中国完成首个鱼类基因组测序
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Ｔ…Ⅲｉ ａｌｌｙ Ａｔｔｅｎｔｉ。ｎ
计划以新余为中心．打造年出栏５００
万头优质生猪的现代养殖基地 在 管理上将采用公司加农户的养殖模 式，整合饲料、养殖、加工、销售产业
链资源．推动＂－３地养猪业在技术和 规模上的升级
河南省世行贷款生态畜牧业
项目启动培训班开班
８月９日．河南省世行贷款生态 畜牧业项目启动培训班在郑州正式 开班．这意味着历经７年努力的世行 贷款项目即将进入实施阶段。 据了解．这一项目计划总投资
１．７１亿美元．其中利用世行贷款８０００ 万美元．贷款期限为３０年．实施期限
为５年，将在河南省的郑州、开封、洛 阳、焦作、新乡、濮阳、商丘、济源等８ 个省辖市、３０个县（市、区）实施，项
目内容主要包括机构加强、培训和技 术支持，支持新建、改扩建５９０个项
目养殖场和养殖小区．以及项目管 理、监测与评价等。在项目设计上，将 通过利用生态经济学原理．建立新型
的动物生产模式．真正实现植物生 产——动物转化——微生物还原 项 目将对名单中８０％的养殖场、养殖小
区实施改造．加强粪污收集与处理设 施建设：同时配合河南省新农村建 设．新建项目总数约２０％的养殖小
区．将分散在庭院的养牛农户纳入到 畜牧专业合作社的养殖 卜区中来
河南“正阳三黄鸡”正式
获批国家地理标志产品保护
因嘴黄、毛黄、爪黄而得名的“正 阳三黄鸡”．近日被国家质量监督检
验检疫总局正式批准实施地理标志 产品保护．保护范围是该县的慎水
乡、兰青乡、铜钟镇、大林镇、皮店乡、 陡沟镇６个乡镇现辖行政区域。
正阳三黄鸡肉质鲜美．还具有补 气、养血、利尿之功效，素有“药鸡”、
“中华名贵鸡种”之称。系我国稀有的 特优型地方良种鸡之一 ４
科技
中国完成首个鱼类基因组测序
８月１１日．从深圳华大基因研
究院获悉．由中国黄海水产研究所与
华大基因研究院联合启动的半滑舌
鳎全基因组测序和基因图谱绘制研
究项目已全部完成 华大基因研究院副院长王俊博
士说．这是中国完成的第一个鱼类基
因组测序项目和全基因组序列图谱．
使半滑舌鳎成为世界上第一个测定
了全基因组序列的鲽形目鱼类 这个 项目得到了科技部、农业部和国家自 然科学基金委员会等部门的支持
丰滑舌鳎俗名鳎米鱼．是中国特
有的名贵经济海水鱼类。由于其味道 鲜美、肉质细嫩、营养丰富．市场价值
极高。中国沿海地区普遍养殖．年产
值迭１５亿－２０亿元人民币
疫情
全国动物疫病监测与疫情
形势总结分析工作会议召开
２０１０年７月２８—３０日．农业部
在内蒙古自治区呼伦贝尔市召开
２０１０年上半年全国动物疫病监测与
疫情形势总结分析工作会议。会议总 结了上半年全国动物疫病监澳ｌ、疫情
报告及疫情形势分析评估工作开展
情况．研究分析了重大动物疫病发生 特点与流行规律、当前发生形势及发
展趋势．就下一阶段工作进行部署。
上半年．各级动物疫病预防控制
机构按照农业部统一部署．根据国家 动物疫病监测计划要求．深入研究难
点ｆ＂ｌ题．创新Ｚ－作思路。扎实开展动
物疫病监测、疫情报告与分析评估及 流行病学调查等工作．逐步提高监测
水平和疫情分析评估质量．取得较好
成效。
会议对下半年全国动物疫病监 嘲纠广裔２０１０年第１６期
测与疫情形势分析评估工作进行部
署．要求各地在落实各项监测措施的
基础上，进一步强化防控工作．努力
确保不发生区域性重大动物疫情 一 是科学开展监测工作．实事求是地上 报监测结果．及时准确地发现和消除
疫情隐患 二是积极推行“定点定期
定量定性”监测模式．及时掌握动物
病原分布变异情况和疫情动态 三是
确保监测经费投入．加大监测投入力 度．强化技术培训，建立相对稳定的
监测队伍．建立经费保障长效机制
四是充分发挥测报站的作用．严格按 照农业部《国家动物疫情测报站和边
境动物疫情监测站管理规范》要求，
加强“两站”建设管理 五是确保检测
试剂质量．尽快推进全国监测工作实 现统一仪器设备、技术标准、检测试
剂。六是建立健全科学评价制度。建
立动物疫情定期分析评估制度和科
学的工作考评机制．探索建立适应我 国重大动物疫病预警预报的方法等
农业部兽医局副局长李长友指
出。近年来，全国动物疫情监测工作
发展较快、进步很大．监测数量逐年 增加、监测力度逐步加大、规章制度
不断健全、监测职能充分发挥．疫情
测报工作有序有效开展 各地要继续
坚持“国家监测与地方监测相结合、 常规监测和应急监测相结合、定点监
测和全面监测相结合、抗体监测和病
原学监测相结合”的工作原则．以禽
流感等重大动物疫病为重点．发挥国 家动物疫情测报站和边境动物疫情
监测站的作用
中国动物疫病预防控制中心主 任张仲秋说．各级动物疫病预防控制 机构的大量工作为科学预测下阶段
全国疫病发生趋势奠定技术基础．推
动完善疫情形势分析评估机制．各地
通过此次会议建立全国性的疫病监
授６和疫情形势分析交流平台 要进一
步健全完善实验室网络．坚持推行科 学监测模式．加强疫情监测信息化系
统建设．提高疫情监测数据的信息化
应用水平
我国蔬菜生物技术育种发展成就
我国蔬菜生物技术育种发展成就
1 完成了主要蔬菜的基因组测序
2009年，我国科学家主持完成了世界上第一个蔬菜作物——黄瓜全基因组的测序和分析。目前测序的蔬菜作物已超过50多种，其中我国科学家主导完成了黄瓜、西瓜、番茄、白菜、甘蓝、芥菜、辣椒、茄子、菠菜、南瓜、冬瓜、丝瓜、苦瓜和芹菜等主要蔬菜的基因组测序，发现了作物驯化和种群分化的遗传基础。
在此基础上，通过规模化重测序，建立了蔬菜作物变异组数据库，揭示了白菜和甘蓝类蔬菜抱球和根茎膨大、西甜瓜的“甜蜜基因”、黄瓜苦味、番茄风味物质驯化的分子机制。相关成果在《Nature》《Cell》《Science》《Nature Genetics》等权威学术期刊发表。这些大数据为物种进化、功能基因挖掘、全基因组高通量分子标记开发及各类组学研究提供了全视角、高效的技术方案，奠定了我国在蔬菜基因组研究领域的国际领先优势。
2 挖掘了控制重要性状的关键基因
利用遗传作图、进化选择分析、全基因组关联分析等挖掘了一批控制抗病、抗逆、品质等重要性状的关键基因，如：在白菜中，鉴定了多个控制抽薹开花时间和抗霜霉病的基因；在西瓜中，揭示了控制果实含糖量、瓤色等“甜蜜基因”的遗传调控网络；
在黄瓜中，鉴定了控制果长和分枝的功能基因；在番茄中，发掘了决定番茄风味的关键遗传位点，解释了番茄风味变差的原因。这些研究为蔬菜作物分子育种平台的建立提供了基因资源。
3 高通量分子标记辅助育种平台基本建成 建立以全基因组SNP为基础的全基因组选择技术平台是目前蔬菜育种的核心技术。近年来，我国先后引进20多套SNP高通量分型平台，主要包括Douglas Array Tape和LGC SNPline。北京市农林科学院蔬菜研究所基于LGC平台，在高通量DNA提取、高通量SNP分型、数据分析与管理系统研发等共性关键技术上集成创新；开发了结球白菜、西瓜、黄瓜等主要蔬菜的背景选择与重要抗病优质基因的前景选择标记，构建了国内首个蔬菜高通量分子育种公益服务平台，引领了国内蔬菜育种技术的升级；北京通州国际种业研发中心基于Douglas系统，开发了番茄和西瓜等蔬菜的抗病优质性状选择标记，为国内蔬菜种业企业和育种科研单位提供了技术服务。
水产动物营养基因组学的研究进展
周玲，等：水产动物营养基因组学的研究进展 一１一
蟹垂墨圜 囊鍪 攀 蘩 ｌ 篓 囊 萋霎萎囊 囊
水产动物营养基因组学的研究进展
周玲 ・ 刘臻 孙浪。 王晓晴 王赏初。 冯军厂
（１．湖南农业大学动物科技学院水产系，长沙４１０１２８；２．长沙学院生物工程与环境科学系，长沙４１（１００３）
摘要：近年来，基因组学和生物信息学在生物技术领域中的研究获得了巨大进展。在 营养学领域研究营养素与基因相互作用下，营养基因组学迅速发展成为营养学研究的热点。
营养基因组学涵盖了一个广泛的领域，它研究营养素和基因表达的相互影响，预测其对营养 素的反应。是利用基因组学研究成果及方法技术来发现与营养的合成、积累、吸收、转运及
代谢等有关基因的综合方法。本文重点介绍了水产营养基因组学的研究与应用的现状，并 对今后的研究趋势作了进一步的展望。 关键词：营养基因组学；水产动物；营养素
Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｉｎ Ａｑｕａｔｉｃ Ｎｕｔｒｉｇｅｎｏｍｉｃｓ
Ｚｈｏｕ Ｌｉｎｇ Ｌｉｕ Ｚｈｅｎ Ｓｕｎ Ｌａｎｇ Ｗａｎｇ Ｘｉａｏｑｉｎｇ Ｗａｎｇ Ｓｈａｎｇｃｈｕ Ｆｅｎｇ Ｊｕｎｃｈａｎｇ
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｉｎ ｒｅｃｅｎｔ ｙｅａｒｓ，ｇｅｎｏｍｉｃｓ ａｎｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ｒｅｓｅａｒｃｈ ｉｎ ｔｈｅ ｆｉｅｌｄ ｏｆ ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ
ｈａｓ ｍａｄｅ ｇｒｅａｔ ｐｒｏｇｒｅｓｓ．Ａｎｄ ｔｈｅ ｎｕｔｒｉｇｅｎｏｍｉｃｓ ｑｕｉｃｋｌｙ ｄｅｖｅｌｏｐｅｄ ｉｎｔｏ ａ ｈｏｔ ｓｐｏｔ ｏｆ ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ ｒｅ— ｓｅａｒｃｈ ｂｅｃａｕｓｅ ｏｆ ｔｈｅ ｒｅｓｅａｒｃｈ ｏｎ ｎｕｔｒｉｅｎｔ ａｎｄ ｇｅｎｅ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ ｆｉｅｌｄ ｏｆ ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ．Ｎｕｔｒｉｇ－
ｅｎｏｍｉｃｓ ｃｏｖｅｒｓ ａ ｗｉｄｅ ｒａｎｇｅ ｏｆ ａｒｅａｓ，ｗｈｉｃｈ ｓｔｕｄｉｅｓ ｔｈｅ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｖｅ ｅｆｆｅｃｔｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ｎｕｔｒｉｅｎｔｓ ａｎｄ ｇｅｎｅｓ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ａｎｄ ｐｒｅｄｉｃｔｓ ｔｈｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｖｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ ｔｈｅ ｎｕｔｒｉｅｎｔｓ．Ｉｔ ｉｓ ｔｈｅ ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ ａｐ－ ｐｒｏａｃｈ ｏｆ ｇｅｎｏｍｉｃｓ ｒｅｓｅａｒｃｈ，ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ｔｏ ｆｉｎｄ ｔｈｅ ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅｓ ｗｉｔｈ ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ ｇ ｓｙｎ—
我国参与人类基因组计划的始末
《中国参与人类基因组计划的始末》
1、人类基因组计划是什么
人类基因组计划HGP(Human Genome Projects)，1985年美国科学家率先提出，1990年正式启动。美、英、法、德、日和中国科学家共同参与，总价值达30亿美元，它旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因组（基因组是一个物种中所有基因的整体组成，人类的基因组约含4万到10万个基因，由约30亿个碱基对组成，分布在细胞核的23对染色体中。）精确全基因组测序，从整体水平研究基因的位置、基因的结构与功能和基因互作。
全基因组测序（Whole Genome Sequencing），简称WGS。“全（whole）”指的就是把物种细胞里面完整的基因组序列从第1个DNA开始一直到最后一个DNA，完完整整地检测出来，并排列好，因此这个技术几乎能够鉴定出基因组上任何类型的突变。对于人类来说，全基因组测序的价值是极大的，它包含了所有基因和生命特征之间的内在关联性，技术含量极高。
2、发起过程
1984年末，犹他州受美国能源部的委托，主持召开会议，讨论DNA重组技术的发展及测定人类整个基因组的DNA序列的意义。
1985年中，美国加州举行会议，美国科学家于美国能源部的一次会议中提出HGP草案。
1986年中，美国新墨西哥州讨论草案的可行性。与此同时，诺贝尔奖获得者Renato Dulbecco在《Science》杂志上发表文章提出“研究人类基因组DNA长达三亿多的碱基对序列,发现所有人类基因并阐明其在染色体上的位置,以便于在整体上破译人类遗传信息”。
1987年初，美国能源部与国家医学研究院（NIH）拨款550万美元，年末拨款总额近1.66亿美元。同时，美国开始筹建人类基因组计划实验室。
1989年美国成立“国家人类基因组研究中心”。
1990年，历经5年辩论之后，美国国会批准HGP于10月1日正式启动，拟在15年内至少投入30亿美元，这项计划被誉为生命科学界的“登月计划”，英法德日相继参与。
我国参与人类基因组计划的始末 2
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《XX参与人类基因组计划的始末》
1、人类基因组计划是什么
人类基因组计划 HGP（Human Genome Projects） 1985年美国科学家率先提
出，1990年正式启动。美、英、法、德、日和中国科学家共同参与，总价值达 30亿美元，它旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因组（基因组是一个物种中 所有基因的整体组成，人类的基因组约含 4万到10万个基因，由约30亿个碱 基对组成，分布在细胞核的23对染色体中。）精确全基因组测序，从整体水平 研究基因的位置、基因的结构与功能和基因互作。
全基因组测序（Whole Genome Sequencing，简称 WGS 全（whole） ” 指的就是把物种细胞里面完整的基因组序列从第 1个DNA开始一直到最后一个
DNA,完完整整地检测出来，并排列好，因此这个技术几乎能够鉴定出基因组 上任何类型的突变。对于人类来说，全基因组测序的价值是极大的，它包含了 所有基因和生命特征之间的内在关联性，技术含量极高。
2、发起过程
1984年末，犹他州受美国能源部的委托，主持召开会议，讨论 DNA重组
技术的发展及测定人类整个基因组的 DNA序列的意义。
1985年中，美国加州举行会议，美国科学家于美国能源部的一次会议中 提出HGP草案。
1986年中，美国新墨西哥州讨论草案的可行性。与此同时，诺贝尔奖获 得者Renato Dulbecco在《Science＞杂志上发表文章提出 研究人类基因组DNA 长达三亿多的碱基对序列，发现所有人类基因并阐明其在染色体上的位置，以便于 在整体上破译人类遗传信息”。
1987年初，美国能源部与国家医学研究院（NIH）拨款550万美元，年 末拨款总额近1.66亿美元。同时，美国开始筹建人类基因组计划实验室。
1989年美国成立 国家人类基因组研究中心”。
1990年，历经5年辩论之后，美国国会批准 HGP于10月1日正式启 动，2 / 8
虹银汉鱼科4种鱼类线粒体基因组分析及系统发育研究
虹银汉鱼科4种鱼类线粒体基因组分析及系统发育研究
虹银汉鱼指银汉鱼目(Atheriniformes)下的虹银汉鱼科(Melanotaeniidae)的鱼类,虹银汉鱼主要分布在澳洲地区,体长多半在6-18公分之间,体色丰富多变,中文名常以“美人”、“彩虹鱼”称之。虹银汉鱼在我国没有分布,全部依赖原产地进口,其分子数据(mtDNA)极度匮乏,为引进开发和保育工作带来一定难度。
虹银汉鱼具有明显的地理分布特征,被认为是研究澳洲地区生物地理学的重要生物材料,具有重要的分子系统学意义。本研究通过PCR测序和克隆测序的方法测得了4种虹银汉鱼线粒体基因组序列,并运用生物信息学软件对测序结果进行了拼接、注释及分析。
然后以颌针鱼目青鳉鱼作为外系群,基于银汉鱼目12种鱼类线粒体基因组序列,采用3种建树方法:邻接法(NJ)、最大似然法(ML)及贝叶斯法(BI)对该科鱼系统发育关系进行研究。并在系统发育结果的基础上结合地理分布,探讨了薄唇虹银汉鱼与虹银汉鱼属、舌鳞银汉鱼属的系统发育关系。
主要研究结果如下:1.4种虹银汉鱼线粒体基因组测序及结构分析所测得的4种虹银汉鱼mtDNA长度分别为:16539bp(舌鳞银汉鱼)、16493bp(贝氏虹银汉鱼)、16536bp(薄唇虹银汉鱼)、16530bp(澳洲虹银汉鱼),长度不同主要是由非编码区的长度差异较大引起的。线粒体基因组主要由编码区和非编码区构成,非编码区为两段:轻链复制起始区与控制区,编码区由13个编码蛋白质的基因、2个rRNA基因及22个tRNA基因。
另外,编码在轻链(L-strand)的基因仅有ND6和8个tRNA基因,剩余基因均编码于重链(H-strand)。一般情况下仅COⅠ基因使用GTG作为起始密码子,但舌鳞银汉鱼的ATP6基因采用GTG作为起始密码子。 线粒体基因组全序列AT碱基含量大于GC含量,且蛋白质编码基因密码子三个位点均表现出较严重的低G偏倚现象。22个tRNA中,除tRNASer(UGA)基因缺失DHU臂之外,其他tRNA基因均可形成稳定的三叶草型二级结构。
中国科学家主导完成一项国际协作的白菜全基因组研究
・７６・ 这一研究成果公布在《细胞》杂志上。文章的通讯作者 是华裔科学、哈佛医学院袁钧英教授。她一直从事细胞死亡 的相关研究。２００５年发现了一种细胞非调亡性的程序性死 亡，英文称为ｎｅｃｒｏｐｔｏｓｉｓ。据报道，Ｎ一末端乙酰化修饰是在 真核生物中广泛存在的修饰形式，其中Ｎ末端 一乙酰化（Ｎ —ａｌｐｈａ—ａｃｅｔｙｌａｔｉｏｎ）通常与翻译同时发生，一般发生在新生 肽链大约４Ｏ个残基长的时候。这种修饰形式普遍存在，比 如一些细菌细胞中大约８０％的可溶蛋白是Ｎ端仪一乙酰化 修饰的。 之前的研究证明Ｎ末端仪一乙酰化修饰蛋白与细胞对 凋亡信号的敏感性密切相关，在该研究中，研究人员通过生 化实验分析蛋白乙酰化状态，证明蛋白Ｎ末端 一乙酰化受 到乙酰辅酶Ａ（ａｅｅｔｙｌ—ＣｏＡ）的调控。乙酰辅酶Ａ是乙酰基 的活化形式，参与各种乙酰化反应，也是糖类、脂肪、氨基酸 氧化时的重要中间产物。 由于Ｂｄ—ｘＬ是一种著名的影响线粒体代谢的抗凋亡 蛋白，因此这一因子可能在末端 一乙酰化修饰蛋白与凋亡 之间搭建了桥梁。研究人员通过一系列实验证明了这一点， 从而提出Ｎ末端 一乙酰化修饰蛋白的代谢调控可以促进 细胞生存。 这项研究是袁钧英教授与上海生化与细胞所吴家容研 究组以及上海有机所马大为研究组共同合作完成的。 美国科学家首次发现前核小体是处于 染色质和核小体之间的中间物质结构 据生物通网２０１１年８月２３日援引《科技日报》报道美 国物理学家组织网２０１１年８月１８日消息，美国科学家在人 类遗传物质中发现了一种新物质并将其命名为“前核小体”。 科学家们认为，这种新物质是位于染色质和核小体之间的中 间物质，新发现有望让生物教科书发生小小的“变脸”。相关 研究发表在２０１１年８月１９日的《分子细胞》杂志上。 据介绍，染色质是细胞周期间期细胞核内能被碱性染料 染色的物质，是ＤＮＡ在细胞中的天然状态，也是调节生物体 新陈代谢、遗传和变异的物质基础。而以往的生物学教科书 将核小体作为构成染色质的基本单位，其形状类似于一个扁 平的碟子或一个圆柱体，染色质由一连串的核小体所组成。 美国加州大学圣地亚哥分校的生物学家却指出，他们在最新 研究中发现了一种组成染色质的新奇粒子 其介于ＤＮＡ和 核小体中间，尽管这种新奇粒子的外表类似于核小体，但它 实际上是另外一种不同的粒子，是核小体的前体。他们将这 种粒子命名为“前核小体”。 尽管这种前核小体在显微镜下看起来与核小体类似，但 是，生物化学测试表明，它们其实是ＤＮＡ和核小体之间的中 间物质。一种蛋白使用能量分子腺嘌呤核苷三磷酸（ＡＴＰ） 将这些前核小体变成了核小体。 此前认为染色质只由核小体组成。最新研究却证明，染 色质可能由核小体和前核小体组成。领导该研究的生物学 教授詹姆斯・门永表示：“最新发现可能拉开了我们重新理 解染色质的序幕。在生物体内遗传物质的复制和使用中，这 生物学教学２０１２年（第３７卷）第２期 种前核小体很可能起着关键作用。”美国国家卫生研究院 （ＮＩＨ）国立综合医学研究所负责监管染色质研究的安东尼 ・卡特表示：“用组蛋白包装ＤＮＡ形成的染色质有助于稳定 染色体，其在调控基因活动以及ＤＮＡ复制方面也起重要作 用。发现这种新奇的中间型的ＤＮＡ一组蛋白复合物将有助 ．于我们更好地理解这种复合物如何影响这些关键的细胞过 程。” ‘ ［基因组研究］ 中国科学家主导完成一项国际协作的白菜全基因组研究 椐生物通网２０１１年８月３０日报道，２０１１年８月２９日， 由中国农业科学院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所、深圳 华大基因研究院主导，有英国、韩国、加拿大、美国、法国、澳 大利亚等国家科学家组成的“白菜基因组测序国际协作组”， 合作完成的白菜全基因组研究成果在国际权威杂志《自然・ 遗传学》上发表。这一重大成果标志着我国以白菜类作物为 代表的芸薹属作物基因组学研究取得了国际领先的地位。 白菜类蔬菜包括结球白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态 各异的一大类蔬菜，其中结球白菜和小白菜是我国栽培面积 和消费量最大的蔬菜作物。我国是世界最大的白菜生产国， 目前大白菜和小白菜栽培面积已超过４００万ｌｌａ，总产量约 １２，０００万ｔ，在我国的蔬菜供应中具有举足轻重的地位。白 菜在韩国、日本以及东南亚各国也是主要的蔬菜。此外，白 菜（Ａ基因组）还是世界上最主要的油料作物油菜（由ＡＣ基 因组组成的异源四倍体）和油料蔬菜兼用作物芥菜（由ＡＢ 基因组组成的异源四倍体）的基本种。因此，白菜全基因组 测序的完成对白菜类作物和其他芸薹属类作物的遗传改良 具有重要的意义。 据了解，中国农业科学院蔬菜花卉研究所联合油料作物 研究所和深圳华大基因研究院于２００８年１Ｏ月启动白菜基 因组测序项目，２００９年９月鉴于我国开展的白菜基因组测序 取得重大进展，“白菜基因组测序国际协作组”正式决定终止 原有的所有测序活动，以中国测定的白菜基因组序列为Ａ基 因组参考序列。在完成白菜基因组组装的基础上，我国科学 家联合国际同盟进一步开展了白菜基因组注释、比较基因组 学、基因组进化和各种相关的生物学分析。分析结果表明， 白菜基因组大小为约４８５Ｍｂ（由于重复序列的分布过于集 中，因此实际组装的长度为２８５Ｍｂ，基因组覆盖度大于 ９８％），共包含约４万多个基因；白菜的祖先种与模式物种拟 南芥非常相似，它们大约在１３００—１７００万年前发生了分化， 两者依然维持着良好的基因之间的线性对应关系；白菜基因 组存在３个类似但基因密度明显不同的亚基因组，其中一个 亚基因组密度显著高于另外两个亚基因组，推测白菜基因组 在进化过程中经历了两次全基因组复制事件与两次基因丢 失的过程。研究还发现，白菜在基因组发生复制之后，与器 官形态变异有关的生长素相关基因发生了显著的扩增，白菜
40个蚕基因组测序揭开了其选育史
第２９卷第３期 ２００９年９月 ３１
４Ｏ个蚕基因组测序揭开了其选育史
中国古代通过处死那些将蚕或蚕卵走私出国的人来保护蚕丝生产的秘密。在蚕丝生产技
术传播到日本、韩国、中东和欧洲之前，这种处罚措施一直持续了几千年。但是现在，中国无私
地提供家蚕的秘密：在这个星期ＳＣＩＥＮＣＥ杂志在线网络上（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｓｃｉｅｎｃｅｍａｇ．ｏｒｇ／
ｃｇｉ／ｃｏｎｔｅｎｔ／ａｂｓｔｒａｃｔ／１１７６６２０），主要由中国科学家组成的团队报道了他们利用现代基因组方
法探究家蚕驯化的结果。研究鉴定了一大群可能影响吐丝、能量代谢和繁殖等基因，这些基因
不仅能在培育蚕品种而且能在其他昆虫甚至动物上被开发利用。考古学证据表明中国驯化家
蚕超过５０００年。但是驯化的细节很难探明并一直存在争论。蚕的驯化是一个长期的、缓慢的
过程吗？在此过程中，蚕逐渐扩散到全国各地，出现不同生态背景的变种？或者蚕驯化只是一
次事件，在一个有限的地理区域快速发生驯化？
重庆西南大学的家蚕遗传学家向仲怀和北京基因组研究所基因组学专家王俊领导的此团
队采用现代ＤＮＡ测序技术解答了这些问题。他们已有参考基因组序列，即家蚕基因组精细
图，此结果由国际蚕基因组协会完成，发表于去年１２月的昆虫生物化学与分子生物学杂志上。
为了阐明蚕的驯化，研究者对２９个不同家蚕品系和ｌ１个野蚕进行了基因组测序，２９个家蚕
血缘来源于世界各地，１１个野蚕在中国国内收集。
他们对４Ｏ个基因组的差异进行研究，鉴定了近１千６百万个单核苷酸多态性
（ＳＮＰｓ）——即位于染色体上的个体间存在单个碱基的差异，以及其他基因组结构变异。这些
数据分析和群体统计学模型显示家蚕与野蚕遗传上明显分开，并且家蚕内部具有很高的遗传
变异，虽然变异程度要小于野蚕内部。从此次以及其他基因组数据，他们推测在一个相对很短
的时间内，大量野蚕被收集驯化，即驯化的发生是一个单一事件。王俊说：“驯化是在一个单一
我国干细胞研究新突破：维生素C的非凡功效
＿ 堡塑
世界上第一个鲤科经济鱼类基因组计划正式启动
近日，由中国水产科学研究院组织的“鲤鱼基
因组计划”论证会在北京召开，这是我国继水稻、家
蚕、黄瓜、牡蛎等基因组计划之后启动的又一项重
要经济物种全基因组计划。鲤鱼是我国最具代表性
的养殖鱼类之一，也是育成品种最多的水产养殖种
类，其基因组测序研究将对鲤的品种培育、病害防
治、饲料营养和食品安全等方面具有重要的促进作
用。作为第一个基因组测序的鲤科养殖鱼类，将对
其他鲤科经济鱼类的基因组研究起到重要的带动
作用，为深入探索和解析鲤科鱼类及硬骨鱼类基因
组进化提供重要依据。论证专家组长朱作言院士高
度评价了“鲤鱼基因组计划”的重大科学价值和对 渔业科技发展的重要推动作用。他指出，这一计划
是我国第一个鱼类全基因组计划，也是世界上第一 个鲤科经济鱼类基因组计划，该计划的启动对我国
的水产科技工作具有开创性，对水科院而言是具有
标志性的工作，鲤鱼基因组测序及后一步的深入挖
掘工作的实施和完成，将对我国乃至世界水产业的
发展产生重要的影响。
ｆ摘编自：中国畜牧兽医信息网２００９—１２—２８）
我国千细胞研究新突破：维生素Ｃ的非凡功效
在第１２届中国留学人员广州科技交流会生命
科学与生物技术高峰论坛上，中国科学院副院长李
家洋发布了中科院广州生物医药与健康研究院目
前在干细胞研究领域的重要成果，维生素Ｃ可以大
大提高从成体细胞转化为“诱导多能干细胞”的效
率，加入维生素ｃ后，效率可以由几万分之一提高
至１０％。这是干细胞研究领域的一个重大突破，该
项成果于ｌ２月２４日在世界干细胞权威杂志《细
胞・干细胞》在线发布，并且被选为封面文章。如果
这一技术应用于人类疾病治疗，既避免了病人对异 体移植的排斥性，又不产生伦理问题，还可以治疗
多种疾病，如白血病，老年痴呆，糖尿病以及肾、肝、
心脏器官移植等。
（摘编自：新华网２００９—１２—２８）
１１４中国动物保健Ｃｈｉｎａ Ａｎｉｍａｌ Ｈｅａｌｔｈ ２０１０年１月 ※资讯窗
菰米首个染色体水平基因组组装完成
科创中国INNOVATION CHINA10 科学家发现桑树有两套染色体基数近日，中国科技期刊《园艺研究》发表了该实验室论文《川桑和白桑在进化过程中的染色体重构与数目的改变》，在世界上首次发现桑树有14条和7条两套染色体基数，并提出“桑树染色体断裂-融合循环”理论。这一研究成果为绘制桑树亲缘关系“家谱”奠定了基础，也将为桑树学科和产业发展提供更精准的指导。以往的研究文献将桑树染色体基数定为14条，以此作为桑树基因组测序的单倍体，不过在研究中何宁佳团队却发现很多染色体数目不是14的倍数。2012年，团队发现有的桑树染色体基数是7条，并历时10年，搭建起分子细胞遗传学平台，解析桑树全基因组，反复确证判明：14条和7条都是组成桑树最小遗传单位的染色体基数，而且这两套染色体之间，不是简单的倍数关系，不能相互取代，他们是由于1条染色体断裂形成多染色体或者多条染色体头尾
相连地融合造成的。菰米首个染色体水平基因组组装完成近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研究所、深圳农业基因组研究所等单位联合，完成首个中国菰染色体水平基因组组装，并通过共线性分析和转录组测序鉴定到中国菰落粒性相关基因。该研究为中国菰落粒性基因编辑提供了候选靶点，有助于加速中国菰落粒性的定向驯化改良。相关研究成果发表于《通讯—生物学》。中国菰原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。由于缺乏高质量基因组，中国菰的遗传学及其落粒性基因研究远远落后于水稻等重要禾本科作物。研究团队运用第三代Nanopore、二代Illumina和高通量染色体捕获技术进行全基因组测序与组装，获得中国菰基因组全长547.38Mb，其中含有38852个基因以及52.89%的重复序列，重叠群（Contig N50）为4.78 Mb，基因组骨架（Scaffold N50）为32.79 Mb。545.36 Mb基因组序列被定位到17条染色体上，挂载率高达99.63%。系统发育分析发现，中国菰与假稻和稻属植物亲缘关系更近，其分化时间约为19.7百万-31.0百万年前。研究还发现，中国菰和水稻基因组之间存在显著的共线性。该团队通过与水稻落粒性基因共线性分析鉴定出中国菰落粒性相关基因，并分析了这些基因在离层形成和降解过程
家蚕基因组“框架图”绘制完成
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家蚕基因组“框架图”绘制完成
作者：田文生
来源：《语文世界(高中版 )》2005年第01期
我国已在全世界率先完成家蚕基因组“框架图”绘制工作。这是我国科学家继完成人类基因组1%测序工作、水稻基因组“框架图”和“精细图”之后，向人类贡献的第三大基因组研究成果。这也是迄今为止我国科学家利用霰弹法测序完成的最大的生物种基因组，共注释获得了16948个完整基因，7285个基因片断。根据生物信息学的分析推断，家蚕约有两万个基因，其中约6000个基因为新发现。家蚕全基因组有4亿5千万个碱基对，约为人类全基因组的七分之一，略大于水稻基因组，但科研人员仅用了5个多月的时间就完成了从cDNA文库构建到测序和组装“框架图”的所有工作，创下了基因组研究的最快纪录，并且优化了基因组测序技术，大幅度降低了研究成本，提高了“框架图”的质量和准确度。课题组在家蚕基因组结构特征、基因的组织、进化和比较基因组学方面，也获得了一批具有重要价值的理论成果。
中国是世界蚕丝业的起源地，栽桑养蚕已有5000多年历史，“丝绸之路”曾是中华民族智慧和文明的象征之一。目前以现代科技为核心，以基因组研究为平台，从家蚕入手，找到并构筑一条以突破蚕业技术、根治鳞翅目类农林害虫、开发生物药品为主要内容的“21世纪丝绸之路”，已成为各国蚕业科学家的共识，并为此展开了激烈的国际竞争。中国家蚕基因组计划项目主持人、中国工程院院士向仲怀说：“我国率先向世界公布第一个家蚕基因组‘框架图’，标志着我国在家蚕基因组研究方面已居世界领先地位。也是建立21世纪‘丝绸之路’的起点和里程碑。”
家蚕基因组“框架图”的绘制完成，对阐明家蚕生物学的遗传基础，进一步认识与蚕丝产量、质量密切相关性状的分子机制，有着重要的意义。它将使应用现代科技手段改造传统的蚕丝产业，开发新的高技术产业成为可能。家蚕是鳞翅目昆虫的典型代表，是农林害虫防治研究的不可替代的生物模型。通过对家蚕生理、病理、发育、行为和遗传致死基因的研究，可找到它的致死基因，然后通过技术手段让危害农业的鳞翅目昆虫在虫卵期就自动死亡，从害虫自身入手开发根治害虫技术，从根本上消除虫害的威胁。家蚕在基础生命体系、物质代谢、能量代谢和遗传方式上与人类有很大的相似性，通过研究家蚕的遗传模型，对解决人类疾病、寿命等重大问题具有重要的参考价值。此外，此项研究能促进我国生物反应器的实用性开发，推动生物药业的长远发展；通过家蚕基因组研究，彻底揭示蚕丝生产的调控机理，可让家蚕高效地生产对人类健康有益的高纯度药用蛋白质。