生物信息学选择题
生物信息学选择题
Document number【980KGB-6898YT-769T8CB-246UT-18GG08】 GenBank数据库的基本信息单位是（ B）。
A. FASTA
B. GBFF
C. GCG
D.
DNA中Tm值与( )含量成正比。(B)
A. G+A
B. G+C
C. T+C
D. A+T
目前应用于基因芯片表达数据统计分析的主要方法是（C ）。
A. 卡方检验
B. 相关分析
C. 聚类分析
D. 正态性分布检验
蛋白质信号肽的预测工具有（D ）。
A. nnpredict
B. PredictProtein
C. SingalD
D. SingalP
隐马尔科夫模型的代号是（ A）。
A. HMM
B. CDD
C. HTGS
D. GSS
如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用（ B）。
A. NDB数据库
B. PDB数据库
C. GenBank数据库
D. SWISS-PROT数据库
RGP是（D ）。
A. 在线人类孟德尔遗传数据
B. 国家核酸数据库
C. 人类基因组计划
D. 水稻基因组计划
蛋白质基序（motif）中[ST]的含义是（C ）。
A. 氨基酸为ST
B. 氨基酸为S和T
C. 氨基酸为S或T
D. 除掉S和T之外的任意氨基酸
构建进化树工具是（C ）。
A. BLAST
B. ClustalW
C. Mega D. GCG
没有直接参与完成人类基因组计划的国家是（C）
A. 英国
B. 中国
C. 俄罗斯
D. 德国
限制性片段长度多态性标记是（ A）。
A. RFLP
B. SNP
C. SSR
D. RAPD
PDB是蛋白质的（ B）。
A. 分类数据库
B. 结构数据库
C. 模体数据库
D. 结构域数据库
基本局部比对搜素工具是C ）。
A. Mega
B. ClustalW
C. BLAST
D. GCG
单核苷酸标记是（B）。
A. RFLP
B. SNP
C. SSR
D. RAPD
国际三大核酸数据库每间隔多长时间就互相交换数据库里的数据（A ）。
A. 1天
B. 7天
C. 10天
D. 30天
将核酸序列按照6条链翻译成蛋白质序列后搜索蛋白质序列数据库使用的程序是（B ）。
A. blastp
B. blastx
C. tblastn
D. tblastx
OMIM是（A ）。
A. 在线人类孟德尔遗传数据库
B. 国家核酸数据库
C. 人类基因组计划
D. 水稻基因组计划
NCBI的含义是（ A）。
A. 美国国家生物信息中心 B. 欧洲分子生物学实验室
C. 日本DNA数据库
D. 中国基因组研究中心
PIR是（ D）。
A. 核酸数据库
B. mRNA数据库
C. 启动子数据库
D. 蛋白质数据库
GenBank是（B ）。
A. 在线人类孟德尔遗传数据
B. 国际核酸数据库
C. 人类基因组计划
D. 水稻基因组计划
EMBL的含义是（B ）。
A. 美国国家生物信息中心
B. 欧洲分子生物学实验室
C. 日本DNA数据库
D. 中国国家基因组研究中心
DDBJ的含义是（ C）。
A. 美国国家生物信息中心
B. 欧洲分子生物学实验室
C. 日本DNA数据库
D. 中国基因组研究中心
TAIR（AtDB）数据库是（C ）。
A. 线虫基因组
B. 果蝇基因组
C. 拟南芥数据库
D. 大肠杆菌基因组
微卫星标记是（C）。
A. RFLP
B. SNP
C. SSR
D. RAPD
被誉为“生物信息学之父”的科学家是（D ）。
A. Dulbecco
B. Sanger
C. 吴瑞
D. 林华安
根据大量EST具有相互重叠的性质，通过计算机算法获得cDNA全长序列，这种克隆基因的方法是（ B）。
A. 重叠克隆
B. 电子克隆
C. 基因步移
D. 基因重组 HGP是（C）。
A. 在线人类孟德尔遗传数据
B. 国家核酸数据库
C. 人类基因组计划
D. 水稻基因组计划
NCBI中人类无冗余基因数据库是（ A）。
A. UniGene
B. UniPro
C. UniRef
D. URF
生物芯片分析中使用的聚类分析输出图形主要以下列哪种方式表现（A）
A. 以彩色小方块阵列表示
B. 以蜂窝形状表示
C. 以黑白圆点表示
D. 以彩色线条表示
GenBank中分类码PLN表示是（ D）。
A. 哺乳类序列
B. 细菌序列
C. 噬菌体序列
D. 植物、真菌和藻类序列
Entrez数据库中的剪贴板的容量是（A ）。
A. 500条记录
B. 1000条记录
C. 5000条记录
D. 10000条记录
提交序列到GenBank中，使用的程序可以是（D ）。
A. Entrez
B. SRS
C. Medline
D. BankIt
限制性片段长度多态性标记是（ A）。
A. RFLP
B. SNP
C. SSR
D. RAPD
构建系统发生树，应使用（C ）。
A. BLAST
B. FASTA
C. UPGMA
D. FTP
从cDNA文库中获得的短序列是（D ）。
A. STS
B. UTR
C. CDS D. EST
下列Fasta格式正确的是（B ）。
A. seq1:
agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
B. >seq1
agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
C. seq1:agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta
D. >seq1agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctt
SAGE的含义是（A ）。
A. 基因表达连续分析
B. 聚丙烯酰胺凝胶电泳
C. 基因组分析
D. 双向电泳分析
CDS的含义是（A ）。
A. 编码区
B. 非编码区
C. 低复杂度区域
D. 非调控区
ORF的含义是（D ）。
A. 调控区
B. 非编码区
C. 低复杂度区域
D. 开放阅读框
STS的含义是（B ）。
A. 表达序列标签
B. 序列标签位点
C. 高通量基因组序列
D. 人工合成序列
Blast结果中HSP的含义是（B ）。
A. 空位
B. 期望值
C. 过滤
D. 高分配对片段
ortholog的含义是（ A）。
A. 直系同源
B. 旁系同源
C. 直接进化
D. 间接进化
Genomics的含义是（B ）。
A. 生物信息学
B. 基因组学
C. 蛋白质组学
D. 表观遗传学
accession number的含义是（ A）。 A. 登录号
B. 算法
C. 比对
D. 类推
LCR的含义是（ C）。
A. 编码区
B. 非编码区
C. 低复杂度区域
D. 开放阅读框
base pair的含义是（ C）。
A. 基序
B. 跨叠克隆群
C. 碱基对
D. 结构域
motif的含义是（A ）。
A. 基序
B. 跨叠克隆群
C. 碱基对
D. 结构域
UTR的含义是（B ）。
A. 编码区
B. 非编码区
C. 低复杂度区域
D. 开放阅读框
HTGS的含义是（C ）。
A. 表达序列标签
B. 序列标签位点
C. 高通量基因组序列
D. 人工合成序列
domain的含义是（D ）。
A. 基序
B. 跨叠克隆群
C. 碱基对
D. 结构域
algorithm的含义是（B ）。
A. 登录号
B. 算法
C. 比对
D. 类推
contig的含义是（B ）。
A. 基序
B. 跨叠克隆群
C. 碱基对
D. 结构域
《生物信息学》题集
《生物信息学》题集
一、选择题（每题3分，共30分）
1. 生物信息学的主要研究对象是什么？
A. 蛋白质结构
B. 基因序列
C. 生态系统
D. 细胞代谢
2. 下列哪项技术不是生物信息学中常用的数据库技术？
A. BLAST
B. GenBank
C. PubMed
D. SWISS-PROT
3. 在生物信息学中，进行多序列比对时常用的软件是什么？
A. MATLAB
B. ClustalW
C. Excel
D. PowerPoint
4. 哪种算法常用于基因表达数据的聚类分析？
A. K-means
B. Dijkstra
C. A*
D. Floyd 5. 生物信息学中，下列哪项不是常用的序列分析技术？
A. PCR
B. 测序
C. 质谱分析
D. 芯片技术
6. 下列哪项不是生物信息学在医学领域的应用？
A. 疾病诊断
B. 药物设计
C. 天气预报
D. 个性化医疗
7. 下列哪项技术常用于生物大分子的结构预测？
A. NMR
B. X射线衍射
C. 同源建模
D. 质谱分析
8. 在生物信息学中，下列哪项不是基因注释的内容？
A. 基因功能
B. 基因表达水平
C. 基因在染色体上的位置
D. 基因的长度
9. 下列哪项技术不是高通量测序技术？
A. Sanger测序 B. Illumina测序
C. 454测序
D. SOLiD测序
10. 下列哪项不是生物信息学在农业领域的应用？
A. 作物育种
B. 病虫害防治
C. 土壤成分分析
D. 农产品品质改良
二、填空题（每题2分，共20分）
1. 生物信息学是一门交叉学科，它主要涉及______、计算机科学和数学等领域。
2. 在生物信息学中，______技术常用于基因序列的相似性搜索。
3. 生物信息学在药物研发中的主要应用包括______和药物靶点的预测。
4. 在基因表达数据分析中，______是一种常用的数据标准化方法。
生物信息学考试试题
生物信息学考试试题
一、选择题（每题 3 分，共 30 分）
1、 以下哪种不是常见的生物信息学数据库？（ ）
A GenBank
B SWISSPROT
C PubMed
D Baidu
2、 在 DNA 序列分析中，以下哪个不是用于序列比对的算法？（ ）
A NeedlemanWunsch 算法
B SmithWaterman 算法
C BLAST 算法
D Fourier 变换算法
3、 蛋白质结构预测的方法不包括（ ）
A 同源建模
B 从头预测
C 折叠识别
D 随机模拟 4、 以下哪种不是基因表达数据分析的常用方法？（ ）
A 聚类分析
B 主成分分析
C 判别分析
D 回归分析
5、 生物信息学中，用于预测蛋白质功能的方法有（ ）
A 基于序列相似性
B 基于结构相似性
C 基于基因共表达
D 以上都是
6、 在基因组学中，以下哪个不是测序技术？（ ）
A Sanger 测序
B 二代测序
C 三代测序
D 四代测序
7、 系统发生树构建的方法不包括（ ）
A 距离法 B 最大简约法
C 最大似然法
D 最小二乘法
8、 以下哪种不是生物信息学中常用的编程语言？（ ）
A Python
B Java
C C+＋
D Visual Basic
9、 以下哪个不是生物信息学在医学领域的应用？（ ）
A 疾病诊断
B 药物研发
C 医疗美容
D 个性化医疗
10、 生物信息学中，处理大规模数据常用的工具是（ ）
A Excel
B R 语言
C SPSS
D Word 二、填空题（每题 2 分，共 20 分）
1、 生物信息学是一门融合了生物学、计算机科学和（ ）的交叉学科。
2、 常见的核酸序列格式有 FASTA 和（ ）。
3、 蛋白质的二级结构包括α螺旋、β折叠和（ ）等。
4、 基因芯片技术是一种（ ）分析技术。
5、 序列比对的目的是寻找两个或多个序列之间的（ ）。
生物信息学试题及答案
生物信息学试题及答案
一、单项选择题（每题2分，共20分）
1. 生物信息学的主要研究对象是（ ）。
A. 生物数据
B. 生物实验
C. 生物模型
D. 生物技术
答案：A
2. 下列哪项不是生物信息学中的常用数据库（ ）。
A. GenBank
B. Swiss-Prot
C. PubMed
D. Google Scholar
答案：D
3. 蛋白质序列比对的主要目的是（ ）。
A. 确定蛋白质的三维结构
B. 预测蛋白质的功能
C. 比较蛋白质的氨基酸序列
D. 计算蛋白质的分子量
答案：B
4. 在生物信息学中，以下哪种算法不是用于序列比对的（ ）。
A. BLAST
B. FASTA
C. Smith-Waterman
D. Hidden Markov Model
答案：D
5. 下列哪种生物信息学工具主要用于基因表达分析（ ）。
A. ClustalW
B. Primer3
C. R语言
D. PDB
答案：C
6. 以下哪种技术不是用于蛋白质结构预测的（ ）。
A. 同源建模
B. 从头预测
C. 序列比对
D. 折叠识别
答案：C
7. 以下哪种生物信息学工具主要用于基因组注释（ ）。
A. BLAST B. Pfam
C. GATK
D. Primer3
答案：B
8. 在生物信息学中，以下哪种方法不用于基因表达数据的聚类分析（ ）。
A. K-means
B. Hierarchical clustering
C. Principal component analysis
D. Multiple sequence alignment
答案：D
9. 下列哪种生物信息学工具主要用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析（ ）。
A. STRING
B. BLAST C. Pfam
D. Primer3
答案：A
10. 在生物信息学中，以下哪种数据库不包含蛋白质结构信息（ ）。
A. PDB
四川大学普通生物学2006
四川大学
2006年攻读硕士学位研究生入学考试试题
考试科目：生物学
科目代码：356
适用专业：植物学、动物学、微生物学、遗传学、细胞生物学、生物化学与分子
生物学、生态学、生物信息学、生物安全、结构生物学、农药学（试题共四页）
一、选择题：选择正确的一个或几个答案写在答题纸上。（总计30分，每题2分，
不答全不得分）
1、染色体组型研究关注的是染色体的（ ）。
A、数目； B、形态； C、大小； D、核苷酸的序列
2、RNA组成成分是（ ）
A、脱氧核糖，磷酸，碱基； B、核糖，碱基，磷酸；
C、氨基酸，葡萄糖，碱基； D、戊糖，碱基，磷酸。
3、在正常人体中，病毒感染细胞后，相邻细胞会产生（ ）。
A、类毒素； B、抗生素 C、外毒素 D、干扰素
4、植物茎运输有机养分的管道是（ ）
A、筛管； B、导管； C、伴胞 D、乳汁管
5、高等动植物体内的细胞主要是二倍体的，例外的是单倍体的（ ）。
A、卵母细胞； B、精母细胞； C、精细胞； D、卵细胞。
6、光周期的形成是因为植物体内存在（ ） ，它们能够感知光的性质。
A、叶绿素； B、光敏色素； C、成花素； D、花青素
7、物种数量最多的纲是（ ）。
A、被子植物纲 B、昆虫纲 C、鸟纲 D、两栖纲
8、白蚁与其消化道中的原生动物的关系是（ ）。
A、捕食 B、寄生 C、互利共生 D、共栖
9、在mRNA上的起始密码子和终止密码子可能分别是（ ）。
A、UAG、CAU； B、AUG、UAG；
C、AUG、UAA； D、AUG、UGA。
10、生态演替的终极阶段是（ ），其中各主要种群的出生率和死亡率达到平衡，
能量的输入和输出以及生产量和消耗量也达到平衡。
A、顶级群落； B、优势群落； C、热带雨林； D、全球沙化
11、有三个物种的拉丁学名分别为： ○1Pinus palustris, ○2Quercus palustris,○
3Pinus Echinata, 可以判断，亲缘关系较近的两个物种是（ ）。
生物信息学试题答案(2)
外科理论与实践２００７年第１２卷第４期
生物信息学试题答案（２）
一、单选题（每题１分。１０题＝１０分） １．以下哪一种不属于医学信息数据库范畴：（Ｄ） Ａ．医学影像学数据库 Ｂ．实验室检验数据库 Ｃ．临床病史数据库 Ｄ．后勤被服库 Ｅ．以上均是 ２．可在网站免费下载使用的生物芯片数据分析平台ＣＬＵＳ． ＴＥＲ和ＴＲＥＥＶＩＥＷ是以下哪所大学所开发：（Ｂ） Ａ．英国牛津大学 Ｂ．美国斯坦福大学 Ｃ．美国耶鲁大学 Ｄ．巴黎第七大学 Ｅ．日本东京大学 ３．以下哪一项不属于启动子研究范围：ｆＤ） Ａ．启动子预测 Ｂ．ＣｐＧ岛预测 Ｃ．转录起始点预测 Ｄ．糖基化修饰 Ｅ．甲基化检测 ４．Ｗｅｂｇｅｎｅ的ＣｐＧ岛预测程序是由哪个国家开发？（Ｂ） Ａ．英国 Ｂ．意大利 Ｃ．德国 Ｄ．法国 Ｅ．美国 ５．关于医学数据挖掘的目的哪一项是不对的：（Ｅ） Ａ．预测疾病 Ｂ．对疾病进行科学分类 Ｃ．发现新型诊断标识 Ｄ．寻找新型治疗靶点 Ｅ．发现患者隐私 ６．以下哪一种不属于外科学领域国际刊物：（Ｃ） Ａ．美国外科学杂志 Ｂ．英国外科学 Ｃ．美国血液病杂志 Ｄ．外科学文献 Ｅ．外科学年鉴 ７．抑癌基因失活与启动子的关系哪一项是正确的：（Ｂ） Ａ．启动子磷酸化 Ｂ．启动子高甲基化 Ｃ．启动子低甲基化 Ｄ．启动子糖基化 Ｅ．以上均不对 ８．ＰＣＲ方法可以检测的信息是：（Ａ） Ａ．基因突变 Ｂ．蛋白修饰 Ｃ．细胞有丝分裂 Ｄ．以上均是 Ｅ．以上均不是 ９．医学分子生物学研究中哪种技术是目前使用最多、最广 泛的技术：（Ｃ） Ａ．荧光显微镜 Ｂ．流式细胞仪 Ｃ．ＰＣＲ技术 Ｄ．质谱技术 Ｅ．以上均不是 １０．生物芯片分析中使用的聚类分析输出图形主要以下列 哪种方式表现：（Ａ） Ａ．以彩色小方块阵列表示 Ｂ．以蜂窝形状表示 Ｃ．以黑白圆点表示 Ｄ．以彩色线条表示 Ｅ．以上均可以 ・附６３・
二、多选题（每题２分。１０题＝２０分） １．生物信息学在医学研究中的作用包括：（Ｄ） Ａ．协助科研选题 Ｂ．文献检索 Ｃ．实验结果分析 Ｄ．以上均是 Ｅ．以上均不是 ２．当前丙型肝炎诊治中存在的问题包括：（Ｅ） Ａ．肝脏组织学与血清学检测结果不符 Ｂ．不同试剂的阳性检出率不一致 Ｃ．ＨＣＶ抗原的阳性定位不统一 Ｄ．ＲＮＡ病毒本身不稳定 Ｅ．以上均是 ３．分子生物学引物设计时的注意点有：（ＡＢＣ） Ａ．引物长度 Ｂ．引物退火温度 Ｃ．引物中的ＧＣ含量 Ｄ．室内温度 Ｅ．室外温度 ４．抑癌基因的失活与以下哪些情况有关：（Ｄ） Ａ．启动子甲基化 Ｂ．基因缺失 Ｃ．基因突变 Ｄ．以上均是 Ｅ．以上均不是 ５．关于人工神经网络的概念哪些是对的：（ＢＣＤ） Ａ．机器人脑芯片 Ｂ．一种生物统计方法 Ｃ．模拟人脑神经元结构 Ｄ．数据挖掘方法之一 Ｅ．以上均不对 ６．医学信息挖掘中需要以下哪些人员的通力合作：（Ｅ） Ａ．智能信息处理人员 Ｂ．计算机软硬件人员 Ｃ．应用数学研究人员 Ｄ．医务工作者 Ｅ．以上均是 ７．国际著名的生物医学综合类期刊包括：（ＡＢＣＤ） Ａ．自然杂志（ｎａｔｕｒｅ） Ｂ．细胞杂志（ｃｅｌ１） Ｃ．科学杂志（ｓｃｉｅｎｃｅ）Ｄ．柳叶￣（１ａｎｃｅｔ） Ｅ．中华外科杂志 ８．医学分子生物学领域的国际刊物包括：（ＡＢＣＤＥ） Ａ．美国人类遗传学杂志 Ｂ．美国医学遗传学杂志 Ｃ．生物化学 Ｄ．蛋白质组 Ｅ．核酸研究 ９．ＰＣＲ反应中出现哪些现象代表扩增失败：（ＡＢＣ） Ａ．扩增出多条带 Ｂ．不出目的带或出目的带很弱 Ｃ．引物二聚体带 Ｄ．目的基因条带清晰 Ｅ．以上均不对 １０．消化病学领域国际刊物包括：（ＡＢＣ） Ａ．美国胃肠道 Ｂ．ＢＭＣ胃肠道 Ｃ．肝脏病
生物信息学重点
⽣物信息学重点
⼀、名解1.⽣物信息学：（狭义）专指应⽤信息技术储存和分析基因组测序所产⽣的分⼦序列及其相关数据的学科；
（⼴义）指⽣命科学与数学、计算机科学和信息科学等交汇融合所形成的⼀门交叉学科。2.⼈类基因组测序计划：
3基因组学：以基因组分析为⼿段，研究基因组的结构组成、时序表达模式和功能，并提供有关⽣物物种及其细胞功能的进化信息。p1504基因组：是指⼀个⽣物体、细胞器或病毒的整套基因。p150
5.⽐较基因组学：是指基因组学与⽣物信息学的⼀个重要分⽀。通过模式⽣物基因组之间或模式⽣物基因组与⼈类基因组之间的⽐较与鉴别，可以为研究⽣物进化和分离⼈类遗传病的候选基因以及预测新的基因功能提供依据。p1666功能基因组：表达⼀定功能的全部基因所组成的DNA序列，包括编码基因和调控基因。
功能基因组学：利⽤结构基因组学研究所得的各种来源的信息，建⽴与发展各种技术和实验模型来测定基因及基因组⾮编码序列的⽣物学功能。7蛋⽩质组：是指⼀个基因组中各个基因编码产⽣的蛋⽩质的总体，即⼀个基因组的全部蛋⽩产物及其表达情况。p179
8蛋⽩质组学：指应⽤各种技术⼿段来研究蛋⽩质组的⼀门新兴科学，其⽬的是从整体的⾓度分析细胞内动态变化的蛋⽩质组成成分、表达⽔平与修饰状态，了解蛋⽩质之间的相互作⽤与联系，
揭⽰蛋⽩质功能与细胞⽣命活动规律。9功能蛋⽩质组学：（功能蛋⽩质组，即细胞在⼀定阶段或与某⼀⽣理现象相关的所有蛋⽩）。
10序列对位排列：通过插⼊间隔的⽅法使不同长度的序列对齐，达到长度⼀致。
11 基因组作图：是确定界标或基因在构成基因组的每条染⾊体上的位置，以及同条染⾊体上各个界标或
基因之间的相对距离。p15512 后基因组时代：其标志是⼤规模基因组分析、蛋⽩质组分析以及各种数据的⽐较和整合。p3
⼆填空题1⽣物信息学的发展⼤致经历了3个阶段，分别为前基因组时代、基因组时代、后基因组时代。p2
2后基因组时代的标志性⼯作是（基因组分析）（蛋⽩质组分析）以及（各种数据的⽐较和整合）p3
2012生物信息学题库
1 一、选择题: 1.以下哪一个是mRNA条目序列号：A. J01536 B. NM_15392 C. NP_52280 D. AAB134506 2.确定某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方式是：A. UnigeneB. Entrez C. LocusLink D. PCR 3.一个基因可能对应两个Unigene簇吗？A. 可能B. 不可能4.下面哪种数据库源于mRNA信息：A. dbESTB. PDB C. OMIM D. HTGS 5.下面哪个数据库面向人类疾病构建：A. EST B. PDB C. OMIMD. HTGS 6.Refseq和GenBank有什么区别：A. Refseq包括了全世界各个实验室和测序项目提交的DNA序列B. GenBank提供的是非冗余序列C. Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D. GenBank源于Refseq 7.如果你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择：A. OMIM B. Entrez C. PubMed D. PROSITE 8.比较从Entrez和ExPASy中提取有关蛋白质序列信息的方法，下列哪种说法正确：A. 因为GenBank的数据比EMBL更多，Entrez给出的搜索结果将更多B. 搜索结果很可能一样，因为GenBank和EMBL的序列数据实际一样C. 搜索结果应该相当，但是ExPASy中的SwissProt记录的输出格式不同9.天冬酰胺、色氨酸和酪氨酸的单字母代码分别对应于：A. N/W/YB. Q/W/Y C. F/W/Y D. Q/N/W 10.直系同源定义为：A. 不同物种中具有共同祖先的同源序列B. 具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列C. 同一物种中由基因复制产生的同源序列D. 同一物种中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列11.下列那个氨基酸最不容易突变：A. 丙氨酸B. 谷氨酰胺C. 甲硫氨酸D.半胱氨酸12.PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变：A. 1% B. 20% C. 80%D. 250% 13.下列哪个句子最好的描述了两个序列全局比对和局部比对的不同：A. 全局比对通常用于比对DNA序列，而局部比对通常用于比对蛋白质序列B. 全局比对允许间隙，而局部比对不允许C. 全局比对寻找全局最大化，而局部比对寻找局部最大化D. 全局比对比对整体序列，而局部比对寻找最佳匹配子序列14.假设你有两条远源相关蛋白质序列。为了比较它们，最好使用下列哪个BLOSUM和PAM矩阵：A. BLOSUM45和PAM250 B. BLOSUM45和PAM1 C. BLOSUM80和PAM250 D. BLOSUM10和PAM1 15.与PAM打分矩阵比较，BLOSUM打分矩阵的最大区别是：A. 最好用于比对相关性高的蛋白B. 它是基于近相关蛋白的全局多序列比对C. 它是基于远相关蛋白的局部多序列比对D. 它结合了全局比对和局部比对16.如果有一段DNA序列，它可能编码多少种蛋白质序列：A. 1 B. 2 C. 3 D. 617.要在数据库查询一段与某DNA序列编码蛋白质最相似的序列，应选择：A. blastn B. blastp C. tblastn D. tblastp E. blastx18.为什么ClustalW（一个采用了Feng-Doolittle渐进比对算法的程序）不报告E值：A. ClustalW报告E值B. 使用了全局比对C. 使用了局部比对D. 因为是多序列比对19.Feng-Doolittle方法提出“一旦是空隙，永远是空隙”规则的依据是：A. 保证空隙不会引物序列加入而填充B. 假定进化早期分歧的序列有较高优先级别C. 假定最近序列空隙应该保留D. 假定最远序列空隙应该保留20.根据分子钟假说：A. 所有蛋白质都保持一个相同的恒定进化速率B. 所有蛋白质的进化速率都与化石记录相符合C. 对于每一个给定的蛋白质，分子进化的速率是逐渐减慢的，就如同不准时的钟D. 对于每一个给定的蛋白质，其分子进化的速率在所有的进化分支上大致是恒定的21.系统发生树的两个特征是：A. 进化分支和进化节点B. 树的拓扑结构和分支长度C. 进化分支和树根D. 序列比对和引导检测方法22.下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法：A. 邻位连接法（NJ法）B. Kimura算法C. 最大似然法（ML）D. 非加权平均法（UPGMA）23.基于字母特征和基于距离的系统发生分析的算法的基本差异是：A. 基于字母特征的算法没有定义分支序列的中间数据矩阵
生物信息学试题答案(1)
外科理论与实践２００７年第ｌ２卷第４期 ・附６１・ ・函授继续医学教育・
生物信息学试题答案【１）
一、单选题（每题１分。１０题＝１０分） １．生物信息学主要是利用哪种工具实现对生命科学研究中 生物信息的存储、检索和分析的科学。（Ｂ） Ａ．人造卫星 Ｂ．计算机 Ｃ．手机 Ｄ．以上均是 Ｅ．以上均不是 ２人类基因组中真正编码蛋白质的区域仅占ＤＮＡ序列的：（Ｂ） Ａ．１～２％ Ｂ．３～５％ Ｃ．５～１Ｏ％ Ｄ．１Ｏ～２Ｏ％ Ｅ．２Ｏ％以上 ３．生命活动的执行者是基因的哪一类表达产物。（Ｃ） Ａ．ＲＮＡ Ｂ．小分子代谢物 Ｃ．蛋白质 Ｄ．ＤＮＡ Ｅ．以上均不是 ４．以下哪一种不属于基因工程药物。（Ｄ） Ａ．红细胞生成素 Ｂ．人胰岛素 Ｃ．人生长激素 Ｄ．黄连素 Ｅ．粒细胞集落刺激因子 ５．在固相载体上密集排列着以下哪一种物质是生物芯片：（Ａ） Ａ．基因探针 Ｂ．集成电路 Ｃ．光电二极管 Ｄ．微生物菌落 Ｅ．以上均是 ６．目前应用于基因芯片表达数据统计分析的主要方法是：（Ｃ） Ａ．卡方检验 Ｂ．相关分析 Ｃ．聚类分析 Ｄ．正态性分布检验 Ｅ．以上均不是 ７．关于基因多态性的描述哪一项是正确的：（Ｂ） Ａ．在人群中出现频率＜１％ Ｂ．人群中出现频率＞１％ Ｃ．人群中出现频率＞１Ｏ％ Ｄ．人群众出现频率在１Ｏ～２Ｏ％ Ｅ．以上均不对 ８．以下哪一种疾病属于单基因病：（Ｃ） Ａ．高血压 Ｂ．胃癌 Ｃ．镰刀形红细胞贫血症 Ｄ．以上均是 Ｅ．以上均不是 ９．以下哪一种不属于基因治疗的病毒载体：（Ｅ） Ａ．逆转录病毒 Ｂ．腺病毒 Ｃ．单纯疱疹病毒 Ｄ．腺相关病毒 Ｅ．乙肝病毒 １Ｏ．细胞因子（ｃｙｔｏｋｉｎｅ）是机体的各种细胞合成和分泌的小 分子多肽类物质，例如：（Ｅ） Ａ．白细胞介素 Ｂ．干扰素 Ｃ．集落刺激因子 Ｄ．肿瘤坏死因子 Ｅ．以上均是 二、多选题（每题２分。１０题＝２０分） １．人类基因组计划及生物信息研究的海量数据处理需要的 计算机要求：（Ａ，Ｂ） Ａ．大容量 Ｂ．高性能 Ｃ．笔记本电脑 Ｄ．以上均是 Ｅ．以上均不是 ２．基因组信息学的主要工作是：（Ｅ） Ａ．大量核苷酸序列的测定 Ｂ．新基因的发现和鉴定 Ｃ．基因组信息的收集、存储、管理 Ｄ．提供数学、计算机科学的配合 Ｅ．以上均是 ３．化学蛋白质组学是利用哪类分子直接从功能角度切入蛋 白质组的研究：（Ｃ） Ａ．生物大分子 Ｂ．金属离子 Ｃ．化学小分之 Ｄ．纳米颗粒 Ｅ．以上均不是 ４．有关基因工程的正确表述是：（ＡＢＣ） Ａ．人工的 Ｂ．离体的 Ｃ．分子水平的 Ｄ．机器人辅助的 Ｅ．以上均不是 ５．有关基因组文库哪些概念是不正确的：（ＢＣＤＥ） Ａ．是含有某种生物体全部基因随机片断的重组ＤＮＡ 克隆群体 Ｂ．是含有感兴趣基因片段的重组ＤＮＡ克隆群体 Ｃ．是基因组计划的文献数据库 Ｄ．是基因组网络数据库 Ｅ．以上均不对 ６．人类脑计划的研究项目包括：（Ｅ） Ａ．神经元 Ｂ．神经网络模型 Ｃ．脑解剖图谱 Ｄ．脑功能图像 Ｅ．以上均是 ７．基因诊断中的分子生物学技术包括：（Ｄ） Ａ．核酸杂交 Ｂ．聚合酶链式反应 Ｃ．基因测序分析 Ｄ．以上均是 Ｅ．以上均不对 ８．获得性基因病是指病原微生物基因及其表达产物入侵所 致。它包括：（ＡＢＣ） Ａ．艾滋病 Ｂ．乙型肝炎 Ｃ．丙型肝炎 Ｄ．血吸虫病 Ｅ．以上均是 ９．非病毒性基因导入载体系统包括：（Ｅ） Ａ．脂质体 Ｂ．磷酸钙 Ｃ．基因枪 Ｄ．分子偶联载体
生物信息学复习要点
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1 一、名词解释（每小题3分，共30分）分）
1.1. 生物信息学生物信息学
2.2. 数据库技术数据库技术
3.3. 数据仓库数据仓库
4.4. EST
5.5. 概念性翻译概念性翻译
6.6. 同源性同源性
7.7. 单系类群单系类群
8.8. 全局排列全局排列
9.9. 基因作图基因作图
1010．直系同源体簇．直系同源体簇．直系同源体簇
二、填空题（每空1分，共10分）分）
1． 生物信息学主要研究的两种信息载体是生物信息学主要研究的两种信息载体是 和 。
2． 国际上的三大核苷酸序列数据库分别是 、
和 。
3． 数据挖掘的三大技术支柱是数据挖掘的三大技术支柱是 、 和 。
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2 4． 相同类型核苷酸的替换称为 ，不同类型核苷酸的替换称
为 。
三、单项选择题（每小题1分，共10分）分）
1.1. 在对模式生物进行全基因组的测定中，作为真菌模式生物的是在对模式生物进行全基因组的测定中，作为真菌模式生物的是 。
A、大肠杆菌、大肠杆菌
B、青霉菌、青霉菌
C、酵母菌、酵母菌
D、线虫、线虫
2．NCBI成立于成立于 。
A、1988年
B、1989年
C、1990年
D、1992年
3．根据数据库管理系统所支持的基本数据模型的不同，可以将数据库分为五类，其中第二
代数据库是代数据库是 。
A、层次数据库、层次数据库
B、网状数据库、网状数据库
C、关系数据库、关系数据库
D、分布式数据库、分布式数据库
4．在向GenBank投送序列的工具中，投送序列的工具中， 是标准的序列投送工具。是标准的序列投送工具。
A、Cn3D
B、tb12asn
C、BankIt
D、Sequin
5. 目前最为常用和注释最全的蛋白质序列数据库是目前最为常用和注释最全的蛋白质序列数据库是 。
生物信息学复习资料
⽣物信息学复习资料
第⼀章1.⽣物信息学：⽤数学的、统计的、计算的⽅法来解决⽣物问题，这基于⽤DNA、氨基酸及相关信息。即⽣物+信息学，其中⽣物是指从基因型到表型：DNA/基因组→RNA→蛋⽩质→分⼦⽹络→细胞→⽣理学/疾病。信息学是指从数据到发现：数据管理→数据计算→数据挖掘→模型/模拟
2.⼈类基因组计划：①前基因组时代(1990年前)：通过序列之间的对⽐，寻找序列变化，确定序列功能。②基因组时代(1990年后～2001年)迅猛发展：标志性的⼯作包括基因寻找和识别，数据库系统的建⽴。③后基因组时代(2001年⾄今)功能基因组研究：研究内容发展到基因和基因组的功能分析，即功能基因组，学研究。从传统的还原论研究⽣命过程转到了整体论思想。2001年,中美⽇德法英6国科学家耗费⼗年，联合公布⼈类基因组草图
3.基因芯⽚：⼜称DNA芯⽚，由⼤量DNA或寡聚核苷酸探针密集排列形成的探针阵列。原理：杂交测序⽅法，在⼀定条件下，载体上的核酸分⼦可以与来⾃样品的序列互补的核酸⽚段杂交，如果把样品中的核酸⽚段进⾏标记，在专⽤的芯⽚阅读仪上就可以检测到杂交信号。药物处理细胞总mRNA⽤Cy5标记，未处理的细胞总mRNA⽤Cy3标记，颜⾊？将两者杂交形成固相探针，包含cDNA和寡核苷酸，最后进⾏结果观察和信息分析。
、EMBL、DDBJ5.数据挖掘：①理解数据和数据的来源②获取相关知识与技术③整合与检查数据④去除错误或不⼀致的数据⑤建⽴模型和假设⑥实际数据挖掘⼯作⑦测试和验证挖掘结果⑧解释和应⽤。数据挖掘中的常见算法思想：判断、聚类、关联。数据挖掘模型：①监督模型、预测模型②⽆监督模型：聚类分析和关联分析②数据降维：主成分分析和因⼦分析。
第⼆章：1.Sanger法：①1977年，提出了“双脱氧核苷酸末端终⽌测序⽅法”②技术基础：PCR扩增；双脱氧核苷酸的扩增终⽌；电泳分离扩增⽚段③优点1.读取⽚段长2.准确率⾼99.9% 缺点：1.测序通量低2.成本⾼、流程多④⽅法、原理：每个反应含有所以四种dNTP使之扩增，并混⼊限量的⼀种不同的ddNTP使之终⽌，由于ddNTP缺乏延伸所需要的3’-OH基团，使延长的寡聚核苷酸选择性地在G,A,T或 C 处终⽌，终⽌点由反应中相应的双脱氧⽽定，每⼀种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整，使反应得到⼀组长⼏百⾄⼏千碱基的链终⽌产物。它们具有共同的起始点，但终⽌在不同的核苷酸上，可通过⾼分辨率变性凝胶电泳分离⼤⼩不同的⽚段，凝胶处理后可以X-光胶⽚放射性⾃显影或⾮同位素标记进⾏检测2. 第2代测序技术（2005）①特点：1.PCR反应空间限定在特定的微⼩载体中。降低成本，实现⾼通量2.边合成边测序以及平⾏测序②第⼀代测序就出现了⾃动化测序③Solexa步骤：(1)制备模板，单链⽚断固定到载⽚表⾯(2)DNA簇群⽣成(3)循环合成反应+荧光成像④技术基础：基于芯⽚或其他载体、3’受保护的荧光标记碱基、PCR ⑤优点：⾼通量、没有电泳的步骤，成本降低缺点：读取⽚段长度短、准确率下降3．Read contig Scaffold ①Read:测序读到的碱基序列⽚段，测序的最⼩单位②contig:由reads通过对overlap区域拼接组装成的没有gap的序列段③Scaffold：通过pair ends信息确定出的contig排列，中间有gap4.测序的应⽤：①遗传多样性分析②甲基化分析③研究与蛋⽩质结合的DNA序列特征④转录组测序