华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070;华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070;华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070;华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070;华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070;华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070;华中农业大学畜牧兽医学院农业部猪遗传与改良重点实验室,武汉,430070【正文语种】中文【中图分类】S828.2【相关文献】1.鸡F2群体13号染色体微卫星标记与生长性状的关系及QTL定位 [J], 张艳芳;康相涛;孙桂荣;韩瑞丽;田亚东;亢娟娟2.猪13号染色体上脂肪沉积相关QTL定位与候选基因研究进展 [J], 何小平;彭中镇;刘榜3.猪8号染色体影响产仔数性状的QTL精细定位 [J], 蒋能静;阮丽莎;石晓峰;李平华;黄瑞华;侯黎明;刘晨曦;周天威;张萍;黄媛;陆志强;华金弟;周腾彬4.猪13号染色体部分微卫星标记与肉质性状关系的研究 [J], 邵根宝;贾超;赵茹茜;陈杰;杨晓静;黄瑞华;徐银学;刘红林5.用混合模型定位一个复杂家猪家系13号染色体QTL的研究 [J], 吴晓林;施启顺;柳小春;彭英林;蒋隽;杨仕柳;肖兵南因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

云南高黎贡山猪微卫星DNA多态性分析

云南高黎贡山猪微卫星DNA多态性分析
模 板
( m lr) 1 l r rR( m l )04 Tq 5p o d , i 5p o ,. a / P me /
酶 ( . / ) 1. 2 5 U ,4 6—1. ld H 1 5 6 d 2 0,
基金项 目:滇撒猪配套系特色养猪产业化 生产” 业科技成果 “ 农 转化资金项 目( 编号 :0 6 2 0 2 1 2 0 CB 07 )
云南 高 黎 贡 山猪 原名 明光 小耳 猪 . 其产 区 云 取
11 试验动物 试验用 2 头高黎贡山猪样本采 自 . 4 高黎 贡 山猪 主产 区云南 省保 山市腾 冲县 明光 乡和瑞
滇乡 4个 自然 村 的养 猪农 户 , 母 各 半 。样 品 为高 公 黎贡 山猪 肥育 至 5 O一6 g后 屠 宰所 取 的肝 组 织 , 0k
摘要 : 高黎贡山猪是云南省独特的小型猪种, 其肌内脂肪的非饱和脂肪酸和营养必需脂肪酸的含量远
高于其他猪种 , 具有发展优质保健猪 肉的 良好潜 质。本研 究选用 世界粮农组 织 ( A 和 国际动物遗 传学会 F O)
(S G) IA 联合推荐 的 2 O个微卫 星位点对高黎贡 山猪和杂种群体进行 遗传学检测和分析 。结果表 明:O个微卫 2
色 , 有抗 逆性强 , 具 肉质好等 特性 。该猪胴 体瘦 肉率 为 4 .4 , 内脂 肪为 77 % , 5 8% 肌 .6 肉质性 状多 项指 标
收稿 日期 :0 90 .6 2 0 -91
M C22 ah , C(2 5M) D O因位 g 1 5mM ec )K I1. 和 MS ( 点而 异 , d T s 2 5m ec ) 1 2 N P ( . M ah , P m rF i r e
星座位在群体中均表现为多态 , 每位点等位基 因数 2— 5个。群体平均 多态信息含 量高 黎贡 山猪 为 0 6 2 , .8 9 杂种 群体 为 0 5 2 , .9 4 平均杂合度分别为 07 0 .32和 0 6 6 。 .4 5

猪肉质性状基因遗传标记的研究进展

猪肉质性状基因遗传标记的研究进展

目录1 猪肉质性状的主效基因 (1)1.1 猪氟烷基因 (1)1.2 猪酸肉基因 (1)1.3 单磷酸腺苷蛋白激酶γ3亚基基因 (2)2 猪肉质性状的主要候选基因 (2)2.1 脂肪酸结合蛋白基因 (3)2.2 激素敏感脂肪酶基因 (3)2.3 酯蛋白脂肪酶基因 (3)2.4 MyoD 基因家族 (3)2.5 钙蛋白酶抑制蛋白基因 (4)2.6 黑素皮质素受体 (4)2.7 肥胖基因 (4)2.8 肌生成抑制蛋白基因 (5)2.9 ACSL基因 (5)2.10 过氧化物酶体增殖物活化受体基因 (5)2.11编码腺苷-磷酸脱氨酶基因 (5)2.12 固醇调节元件结合蛋白1基因 (5)3 基因遗传标记的研究与应用策略 (6)3.1 候选基因分析( candidate genes approach) (6)3.2 标记辅助选择( marker assisted selection ,MAS) (6)3.3 标记辅助渗入( marker assisted introgression ,MAI) (7)4 结语与展望 (7)参考文献 (8)猪肉质性状基因遗传标记的研究进展随着人民生活水平的提高,消费者对于食品品质认识的提高促使肉品加工业和零售业更加重视肉品的质量。

分子生物学技术的发展也让研究者认识到基于DNA标识的选育是最有效的选育手段。

如果相应性状不能用一定的标记进行识别就得将动物养育到正常屠宰月龄屠宰后才能检测分析相应性状,费时费力且成本高。

如果发现某一DNA标记(如多态性)和目标性状有联系就可以对年幼的动物进行基因型研究而不必等到屠宰时,并且可以敲除对性状有害的基因改良品种性状。

分子标记选育技术要能够持续地用于动物育种必须在我们发现使用现有的标记已经不能满足要求的情况下能够发现新的标记。

经过长时间建立的数据库是发现新的标记和检测候选基因的宝贵资源。

因此与肉质相关基因的研究显得尤为重要。

近年来,采用分子生物学技术对影响猪肉质性状的主效基因、候选基因及QTL定位已取得迅猛发展,下面就有关猪肉质性状基因及QTL定位的研究进展作扼要概括。

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星标记 与猪 部分 肉质 性状 相关 分析 等 微卫
3 1
变性 9 4℃ 3 , 0s退火 3 ,2o 4 ,0个 0S7 5s3 C 与性状显著相关 的微卫星标记进行分子标记辅助育 下循环 : 循环 , 结束后 7 2℃延伸 1 i, 保存 , 0m n4o C 其中退火 种, 高育种 的效率和选种的准确性 , 提 加快选育 的进 程 。因此研究猪 的微卫星标记 多态性分布及其与 肉 温度根据不同引物而 定。 取 P R反应产物 加 2 L上 样缓 冲液用 8 C %聚 质 性状 的相关分析具有 重要的意义[] 1。 - - 4 丙烯酰胺 电泳分离,银 染法显色 。在凝胶成像系统 1 材 料 与 方 法 上拍下试验结果 ,进 ~步分析等位基 因片段大小及 11 试验 动 物 及 测 定 性 状 . 试验于 2 0 年 1 o5 月至 20 年 3月在湖南省畜 基 因型 。 06 牧 兽医研 究所进 行 。选择湖南省畜牧 兽医研究所的 15 统 计 分 析 . 利用 S Sv . 软件的 G M过程 , A 81 L 进行微卫星标 试 验猪群 , 中湘黄猪 6头、 其 湘黄 × 白X 白( 长 长 大 黄 大)9头、 白X 围子 ( 围) 7头 、 围子 1 1 大 大 大 1 大 5头 , 记各基因型与各性状 间的相 关分析 。 4个 品种 共计 5 7头 。 2 结果 与分析 测定性状主要包括 失水率 、 肉率、 熟 滴水损失及 21 微 卫星标 记等位 基 因数 、 . 等位基 因频 率 、 杂合 水 分、 粗蛋 白质 、 内脂肪 含量等 , 肌 具体 测定方法 见 度 、 多态 信 息含 量 ∞ 参 考 文 献 -。 5 7 1 将 校 正的基 因型数据 用 C ru20处理 ,运 行 ∞ ∞ ev s. 船 ∞ 1 基 因组 D A 的提 取 . 2 N A lef q e c nls 程序 进行 分析 , 5 l l r u nyaa i e e ys 在 7头个
胴体瘦 肉率等生长和胴体性状为主,取得 了明显的 改 良效果 , 育种非常成功 。然而生长速度提 高, 肉质
却逐渐变劣 , 随着 人民生活水平 的提高, 消费者对 肉 质 以及 加工工业对 肉品一致性 的要求越来越 高 , 肉 质性状在猪 的育种 目标 中变得越来越重要,猪 肉质 性状 的选育 已经逐渐 为育种工作者所重视 。本论文
通过 选取位于猪 14 6号染色 体上 的 1 、、 5个微 卫星 标 记 , 与 6个 肉质 性 状 之 间进 行 标 记 一 状 关 联 分 性 析 , 出与猪 肉质 性状相关 的微卫星标记 , 找 利用这些 基酸 总量 比例及棕榈酸 、 硬脂酸 、 油酸和干物质含量
通讯 作 者 : 彭英 林 (9 5 , , 南双 峰 人 , 究 员 , 士 , 攻 动 16 一)男 湖 研 博 主 物遗 传 育种 .
取 鲜 耳 组织 置 于 1 LTp 管 冻 存 , 常规 苯 体 中共 检 测 到 1 微 卫 星 标 记 。各 位 点 等 位 基 因 . m is 5 按 2个 数为 2 8个 , 均等位基 因数 为 53 ~ 平 . 3个 ; 期望杂 合 酚/ 氯仿抽提 法提取基 因组 D A。 N
微 卫星标记具有数 量大、 分布广、 分布均匀 、 多 进 程 。 态性强、 准确度高和分析操作简便等优点 , 在家畜育 以往猪 的遗传育种 一直 以注重提 高生长速度和
种中被广泛应用 。微卫星标记与经济性状之间关系 的研 究对 于畜牧业的生产实践具有重要意义 ,利用 标记与经济性状 的连锁 ,找 到与经济性状紧密连锁 的微卫星标记 , 进行标记辅助选择育种 , 能加快育种
养 猪 S N R D TO () WI E P O UC I N 6
2 1 00
微 卫 星 标 记 与 猪 部 分 肉 质 性 状 相 关 分 析
朱 吉 冯 曙光 陈 , , 旭z孙建 帮 杨仕柳 彭英林 , , ,
4 0 2) 11 8 (. 1 湖南省畜牧兽医研 究所 , 湖南 长沙
收稿 日期 :0 0 1— 7 21—02 基 金 项 目 : 南 省科 技 厅 重 大专 项 (5 K10 — 1 湖 0 N 010 ) 作者简 介: 朱 吉(9 l , , 南望城人 , 18 一)女 湖 硕士 , 主攻动物遗传
育种 . — i z e g 1 2 . m E ma : tn l @1 6e li l o
传连锁 图谱, 在猪 的 14 6号染色体上平 均相隔 一 、、 定 间距各 选取 5个微卫星 标记位 点 ,共 1 5个微 卫 星标记 位点 , 引物 由上海 英俊 生物 公司 合成 , 引物 序 列 见 表 1 。
表 1 1 5个微 卫星 引物 序 列 及 退 火 温度 微 卫 星 上 游 引物 下 游 引 物
表 3 微 卫 星标 记 等 位 基 因及 其 频 率 位 点 等 位 基 因 频 率 ETS 21 29)1( 6424.9)2( 1524.9) SM 1 101322 .1) 1o 1323.0)2o8 ( 、 0 、 (2 、 0 、 (2 5 0 2
1 微 卫 星 标 记及 引物合 成 . 3
度 为 05 4 08 9 平 均杂 合 度 07 6 多态 信 息 含 . ~. , 0 3 .5 ;
根 据 国 内外 已发 表 相 关 文 献 以 及 在 此 领 域 的 量为 03 5 08 8 . . ,平 均 多态 信息含 量为 07 5 见 7 0 . , 0 研 究成果 ,参照美 国 U D MA C所 公布猪 的遗 表 2和 表 3。 S A— R
3 讨论与结论
31 胴体 性 能及 肉质 性 状 .
都以长大莱较高,说明长大莱猪肌 肉具有较浓 的鲜 贡‘ 生物学效价 ”营养价值更高 , , 其 长大 莱试验 猪含莱芜猪血统 2%、 5 大约克猪血 味和较高的蛋 白, ‘ 统 2 %、长 白猪血 统 5 %,大 大莱含 莱芜猪 血统 肌 肉的嫩度 、 5 0 多汁性和风 味较好 。 2 %、 5 大约克猪血统 7 %。屠宰测 定表 明, 5 大大 莱试 综 上所 述 , 大大莱 猪 的胴体 性 能较 高 , 长大 莱 验猪 的平均背膘较薄、 皮脂 率较低 、 胴体瘦 肉率较 高 猪 的肉品质 较好 , 养猪生产 实践中可根据市 场需要 (89%) 说 明其 胴 体 性 能 高 ; 大 莱 试 验 猪 的 肉 选择 合适的组合进行繁殖饲养 , 5 .3 , 长 以取得 良好 的经济 色和 大理石纹评分较高 , 失水率较低 , 内脂肪含量 效 益 。 肌 高 (. %) 说 明长大莱猪肌 肉具有感 官品质好 、 43 7 , 风 味优 美、 保水性好等优 良肉质特性 。 参考文献 : 32 背最长肌氨基酸、 . 脂肪酸等含量 [] 郭 建 风 , 英 , 述 东 , . 芜 猪 胴 体 品 质 肉质 特 性 及 其 随 1 武 魏 等 莱 氨基酸 是肉类鲜味 的主要来源之 一, 也是评价 体 重 变化 规 律 的研 究 [1 畜 生 态 学报 ,0 7 2 () 1— 9 J家 . 2 0 ,8 3 :5 1 . 2 王 现 M1 北 中 蛋 白质营养价值高低的重要指标 。肌 肉中脂肪 酸组 [】 陈 清 明 , 连 纯 . 代 养 猪 生产 『 . 京 : 国农 业 大 学 出 版 社 , 97 6 — 9 3 3 3 7 19 :8 6 ,5 — 5 . 成和含量与其食用品质密切相关[ 4 1 。试验得出, 长大 f1 郭建风, 3 王继英, 印, 专门化品系 Z Y猪生长性能、 体 张 等. F 胴 莱和 大大 莱试验猪 每 10g背最长肌 1 0 7种氨 基酸 性能及不 同部位肌 肉品质研究l1 J. ,0 9 ()2 — 7 养猪 2 0 ,3 :5 2 . 含量、 4种脂肪酸、 白质和干物质含量差异都不显 【] 郭 建 凤 , 英 , 德 云 , . 农 Ⅱ号 猪 生 长 肥 育 性 能 、 体 品 蛋 4 武 赵 等鲁 胴 著。氨基酸总量、鲜味氨基酸含量和必 需氨基酸含 质 及 肉质 的研 究 f. 猪 ,09 () 2 — 9 J养 ] 20 ,2 :7 2 . 量、 鲜味氨基酸 占氨基酸总量 比例、 必需氨基酸 占氨 ( 辑: 妮 ) 编 富春
从 CC C
表 2 微卫星标记多态信 息
S 3 1 T G T A c 他 A GI C T 哪 G T r队 ^ W10 GAAG 从 G. C A ℃ A rA
S 0 C G G 盯 I A A 从 A G T T G G A r℃ G G 从 G W7 5 T从 T _ G他 G C C G A A c TIA A G C S 7 W9 0 A T GA ACA从 TC G BG C A C A T G G G C C G A rA 唧 CA 从 m Cc
中图分类号 :8 8 S2 文献标 志码 : A
403;. 1 112湖南农业大学动物科学院, 南 长沙 湖
文章编号: O — 9 72 1)6 0 3— 3 1 2 15 (0 00 — 0 0 0 0
摘 要: 选取位 于猪 14 6号染色体上 的 1 、. 5个微卫星座位 , 以湘黄猪 、 湘黄× 白× 白( 长 大 黄长 大) 、 大 白× 围子( 大 大围) 大 围子等猪群 为研究材料 , 、 进行 了微 卫星标记 与部 分 肉质性状 的相 关性研 究。 微卫星座位 的群体遗传 学特性分析表 明, 各座位等位基 因数在 2 8 ~ 个之 间, 平均等位基 因数为 53 个 ; - 3 杂合度在 0 0 ~ . 9之 间, . 4 08 5 3 平均杂合度 为 0 5 ; . 6 多态信息含 量在 03 5 0 0 7 . ~ . 8之 间, 7 8 平均 多态信息含 量为 0 0 。 . 5 微卫星座位基 因型间方差分析结果表明, 卫星 E T 1 7 微 S MS 与失水率呈极显 著相关,W14 S 8 1与失水率呈显著相关 ; S M 1与熟肉率呈显著相关 ;W2 6与水分呈显著相关; ET S S 8 ET S S M 1与粗蛋 白质呈极 显著相关 ,W7 2与粗蛋 白质 呈显著 相关;W11 、W16 S 5 S 3 1S 4 2与肌 内脂肪 呈极显著相关,W8 1 S 7 与肌 内脂肪 呈显著相关。其他微 卫星座位未达到显著水平。 关键词 : ; 猪 微卫星标记 ; 肉质 性状 ; 相关分析
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