结直肠癌基因检测培训PPT-20181214

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你知道吗 结直肠癌需要检测哪些基因?

你知道吗 结直肠癌需要检测哪些基因?

你知道吗 结直肠癌需要检测哪些基因?

结直肠癌的发生、发展、浸润、转移是一系列分子基因参与、多步骤调控的极其复杂的机制,此过程常与细胞失控性增殖、逃脱凋亡有关,涉及原癌基因激活(常见有为C-myc基因、Ras基因及EGFR等)、错配修复基因突变(HMSHI、HLH1、PMS1、PMS2、GTBP)、抑癌基因失活(常见的有p53基因、DCC基因、APC基因等)以及一些危险修饰基因(如COX-2、CD44等)。

基于CRYSTAL研究,KRAS基因成为了结直肠癌患者抗EGFR靶向治疗前必须检测的首个分子标记物,自此开启了结直肠癌基于分子亚型靶向治疗的里程碑,随后BRAF、MSI/MMR、PIK3CA等基因丰富了结肠癌的基因检测。

在出国医疗发达的今天,了解结直肠癌中基因突变的分布,并结合患者临床一般情况进行分析,在接受术后辅助化疗的患者中评估相关基因的预后指导意义,对于研究中国人群特有的基因频谱特征和筛选适宜预后分子标志物都具有重要的参考价值。

一、RAS基因

RAS突变主要发生在KRAS第2号外显子的12、13密码子,在结直肠癌患者中KRAS第2号外显子的突变率在40%左右,SepulvedaAR等综合众多研究发现其他的RAS突变(包括KRAS3、4号外显子及NRAS的2、3、4外显子)的突变率约为16.7%~23.4%。

KRAS属于RAS基因家族(HRAS,NRAS,KRAS)中的一员,编码GTP/CDP结合蛋白,其作为EGFR下游信号通路的重要效应分子,主要激活RAF-MAPK通路进行后续信号转导,参与细胞的生长调控,在抗细胞调亡,介导肿瘤侵袭和转移,乃至肿瘤引起的新血管生成中起作用。

结直肠癌中约32%~40%的患者存在KRAS基因突变,存在KRAS突变的患者中约85%~90%的突变集中在第2号外显子的12、13密码子上,其余突变中约5%发生在61密码子上,5%发生在146外显子上。结肠直肠癌中KRAS基因的突变状态对靶向治疗的选择有着决定性的作用。

结直肠癌基因检测的意义

结直肠癌基因检测的意义

结直肠癌基因检测的意义

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普通人群大约有5%的结直肠癌患癌风险,大约20%-30%有大肠癌家族史,称为遗传相关大肠癌,此类结直肠癌经常表现出明显的家族聚集性,因此,此类患者的家属发生结直肠癌的风险也很高,属于高危人群。在导致遗传性结直肠癌的因素中,临床上最多见的是Lynch综合征(Lynch syndrome,LS)、家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatous polyposis,FAP)、MUTYH相关性息肉病(MUTYH-associated polyposis,MAP)、PJS综合征、JPS综合征等。 在我国每年结直肠癌新发病例达13-16万,已经成为五大癌症之一,而在这些患者中有20%有大肠癌家族史,因此,《NCCN指南》提出:所有的大肠癌患者都应该询问家族史,疑似遗传性大肠癌患者应当进行相应遗传学检测,做到早发现早预防,早诊断早治疗。随着基因检测技术的迅猛发展,使针对家族性结直肠癌进行基因突变筛查成为可能,对具有遗传高风险的家庭进行基因筛查,从而有效预防结直肠癌的发生,大大降低其发生率和死亡率。通过基因检测技术筛查结直肠癌高危人群(突变基因携带人群),从而预测患癌风险,做到及早干预和预防,节省治疗时间和成本;其次,针对结直肠癌患者可通过基因检测技术挖掘致病原因,从而提供针对性治疗方案以及预测其他患癌风险。

涵盖结直肠癌NCCN指南推荐的所有关键基因。 依据《NCCN指南》建议:满足如下条件之一的都应该进行LS的筛查检测:①符合Bethesda标准(修订)或Amsterdam标准;②年龄<50岁的子宫内膜癌;③有LS家族史。 附:Bethesda标准 1.结直肠癌发病年龄<50岁; 2.结直肠癌合并其余林奇综合征相关癌种(子宫内膜癌、胃癌、卵巢癌、胰腺癌、尿道和肾癌、胆道癌、脑癌、小肠癌、皮脂腺瘤、角化棘皮瘤),不论年龄; 3.结直肠癌发病年龄小于60岁并且为MSI-H; 4.为结直肠癌患者,且有一个及以上一级直系亲属诊断为林奇综合征相关癌症,其亲属发病年龄<50岁; 5.为结直肠癌患者,且有2个及以上一级或二级直系亲属诊断为林奇综合征相关癌症,不论年龄;阿姆斯特丹标准Ⅱ 1:亲属中3例以上患有组织学证实的HNPCC相关肿瘤(包括结肠癌、子宫内膜癌、小肠癌、肾盂输尿管癌); 2:其中1例为另2例的一级亲属: 3:肿瘤累及连续的二代人; 4:其中至少1例发病年龄小于50岁; 5:排除家族性息肉病。 需要进行APC遗传筛查的人群有:①结肠腺瘤数目>10个;②有硬纤维瘤的个人史;③APC基因有害突变的遗传家系成员。 需要进行MUTYH基因遗传筛查的人群有:①结肠腺瘤数目>10个;②符合锯齿型息肉病诊断标准但病理检查息肉有腺瘤变者;③有MUTYH基因双等位突变的遗传家系成员。 其余需要检测的类型包括PJS综合征(Peutz-Jeghers syndrome),主要检测STK11基因;JPS综合征(Juvenile polyposis syndrome),主要检测BMPR1A,SMAD4基因。

结直肠癌组织 KRAS 和 BRAF 基因突变情况及意义

结直肠癌组织 KRAS 和 BRAF 基因突变情况及意义

结直肠癌组织 KRAS 和 BRAF 基因突变情况及意义

宋敏;孙亚琼;张莉;潘琼

【摘 要】目的:观察结直肠癌组织KRAS、BRAF基因突变情况,并探讨其意义。方法采用实时荧光PCR及多重PCR-STR法检测477例结直肠癌组织KRAS基因外显子2第12、13位密码子的基因突变情况,其中315例同时检测BRAF基因外显子15的突变情况。随访记录无进展生存期( PFS),并分析基因突变与临床因素的关系。结果结直肠癌患者中KRAS基因突变率为24.5%,BRAF基因突变率为11.4%,未检测到同时发生KRAS与BRAF基因突变者。 KRAS基因突变型和野生型患者中分别有69.2%、30.0%出现肝转移,P<0.01;KRAS基因突变率在≥65岁、原发部位为右侧的患者中升高,P≤0.05。 BRAF基因突变率在男性、高分化、TNM分期Ⅲ~Ⅳ期患者中升高,P均<0.05。 KRAS、BRAF基因突变型和野生型的PFS比较,P均>0.05。结论在结直肠癌患者中,KRAS基因突变与年龄、发病部位及发生肝转移有关,BRAF基因突变与性别、分化程度、肿瘤TNM分期有关;联合检测两基因突变情况有助于判断病情。

【期刊名称】《山东医药》

【年(卷),期】2014(000)032

【总页数】3页(P32-34)

【关键词】结直肠癌;KRAS;BRAF;基因突变;序列分析

【作 者】宋敏;孙亚琼;张莉;潘琼 【作者单位】郑州大学第一附属医院,郑州450052;郑州大学第一附属医院,郑州450052;郑州大学第一附属医院,郑州450052;郑州大学第一附属医院,郑州450052

【正文语种】中 文

【中图分类】R739.5

结直肠癌是三大常见的恶性肿瘤之一,多数患者就诊时已经处于晚期,失去了手术治疗的最佳机会。临床试验证明,西妥昔单抗、帕尼单抗等表皮生长因子受体(EGFR)拮抗剂治疗转移性结直肠癌的疗效较常规化疗显著提高,但只有KRAS野生型患者从中受益[1,2]。KRAS对抗 EGFR 治疗的预测作用已经明确,但其与临床特征、预后之间的关系无明确结论。而关于BRAF基因的研究相对较少,虽被报道与抗 EGFR 耐药相关[1,3],但其突变状态与病情及预后的关系尚无定论。2010年1月~2013年12月,我们观察了结直肠癌组织KRAS和BRAF基因突变情况,并探讨其意义。

结直肠癌基因组研究研究方案

结直肠癌基因组研究研究方案

结直肠癌基因组研究研究方案

全文共四篇示例,供读者参考

第一篇示例:

结直肠癌是一种常见的恶性肿瘤,其致病机制和基因组学特征一直备受关注。随着高通量测序技术的发展,人们对结直肠癌基因组进行研究的深度和广度不断扩大。本文将介绍一份关于结直肠癌基因组研究的研究方案,希望能够为深入了解结直肠癌的发病机制和个体化治疗提供参考。

一、研究目的

本研究旨在探讨结直肠癌的基因组学特征,分析结直肠癌的致病机制和演化过程,发现潜在的致病基因和驱动突变,为结直肠癌个体化治疗提供依据。

二、研究方法

1. 数据样本采集:从结直肠癌患者中收集组织样本和血液样本,进行基因组学分析。

2. 高通量测序:运用全基因组测序、外显子测序和RNA测序技术,对结直肠癌患者样本进行全面测序。

3. 生物信息学分析:对测序数据进行生物信息学分析,包括突变筛查、拷贝数变异分析、功能富集分析等。 4. 临床数据整合:整合临床病理数据、生存数据和治疗反应数据,进行生物信息学和统计学分析。

5. 功能实验验证:对筛选出的潜在致病基因进行功能实验验证,探索其在结直肠癌发生发展中的作用机制。

6. 个体化治疗研究:根据结直肠癌患者研究结果,探讨个体化治疗策略,包括靶向治疗、免疫治疗等。

三、预期研究成果

1. 揭示结直肠癌的基因组学特征,发现新的致病基因和驱动突变。

2. 确定结直肠癌患者的分子亚型和预后标志物,实现个体化诊疗。

3. 探索结直肠癌的发病机制和治疗靶点,为临床治疗提供新的思路和方法。

四、研究意义和应用价值

本研究将有助于深入了解结直肠癌的分子机制,为临床治疗提供新的方向和策略。通过个体化治疗模式,可以提高结直肠癌患者的治疗效果和生存率。研究结果还将为其他恶性肿瘤的基因组学研究提供借鉴和启示。

结直肠癌基因组研究是一个具有重要意义和广阔前景的领域。通过深入研究结直肠癌的基因组学特征,我们可以更好地理解这一疾病的发生发展过程,为患者提供更有效的个体化治疗方案,实现精准医学的目标。希望本研究方案能够得到实施,并取得预期成果,为结直肠癌患者带来新的希望和福音。【2000字】。

结直肠肿瘤相关基因与靶向药物的研究进展

结直肠肿瘤相关基因与靶向药物的研究进展

结直肠肿瘤相关基因与靶向药物的研究进展

摘要:结直肠肿瘤(CRC)是世界上最常见的异质性恶性肿瘤之一,且发病率和死亡率在不断升高。结直肠肿瘤发病率与经济发展有着一定关系,发达国家最高,我国亦不断攀升。现有技术可短期内改善患者预后,但对于病死率与后期转移比例并无明确效果。随着近年来对肿瘤发病机制、分子及亚分子的深入研究,传统医学与现代医学对结直肠肿瘤的理解与认知不断提高。基于此,本文通过对结直肠肿瘤的基本情况、原癌基因、抑癌基因、靶向药物治疗及联合用药等方面对结直肠肿瘤已有研究进行梳理总结,旨在为现阶段结直肠肿瘤的基因研究、靶向药物研发与推广提供研究基础,为进一步开展结直肠癌发病机制的研究打下基石,以及在靶向治疗方面提供借鉴方案。

关键词:结直肠肿瘤;靶向药物;相关基因

引言

结肠癌的治疗基于手术切除,辅以化疗和放射治疗的综合治疗。近年来,随着化疗药物的进步和靶向药物的应用,转移性结直肠癌患者的生存时间明显改善,中位生存时间从原来的3.6~6个月延长到24~28个月。化疗的有效性已进入平台阶段,分子靶向治疗是改善晚期结直肠癌预后的主要治疗手段。近两年来,随着靶向治疗研究和基因分型研究的深入,国内外批准了更多的靶向药物。分子靶向药物已经发展成为一线结直肠癌的个性化和综合治疗,为结直肠癌患者带来更好的生存益处。新的靶向药物为患者提供了更多的治愈和生存的愿望,但也有一些患者可能会有不良反应。靶向药物的不良反应与传统化疗不同,不同靶向药物的不良反应范围因目标和途径的差异而异。靶向药物已成为最令人担忧和最有希望的治疗方法之一。

1概述 目前临床上精准治疗主要是根据肿瘤分子生物标志物的检测结果来选择相应的靶向药物治疗方案,从而提高治疗方案的针对性,最大限度地提高患者的5年生存率。临床上针对结直肠癌靶向治疗主要包括抗血管内皮生长因子及受体(VEGF/VEGFR)为靶点、针对以表皮生长因子受体(EGFR)为靶点的靶向治疗及多靶点激酶抑制剂类药物。

结直肠癌组织KRAS、BRAF基因突变情况及其临床意义

结直肠癌组织KRAS、BRAF基因突变情况及其临床意义

结直肠癌组织KRAS、BRAF基因突变情况及其临床意义

陈伊;韦常宏;宁淑芳;韦文娥;刘海洲;利基林;张力图

【摘 要】目的 探讨结直肠癌组织KRAS、BRAF基因突变情况及其临床意义.方法

选择行手术治疗的结直肠癌患者262例,采用ARMS-PCR法检测其结直肠癌组织KRAS基因外显子2第12、13位密码子及BRAF V600E基因突变情况,分析其与患者临床病理参数、肝转移及预后的关系.结果 262例结肠癌患者中女性患者98例.262例份结肠癌组织中,KRAS基因突变49例(18.7%),其中第12位密码子突变37例(包括1例KRAS复合突变),第13位密码子突变12例;184例份结肠癌组织中,BRAF V600E基因突变6例.结直肠癌组织KRAS基因突变与患者性别(女性)、原发肿瘤直径、远处转移情况均有关,BRAF基因突变与民族、家族史、原发肿瘤分化程度均有关(P均<0.05).同时性肝转移患者KRAS基因突变率高于异时性肝转移患者,KRAS基因G13D突变率低于异时性肝转移患者(P均<0.05).KRAS基因突变的结直肠癌患者生存时间短于未突变者(P<0.05).KRAS基因突变是结直肠癌患者预后的独立危险因素(P<0.01).BRAF基因突变与未突变者生存时间比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 结直肠癌组织KRAS基因突变率高,BRAF基因突变率低;KRAS基因突变多发生于女性,与结直肠癌的发生、发展有关.

【期刊名称】《山东医药》

【年(卷),期】2017(057)016

【总页数】4页(P77-80)

【关键词】结直肠癌;KRAS基因;BRAF基因;基因突变;预后

【作 者】陈伊;韦常宏;宁淑芳;韦文娥;刘海洲;利基林;张力图 【作者单位】广西医科大学附属肿瘤医院,南宁 530021;广西医科大学附属肿瘤医院,南宁 530021;广西医科大学附属肿瘤医院,南宁 530021;广西医科大学附属肿瘤医院,南宁 530021;广西医科大学附属肿瘤医院,南宁 530021;广西医科大学附属肿瘤医院,南宁 530021;广西医科大学附属肿瘤医院,南宁 530021

抽血就能检测结直肠癌septin9基因甲基化检测早提示

抽血就能检测结直肠癌septin9基因甲基化检测早提示

大肠癌呈现出年轻化、高发病率的特点,要想提升患者的长期生存率,就要尽早发现。以往需要做肠镜及大便暗血实验,取病理活检进行诊断,然而很多人都害怕做肠镜检查,使得一些患者由于肿瘤较大导致肠梗阻才去就诊,已经发展到局部晚期。当前医学已步入到靶向治疗、基因检测、免疫治疗时期,而septin9基因甲基化检测,可以在大肠癌早期检测中应用,受到了人们的认可。

1、肠癌的高危人群

肠癌是一种高发病率的恶性肿瘤,很多患者发现就是晚期。随着人们的饮食习惯改变等因素影响,疾病的患病率日益提升,且年轻人患疾病的数量不断增加。有几类人群容易患上肠癌,主要包括:第一,有家族遗传病史。如果家庭中有直系亲属换过该疾病,那么相较于其他人,其患病概率要高出八倍。有1/4的患者有家属患病史。第二,有结肠息肉。部分大肠癌是从癌前病变发展的,即息肉。绒毛样腺瘤样息肉更易发展成癌症,几率为25%。管状腺瘤样息肉变成癌症的概率是1%-5%。第三,慢性溃疡性结肠炎患者。第四,中老年人。患者很多都超过50岁,随着年龄增加,相关的致病因素对于大肠黏膜的刺激时间增加,因此,患者年龄较高,也有一些患者年龄较小。最后,吸烟喝酒人群。有研究显示,吸烟的人相较于没有吸烟的人,患大肠癌的风险更高。如果有大肠息肉及大肠癌的家族病史,每天喝酒超过30g,会提升患大肠癌的概率。

2、什么是septin9基因甲基化检测?

septin9基因是直肠癌及结肠癌病人特有的血液标志物,septin9基因甲基化是早期筛查直肠癌的方式之一,特异性较高,通常在95%左右。通过这一检测,能够了解检测人员的血液样本中是不是有septin9基因的DNA,若是检查发现,代表着患者可能会患结肠癌或直肠癌,需要继续做肠镜以及病理检查,综合检查结果之后做出诊断。septin9基因甲基化在I期结直肠癌检测中的应用,灵敏度约为60%;在II-III期检测中应用,灵敏度超过80%;在IV期检测中应用,灵敏度超过90%。在检测前,患者不用进行特殊的准备,可以正常喝水和吃东西,直接抽血送去检测就可以。全血标本应该在2-8摄氏度中保存,不可以超过24小时,禁止冷冻。

结直肠癌患者KRAS、NRAS、BRAF基因突变与临床病理特征关系的研究

结直肠癌患者KRAS、NRAS、BRAF基因突变与临床病理特征关系的研究

贠田;王长松;李富林;吕学霞;蒙念龙;高春芳

【摘 要】目的 探讨在结直肠癌中KRAS、NRAS和BRAF基因突变的状态与病理学因素之间的关系.方法采用RT-PCR的方法检测389例结直肠癌患者的KRAS、NRAS和BRAF基因突变情况,并用统计学方法分析与临床病理学因素之间的关系.结果KRAS总突变率为42.4%,该基因在直肠的突变率显著高于结肠.NRAS和BRAF基因的突变率分别为4.6%和4.1%,这两个基因的突变状态与临床病理学关系不大.结论KRAS、NRAS和BRAF基因属于相互联系的通路,一个发生突变将制约另外两个基因的发生改变,检测结直肠癌中KRAS、NRAS和BRAF基因的突变状态能够更好地指导个体化治疗.

【期刊名称】《实用医药杂志》

【年(卷),期】2019(036)008

【总页数】4页(P733-736)

【关键词】结直肠癌;KRAS;NRAS;BRAF;临床病理特征

【作 者】贠田;王长松;李富林;吕学霞;蒙念龙;高春芳

【作者单位】471031 河南洛阳,解放军第989医院病理科;471031 河南洛阳,解放军第989医院病理科;471031 河南洛阳,解放军第989医院病理科;471031 河南洛阳,解放军第989医院病理科;471031 河南洛阳,解放军第989医院病理科;471031

河南洛阳,解放军第989医院病理科 【正文语种】中 文

【中图分类】R735.34

散发性结直肠癌是消化道最常见的恶性肿瘤之一,发病率和病死率长期高居恶性肿瘤前列。结直肠癌的发生发展是多基因、多步骤的复杂过程,个体差异较大,随着精准治疗时代的来临,基于基因检测治疗策略的选择在提升结直肠癌的诊治水平中发挥着巨大的作用,在结直肠癌靶向治疗过程中检测KRAS、NRAS、BRAF基因突变状态对于结直肠癌的治疗有很重要的意义[1,2]。结直肠癌是一个复杂的多基因参与的疾病,这些个体化药物的靶点基因在结直肠癌中起到关键的作用,因此探讨这些靶点与病理学因素之间的关系也很有必要。此前也有很多的文献对这些基因进行研究,但是学者们对于这些基因与临床病理之间的关系众说纷纭,因此该文采用大样本量的病例更进一步研究在结直肠癌患者中,KRAS、NRAS、BRAF

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